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* 5HT2AR_elNemo_NMA *

LOGs for ID: 2604181804313498919

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2604181804313498919.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2604181804313498919.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2604181804313498919.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    262
            First residue number     =     78
            Last  residue number     =    393
            Number of atoms found    =   4238
            Mean number per residue  =     16.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   113.613095 +/-     8.782029 From:    92.617000 To:   136.590000
 =   110.722176 +/-    10.378891 From:    83.779000 To:   134.611000
 =   132.616859 +/-    14.471354 From:   103.241000 To:   164.296000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.5306 % Filled.
 Pdbmat>      2853719  non-zero elements.
 Pdbmat>       314304 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    148.33 +/-     41.07
         Maximum number =    235
         Minimum number =     27

 Pdbmat> Matrix trace   = 6.286080E+06
 Pdbmat> Larger element =  875.540    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
262 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2604181804313498919.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2604181804313498919.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604181804313498919.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4238 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   262 residues.
 Blocpdb>    31 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    33 atoms in block      2
 Block first atom:     32
 Blocpdb>    26 atoms in block      3
 Block first atom:     65
 Blocpdb>    35 atoms in block      4
 Block first atom:     91
 Blocpdb>    38 atoms in block      5
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    33 atoms in block      6
 Block first atom:    164
 Blocpdb>    17 atoms in block      7
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    214
 Blocpdb>    35 atoms in block      9
 Block first atom:    247
 Blocpdb>    36 atoms in block     10
 Block first atom:    282
 Blocpdb>    26 atoms in block     11
 Block first atom:    318
 Blocpdb>    30 atoms in block     12
 Block first atom:    344
 Blocpdb>    37 atoms in block     13
 Block first atom:    374
 Blocpdb>    41 atoms in block     14
 Block first atom:    411
 Blocpdb>    31 atoms in block     15
 Block first atom:    452
 Blocpdb>    24 atoms in block     16
 Block first atom:    483
 Blocpdb>    35 atoms in block     17
 Block first atom:    507
 Blocpdb>    39 atoms in block     18
 Block first atom:    542
 Blocpdb>    28 atoms in block     19
 Block first atom:    581
 Blocpdb>    29 atoms in block     20
 Block first atom:    609
 Blocpdb>    29 atoms in block     21
 Block first atom:    638
 Blocpdb>    29 atoms in block     22
 Block first atom:    667
 Blocpdb>    38 atoms in block     23
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    27 atoms in block     24
 Block first atom:    734
 Blocpdb>    35 atoms in block     25
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    31 atoms in block     26
 Block first atom:    796
 Blocpdb>    27 atoms in block     27
 Block first atom:    827
 Blocpdb>    36 atoms in block     28
 Block first atom:    854
 Blocpdb>    33 atoms in block     29
 Block first atom:    890
 Blocpdb>    40 atoms in block     30
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    28 atoms in block     31
 Block first atom:    963
 Blocpdb>    48 atoms in block     32
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    33 atoms in block     33
 Block first atom:   1039
 Blocpdb>    25 atoms in block     34
 Block first atom:   1072
 Blocpdb>    41 atoms in block     35
 Block first atom:   1097
 Blocpdb>    21 atoms in block     36
 Block first atom:   1138
 Blocpdb>    40 atoms in block     37
 Block first atom:   1159
 Blocpdb>    40 atoms in block     38
 Block first atom:   1199
 Blocpdb>    31 atoms in block     39
 Block first atom:   1239
 Blocpdb>    35 atoms in block     40
 Block first atom:   1270
 Blocpdb>    31 atoms in block     41
 Block first atom:   1305
 Blocpdb>    24 atoms in block     42
 Block first atom:   1336
 Blocpdb>    30 atoms in block     43
 Block first atom:   1360
 Blocpdb>    34 atoms in block     44
 Block first atom:   1390
 Blocpdb>    30 atoms in block     45
 Block first atom:   1424
 Blocpdb>    29 atoms in block     46
 Block first atom:   1454
 Blocpdb>    30 atoms in block     47
 Block first atom:   1483
 Blocpdb>    36 atoms in block     48
 Block first atom:   1513
 Blocpdb>    37 atoms in block     49
 Block first atom:   1549
 Blocpdb>    29 atoms in block     50
 Block first atom:   1586
 Blocpdb>    31 atoms in block     51
 Block first atom:   1615
 Blocpdb>    33 atoms in block     52
 Block first atom:   1646
 Blocpdb>    34 atoms in block     53
 Block first atom:   1679
 Blocpdb>    35 atoms in block     54
 Block first atom:   1713
 Blocpdb>    34 atoms in block     55
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    35 atoms in block     56
 Block first atom:   1782
 Blocpdb>    36 atoms in block     57
 Block first atom:   1817
 Blocpdb>    30 atoms in block     58
 Block first atom:   1853
 Blocpdb>    41 atoms in block     59
 Block first atom:   1883
 Blocpdb>    38 atoms in block     60
 Block first atom:   1924
 Blocpdb>    26 atoms in block     61
 Block first atom:   1962
 Blocpdb>    38 atoms in block     62
 Block first atom:   1988
 Blocpdb>    30 atoms in block     63
 Block first atom:   2026
 Blocpdb>    23 atoms in block     64
 Block first atom:   2056
 Blocpdb>    30 atoms in block     65
 Block first atom:   2079
 Blocpdb>    31 atoms in block     66
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    33 atoms in block     67
 Block first atom:   2140
 Blocpdb>    36 atoms in block     68
 Block first atom:   2173
 Blocpdb>    26 atoms in block     69
 Block first atom:   2209
 Blocpdb>    29 atoms in block     70
 Block first atom:   2235
 Blocpdb>    23 atoms in block     71
 Block first atom:   2264
 Blocpdb>    38 atoms in block     72
 Block first atom:   2287
 Blocpdb>    42 atoms in block     73
 Block first atom:   2325
 Blocpdb>    22 atoms in block     74
 Block first atom:   2367
 Blocpdb>    22 atoms in block     75
 Block first atom:   2389
 Blocpdb>    38 atoms in block     76
 Block first atom:   2411
 Blocpdb>    22 atoms in block     77
 Block first atom:   2449
 Blocpdb>    26 atoms in block     78
 Block first atom:   2471
 Blocpdb>    36 atoms in block     79
 Block first atom:   2497
 Blocpdb>    38 atoms in block     80
 Block first atom:   2533
 Blocpdb>    18 atoms in block     81
 Block first atom:   2571
 Blocpdb>    36 atoms in block     82
 Block first atom:   2589
 Blocpdb>    31 atoms in block     83
 Block first atom:   2625
 Blocpdb>    39 atoms in block     84
 Block first atom:   2656
 Blocpdb>    33 atoms in block     85
 Block first atom:   2695
 Blocpdb>    33 atoms in block     86
 Block first atom:   2728
 Blocpdb>    33 atoms in block     87
 Block first atom:   2761
 Blocpdb>    33 atoms in block     88
 Block first atom:   2794
 Blocpdb>    41 atoms in block     89
 Block first atom:   2827
 Blocpdb>    33 atoms in block     90
 Block first atom:   2868
 Blocpdb>    41 atoms in block     91
 Block first atom:   2901
 Blocpdb>    30 atoms in block     92
 Block first atom:   2942
 Blocpdb>    17 atoms in block     93
 Block first atom:   2972
 Blocpdb>    30 atoms in block     94
 Block first atom:   2989
 Blocpdb>    29 atoms in block     95
 Block first atom:   3019
 Blocpdb>    39 atoms in block     96
 Block first atom:   3048
 Blocpdb>    21 atoms in block     97
 Block first atom:   3087
 Blocpdb>    38 atoms in block     98
 Block first atom:   3108
 Blocpdb>    26 atoms in block     99
 Block first atom:   3146
 Blocpdb>    35 atoms in block    100
 Block first atom:   3172
 Blocpdb>    40 atoms in block    101
 Block first atom:   3207
 Blocpdb>    39 atoms in block    102
 Block first atom:   3247
 Blocpdb>    32 atoms in block    103
 Block first atom:   3286
 Blocpdb>    41 atoms in block    104
 Block first atom:   3318
 Blocpdb>    25 atoms in block    105
 Block first atom:   3359
 Blocpdb>    40 atoms in block    106
 Block first atom:   3384
 Blocpdb>    33 atoms in block    107
 Block first atom:   3424
 Blocpdb>    33 atoms in block    108
 Block first atom:   3457
 Blocpdb>    27 atoms in block    109
 Block first atom:   3490
 Blocpdb>    35 atoms in block    110
 Block first atom:   3517
 Blocpdb>    33 atoms in block    111
 Block first atom:   3552
 Blocpdb>    25 atoms in block    112
 Block first atom:   3585
 Blocpdb>    27 atoms in block    113
 Block first atom:   3610
 Blocpdb>    35 atoms in block    114
 Block first atom:   3637
 Blocpdb>    17 atoms in block    115
 Block first atom:   3672
 Blocpdb>    38 atoms in block    116
 Block first atom:   3689
 Blocpdb>    30 atoms in block    117
 Block first atom:   3727
 Blocpdb>    36 atoms in block    118
 Block first atom:   3757
 Blocpdb>    43 atoms in block    119
 Block first atom:   3793
 Blocpdb>    28 atoms in block    120
 Block first atom:   3836
 Blocpdb>    30 atoms in block    121
 Block first atom:   3864
 Blocpdb>    21 atoms in block    122
 Block first atom:   3894
 Blocpdb>    30 atoms in block    123
 Block first atom:   3915
 Blocpdb>    33 atoms in block    124
 Block first atom:   3945
 Blocpdb>    37 atoms in block    125
 Block first atom:   3978
 Blocpdb>    33 atoms in block    126
 Block first atom:   4015
 Blocpdb>    34 atoms in block    127
 Block first atom:   4048
 Blocpdb>    36 atoms in block    128
 Block first atom:   4082
 Blocpdb>    45 atoms in block    129
 Block first atom:   4118
 Blocpdb>    21 atoms in block    130
 Block first atom:   4163
 Blocpdb>    31 atoms in block    131
 Block first atom:   4184
 Blocpdb>    24 atoms in block    132
 Block first atom:   4214

 Blocpdb>   132 blocks.

 Blocpdb> At most,     48 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    17 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      2853851 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      12714

 Prepmat> Matrix trace    =    6286080.0000
 Prepmat> Last element read:   12714  12714       307.9592
 Prepmat>         8779 lines saved.
 Prepmat>         7329 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4238
 RTB> Total mass =        4238.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4238
 RTB> Number of blocks =   132
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  325395.4599
 RTB>     50184 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      792
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    50184
 Diagstd> Projected matrix trace =  325395.4599

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    792 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 325395.4599
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      4.6668011      5.4935634      6.4521643      8.2870971
      8.7309943     10.8502067     13.3691809     16.3640474     18.5266282
     19.1617098     20.6910931     21.6290734     22.3783481     23.5642148
     26.0878445     26.9239349     28.6024512     30.4400358     31.4105142
     33.0318514     34.2767237     36.5741985     37.5431593     39.7804003
     41.2046698     41.3552374     43.1409805     45.2676943     47.3706755
     49.0762268     50.1456584     52.0875864     52.2184206     54.9474331
     55.7218151     57.0043554     57.9035377     58.7733581     63.7665959
     64.0384951     64.8075413     66.1230262     67.4015602     68.7275163
     70.8753663     71.3996282     75.7811150     76.5815940     77.2517866
     78.2576293     79.2165867     81.5643904     82.8193917     84.2408655
     85.5693251     86.3994484     87.8848390     88.2441236     90.6660952
     91.7754671     94.2792628     95.2852447     97.1789114     98.1051421
     98.2567131    100.3963234    101.3912769    102.1171649    103.1080582
    104.7846294    106.1490138    108.2931593    109.8221181    110.7518428
    111.5442576    114.4040544    114.9450092    117.6868001    118.7294998
    118.9480893    121.1628392    122.7741313    124.3133354    124.5411945
    126.5412344    127.9829306    130.3495077    131.4684631    132.6114800
    134.1848776    137.0094689    137.8120246    138.3440515    140.5180872
    140.9773863    142.6101326    144.0202295    144.7829255    146.6704956
    148.1839218

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034304      0.0034330      0.0034333      0.0034340      0.0034344
      0.0034345    234.5875313    254.5202560    275.8341229    312.6054126
    320.8685368    357.6961666    397.0522674    439.2792044    467.4051291
    475.3488080    493.9545587    505.0265812    513.6996773    527.1348955
    554.6440756    563.4618881    580.7602816    599.1255759    608.6011987
    624.1108583    635.7625358    656.7236998    665.3661284    684.9042400
    697.0573318    698.3297421    713.2475460    730.6164854    747.3947949
    760.7305597    768.9745194    783.7226478    784.7063123    804.9501486
    810.6024420    819.8781258    826.3191721    832.5024746    867.1453446
    868.9921214    874.1944661    883.0222379    891.5182851    900.2447661
    914.2036240    917.5785557    945.3133164    950.2928924    954.4420090
    960.6354829    966.5033042    980.7212323    988.2374287    996.6821728
   1004.5101597   1009.3708655   1018.0105082   1020.0892652   1033.9933278
   1040.2999605   1054.3950765   1060.0054719   1070.4867475   1075.5761559
   1076.4067094   1088.0633573   1093.4415595   1097.3487030   1102.6599080
   1111.5885665   1118.8020722   1130.0451408   1137.9945652   1142.8013922
   1146.8824020   1161.4913725   1164.2341658   1178.0376144   1183.2447856
   1184.3335039   1195.3084815   1203.2301761   1210.7490576   1211.8581662
   1221.5501842   1228.4890948   1239.7952781   1245.1052755   1250.5061768
   1257.9027526   1271.0732288   1274.7905540   1277.2488646   1287.2455373
   1289.3475744   1296.7924462   1303.1878719   1306.6339980   1315.1238685
   1321.8915380

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4238
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    132

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9794E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9944E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9960E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.667    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.494    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.452    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.287    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.731    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   94.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   95.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   102.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   104.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   106.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   108.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   110.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   114.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   117.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   118.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   118.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   121.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   122.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   124.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   124.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   126.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   130.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   131.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   132.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   134.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   137.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   137.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   138.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   140.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   141.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   142.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   144.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   144.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   146.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   148.2    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    792 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99996
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 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
 1.00004 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
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 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003
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 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002
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 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    76284 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
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 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
 1.00004 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001
 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604181804313498919.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604181804313498919.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2604181804313498919.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2604181804313498919.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    262
            First residue number     =     78
            Last  residue number     =    393
            Number of atoms found    =   4238
            Mean number per residue  =     16.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9794E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9944E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9960E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.667    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.494    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.452    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.287    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.731    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   94.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   95.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   102.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   104.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   106.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   108.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   110.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   114.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   117.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   118.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   118.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   121.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   124.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   124.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   126.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   130.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   132.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   134.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   137.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   137.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   138.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   140.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   141.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   142.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   144.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   144.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   146.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   148.2    

 Bfactors>  106 vectors,  12714 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     4.667000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.496 for    262 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.007 +/-   0.01
 Bfactors> =     32.500 +/-  15.26
 Bfactors> Shiftng-fct=     32.493
 Bfactors> Scaling-fct=   2036.475

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2604181804313498919.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2604181804313498919.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4303E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   234.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   254.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   275.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   312.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   320.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   357.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   397.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   439.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   467.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   475.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   493.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   505.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   513.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   527.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   554.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1322.    

 Chkmod>  106 vectors,  12714 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4238 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
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      0.0034      0.7641
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      0.0034      0.8954
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getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604181804313498919 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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2604181804313498919.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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calculating perturbed structure for DQ=100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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11 models are in 2604181804313498919.7.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604181804313498919 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
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getting mode 10
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generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604181804313498919 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2604181804313498919.8.pdb
2604181804313498919.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m14.322s
user	0m14.129s
sys	0m0.184s
rm: cannot remove '2604181804313498919.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Still some additional cleaning from time to time
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