CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
 elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TRANSCRIPTION 01-DEC-01 1KHX  ***

CA distance fluctuations for 2604171658123059867

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ARG 285 0.01 PRO 265 -0.54 SER 464
ARG 285 0.01 VAL 266 -0.45 SER 464
ARG 285 0.01 THR 267 -0.37 SER 464
ARG 285 0.01 TYR 268 -0.27 SER 464
ALA 395 0.01 SER 269 -0.22 SER 464
VAL 461 0.01 GLU 270 -0.14 SER 464
ARG 462 0.02 PRO 271 -0.08 SER 464
ARG 462 0.02 ALA 272 -0.06 SER 464
CYS 463 0.08 PHE 273 -0.01 SER 460
MET 466 0.12 TRP 274 -0.00 SER 460
MET 466 0.20 CYS 275 -0.01 SER 460
MET 466 0.23 SER 276 -0.01 SER 460
MET 466 0.33 ILE 277 -0.01 SER 460
MET 466 0.40 ALA 278 -0.01 SER 460
MET 466 0.48 TYR 279 -0.01 SER 460
MET 466 0.59 TYR 280 -0.01 SER 460
MET 466 0.68 GLU 281 -0.01 SER 460
MET 466 0.80 LEU 282 -0.00 SER 460
MET 466 0.78 ASN 283 -0.01 SER 460
MET 466 0.66 GLN 284 -0.01 SER 460
MET 466 0.53 ARG 285 -0.01 SER 460
MET 466 0.48 VAL 286 -0.01 SER 460
MET 466 0.37 GLY 287 -0.01 SER 460
MET 466 0.27 GLU 288 -0.01 SER 460
MET 466 0.26 THR 289 -0.01 SER 460
MET 466 0.24 PHE 290 -0.01 SER 460
MET 466 0.16 HIS 291 -0.01 SER 460
MET 466 0.17 ALA 292 -0.01 SER 460
MET 466 0.09 SER 293 -0.01 GLU 270
MET 466 0.13 GLN 294 -0.01 GLU 270
MET 466 0.17 PRO 295 -0.01 GLU 270
MET 466 0.24 SER 296 -0.01 GLU 270
MET 466 0.27 LEU 297 -0.00 SER 460
MET 466 0.35 THR 298 -0.00 SER 460
MET 466 0.40 VAL 299 -0.00 SER 460
MET 466 0.43 ASP 300 -0.00 SER 460
MET 466 0.47 GLY 301 -0.00 SER 460
MET 466 0.41 PHE 302 -0.00 SER 460
MET 466 0.35 THR 303 -0.00 SER 460
MET 466 0.28 ASP 304 -0.00 SER 460
MET 466 0.24 PRO 305 -0.01 SER 460
MET 466 0.18 SER 306 -0.01 SER 460
MET 466 0.19 ASN 307 -0.00 SER 460
MET 466 0.16 SER 308 -0.00 SER 460
MET 466 0.22 GLU 309 -0.00 SER 460
MET 466 0.28 ARG 310 -0.00 SER 460
MET 466 0.32 PHE 311 -0.01 SER 460
MET 466 0.36 CYS 312 -0.00 SER 460
MET 466 0.44 LEU 313 -0.00 SER 460
MET 466 0.45 GLY 314 -0.00 SER 460
MET 466 0.39 LEU 315 -0.01 SER 460
MET 466 0.41 LEU 316 -0.01 SER 460
MET 466 0.45 SER 317 -0.01 SER 460
MET 466 0.52 ASN 318 -0.01 SER 460
MET 466 0.54 VAL 319 -0.01 SER 460
MET 466 0.63 ASN 320 -0.01 SER 460
MET 466 0.67 ARG 321 -0.00 SER 460
MET 466 0.76 ASN 322 -0.00 SER 460
MET 466 0.76 ALA 323 -0.00 SER 460
MET 466 0.80 THR 324 -0.00 SER 460
MET 466 0.73 VAL 325 -0.00 SER 460
MET 466 0.66 GLU 326 -0.00 SER 460
MET 466 0.70 MET 327 -0.00 SER 460
MET 466 0.69 THR 328 -0.00 SER 460
MET 466 0.61 ARG 329 -0.00 SER 460
MET 466 0.59 ARG 330 -0.00 SER 460
MET 466 0.61 HIS 331 -0.00 SER 460
MET 466 0.56 ILE 332 -0.00 SER 460
MET 466 0.50 GLY 333 -0.00 SER 460
MET 466 0.45 ARG 334 -0.00 SER 460
MET 466 0.49 GLY 335 -0.00 SER 460
MET 466 0.46 VAL 336 -0.00 SER 460
MET 466 0.38 ARG 337 -0.00 SER 460
MET 466 0.35 LEU 338 -0.00 SER 460
MET 466 0.28 TYR 339 -0.00 GLU 270
MET 466 0.24 TYR 340 -0.01 TRP 448
MET 466 0.21 ILE 341 -0.01 GLY 457
MET 466 0.16 GLY 342 -0.01 GLY 457
MET 466 0.18 GLY 343 -0.01 GLY 457
MET 466 0.26 GLU 344 -0.01 GLY 457
MET 466 0.31 VAL 345 -0.01 VAL 452
MET 466 0.37 PHE 346 -0.00 VAL 452
MET 466 0.43 ALA 347 -0.00 SER 460
MET 466 0.44 GLU 348 -0.00 GLU 270
MET 466 0.50 CYS 349 -0.00 SER 460
MET 466 0.47 LEU 350 -0.00 SER 460
MET 466 0.52 SER 351 -0.00 SER 460
MET 466 0.56 ASP 352 -0.00 SER 460
MET 466 0.62 SER 353 -0.00 SER 460
MET 466 0.64 ALA 354 -0.00 SER 460
MET 466 0.63 ILE 355 -0.00 SER 460
MET 466 0.67 PHE 356 -0.00 SER 460
MET 466 0.62 VAL 357 -0.00 SER 460
MET 466 0.64 GLN 358 -0.00 SER 460
MET 466 0.54 SER 359 -0.00 SER 460
MET 466 0.53 PRO 360 -0.00 LEU 393
MET 466 0.43 ASN 361 -0.00 LEU 393
MET 466 0.49 CYS 362 -0.00 ALA 392
MET 466 0.57 ASN 363 -0.00 GLN 396
MET 466 0.51 GLN 364 -0.01 GLN 396
MET 466 0.46 ARG 365 -0.01 GLY 457
MET 466 0.53 TYR 366 -0.00 ALA 392
MET 466 0.57 GLY 367 -0.01 GLN 396
MET 466 0.66 TRP 368 -0.00 GLN 396
MET 466 0.72 HIS 369 -0.00 GLN 396
MET 466 0.67 PRO 370 -0.00 GLN 396
MET 466 0.76 ALA 371 -0.00 GLN 396
MET 466 0.75 THR 372 -0.00 GLN 396
MET 466 0.74 VAL 373 -0.00 GLN 396
MET 466 0.67 CYS 374 -0.00 ALA 392
MET 466 0.67 LYS 375 -0.00 ALA 392
MET 466 0.59 ILE 376 -0.00 LYS 383
MET 466 0.60 PRO 377 -0.00 ALA 392
MET 466 0.55 PRO 378 -0.00 GLU 270
MET 466 0.49 GLY 379 -0.00 GLU 270
MET 466 0.50 CYS 380 -0.00 TRP 448
MET 466 0.46 ASN 381 -0.00 VAL 452
MET 466 0.47 LEU 382 -0.00 LYS 383
MET 466 0.41 LYS 383 -0.00 VAL 452
MET 466 0.43 ILE 384 -0.00 VAL 452
MET 466 0.35 PHE 385 -0.00 VAL 452
MET 466 0.29 ASN 386 -0.01 GLY 457
MET 466 0.21 ASN 387 -0.01 GLY 457
MET 466 0.19 GLN 388 -0.02 GLY 457
MET 466 0.27 GLU 389 -0.01 GLY 457
MET 466 0.24 PHE 390 -0.01 GLY 457
MET 466 0.15 ALA 391 -0.02 GLY 457
MET 466 0.18 ALA 392 -0.02 GLY 457
MET 466 0.24 LEU 393 -0.02 GLY 457
CYS 463 0.17 LEU 394 -0.02 GLY 457
VAL 461 0.13 ALA 395 -0.03 GLY 457
VAL 461 0.16 GLN 396 -0.03 GLY 457
CYS 463 0.20 SER 397 -0.02 GLY 457
VAL 461 0.16 VAL 398 -0.04 GLY 457
VAL 461 0.19 ASN 399 -0.03 GLY 457
VAL 461 0.26 GLN 400 -0.02 GLY 457
VAL 461 0.24 GLY 401 -0.03 GLY 457
VAL 461 0.19 PHE 402 -0.01 GLY 457
CYS 463 0.37 GLU 403 -0.02 SER 460
CYS 463 0.37 ALA 404 -0.01 SER 460
CYS 463 0.23 VAL 405 -0.01 GLY 457
CYS 463 0.30 TYR 406 -0.01 SER 460
CYS 463 0.46 GLN 407 -0.01 SER 460
CYS 463 0.34 LEU 408 -0.01 SER 460
CYS 463 0.33 THR 409 -0.01 SER 460
CYS 463 0.44 ARG 410 -0.01 SER 460
MET 466 0.38 MET 411 -0.00 SER 460
MET 466 0.31 CYS 412 -0.01 SER 460
MET 466 0.41 THR 413 -0.01 SER 460
MET 466 0.48 ILE 414 -0.01 SER 460
MET 466 0.57 ARG 415 -0.00 SER 460
MET 466 0.60 MET 416 -0.00 SER 460
MET 466 0.67 SER 417 -0.00 SER 460
MET 466 0.64 PHE 418 -0.00 SER 460
MET 466 0.70 VAL 419 -0.00 SER 460
MET 466 0.79 LYS 420 -0.00 SER 460
MET 466 0.82 GLY 421 -0.00 SER 460
MET 466 0.89 TRP 422 -0.00 SER 460
MET 466 0.94 GLY 423 -0.00 TRP 368
MET 466 0.96 ALA 424 -0.00 TYR 366
MET 466 0.96 GLU 425 -0.00 TYR 366
MET 466 0.97 TYR 426 -0.00 TYR 366
MET 466 1.06 ARG 427 -0.00 TYR 366
MET 466 1.02 ARG 428 -0.00 SER 460
MET 466 1.05 GLN 429 -0.00 THR 372
MET 466 0.96 THR 430 -0.00 THR 372
MET 466 0.83 VAL 431 -0.00 SER 460
MET 466 0.86 THR 432 -0.00 SER 460
MET 466 0.95 SER 433 -0.00 SER 460
MET 466 0.84 THR 434 -0.00 SER 460
MET 466 0.77 PRO 435 -0.00 SER 460
MET 466 0.67 CYS 436 -0.00 SER 460
MET 466 0.63 TRP 437 -0.00 SER 460
MET 466 0.53 ILE 438 -0.01 SER 460
MET 466 0.48 GLU 439 -0.01 SER 460
MET 466 0.38 LEU 440 -0.01 SER 460
MET 466 0.29 HIS 441 -0.01 SER 460
MET 466 0.23 LEU 442 -0.01 SER 460
CYS 463 0.12 ASN 443 -0.01 SER 460
CYS 463 0.09 GLY 444 -0.01 TYR 340
CYS 463 0.14 PRO 445 -0.01 GLY 457
CYS 463 0.13 LEU 446 -0.00 SER 460
VAL 461 0.03 GLN 447 -0.07 SER 464
VAL 461 0.06 TRP 448 -0.07 SER 464
CYS 463 0.09 LEU 449 -0.02 SER 464
VAL 461 0.03 ASP 450 -0.13 SER 464
VAL 461 0.03 LYS 451 -0.21 SER 464
VAL 461 0.06 VAL 452 -0.17 SER 464
VAL 461 0.05 LEU 453 -0.15 SER 464
ASN 283 0.01 THR 454 -0.32 SER 464
SER 460 0.03 GLN 455 -0.35 SER 464
VAL 461 0.05 MET 456 -0.25 SER 464
PRO 459 0.07 GLY 457 -0.37 SER 464
PRO 459 0.09 SER 458 -0.30 SER 464
SER 458 0.09 PRO 459 -0.07 SER 464
VAL 461 0.08 SER 460 -0.05 SER 464
GLU 403 0.32 VAL 461 -0.09 SER 458
THR 430 0.32 ARG 462 -0.24 SER 458
THR 430 0.58 CYS 463 -0.33 PRO 265
GLN 429 0.75 SER 464 -0.54 PRO 265
ARG 427 1.06 MET 466 -0.47 PRO 265

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.