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***  shlomo1  ***

LOGs for ID: 2605130705042351780

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605130705042351780.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605130705042351780.atom to be opened. Openam> File opened: 2605130705042351780.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 974 First residue number = 6 Last residue number = 518 Number of atoms found = 7880 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 266.684689 +/- 17.003668 From: 220.581000 To: 298.549000 = 229.677207 +/- 17.394130 From: 196.329000 To: 275.740000 = 123.870256 +/- 23.012156 From: 64.358000 To: 181.538000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0380 % Filled. Pdbmat> 2900488 non-zero elements. Pdbmat> 317082 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.48 +/- 21.19 Maximum number = 128 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 6.341640E+06 Pdbmat> Larger element = 493.997 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 974 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605130705042351780.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605130705042351780.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605130705042351780.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7880 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 974 residues. Blocpdb> 32 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 38 atoms in block 2 Block first atom: 33 Blocpdb> 43 atoms in block 3 Block first atom: 71 Blocpdb> 42 atoms in block 4 Block first atom: 114 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 156 Blocpdb> 51 atoms in block 6 Block first atom: 200 Blocpdb> 41 atoms in block 7 Block first atom: 251 Blocpdb> 44 atoms in block 8 Block first atom: 292 Blocpdb> 39 atoms in block 9 Block first atom: 336 Blocpdb> 34 atoms in block 10 Block first atom: 375 Blocpdb> 32 atoms in block 11 Block first atom: 409 Blocpdb> 42 atoms in block 12 Block first atom: 441 Blocpdb> 46 atoms in block 13 Block first atom: 483 Blocpdb> 35 atoms in block 14 Block first atom: 529 Blocpdb> 39 atoms in block 15 Block first atom: 564 Blocpdb> 34 atoms in block 16 Block first atom: 603 Blocpdb> 43 atoms in block 17 Block first atom: 637 Blocpdb> 33 atoms in block 18 Block first atom: 680 Blocpdb> 41 atoms in block 19 Block first atom: 713 Blocpdb> 44 atoms in block 20 Block first atom: 754 Blocpdb> 41 atoms in block 21 Block first atom: 798 Blocpdb> 46 atoms in block 22 Block first atom: 839 Blocpdb> 36 atoms in block 23 Block first atom: 885 Blocpdb> 42 atoms in block 24 Block first atom: 921 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 963 Blocpdb> 39 atoms in block 26 Block first atom: 1004 Blocpdb> 45 atoms in block 27 Block first atom: 1043 Blocpdb> 32 atoms in block 28 Block first atom: 1088 Blocpdb> 30 atoms in block 29 Block first atom: 1120 Blocpdb> 44 atoms in block 30 Block first atom: 1150 Blocpdb> 43 atoms in block 31 Block first atom: 1194 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 1237 Blocpdb> 42 atoms in block 33 Block first atom: 1278 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1320 Blocpdb> 30 atoms in block 35 Block first atom: 1359 Blocpdb> 34 atoms in block 36 Block first atom: 1389 Blocpdb> 38 atoms in block 37 Block first atom: 1423 Blocpdb> 41 atoms in block 38 Block first atom: 1461 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1502 Blocpdb> 34 atoms in block 40 Block first atom: 1547 Blocpdb> 45 atoms in block 41 Block first atom: 1581 Blocpdb> 47 atoms in block 42 Block first atom: 1626 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 1673 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1716 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1760 Blocpdb> 41 atoms in block 46 Block first atom: 1806 Blocpdb> 42 atoms in block 47 Block first atom: 1847 Blocpdb> 37 atoms in block 48 Block first atom: 1889 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 1926 Blocpdb> 39 atoms in block 50 Block first atom: 1965 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 2004 Blocpdb> 49 atoms in block 52 Block first atom: 2049 Blocpdb> 44 atoms in block 53 Block first atom: 2098 Blocpdb> 41 atoms in block 54 Block first atom: 2142 Blocpdb> 33 atoms in block 55 Block first atom: 2183 Blocpdb> 37 atoms in block 56 Block first atom: 2216 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2253 Blocpdb> 35 atoms in block 58 Block first atom: 2295 Blocpdb> 41 atoms in block 59 Block first atom: 2330 Blocpdb> 41 atoms in block 60 Block first atom: 2371 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 2412 Blocpdb> 50 atoms in block 62 Block first atom: 2450 Blocpdb> 45 atoms in block 63 Block first atom: 2500 Blocpdb> 41 atoms in block 64 Block first atom: 2545 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2586 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 2633 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 2670 Blocpdb> 47 atoms in block 68 Block first atom: 2714 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 2761 Blocpdb> 35 atoms in block 70 Block first atom: 2797 Blocpdb> 36 atoms in block 71 Block first atom: 2832 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 2868 Blocpdb> 45 atoms in block 73 Block first atom: 2906 Blocpdb> 30 atoms in block 74 Block first atom: 2951 Blocpdb> 38 atoms in block 75 Block first atom: 2981 Blocpdb> 48 atoms in block 76 Block first atom: 3019 Blocpdb> 42 atoms in block 77 Block first atom: 3067 Blocpdb> 44 atoms in block 78 Block first atom: 3109 Blocpdb> 39 atoms in block 79 Block first atom: 3153 Blocpdb> 38 atoms in block 80 Block first atom: 3192 Blocpdb> 47 atoms in block 81 Block first atom: 3230 Blocpdb> 39 atoms in block 82 Block first atom: 3277 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 3316 Blocpdb> 45 atoms in block 84 Block first atom: 3352 Blocpdb> 43 atoms in block 85 Block first atom: 3397 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 3440 Blocpdb> 41 atoms in block 87 Block first atom: 3480 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 3521 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 3561 Blocpdb> 38 atoms in block 90 Block first atom: 3598 Blocpdb> 39 atoms in block 91 Block first atom: 3636 Blocpdb> 48 atoms in block 92 Block first atom: 3675 Blocpdb> 37 atoms in block 93 Block first atom: 3723 Blocpdb> 46 atoms in block 94 Block first atom: 3760 Blocpdb> 39 atoms in block 95 Block first atom: 3806 Blocpdb> 37 atoms in block 96 Block first atom: 3845 Blocpdb> 43 atoms in block 97 Block first atom: 3882 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 3925 Blocpdb> 32 atoms in block 99 Block first atom: 3941 Blocpdb> 38 atoms in block 100 Block first atom: 3973 Blocpdb> 43 atoms in block 101 Block first atom: 4011 Blocpdb> 42 atoms in block 102 Block first atom: 4054 Blocpdb> 44 atoms in block 103 Block first atom: 4096 Blocpdb> 51 atoms in block 104 Block first atom: 4140 Blocpdb> 41 atoms in block 105 Block first atom: 4191 Blocpdb> 44 atoms in block 106 Block first atom: 4232 Blocpdb> 39 atoms in block 107 Block first atom: 4276 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 4315 Blocpdb> 32 atoms in block 109 Block first atom: 4349 Blocpdb> 42 atoms in block 110 Block first atom: 4381 Blocpdb> 46 atoms in block 111 Block first atom: 4423 Blocpdb> 35 atoms in block 112 Block first atom: 4469 Blocpdb> 39 atoms in block 113 Block first atom: 4504 Blocpdb> 34 atoms in block 114 Block first atom: 4543 Blocpdb> 43 atoms in block 115 Block first atom: 4577 Blocpdb> 33 atoms in block 116 Block first atom: 4620 Blocpdb> 41 atoms in block 117 Block first atom: 4653 Blocpdb> 44 atoms in block 118 Block first atom: 4694 Blocpdb> 41 atoms in block 119 Block first atom: 4738 Blocpdb> 46 atoms in block 120 Block first atom: 4779 Blocpdb> 36 atoms in block 121 Block first atom: 4825 Blocpdb> 42 atoms in block 122 Block first atom: 4861 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 4903 Blocpdb> 39 atoms in block 124 Block first atom: 4944 Blocpdb> 45 atoms in block 125 Block first atom: 4983 Blocpdb> 32 atoms in block 126 Block first atom: 5028 Blocpdb> 30 atoms in block 127 Block first atom: 5060 Blocpdb> 44 atoms in block 128 Block first atom: 5090 Blocpdb> 43 atoms in block 129 Block first atom: 5134 Blocpdb> 41 atoms in block 130 Block first atom: 5177 Blocpdb> 42 atoms in block 131 Block first atom: 5218 Blocpdb> 39 atoms in block 132 Block first atom: 5260 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 5299 Blocpdb> 34 atoms in block 134 Block first atom: 5329 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 5363 Blocpdb> 41 atoms in block 136 Block first atom: 5401 Blocpdb> 45 atoms in block 137 Block first atom: 5442 Blocpdb> 34 atoms in block 138 Block first atom: 5487 Blocpdb> 45 atoms in block 139 Block first atom: 5521 Blocpdb> 47 atoms in block 140 Block first atom: 5566 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 5613 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 5656 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 5700 Blocpdb> 41 atoms in block 144 Block first atom: 5746 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 5787 Blocpdb> 37 atoms in block 146 Block first atom: 5829 Blocpdb> 39 atoms in block 147 Block first atom: 5866 Blocpdb> 39 atoms in block 148 Block first atom: 5905 Blocpdb> 45 atoms in block 149 Block first atom: 5944 Blocpdb> 49 atoms in block 150 Block first atom: 5989 Blocpdb> 44 atoms in block 151 Block first atom: 6038 Blocpdb> 41 atoms in block 152 Block first atom: 6082 Blocpdb> 33 atoms in block 153 Block first atom: 6123 Blocpdb> 37 atoms in block 154 Block first atom: 6156 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 6193 Blocpdb> 35 atoms in block 156 Block first atom: 6235 Blocpdb> 41 atoms in block 157 Block first atom: 6270 Blocpdb> 41 atoms in block 158 Block first atom: 6311 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 6352 Blocpdb> 50 atoms in block 160 Block first atom: 6390 Blocpdb> 45 atoms in block 161 Block first atom: 6440 Blocpdb> 41 atoms in block 162 Block first atom: 6485 Blocpdb> 47 atoms in block 163 Block first atom: 6526 Blocpdb> 37 atoms in block 164 Block first atom: 6573 Blocpdb> 44 atoms in block 165 Block first atom: 6610 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 6654 Blocpdb> 36 atoms in block 167 Block first atom: 6701 Blocpdb> 35 atoms in block 168 Block first atom: 6737 Blocpdb> 36 atoms in block 169 Block first atom: 6772 Blocpdb> 38 atoms in block 170 Block first atom: 6808 Blocpdb> 45 atoms in block 171 Block first atom: 6846 Blocpdb> 30 atoms in block 172 Block first atom: 6891 Blocpdb> 38 atoms in block 173 Block first atom: 6921 Blocpdb> 48 atoms in block 174 Block first atom: 6959 Blocpdb> 42 atoms in block 175 Block first atom: 7007 Blocpdb> 44 atoms in block 176 Block first atom: 7049 Blocpdb> 39 atoms in block 177 Block first atom: 7093 Blocpdb> 38 atoms in block 178 Block first atom: 7132 Blocpdb> 47 atoms in block 179 Block first atom: 7170 Blocpdb> 39 atoms in block 180 Block first atom: 7217 Blocpdb> 36 atoms in block 181 Block first atom: 7256 Blocpdb> 45 atoms in block 182 Block first atom: 7292 Blocpdb> 43 atoms in block 183 Block first atom: 7337 Blocpdb> 40 atoms in block 184 Block first atom: 7380 Blocpdb> 41 atoms in block 185 Block first atom: 7420 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 7461 Blocpdb> 37 atoms in block 187 Block first atom: 7501 Blocpdb> 38 atoms in block 188 Block first atom: 7538 Blocpdb> 39 atoms in block 189 Block first atom: 7576 Blocpdb> 48 atoms in block 190 Block first atom: 7615 Blocpdb> 37 atoms in block 191 Block first atom: 7663 Blocpdb> 46 atoms in block 192 Block first atom: 7700 Blocpdb> 39 atoms in block 193 Block first atom: 7746 Blocpdb> 37 atoms in block 194 Block first atom: 7785 Blocpdb> 43 atoms in block 195 Block first atom: 7822 Blocpdb> 16 atoms in block 196 Block first atom: 7864 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2900684 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23640 Prepmat> Matrix trace = 6341640.0000 Prepmat> Last element read: 23640 23640 154.7945 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17624 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7880 RTB> Total mass = 7880.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7880 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 217382.6994 RTB> 57612 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57612 Diagstd> Projected matrix trace = 217382.6994 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 217382.6994 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3403572 0.7000604 1.2040459 1.5404985 1.7261027 1.9051768 2.1398984 2.6488970 2.7488237 2.8806668 3.4799809 4.1863701 4.4309090 5.2737282 5.5361574 5.5811883 5.7729266 5.9371797 7.3643068 7.5463544 8.0820725 8.6999410 8.8096528 8.9810959 9.6944842 10.0611104 10.7785140 10.8293244 11.5761453 12.1731479 12.5502355 12.8969851 13.0795612 13.6638949 14.1203194 14.1594581 14.6537479 15.2630746 15.5444928 15.7373940 16.5926870 17.1459112 17.5805291 17.6694010 17.7895754 18.1665727 18.7879590 18.9233839 19.2999857 20.1313172 20.3817539 20.5354037 20.9198223 20.9243759 21.2797045 21.4287339 21.9527903 22.4901199 23.6013495 23.7348094 24.7208403 24.8815354 25.3717564 25.8159256 26.7068753 27.0140578 27.2045481 27.7619768 28.0911328 28.8563218 29.0071480 29.3393645 29.9530332 29.9860304 30.5982832 30.8253270 31.1027296 31.6891550 31.7605791 32.1362787 32.5298587 32.9652328 32.9889547 33.3869417 33.6725489 34.1794130 34.2214695 34.6815301 35.5877473 35.6688868 36.3206955 36.9575108 37.4820450 37.7658562 37.8142945 37.8546239 38.8437695 39.2542693 39.4105850 39.9835755 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034326 0.0034336 0.0034339 0.0034340 0.0034348 63.3523568 90.8579697 119.1562412 134.7801474 142.6686636 149.8866404 158.8516957 176.7371366 180.0398830 184.3069853 202.5740039 222.1846705 228.5818237 249.3757103 255.5050543 256.5420833 260.9115453 264.5972819 294.6871621 298.3072977 308.7142313 320.2974161 322.3106653 325.4317698 338.1097022 344.4436936 356.5124702 357.3517906 369.4683698 378.8756809 384.6991417 389.9773457 392.7280011 401.4047776 408.0539064 408.6190379 415.6900588 424.2445717 428.1377854 430.7861069 442.3373793 449.6510024 455.3142583 456.4636447 458.0132815 462.8409545 470.6901200 472.3834567 477.0608453 487.2270324 490.2482560 492.0926777 496.6772593 496.7313117 500.9311939 502.6822333 508.7918485 514.9809520 527.5500858 529.0395673 539.9168662 541.6688587 546.9788660 551.7459203 561.1859895 564.4041427 566.3906014 572.1639276 575.5458237 583.3319532 584.8544457 588.1940559 594.3136217 594.6408885 600.6808827 602.9053342 605.6120849 611.2946705 611.9831807 615.5921498 619.3503232 623.4811876 623.7054766 627.4564666 630.1345269 634.8594378 635.2499030 639.5056787 647.8068399 648.5449140 654.4438007 660.1560939 664.8243527 667.3366056 667.7644297 668.1204237 676.7931652 680.3599318 681.7132281 686.6510594 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7880 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.905 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.140 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.649 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.431 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.274 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.773 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.937 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.700 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.981 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 141840 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605130705042351780.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605130705042351780.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605130705042351780.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605130705042351780.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 974 First residue number = 6 Last residue number = 518 Number of atoms found = 7880 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.905 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.140 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.431 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.274 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.937 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.700 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.981 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Bfactors> 106 vectors, 23640 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.340400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.389 for 974 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.027 +/- 0.02 Bfactors> = 73.070 +/- 23.38 Bfactors> Shiftng-fct= 73.042 Bfactors> Scaling-fct= 1086.314 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605130705042351780.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605130705042351780.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6 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Chkmod> That is: 7880 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9946 0.0034 0.7759 0.0034 0.6318 0.0034 0.8365 0.0034 0.7729 0.0034 0.6700 63.3536 0.5575 90.8566 0.6262 119.1489 0.5718 134.7526 0.4641 142.6583 0.6308 149.8733 0.7748 158.8486 0.5378 176.7330 0.6841 180.0379 0.5971 184.3097 0.6196 202.5659 0.4998 222.1653 0.4800 228.5744 0.4521 249.3714 0.4548 255.4905 0.4552 256.5267 0.4824 260.9020 0.6594 264.5819 0.4916 294.6684 0.6208 298.2875 0.5900 308.6996 0.5923 320.2848 0.4194 322.3032 0.6436 325.4161 0.5988 338.0867 0.5049 344.4099 0.4875 356.5217 0.5251 357.3476 0.5803 369.5140 0.3733 378.8104 0.5600 384.6790 0.5267 390.0062 0.5225 392.7177 0.1823 401.3303 0.3889 408.0318 0.6307 408.6093 0.4794 415.6191 0.2989 424.1836 0.3080 428.0575 0.5331 430.8033 0.4729 442.2826 0.4777 449.6853 0.4841 455.2879 0.4759 456.4518 0.4119 457.9991 0.4382 462.8647 0.4872 470.6955 0.4625 472.3209 0.4870 477.0405 0.5979 487.1902 0.5209 490.2061 0.3513 492.1266 0.3610 496.6580 0.4903 496.6580 0.4747 500.9132 0.5040 502.6755 0.4900 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DQ=-80 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom making animated gifs 11 models are in 2605130705042351780.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605130705042351780.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605130705042351780.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605130705042351780 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605130705042351780.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605130705042351780 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom making animated gifs 11 models are in 2605130705042351780.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605130705042351780.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605130705042351780.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605130705042351780 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605130705042351780.eigenfacs 2605130705042351780.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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