***  LRRK2_WT  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605160850333024550.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605160850333024550.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605160850333024550.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1795
First residue number = 558
Last residue number = 2527
Number of atoms found = 14110
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 174.474689 +/- 20.807537 From: 128.501000 To: 235.962000
= 221.158306 +/- 20.818766 From: 170.335000 To: 275.584000
= 198.403096 +/- 32.659665 From: 122.728000 To: 257.408000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.5710 % Filled.
Pdbmat> 5115546 non-zero elements.
Pdbmat> 559064 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.24 +/- 21.17
Maximum number = 126
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.118128E+07
Pdbmat> Larger element = 480.769
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1795 non-zero elements, NRBL set to 9
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605160850333024550.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 9
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605160850333024550.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605160850333024550.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 14110 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 9 residue(s) per block.
Blocpdb> 1795 residues.
Blocpdb> 64 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 68 atoms in block 2
Block first atom: 65
Blocpdb> 13 atoms in block 3
Block first atom: 133
Blocpdb> 60 atoms in block 4
Block first atom: 146
Blocpdb> 65 atoms in block 5
Block first atom: 206
Blocpdb> 61 atoms in block 6
Block first atom: 271
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 332
Blocpdb> 63 atoms in block 8
Block first atom: 348
Blocpdb> 75 atoms in block 9
Block first atom: 411
Blocpdb> 67 atoms in block 10
Block first atom: 486
Blocpdb> 67 atoms in block 11
Block first atom: 553
Blocpdb> 70 atoms in block 12
Block first atom: 620
Blocpdb> 79 atoms in block 13
Block first atom: 690
Blocpdb> 71 atoms in block 14
Block first atom: 769
Blocpdb> 76 atoms in block 15
Block first atom: 840
Blocpdb> 62 atoms in block 16
Block first atom: 916
Blocpdb> 70 atoms in block 17
Block first atom: 978
Blocpdb> 66 atoms in block 18
Block first atom: 1048
Blocpdb> 70 atoms in block 19
Block first atom: 1114
Blocpdb> 58 atoms in block 20
Block first atom: 1184
Blocpdb> 60 atoms in block 21
Block first atom: 1242
Blocpdb> 70 atoms in block 22
Block first atom: 1302
Blocpdb> 68 atoms in block 23
Block first atom: 1372
Blocpdb> 73 atoms in block 24
Block first atom: 1440
Blocpdb> 62 atoms in block 25
Block first atom: 1513
Blocpdb> 76 atoms in block 26
Block first atom: 1575
Blocpdb> 60 atoms in block 27
Block first atom: 1651
Blocpdb> 60 atoms in block 28
Block first atom: 1711
Blocpdb> 70 atoms in block 29
Block first atom: 1771
Blocpdb> 75 atoms in block 30
Block first atom: 1841
Blocpdb> 67 atoms in block 31
Block first atom: 1916
Blocpdb> 79 atoms in block 32
Block first atom: 1983
Blocpdb> 45 atoms in block 33
Block first atom: 2062
Blocpdb> 77 atoms in block 34
Block first atom: 2107
Blocpdb> 71 atoms in block 35
Block first atom: 2184
Blocpdb> 63 atoms in block 36
Block first atom: 2255
Blocpdb> 78 atoms in block 37
Block first atom: 2318
Blocpdb> 70 atoms in block 38
Block first atom: 2396
Blocpdb> 74 atoms in block 39
Block first atom: 2466
Blocpdb> 74 atoms in block 40
Block first atom: 2540
Blocpdb> 71 atoms in block 41
Block first atom: 2614
Blocpdb> 70 atoms in block 42
Block first atom: 2685
Blocpdb> 72 atoms in block 43
Block first atom: 2755
Blocpdb> 61 atoms in block 44
Block first atom: 2827
Blocpdb> 73 atoms in block 45
Block first atom: 2888
Blocpdb> 76 atoms in block 46
Block first atom: 2961
Blocpdb> 68 atoms in block 47
Block first atom: 3037
Blocpdb> 77 atoms in block 48
Block first atom: 3105
Blocpdb> 59 atoms in block 49
Block first atom: 3182
Blocpdb> 77 atoms in block 50
Block first atom: 3241
Blocpdb> 71 atoms in block 51
Block first atom: 3318
Blocpdb> 66 atoms in block 52
Block first atom: 3389
Blocpdb> 66 atoms in block 53
Block first atom: 3455
Blocpdb> 71 atoms in block 54
Block first atom: 3521
Blocpdb> 70 atoms in block 55
Block first atom: 3592
Blocpdb> 72 atoms in block 56
Block first atom: 3662
Blocpdb> 68 atoms in block 57
Block first atom: 3734
Blocpdb> 71 atoms in block 58
Block first atom: 3802
Blocpdb> 71 atoms in block 59
Block first atom: 3873
Blocpdb> 79 atoms in block 60
Block first atom: 3944
Blocpdb> 77 atoms in block 61
Block first atom: 4023
Blocpdb> 63 atoms in block 62
Block first atom: 4100
Blocpdb> 84 atoms in block 63
Block first atom: 4163
Blocpdb> 77 atoms in block 64
Block first atom: 4247
Blocpdb> 66 atoms in block 65
Block first atom: 4324
Blocpdb> 70 atoms in block 66
Block first atom: 4390
Blocpdb> 76 atoms in block 67
Block first atom: 4460
Blocpdb> 75 atoms in block 68
Block first atom: 4536
Blocpdb> 74 atoms in block 69
Block first atom: 4611
Blocpdb> 72 atoms in block 70
Block first atom: 4685
Blocpdb> 77 atoms in block 71
Block first atom: 4757
Blocpdb> 74 atoms in block 72
Block first atom: 4834
Blocpdb> 79 atoms in block 73
Block first atom: 4908
Blocpdb> 56 atoms in block 74
Block first atom: 4987
Blocpdb> 75 atoms in block 75
Block first atom: 5043
Blocpdb> 63 atoms in block 76
Block first atom: 5118
Blocpdb> 72 atoms in block 77
Block first atom: 5181
Blocpdb> 80 atoms in block 78
Block first atom: 5253
Blocpdb> 76 atoms in block 79
Block first atom: 5333
Blocpdb> 74 atoms in block 80
Block first atom: 5409
Blocpdb> 80 atoms in block 81
Block first atom: 5483
Blocpdb> 73 atoms in block 82
Block first atom: 5563
Blocpdb> 62 atoms in block 83
Block first atom: 5636
Blocpdb> 82 atoms in block 84
Block first atom: 5698
Blocpdb> 61 atoms in block 85
Block first atom: 5780
Blocpdb> 65 atoms in block 86
Block first atom: 5841
Blocpdb> 52 atoms in block 87
Block first atom: 5906
Blocpdb> 68 atoms in block 88
Block first atom: 5958
Blocpdb> 80 atoms in block 89
Block first atom: 6026
Blocpdb> 62 atoms in block 90
Block first atom: 6106
Blocpdb> 77 atoms in block 91
Block first atom: 6168
Blocpdb> 75 atoms in block 92
Block first atom: 6245
Blocpdb> 66 atoms in block 93
Block first atom: 6320
Blocpdb> 76 atoms in block 94
Block first atom: 6386
Blocpdb> 73 atoms in block 95
Block first atom: 6462
Blocpdb> 74 atoms in block 96
Block first atom: 6535
Blocpdb> 77 atoms in block 97
Block first atom: 6609
Blocpdb> 70 atoms in block 98
Block first atom: 6686
Blocpdb> 74 atoms in block 99
Block first atom: 6756
Blocpdb> 72 atoms in block 100
Block first atom: 6830
Blocpdb> 68 atoms in block 101
Block first atom: 6902
Blocpdb> 77 atoms in block 102
Block first atom: 6970
Blocpdb> 68 atoms in block 103
Block first atom: 7047
Blocpdb> 65 atoms in block 104
Block first atom: 7115
Blocpdb> 49 atoms in block 105
Block first atom: 7180
Blocpdb> 83 atoms in block 106
Block first atom: 7229
Blocpdb> 72 atoms in block 107
Block first atom: 7312
Blocpdb> 66 atoms in block 108
Block first atom: 7384
Blocpdb> 73 atoms in block 109
Block first atom: 7450
Blocpdb> 71 atoms in block 110
Block first atom: 7523
Blocpdb> 78 atoms in block 111
Block first atom: 7594
Blocpdb> 85 atoms in block 112
Block first atom: 7672
Blocpdb> 66 atoms in block 113
Block first atom: 7757
Blocpdb> 84 atoms in block 114
Block first atom: 7823
Blocpdb> 80 atoms in block 115
Block first atom: 7907
Blocpdb> 64 atoms in block 116
Block first atom: 7987
Blocpdb> 69 atoms in block 117
Block first atom: 8051
Blocpdb> 69 atoms in block 118
Block first atom: 8120
Blocpdb> 67 atoms in block 119
Block first atom: 8189
Blocpdb> 70 atoms in block 120
Block first atom: 8256
Blocpdb> 79 atoms in block 121
Block first atom: 8326
Blocpdb> 63 atoms in block 122
Block first atom: 8405
Blocpdb> 79 atoms in block 123
Block first atom: 8468
Blocpdb> 57 atoms in block 124
Block first atom: 8547
Blocpdb> 74 atoms in block 125
Block first atom: 8604
Blocpdb> 66 atoms in block 126
Block first atom: 8678
Blocpdb> 72 atoms in block 127
Block first atom: 8744
Blocpdb> 67 atoms in block 128
Block first atom: 8816
Blocpdb> 71 atoms in block 129
Block first atom: 8883
Blocpdb> 78 atoms in block 130
Block first atom: 8954
Blocpdb> 69 atoms in block 131
Block first atom: 9032
Blocpdb> 66 atoms in block 132
Block first atom: 9101
Blocpdb> 67 atoms in block 133
Block first atom: 9167
Blocpdb> 76 atoms in block 134
Block first atom: 9234
Blocpdb> 78 atoms in block 135
Block first atom: 9310
Blocpdb> 73 atoms in block 136
Block first atom: 9388
Blocpdb> 63 atoms in block 137
Block first atom: 9461
Blocpdb> 71 atoms in block 138
Block first atom: 9524
Blocpdb> 68 atoms in block 139
Block first atom: 9595
Blocpdb> 72 atoms in block 140
Block first atom: 9663
Blocpdb> 76 atoms in block 141
Block first atom: 9735
Blocpdb> 73 atoms in block 142
Block first atom: 9811
Blocpdb> 74 atoms in block 143
Block first atom: 9884
Blocpdb> 75 atoms in block 144
Block first atom: 9958
Blocpdb> 66 atoms in block 145
Block first atom: 10033
Blocpdb> 68 atoms in block 146
Block first atom: 10099
Blocpdb> 43 atoms in block 147
Block first atom: 10167
Blocpdb> 62 atoms in block 148
Block first atom: 10210
Blocpdb> 63 atoms in block 149
Block first atom: 10272
Blocpdb> 78 atoms in block 150
Block first atom: 10335
Blocpdb> 73 atoms in block 151
Block first atom: 10413
Blocpdb> 65 atoms in block 152
Block first atom: 10486
Blocpdb> 75 atoms in block 153
Block first atom: 10551
Blocpdb> 71 atoms in block 154
Block first atom: 10626
Blocpdb> 67 atoms in block 155
Block first atom: 10697
Blocpdb> 77 atoms in block 156
Block first atom: 10764
Blocpdb> 74 atoms in block 157
Block first atom: 10841
Blocpdb> 72 atoms in block 158
Block first atom: 10915
Blocpdb> 67 atoms in block 159
Block first atom: 10987
Blocpdb> 74 atoms in block 160
Block first atom: 11054
Blocpdb> 69 atoms in block 161
Block first atom: 11128
Blocpdb> 70 atoms in block 162
Block first atom: 11197
Blocpdb> 67 atoms in block 163
Block first atom: 11267
Blocpdb> 73 atoms in block 164
Block first atom: 11334
Blocpdb> 70 atoms in block 165
Block first atom: 11407
Blocpdb> 68 atoms in block 166
Block first atom: 11477
Blocpdb> 69 atoms in block 167
Block first atom: 11545
Blocpdb> 70 atoms in block 168
Block first atom: 11614
Blocpdb> 65 atoms in block 169
Block first atom: 11684
Blocpdb> 74 atoms in block 170
Block first atom: 11749
Blocpdb> 69 atoms in block 171
Block first atom: 11823
Blocpdb> 72 atoms in block 172
Block first atom: 11892
Blocpdb> 77 atoms in block 173
Block first atom: 11964
Blocpdb> 57 atoms in block 174
Block first atom: 12041
Blocpdb> 76 atoms in block 175
Block first atom: 12098
Blocpdb> 63 atoms in block 176
Block first atom: 12174
Blocpdb> 63 atoms in block 177
Block first atom: 12237
Blocpdb> 64 atoms in block 178
Block first atom: 12300
Blocpdb> 72 atoms in block 179
Block first atom: 12364
Blocpdb> 68 atoms in block 180
Block first atom: 12436
Blocpdb> 76 atoms in block 181
Block first atom: 12504
Blocpdb> 74 atoms in block 182
Block first atom: 12580
Blocpdb> 69 atoms in block 183
Block first atom: 12654
Blocpdb> 64 atoms in block 184
Block first atom: 12723
Blocpdb> 71 atoms in block 185
Block first atom: 12787
Blocpdb> 79 atoms in block 186
Block first atom: 12858
Blocpdb> 64 atoms in block 187
Block first atom: 12937
Blocpdb> 79 atoms in block 188
Block first atom: 13001
Blocpdb> 77 atoms in block 189
Block first atom: 13080
Blocpdb> 70 atoms in block 190
Block first atom: 13157
Blocpdb> 74 atoms in block 191
Block first atom: 13227
Blocpdb> 57 atoms in block 192
Block first atom: 13301
Blocpdb> 75 atoms in block 193
Block first atom: 13358
Blocpdb> 79 atoms in block 194
Block first atom: 13433
Blocpdb> 68 atoms in block 195
Block first atom: 13512
Blocpdb> 66 atoms in block 196
Block first atom: 13580
Blocpdb> 74 atoms in block 197
Block first atom: 13646
Blocpdb> 73 atoms in block 198
Block first atom: 13720
Blocpdb> 73 atoms in block 199
Block first atom: 13793
Blocpdb> 74 atoms in block 200
Block first atom: 13866
Blocpdb> 81 atoms in block 201
Block first atom: 13940
Blocpdb> 74 atoms in block 202
Block first atom: 14021
Blocpdb> 16 atoms in block 203
Block first atom: 14094
Blocpdb> 203 blocks.
Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5115749 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 42330
Prepmat> Matrix trace = 11181280.0000
Prepmat> Last element read: 42330 42330 130.4897
Prepmat> 20707 lines saved.
Prepmat> 19204 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14110
RTB> Total mass = 14110.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 14110
RTB> Number of blocks = 203
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 188660.4243
RTB> 51027 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1218
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51027
Diagstd> Projected matrix trace = 188660.4243
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1218 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 188660.4243
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1057675 0.1495276 0.2535199 0.2794430
0.3682938 0.5182401 0.7753750 0.8194107 1.1898957
1.3747320 1.5910139 1.7405953 1.8029928 2.1073969
2.3226948 2.4636417 2.7366224 2.9682298 3.0542629
3.2430450 3.4836050 3.7056194 3.9041429 4.0923296
4.2331409 4.5712539 4.7902596 4.9196481 5.2139600
5.3957801 5.5333354 5.6026738 5.8401029 6.2580990
6.3207023 6.4927312 6.7397183 6.8857240 7.1738835
7.3308052 7.7067667 7.9701152 8.0504249 8.1258993
8.4363193 8.6895718 8.8949634 9.1500991 9.3979320
9.6027809 9.7380641 9.9809599 10.5973378 11.0964030
11.3143851 11.3397065 11.5816073 11.7664166 11.9292284
12.2008203 12.3790118 12.6360542 12.7683475 13.0408146
13.2709242 13.9284360 14.1521901 14.1947009 14.6917496
14.9120833 15.4945404 15.6757912 15.8995108 16.4020556
16.6971314 16.7968865 16.8794313 17.1364882 17.2576502
17.5979902 17.7932350 18.0266657 18.4239286 18.5634083
18.6906063 18.9633701 19.3487342 19.5336349 19.8492678
20.2050379 20.2891557 20.5167901 20.7307784 20.8634882
21.3333144 21.7354568 22.0524825 22.3636480 22.6409909
22.7470328
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034333 0.0034339 0.0034341 0.0034343
0.0034345 35.3159983 41.9909741 54.6765720 57.4039676
65.9010711 78.1737194 95.6205364 98.2983225 118.4539985
127.3222495 136.9721484 143.2663439 145.8116689 157.6407337
165.4974690 170.4449151 179.6398647 187.0871837 189.7791476
195.5562809 202.6794579 209.0382138 214.5646295 219.6749734
223.4223646 232.1736618 237.6702397 240.8586789 247.9585719
252.2449038 255.4399260 257.0354050 262.4251947 271.6542434
273.0096177 276.6998934 281.9136809 284.9509355 290.8522575
294.0161051 301.4611748 306.5685366 308.1092106 309.5501344
315.4073322 320.1064826 323.8674947 328.4794308 332.8981872
336.5067574 338.8688078 343.0689683 353.5034608 361.7315514
365.2672703 365.6757729 369.5555241 372.4923781 375.0606121
379.3060725 382.0658926 386.0121910 388.0276085 392.1458652
395.5905094 405.2718666 408.5141533 409.1272461 416.2287154
419.3382135 427.4493187 429.9421417 432.9992673 439.7890587
443.7273646 445.0508905 446.1431048 449.5274254 451.1137982
455.5403132 458.0603885 461.0552620 466.1078324 467.8688582
469.4690588 472.8822806 477.6629537 479.9398515 483.8018509
488.1183280 489.1333420 491.8696071 494.4280310 496.0080677
501.5617942 506.2670546 509.9458046 513.5309277 516.7053944
517.9140078
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14110
Rtb_to_modes> Number of blocs = 203
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1058
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1495
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2535
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2794
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3683
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5182
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7754
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8194
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.375
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.741
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.803
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.107
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.323
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.737
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.968
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.054
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.243
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.484
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.706
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.904
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.092
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.233
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.571
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.790
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.920
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.214
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.396
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.533
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.603
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.840
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.321
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.493
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.740
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.886
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.174
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.707
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.970
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.050
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.126
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.436
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.895
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.150
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.603
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.738
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.981
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003
0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 1.00003 0.99996 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003
0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00005 0.99997 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 253980 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003
0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 1.00003 0.99996 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003
0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00005 0.99997 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997
0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605160850333024550.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605160850333024550.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605160850333024550.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605160850333024550.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1795
First residue number = 558
Last residue number = 2527
Number of atoms found = 14110
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1058
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1495
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2535
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2794
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3683
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5182
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7754
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8194
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.741
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.803
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.107
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.323
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.737
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.968
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.054
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.484
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.706
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.904
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.092
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.233
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.571
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.790
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.214
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.396
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.603
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.840
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.321
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.493
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.886
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.707
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.970
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.050
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.436
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.895
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.150
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.398
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.603
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.738
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.981
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75
Bfactors> 106 vectors, 42330 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.105800
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.555 for 1795 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.049 +/- 0.06
Bfactors> = 46.434 +/- 23.90
Bfactors> Shiftng-fct= 46.385
Bfactors> Scaling-fct= 417.079
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605160850333024550.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605160850333024550.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Chkmod> 106 vectors, 42330 coordinates in file.
Chkmod> That is: 14110 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8812
0.0034 0.7167
0.0034 0.9896
0.0034 0.7992
0.0034 0.7066
0.0034 0.9195
35.3199 0.5307
41.9853 0.4016
54.6721 0.5027
57.3971 0.3567
65.8988 0.4358
78.1673 0.6726
95.6180 0.2552
98.2935 0.6458
118.4541 0.5964
127.3292 0.6319
136.9657 0.2853
143.2768 0.5411
145.8057 0.6715
157.6191 0.6639
165.5012 0.4483
170.4500 0.6450
179.6445 0.3667
187.0719 0.5145
189.7628 0.4895
195.5465 0.2571
202.6822 0.5364
209.0400 0.0854
214.5515 0.3698
219.6567 0.3194
223.4091 0.3698
232.1572 0.0975
237.6536 0.2007
240.8570 0.4958
247.9489 0.2791
252.2392 0.3476
255.4212 0.2913
257.0319 0.3181
262.4116 0.3534
271.6404 0.2362
273.0043 0.0571
276.6937 0.3066
281.9075 0.2060
284.9444 0.4313
290.8421 0.3833
294.0074 0.2505
301.4528 0.3092
306.5532 0.3379
308.0879 0.3797
309.5388 0.4196
315.3878 0.4837
320.1006 0.3933
323.8543 0.3139
328.4636 0.3295
332.8851 0.3806
336.4962 0.4426
338.8531 0.3665
343.0549 0.3688
353.5327 0.3553
361.7746 0.5145
365.1808 0.3752
365.6648 0.3383
369.5140 0.0861
372.5331 0.4410
375.0566 0.1083
379.2770 0.3586
382.0647 0.3409
386.0559 0.1559
388.0361 0.3321
392.1168 0.3623
395.5598 0.4245
405.2772 0.2701
408.4650 0.4958
409.0419 0.4033
416.1861 0.4462
419.2909 0.4283
427.3683 0.4186
429.9814 0.3777
432.9873 0.4864
439.7426 0.3760
443.7464 0.3784
445.0730 0.2926
446.1315 0.0439
449.5542 0.2301
451.1251 0.0972
455.5468 0.3680
457.9991 0.3997
461.0781 0.3530
466.0381 0.3010
467.8058 0.1276
469.4413 0.2105
472.8200 0.2774
477.6581 0.3126
479.8746 0.2503
483.7900 0.2910
488.1573 0.1472
489.1225 0.4172
491.8870 0.4061
494.3975 0.3719
495.9453 0.3497
501.5013 0.4134
506.2982 0.5070
509.8952 0.2487
513.4670 0.4125
516.6719 0.5235
517.9256 0.3233
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605160850333024550 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
making animated gifs
11 models are in 2605160850333024550.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605160850333024550 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
making animated gifs
11 models are in 2605160850333024550.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605160850333024550 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
making animated gifs
11 models are in 2605160850333024550.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605160850333024550 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
making animated gifs
11 models are in 2605160850333024550.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605160850333024550 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605160850333024550.eigenfacs
2605160850333024550.atom
making animated gifs
11 models are in 2605160850333024550.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605160850333024550.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605160850333024550.10.pdb
2605160850333024550.11.pdb
2605160850333024550.7.pdb
2605160850333024550.8.pdb
2605160850333024550.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m46.832s
user 1m46.258s
sys 0m0.508s
rm: cannot remove '2605160850333024550.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|