*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605130711312364070.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605130711312364070.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605130711312364070.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 74
First residue number = 1
Last residue number = 74
Number of atoms found = 1570
Mean number per residue = 21.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 2.307348 +/- 14.702951 From: -36.984000 To: 29.431000
= 0.554790 +/- 8.613678 From: -24.062000 To: 17.973000
= 0.812525 +/- 15.187484 From: -27.804000 To: 40.751000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 74 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.8459 % Filled.
Pdbmat> 537624 non-zero elements.
Pdbmat> 58696 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 74.77 +/- 24.25
Maximum number = 133
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 1.173920E+06
Pdbmat> Larger element = 507.756
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
74 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605130711312364070.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605130711312364070.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605130711312364070.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1570 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 74 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 23 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 23 atoms in block 3
Block first atom: 47
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 70
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 93
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 115
Blocpdb> 22 atoms in block 7
Block first atom: 135
Blocpdb> 20 atoms in block 8
Block first atom: 157
Blocpdb> 23 atoms in block 9
Block first atom: 177
Blocpdb> 23 atoms in block 10
Block first atom: 200
Blocpdb> 20 atoms in block 11
Block first atom: 223
Blocpdb> 23 atoms in block 12
Block first atom: 243
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 266
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 286
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 308
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 330
Blocpdb> 23 atoms in block 17
Block first atom: 350
Blocpdb> 23 atoms in block 18
Block first atom: 373
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 396
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 416
Blocpdb> 23 atoms in block 21
Block first atom: 438
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 461
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 481
Blocpdb> 20 atoms in block 24
Block first atom: 503
Blocpdb> 22 atoms in block 25
Block first atom: 523
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 545
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 567
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 587
Blocpdb> 23 atoms in block 29
Block first atom: 609
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 632
Blocpdb> 20 atoms in block 31
Block first atom: 654
Blocpdb> 20 atoms in block 32
Block first atom: 674
Blocpdb> 20 atoms in block 33
Block first atom: 694
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 714
Blocpdb> 23 atoms in block 35
Block first atom: 734
Blocpdb> 23 atoms in block 36
Block first atom: 757
Blocpdb> 20 atoms in block 37
Block first atom: 780
Blocpdb> 20 atoms in block 38
Block first atom: 800
Blocpdb> 20 atoms in block 39
Block first atom: 820
Blocpdb> 20 atoms in block 40
Block first atom: 840
Blocpdb> 23 atoms in block 41
Block first atom: 860
Blocpdb> 20 atoms in block 42
Block first atom: 883
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 903
Blocpdb> 20 atoms in block 44
Block first atom: 923
Blocpdb> 23 atoms in block 45
Block first atom: 943
Blocpdb> 20 atoms in block 46
Block first atom: 966
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 986
Blocpdb> 20 atoms in block 48
Block first atom: 1006
Blocpdb> 22 atoms in block 49
Block first atom: 1026
Blocpdb> 23 atoms in block 50
Block first atom: 1048
Blocpdb> 23 atoms in block 51
Block first atom: 1071
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 1094
Blocpdb> 20 atoms in block 53
Block first atom: 1114
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 1134
Blocpdb> 23 atoms in block 55
Block first atom: 1154
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1177
Blocpdb> 22 atoms in block 57
Block first atom: 1199
Blocpdb> 20 atoms in block 58
Block first atom: 1221
Blocpdb> 20 atoms in block 59
Block first atom: 1241
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1261
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 1281
Blocpdb> 20 atoms in block 62
Block first atom: 1301
Blocpdb> 23 atoms in block 63
Block first atom: 1321
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 1344
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1364
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1386
Blocpdb> 20 atoms in block 67
Block first atom: 1406
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1426
Blocpdb> 20 atoms in block 69
Block first atom: 1446
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1466
Blocpdb> 23 atoms in block 71
Block first atom: 1486
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1509
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1529
Blocpdb> 22 atoms in block 74
Block first atom: 1548
Blocpdb> 74 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 537698 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4710
Prepmat> Matrix trace = 1173920.0000
Prepmat> Last element read: 4710 4710 126.0340
Prepmat> 2776 lines saved.
Prepmat> 2298 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1570
RTB> Total mass = 1570.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1570
RTB> Number of blocks = 74
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 85709.6247
RTB> 16062 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 444
Diagstd> Nb of non-zero elements: 16062
Diagstd> Projected matrix trace = 85709.6247
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 444 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 85709.6247
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0705485 0.1687408 0.2532178 0.3858340
0.4845856 0.6285288 0.8030159 1.1084032 1.7020190
1.8389694 2.1676040 2.4883994 3.2310772 3.6582873
4.2709688 5.4250005 5.8279694 6.4940940 7.1785556
8.1601332 9.0408546 9.6349055 10.5784463 11.7970621
12.0678032 12.6511497 13.9673646 14.9173983 15.0567925
16.4643591 16.6139100 18.6102385 18.7123744 19.2082521
20.4632052 20.8900560 22.1420212 22.7384564 23.6147920
24.8928715 26.5389671 27.0039219 28.1879462 28.5506719
30.0905407 30.2650428 30.5275533 31.1033503 31.6234819
32.1265957 32.9698776 34.1522706 35.5005986 35.7720066
36.5335067 37.3899034 37.9742683 39.4283766 39.7173302
40.1679466 40.9003739 42.0438997 42.6799223 44.2156518
45.2823936 45.7247338 46.7128745 47.6461736 49.0211167
49.3889381 50.6478834 51.6308245 52.0962153 52.8057929
54.1839860 54.7537851 55.4727307 56.4189494 57.5250972
58.1662968 59.1611199 60.0396148 60.2792157 61.6317312
61.8367422 62.1676655 62.9031146 63.3798301 63.9603987
65.4046271 65.9811139 67.4920232 68.3820883 68.7852596
70.9566168 71.2969629 72.0552642 73.4592158 74.2073576
74.8797105
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034324 0.0034326 0.0034336 0.0034342 0.0034346
0.0034350 28.8429250 44.6072399 54.6439906 67.4521065
75.5928158 86.0910255 97.3099725 114.3257759 141.6698660
147.2592306 159.8767279 171.2991959 195.1951174 207.6988940
224.4184100 252.9269868 262.1524438 276.7289304 290.9469537
310.2015068 326.5126580 337.0691537 353.1882315 372.9771389
377.2327507 386.2426940 405.8378186 419.4129382 421.3679628
440.6235400 442.6201768 468.4586356 469.7423639 475.9257513
491.2268645 496.3237784 510.9800107 517.8163634 527.7003017
541.7922380 559.4190971 564.2982484 576.5367517 580.2343651
595.6762384 597.4009739 599.9862249 605.6181270 610.6609136
615.4994009 623.5251097 634.6073121 647.0131666 649.4817187
656.3582686 664.0066847 669.1754311 681.8670872 684.3610818
688.2323706 694.4786824 704.1201555 709.4259822 722.0766416
730.7350986 734.2955107 742.1873994 749.5649920 760.3033082
763.1503796 772.8156898 780.2788058 783.7875613 789.1073058
799.3385446 803.5304775 808.7886585 815.6573942 823.6144566
828.1919175 835.2442095 841.4227087 843.0999756 852.5060381
853.9227435 856.2046061 861.2542046 864.5115814 868.4620819
878.2123038 882.0741640 892.1163604 897.9795780 900.6228689
914.7274890 916.9186267 921.7818187 930.7186664 935.4460895
939.6743206
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1570
Rtb_to_modes> Number of blocs = 74
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0549E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1687
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2532
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3858
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4846
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6285
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8030
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.839
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.168
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.488
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.231
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.658
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.425
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.828
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.494
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.179
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.160
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.041
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.635
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.88
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 444 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00004 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003
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0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997
0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
1.00003 0.99996 0.99997 0.99998 1.00002
0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99997
1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001
1.00002 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000
0.99999 0.99999 0.99997 1.00004 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 28260 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00004 1.00000 0.99999 0.99998
1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003
1.00002 0.99998 0.99996 0.99998 1.00001
0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997
0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999
0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
1.00003 0.99996 0.99997 0.99998 1.00002
0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99997
1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 1.00001
1.00002 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000
0.99999 0.99999 0.99997 1.00004 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605130711312364070.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605130711312364070.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605130711312364070.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605130711312364070.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 74
First residue number = 1
Last residue number = 74
Number of atoms found = 1570
Mean number per residue = 21.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0549E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2532
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3858
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4846
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8030
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.839
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.168
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.488
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.658
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.425
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.494
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.179
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.160
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.041
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.635
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.88
Bfactors> 106 vectors, 4710 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.070549
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> 0 negative values found in the B-factors column of pdb file.
%Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605130711312364070.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605130711312364070.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.6
Chkmod> 106 vectors, 4710 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1570 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9807
0.0034 0.6072
0.0034 0.6471
0.0034 0.9213
0.0034 0.7794
0.0034 0.8472
28.8418 0.4317
44.5999 0.3941
54.6397 0.4974
67.4462 0.4936
75.5907 0.3189
86.0854 0.3921
97.3048 0.3567
114.3001 0.5661
141.6630 0.4624
147.2541 0.4557
159.8845 0.4343
171.2781 0.4169
195.1844 0.6442
207.6818 0.5089
224.4096 0.5833
252.9161 0.3686
262.1419 0.6328
276.7150 0.6017
290.9435 0.4965
310.1857 0.5478
326.5013 0.6399
337.0563 0.5154
353.1990 0.2353
373.0076 0.5043
377.2509 0.5343
386.2086 0.5300
405.8587 0.4305
419.4315 0.5891
421.3948 0.5673
440.5463 0.4588
442.5491 0.3033
468.4355 0.5159
469.6924 0.5025
475.9270 0.4610
491.1673 0.2704
496.3018 0.4661
510.9348 0.3129
517.8117 0.4726
527.6241 0.4662
541.7377 0.4602
559.4060 0.4449
564.2330 0.5311
576.5330 0.4306
580.2026 0.4677
595.6453 0.3786
597.4243 0.4981
599.9845 0.3933
605.5595 0.3936
610.6011 0.4323
615.5056 0.3641
623.4995 0.3696
634.5590 0.4736
646.9799 0.3709
649.4356 0.4064
656.2986 0.5065
663.9790 0.4724
669.1091 0.3492
681.8519 0.4669
684.3547 0.4724
688.2204 0.5176
694.4457 0.4854
704.0573 0.5222
709.3962 0.4737
722.0811 0.2817
730.6844 0.4583
734.2260 0.4735
742.1327 0.3875
749.5629 0.5361
760.2620 0.5139
763.1258 0.4232
772.7987 0.3800
780.2391 0.4716
783.7824 0.5002
789.1049 0.3880
799.2748 0.4448
803.4682 0.3241
808.7340 0.4607
815.6300 0.4087
823.6142 0.5559
828.1827 0.5426
835.2004 0.5086
841.3893 0.6049
843.0693 0.3766
852.4575 0.4923
853.9086 0.4216
856.1839 0.2967
861.1959 0.3256
864.4756 0.5563
868.4221 0.1560
878.1435 0.5666
882.0289 0.4691
892.0647 0.5091
897.9273 0.3733
900.6152 0.3802
914.7100 0.4060
916.8988 0.4203
921.7725 0.4511
930.6837 0.3077
935.4226 0.2941
939.6358 0.5401
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605130711312364070 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
making animated gifs
11 models are in 2605130711312364070.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605130711312364070.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605130711312364070.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605130711312364070 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605130711312364070.eigenfacs
2605130711312364070.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
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2605130711312364070.atom
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Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
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user 0m2.741s
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rm: cannot remove '2605130711312364070.sdijf': No such file or directory
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