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***  LRRK2_7LI4_R1441C  ***

CA distance fluctuations for 2605160929253032129

---  normal mode 7  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
SER 1743 0.03 GLY 558 -0.03 SER 2257
SER 1743 0.03 ILE 559 -0.03 SER 2257
SER 1743 0.03 GLN 560 -0.03 LYS 2379
LYS 2399 0.03 LYS 561 -0.04 GLU 2311
LYS 2399 0.03 CYS 562 -0.04 GLU 2311
LYS 2399 0.03 GLY 563 -0.04 LYS 2379
LYS 2399 0.03 LEU 564 -0.04 LYS 2379
LYS 2399 0.03 LYS 565 -0.04 LYS 2379
LYS 2399 0.04 VAL 566 -0.04 LYS 2379
LYS 2399 0.04 ILE 567 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 SER 568 -0.05 LYS 2379
LYS 2399 0.04 SER 569 -0.05 LYS 2379
LYS 2399 0.04 ILE 570 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 VAL 571 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 HIS 572 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 PHE 573 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 PRO 574 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 ASP 575 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 ALA 576 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.04 LEU 577 -0.05 THR 2380
LEU 1727 0.04 GLY 584 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 ALA 585 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 MET 586 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 ASP 587 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 SER 588 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.03 VAL 589 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.03 LEU 590 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 HIS 591 -0.03 THR 2380
LEU 1727 0.03 THR 592 -0.03 LYS 2379
LEU 1727 0.03 LEU 593 -0.03 LYS 2379
SER 1743 0.03 GLN 594 -0.03 LYS 2379
SER 1743 0.03 MET 595 -0.03 LYS 2379
SER 1743 0.03 TYR 596 -0.03 GLU 2311
SER 1743 0.03 PRO 597 -0.03 GLU 2311
SER 1743 0.03 ASP 598 -0.03 THR 2310
SER 1743 0.03 ASP 599 -0.03 THR 2310
SER 1743 0.03 GLN 600 -0.03 THR 2310
LYS 2399 0.02 GLU 601 -0.04 THR 2310
LYS 2399 0.03 ILE 602 -0.04 GLU 2311
LYS 2399 0.03 GLN 603 -0.04 GLU 2311
LYS 2399 0.03 CYS 604 -0.04 GLU 2311
LYS 2399 0.03 LEU 605 -0.04 LYS 2379
LYS 2399 0.03 GLY 606 -0.04 LYS 2379
LYS 2399 0.03 LEU 607 -0.05 LYS 2379
LYS 2399 0.04 SER 608 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 LEU 609 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 ILE 610 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 GLY 611 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 TYR 612 -0.06 THR 2380
LEU 1727 0.04 GLY 624 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 HIS 625 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.04 LEU 626 -0.03 THR 2380
LEU 1727 0.03 LEU 627 -0.04 THR 2380
VAL 2526 0.03 ALA 628 -0.04 THR 2380
LEU 1727 0.03 LYS 629 -0.03 THR 2380
LEU 1727 0.03 ILE 630 -0.03 THR 2380
VAL 2526 0.03 LEU 631 -0.04 THR 2380
VAL 2526 0.03 VAL 632 -0.03 THR 2380
SER 1743 0.03 SER 633 -0.02 LYS 2379
SER 1743 0.03 SER 634 -0.03 GLU 2311
VAL 2526 0.02 LEU 635 -0.03 THR 2310
VAL 2526 0.02 TYR 636 -0.03 THR 2310
SER 1743 0.02 ARG 637 -0.03 THR 2310
SER 1743 0.02 PHE 638 -0.03 THR 2310
VAL 2398 0.02 LYS 639 -0.03 THR 2310
SER 2345 0.02 ASP 640 -0.04 THR 2310
SER 2345 0.02 VAL 641 -0.04 THR 2310
LYS 2405 0.03 ALA 642 -0.05 THR 2310
VAL 2398 0.03 GLU 643 -0.05 THR 2310
LYS 2399 0.03 ILE 644 -0.05 GLU 2311
LYS 2399 0.03 GLN 645 -0.04 GLU 2311
VAL 2398 0.04 THR 646 -0.06 LYS 2379
LYS 2399 0.04 LYS 647 -0.05 LYS 2379
LYS 2399 0.03 GLY 648 -0.05 LYS 2379
LYS 2399 0.04 PHE 649 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 GLN 650 -0.07 THR 2380
LYS 2399 0.04 THR 651 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.04 ILE 652 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.04 LEU 653 -0.07 THR 2380
LYS 2399 0.05 ALA 654 -0.07 THR 2380
LYS 2399 0.04 ILE 655 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.04 LEU 656 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.05 LYS 657 -0.07 THR 2380
LYS 2399 0.05 LEU 658 -0.07 GLN 2342
LYS 2399 0.04 SER 659 -0.06 GLN 2342
LYS 2399 0.04 ALA 660 -0.06 GLN 2342
GLU 2519 0.04 SER 661 -0.05 GLN 2342
GLU 2519 0.04 PHE 662 -0.05 THR 2380
GLU 2519 0.04 SER 663 -0.05 THR 2380
GLU 2519 0.04 LYS 664 -0.04 GLN 2342
GLU 2519 0.04 LEU 665 -0.04 THR 2380
GLU 2519 0.03 LEU 666 -0.04 THR 2380
GLU 2519 0.03 VAL 667 -0.03 THR 2380
ARG 2523 0.04 HIS 668 -0.03 THR 2380
ARG 2523 0.03 HIS 669 -0.03 THR 2380
VAL 2526 0.03 SER 670 -0.02 THR 2380
ARG 2523 0.03 PHE 671 -0.03 THR 2380
ARG 2523 0.03 ASP 672 -0.02 THR 2380
GLU 2527 0.02 LEU 673 -0.02 SER 753
GLU 2527 0.02 VAL 674 -0.03 THR 2310
ARG 2523 0.02 ILE 675 -0.03 THR 2310
GLU 2527 0.02 PHE 676 -0.02 THR 2310
GLU 2527 0.02 HIS 677 -0.03 THR 2310
GLU 2395 0.02 GLN 678 -0.04 THR 2310
GLU 2395 0.02 MET 679 -0.04 THR 2310
LEU 2343 0.02 SER 680 -0.04 THR 2310
LEU 2343 0.03 SER 681 -0.04 THR 2310
LEU 2343 0.04 ASN 682 -0.05 THR 2310
LEU 2343 0.04 ILE 683 -0.06 THR 2310
LEU 2343 0.05 MET 684 -0.07 THR 2310
LEU 2343 0.07 GLU 685 -0.08 THR 2310
LEU 2343 0.06 GLN 686 -0.08 THR 2310
LEU 2343 0.07 LYS 687 -0.09 THR 2310
LEU 2343 0.05 ASP 688 -0.07 THR 2310
SER 2345 0.06 GLN 689 -0.09 LYS 2379
SER 2345 0.05 GLN 690 -0.09 LYS 2379
GLU 2395 0.04 PHE 691 -0.07 LYS 2379
GLU 2395 0.04 LEU 692 -0.07 LYS 2379
GLU 2395 0.05 ASN 693 -0.09 THR 2380
GLU 2395 0.04 LEU 694 -0.08 THR 2380
GLU 2395 0.04 CYS 695 -0.06 LYS 2379
GLU 2395 0.04 CYS 696 -0.06 THR 2380
GLU 2395 0.05 LYS 697 -0.08 THR 2380
LYS 2399 0.04 CYS 698 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.03 PHE 699 -0.05 THR 2380
LYS 2399 0.04 ALA 700 -0.06 THR 2380
LYS 2399 0.04 LYS 701 -0.06 THR 2380
GLU 2519 0.03 VAL 702 -0.05 THR 2380
GLU 2512 0.03 ALA 703 -0.05 CYS 2384
GLU 2512 0.04 MET 704 -0.06 CYS 2384
GLU 2512 0.04 ASP 705 -0.05 LEU 2343
GLU 2512 0.05 ASP 706 -0.05 LEU 2343
GLU 2516 0.05 TYR 707 -0.04 LEU 2343
GLU 2516 0.04 LEU 708 -0.04 CYS 2384
GLU 2516 0.03 LYS 709 -0.03 CYS 2384
GLU 2516 0.04 ASN 710 -0.03 LEU 2343
LYS 2520 0.03 VAL 711 -0.02 LEU 2343
GLU 2519 0.03 MET 712 -0.02 THR 2380
LYS 2520 0.02 LEU 713 -0.01 CYS 2384
LYS 2520 0.03 GLU 714 -0.01 LYS 751
ARG 2523 0.03 ARG 715 -0.02 LYS 751
LYS 2520 0.02 ALA 716 -0.01 SER 753
GLU 2527 0.02 CYS 717 -0.02 SER 753
GLU 2527 0.02 ASP 718 -0.03 LYS 751
GLU 2527 0.02 GLN 719 -0.02 SER 753
GLU 2527 0.02 ASN 720 -0.03 SER 754
GLU 2527 0.02 ASN 721 -0.02 HIS 677
CYS 2384 0.02 SER 722 -0.02 HIS 677
CYS 2384 0.02 ILE 723 -0.02 SER 2465
LYS 2520 0.01 MET 724 -0.01 THR 2310
LYS 2520 0.02 VAL 725 -0.01 SER 2465
LYS 2520 0.01 GLU 726 -0.01 SER 2465
GLU 2395 0.01 CYS 727 -0.02 THR 2361
GLU 2512 0.02 LEU 728 -0.02 THR 2380
SER 764 0.02 LEU 729 -0.01 CYS 2384
LYS 2509 0.02 LEU 730 -0.03 THR 2441
LYS 2509 0.02 LEU 731 -0.04 CYS 2384
LYS 2509 0.03 GLY 732 -0.04 GLY 2385
GLU 2512 0.03 ALA 733 -0.03 GLY 2385
VAL 2513 0.03 ASP 734 -0.03 GLU 2395
VAL 2513 0.02 ALA 735 -0.03 GLU 2395
LEU 2517 0.03 ASN 736 -0.04 GLU 2395
LYS 2520 0.03 GLN 737 -0.04 GLU 2395
LYS 2520 0.03 ALA 738 -0.03 GLU 2395
LYS 2520 0.04 LYS 739 -0.04 LYS 2399
LYS 2520 0.04 GLU 740 -0.04 LYS 2399
THR 2524 0.03 GLY 741 -0.04 LYS 2399
THR 2524 0.03 SER 742 -0.03 LYS 2399
LYS 2520 0.03 SER 743 -0.03 LYS 2399
LYS 2520 0.02 LEU 744 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.03 ILE 745 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.03 CYS 746 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.02 GLN 747 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.03 VAL 748 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.04 CYS 749 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.03 GLU 750 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.03 LYS 751 -0.03 ASP 718
THR 2310 0.04 GLU 752 -0.02 ASP 718
THR 2310 0.03 SER 753 -0.03 ASP 718
THR 2310 0.04 SER 754 -0.03 ASN 720
THR 2310 0.05 PRO 755 -0.02 ASP 640
THR 2361 0.04 LYS 756 -0.02 HIS 677
THR 2361 0.03 LEU 757 -0.01 HIS 677
THR 2310 0.04 VAL 758 -0.01 ASP 640
THR 2310 0.04 GLU 759 -0.01 ASP 640
SER 2440 0.03 LEU 760 -0.01 HIS 677
THR 2310 0.02 LEU 761 -0.01 LYS 2399
THR 2310 0.03 LEU 762 -0.02 LYS 2399
ASN 2422 0.03 ASN 763 -0.01 LYS 2399
GLY 732 0.02 SER 764 -0.01 VAL 2396
ASP 734 0.03 GLY 765 -0.03 GLU 2395
THR 2310 0.02 SER 766 -0.03 LYS 2399
THR 2310 0.02 ARG 767 -0.04 LYS 2399
THR 2310 0.03 GLU 768 -0.03 LYS 2399
THR 2310 0.03 GLN 769 -0.04 LYS 2399
THR 2310 0.03 ASP 770 -0.03 LYS 2399
THR 2310 0.04 VAL 771 -0.03 LYS 2399
THR 2310 0.04 ARG 772 -0.03 LYS 2399
THR 2310 0.04 LYS 773 -0.03 LYS 2399
THR 2310 0.04 ALA 774 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.05 LEU 775 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.04 THR 776 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.04 ILE 777 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.05 SER 778 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.05 ILE 779 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.05 GLY 780 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.05 LYS 781 -0.02 ASP 598
THR 2310 0.06 GLY 782 -0.02 ARG 637
THR 2310 0.06 ASP 783 -0.02 ARG 637
THR 2310 0.07 SER 784 -0.02 ARG 637
THR 2310 0.07 GLN 785 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.06 ILE 786 -0.02 ARG 637
THR 2310 0.06 ILE 787 -0.01 ASP 640
THR 2310 0.07 SER 788 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.06 LEU 789 -0.01 ASP 640
THR 2310 0.05 LEU 790 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.06 LEU 791 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.07 ARG 792 -0.01 LYS 2399
ASN 2308 0.05 ARG 793 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.05 LEU 794 -0.02 LYS 2399
SER 2309 0.06 ALA 795 -0.02 LYS 2399
SER 2309 0.07 LEU 796 -0.01 SER 1965
LYS 2467 0.07 ASP 797 -0.02 SER 1965
ASN 2468 0.09 VAL 798 -0.02 LEU 829
ASN 2468 0.11 ALA 799 -0.02 LEU 829
LEU 2466 0.12 ASN 800 -0.02 ALA 1964
LYS 2467 0.11 ASN 801 -0.02 ALA 1964
SER 2465 0.09 SER 802 -0.02 SER 1965
SER 2309 0.07 ILE 803 -0.01 LYS 2399
SER 2465 0.07 CYS 804 -0.02 LYS 2399
SER 2309 0.06 LEU 805 -0.02 LYS 2399
SER 2465 0.06 GLY 806 -0.02 LYS 2399
SER 2465 0.05 GLY 807 -0.03 LYS 2399
SER 2257 0.05 PHE 808 -0.03 LYS 2399
SER 2257 0.05 CYS 809 -0.03 LYS 2399
SER 2257 0.06 ILE 810 -0.02 LYS 2399
SER 2257 0.06 GLY 811 -0.02 LYS 2399
SER 2257 0.06 LYS 812 -0.02 LYS 2399
SER 2257 0.07 VAL 813 -0.02 LYS 2399
THR 2310 0.08 GLU 814 -0.02 ASP 598
THR 2310 0.09 PRO 815 -0.02 ASP 598
THR 2310 0.09 SER 816 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.08 TRP 817 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.09 LEU 818 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.10 GLY 819 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.10 PRO 820 -0.02 ASP 640
THR 2310 0.09 LEU 821 -0.01 ASP 640
SER 2309 0.11 PHE 822 -0.02 ALA 1964
SER 2309 0.13 PRO 823 -0.02 ALA 1964
THR 2310 0.15 ASP 824 -0.02 GLY 2100
SER 2309 0.20 LYS 825 -0.02 SER 2465
THR 2310 0.21 THR 826 -0.03 SER 2465
THR 2310 0.17 SER 827 -0.03 SER 2465
THR 2310 0.18 ASN 828 -0.05 SER 2465
THR 2361 0.12 LEU 829 -0.04 SER 2465
THR 2361 0.12 ARG 830 -0.05 SER 2465
THR 2361 0.10 LYS 831 -0.04 SER 2465
CYS 2384 0.07 GLN 832 -0.04 SER 2465
CYS 2384 0.05 THR 833 -0.03 SER 2465
CYS 2384 0.07 ASN 834 -0.05 THR 2310
CYS 2384 0.05 ILE 835 -0.05 THR 2310
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GLY 624 0.03 MET 2027 -0.05 LYS 2402
ARG 2163 0.03 THR 2031 -0.04 LYS 2402
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ARG 2163 0.03 ARG 2039 -0.04 GLU 2400
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LEU 2466 0.03 LEU 2063 -0.03 GLU 2400
ARG 2163 0.03 TYR 2064 -0.03 GLU 2400
ARG 2163 0.04 ASP 2065 -0.03 GLU 2400
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ARG 2163 0.06 GLY 2070 -0.02 GLU 2400
ARG 2163 0.06 GLY 2071 -0.02 GLU 982
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ASN 2185 0.03 PRO 2103 -0.02 ARG 830
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CYS 2139 0.04 VAL 2138 -0.02 ARG 830
VAL 2138 0.04 CYS 2139 -0.02 ARG 830
VAL 852 0.02 LEU 2140 -0.02 ASN 1644
ARG 1968 0.04 THR 2141 -0.02 ARG 830
ALA 2102 0.04 ARG 2142 -0.02 PRO 2105
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PRO 1083 0.03 LYS 2148 -0.05 LYS 1551
PRO 1083 0.03 ASN 2149 -0.06 ASN 1644
THR 1084 0.04 VAL 2150 -0.05 ASN 1644
ARG 981 0.04 ILE 2151 -0.05 ASN 1644
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ARG 981 0.12 HIS 2160 -0.04 GLU 685
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CYS 1059 0.08 ALA 2165 -0.03 GLU 685
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CYS 1059 0.06 TRP 2168 -0.03 ASN 1644
ARG 981 0.06 LEU 2169 -0.04 ASN 1644
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ARG 981 0.04 HIS 2173 -0.06 ASN 1644
PRO 1083 0.04 THR 2174 -0.05 LYS 1643
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THR 1084 0.05 SER 2180 -0.04 ASN 1644
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THR 1084 0.06 ASP 2183 -0.02 ASN 1644
GLY 2100 0.06 LEU 2184 -0.02 ARG 830
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GLY 2100 0.05 GLU 2187 -0.03 ASN 1644
LYS 1108 0.05 GLY 2188 -0.03 ASN 1644
THR 1084 0.05 TYR 2189 -0.03 ASN 1644
THR 1084 0.05 THR 2190 -0.03 ASN 1644
PRO 1083 0.05 SER 2191 -0.04 LYS 1643
PRO 1083 0.06 GLU 2192 -0.04 LYS 1643
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PRO 1083 0.05 ASP 2196 -0.05 LYS 1643
ARG 981 0.05 SER 2197 -0.05 LYS 1643
ARG 981 0.05 ARG 2198 -0.05 LYS 1643
ARG 981 0.06 ILE 2199 -0.04 LYS 1643
ARG 981 0.06 LEU 2200 -0.04 ASN 1644
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ARG 981 0.08 LEU 2202 -0.03 ASN 1644
ARG 981 0.09 ALA 2203 -0.03 LYS 1643
ARG 981 0.10 LEU 2204 -0.03 LYS 687
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ARG 981 0.08 ILE 2215 -0.03 LYS 1643
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ARG 981 0.07 MET 2241 -0.04 LYS 1643
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ARG 981 0.10 TYR 2249 -0.03 GLN 690
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ARG 981 0.13 ASN 2251 -0.04 LYS 687
ARG 981 0.15 SER 2252 -0.05 LYS 687
ARG 981 0.13 PHE 2253 -0.06 LYS 687
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ARG 981 0.12 LYS 2255 -0.06 LYS 687
VAL 1008 0.11 GLN 2256 -0.06 LYS 687
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ARG 981 0.13 GLN 2259 -0.05 LYS 687
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ARG 981 0.12 ASN 2261 -0.05 LYS 687
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SER 1058 0.08 ALA 2286 -0.03 PHE 573
ARG 981 0.08 PRO 2287 -0.04 PHE 573
ARG 981 0.08 LEU 2288 -0.04 PHE 573
ARG 981 0.08 LYS 2289 -0.04 PHE 573
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