CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
 elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TRANSCRIPTION 01-DEC-01 1KHX  ***

CA distance fluctuations for 2604171658123059867

---  normal mode 10  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
CYS 463 0.37 PRO 265 -0.38 MET 466
CYS 463 0.36 VAL 266 -0.28 MET 466
CYS 463 0.33 THR 267 -0.23 SER 464
CYS 463 0.25 TYR 268 -0.27 SER 464
CYS 463 0.23 SER 269 -0.25 SER 464
CYS 463 0.15 GLU 270 -0.28 SER 464
PRO 459 0.12 PRO 271 -0.29 SER 464
CYS 463 0.13 ALA 272 -0.26 SER 464
PRO 459 0.12 PHE 273 -0.31 SER 464
PRO 459 0.10 TRP 274 -0.36 SER 464
PRO 459 0.10 CYS 275 -0.41 SER 464
PRO 459 0.12 SER 276 -0.41 SER 464
MET 466 0.14 ILE 277 -0.45 SER 464
MET 466 0.17 ALA 278 -0.47 SER 464
MET 466 0.19 TYR 279 -0.47 SER 464
MET 466 0.22 TYR 280 -0.51 SER 464
MET 466 0.23 GLU 281 -0.50 SER 464
MET 466 0.24 LEU 282 -0.56 SER 464
MET 466 0.27 ASN 283 -0.60 SER 464
MET 466 0.28 GLN 284 -0.52 SER 464
MET 466 0.25 ARG 285 -0.48 SER 464
MET 466 0.23 VAL 286 -0.41 SER 464
MET 466 0.21 GLY 287 -0.36 SER 464
MET 466 0.19 GLU 288 -0.33 SER 464
MET 466 0.16 THR 289 -0.37 SER 464
MET 466 0.14 PHE 290 -0.35 SER 464
PRO 459 0.13 HIS 291 -0.33 SER 464
PRO 459 0.10 ALA 292 -0.33 SER 464
PRO 459 0.11 SER 293 -0.29 SER 464
GLU 270 0.08 GLN 294 -0.30 SER 464
GLU 270 0.10 PRO 295 -0.33 SER 464
MET 466 0.08 SER 296 -0.34 SER 464
MET 466 0.10 LEU 297 -0.35 SER 464
MET 466 0.11 THR 298 -0.37 SER 464
MET 466 0.13 VAL 299 -0.40 SER 464
MET 466 0.14 ASP 300 -0.38 SER 464
MET 466 0.15 GLY 301 -0.37 SER 464
MET 466 0.15 PHE 302 -0.33 SER 464
MET 466 0.15 THR 303 -0.29 SER 464
MET 466 0.14 ASP 304 -0.27 SER 464
MET 466 0.14 PRO 305 -0.26 SER 464
MET 466 0.12 SER 306 -0.24 SER 464
MET 466 0.11 ASN 307 -0.26 SER 464
MET 466 0.10 SER 308 -0.27 SER 464
MET 466 0.10 GLU 309 -0.30 SER 464
MET 466 0.12 ARG 310 -0.32 SER 464
MET 466 0.14 PHE 311 -0.35 SER 464
MET 466 0.15 CYS 312 -0.34 SER 464
MET 466 0.17 LEU 313 -0.37 SER 464
MET 466 0.17 GLY 314 -0.34 SER 464
MET 466 0.17 LEU 315 -0.31 SER 464
MET 466 0.19 LEU 316 -0.33 SER 464
MET 466 0.21 SER 317 -0.32 SER 464
MET 466 0.23 ASN 318 -0.34 SER 464
MET 466 0.24 VAL 319 -0.31 SER 464
MET 466 0.26 ASN 320 -0.36 SER 464
MET 466 0.24 ARG 321 -0.39 SER 464
MET 466 0.23 ASN 322 -0.41 SER 464
MET 466 0.21 ALA 323 -0.40 CYS 463
MET 466 0.21 THR 324 -0.46 CYS 463
MET 466 0.21 VAL 325 -0.44 SER 464
MET 466 0.20 GLU 326 -0.39 SER 464
MET 466 0.18 MET 327 -0.40 SER 464
MET 466 0.18 THR 328 -0.44 SER 464
MET 466 0.18 ARG 329 -0.41 SER 464
MET 466 0.16 ARG 330 -0.38 SER 464
MET 466 0.15 HIS 331 -0.40 SER 464
MET 466 0.15 ILE 332 -0.41 SER 464
MET 466 0.14 GLY 333 -0.38 SER 464
MET 466 0.12 ARG 334 -0.37 SER 464
MET 466 0.13 GLY 335 -0.41 SER 464
MET 466 0.12 VAL 336 -0.43 SER 464
MET 466 0.10 ARG 337 -0.40 SER 464
MET 466 0.09 LEU 338 -0.42 SER 464
MET 466 0.07 TYR 339 -0.39 SER 464
GLU 270 0.09 TYR 340 -0.38 SER 464
PRO 265 0.10 ILE 341 -0.36 SER 464
PRO 265 0.14 GLY 342 -0.35 SER 464
PRO 265 0.12 GLY 343 -0.39 SER 464
PRO 265 0.09 GLU 344 -0.42 SER 464
MET 466 0.06 VAL 345 -0.44 SER 464
MET 466 0.08 PHE 346 -0.44 SER 464
MET 466 0.09 ALA 347 -0.46 SER 464
MET 466 0.10 GLU 348 -0.43 SER 464
MET 466 0.11 CYS 349 -0.43 SER 464
MET 466 0.11 LEU 350 -0.40 SER 464
MET 466 0.12 SER 351 -0.41 SER 464
MET 466 0.12 ASP 352 -0.40 SER 464
MET 466 0.13 SER 353 -0.44 SER 464
MET 466 0.13 ALA 354 -0.47 SER 464
MET 466 0.13 ILE 355 -0.50 SER 464
MET 466 0.13 PHE 356 -0.55 SER 464
MET 466 0.12 VAL 357 -0.58 SER 464
MET 466 0.12 GLN 358 -0.64 SER 464
MET 466 0.10 SER 359 -0.62 SER 464
MET 466 0.09 PRO 360 -0.67 SER 464
MET 466 0.06 ASN 361 -0.60 SER 464
MET 466 0.07 CYS 362 -0.57 SER 464
MET 466 0.08 ASN 363 -0.62 SER 464
MET 466 0.05 GLN 364 -0.62 SER 464
MET 466 0.04 ARG 365 -0.55 SER 464
MET 466 0.06 TYR 366 -0.57 CYS 463
MET 466 0.05 GLY 367 -0.66 CYS 463
MET 466 0.08 TRP 368 -0.72 CYS 463
MET 466 0.09 HIS 369 -0.82 CYS 463
MET 466 0.10 PRO 370 -0.77 CYS 463
MET 466 0.13 ALA 371 -0.81 CYS 463
MET 466 0.12 THR 372 -0.75 CYS 463
MET 466 0.12 VAL 373 -0.67 CYS 463
MET 466 0.11 CYS 374 -0.60 CYS 463
MET 466 0.11 LYS 375 -0.56 CYS 463
MET 466 0.11 ILE 376 -0.49 SER 464
MET 466 0.11 PRO 377 -0.46 SER 464
MET 466 0.11 PRO 378 -0.43 SER 464
MET 466 0.10 GLY 379 -0.40 SER 464
MET 466 0.09 CYS 380 -0.43 SER 464
MET 466 0.09 ASN 381 -0.44 SER 464
MET 466 0.08 LEU 382 -0.48 SER 464
MET 466 0.07 LYS 383 -0.47 SER 464
MET 466 0.08 ILE 384 -0.52 SER 464
MET 466 0.06 PHE 385 -0.51 SER 464
PRO 265 0.07 ASN 386 -0.47 SER 464
PRO 265 0.09 ASN 387 -0.45 SER 464
PRO 265 0.13 GLN 388 -0.43 SER 464
PRO 265 0.09 GLU 389 -0.48 SER 464
PRO 265 0.07 PHE 390 -0.51 SER 464
PRO 265 0.11 ALA 391 -0.45 SER 464
PRO 265 0.11 ALA 392 -0.45 SER 464
PRO 265 0.06 LEU 393 -0.52 SER 464
PRO 265 0.06 LEU 394 -0.51 SER 464
PRO 265 0.11 ALA 395 -0.43 SER 464
PRO 265 0.08 GLN 396 -0.46 SER 464
ARG 410 0.05 SER 397 -0.54 SER 464
GLY 457 0.07 VAL 398 -0.47 SER 464
GLY 457 0.06 ASN 399 -0.45 VAL 461
ALA 404 0.06 GLN 400 -0.56 VAL 461
GLY 457 0.08 GLY 401 -0.53 SER 464
ALA 272 0.05 PHE 402 -0.63 SER 464
GLU 288 0.07 GLU 403 -0.77 SER 464
GLN 400 0.06 ALA 404 -0.70 SER 464
THR 289 0.04 VAL 405 -0.65 SER 464
ASN 443 0.07 TYR 406 -0.77 SER 464
MET 466 0.08 GLN 407 -0.84 SER 464
MET 466 0.04 LEU 408 -0.70 SER 464
SER 460 0.06 THR 409 -0.70 SER 464
MET 466 0.10 ARG 410 -0.75 SER 464
MET 466 0.07 MET 411 -0.66 SER 464
MET 466 0.06 CYS 412 -0.59 SER 464
MET 466 0.10 THR 413 -0.63 SER 464
MET 466 0.12 ILE 414 -0.61 SER 464
MET 466 0.15 ARG 415 -0.62 SER 464
MET 466 0.15 MET 416 -0.56 SER 464
MET 466 0.16 SER 417 -0.55 SER 464
MET 466 0.16 PHE 418 -0.49 SER 464
MET 466 0.15 VAL 419 -0.48 SER 464
MET 466 0.16 LYS 420 -0.56 CYS 463
MET 466 0.15 GLY 421 -0.63 CYS 463
MET 466 0.16 TRP 422 -0.72 CYS 463
MET 466 0.15 GLY 423 -0.82 CYS 463
MET 466 0.13 ALA 424 -0.86 CYS 463
MET 466 0.13 GLU 425 -0.80 CYS 463
MET 466 0.15 TYR 426 -0.76 CYS 463
MET 466 0.17 ARG 427 -0.78 CYS 463
MET 466 0.19 ARG 428 -0.76 CYS 463
MET 466 0.18 GLN 429 -0.85 CYS 463
MET 466 0.20 THR 430 -0.79 CYS 463
MET 466 0.20 VAL 431 -0.68 SER 464
MET 466 0.23 THR 432 -0.66 SER 464
MET 466 0.22 SER 433 -0.66 CYS 463
MET 466 0.20 THR 434 -0.58 CYS 463
MET 466 0.21 PRO 435 -0.51 SER 464
MET 466 0.19 CYS 436 -0.50 SER 464
MET 466 0.18 TRP 437 -0.54 SER 464
MET 466 0.17 ILE 438 -0.52 SER 464
MET 466 0.16 GLU 439 -0.56 SER 464
MET 466 0.12 LEU 440 -0.52 SER 464
MET 466 0.10 HIS 441 -0.52 SER 464
PRO 459 0.08 LEU 442 -0.48 SER 464
PRO 459 0.11 ASN 443 -0.42 SER 464
PRO 459 0.07 GLY 444 -0.41 SER 464
GLY 343 0.06 PRO 445 -0.47 SER 464
PRO 459 0.10 LEU 446 -0.49 SER 464
PRO 459 0.10 GLN 447 -0.42 SER 464
GLY 343 0.08 TRP 448 -0.43 SER 464
PRO 459 0.05 LEU 449 -0.51 SER 464
PRO 459 0.11 ASP 450 -0.46 SER 464
CYS 463 0.13 LYS 451 -0.39 SER 464
ALA 391 0.06 VAL 452 -0.44 SER 464
SER 458 0.07 LEU 453 -0.51 SER 464
CYS 463 0.23 THR 454 -0.40 SER 464
CYS 463 0.21 GLN 455 -0.36 SER 464
GLY 457 0.14 MET 456 -0.45 SER 464
ARG 462 0.24 GLY 457 -0.42 SER 464
ARG 462 0.23 SER 458 -0.52 SER 464
GLU 288 0.14 PRO 459 -0.55 SER 464
GLU 288 0.16 SER 460 -0.27 ASN 399
MET 466 0.51 VAL 461 -0.56 GLN 400
VAL 266 0.29 ARG 462 -0.57 HIS 369
PRO 265 0.37 CYS 463 -0.86 ALA 424
VAL 461 0.20 SER 464 -0.84 GLN 407
VAL 461 0.51 MET 466 -0.38 PRO 265

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.