*** c_hıv_10_test ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2604201126423830431.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2604201126423830431.atom to be opened.
Openam> File opened: 2604201126423830431.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 14.987283 +/- 8.120864 From: -0.564000 To: 30.374000
= 32.098990 +/- 6.985104 From: 13.071000 To: 43.846000
= 13.002768 +/- 7.601882 From: -7.872000 To: 27.985000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 16.2701 % Filled.
Pdbmat> 7200 non-zero elements.
Pdbmat> 734 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 14.83 +/- 5.35
Maximum number = 26
Minimum number = 3
Pdbmat> Matrix trace = 14680.0
Pdbmat> Larger element = 116.201
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 99 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 297
Diagstd> Number of non-zero elements 7200
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 14680.0000003
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 297
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 297 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 14680.0000003
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0191511 0.2616083 0.2872228 0.3531473
0.4764481 0.6503229 1.0306220 1.2835771 1.6634809
1.8200884 1.8995570 2.3442147 2.9887666 3.2798919
3.3299937 3.7021183 3.8622868 4.0320735 4.1663879
4.5657119 4.7131215 5.3256994 5.5006634 5.7441080
6.2302504 6.3183202 6.7882822 6.8608343 7.1503304
7.3838870 7.8328996 7.9099372 8.5814231 9.0465205
9.4616398 9.6222950 9.7720549 10.0046960 10.4882731
11.0201423 11.2587673 11.4805891 11.6656686 11.7541855
12.5257658 12.6571647 12.9479120 13.4635290 13.5938097
13.9141066 14.4735559 15.0093105 15.3234728 15.6870980
15.8472475 16.6241403 16.8289497 17.4073799 17.8752936
18.3014967 19.0537233 19.2938123 19.7834028 20.4205440
20.6917599 20.8572611 21.4249478 21.5486040 21.7695340
22.0074332 22.1978682 22.4012383 22.7451705 23.0246551
23.1483424 23.6443590 23.9937339 24.2351267 24.4381843
24.9242496 25.2310487 25.6523707 25.9281660 26.1735003
26.5612708 26.7644986 27.0270919 27.3352925 27.7601273
28.0615113 28.1802310 28.6648335 28.9108626 29.0690102
29.5322840 29.6443673 29.9369021 30.4892176 30.6830511
31.1112925 31.3929169 31.6601789 32.5363260 32.7804507
32.8413674 32.8889647 33.0524745 33.1394445 33.6548153
33.8561387 34.3789543 34.7171923 34.8492537 35.2233582
35.2987113 35.5190191 35.8696723 35.9880266 36.3052470
36.5631690 36.8972155 37.5628487 37.6194587 37.8028404
38.0256519 38.2795456 38.7206354 38.9634477 39.1902205
39.6308007 40.0392782 40.1906496 40.4139702 40.8020286
41.3976083 41.4614371 41.8069719 41.9511261 42.1569279
42.5462985 42.6452732 42.7759072 43.2083381 43.3309862
43.7919159 43.9837981 44.4833933 44.7868568 45.2547316
45.4357658 45.5669507 45.7487748 46.1905455 46.4759999
47.0673273 47.5394013 48.0406196 48.2505055 48.5038987
48.7410825 49.8987142 50.0492410 50.1313949 50.5330584
51.2810020 51.6283179 52.1547345 52.5672032 52.8126314
52.8819381 53.2696237 53.6218190 54.2422286 54.6974053
55.5755940 55.8095840 56.2921561 56.7324583 57.0157149
57.1360553 57.5561033 58.0754391 58.3989696 58.9754646
59.1492922 59.4328012 60.0142525 60.5458444 61.2278991
61.3541954 61.7483952 62.5883857 62.6679276 63.0241087
63.9301080 64.6373832 64.7663847 64.9022960 65.3774390
65.7523360 65.8736031 66.0789253 66.6493353 67.2035989
67.6479869 67.8217381 68.1829056 68.3401026 69.1400774
69.8145410 70.2084502 70.3319530 70.7357128 70.8964633
71.1501769 71.5871694 72.7008449 72.9092285 73.3307378
73.6197937 74.0303783 74.7749862 75.0169601 75.7302867
76.7343151 77.1066649 77.7034516 78.1979999 78.8667150
79.5296162 79.8592021 80.2882287 80.4525950 81.5801071
81.8487676 82.3330385 82.7606232 84.2072182 84.5932395
85.0673929 85.5854363 85.8839039 86.9216686 87.1647047
87.6651528 88.1800181 88.9697452 89.7871197 90.1873564
90.9702857 92.0860521 92.2062670 92.7561454 94.2063498
94.6401995 95.3877337 96.1550822 96.4150438 97.7589783
98.6491802 99.3032558 99.6693906 100.6757511 101.7278442
102.4129127 103.5443555 104.1160975 105.7360920 106.2603826
108.1287007 108.8045240 109.5998549 112.4156312 114.5370994
114.6712831 115.5586698 117.4118905 117.8183126 119.4492782
121.4351645 124.9465597 125.7757474 127.6932049 129.6826217
131.1326880 133.5277126 136.0123820 141.6207146 142.6813650
148.9066104 155.2773591
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the matrix is a hessien in CHARMM units):
0.0034229 0.0034234 0.0034304 0.0034338 0.0034392
0.0034474 15.0276814 55.5419422 58.1975545 64.5317162
74.9554243 87.5709014 110.2414689 123.0286490 140.0567968
146.5013147 149.6654103 166.2623716 187.7332848 196.6640791
198.1604544 208.9394393 213.4113644 218.0517122 221.6537736
232.0328798 235.7488584 250.6014650 254.6846755 260.2594932
271.0491390 272.9581679 282.9275412 284.4354640 290.3744056
295.0786589 303.9180970 305.4089765 318.1082535 326.6149548
334.0246250 336.8484967 339.4597056 343.4766585 351.6796790
360.4863975 364.3683971 367.9403068 370.8942481 372.2987271
384.3239275 386.3345036 390.7465479 398.4508292 400.3740063
405.0633438 413.1263559 420.7030405 425.0831418 430.0971703
432.2870252 442.7564309 445.4754618 453.0665339 459.1154127
464.5565460 474.0074935 476.9845427 482.9984942 490.7145489
493.9625173 495.9340406 502.6378245 504.0862493 506.6637656
509.4246739 511.6240065 513.9623352 517.8928066 521.0649330
522.4626262 528.0305533 531.9174027 534.5864260 536.8213109
542.1336021 545.4600295 549.9953709 552.9440380 555.5538785
559.6541195 561.7910757 564.5402871 567.7500002 572.1448686
575.2422928 576.4578465 581.3932586 583.8829660 585.4777598
590.1247082 591.2434921 594.1535674 599.6093824 601.5123544
605.6954442 608.4306944 611.0151273 619.4118873 621.7313122
622.3087337 622.7595288 624.3056564 625.1264751 629.9685755
631.8500046 636.7099130 639.8343883 641.0501724 644.4818033
645.1708028 647.1810054 650.3677305 651.4398125 654.3046068
656.6246698 659.6173596 665.5405803 666.0419006 667.6632881
669.6280140 671.8598169 675.7196029 677.8349685 679.8046546
683.6151895 687.1291931 688.4268385 690.3368219 693.6432404
698.6873914 699.2258181 702.1334061 703.3428745 705.0659766
708.3145644 709.1379550 710.2232655 713.8041384 714.8164974
718.6083404 720.1809752 724.2595568 726.7257897 730.5118699
731.9715588 733.0274928 734.4885232 738.0262783 740.3032420
744.9979012 748.7246552 752.6612893 754.3036582 756.2817223
758.1285737 767.0787602 768.2348921 768.8651470 771.9391585
777.6309398 780.2598645 784.2276487 787.3225966 789.1583998
789.6760416 792.5653741 795.1811045 799.7680352 803.1166741
809.5381811 811.2405911 814.7403439 817.9204780 819.9598126
820.8246813 823.8363906 827.5448329 829.8467021 833.9326272
835.1607128 837.1598285 841.2449708 844.9625297 849.7084928
850.5843992 853.3125202 859.0969068 859.6426349 862.0821178
868.2564119 873.0460730 873.9168396 874.8333098 878.0297520
880.5436178 881.3552377 882.7277223 886.5294995 890.2081089
893.1465374 894.2928075 896.6708114 897.7038621 902.9427413
907.3361700 909.8922655 910.6922040 913.3025019 914.3396762
915.9742660 918.7828404 925.9019725 927.2279869 929.9044107
931.7353619 934.3299373 939.0169918 940.5351071 944.9962405
951.2399704 953.5451023 957.2280922 960.2694286 964.3665904
968.4110217 970.4155868 973.0187715 974.0142455 980.8157154
982.4294044 985.3314659 987.8867405 996.4831070 998.7645258
1001.5597007 1004.6047213 1006.3549081 1012.4167169 1013.8311057
1016.7373490 1019.7186729 1024.2747192 1028.9690224 1031.2598477
1035.7264320 1042.0587566 1042.7387192 1045.8433197 1053.9872774
1056.4114600 1060.5753902 1064.8327554 1066.2712067 1073.6768946
1078.5543147 1082.1239874 1084.1170679 1089.5764790 1095.2548900
1098.9366038 1104.9903746 1108.0368932 1116.6238705 1119.3888276
1129.1867476 1132.7100579 1136.8424187 1151.3533579 1162.1665482
1162.8471060 1167.3377958 1176.6608957 1178.6956464 1186.8259815
1196.6510133 1213.8287834 1217.8498126 1227.0977900 1236.6197294
1243.5142374 1254.8187079 1266.4396630 1292.2860942 1297.1162736
1325.1110307 1353.1606137
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604201126423830431.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604201126423830431.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2604201126423830431.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604201126423830431.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9355E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9387E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9790E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0030E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0079E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9151E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2616
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2872
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3531
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4764
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.031
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.820
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.900
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.344
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.989
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.862
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.032
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.166
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.566
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.713
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.326
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.744
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.230
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.318
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.788
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.861
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.150
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.833
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.910
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.581
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.047
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.462
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.772
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.11
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.019151
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.033 for 99 C-alpha atoms.
Bfactors> = 12.201 +/- 79.55
Bfactors> = 31.076 +/- 10.13
Bfactors> Shiftng-fct= 18.875
Bfactors> Scaling-fct= 0.127
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2604201126423830431.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604201126423830431.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4227E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4233E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4390E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4473E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Chkmod> That is: 99 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6737
0.0034 0.7881
0.0034 0.9903
0.0034 0.7142
0.0034 0.7856
0.0034 0.7256
15.0270 0.0159
55.5387 0.1142
58.1927 0.1896
64.5246 0.1249
74.9484 0.2184
87.5656 0.1645
110.2569 0.3142
123.0436 0.2748
140.0305 0.1665
146.4915 0.2389
149.6764 0.5120
166.2476 0.2549
187.7326 0.2746
196.6589 0.4613
198.1521 0.3426
208.9271 0.3707
213.3943 0.2378
218.0404 0.3185
221.6339 0.5896
232.0302 0.3800
235.7357 0.3891
250.5978 0.5380
254.6815 0.2434
260.2459 0.5164
271.0321 0.4426
272.9395 0.4673
282.9095 0.5008
284.4267 0.2690
290.3552 0.5621
295.0682 0.7105
303.9070 0.3264
305.3971 0.3268
318.0868 0.4698
326.6096 0.2411
334.0166 0.3921
336.8289 0.3633
339.4442 0.3242
343.3813 0.2116
351.6935 0.4228
360.4686 0.3645
364.3727 0.3417
367.9151 0.4864
370.9472 0.1861
372.2165 0.4484
384.3724 0.4678
386.3612 0.6190
390.7613 0.1537
398.3815 0.5660
400.3007 0.2747
404.9862 0.4148
413.0579 0.2717
420.6946 0.2202
425.0167 0.2598
430.1185 0.4592
432.3060 0.5003
442.6823 0.5416
445.4702 0.3263
453.0812 0.5470
459.1561 0.3570
464.5176 0.4810
473.9408 0.4472
476.9169 0.4596
482.9362 0.4449
490.6869 0.4832
493.9203 0.5190
495.9453 0.5000
502.5582 0.3916
504.0809 0.4581
506.6474 0.2966
509.4325 0.4932
511.6266 0.4488
513.9261 0.4012
517.9256 0.5504
520.9899 0.5220
522.4589 0.5407
527.9592 0.4324
531.8532 0.3935
534.6172 0.3969
536.8182 0.3972
542.0641 0.5897
545.4253 0.4335
549.9463 0.3635
552.9399 0.4836
555.4929 0.4923
559.6167 0.4255
561.7197 0.6113
564.5464 0.5067
567.7745 0.5287
572.1190 0.4110
575.2021 0.5126
576.4307 0.4714
581.3193 0.4855
583.8492 0.2186
585.4626 0.5473
590.0766 0.4936
591.1746 0.3637
594.1588 0.4497
599.5913 0.5186
601.4566 0.5317
605.6569 0.4892
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2604201126423830431.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2604201126423830431.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2604201126423830431.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2604201126423830431.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2604201126423830431.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2604201126423830431.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4227E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4233E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4390E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4473E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Projmod> 106 vectors, 297 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 1
Last residue number = 99
Number of atoms found = 99
Mean number per residue = 1.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 99 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.04
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.054 Sum= 0.003 q= 0.5544
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.011 Sum= 0.003 q= -0.1169
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.018 Sum= 0.003 q= -0.1824
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.052 Sum= 0.006 q= 0.5408
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.080 Sum= 0.012 q= 0.8221
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.092 Sum= 0.021 q= -0.9467
%Projmod-Wn> Eigenvector 7 Norm= 1.0001
Vector: 7 F= 15.03 Cos= 0.078 Sum= 0.027 q= 0.8038
Vector: 8 F= 55.54 Cos= 0.215 Sum= 0.073 q= 2.2172
Vector: 9 F= 58.19 Cos= -0.699 Sum= 0.562 q= -7.2114
Vector: 10 F= 64.52 Cos= 0.346 Sum= 0.682 q= 3.5650
Vector: 11 F= 74.95 Cos= -0.064 Sum= 0.686 q= -0.6565
Vector: 12 F= 87.57 Cos= 0.259 Sum= 0.753 q= 2.6738
Vector: 13 F= 110.26 Cos= 0.120 Sum= 0.768 q= 1.2394
Vector: 14 F= 123.04 Cos= 0.035 Sum= 0.769 q= 0.3568
Vector: 15 F= 140.03 Cos= 0.162 Sum= 0.795 q= 1.6662
Vector: 16 F= 146.49 Cos= 0.146 Sum= 0.816 q= 1.5009
Vector: 17 F= 149.68 Cos= -0.036 Sum= 0.818 q= -0.3742
Vector: 18 F= 166.25 Cos= -0.052 Sum= 0.820 q= -0.5337
Vector: 19 F= 187.73 Cos= 0.014 Sum= 0.821 q= 0.1410
Vector: 20 F= 196.66 Cos= -0.069 Sum= 0.825 q= -0.7124
Vector: 21 F= 198.15 Cos= -0.098 Sum= 0.835 q= -1.0080
Vector: 22 F= 208.93 Cos= 0.052 Sum= 0.838 q= 0.5337
Vector: 23 F= 213.39 Cos= 0.096 Sum= 0.847 q= 0.9895
Vector: 24 F= 218.04 Cos= 0.048 Sum= 0.849 q= 0.4929
Vector: 25 F= 221.63 Cos= -0.024 Sum= 0.850 q= -0.2522
Vector: 26 F= 232.03 Cos= 0.051 Sum= 0.852 q= 0.5236
Vector: 27 F= 235.74 Cos= 0.070 Sum= 0.857 q= 0.7199
Vector: 28 F= 250.60 Cos= -0.028 Sum= 0.858 q= -0.2885
Vector: 29 F= 254.68 Cos= -0.040 Sum= 0.859 q= -0.4144
Vector: 30 F= 260.25 Cos= -0.062 Sum= 0.863 q= -0.6369
Vector: 31 F= 271.03 Cos= 0.046 Sum= 0.865 q= 0.4770
Vector: 32 F= 272.94 Cos= 0.044 Sum= 0.867 q= 0.4569
Vector: 33 F= 282.91 Cos= 0.042 Sum= 0.869 q= 0.4300
Vector: 34 F= 284.43 Cos= 0.071 Sum= 0.874 q= 0.7312
Vector: 35 F= 290.36 Cos= -0.023 Sum= 0.875 q= -0.2321
Vector: 36 F= 295.07 Cos= 0.017 Sum= 0.875 q= 0.1761
Vector: 37 F= 303.91 Cos= 0.051 Sum= 0.878 q= 0.5286
Vector: 38 F= 305.40 Cos= -0.040 Sum= 0.879 q= -0.4162
Vector: 39 F= 318.09 Cos= 0.050 Sum= 0.882 q= 0.5112
Vector: 40 F= 326.61 Cos= -0.016 Sum= 0.882 q= -0.1664
Vector: 41 F= 334.02 Cos= -0.018 Sum= 0.882 q= -0.1904
Vector: 42 F= 336.83 Cos= 0.047 Sum= 0.884 q= 0.4821
Vector: 43 F= 339.44 Cos= -0.004 Sum= 0.884 q= -0.0363
Vector: 44 F= 343.38 Cos= -0.000 Sum= 0.884 q= -0.0002
Vector: 45 F= 351.69 Cos= 0.021 Sum= 0.885 q= 0.2168
Vector: 46 F= 360.47 Cos= 0.005 Sum= 0.885 q= 0.0477
Vector: 47 F= 364.37 Cos= -0.001 Sum= 0.885 q= -0.0058
Vector: 48 F= 367.92 Cos= 0.005 Sum= 0.885 q= 0.0530
Vector: 49 F= 370.95 Cos= -0.004 Sum= 0.885 q= -0.0396
Vector: 50 F= 372.22 Cos= -0.097 Sum= 0.894 q= -1.0030
Vector: 51 F= 384.37 Cos= -0.024 Sum= 0.895 q= -0.2513
Vector: 52 F= 386.36 Cos= -0.050 Sum= 0.898 q= -0.5152
Vector: 53 F= 390.76 Cos= -0.040 Sum= 0.899 q= -0.4117
Vector: 54 F= 398.38 Cos= 0.021 Sum= 0.900 q= 0.2163
Vector: 55 F= 400.30 Cos= -0.005 Sum= 0.900 q= -0.0508
Vector: 56 F= 404.99 Cos= -0.022 Sum= 0.900 q= -0.2278
Vector: 57 F= 413.06 Cos= -0.035 Sum= 0.901 q= -0.3586
Vector: 58 F= 420.69 Cos= 0.018 Sum= 0.902 q= 0.1851
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Vector: 60 F= 430.12 Cos= -0.055 Sum= 0.905 q= -0.5663
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Vector: 64 F= 453.08 Cos= -0.016 Sum= 0.906 q= -0.1622
Vector: 65 F= 459.16 Cos= -0.008 Sum= 0.906 q= -0.0838
Vector: 66 F= 464.52 Cos= -0.007 Sum= 0.906 q= -0.0672
Vector: 67 F= 473.94 Cos= -0.029 Sum= 0.907 q= -0.3019
Vector: 68 F= 476.92 Cos= -0.041 Sum= 0.908 q= -0.4232
Vector: 69 F= 482.94 Cos= 0.060 Sum= 0.912 q= 0.6201
Vector: 70 F= 490.69 Cos= 0.018 Sum= 0.912 q= 0.1906
Vector: 71 F= 493.92 Cos= -0.036 Sum= 0.914 q= -0.3747
Vector: 72 F= 495.95 Cos= -0.067 Sum= 0.918 q= -0.6953
Vector: 73 F= 502.56 Cos= -0.023 Sum= 0.919 q= -0.2367
Vector: 74 F= 504.08 Cos= -0.020 Sum= 0.919 q= -0.2063
Vector: 75 F= 506.65 Cos= -0.013 Sum= 0.919 q= -0.1346
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Vector: 78 F= 513.93 Cos= -0.004 Sum= 0.922 q= -0.0426
Vector: 79 F= 517.93 Cos= 0.027 Sum= 0.923 q= 0.2738
Vector: 80 F= 520.99 Cos= -0.041 Sum= 0.924 q= -0.4270
Vector: 81 F= 522.46 Cos= -0.031 Sum= 0.925 q= -0.3162
Vector: 82 F= 527.96 Cos= -0.030 Sum= 0.926 q= -0.3118
Vector: 83 F= 531.85 Cos= -0.027 Sum= 0.927 q= -0.2774
Vector: 84 F= 534.62 Cos= 0.021 Sum= 0.927 q= 0.2211
Vector: 85 F= 536.82 Cos= -0.032 Sum= 0.928 q= -0.3264
Vector: 86 F= 542.06 Cos= -0.032 Sum= 0.929 q= -0.3296
Vector: 87 F= 545.43 Cos= 0.009 Sum= 0.929 q= 0.0972
Vector: 88 F= 549.95 Cos= 0.022 Sum= 0.930 q= 0.2259
Vector: 89 F= 552.94 Cos= -0.020 Sum= 0.930 q= -0.2046
Vector: 90 F= 555.49 Cos= -0.008 Sum= 0.930 q= -0.0817
Vector: 91 F= 559.62 Cos= 0.003 Sum= 0.930 q= 0.0310
Vector: 92 F= 561.72 Cos= -0.010 Sum= 0.930 q= -0.1038
Vector: 93 F= 564.55 Cos= -0.011 Sum= 0.931 q= -0.1084
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Vector: 95 F= 572.12 Cos= 0.015 Sum= 0.931 q= 0.1518
Vector: 96 F= 575.20 Cos= 0.020 Sum= 0.931 q= 0.2092
Vector: 97 F= 576.43 Cos= 0.021 Sum= 0.932 q= 0.2154
Vector: 98 F= 581.32 Cos= 0.008 Sum= 0.932 q= 0.0841
Vector: 99 F= 583.85 Cos= 0.007 Sum= 0.932 q= 0.0703
Vector: 100 F= 585.46 Cos= -0.027 Sum= 0.933 q= -0.2757
Vector: 101 F= 590.08 Cos= 0.003 Sum= 0.933 q= 0.0343
Vector: 102 F= 591.17 Cos= 0.028 Sum= 0.933 q= 0.2922
Vector: 103 F= 594.16 Cos= 0.035 Sum= 0.935 q= 0.3639
Vector: 104 F= 599.59 Cos= 0.003 Sum= 0.935 q= 0.0284
Vector: 105 F= 601.46 Cos= -0.024 Sum= 0.935 q= -0.2441
Vector: 106 F= 605.66 Cos= 0.029 Sum= 0.936 q= 0.3039
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003423
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003447
Projmod> Lowest non-zero frequency : 15.027003
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.70 for mode 9 with F= 58.19 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.489 0.676 0.770 0.803 0.827 0.936
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 7 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
making animated gifs
3 models are in 2604201126423830431.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.7.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-20 99 2.326 95 0.734
MODEL 2 MODE=7 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=7 DQ=20 99 2.184 95 0.703
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 8 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.8.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-20 99 2.444 90 0.973
MODEL 2 MODE=8 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=8 DQ=20 99 2.050 93 0.746
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 9 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.9.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-20 99 1.477 92 0.878
MODEL 2 MODE=9 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=9 DQ=20 99 2.828 84 0.846
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 10 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-20 99 2.556 87 1.062
MODEL 2 MODE=10 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=10 DQ=20 99 1.910 90 0.699
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 11 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-20 99 2.198 92 1.217
MODEL 2 MODE=11 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=11 DQ=20 99 2.312 91 1.131
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 12 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-20 99 2.487 95 1.318
MODEL 2 MODE=12 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=12 DQ=20 99 1.994 94 0.948
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 13 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
making animated gifs
3 models are in 2604201126423830431.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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3 models are in 2604201126423830431.13.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-20 99 2.364 84 1.167
MODEL 2 MODE=13 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=13 DQ=20 99 2.143 87 0.964
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 14 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
making animated gifs
3 models are in 2604201126423830431.14.pdb, 0 models will be skipped
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3 models are in 2604201126423830431.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.14.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-20 99 2.288 86 1.261
MODEL 2 MODE=14 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=14 DQ=20 99 2.224 91 1.177
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 15 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
making animated gifs
3 models are in 2604201126423830431.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
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3 models are in 2604201126423830431.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.15.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-20 99 2.401 88 1.129
MODEL 2 MODE=15 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=15 DQ=20 99 2.102 89 1.049
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2604201126423830431 16 -20 20 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2604201126423830431.eigenfacs
2604201126423830431.atom
making animated gifs
3 models are in 2604201126423830431.16.pdb, 0 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
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3 models are in 2604201126423830431.16.pdb, 0 models will be skipped
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MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
3 models are in 2604201126423830431.16.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-20 99 2.387 87 1.401
MODEL 2 MODE=16 DQ=0 99 1.025 96 0.742
MODEL 3 MODE=16 DQ=20 99 2.117 89 1.082
2604201126423830431.10.pdb
2604201126423830431.11.pdb
2604201126423830431.12.pdb
2604201126423830431.13.pdb
2604201126423830431.14.pdb
2604201126423830431.15.pdb
2604201126423830431.16.pdb
2604201126423830431.7.pdb
2604201126423830431.8.pdb
2604201126423830431.9.pdb
STDERR:
real 0m0.426s
user 0m0.419s
sys 0m0.006s
rm: cannot remove '2604201126423830431.sdijb': No such file or directory
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