*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605121008142059526.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605121008142059526.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605121008142059526.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1466
First residue number = 1
Last residue number = 690
Number of atoms found = 11398
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -12.511312 +/- 24.429531 From: -77.061000 To: 45.095000
= 36.930461 +/- 18.134184 From: -10.582000 To: 77.602000
= 31.646815 +/- 25.450531 From: -28.134000 To: 102.532000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.7367 % Filled.
Pdbmat> 4306911 non-zero elements.
Pdbmat> 471017 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.65 +/- 23.12
Maximum number = 134
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 9.420340E+06
Pdbmat> Larger element = 510.589
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1466 non-zero elements, NRBL set to 8
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605121008142059526.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 8
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605121008142059526.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605121008142059526.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 11398 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 8 residue(s) per block.
Blocpdb> 1466 residues.
Blocpdb> 63 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 56 atoms in block 2
Block first atom: 64
Blocpdb> 64 atoms in block 3
Block first atom: 120
Blocpdb> 59 atoms in block 4
Block first atom: 184
Blocpdb> 62 atoms in block 5
Block first atom: 243
Blocpdb> 59 atoms in block 6
Block first atom: 305
Blocpdb> 52 atoms in block 7
Block first atom: 364
Blocpdb> 64 atoms in block 8
Block first atom: 416
Blocpdb> 72 atoms in block 9
Block first atom: 480
Blocpdb> 63 atoms in block 10
Block first atom: 552
Blocpdb> 65 atoms in block 11
Block first atom: 615
Blocpdb> 68 atoms in block 12
Block first atom: 680
Blocpdb> 65 atoms in block 13
Block first atom: 748
Blocpdb> 59 atoms in block 14
Block first atom: 813
Blocpdb> 77 atoms in block 15
Block first atom: 872
Blocpdb> 60 atoms in block 16
Block first atom: 949
Blocpdb> 63 atoms in block 17
Block first atom: 1009
Blocpdb> 63 atoms in block 18
Block first atom: 1072
Blocpdb> 59 atoms in block 19
Block first atom: 1135
Blocpdb> 55 atoms in block 20
Block first atom: 1194
Blocpdb> 67 atoms in block 21
Block first atom: 1249
Blocpdb> 48 atoms in block 22
Block first atom: 1316
Blocpdb> 75 atoms in block 23
Block first atom: 1364
Blocpdb> 59 atoms in block 24
Block first atom: 1439
Blocpdb> 69 atoms in block 25
Block first atom: 1498
Blocpdb> 68 atoms in block 26
Block first atom: 1567
Blocpdb> 57 atoms in block 27
Block first atom: 1635
Blocpdb> 69 atoms in block 28
Block first atom: 1692
Blocpdb> 56 atoms in block 29
Block first atom: 1761
Blocpdb> 58 atoms in block 30
Block first atom: 1817
Blocpdb> 56 atoms in block 31
Block first atom: 1875
Blocpdb> 66 atoms in block 32
Block first atom: 1931
Blocpdb> 57 atoms in block 33
Block first atom: 1997
Blocpdb> 68 atoms in block 34
Block first atom: 2054
Blocpdb> 61 atoms in block 35
Block first atom: 2122
Blocpdb> 53 atoms in block 36
Block first atom: 2183
Blocpdb> 63 atoms in block 37
Block first atom: 2236
Blocpdb> 62 atoms in block 38
Block first atom: 2299
Blocpdb> 60 atoms in block 39
Block first atom: 2361
Blocpdb> 56 atoms in block 40
Block first atom: 2421
Blocpdb> 61 atoms in block 41
Block first atom: 2477
Blocpdb> 63 atoms in block 42
Block first atom: 2538
Blocpdb> 61 atoms in block 43
Block first atom: 2601
Blocpdb> 57 atoms in block 44
Block first atom: 2662
Blocpdb> 60 atoms in block 45
Block first atom: 2719
Blocpdb> 54 atoms in block 46
Block first atom: 2779
Blocpdb> 68 atoms in block 47
Block first atom: 2833
Blocpdb> 56 atoms in block 48
Block first atom: 2901
Blocpdb> 59 atoms in block 49
Block first atom: 2957
Blocpdb> 62 atoms in block 50
Block first atom: 3016
Blocpdb> 61 atoms in block 51
Block first atom: 3078
Blocpdb> 58 atoms in block 52
Block first atom: 3139
Blocpdb> 62 atoms in block 53
Block first atom: 3197
Blocpdb> 55 atoms in block 54
Block first atom: 3259
Blocpdb> 69 atoms in block 55
Block first atom: 3314
Blocpdb> 56 atoms in block 56
Block first atom: 3383
Blocpdb> 65 atoms in block 57
Block first atom: 3439
Blocpdb> 59 atoms in block 58
Block first atom: 3504
Blocpdb> 52 atoms in block 59
Block first atom: 3563
Blocpdb> 71 atoms in block 60
Block first atom: 3615
Blocpdb> 52 atoms in block 61
Block first atom: 3686
Blocpdb> 72 atoms in block 62
Block first atom: 3738
Blocpdb> 67 atoms in block 63
Block first atom: 3810
Blocpdb> 61 atoms in block 64
Block first atom: 3877
Blocpdb> 67 atoms in block 65
Block first atom: 3938
Blocpdb> 62 atoms in block 66
Block first atom: 4005
Blocpdb> 59 atoms in block 67
Block first atom: 4067
Blocpdb> 69 atoms in block 68
Block first atom: 4126
Blocpdb> 71 atoms in block 69
Block first atom: 4195
Blocpdb> 65 atoms in block 70
Block first atom: 4266
Blocpdb> 74 atoms in block 71
Block first atom: 4331
Blocpdb> 55 atoms in block 72
Block first atom: 4405
Blocpdb> 63 atoms in block 73
Block first atom: 4460
Blocpdb> 65 atoms in block 74
Block first atom: 4523
Blocpdb> 59 atoms in block 75
Block first atom: 4588
Blocpdb> 62 atoms in block 76
Block first atom: 4647
Blocpdb> 62 atoms in block 77
Block first atom: 4709
Blocpdb> 63 atoms in block 78
Block first atom: 4771
Blocpdb> 61 atoms in block 79
Block first atom: 4834
Blocpdb> 60 atoms in block 80
Block first atom: 4895
Blocpdb> 58 atoms in block 81
Block first atom: 4955
Blocpdb> 60 atoms in block 82
Block first atom: 5013
Blocpdb> 61 atoms in block 83
Block first atom: 5073
Blocpdb> 63 atoms in block 84
Block first atom: 5134
Blocpdb> 67 atoms in block 85
Block first atom: 5197
Blocpdb> 58 atoms in block 86
Block first atom: 5264
Blocpdb> 50 atoms in block 87
Block first atom: 5322
Blocpdb> 71 atoms in block 88
Block first atom: 5372
Blocpdb> 60 atoms in block 89
Block first atom: 5443
Blocpdb> 65 atoms in block 90
Block first atom: 5503
Blocpdb> 64 atoms in block 91
Block first atom: 5568
Blocpdb> 62 atoms in block 92
Block first atom: 5632
Blocpdb> 54 atoms in block 93
Block first atom: 5694
Blocpdb> 59 atoms in block 94
Block first atom: 5748
Blocpdb> 70 atoms in block 95
Block first atom: 5807
Blocpdb> 68 atoms in block 96
Block first atom: 5877
Blocpdb> 58 atoms in block 97
Block first atom: 5945
Blocpdb> 75 atoms in block 98
Block first atom: 6003
Blocpdb> 57 atoms in block 99
Block first atom: 6078
Blocpdb> 69 atoms in block 100
Block first atom: 6135
Blocpdb> 72 atoms in block 101
Block first atom: 6204
Blocpdb> 74 atoms in block 102
Block first atom: 6276
Blocpdb> 54 atoms in block 103
Block first atom: 6350
Blocpdb> 67 atoms in block 104
Block first atom: 6404
Blocpdb> 45 atoms in block 105
Block first atom: 6471
Blocpdb> 55 atoms in block 106
Block first atom: 6516
Blocpdb> 59 atoms in block 107
Block first atom: 6571
Blocpdb> 64 atoms in block 108
Block first atom: 6630
Blocpdb> 59 atoms in block 109
Block first atom: 6694
Blocpdb> 68 atoms in block 110
Block first atom: 6753
Blocpdb> 70 atoms in block 111
Block first atom: 6821
Blocpdb> 63 atoms in block 112
Block first atom: 6891
Blocpdb> 65 atoms in block 113
Block first atom: 6954
Blocpdb> 68 atoms in block 114
Block first atom: 7019
Blocpdb> 59 atoms in block 115
Block first atom: 7087
Blocpdb> 62 atoms in block 116
Block first atom: 7146
Blocpdb> 9 atoms in block 117
Block first atom: 7208
Blocpdb> 65 atoms in block 118
Block first atom: 7217
Blocpdb> 64 atoms in block 119
Block first atom: 7282
Blocpdb> 51 atoms in block 120
Block first atom: 7346
Blocpdb> 61 atoms in block 121
Block first atom: 7397
Blocpdb> 69 atoms in block 122
Block first atom: 7458
Blocpdb> 64 atoms in block 123
Block first atom: 7527
Blocpdb> 72 atoms in block 124
Block first atom: 7591
Blocpdb> 70 atoms in block 125
Block first atom: 7663
Blocpdb> 65 atoms in block 126
Block first atom: 7733
Blocpdb> 69 atoms in block 127
Block first atom: 7798
Blocpdb> 57 atoms in block 128
Block first atom: 7867
Blocpdb> 68 atoms in block 129
Block first atom: 7924
Blocpdb> 58 atoms in block 130
Block first atom: 7992
Blocpdb> 68 atoms in block 131
Block first atom: 8050
Blocpdb> 59 atoms in block 132
Block first atom: 8118
Blocpdb> 65 atoms in block 133
Block first atom: 8177
Blocpdb> 63 atoms in block 134
Block first atom: 8242
Blocpdb> 64 atoms in block 135
Block first atom: 8305
Blocpdb> 71 atoms in block 136
Block first atom: 8369
Blocpdb> 64 atoms in block 137
Block first atom: 8440
Blocpdb> 56 atoms in block 138
Block first atom: 8504
Blocpdb> 61 atoms in block 139
Block first atom: 8560
Blocpdb> 65 atoms in block 140
Block first atom: 8621
Blocpdb> 64 atoms in block 141
Block first atom: 8686
Blocpdb> 61 atoms in block 142
Block first atom: 8750
Blocpdb> 62 atoms in block 143
Block first atom: 8811
Blocpdb> 56 atoms in block 144
Block first atom: 8873
Blocpdb> 54 atoms in block 145
Block first atom: 8929
Blocpdb> 61 atoms in block 146
Block first atom: 8983
Blocpdb> 61 atoms in block 147
Block first atom: 9044
Blocpdb> 65 atoms in block 148
Block first atom: 9105
Blocpdb> 63 atoms in block 149
Block first atom: 9170
Blocpdb> 66 atoms in block 150
Block first atom: 9233
Blocpdb> 67 atoms in block 151
Block first atom: 9299
Blocpdb> 50 atoms in block 152
Block first atom: 9366
Blocpdb> 60 atoms in block 153
Block first atom: 9416
Blocpdb> 61 atoms in block 154
Block first atom: 9476
Blocpdb> 67 atoms in block 155
Block first atom: 9537
Blocpdb> 67 atoms in block 156
Block first atom: 9604
Blocpdb> 57 atoms in block 157
Block first atom: 9671
Blocpdb> 59 atoms in block 158
Block first atom: 9728
Blocpdb> 58 atoms in block 159
Block first atom: 9787
Blocpdb> 57 atoms in block 160
Block first atom: 9845
Blocpdb> 59 atoms in block 161
Block first atom: 9902
Blocpdb> 69 atoms in block 162
Block first atom: 9961
Blocpdb> 62 atoms in block 163
Block first atom: 10030
Blocpdb> 60 atoms in block 164
Block first atom: 10092
Blocpdb> 33 atoms in block 165
Block first atom: 10152
Blocpdb> 56 atoms in block 166
Block first atom: 10185
Blocpdb> 49 atoms in block 167
Block first atom: 10241
Blocpdb> 61 atoms in block 168
Block first atom: 10290
Blocpdb> 69 atoms in block 169
Block first atom: 10351
Blocpdb> 56 atoms in block 170
Block first atom: 10420
Blocpdb> 51 atoms in block 171
Block first atom: 10476
Blocpdb> 53 atoms in block 172
Block first atom: 10527
Blocpdb> 56 atoms in block 173
Block first atom: 10580
Blocpdb> 59 atoms in block 174
Block first atom: 10636
Blocpdb> 59 atoms in block 175
Block first atom: 10695
Blocpdb> 64 atoms in block 176
Block first atom: 10754
Blocpdb> 73 atoms in block 177
Block first atom: 10818
Blocpdb> 67 atoms in block 178
Block first atom: 10891
Blocpdb> 67 atoms in block 179
Block first atom: 10958
Blocpdb> 62 atoms in block 180
Block first atom: 11025
Blocpdb> 62 atoms in block 181
Block first atom: 11087
Blocpdb> 67 atoms in block 182
Block first atom: 11149
Blocpdb> 66 atoms in block 183
Block first atom: 11216
Blocpdb> 66 atoms in block 184
Block first atom: 11282
Blocpdb> 51 atoms in block 185
Block first atom: 11347
Blocpdb> 185 blocks.
Blocpdb> At most, 77 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4307096 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 34194
Prepmat> Matrix trace = 9420340.0000
Prepmat> Last element read: 34194 34194 29.3593
Prepmat> 17206 lines saved.
Prepmat> 15643 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11398
RTB> Total mass = 11398.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 11398
RTB> Number of blocks = 185
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 201668.8639
RTB> 53457 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1110
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53457
Diagstd> Projected matrix trace = 201668.8639
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1110 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 201668.8639
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1282721 0.2137979 0.3492314 0.4947843
0.7528820 0.8468387 1.3267116 1.4547244 1.7675057
1.8257085 1.8643547 2.3786394 2.5357959 2.9528837
3.1184468 3.3615084 3.6708278 4.1507832 4.5303670
5.0544616 5.3506894 5.9383373 6.5264351 6.8906381
7.1653374 7.1996560 7.9099365 8.3458377 8.6482148
9.0063850 9.2148129 9.4753020 9.8191639 10.0699988
10.5645313 10.8033682 10.9893652 11.5533269 12.2015875
12.5634700 13.1054672 13.2252222 13.9334713 14.0972780
14.5952129 14.9739497 15.2254304 15.3392113 15.6831821
15.7380666 16.3040034 16.8344331 17.2283291 17.6454494
18.0082647 18.2420362 18.6025728 19.1702393 19.6400627
20.2246197 20.3372707 20.5792268 21.0160987 21.4474522
21.9102613 22.0168110 22.7378222 23.1121980 23.3500197
23.6098256 23.8105064 24.3759511 24.5717373 25.2166058
25.3434812 25.9524493 26.2057005 26.9518112 27.4234234
27.9259038 27.9592530 28.6523541 29.2989010 29.5673223
30.0895650 30.4662894 30.7197476 31.0822291 31.3060661
31.9845100 32.4496991 33.4597998 33.5627450 34.1265680
34.2259260 34.7696661 34.8493348 35.9035066 36.3102770
36.6357400
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034331 0.0034333 0.0034340 0.0034343 0.0034359
0.0034360 38.8920959 50.2107837 64.1729347 76.3841448
94.2233923 99.9299399 125.0787541 130.9741659 144.3695778
146.7273260 148.2721398 167.4787010 172.9228674 186.6029257
191.7628401 199.0959290 208.0545828 221.2382974 231.1330100
244.1365088 251.1887310 264.6230755 277.4171404 285.0525966
290.6789633 291.3742398 305.4089637 313.7113624 319.3438180
325.8896247 329.6389645 334.2656970 340.2769524 344.5958073
352.9558598 356.9232745 359.9826620 369.1040511 379.3179982
384.9019256 393.1167375 394.9087607 405.3451158 407.7208420
414.8589821 420.2071764 423.7210794 425.3013839 430.0434849
430.7953135 438.4725494 445.5480306 450.7304097 456.1541619
460.8198873 463.8012741 468.3621450 475.4545930 481.2455376
488.3548011 489.7129794 492.6174671 497.8188412 502.9017361
508.2987700 509.5332005 517.8091415 522.0545739 524.7336391
527.6448093 529.8825239 536.1373528 538.2861580 545.3038886
546.6739953 553.2029099 555.8955104 563.7535092 568.6644961
573.8506775 574.1932225 581.2666884 587.7883114 590.4746781
595.6665805 599.3838846 601.8719473 605.4124656 607.5884777
614.1368133 618.5867560 628.1407222 629.1062745 634.3684680
635.2912646 640.3177490 641.0509180 650.6743902 654.3499313
657.2759850
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11398
Rtb_to_modes> Number of blocs = 185
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1283
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2138
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3492
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4948
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7529
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8468
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.327
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.455
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.768
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.826
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.953
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.118
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.362
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.671
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.151
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.530
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.054
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.351
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.891
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.910
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.346
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.648
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.006
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.215
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.475
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.819
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.64
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99996
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 1.00003 0.99999 1.00003 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00005 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 205164 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99996
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 1.00003 0.99999 1.00003 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00005 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605121008142059526.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605121008142059526.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605121008142059526.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605121008142059526.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1466
First residue number = 1
Last residue number = 690
Number of atoms found = 11398
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1283
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2138
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3492
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4948
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7529
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.455
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.768
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.826
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.953
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.118
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.362
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.671
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.151
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.530
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.054
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.351
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.938
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.891
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.910
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.346
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.648
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.475
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.819
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.64
Bfactors> 106 vectors, 34194 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.128300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.521 for 1466 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.040 +/- 0.03
Bfactors> = 36.566 +/- 23.59
Bfactors> Shiftng-fct= 36.526
Bfactors> Scaling-fct= 853.518
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605121008142059526.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605121008142059526.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.3
Chkmod> 106 vectors, 34194 coordinates in file.
Chkmod> That is: 11398 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9906
0.0034 0.7325
0.0034 0.7335
0.0034 0.9942
0.0034 0.7578
0.0034 0.8622
38.8947 0.5314
50.2089 0.6280
64.1673 0.3776
76.3821 0.6009
94.2205 0.5930
99.9234 0.7769
125.0870 0.5756
130.9809 0.4800
144.3836 0.6122
146.7327 0.4863
148.2517 0.4167
167.4842 0.6322
172.9224 0.6366
186.5986 0.7110
191.7409 0.3829
199.1019 0.6909
208.0505 0.4598
221.2346 0.6630
231.1137 0.5710
244.1149 0.6289
251.1852 0.4542
264.6042 0.4986
277.3960 0.5906
285.0478 0.4661
290.6596 0.2919
291.3687 0.4227
305.3971 0.2279
313.7009 0.6577
319.3261 0.2729
325.8687 0.4958
329.6282 0.3445
334.2460 0.2975
340.2595 0.4336
344.5810 0.5051
352.8650 0.5563
356.8523 0.4834
359.9776 0.3787
369.0351 0.3603
379.2770 0.4700
384.8322 0.3539
393.1678 0.3059
394.9631 0.3973
405.2772 0.3421
407.7427 0.3515
414.9092 0.4242
420.1337 0.5357
423.7665 0.4541
425.2941 0.4820
429.9814 0.5501
430.8033 0.4192
438.3999 0.2502
445.4702 0.5314
450.7329 0.4455
456.1934 0.2690
460.8223 0.0371
463.7555 0.4755
468.3097 0.4987
475.4312 0.3718
481.2241 0.3298
488.2781 0.4312
489.7248 0.3524
492.6056 0.4959
497.8437 0.4436
502.9100 0.4257
508.2739 0.3616
509.5482 0.2450
517.8117 0.4678
522.0073 0.2928
524.7109 0.3859
527.6241 0.3813
529.8541 0.4935
536.1589 0.4007
538.2440 0.4561
545.3172 0.3856
546.6130 0.4664
553.1531 0.1430
555.9172 0.5047
563.7104 0.3616
568.6046 0.3550
573.8681 0.4429
574.1762 0.2702
581.2179 0.4157
587.7741 0.3979
590.4761 0.2996
595.6453 0.3133
599.3947 0.2990
601.8486 0.2957
605.3648 0.3720
607.6006 0.3917
614.0672 0.3949
618.5631 0.5051
628.1156 0.3592
629.0535 0.2610
634.3731 0.4750
635.3018 0.3811
640.2933 0.3754
641.0295 0.3719
650.6147 0.2089
654.3193 0.4825
657.2860 0.5060
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605121008142059526 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
making animated gifs
11 models are in 2605121008142059526.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605121008142059526 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
making animated gifs
11 models are in 2605121008142059526.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605121008142059526 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
making animated gifs
11 models are in 2605121008142059526.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605121008142059526 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
making animated gifs
11 models are in 2605121008142059526.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605121008142059526 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605121008142059526.eigenfacs
2605121008142059526.atom
making animated gifs
11 models are in 2605121008142059526.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605121008142059526.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605121008142059526.10.pdb
2605121008142059526.11.pdb
2605121008142059526.7.pdb
2605121008142059526.8.pdb
2605121008142059526.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m17.210s
user 1m16.652s
sys 0m0.474s
rm: cannot remove '2605121008142059526.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
