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***  2647-Man  ***

LOGs for ID: 2605141239482667164

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605141239482667164.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605141239482667164.atom to be opened. Openam> File opened: 2605141239482667164.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 523 First residue number = 44 Last residue number = 566 Number of atoms found = 3970 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -51.258985 +/- 11.813881 From: -80.473000 To: -22.847000 = 4.039902 +/- 16.617593 From: -37.860000 To: 36.268000 = -14.705812 +/- 13.063785 From: -47.104000 To: 13.523000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1460 % Filled. Pdbmat> 1522153 non-zero elements. Pdbmat> 166507 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.88 +/- 22.56 Maximum number = 131 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 3.330140E+06 Pdbmat> Larger element = 507.612 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 523 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605141239482667164.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605141239482667164.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605141239482667164.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3970 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 523 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 22 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 42 Blocpdb> 19 atoms in block 4 Block first atom: 66 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 85 Blocpdb> 25 atoms in block 6 Block first atom: 109 Blocpdb> 26 atoms in block 7 Block first atom: 134 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 160 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 184 Blocpdb> 16 atoms in block 10 Block first atom: 207 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 223 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 242 Blocpdb> 30 atoms in block 13 Block first atom: 269 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 299 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 321 Blocpdb> 28 atoms in block 16 Block first atom: 341 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 369 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 391 Blocpdb> 26 atoms in block 19 Block first atom: 411 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 437 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 468 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 512 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 28 atoms in block 25 Block first atom: 558 Blocpdb> 19 atoms in block 26 Block first atom: 586 Blocpdb> 25 atoms in block 27 Block first atom: 605 Blocpdb> 21 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 22 atoms in block 29 Block first atom: 651 Blocpdb> 29 atoms in block 30 Block first atom: 673 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 702 Blocpdb> 27 atoms in block 32 Block first atom: 727 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 754 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 774 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 793 Blocpdb> 20 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 836 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 859 Blocpdb> 23 atoms in block 39 Block first atom: 881 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 904 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 928 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 974 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 992 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1016 Blocpdb> 26 atoms in block 46 Block first atom: 1036 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 1062 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1088 Blocpdb> 23 atoms in block 49 Block first atom: 1114 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1137 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 1158 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 1181 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 1202 Blocpdb> 23 atoms in block 54 Block first atom: 1220 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 1243 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1262 Blocpdb> 21 atoms in block 57 Block first atom: 1291 Blocpdb> 26 atoms in block 58 Block first atom: 1312 Blocpdb> 19 atoms in block 59 Block first atom: 1338 Blocpdb> 29 atoms in block 60 Block first atom: 1357 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1386 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 1408 Blocpdb> 24 atoms in block 63 Block first atom: 1425 Blocpdb> 30 atoms in block 64 Block first atom: 1449 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1479 Blocpdb> 18 atoms in block 66 Block first atom: 1501 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1519 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 1535 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1553 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1571 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1621 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1639 Blocpdb> 25 atoms in block 74 Block first atom: 1661 Blocpdb> 22 atoms in block 75 Block first atom: 1686 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 1708 Blocpdb> 25 atoms in block 77 Block first atom: 1735 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1760 Blocpdb> 22 atoms in block 79 Block first atom: 1780 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1802 Blocpdb> 21 atoms in block 81 Block first atom: 1827 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1848 Blocpdb> 21 atoms in block 83 Block first atom: 1866 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1887 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1905 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1925 Blocpdb> 19 atoms in block 87 Block first atom: 1949 Blocpdb> 25 atoms in block 88 Block first atom: 1968 Blocpdb> 32 atoms in block 89 Block first atom: 1993 Blocpdb> 21 atoms in block 90 Block first atom: 2025 Blocpdb> 28 atoms in block 91 Block first atom: 2046 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2074 Blocpdb> 24 atoms in block 93 Block first atom: 2095 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2119 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 2139 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2159 Blocpdb> 23 atoms in block 97 Block first atom: 2180 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2203 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2226 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 2249 Blocpdb> 19 atoms in block 101 Block first atom: 2277 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2296 Blocpdb> 21 atoms in block 103 Block first atom: 2322 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 2343 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2364 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 2385 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2409 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 2434 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 22 atoms in block 110 Block first atom: 2474 Blocpdb> 18 atoms in block 111 Block first atom: 2496 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2514 Blocpdb> 21 atoms in block 113 Block first atom: 2539 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2560 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2584 Blocpdb> 23 atoms in block 116 Block first atom: 2608 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 2631 Blocpdb> 29 atoms in block 118 Block first atom: 2649 Blocpdb> 27 atoms in block 119 Block first atom: 2678 Blocpdb> 21 atoms in block 120 Block first atom: 2705 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2726 Blocpdb> 26 atoms in block 122 Block first atom: 2747 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2773 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 2792 Blocpdb> 19 atoms in block 125 Block first atom: 2808 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 28 atoms in block 127 Block first atom: 2848 Blocpdb> 30 atoms in block 128 Block first atom: 2876 Blocpdb> 26 atoms in block 129 Block first atom: 2906 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2932 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 2951 Blocpdb> 21 atoms in block 132 Block first atom: 2979 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 3000 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 3022 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 3039 Blocpdb> 27 atoms in block 136 Block first atom: 3057 Blocpdb> 32 atoms in block 137 Block first atom: 3084 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 3116 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 3143 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 3163 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3183 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 3204 Blocpdb> 19 atoms in block 143 Block first atom: 3222 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3261 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 3289 Blocpdb> 24 atoms in block 147 Block first atom: 3309 Blocpdb> 18 atoms in block 148 Block first atom: 3333 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 3351 Blocpdb> 26 atoms in block 150 Block first atom: 3375 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3401 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 3424 Blocpdb> 29 atoms in block 153 Block first atom: 3443 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 3472 Blocpdb> 24 atoms in block 155 Block first atom: 3500 Blocpdb> 18 atoms in block 156 Block first atom: 3524 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3542 Blocpdb> 27 atoms in block 158 Block first atom: 3566 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 3593 Blocpdb> 19 atoms in block 160 Block first atom: 3616 Blocpdb> 18 atoms in block 161 Block first atom: 3635 Blocpdb> 27 atoms in block 162 Block first atom: 3653 Blocpdb> 24 atoms in block 163 Block first atom: 3680 Blocpdb> 26 atoms in block 164 Block first atom: 3704 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 3730 Blocpdb> 24 atoms in block 166 Block first atom: 3755 Blocpdb> 28 atoms in block 167 Block first atom: 3779 Blocpdb> 23 atoms in block 168 Block first atom: 3807 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3830 Blocpdb> 18 atoms in block 170 Block first atom: 3856 Blocpdb> 21 atoms in block 171 Block first atom: 3874 Blocpdb> 27 atoms in block 172 Block first atom: 3895 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 3922 Blocpdb> 23 atoms in block 174 Block first atom: 3944 Blocpdb> 4 atoms in block 175 Block first atom: 3966 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1522328 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 11910 Prepmat> Matrix trace = 3330140.0000 Prepmat> Last element read: 11910 11910 49.6873 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 13667 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3970 RTB> Total mass = 3970.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3970 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 231732.2054 RTB> 59763 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59763 Diagstd> Projected matrix trace = 231732.2054 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 231732.2054 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4034613 0.9483114 2.4726465 2.9894904 3.6747995 4.3029389 4.8371537 5.9139473 6.8976597 8.0081389 8.1621222 9.7839724 10.0426086 10.7830133 11.2542022 11.7921475 13.1735247 13.7866532 14.1411343 14.5626227 14.6480663 14.8752533 16.8791970 17.4248945 18.0191587 18.7954662 20.0836893 20.5314889 21.4840728 21.8012668 22.4410974 22.6778229 23.5652262 24.2446249 24.8571062 25.9307990 26.0398171 26.4087081 26.6265727 27.3027339 28.2335806 28.6337813 29.0021595 29.9577247 30.6076857 30.8570326 31.1461863 31.8252299 32.2308193 32.6454205 33.0178574 33.6274919 34.2010363 35.3535209 36.0108722 36.7226402 37.0992432 37.7142177 38.1688550 39.2470241 39.4735364 39.7099767 40.1895448 41.4702689 41.7209071 41.9222407 42.7745907 43.0287449 43.3757229 44.1715166 44.6103778 45.1199024 45.7375054 46.0926578 47.2860991 47.5371497 48.1323864 48.4427906 48.7662676 49.4893059 50.1286398 50.3930239 51.1610146 51.7770060 52.5022840 52.6499793 54.5550633 55.3202714 55.6795223 56.3196622 56.6129610 56.7718042 57.2093767 57.7334109 58.6735415 59.3398658 59.9453726 60.4470065 61.0321633 61.4772619 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034332 0.0034335 0.0034338 0.0034340 0.0034341 0.0034344 68.9757210 105.7476588 170.7561271 187.7560151 208.1671070 225.2567790 238.8307389 264.0790850 285.1977937 307.2989517 310.2393100 339.6666353 344.1268422 356.5868727 364.2945198 372.8994408 394.1361543 403.2038829 408.3545547 414.3955466 415.6094637 418.8200503 446.1400090 453.2944056 460.9592507 470.7841484 486.6503360 492.0457694 503.3308939 507.0329051 514.4193844 517.1255076 527.1462084 534.6911735 541.4028829 552.9721123 554.1332946 558.0445338 560.3416631 567.4117812 577.0032503 581.0782658 584.8041535 594.3601624 600.7731668 603.2153164 606.0350167 612.6057309 616.4969796 620.4494642 623.9786416 629.7127966 635.0602251 645.6714993 651.6465502 658.0550537 661.4207350 666.8802138 670.8877254 680.2971418 682.2574685 684.2977254 688.4173765 699.3002862 701.4103197 703.1006896 710.2123359 712.3191492 715.1854047 721.7161698 725.2925736 729.4228367 734.3980538 737.2438461 746.7272918 748.7069239 753.3798107 755.8051678 758.3244156 763.9254200 768.8440195 770.8688386 776.7206553 781.3826204 786.8362842 787.9422401 802.0709964 807.6764708 810.2947604 814.9393729 817.0586182 818.2040567 821.3511856 825.1043723 831.7952419 836.5050363 840.7620728 844.2725701 848.3492150 851.4370386 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3970 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4035 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.675 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.898 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.162 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.784 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.48 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99995 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 71460 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99995 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605141239482667164.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605141239482667164.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605141239482667164.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605141239482667164.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 523 First residue number = 44 Last residue number = 566 Number of atoms found = 3970 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4035 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.675 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.898 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.162 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.784 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.48 Bfactors> 106 vectors, 11910 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.403500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.301 for 523 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.06 Bfactors> = 43.638 +/- 10.30 Bfactors> Shiftng-fct= 43.605 Bfactors> Scaling-fct= 176.224 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605141239482667164.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605141239482667164.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.4 Chkmod> 106 vectors, 11910 coordinates in file. Chkmod> That is: 3970 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7680 0.0034 0.9249 0.0034 0.7689 0.0034 0.8256 0.0034 0.9835 0.0034 0.8536 68.9761 0.6544 105.7425 0.6548 170.7610 0.5141 187.7326 0.6865 208.1638 0.0007 225.2487 0.6808 238.8167 0.7684 264.0689 0.5970 285.1926 0.5255 307.2831 0.5824 310.2237 0.3509 339.6525 0.2182 344.0674 0.0067 356.5217 0.3119 364.2109 0.4197 372.8495 0.4180 394.0665 0.2801 403.2355 0.2958 408.3206 0.5197 414.3404 0.3289 415.6191 0.2966 418.8689 0.0575 446.1315 0.5159 453.2113 0.4774 460.9502 0.5256 470.8207 0.4260 486.5847 0.4725 492.0068 0.4269 503.2616 0.3828 506.9964 0.3479 514.3847 0.3377 517.1281 0.5639 527.1770 0.2818 534.6172 0.4563 541.4112 0.1695 552.9399 0.3418 554.1115 0.3253 558.0342 0.2788 560.3537 0.1954 567.3590 0.4656 576.9419 0.3686 581.0150 0.5124 584.7573 0.3732 594.3572 0.5320 600.7701 0.3305 603.2184 0.5173 606.0461 0.4555 612.6253 0.5581 616.4627 0.3772 620.4663 0.4144 623.9721 0.4608 629.7092 0.4700 635.0233 0.3878 645.6116 0.4377 651.6107 0.2563 658.0032 0.5017 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DQ=-80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom making animated gifs 11 models are in 2605141239482667164.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141239482667164.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141239482667164.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141239482667164 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605141239482667164.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141239482667164 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom making animated gifs 11 models are in 2605141239482667164.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141239482667164.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141239482667164.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141239482667164 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141239482667164.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2605141239482667164 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605141239482667164.eigenfacs 2605141239482667164.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605141239482667164.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605141239482667164.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605141239482667164.10.pdb 2605141239482667164.11.pdb 2605141239482667164.7.pdb 2605141239482667164.8.pdb 2605141239482667164.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m19.919s user 0m19.773s sys 0m0.137s rm: cannot remove '2605141239482667164.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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