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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* IMMUNE SYSTEM 09-APR-02 1LDS *

LOGs for ID: 2604171651193055328

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604171651193055328.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604171651193055328.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604171651193055328.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =     97
            First residue number     =      0
            Last  residue number     =     96
            Number of atoms found    =    803
            Mean number per residue  =      8.3

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    31.177213 +/-     8.769578 From:    13.079000 To:    53.413000
 =     0.453557 +/-     6.298284 From:   -12.728000 To:    16.107000
 =     8.174306 +/-     9.495103 From:   -15.758000 To:    30.446000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   9.2520 % Filled.
 Pdbmat>       268571  non-zero elements.
 Pdbmat>        29307 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     72.99 +/-     24.06
         Maximum number =    123
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   =  586140.    
 Pdbmat> Larger element =  473.118    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
97 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604171651193055328.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604171651193055328.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171651193055328.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>   803 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>    97 residues.
 Blocpdb>     8 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     8 atoms in block      2
 Block first atom:      9
 Blocpdb>     9 atoms in block      3
 Block first atom:     17
 Blocpdb>    11 atoms in block      4
 Block first atom:     26
 Blocpdb>     7 atoms in block      5
 Block first atom:     37
 Blocpdb>     7 atoms in block      6
 Block first atom:     44
 Blocpdb>     9 atoms in block      7
 Block first atom:     51
 Blocpdb>     8 atoms in block      8
 Block first atom:     60
 Blocpdb>     9 atoms in block      9
 Block first atom:     68
 Blocpdb>     7 atoms in block     10
 Block first atom:     77
 Blocpdb>     6 atoms in block     11
 Block first atom:     84
 Blocpdb>     6 atoms in block     12
 Block first atom:     90
 Blocpdb>    11 atoms in block     13
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    10 atoms in block     14
 Block first atom:    107
 Blocpdb>     7 atoms in block     15
 Block first atom:    117
 Blocpdb>     5 atoms in block     16
 Block first atom:    124
 Blocpdb>     9 atoms in block     17
 Block first atom:    129
 Blocpdb>     8 atoms in block     18
 Block first atom:    138
 Blocpdb>     4 atoms in block     19
 Block first atom:    146
 Blocpdb>     9 atoms in block     20
 Block first atom:    150
 Blocpdb>     6 atoms in block     21
 Block first atom:    159
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    165
 Blocpdb>    11 atoms in block     23
 Block first atom:    173
 Blocpdb>     8 atoms in block     24
 Block first atom:    184
 Blocpdb>     8 atoms in block     25
 Block first atom:    192
 Blocpdb>     6 atoms in block     26
 Block first atom:    200
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    206
 Blocpdb>     7 atoms in block     28
 Block first atom:    218
 Blocpdb>     6 atoms in block     29
 Block first atom:    225
 Blocpdb>     4 atoms in block     30
 Block first atom:    231
 Blocpdb>    11 atoms in block     31
 Block first atom:    235
 Blocpdb>    10 atoms in block     32
 Block first atom:    246
 Blocpdb>     7 atoms in block     33
 Block first atom:    256
 Blocpdb>     6 atoms in block     34
 Block first atom:    263
 Blocpdb>     8 atoms in block     35
 Block first atom:    269
 Blocpdb>     8 atoms in block     36
 Block first atom:    277
 Blocpdb>     9 atoms in block     37
 Block first atom:    285
 Blocpdb>     7 atoms in block     38
 Block first atom:    294
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    301
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    309
 Blocpdb>     8 atoms in block     41
 Block first atom:    317
 Blocpdb>     9 atoms in block     42
 Block first atom:    325
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    334
 Blocpdb>     4 atoms in block     44
 Block first atom:    342
 Blocpdb>     9 atoms in block     45
 Block first atom:    346
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    355
 Blocpdb>     8 atoms in block     47
 Block first atom:    366
 Blocpdb>     9 atoms in block     48
 Block first atom:    374
 Blocpdb>     9 atoms in block     49
 Block first atom:    383
 Blocpdb>     7 atoms in block     50
 Block first atom:    392
 Blocpdb>     9 atoms in block     51
 Block first atom:    399
 Blocpdb>    10 atoms in block     52
 Block first atom:    408
 Blocpdb>     6 atoms in block     53
 Block first atom:    418
 Blocpdb>     8 atoms in block     54
 Block first atom:    424
 Blocpdb>     8 atoms in block     55
 Block first atom:    432
 Blocpdb>     6 atoms in block     56
 Block first atom:    440
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:    446
 Blocpdb>     6 atoms in block     58
 Block first atom:    457
 Blocpdb>     9 atoms in block     59
 Block first atom:    463
 Blocpdb>     8 atoms in block     60
 Block first atom:    472
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    480
 Blocpdb>     6 atoms in block     62
 Block first atom:    494
 Blocpdb>    11 atoms in block     63
 Block first atom:    500
 Blocpdb>    12 atoms in block     64
 Block first atom:    511
 Blocpdb>     8 atoms in block     65
 Block first atom:    523
 Blocpdb>     8 atoms in block     66
 Block first atom:    531
 Blocpdb>    12 atoms in block     67
 Block first atom:    539
 Blocpdb>    12 atoms in block     68
 Block first atom:    551
 Blocpdb>     7 atoms in block     69
 Block first atom:    563
 Blocpdb>     9 atoms in block     70
 Block first atom:    570
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:    579
 Blocpdb>     7 atoms in block     72
 Block first atom:    590
 Blocpdb>     7 atoms in block     73
 Block first atom:    597
 Blocpdb>     7 atoms in block     74
 Block first atom:    604
 Blocpdb>     9 atoms in block     75
 Block first atom:    611
 Blocpdb>     9 atoms in block     76
 Block first atom:    620
 Blocpdb>     8 atoms in block     77
 Block first atom:    629
 Blocpdb>     9 atoms in block     78
 Block first atom:    637
 Blocpdb>    12 atoms in block     79
 Block first atom:    646
 Blocpdb>     5 atoms in block     80
 Block first atom:    658
 Blocpdb>     6 atoms in block     81
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    11 atoms in block     82
 Block first atom:    669
 Blocpdb>     7 atoms in block     83
 Block first atom:    680
 Blocpdb>     8 atoms in block     84
 Block first atom:    687
 Blocpdb>    10 atoms in block     85
 Block first atom:    695
 Blocpdb>     7 atoms in block     86
 Block first atom:    705
 Blocpdb>     7 atoms in block     87
 Block first atom:    712
 Blocpdb>     8 atoms in block     88
 Block first atom:    719
 Blocpdb>     6 atoms in block     89
 Block first atom:    727
 Blocpdb>     9 atoms in block     90
 Block first atom:    733
 Blocpdb>     7 atoms in block     91
 Block first atom:    742
 Blocpdb>     9 atoms in block     92
 Block first atom:    749
 Blocpdb>     8 atoms in block     93
 Block first atom:    758
 Blocpdb>     7 atoms in block     94
 Block first atom:    766
 Blocpdb>     9 atoms in block     95
 Block first atom:    773
 Blocpdb>    14 atoms in block     96
 Block first atom:    782
 Blocpdb>     8 atoms in block     97
 Block first atom:    795

 Blocpdb>    97 blocks.

 Blocpdb> At most,     14 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       268668 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       2409

 Prepmat> Matrix trace    =     586140.0000
 Prepmat> Last element read:    2409   2409         7.4168
 Prepmat>         4754 lines saved.
 Prepmat>         3692 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:   803
 RTB> Total mass =         803.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:   803
 RTB> Number of blocks =    97
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  128947.7524
 RTB>     36741 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      582
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    36741
 Diagstd> Projected matrix trace =  128947.7524

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    582 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 128947.7524
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      2.3354286      2.9111716      4.0000356      4.4869552
      5.8170561      7.7229685      8.4044214     10.0835209     11.4435735
     12.5384821     13.0032866     14.0961234     15.0400922     16.3628081
     16.8721673     17.5533895     18.5743493     19.4823198     20.1923909
     21.4421448     22.9002784     23.8619818     24.6948341     25.5039332
     26.5627880     27.3731945     28.1752957     29.2003701     30.9334003
     32.2521667     33.1169409     34.2937575     36.2037062     37.0171305
     39.3902646     39.8979129     41.4714602     43.2445065     44.6888597
     45.2388265     45.4557259     47.1422794     48.1349778     48.7274890
     50.8239981     51.2660014     52.5549929     53.4821340     54.8190357
     55.0548995     55.7504511     57.3750529     57.6740431     58.9443791
     60.0728345     61.0258661     64.8201779     65.2284697     65.6781034
     67.5798623     70.3401267     71.3354850     72.0645586     72.9775540
     73.7126293     74.7419460     76.3276733     78.6132649     78.9117770
     78.9898007     79.7212325     80.5823153     82.1442050     82.2597943
     82.6818534     83.5491603     84.0779325     85.1358001     87.2079333
     87.5657148     89.5101148     91.2491375     92.2241870     92.5965593
     93.2369138     94.1282365     95.3550459     96.7261667     97.6666279
     99.0304585     99.6490006    100.5017968    100.5991040    101.1337254
    102.3089271    103.4344447    104.4280169    104.6022803    105.6725415
    107.6829524

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034325      0.0034330      0.0034336      0.0034336      0.0034344
      0.0034344    165.9505031    185.2802720    217.1836914    230.0229373
    261.9068801    301.7778855    314.8104865    344.8270934    367.3466733
    384.5189633    391.5812136    407.7041453    421.1342170    439.2625702
    446.0470972    454.9626822    468.0067150    479.3090335    487.9655397
    502.8395081    519.6556595    530.4549854    539.6327967    548.4017870
    559.6701034    568.1434729    576.4073658    586.7991260    603.9613001
    616.7011068    624.9141909    635.9204871    653.3889664    660.6883595
    681.5374570    685.9151088    699.3103301    714.1028278    725.9302881
    730.3834871    732.1323196    745.5908487    753.4000910    758.0228486
    774.1581555    777.5171959    787.2311513    794.1447046    804.0091221
    805.7369258    810.8107033    822.5396270    824.6800323    833.7128182
    841.6554549    848.3054479    874.2796900    877.0288409    880.0464227
    892.6967042    910.7451209    917.1663010    921.8412667    927.6623521
    932.3226425    938.8095108    948.7161468    962.8157745    964.6420555
    965.1188308    969.5769503    974.7991707    984.2008725    984.8930885
    987.4165040    992.5818396    995.7178485   1001.9623236   1014.0824750
   1016.1605463   1027.3805448   1037.3126268   1042.8400409   1044.9432501
   1048.5501943   1053.5502181   1060.3936539   1067.9902028   1073.1696372
   1080.6366068   1084.0061696   1088.6347505   1089.1616384   1092.0519106
   1098.3785558   1104.4037530   1109.6954252   1110.6209368   1116.2882580
   1126.8568719

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =    803
 Rtb_to_modes> Number of blocs =     97

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9914E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.335    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.911    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.000    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.487    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.817    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.723    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.404    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   96.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   99.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.7    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    582 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997
 1.00003 1.00000 1.00005 1.00001 1.00002
 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99996 1.00004 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00005 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00001 0.99998 0.99995 0.99998 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002
 0.99999 0.99995 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00004
 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 1.00002
 1.00005 1.00004 0.99999 0.99994 1.00003
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    14454 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997
 1.00003 1.00000 1.00005 1.00001 1.00002
 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99996 1.00004 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00005 0.99998 1.00001 1.00002
 1.00001 0.99998 0.99995 0.99998 0.99998
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002
 0.99999 0.99995 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00004
 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998
 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003 1.00002
 1.00005 1.00004 0.99999 0.99994 1.00003
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171651193055328.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171651193055328.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604171651193055328.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171651193055328.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =     97
            First residue number     =      0
            Last  residue number     =     96
            Number of atoms found    =    803
            Mean number per residue  =      8.3

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9914E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9943E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9976E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.335    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.911    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.000    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.487    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.817    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.723    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.404    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   96.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   99.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.7    

 Bfactors>  106 vectors,   2409 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     2.335000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.354 for     97 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.053 +/-   0.07
 Bfactors> =      9.171 +/-   7.73
 Bfactors> Shiftng-fct=      9.117
 Bfactors> Scaling-fct=    104.251

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171651193055328.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171651193055328.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4323E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   165.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   185.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   217.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   230.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   261.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   301.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   314.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   344.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   367.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   384.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   391.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   407.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   421.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   439.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   446.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   454.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   467.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   479.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   487.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   502.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   519.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   530.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   539.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   548.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   559.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   568.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   576.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   586.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   603.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   616.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   624.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   635.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   653.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   660.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   681.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   699.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   714.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   725.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   730.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   992.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   995.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1014.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1016.    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1027.    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1089.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1092.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1098.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1104.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1109.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1111.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1116.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1127.    

 Chkmod>  106 vectors,   2409 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:    803 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    33 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    37 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    43 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    90 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   101 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8430
      0.0034      0.8079
      0.0034      0.8195
      0.0034      0.7739
      0.0034      0.6871
      0.0034      0.6288
    165.9282      0.1658
    185.2669      0.2754
    217.1734      0.4450
    230.0142      0.1450
    261.8944      0.3109
    301.7655      0.2111
    314.7891      0.4497
    344.7521      0.1692
    367.2735      0.1245
    384.5257      0.0531
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    421.1148      0.1248
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    454.8992      0.1649
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    559.6167      0.0765
    568.0859      0.2033
    576.4307      0.1164
    586.7702      0.1547
    603.9022      0.2655
    616.6539      0.2749
    624.9162      0.4676
    635.8584      0.3769
    653.3275      0.4298
    660.6856      0.1124
    681.5059      0.1148
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    714.0350      0.4141
    725.9084      0.4618
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    803.9817      0.4421
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   1080.5877      0.3611
   1083.9651      0.4104
   1088.5783      0.3744
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   1098.2835      0.2920
   1104.1724      0.3664
   1109.4989      0.4217
   1110.5612      0.4086
   1116.3854      0.3897
   1126.8977      0.4106
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171651193055328 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2604171651193055328.eigenfacs
2604171651193055328.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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2604171651193055328.atom
making animated gifs
11 models are in 2604171651193055328.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171651193055328.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171651193055328.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171651193055328 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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11 models are in 2604171651193055328.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171651193055328.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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11 models are in 2604171651193055328.8.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2604171651193055328.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
getting mode 10
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171651193055328.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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2604171651193055328.8.pdb
2604171651193055328.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m2.897s
user	0m2.877s
sys	0m0.018s
rm: cannot remove '2604171651193055328.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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