*** hiv1_open_cutoff8_ca ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604200934113787483.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604200934113787483.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604200934113787483.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 15.029303 +/- 6.944924 From: 0.398000 To: 27.258000
= 32.184020 +/- 7.214204 From: 16.615000 To: 46.235000
= 12.970677 +/- 8.500155 From: -7.093000 To: 30.470000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 10.1078 % Filled.
Pdbmat> 4473 non-zero elements.
Pdbmat> 431 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 8.71 +/- 3.13
Maximum number = 15
Minimum number = 2
Pdbmat> Matrix trace = 8620.00
Pdbmat> Larger element = 63.4791
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 99 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 297
Diagstd> Number of non-zero elements 4473
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 8620.0000003
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 297
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 297 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 8620.0000003
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0198032 0.0339443
0.0510275 0.0564130 0.1140283 0.1487546 0.1535044
0.2013282 0.2253905 0.2374532 0.3189145 0.3479433
0.4577285 0.5295408 0.5940847 0.7278559 0.8827153
0.9588271 1.0812326 1.1279251 1.1643407 1.2876762
1.4192466 1.4401119 1.5842448 1.6002603 1.6217613
1.8144660 1.9201414 2.0189239 2.1165063 2.5049314
2.5563933 2.6459472 2.7219853 3.1386251 3.1836305
3.5257946 3.6025845 3.8601943 4.1988553 4.2807494
4.3886132 4.6119376 4.8200249 5.1176596 5.2321044
5.3215210 5.3959308 5.4497477 5.7020140 5.8595798
6.0304009 6.3160902 6.7746691 6.8941905 6.9594165
7.1985708 7.2935392 7.7018083 7.9335113 8.0652072
8.1306850 8.2675440 8.3646939 8.4490184 8.6737734
8.7911500 9.0847690 9.3012494 9.3542565 9.7508748
9.7819203 9.9064548 10.4256818 10.6548313 10.8539632
11.0825056 11.3116053 11.4390535 11.4779811 11.9128534
12.1308344 12.2802016 12.4472462 12.7297841 12.9955189
13.1622353 13.3105866 13.4738671 13.5938782 13.9184461
14.2527014 14.3620514 14.6005760 14.9105302 15.0557026
15.3366101 15.5059409 15.5603855 15.7629535 16.2039106
16.5158260 16.9169165 17.1154682 17.1725785 17.4681951
17.5838104 17.7409696 17.8484726 18.3183252 18.5191925
18.8561866 19.1127330 19.4354380 19.5979477 19.8690452
20.0252769 20.3116736 20.4560800 20.5341118 20.9080605
20.9850181 21.2403706 21.4534282 21.7578242 21.9285049
22.0969623 22.1950990 22.4749562 22.5048481 22.9348258
23.3025139 23.4314686 23.7169161 24.2925728 24.5094486
24.6603989 24.9039422 24.9511816 25.1367026 25.2516046
25.4653462 25.7698191 26.0380767 26.3756468 26.4998994
26.7202773 26.7492898 27.0524245 27.3046981 27.7314999
28.2742657 28.4827099 28.5727669 28.8397166 29.4098381
29.5847170 29.7971022 30.0135079 30.2640855 30.5332941
30.5575591 30.8622891 31.1765884 31.2704360 31.4044209
31.7461281 31.9420527 32.1296862 32.3897350 33.0087083
33.2552702 33.5791000 33.5997588 34.6128974 34.6649110
35.2028677 35.4248671 35.4859907 35.7122305 36.1656000
36.4415022 36.7015604 37.4611074 37.8234860 38.0274347
38.4494476 38.9546804 39.0781298 39.6087965 40.0397958
40.2431753 40.3524571 40.7427195 41.0781507 41.3686986
41.6889733 42.0170256 42.3499265 42.4303081 42.9004951
43.1242640 43.6879917 43.9253851 44.2971213 44.9766161
45.1689459 45.5606302 45.9846034 46.2015275 46.3883163
47.0382315 47.4142349 47.5955399 47.7906791 48.1714185
48.5451590 48.6450855 49.0654195 49.1976073 49.8368143
50.0167529 50.0973313 50.6494103 51.2661460 51.4480163
52.1103015 52.4253648 52.7712996 52.9291981 53.5518241
53.8700985 54.3942002 54.5314479 54.9693155 55.5997548
55.9574140 55.9939650 56.7272686 56.8540381 57.3420246
58.0409593 58.6677141 59.1530649 60.6473819 60.9024723
61.1357138 61.3359804 61.8887010 62.4101431 63.2517514
63.9749612 64.2470356 64.8575919 66.1898740 67.4071478
67.5206619 68.4503907 68.6943357 69.8505434 70.8561826
72.1994373 72.8529987 73.1093660 73.7216618 74.6688046
75.0347499 75.6029670 76.3698202 77.6941331 79.2997877
80.3756990 81.9400009 83.0188456 84.6574616 84.9227717
86.6452462 87.5478379 89.3880004 90.1194469 93.1470243
94.5779588 103.8886173
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the matrix is a hessien in CHARMM units):
0.0034144 0.0034178 0.0034204 0.0034233 0.0034275
0.0034292 0.0034331 0.0034336 0.0034340 0.0034362
0.0034384 0.0034411 0.0034443 15.2813767 20.0068359
24.5299855 25.7919835 36.6692090 41.8822998 42.5457007
48.7245234 51.5540847 52.9156664 61.3242714 64.0544775
73.4681753 79.0214478 83.6988424 92.6441459 102.0247641
106.3323570 112.9158335 115.3281746 117.1750949 123.2249421
129.3672120 130.3146975 136.6804589 137.3695868 138.2893521
146.2748611 150.4741454 154.2962091 157.9810762 171.8672793
173.6237427 176.6387044 179.1588083 192.3822507 193.7566471
203.9030780 206.1115679 213.3535434 222.5157384 224.6752246
227.4882315 233.2045342 238.4075037 245.6580387 248.3896417
250.5031387 252.2484256 253.5032189 259.3041219 262.8624282
266.6664453 272.9099957 282.6437091 285.1260643 286.4716805
291.3522805 293.2678407 301.3641803 305.8637461 308.3919588
309.6412751 312.2364055 314.0655541 315.6446313 319.8153592
321.9720157 327.3046867 331.1813897 332.1237379 339.0916305
339.6310122 341.7861117 350.6287419 354.4610906 357.7580816
361.5049598 365.2223958 367.2741200 367.8985126 374.8031037
378.2166277 380.5379969 383.1174387 387.4411987 391.4642370
393.9672367 396.1812136 398.6037780 400.3750144 405.1265035
409.9622559 411.5319126 414.9351964 419.3163765 421.3527129
425.2653201 427.6065434 428.3565933 431.1357915 437.1245518
441.3116877 446.6382196 449.2516410 450.0005399 453.8572712
455.3567477 457.3871467 458.7708427 464.7700804 467.3113224
471.5439900 474.7409306 478.7319874 480.7292827 484.0428169
485.9421215 489.4046987 491.1413359 492.0771978 496.5376159
497.4505948 500.4680137 502.9717940 506.5274808 508.5103432
510.4598253 511.5920929 514.8073124 515.1495487 520.0474882
524.1995797 525.6480230 528.8401123 535.2196342 537.6034546
539.2564259 541.9127017 542.4264257 544.4392583 545.6821789
547.9867694 551.2529992 554.1147760 557.6951142 559.0071885
561.3267779 561.6314359 564.8047971 567.4321904 571.8497827
577.4188371 579.5433586 580.4588397 583.1640916 588.9000576
590.6483426 592.7646492 594.9132742 597.3915263 600.0426369
600.2810183 603.2666929 606.3307237 607.2426244 608.5421644
611.8439389 613.7290647 615.5290043 618.0149453 623.8921847
626.2179625 629.2595370 629.4530763 638.8725931 639.3524374
644.2943187 646.3226786 646.8800349 648.9388401 653.0450137
655.5312739 657.8661566 664.6386398 667.8455815 669.6437120
673.3491758 677.7587035 678.8317797 683.4253810 687.1336347
688.8765490 689.8112492 693.1389230 695.9863500 698.4433872
701.1418339 703.8950853 706.6780640 707.3483958 711.2568011
713.1093459 717.7551557 719.7025959 722.7415654 728.2637097
729.8191558 732.9766531 736.3791833 738.1140078 739.6045689
744.7675961 747.7383475 749.1666038 750.7008046 753.6852184
756.6033227 757.3816277 760.6467924 761.6707379 766.6028280
767.9855120 768.6038860 772.8273393 777.5182922 778.8962217
783.8935181 786.2596899 788.8495369 790.0288257 794.6619425
797.0199003 800.8876151 801.8973807 805.1104153 809.7141310
812.3142992 812.5795553 817.8830666 818.7964263 822.3028430
827.2991365 831.7539338 835.1873472 845.6707493 847.4473808
849.0685877 850.4581279 854.2814257 857.8727435 863.6376318
868.5609418 870.4059023 874.5319692 883.4684755 891.5552382
892.3056149 898.4279327 900.0274274 907.5700901 914.0798924
922.7035397 926.8703649 928.4997456 932.3797624 938.3500461
940.6466213 944.2015306 948.9780437 957.1706936 967.0107287
973.5486563 982.9767877 989.4266990 999.1435780 1000.7079738
1010.8056259 1016.0568143 1026.6795025 1030.8715145 1048.0446202
1056.0640252 1106.8257731
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604200934113787483.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604200934113787483.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604200934113787483.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604200934113787483.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8862E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9060E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9213E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9626E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9720E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.281
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 13 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.019803
Bfactors> 93 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.309 for 99 C-alpha atoms.
Bfactors> = 29.284 +/- 52.49
Bfactors> = 31.076 +/- 10.13
Bfactors> Shiftng-fct= 1.792
Bfactors> Scaling-fct= 0.193
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604200934113787483.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604200934113787483.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4443E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Chkmod> That is: 99 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7085
0.0034 0.1150
0.0034 0.7149
0.0034 0.8351
0.0034 0.5226
0.0034 0.0789
0.0034 0.3808
0.0034 0.0425
0.0034 0.0303
0.0034 0.6507
0.0034 0.4282
0.0034 0.1017
0.0034 0.0358
15.2807 0.1868
20.0059 0.0902
24.5288 0.2934
25.7909 0.1802
36.6631 0.0572
41.8869 0.2931
42.5433 0.2591
48.7190 0.2315
51.5530 0.1442
52.9186 0.4048
61.3202 0.4919
64.0477 0.3558
73.4627 0.2305
79.0150 0.3110
83.6963 0.1755
92.6430 0.4031
102.0195 0.5549
106.3263 0.4673
112.8988 0.4998
115.3271 0.4309
117.1529 0.2915
123.2351 0.3719
129.3504 0.4711
130.3040 0.4003
136.6640 0.4163
137.3525 0.7341
138.2936 0.3844
146.2498 0.5591
150.4621 0.2990
154.2925 0.2424
157.9927 0.3008
171.8623 0.3089
173.6029 0.4331
176.6329 0.4352
179.1516 0.5279
192.3855 0.4863
193.7596 0.5740
203.9003 0.4249
206.1146 0.4215
213.3390 0.4721
222.5100 0.5093
224.6722 0.5507
227.4885 0.5188
233.1961 0.4646
238.3967 0.5100
245.6557 0.4033
248.3765 0.3051
250.5037 0.5250
252.2392 0.5341
253.4982 0.4445
259.2927 0.5629
262.8606 0.5646
266.6461 0.5587
272.8963 0.3482
282.6385 0.3623
285.1099 0.5370
286.4508 0.5657
291.3485 0.5039
293.2645 0.4915
301.3550 0.4869
305.8600 0.3916
308.3748 0.1662
309.6340 0.5166
312.2316 0.5888
314.0578 0.4637
315.6307 0.4330
319.8058 0.6079
321.9554 0.4466
327.2948 0.4131
331.1627 0.5907
332.1049 0.5820
339.0793 0.5471
339.6178 0.5299
341.7636 0.5836
350.6863 0.4554
354.3655 0.4494
357.6774 0.3820
361.4486 0.5263
365.1808 0.3796
367.2735 0.4531
367.9151 0.2399
374.7421 0.5337
378.1874 0.5493
380.5185 0.4838
383.1434 0.4253
387.4279 0.4672
391.5149 0.3230
393.9169 0.0771
396.1555 0.3938
398.5295 0.5141
400.3007 0.3961
405.1317 0.4817
409.9058 0.5671
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604200934113787483.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604200934113787483.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604200934113787483.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604200934113787483.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604200934113787483.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604200934113787483.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4142E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4176E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4203E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4231E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4274E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4290E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4383E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4410E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4443E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 99 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 7.27
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.318 Sum= 0.101 q= 23.0346
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.339 Sum= 0.216 q= -24.5201
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.200 Sum= 0.256 q= 14.4560
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.129 Sum= 0.273 q= 9.3088
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.144 Sum= 0.294 q= 10.4412
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.053 Sum= 0.296 q= 3.8647
Vector: 7 F= 0.00 Cos= -0.014 Sum= 0.297 q= -1.0475
Vector: 8 F= 0.00 Cos= -0.133 Sum= 0.314 q= -9.6468
Vector: 9 F= 0.00 Cos= -0.170 Sum= 0.343 q= -12.3089
Vector: 10 F= 0.00 Cos= -0.618 Sum= 0.726 q= -44.7320
Vector: 11 F= 0.00 Cos= 0.200 Sum= 0.766 q= 14.4705
Vector: 12 F= 0.00 Cos= -0.309 Sum= 0.861 q= -22.3676
Vector: 13 F= 0.00 Cos= -0.107 Sum= 0.873 q= -7.7734
Vector: 14 F= 15.28 Cos= -0.049 Sum= 0.875 q= -3.5089
Vector: 15 F= 20.01 Cos= -0.028 Sum= 0.876 q= -2.0508
Vector: 16 F= 24.53 Cos= -0.024 Sum= 0.877 q= -1.7031
Vector: 17 F= 25.79 Cos= -0.024 Sum= 0.877 q= -1.7570
Vector: 18 F= 36.66 Cos= 0.047 Sum= 0.879 q= 3.3690
Vector: 19 F= 41.89 Cos= 0.034 Sum= 0.880 q= 2.4909
Vector: 20 F= 42.54 Cos= -0.034 Sum= 0.882 q= -2.4343
Vector: 21 F= 48.72 Cos= 0.009 Sum= 0.882 q= 0.6570
Vector: 22 F= 51.55 Cos= 0.004 Sum= 0.882 q= 0.3195
Vector: 23 F= 52.92 Cos= -0.018 Sum= 0.882 q= -1.3009
Vector: 24 F= 61.32 Cos= -0.011 Sum= 0.882 q= -0.8188
Vector: 25 F= 64.05 Cos= -0.038 Sum= 0.884 q= -2.7844
Vector: 26 F= 73.46 Cos= -0.032 Sum= 0.885 q= -2.3337
Vector: 27 F= 79.02 Cos= -0.026 Sum= 0.885 q= -1.8811
Vector: 28 F= 83.70 Cos= 0.012 Sum= 0.885 q= 0.8660
Vector: 29 F= 92.64 Cos= 0.007 Sum= 0.886 q= 0.4730
Vector: 30 F= 102.02 Cos= -0.014 Sum= 0.886 q= -1.0164
Vector: 31 F= 106.33 Cos= -0.079 Sum= 0.892 q= -5.6955
Vector: 32 F= 112.90 Cos= -0.059 Sum= 0.895 q= -4.2626
Vector: 33 F= 115.33 Cos= -0.031 Sum= 0.896 q= -2.2705
Vector: 34 F= 117.15 Cos= -0.032 Sum= 0.897 q= -2.2915
Vector: 35 F= 123.24 Cos= 0.013 Sum= 0.898 q= 0.9423
Vector: 36 F= 129.35 Cos= 0.014 Sum= 0.898 q= 0.9907
Vector: 37 F= 130.30 Cos= -0.038 Sum= 0.899 q= -2.7149
Vector: 38 F= 136.66 Cos= 0.102 Sum= 0.910 q= 7.3779
Vector: 39 F= 137.35 Cos= -0.030 Sum= 0.910 q= -2.1418
Vector: 40 F= 138.29 Cos= -0.013 Sum= 0.911 q= -0.9126
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Vector: 42 F= 150.46 Cos= -0.053 Sum= 0.915 q= -3.8294
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Vector: 45 F= 171.86 Cos= 0.026 Sum= 0.916 q= 1.8620
Vector: 46 F= 173.60 Cos= -0.082 Sum= 0.922 q= -5.9643
Vector: 47 F= 176.63 Cos= 0.038 Sum= 0.924 q= 2.7451
Vector: 48 F= 179.15 Cos= -0.018 Sum= 0.924 q= -1.3354
Vector: 49 F= 192.39 Cos= 0.011 Sum= 0.924 q= 0.8073
Vector: 50 F= 193.76 Cos= -0.045 Sum= 0.926 q= -3.2623
Vector: 51 F= 203.90 Cos= 0.015 Sum= 0.927 q= 1.0768
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Vector: 57 F= 233.20 Cos= 0.093 Sum= 0.937 q= 6.7243
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Vector: 59 F= 245.66 Cos= -0.029 Sum= 0.938 q= -2.0639
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Vector: 61 F= 250.50 Cos= 0.003 Sum= 0.940 q= 0.2037
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Vector: 64 F= 259.29 Cos= 0.026 Sum= 0.941 q= 1.8777
Vector: 65 F= 262.86 Cos= -0.019 Sum= 0.942 q= -1.4024
Vector: 66 F= 266.65 Cos= -0.002 Sum= 0.942 q= -0.1323
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Vector: 68 F= 282.64 Cos= -0.002 Sum= 0.942 q= -0.1459
%Projmod-Wn> Eigenvector 69 Norm= 0.9999
Vector: 69 F= 285.11 Cos= -0.014 Sum= 0.942 q= -1.0490
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Vector: 73 F= 301.35 Cos= 0.018 Sum= 0.945 q= 1.3073
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Vector: 81 F= 321.96 Cos= 0.066 Sum= 0.952 q= 4.7413
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Vector: 83 F= 331.16 Cos= 0.041 Sum= 0.954 q= 2.9933
Vector: 84 F= 332.10 Cos= -0.000 Sum= 0.954 q= -0.0130
Vector: 85 F= 339.08 Cos= 0.025 Sum= 0.954 q= 1.8207
Vector: 86 F= 339.62 Cos= 0.029 Sum= 0.955 q= 2.1153
Vector: 87 F= 341.76 Cos= 0.003 Sum= 0.955 q= 0.2258
Vector: 88 F= 350.69 Cos= 0.069 Sum= 0.960 q= 5.0059
Vector: 89 F= 354.37 Cos= -0.001 Sum= 0.960 q= -0.0952
Vector: 90 F= 357.68 Cos= 0.080 Sum= 0.966 q= 5.7615
Vector: 91 F= 361.45 Cos= 0.000 Sum= 0.966 q= 0.0065
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Vector: 94 F= 367.92 Cos= 0.001 Sum= 0.969 q= 0.0547
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Vector: 97 F= 380.52 Cos= 0.029 Sum= 0.970 q= 2.1220
Vector: 98 F= 383.14 Cos= 0.021 Sum= 0.970 q= 1.5288
Vector: 99 F= 387.43 Cos= 0.032 Sum= 0.971 q= 2.3340
Vector: 100 F= 391.51 Cos= 0.048 Sum= 0.973 q= 3.4434
Vector: 101 F= 393.92 Cos= -0.007 Sum= 0.973 q= -0.5133
Vector: 102 F= 396.16 Cos= -0.005 Sum= 0.973 q= -0.3915
Vector: 103 F= 398.53 Cos= -0.024 Sum= 0.974 q= -1.7481
Vector: 104 F= 400.30 Cos= -0.048 Sum= 0.976 q= -3.5064
Vector: 105 F= 405.13 Cos= 0.034 Sum= 0.978 q= 2.4507
Vector: 106 F= 409.91 Cos= -0.040 Sum= 0.979 q= -2.8993
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003414
Projmod> 13 frequencies less than: 0.003444
Projmod> Lowest non-zero frequency : 15.280661
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.62 for mode 10 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.382 0.599 0.774 0.842 0.880 0.979
Projmod> Normal end.
getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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normal mode computation
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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generate a series of perturbations for mode 10
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getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604200934113787483 16 -20 20 20 0 on
normal mode computation
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calculating perturbed structure for DQ=20
2604200934113787483.eigenfacs
2604200934113787483.atom
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2604200934113787483.9.pdb
STDERR:
real 0m0.404s
user 0m0.392s
sys 0m0.010s
rm: cannot remove '2604200934113787483.sdijb': No such file or directory
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