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***  2647  ***

LOGs for ID: 2605141238122666813

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605141238122666813.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605141238122666813.atom to be opened. Openam> File opened: 2605141238122666813.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 524 First residue number = 44 Last residue number = 567 Number of atoms found = 3980 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -58.653230 +/- 17.452989 From: -93.634000 To: -17.769000 = 20.179913 +/- 10.466527 From: -2.082000 To: 45.444000 = -10.724043 +/- 13.067219 From: -39.479000 To: 19.643000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1550 % Filled. Pdbmat> 1536249 non-zero elements. Pdbmat> 168068 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.46 +/- 22.84 Maximum number = 132 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 3.361360E+06 Pdbmat> Larger element = 497.473 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 524 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605141238122666813.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605141238122666813.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605141238122666813.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3980 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 524 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 22 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 42 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 66 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 85 Blocpdb> 25 atoms in block 6 Block first atom: 109 Blocpdb> 26 atoms in block 7 Block first atom: 134 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 160 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 184 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 207 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 223 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 242 Blocpdb> 30 atoms in block 13 Block first atom: 269 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 299 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 321 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 341 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 369 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 391 Blocpdb> 26 atoms in block 19 Block first atom: 411 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 437 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 468 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 512 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 28 atoms in block 25 Block first atom: 558 Blocpdb> 19 atoms in block 26 Block first atom: 586 Blocpdb> 25 atoms in block 27 Block first atom: 605 Blocpdb> 21 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 22 atoms in block 29 Block first atom: 651 Blocpdb> 29 atoms in block 30 Block first atom: 673 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 702 Blocpdb> 27 atoms in block 32 Block first atom: 727 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 754 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 774 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 793 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 836 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 859 Blocpdb> 23 atoms in block 39 Block first atom: 881 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 904 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 928 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 974 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 992 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1016 Blocpdb> 26 atoms in block 46 Block first atom: 1036 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 1062 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1088 Blocpdb> 23 atoms in block 49 Block first atom: 1114 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1137 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 1158 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 1181 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 1202 Blocpdb> 23 atoms in block 54 Block first atom: 1220 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 1243 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1262 Blocpdb> 21 atoms in block 57 Block first atom: 1291 Blocpdb> 26 atoms in block 58 Block first atom: 1312 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 1338 Blocpdb> 29 atoms in block 60 Block first atom: 1357 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1386 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 1408 Blocpdb> 24 atoms in block 63 Block first atom: 1425 Blocpdb> 30 atoms in block 64 Block first atom: 1449 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1479 Blocpdb> 18 atoms in block 66 Block first atom: 1501 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1519 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 1535 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1553 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1571 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1621 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1639 Blocpdb> 25 atoms in block 74 Block first atom: 1661 Blocpdb> 22 atoms in block 75 Block first atom: 1686 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 1708 Blocpdb> 25 atoms in block 77 Block first atom: 1735 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1760 Blocpdb> 22 atoms in block 79 Block first atom: 1780 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1802 Blocpdb> 21 atoms in block 81 Block first atom: 1827 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1848 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 1866 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1887 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1905 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1925 Blocpdb> 19 atoms in block 87 Block first atom: 1949 Blocpdb> 25 atoms in block 88 Block first atom: 1968 Blocpdb> 32 atoms in block 89 Block first atom: 1993 Blocpdb> 21 atoms in block 90 Block first atom: 2025 Blocpdb> 28 atoms in block 91 Block first atom: 2046 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2074 Blocpdb> 24 atoms in block 93 Block first atom: 2095 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2119 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 2139 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 23 atoms in block 97 Block first atom: 2180 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2203 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2226 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 2249 Blocpdb> 19 atoms in block 101 Block first atom: 2277 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2296 Blocpdb> 21 atoms in block 103 Block first atom: 2322 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 2343 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2364 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 2385 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 22 atoms in block 110 Block first atom: 2474 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 2496 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2514 Blocpdb> 21 atoms in block 113 Block first atom: 2539 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2560 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2584 Blocpdb> 23 atoms in block 116 Block first atom: 2608 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 2631 Blocpdb> 29 atoms in block 118 Block first atom: 2649 Blocpdb> 27 atoms in block 119 Block first atom: 2678 Blocpdb> 21 atoms in block 120 Block first atom: 2705 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2726 Blocpdb> 26 atoms in block 122 Block first atom: 2747 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2773 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 2792 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 2808 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 28 atoms in block 127 Block first atom: 2848 Blocpdb> 30 atoms in block 128 Block first atom: 2876 Blocpdb> 26 atoms in block 129 Block first atom: 2906 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2932 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 2951 Blocpdb> 21 atoms in block 132 Block first atom: 2979 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 3000 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 3022 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 3039 Blocpdb> 27 atoms in block 136 Block first atom: 3057 Blocpdb> 32 atoms in block 137 Block first atom: 3084 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 3116 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 3143 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 3163 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3183 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 3204 Blocpdb> 19 atoms in block 143 Block first atom: 3222 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3261 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 3289 Blocpdb> 24 atoms in block 147 Block first atom: 3309 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 3333 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 3351 Blocpdb> 26 atoms in block 150 Block first atom: 3375 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3401 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 3424 Blocpdb> 29 atoms in block 153 Block first atom: 3443 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 3472 Blocpdb> 24 atoms in block 155 Block first atom: 3500 Blocpdb> 18 atoms in block 156 Block first atom: 3524 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3542 Blocpdb> 27 atoms in block 158 Block first atom: 3566 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 3593 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 3616 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 3635 Blocpdb> 27 atoms in block 162 Block first atom: 3653 Blocpdb> 24 atoms in block 163 Block first atom: 3680 Blocpdb> 26 atoms in block 164 Block first atom: 3704 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 3730 Blocpdb> 24 atoms in block 166 Block first atom: 3755 Blocpdb> 28 atoms in block 167 Block first atom: 3779 Blocpdb> 23 atoms in block 168 Block first atom: 3807 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3830 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 3856 Blocpdb> 21 atoms in block 171 Block first atom: 3874 Blocpdb> 27 atoms in block 172 Block first atom: 3895 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 3922 Blocpdb> 23 atoms in block 174 Block first atom: 3944 Blocpdb> 14 atoms in block 175 Block first atom: 3966 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1536424 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 11940 Prepmat> Matrix trace = 3361360.0000 Prepmat> Last element read: 11940 11940 36.6788 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 13666 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3980 RTB> Total mass = 3980.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3980 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 234122.4447 RTB> 59799 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59799 Diagstd> Projected matrix trace = 234122.4447 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 234122.4447 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4156205 0.9151538 2.3482316 2.5216683 2.9797817 4.3240077 4.8727561 5.3901348 6.0482319 6.7268312 8.1769920 8.4987344 10.2076756 10.7376019 11.4946622 11.9150505 12.8355763 13.5900442 14.0663617 14.4573241 14.8083531 16.7175954 17.7701182 17.8804303 18.3873698 19.3044163 19.9419364 20.4084498 20.9916775 21.5835718 21.8299179 22.5031102 22.6960176 23.2333515 24.3390579 25.2646481 25.9041815 26.4031571 26.7504231 27.7355340 28.2599682 29.3567717 29.4179621 29.9836903 30.4138913 31.0064524 31.2261864 31.8218533 32.2581706 32.8190723 33.6049088 33.7023167 34.7446406 35.3055006 35.8773558 36.3283647 37.2096695 37.3198478 38.6927756 38.8268632 39.8647500 40.3063487 40.8822847 41.4173536 41.8495802 42.4521579 42.9730323 43.4050860 43.8724377 44.1591868 44.7436268 45.2743316 45.6729062 46.8063120 47.5119799 47.8433124 48.7091384 48.9456824 49.6991171 50.0652030 50.4616844 51.1393827 51.6868499 52.1590343 52.8299963 53.9897348 54.8469059 55.3170878 56.3490225 56.7453506 57.1781022 57.6975118 58.4008586 58.6927422 59.0636352 59.8470954 60.2007608 60.8424288 61.0380849 61.7514357 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034321 0.0034330 0.0034336 0.0034351 0.0034352 70.0073714 103.8824818 166.4047614 172.4404959 187.4508905 225.8075758 239.7080493 252.1129139 267.0604017 281.6440269 310.5217801 316.5719341 346.9434636 355.8352187 368.1657524 374.8376651 389.0478018 400.3185504 407.2735171 412.8946345 417.8771852 443.9991974 457.7627390 459.1813743 465.6451519 477.1156006 484.9298790 490.5692127 497.5295185 504.4950833 507.3659663 515.1296568 517.3329142 523.4210832 535.7314744 545.8230947 552.6882321 557.9858817 561.6433325 571.8913741 577.2728263 588.3685192 588.9813896 594.6176850 598.8682311 604.6740347 606.8128295 612.5732313 616.7585059 622.0974636 629.5013140 630.4129963 640.0872730 645.2328457 650.4373830 654.5128907 662.4043666 663.3843357 675.4764664 676.6458663 685.6299853 689.4170336 694.3250904 698.8539970 702.4911109 707.5304996 711.8578528 715.4274354 719.2687027 721.6154348 726.3749733 730.6700465 733.8792417 742.9293087 748.5086863 751.1140748 757.8801007 759.7181013 765.5430484 768.3573869 771.3938141 776.5564313 780.7020369 784.2599751 789.2881277 797.9044316 804.2134769 807.6532304 815.1517655 818.0134079 821.1266519 824.8478043 829.8601233 831.9313315 834.5557754 840.0725979 842.5511395 847.0295305 848.3903692 853.3335285 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3980 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4156 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.348 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.980 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.324 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.177 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.75 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 71640 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605141238122666813.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605141238122666813.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605141238122666813.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605141238122666813.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 524 First residue number = 44 Last residue number = 567 Number of atoms found = 3980 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.348 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.980 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.324 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.177 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.75 Bfactors> 106 vectors, 11940 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.415600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.538 for 524 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.05 Bfactors> = 38.323 +/- 9.01 Bfactors> Shiftng-fct= 38.290 Bfactors> Scaling-fct= 196.539 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605141238122666813.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605141238122666813.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4 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Chkmod> That is: 3980 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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DQ=-80 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom making animated gifs 11 models are in 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141238122666813 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom making animated gifs 11 models are in 2605141238122666813.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141238122666813.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141238122666813.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141238122666813 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141238122666813.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141238122666813 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141238122666813.eigenfacs 2605141238122666813.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141238122666813.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141238122666813.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605141238122666813.10.pdb 2605141238122666813.11.pdb 2605141238122666813.7.pdb 2605141238122666813.8.pdb 2605141238122666813.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m18.972s user 0m18.820s sys 0m0.128s rm: cannot remove '2605141238122666813.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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