*** secyeg-tasr ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605152131492949579.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605152131492949579.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605152131492949579.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 433
First residue number = 1
Last residue number = 433
Number of atoms found = 3363
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 22.313731 +/- 11.972375 From: -3.519000 To: 56.792000
= 15.089510 +/- 12.179278 From: -13.229000 To: 42.037000
= 46.275725 +/- 19.040237 From: 9.480000 To: 96.854000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.2202 % Filled.
Pdbmat> 1130061 non-zero elements.
Pdbmat> 123337 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 73.35 +/- 19.69
Maximum number = 131
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 2.466740E+06
Pdbmat> Larger element = 504.153
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
433 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605152131492949579.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605152131492949579.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605152131492949579.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3363 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 433 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 44
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 61
Blocpdb> 36 atoms in block 5
Block first atom: 84
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 120
Blocpdb> 21 atoms in block 7
Block first atom: 142
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 163
Blocpdb> 31 atoms in block 9
Block first atom: 186
Blocpdb> 23 atoms in block 10
Block first atom: 217
Blocpdb> 23 atoms in block 11
Block first atom: 240
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 263
Blocpdb> 21 atoms in block 13
Block first atom: 281
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 302
Blocpdb> 24 atoms in block 15
Block first atom: 325
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 349
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 371
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 387
Blocpdb> 27 atoms in block 19
Block first atom: 406
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 433
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 457
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 470
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 493
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 516
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 540
Blocpdb> 27 atoms in block 26
Block first atom: 563
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 590
Blocpdb> 23 atoms in block 28
Block first atom: 609
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 632
Blocpdb> 18 atoms in block 30
Block first atom: 657
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 675
Blocpdb> 25 atoms in block 32
Block first atom: 697
Blocpdb> 28 atoms in block 33
Block first atom: 722
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 750
Blocpdb> 23 atoms in block 35
Block first atom: 771
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 794
Blocpdb> 23 atoms in block 37
Block first atom: 819
Blocpdb> 30 atoms in block 38
Block first atom: 842
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 872
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 893
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 915
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 937
Blocpdb> 24 atoms in block 43
Block first atom: 956
Blocpdb> 21 atoms in block 44
Block first atom: 980
Blocpdb> 27 atoms in block 45
Block first atom: 1001
Blocpdb> 23 atoms in block 46
Block first atom: 1028
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 1051
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1073
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 1096
Blocpdb> 30 atoms in block 50
Block first atom: 1115
Blocpdb> 18 atoms in block 51
Block first atom: 1145
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 1163
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1183
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 1204
Blocpdb> 27 atoms in block 55
Block first atom: 1223
Blocpdb> 26 atoms in block 56
Block first atom: 1250
Blocpdb> 28 atoms in block 57
Block first atom: 1276
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1304
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 1326
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1342
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1362
Blocpdb> 26 atoms in block 62
Block first atom: 1384
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1410
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1430
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 1453
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1472
Blocpdb> 26 atoms in block 67
Block first atom: 1492
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1518
Blocpdb> 21 atoms in block 69
Block first atom: 1539
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1560
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 1577
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1599
Blocpdb> 21 atoms in block 73
Block first atom: 1621
Blocpdb> 27 atoms in block 74
Block first atom: 1642
Blocpdb> 27 atoms in block 75
Block first atom: 1669
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 1696
Blocpdb> 31 atoms in block 77
Block first atom: 1720
Blocpdb> 29 atoms in block 78
Block first atom: 1751
Blocpdb> 27 atoms in block 79
Block first atom: 1780
Blocpdb> 27 atoms in block 80
Block first atom: 1807
Blocpdb> 28 atoms in block 81
Block first atom: 1834
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 1862
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1889
Blocpdb> 31 atoms in block 84
Block first atom: 1908
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1939
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 1959
Blocpdb> 24 atoms in block 87
Block first atom: 1985
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 2009
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 2032
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 2048
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 2070
Blocpdb> 21 atoms in block 92
Block first atom: 2094
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2115
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 2137
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2157
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2183
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 2210
Blocpdb> 27 atoms in block 98
Block first atom: 2229
Blocpdb> 23 atoms in block 99
Block first atom: 2256
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 2279
Blocpdb> 21 atoms in block 101
Block first atom: 2310
Blocpdb> 19 atoms in block 102
Block first atom: 2331
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2350
Blocpdb> 27 atoms in block 104
Block first atom: 2375
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 2402
Blocpdb> 30 atoms in block 106
Block first atom: 2423
Blocpdb> 29 atoms in block 107
Block first atom: 2453
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2482
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2507
Blocpdb> 24 atoms in block 110
Block first atom: 2533
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2557
Blocpdb> 25 atoms in block 112
Block first atom: 2579
Blocpdb> 26 atoms in block 113
Block first atom: 2604
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 2630
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 2649
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 2667
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 2694
Blocpdb> 25 atoms in block 118
Block first atom: 2712
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 2737
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2768
Blocpdb> 23 atoms in block 121
Block first atom: 2792
Blocpdb> 22 atoms in block 122
Block first atom: 2815
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 2837
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 2854
Blocpdb> 20 atoms in block 125
Block first atom: 2880
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 2900
Blocpdb> 24 atoms in block 127
Block first atom: 2921
Blocpdb> 33 atoms in block 128
Block first atom: 2945
Blocpdb> 18 atoms in block 129
Block first atom: 2978
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 2996
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 3020
Blocpdb> 24 atoms in block 132
Block first atom: 3036
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3060
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 3084
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3106
Blocpdb> 24 atoms in block 136
Block first atom: 3130
Blocpdb> 25 atoms in block 137
Block first atom: 3154
Blocpdb> 23 atoms in block 138
Block first atom: 3179
Blocpdb> 22 atoms in block 139
Block first atom: 3202
Blocpdb> 29 atoms in block 140
Block first atom: 3224
Blocpdb> 21 atoms in block 141
Block first atom: 3253
Blocpdb> 24 atoms in block 142
Block first atom: 3274
Blocpdb> 31 atoms in block 143
Block first atom: 3298
Blocpdb> 25 atoms in block 144
Block first atom: 3329
Blocpdb> 10 atoms in block 145
Block first atom: 3353
Blocpdb> 145 blocks.
Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1130206 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10089
Prepmat> Matrix trace = 2466740.0000
Prepmat> Last element read: 10089 10089 59.2820
Prepmat> 10586 lines saved.
Prepmat> 9355 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3363
RTB> Total mass = 3363.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3363
RTB> Number of blocks = 145
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 162060.6375
RTB> 42105 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 870
Diagstd> Nb of non-zero elements: 42105
Diagstd> Projected matrix trace = 162060.6375
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 870 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 162060.6375
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0767075 0.0940996 0.4105545 0.4628386
0.8814427 1.0291852 1.1467221 1.4126722 1.6205901
1.7300627 1.9945424 2.4410443 2.8012338 2.9490029
3.4594473 3.9294573 4.6147987 4.7006622 5.2399457
5.8407664 6.1317775 6.4569336 7.4074535 7.7568673
8.4624628 9.0634401 9.2264370 9.9978897 10.1243870
10.5345284 11.1633311 11.4824751 11.7650881 12.4808001
13.1752361 13.3428046 14.2878253 14.4072685 15.4772516
16.2070994 16.2825873 16.7909239 17.6439321 17.9671395
18.3890603 18.8157711 19.6003303 19.8971114 21.3721474
21.7263320 22.2263669 22.5967214 23.2728281 23.6168382
24.1768024 24.3819268 24.5625695 24.9913433 25.8879769
26.5977780 26.8821588 27.3721396 27.5558386 28.3138363
28.8365341 29.2095646 29.9366884 30.0191769 30.3988296
31.5287197 32.1428026 32.7585199 33.1698559 33.6487343
34.4393449 34.9633826 35.6289646 35.9946047 36.1377607
36.7095425 36.9982637 37.7025869 38.3629056 38.5969543
39.6700514 40.0085408 40.4664813 40.9845906 41.2124884
41.6769472 42.0823478 43.0225876 43.1835928 43.8345570
44.3868632 44.5693528 44.9458138 45.2643749 45.6571374
45.9862773
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034334 0.0034336 0.0034338 0.0034339
0.0034347 30.0755868 33.3111126 69.5794002 73.8771425
101.9511961 110.1645939 116.2851788 129.0672251 138.2394102
142.8322231 153.3617023 169.6614245 181.7481345 186.4802665
201.9754755 215.2591227 233.2768605 235.4370466 248.5757019
262.4401031 268.8985583 275.9360489 295.5491723 302.4394653
315.8956649 326.9202442 329.8468123 343.3598027 345.5251376
352.4543134 362.8208062 367.9705292 372.4713495 383.6334741
394.1617553 396.6603978 410.4670930 412.1792309 427.2107784
437.1675598 438.1844772 444.9718900 456.1345495 460.2934024
465.6665561 471.0383757 480.7585041 484.3845647 502.0180825
506.1607746 511.9523250 516.1999949 523.8655755 527.7231637
533.9427703 536.2030644 538.1857308 542.8627971 552.5153351
560.0385968 563.0245751 568.1325262 570.0357537 577.8227519
583.1319147 586.8915036 594.1514465 594.9694555 598.7199255
609.7452808 615.6546312 621.5233024 625.4132424 629.9116590
637.2688947 642.0990121 648.1818722 651.4993467 652.7936172
657.9376911 660.5199692 666.7773752 672.5909613 674.6395505
683.9536352 686.8653944 690.7851637 695.1933051 697.1234616
701.0406965 704.4420315 712.2681816 713.5997126 718.9581170
723.4732997 724.9589974 728.0142910 730.5896979 733.7525437
736.3925857
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3363
Rtb_to_modes> Number of blocs = 145
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 870 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
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0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
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0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 60534 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
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1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999
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1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998
0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 0.99996 1.00002
1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00003 1.00004 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
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1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605152131492949579.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605152131492949579.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605152131492949579.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605152131492949579.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 433
First residue number = 1
Last residue number = 433
Number of atoms found = 3363
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4100E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4106
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4628
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.147
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.407
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.757
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.063
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.998
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.12
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.16
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99
Bfactors> 106 vectors, 10089 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.076707
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.956 for 433 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.155 +/- 0.49
Bfactors> = 1.853 +/- 1.81
Bfactors> Shiftng-fct= 1.697
Bfactors> Scaling-fct= 3.666
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605152131492949579.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605152131492949579.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.4
Chkmod> 106 vectors, 10089 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3363 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7685
0.0034 0.8727
0.0034 0.9200
0.0034 0.6622
0.0034 0.9389
0.0034 0.9848
30.0742 0.0892
33.3098 0.0792
69.5803 0.4011
73.8709 0.3621
101.9443 0.0824
110.1500 0.2067
116.2943 0.3175
129.0767 0.2335
138.2510 0.3105
142.8235 0.3257
153.3727 0.2281
169.6526 0.3548
181.7327 0.4432
186.4722 0.4468
201.9537 0.3126
215.2374 0.4205
233.2719 0.3093
235.4354 0.4719
248.5663 0.3808
262.4341 0.5136
268.8919 0.2956
275.9256 0.3568
295.5274 0.4924
302.4291 0.6198
315.8735 0.4433
326.8983 0.3624
329.8248 0.2848
343.3470 0.4156
345.4354 0.4605
352.3634 0.4281
362.7511 0.6710
367.9151 0.4534
372.5331 0.2893
383.6047 0.3862
394.2161 0.4393
396.6017 0.2828
410.4807 0.4948
412.2006 0.6004
427.2304 0.5423
437.1879 0.5715
438.1309 0.4653
444.9405 0.5142
456.0641 0.4811
460.3103 0.5407
465.6585 0.4544
471.0711 0.6824
480.7338 0.4120
484.3989 0.4626
501.9713 0.4416
506.1818 0.4380
511.9722 0.2995
516.2153 0.4325
523.8113 0.5040
527.7358 0.5269
533.9552 0.6438
536.1589 0.5894
538.1345 0.4315
542.8249 0.5638
552.5132 0.4621
560.0379 0.4738
562.9778 0.5584
568.0859 0.6016
570.0543 0.5485
577.7588 0.4012
583.1419 0.5532
586.8707 0.4965
594.1588 0.4598
594.9521 0.3366
598.7057 0.4727
609.7315 0.4002
615.6014 0.3799
621.5107 0.6088
625.3878 0.5837
629.8965 0.2657
637.2476 0.3028
642.0404 0.3077
648.1635 0.4269
651.4297 0.4608
652.7858 0.5625
657.9135 0.4255
660.5071 0.5546
666.7259 0.3961
672.5366 0.2888
674.6372 0.4580
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Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.086s
user 0m10.990s
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rm: cannot remove '2605152131492949579.sdijf': No such file or directory
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