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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* TRANSCRIPTION 01-DEC-01 1KHX *

LOGs for ID: 2604171658123059867

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604171658123059867.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604171658123059867.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604171658123059867.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    201
            First residue number     =    265
            Last  residue number     =    466
            Number of atoms found    =   1592
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    76.487298 +/-    10.710483 From:    45.925000 To:   100.361000
 =    93.431083 +/-    11.124135 From:    62.321000 To:   113.895000
 =    41.507731 +/-     8.585595 From:    16.976000 To:    60.956000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.9977 % Filled.
 Pdbmat>       570114  non-zero elements.
 Pdbmat>        62298 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     78.26 +/-     25.36
         Maximum number =    132
         Minimum number =      9

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.245960E+06
 Pdbmat> Larger element =  474.896    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
201 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604171658123059867.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604171658123059867.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171658123059867.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1592 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   201 residues.
 Blocpdb>    14 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    19 atoms in block      2
 Block first atom:     15
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     34
 Blocpdb>    12 atoms in block      4
 Block first atom:     49
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     61
 Blocpdb>    12 atoms in block      6
 Block first atom:     86
 Blocpdb>    13 atoms in block      7
 Block first atom:     98
 Blocpdb>    24 atoms in block      8
 Block first atom:    111
 Blocpdb>    17 atoms in block      9
 Block first atom:    135
 Blocpdb>    17 atoms in block     10
 Block first atom:    152
 Blocpdb>    18 atoms in block     11
 Block first atom:    169
 Blocpdb>    13 atoms in block     12
 Block first atom:    187
 Blocpdb>    18 atoms in block     13
 Block first atom:    200
 Blocpdb>    15 atoms in block     14
 Block first atom:    218
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    233
 Blocpdb>    13 atoms in block     16
 Block first atom:    248
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    261
 Blocpdb>    15 atoms in block     18
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    15 atoms in block     20
 Block first atom:    306
 Blocpdb>    13 atoms in block     21
 Block first atom:    321
 Blocpdb>    14 atoms in block     22
 Block first atom:    334
 Blocpdb>    20 atoms in block     23
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    17 atoms in block     24
 Block first atom:    368
 Blocpdb>    12 atoms in block     25
 Block first atom:    385
 Blocpdb>    16 atoms in block     26
 Block first atom:    397
 Blocpdb>    14 atoms in block     27
 Block first atom:    413
 Blocpdb>    15 atoms in block     28
 Block first atom:    427
 Blocpdb>    19 atoms in block     29
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    12 atoms in block     30
 Block first atom:    461
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    473
 Blocpdb>    15 atoms in block     32
 Block first atom:    489
 Blocpdb>    22 atoms in block     33
 Block first atom:    504
 Blocpdb>    18 atoms in block     34
 Block first atom:    526
 Blocpdb>    15 atoms in block     35
 Block first atom:    544
 Blocpdb>    11 atoms in block     36
 Block first atom:    559
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:    570
 Blocpdb>    24 atoms in block     38
 Block first atom:    589
 Blocpdb>    12 atoms in block     39
 Block first atom:    613
 Blocpdb>    13 atoms in block     40
 Block first atom:    625
 Blocpdb>    18 atoms in block     41
 Block first atom:    638
 Blocpdb>    14 atoms in block     42
 Block first atom:    656
 Blocpdb>    14 atoms in block     43
 Block first atom:    670
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    684
 Blocpdb>    11 atoms in block     45
 Block first atom:    698
 Blocpdb>    19 atoms in block     46
 Block first atom:    709
 Blocpdb>    16 atoms in block     47
 Block first atom:    728
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    744
 Blocpdb>    14 atoms in block     49
 Block first atom:    757
 Blocpdb>    17 atoms in block     50
 Block first atom:    771
 Blocpdb>    23 atoms in block     51
 Block first atom:    788
 Blocpdb>    18 atoms in block     52
 Block first atom:    811
 Blocpdb>    17 atoms in block     53
 Block first atom:    829
 Blocpdb>    12 atoms in block     54
 Block first atom:    846
 Blocpdb>    13 atoms in block     55
 Block first atom:    858
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    871
 Blocpdb>    14 atoms in block     57
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    10 atoms in block     58
 Block first atom:    902
 Blocpdb>    16 atoms in block     59
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    17 atoms in block     60
 Block first atom:    928
 Blocpdb>    19 atoms in block     61
 Block first atom:    945
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    964
 Blocpdb>    20 atoms in block     63
 Block first atom:    981
 Blocpdb>    10 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:   1011
 Blocpdb>    14 atoms in block     66
 Block first atom:   1027
 Blocpdb>    13 atoms in block     67
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    17 atoms in block     68
 Block first atom:   1054
 Blocpdb>    15 atoms in block     69
 Block first atom:   1071
 Blocpdb>    14 atoms in block     70
 Block first atom:   1086
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1100
 Blocpdb>    17 atoms in block     72
 Block first atom:   1119
 Blocpdb>    18 atoms in block     73
 Block first atom:   1136
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    15 atoms in block     75
 Block first atom:   1168
 Blocpdb>    19 atoms in block     76
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    17 atoms in block     77
 Block first atom:   1202
 Blocpdb>    16 atoms in block     78
 Block first atom:   1219
 Blocpdb>    18 atoms in block     79
 Block first atom:   1235
 Blocpdb>     9 atoms in block     80
 Block first atom:   1253
 Blocpdb>    21 atoms in block     81
 Block first atom:   1262
 Blocpdb>    22 atoms in block     82
 Block first atom:   1283
 Blocpdb>    16 atoms in block     83
 Block first atom:   1305
 Blocpdb>    14 atoms in block     84
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    13 atoms in block     85
 Block first atom:   1335
 Blocpdb>    13 atoms in block     86
 Block first atom:   1348
 Blocpdb>    22 atoms in block     87
 Block first atom:   1361
 Blocpdb>    17 atoms in block     88
 Block first atom:   1383
 Blocpdb>    18 atoms in block     89
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    12 atoms in block     90
 Block first atom:   1418
 Blocpdb>    15 atoms in block     91
 Block first atom:   1430
 Blocpdb>    23 atoms in block     92
 Block first atom:   1445
 Blocpdb>    16 atoms in block     93
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    16 atoms in block     94
 Block first atom:   1484
 Blocpdb>    15 atoms in block     95
 Block first atom:   1500
 Blocpdb>    17 atoms in block     96
 Block first atom:   1515
 Blocpdb>    10 atoms in block     97
 Block first atom:   1532
 Blocpdb>    13 atoms in block     98
 Block first atom:   1542
 Blocpdb>    18 atoms in block     99
 Block first atom:   1555
 Blocpdb>    12 atoms in block    100
 Block first atom:   1573
 Blocpdb>     8 atoms in block    101
 Block first atom:   1584

 Blocpdb>   101 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       570215 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4776

 Prepmat> Matrix trace    =    1245960.0000
 Prepmat> Last element read:    4776   4776        41.1475
 Prepmat>         5152 lines saved.
 Prepmat>         4162 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1592
 RTB> Total mass =        1592.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1592
 RTB> Number of blocks =   101
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  130672.6100
 RTB>     34089 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      606
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    34089
 Diagstd> Projected matrix trace =  130672.6100

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    606 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 130672.6100
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0868785      0.2189364      0.7127406      0.8889841
      1.4436972      1.5005167      1.8691673      2.7525838      3.0278211
      4.6375201      6.1387676      6.7879836      8.4764609      9.0351154
      9.4451482     10.4342305     11.4595980     12.9006763     14.0415182
     14.2768811     14.8658614     16.0372235     17.1935049     17.8721727
     18.4721477     19.0638375     19.5210527     20.6903553     22.7926365
     23.0719685     24.2336241     24.7101209     25.1878695     26.2416764
     26.9632478     28.4048936     29.3243281     30.0395281     31.1624909
     32.7729661     33.0968646     33.8067468     34.0388974     35.4980890
     36.9377240     37.4484545     38.0047016     38.8100103     39.1117160
     40.4229273     40.5700086     41.7293245     42.0863410     43.1774108
     44.1813284     44.7079565     44.9239838     47.0633794     47.6811843
     48.6973654     50.0786754     50.6474903     50.7324706     52.4252281
     53.3605281     53.7420889     54.6115163     55.0979743     56.3226655
     57.7959663     58.8598229     59.6838603     61.1019286     61.9543495
     62.1448655     63.2436970     63.5605664     64.0253404     65.9506875
     66.7895542     66.9463173     67.7171394     68.5493918     69.3061279
     70.0325518     70.8433580     71.4988230     72.8446851     72.9398692
     73.4575133     73.9709095     74.3739900     75.4095206     76.8401085
     77.8607306     79.6396617     79.8019453     80.7966245     81.3537948
     81.7833490

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034325      0.0034327      0.0034332      0.0034338      0.0034347
      0.0034354     32.0074692     50.8105924     91.6771372    102.3864014
    130.4768143    133.0196204    148.4633886    180.1629795    188.9558680
    233.8504350    269.0517832    282.9213171    316.1568252    326.4090052
    333.7333971    350.7724632    367.6037824    390.0331487    406.9137018
    410.3098584    418.6878130    434.8704228    450.2746410    459.0753311
    466.7173824    474.1332842    479.7852553    493.9457515    518.4329095
    521.6000271    534.5698544    539.7997952    544.9930917    556.2769545
    563.8731070    578.7511459    588.0433122    595.1710980    606.1936223
    621.6603303    624.7247424    631.3889407    633.5531024    646.9902962
    659.9793481    664.5263855    669.4435227    676.4990005    679.1234327
    690.4133181    691.6682336    701.4810733    704.4754534    713.5486326
    721.7963224    726.0853767    727.8374725    744.9666558    749.8403332
    757.7885054    768.4607612    772.8126904    773.4607619    786.2586648
    793.2413407    796.0723719    802.4858769    806.0520674    814.9611018
    825.5512608    833.1146197    838.9261518    848.8339466    854.7343959
    856.0475849    863.5826431    865.7433407    868.9028633    881.8707615
    887.4615634    888.5024427    893.6029261    899.0774043    904.0263688
    908.7517412    913.9971670    918.2157258    926.8174784    927.4228037
    930.7078811    933.9545871    936.4957715    942.9927854    951.8954806
    958.1963619    969.0807877    970.0676442    976.0945523    979.4543244
    982.0367169

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1592
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    101

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9913E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9927E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9957E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  8.6878E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2189    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7127    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8890    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.444    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.501    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.869    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.753    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.028    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.638    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.139    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.788    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.476    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.035    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.445    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.78    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    606 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 0.99998 1.00004 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00002 1.00001 0.99995 1.00006
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 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003
 0.99996 1.00005 1.00000 1.00004 1.00000
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 1.00001 1.00002 1.00004 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99995 1.00000 0.99999
 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
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 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99996 1.00005 1.00000 0.99999 0.99996
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 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    28656 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 0.99998 1.00004 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00002 1.00001 0.99995 1.00006
 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00003
 0.99996 1.00005 1.00000 1.00004 1.00000
 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00002 1.00004 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00002 0.99995 1.00000 0.99999
 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99996 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000
 1.00003 1.00003 0.99999 1.00003 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
 0.99996 1.00005 1.00000 0.99999 0.99996
 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171658123059867.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171658123059867.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604171658123059867.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604171658123059867.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    201
            First residue number     =    265
            Last  residue number     =    466
            Number of atoms found    =   1592
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9913E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9927E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9957E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  8.6878E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2189    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7127    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8890    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.444    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.501    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.869    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.753    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.028    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.638    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.139    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.788    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.476    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.035    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.445    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.78    

 Bfactors>  106 vectors,   4776 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.086878
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.072 for    201 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.218 +/-   1.52
 Bfactors> =     20.324 +/-   8.45
 Bfactors> Shiftng-fct=     20.107
 Bfactors> Scaling-fct=      5.541

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604171658123059867.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604171658123059867.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4323E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4326E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4352E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   32.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   50.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   91.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   102.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   130.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   133.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   148.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   180.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   189.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   233.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   269.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   282.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   316.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   326.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   333.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   350.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   367.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   390.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   406.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   410.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   418.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   434.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   450.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   459.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   466.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   474.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   479.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   493.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   518.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   521.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   534.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   539.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   545.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   556.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   563.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   578.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   588.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   951.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   958.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   969.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   970.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   976.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   979.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   982.0    

 Chkmod>  106 vectors,   4776 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1592 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    10 is:   1.0002 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    52 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    56 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8233
      0.0034      0.8601
      0.0034      0.6743
      0.0034      0.8459
      0.0034      0.7266
      0.0034      0.8660
     32.0060      0.0197
     50.8042      0.0355
     91.6706      0.0198
    102.3829      0.0360
    130.4849      0.0412
    133.0353      0.1045
    148.4504      0.0122
    180.1689      0.3646
    188.9533      0.2723
    233.8525      0.2483
    269.0453      0.1930
    282.9095      0.0383
    316.1347      0.2096
    326.3929      0.3671
    333.7165      0.1411
    350.6863      0.0626
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    390.0062      0.4598
    406.8742      0.3620
    410.3371      0.1669
    418.7281      0.1921
    434.8894      0.4005
    450.2094      0.1697
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    474.0652      0.4685
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    518.3807      0.3644
    521.5554      0.3477
    534.5069      0.5882
    539.7753      0.2887
    544.9927      0.5429
    556.2353      0.4162
    563.8149      0.2689
    578.6764      0.2786
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    606.1434      0.3840
    621.6055      0.4254
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    979.3894      0.4634
    981.9745      0.4959
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171658123059867 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2604171658123059867.eigenfacs
2604171658123059867.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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2604171658123059867.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=60
2604171658123059867.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 2604171658123059867.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171658123059867 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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2604171658123059867.atom
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calculating perturbed structure for DQ=20
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604171658123059867 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2604171658123059867.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2604171658123059867.11.pdb
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2604171658123059867.8.pdb
2604171658123059867.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m4.128s
user	0m4.074s
sys	0m0.051s
rm: cannot remove '2604171658123059867.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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