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LOGs for ID: 2605130447382320865

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605130447382320865.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605130447382320865.atom to be opened. Openam> File opened: 2605130447382320865.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9048 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.111808 +/- 18.955153 From: -41.523000 To: 42.083000 = -0.236703 +/- 19.035565 From: -40.190000 To: 40.367000 = 1.225346 +/- 17.991103 From: -39.614000 To: 41.341000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9909 % Filled. Pdbmat> 3650733 non-zero elements. Pdbmat> 399660 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 88.34 +/- 22.61 Maximum number = 134 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 7.993200E+06 Pdbmat> Larger element = 505.754 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1192 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605130447382320865.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605130447382320865.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605130447382320865.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9048 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1192 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 52 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 147 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 249 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 42 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 516 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 559 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 601 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 646 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 693 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 740 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 795 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 845 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 884 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 929 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 971 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 1009 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1050 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 1096 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1130 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1172 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1212 Blocpdb> 44 atoms in block 29 Block first atom: 1261 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1305 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1347 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1401 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1453 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1503 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1546 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1596 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1636 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1685 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1727 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1775 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1819 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1862 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1906 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1952 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1996 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2042 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 2090 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2131 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2182 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 2240 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2263 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2310 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2357 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2409 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 2459 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2511 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2558 Blocpdb> 50 atoms in block 58 Block first atom: 2600 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2650 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2688 Blocpdb> 42 atoms in block 61 Block first atom: 2736 Blocpdb> 43 atoms in block 62 Block first atom: 2778 Blocpdb> 42 atoms in block 63 Block first atom: 2821 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2863 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2908 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 2955 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 3002 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3057 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 3107 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3146 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 3191 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 3233 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 3271 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3312 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 3358 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3392 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3434 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3474 Blocpdb> 44 atoms in block 79 Block first atom: 3523 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3567 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3609 Blocpdb> 52 atoms in block 82 Block first atom: 3663 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3715 Blocpdb> 43 atoms in block 84 Block first atom: 3765 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3808 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 3858 Blocpdb> 49 atoms in block 87 Block first atom: 3898 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 3947 Blocpdb> 48 atoms in block 89 Block first atom: 3989 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4037 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 4081 Blocpdb> 44 atoms in block 92 Block first atom: 4124 Blocpdb> 46 atoms in block 93 Block first atom: 4168 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4214 Blocpdb> 46 atoms in block 95 Block first atom: 4258 Blocpdb> 48 atoms in block 96 Block first atom: 4304 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 4352 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 4393 Blocpdb> 58 atoms in block 99 Block first atom: 4444 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 4502 Blocpdb> 47 atoms in block 101 Block first atom: 4525 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 4572 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 4619 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4671 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 4721 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 4773 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4820 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 4862 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4912 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 4950 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 4998 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 5040 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5083 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 5125 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5170 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5217 Blocpdb> 55 atoms in block 117 Block first atom: 5264 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 5319 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 5369 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5408 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 5453 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 5495 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 5533 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 5574 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 5620 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 5654 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5696 Blocpdb> 49 atoms in block 128 Block first atom: 5736 Blocpdb> 44 atoms in block 129 Block first atom: 5785 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5829 Blocpdb> 54 atoms in block 131 Block first atom: 5871 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 5925 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 5977 Blocpdb> 43 atoms in block 134 Block first atom: 6027 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 6070 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 6120 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6160 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 6209 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6251 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 6299 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6343 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6386 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 6430 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6476 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 6520 Blocpdb> 48 atoms in block 146 Block first atom: 6566 Blocpdb> 41 atoms in block 147 Block first atom: 6614 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 6655 Blocpdb> 58 atoms in block 149 Block first atom: 6706 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 6764 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 6787 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 6834 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 6881 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 6933 Blocpdb> 52 atoms in block 155 Block first atom: 6983 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7035 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 7082 Blocpdb> 50 atoms in block 158 Block first atom: 7124 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 7174 Blocpdb> 48 atoms in block 160 Block first atom: 7212 Blocpdb> 42 atoms in block 161 Block first atom: 7260 Blocpdb> 43 atoms in block 162 Block first atom: 7302 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 7345 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7387 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7432 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7479 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 7526 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7581 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 7631 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 7670 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7715 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 7757 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 7795 Blocpdb> 46 atoms in block 174 Block first atom: 7836 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 7882 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 7916 Blocpdb> 40 atoms in block 177 Block first atom: 7958 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 7998 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 8047 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 8091 Blocpdb> 54 atoms in block 181 Block first atom: 8133 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 8187 Blocpdb> 50 atoms in block 183 Block first atom: 8239 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 8289 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 8332 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 8382 Blocpdb> 49 atoms in block 187 Block first atom: 8422 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 8471 Blocpdb> 48 atoms in block 189 Block first atom: 8513 Blocpdb> 44 atoms in block 190 Block first atom: 8561 Blocpdb> 43 atoms in block 191 Block first atom: 8605 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 8648 Blocpdb> 46 atoms in block 193 Block first atom: 8692 Blocpdb> 44 atoms in block 194 Block first atom: 8738 Blocpdb> 46 atoms in block 195 Block first atom: 8782 Blocpdb> 48 atoms in block 196 Block first atom: 8828 Blocpdb> 41 atoms in block 197 Block first atom: 8876 Blocpdb> 51 atoms in block 198 Block first atom: 8917 Blocpdb> 58 atoms in block 199 Block first atom: 8968 Blocpdb> 23 atoms in block 200 Block first atom: 9025 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3650933 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27144 Prepmat> Matrix trace = 7993200.0000 Prepmat> Last element read: 27144 27144 147.2112 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18238 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9048 RTB> Total mass = 9048.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9048 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 244811.7729 RTB> 64032 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64032 Diagstd> Projected matrix trace = 244811.7729 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 244811.7729 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4697443 0.6429391 1.3511449 2.0112953 2.3632952 2.6188786 3.1587595 3.5378470 3.7147579 4.0966596 4.3725946 5.2774177 8.1435193 8.3440914 10.4594838 10.7820884 11.2464993 11.6886849 13.7436233 13.8204090 14.3687050 14.5065476 14.7320898 14.9032819 15.3319294 15.6427991 16.9566866 17.3004923 17.3231339 17.4038359 19.9235367 20.1538114 20.3279313 20.6691126 20.8503073 20.9209241 20.9780009 21.2885873 21.8231744 21.9023542 22.1637721 22.4054847 23.7447328 23.8746250 23.9941670 24.2550172 25.2520594 25.2867572 25.5707597 25.6644321 26.3301031 27.3230853 28.1370687 29.0364921 29.4103120 29.5549641 29.7671444 29.8293089 30.1016005 30.4082746 30.8996094 31.2472718 31.5180127 32.4454560 32.6457190 33.9975577 34.2265716 34.3317038 34.4673249 34.8153709 35.4133916 35.9707799 36.1491924 36.1991978 36.4795283 36.6988434 36.9945231 37.1953994 38.8700239 38.9222219 39.0205001 39.1592618 40.0728513 40.3785219 40.5691405 40.7743780 40.8248459 40.9071178 40.9917792 41.4632924 41.6906928 42.3761607 42.7749022 43.3118418 44.0920705 45.1558610 45.2981380 45.4891053 46.6729900 46.9063420 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034327 0.0034332 0.0034336 0.0034339 0.0034349 74.4262324 87.0723392 126.2252522 154.0044239 166.9376399 175.7328556 192.9983342 204.2512877 209.2958105 219.7911582 227.0726819 249.4629273 309.8855637 313.6785382 351.1966831 356.5715790 364.1698283 371.2599528 402.5741666 403.6971917 411.6272274 413.5969375 416.7997593 419.2144452 425.2004205 429.4894637 447.1629138 451.6733957 451.9688576 453.0204116 484.7061129 487.4991639 489.6005225 493.6921209 495.8513618 496.6903388 497.3674166 501.0357350 507.2875942 508.2070433 511.2309260 514.0110464 529.1501504 530.5954969 531.9222038 534.8057573 545.6870926 546.0618671 549.1197902 550.1246558 557.2134103 567.6232152 576.0162110 585.1501956 588.9048026 590.3512648 592.4665933 593.0849122 595.7856991 598.8129306 603.6313331 607.0176693 609.6417392 618.5463118 620.4523010 633.1682661 635.2972568 636.2722151 637.5277150 640.7384606 646.2179856 651.2836970 652.8968602 653.3482819 655.8732025 657.8418051 660.4865782 662.2773365 677.0218485 677.4762775 678.3310479 679.5360920 687.4172134 690.0339976 691.6608331 693.4081672 693.8371623 694.5359355 695.2542701 699.2414625 701.1562932 706.8969103 710.2149223 714.6585707 721.0668449 729.7134382 730.8621240 732.4010827 741.8704834 743.7227442 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9048 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9869E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6429 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.363 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.619 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.373 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.344 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.91 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 162864 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605130447382320865.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605130447382320865.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605130447382320865.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605130447382320865.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9048 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9869E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6429 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.363 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.619 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.373 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.344 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.91 Bfactors> 106 vectors, 27144 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.469700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.033 for 1192 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.01 Bfactors> = 87.003 +/- 9.04 Bfactors> Shiftng-fct= 86.985 Bfactors> Scaling-fct= 702.333 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605130447382320865.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605130447382320865.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0 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vecteur en lecture: 651.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 9048 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9505 0.0034 0.7886 0.0034 0.8438 0.0034 0.8754 0.0034 0.7748 0.0034 0.7433 74.4195 0.7493 87.0660 0.7959 126.2131 0.7221 153.9865 0.9055 166.9200 0.5552 175.7294 0.6750 192.9974 0.7718 204.2469 0.6187 209.2936 0.6175 219.7909 0.7668 227.0735 0.6681 249.4423 0.7399 309.8814 0.8015 313.6634 0.6805 351.1903 0.6676 356.5217 0.7254 364.2109 0.7016 371.2649 0.7353 402.5038 0.3455 403.6739 0.2876 411.6281 0.4947 413.6284 0.3862 416.7523 0.2386 419.1503 0.3951 425.1554 0.4264 429.4326 0.4314 447.1874 0.4207 451.6476 0.2891 451.9086 0.2560 452.9510 0.2421 484.6423 0.3173 487.4321 0.2702 489.6044 0.2554 493.6815 0.3267 495.8264 0.4268 496.6580 0.4370 497.3698 0.4217 501.0308 0.3252 507.2289 0.0910 508.1579 0.0871 511.1655 0.1937 514.0408 0.2110 529.0747 0.4415 530.5213 0.2966 531.8532 0.3092 534.8377 0.3561 545.6414 0.5109 546.0734 0.4411 549.0881 0.5226 550.0535 0.5672 557.1884 0.5907 567.5668 0.5693 576.0215 0.5537 585.1604 0.6845 588.8764 0.4879 590.2763 0.6628 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DQ=-80 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605130447382320865.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605130447382320865 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom making animated gifs 11 models are in 2605130447382320865.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605130447382320865.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605130447382320865.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605130447382320865 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130447382320865.eigenfacs 2605130447382320865.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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