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***  LRRK2_7LI4_R1441C  ***

LOGs for ID: 2605160929253032129

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605160929253032129.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605160929253032129.atom to be opened. Openam> File opened: 2605160929253032129.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1795 First residue number = 558 Last residue number = 2527 Number of atoms found = 14105 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 174.472458 +/- 20.810884 From: 128.501000 To: 235.962000 = 221.161837 +/- 20.821604 From: 170.335000 To: 275.584000 = 198.416653 +/- 32.657509 From: 122.728000 To: 257.408000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.5709 % Filled. Pdbmat> 5111430 non-zero elements. Pdbmat> 558610 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.21 +/- 21.15 Maximum number = 126 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.117220E+07 Pdbmat> Larger element = 480.769 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1795 non-zero elements, NRBL set to 9 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605160929253032129.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 9 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605160929253032129.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605160929253032129.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 14105 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 9 residue(s) per block. Blocpdb> 1795 residues. Blocpdb> 64 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 68 atoms in block 2 Block first atom: 65 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 133 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 146 Blocpdb> 65 atoms in block 5 Block first atom: 206 Blocpdb> 61 atoms in block 6 Block first atom: 271 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 332 Blocpdb> 63 atoms in block 8 Block first atom: 348 Blocpdb> 75 atoms in block 9 Block first atom: 411 Blocpdb> 67 atoms in block 10 Block first atom: 486 Blocpdb> 67 atoms in block 11 Block first atom: 553 Blocpdb> 70 atoms in block 12 Block first atom: 620 Blocpdb> 79 atoms in block 13 Block first atom: 690 Blocpdb> 71 atoms in block 14 Block first atom: 769 Blocpdb> 76 atoms in block 15 Block first atom: 840 Blocpdb> 62 atoms in block 16 Block first atom: 916 Blocpdb> 70 atoms in block 17 Block first atom: 978 Blocpdb> 66 atoms in block 18 Block first atom: 1048 Blocpdb> 70 atoms in block 19 Block first atom: 1114 Blocpdb> 58 atoms in block 20 Block first atom: 1184 Blocpdb> 60 atoms in block 21 Block first atom: 1242 Blocpdb> 70 atoms in block 22 Block first atom: 1302 Blocpdb> 68 atoms in block 23 Block first atom: 1372 Blocpdb> 73 atoms in block 24 Block first atom: 1440 Blocpdb> 62 atoms in block 25 Block first atom: 1513 Blocpdb> 76 atoms in block 26 Block first atom: 1575 Blocpdb> 60 atoms in block 27 Block first atom: 1651 Blocpdb> 60 atoms in block 28 Block first atom: 1711 Blocpdb> 70 atoms in block 29 Block first atom: 1771 Blocpdb> 75 atoms in block 30 Block first atom: 1841 Blocpdb> 67 atoms in block 31 Block first atom: 1916 Blocpdb> 79 atoms in block 32 Block first atom: 1983 Blocpdb> 45 atoms in block 33 Block first atom: 2062 Blocpdb> 77 atoms in block 34 Block first atom: 2107 Blocpdb> 71 atoms in block 35 Block first atom: 2184 Blocpdb> 63 atoms in block 36 Block first atom: 2255 Blocpdb> 78 atoms in block 37 Block first atom: 2318 Blocpdb> 70 atoms in block 38 Block first atom: 2396 Blocpdb> 74 atoms in block 39 Block first atom: 2466 Blocpdb> 74 atoms in block 40 Block first atom: 2540 Blocpdb> 71 atoms in block 41 Block first atom: 2614 Blocpdb> 70 atoms in block 42 Block first atom: 2685 Blocpdb> 72 atoms in block 43 Block first atom: 2755 Blocpdb> 61 atoms in block 44 Block first atom: 2827 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 2888 Blocpdb> 76 atoms in block 46 Block first atom: 2961 Blocpdb> 68 atoms in block 47 Block first atom: 3037 Blocpdb> 77 atoms in block 48 Block first atom: 3105 Blocpdb> 59 atoms in block 49 Block first atom: 3182 Blocpdb> 77 atoms in block 50 Block first atom: 3241 Blocpdb> 71 atoms in block 51 Block first atom: 3318 Blocpdb> 66 atoms in block 52 Block first atom: 3389 Blocpdb> 66 atoms in block 53 Block first atom: 3455 Blocpdb> 71 atoms in block 54 Block first atom: 3521 Blocpdb> 70 atoms in block 55 Block first atom: 3592 Blocpdb> 72 atoms in block 56 Block first atom: 3662 Blocpdb> 68 atoms in block 57 Block first atom: 3734 Blocpdb> 71 atoms in block 58 Block first atom: 3802 Blocpdb> 71 atoms in block 59 Block first atom: 3873 Blocpdb> 79 atoms in block 60 Block first atom: 3944 Blocpdb> 77 atoms in block 61 Block first atom: 4023 Blocpdb> 63 atoms in block 62 Block first atom: 4100 Blocpdb> 84 atoms in block 63 Block first atom: 4163 Blocpdb> 77 atoms in block 64 Block first atom: 4247 Blocpdb> 66 atoms in block 65 Block first atom: 4324 Blocpdb> 70 atoms in block 66 Block first atom: 4390 Blocpdb> 76 atoms in block 67 Block first atom: 4460 Blocpdb> 75 atoms in block 68 Block first atom: 4536 Blocpdb> 74 atoms in block 69 Block first atom: 4611 Blocpdb> 72 atoms in block 70 Block first atom: 4685 Blocpdb> 77 atoms in block 71 Block first atom: 4757 Blocpdb> 74 atoms in block 72 Block first atom: 4834 Blocpdb> 79 atoms in block 73 Block first atom: 4908 Blocpdb> 56 atoms in block 74 Block first atom: 4987 Blocpdb> 75 atoms in block 75 Block first atom: 5043 Blocpdb> 63 atoms in block 76 Block first atom: 5118 Blocpdb> 72 atoms in block 77 Block first atom: 5181 Blocpdb> 80 atoms in block 78 Block first atom: 5253 Blocpdb> 76 atoms in block 79 Block first atom: 5333 Blocpdb> 74 atoms in block 80 Block first atom: 5409 Blocpdb> 80 atoms in block 81 Block first atom: 5483 Blocpdb> 73 atoms in block 82 Block first atom: 5563 Blocpdb> 62 atoms in block 83 Block first atom: 5636 Blocpdb> 82 atoms in block 84 Block first atom: 5698 Blocpdb> 56 atoms in block 85 Block first atom: 5780 Blocpdb> 65 atoms in block 86 Block first atom: 5836 Blocpdb> 52 atoms in block 87 Block first atom: 5901 Blocpdb> 68 atoms in block 88 Block first atom: 5953 Blocpdb> 80 atoms in block 89 Block first atom: 6021 Blocpdb> 62 atoms in block 90 Block first atom: 6101 Blocpdb> 77 atoms in block 91 Block first atom: 6163 Blocpdb> 75 atoms in block 92 Block first atom: 6240 Blocpdb> 66 atoms in block 93 Block first atom: 6315 Blocpdb> 76 atoms in block 94 Block first atom: 6381 Blocpdb> 73 atoms in block 95 Block first atom: 6457 Blocpdb> 74 atoms in block 96 Block first atom: 6530 Blocpdb> 77 atoms in block 97 Block first atom: 6604 Blocpdb> 70 atoms in block 98 Block first atom: 6681 Blocpdb> 74 atoms in block 99 Block first atom: 6751 Blocpdb> 72 atoms in block 100 Block first atom: 6825 Blocpdb> 68 atoms in block 101 Block first atom: 6897 Blocpdb> 77 atoms in block 102 Block first atom: 6965 Blocpdb> 68 atoms in block 103 Block first atom: 7042 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 7110 Blocpdb> 49 atoms in block 105 Block first atom: 7175 Blocpdb> 83 atoms in block 106 Block first atom: 7224 Blocpdb> 72 atoms in block 107 Block first atom: 7307 Blocpdb> 66 atoms in block 108 Block first atom: 7379 Blocpdb> 73 atoms in block 109 Block first atom: 7445 Blocpdb> 71 atoms in block 110 Block first atom: 7518 Blocpdb> 78 atoms in block 111 Block first atom: 7589 Blocpdb> 85 atoms in block 112 Block first atom: 7667 Blocpdb> 66 atoms in block 113 Block first atom: 7752 Blocpdb> 84 atoms in block 114 Block first atom: 7818 Blocpdb> 80 atoms in block 115 Block first atom: 7902 Blocpdb> 64 atoms in block 116 Block first atom: 7982 Blocpdb> 69 atoms in block 117 Block first atom: 8046 Blocpdb> 69 atoms in block 118 Block first atom: 8115 Blocpdb> 67 atoms in block 119 Block first atom: 8184 Blocpdb> 70 atoms in block 120 Block first atom: 8251 Blocpdb> 79 atoms in block 121 Block first atom: 8321 Blocpdb> 63 atoms in block 122 Block first atom: 8400 Blocpdb> 79 atoms in block 123 Block first atom: 8463 Blocpdb> 57 atoms in block 124 Block first atom: 8542 Blocpdb> 74 atoms in block 125 Block first atom: 8599 Blocpdb> 66 atoms in block 126 Block first atom: 8673 Blocpdb> 72 atoms in block 127 Block first atom: 8739 Blocpdb> 67 atoms in block 128 Block first atom: 8811 Blocpdb> 71 atoms in block 129 Block first atom: 8878 Blocpdb> 78 atoms in block 130 Block first atom: 8949 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 9027 Blocpdb> 66 atoms in block 132 Block first atom: 9096 Blocpdb> 67 atoms in block 133 Block first atom: 9162 Blocpdb> 76 atoms in block 134 Block first atom: 9229 Blocpdb> 78 atoms in block 135 Block first atom: 9305 Blocpdb> 73 atoms in block 136 Block first atom: 9383 Blocpdb> 63 atoms in block 137 Block first atom: 9456 Blocpdb> 71 atoms in block 138 Block first atom: 9519 Blocpdb> 68 atoms in block 139 Block first atom: 9590 Blocpdb> 72 atoms in block 140 Block first atom: 9658 Blocpdb> 76 atoms in block 141 Block first atom: 9730 Blocpdb> 73 atoms in block 142 Block first atom: 9806 Blocpdb> 74 atoms in block 143 Block first atom: 9879 Blocpdb> 75 atoms in block 144 Block first atom: 9953 Blocpdb> 66 atoms in block 145 Block first atom: 10028 Blocpdb> 68 atoms in block 146 Block first atom: 10094 Blocpdb> 43 atoms in block 147 Block first atom: 10162 Blocpdb> 62 atoms in block 148 Block first atom: 10205 Blocpdb> 63 atoms in block 149 Block first atom: 10267 Blocpdb> 78 atoms in block 150 Block first atom: 10330 Blocpdb> 73 atoms in block 151 Block first atom: 10408 Blocpdb> 65 atoms in block 152 Block first atom: 10481 Blocpdb> 75 atoms in block 153 Block first atom: 10546 Blocpdb> 71 atoms in block 154 Block first atom: 10621 Blocpdb> 67 atoms in block 155 Block first atom: 10692 Blocpdb> 77 atoms in block 156 Block first atom: 10759 Blocpdb> 74 atoms in block 157 Block first atom: 10836 Blocpdb> 72 atoms in block 158 Block first atom: 10910 Blocpdb> 67 atoms in block 159 Block first atom: 10982 Blocpdb> 74 atoms in block 160 Block first atom: 11049 Blocpdb> 69 atoms in block 161 Block first atom: 11123 Blocpdb> 70 atoms in block 162 Block first atom: 11192 Blocpdb> 67 atoms in block 163 Block first atom: 11262 Blocpdb> 73 atoms in block 164 Block first atom: 11329 Blocpdb> 70 atoms in block 165 Block first atom: 11402 Blocpdb> 68 atoms in block 166 Block first atom: 11472 Blocpdb> 69 atoms in block 167 Block first atom: 11540 Blocpdb> 70 atoms in block 168 Block first atom: 11609 Blocpdb> 65 atoms in block 169 Block first atom: 11679 Blocpdb> 74 atoms in block 170 Block first atom: 11744 Blocpdb> 69 atoms in block 171 Block first atom: 11818 Blocpdb> 72 atoms in block 172 Block first atom: 11887 Blocpdb> 77 atoms in block 173 Block first atom: 11959 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 12036 Blocpdb> 76 atoms in block 175 Block first atom: 12093 Blocpdb> 63 atoms in block 176 Block first atom: 12169 Blocpdb> 63 atoms in block 177 Block first atom: 12232 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 12295 Blocpdb> 72 atoms in block 179 Block first atom: 12359 Blocpdb> 68 atoms in block 180 Block first atom: 12431 Blocpdb> 76 atoms in block 181 Block first atom: 12499 Blocpdb> 74 atoms in block 182 Block first atom: 12575 Blocpdb> 69 atoms in block 183 Block first atom: 12649 Blocpdb> 64 atoms in block 184 Block first atom: 12718 Blocpdb> 71 atoms in block 185 Block first atom: 12782 Blocpdb> 79 atoms in block 186 Block first atom: 12853 Blocpdb> 64 atoms in block 187 Block first atom: 12932 Blocpdb> 79 atoms in block 188 Block first atom: 12996 Blocpdb> 77 atoms in block 189 Block first atom: 13075 Blocpdb> 70 atoms in block 190 Block first atom: 13152 Blocpdb> 74 atoms in block 191 Block first atom: 13222 Blocpdb> 57 atoms in block 192 Block first atom: 13296 Blocpdb> 75 atoms in block 193 Block first atom: 13353 Blocpdb> 79 atoms in block 194 Block first atom: 13428 Blocpdb> 68 atoms in block 195 Block first atom: 13507 Blocpdb> 66 atoms in block 196 Block first atom: 13575 Blocpdb> 74 atoms in block 197 Block first atom: 13641 Blocpdb> 73 atoms in block 198 Block first atom: 13715 Blocpdb> 73 atoms in block 199 Block first atom: 13788 Blocpdb> 74 atoms in block 200 Block first atom: 13861 Blocpdb> 81 atoms in block 201 Block first atom: 13935 Blocpdb> 74 atoms in block 202 Block first atom: 14016 Blocpdb> 16 atoms in block 203 Block first atom: 14089 Blocpdb> 203 blocks. Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5111633 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 42315 Prepmat> Matrix trace = 11172200.0000 Prepmat> Last element read: 42315 42315 130.4897 Prepmat> 20707 lines saved. Prepmat> 19206 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14105 RTB> Total mass = 14105.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 14105 RTB> Number of blocks = 203 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 188565.0694 RTB> 50955 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1218 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50955 Diagstd> Projected matrix trace = 188565.0694 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1218 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 188565.0694 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1057662 0.1495300 0.2534370 0.2793762 0.3681729 0.5182272 0.7752427 0.8182785 1.1893500 1.3740247 1.5907671 1.7401190 1.8023651 2.1033734 2.3186459 2.4505383 2.7342088 2.9622396 3.0445318 3.2296474 3.4804685 3.7048079 3.9018600 4.0777799 4.2309431 4.5704056 4.7896191 4.9184976 5.2129154 5.3951523 5.5236162 5.5966159 5.8390073 6.2558103 6.3195354 6.4890027 6.7323960 6.8775223 7.1691595 7.3253889 7.6887643 7.9686011 8.0437012 8.1044980 8.4322350 8.6883572 8.8764973 9.0971304 9.3800299 9.5895491 9.7367596 9.9467738 10.5718584 11.0646451 11.3120343 11.3317232 11.5590047 11.7521556 11.9168082 12.1969157 12.3782807 12.6314460 12.7535600 13.0295007 13.2579003 13.9168849 14.1505058 14.1715724 14.6763471 14.9028075 15.4895281 15.6671929 15.8705649 16.3915380 16.6905593 16.7822278 16.8782538 17.0865432 17.2545024 17.5963966 17.7871622 18.0170306 18.4183379 18.5621698 18.6890964 18.9615548 19.3041983 19.5310741 19.8393185 20.1871010 20.2794092 20.5131755 20.7227044 20.8314763 21.3295104 21.7306569 22.0513632 22.3548494 22.6311093 22.7211706 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034308 0.0034335 0.0034336 0.0034338 0.0034342 0.0034345 35.3157789 41.9913155 54.6676389 57.3971045 65.8902512 78.1727457 95.6123765 98.2303873 118.4268315 127.2894889 136.9615237 143.2467432 145.7862848 157.4901776 165.3531599 169.9910403 179.5606301 186.8983085 189.4765809 195.1519244 202.5881944 209.0153225 214.5018897 219.2841134 223.3643572 232.1521197 237.6543495 240.8305145 247.9337330 252.2302282 255.2154878 256.8964069 262.4005791 271.6045643 272.9844172 276.6204339 281.7604990 284.7811786 290.7564786 293.9074697 301.1088738 306.5394148 307.9805180 309.1422329 315.3309736 320.0841088 323.5311431 327.5272883 332.5809665 336.2748385 338.8461090 342.4809353 353.0782365 361.2135427 365.2293216 365.5470290 369.1947366 372.2665770 374.8653123 379.2453736 382.0546099 385.9417976 387.8028494 391.9757208 395.3963487 405.1037830 408.4898422 408.7937996 416.0104759 419.2077722 427.3801764 429.8242121 432.6049386 439.6480317 443.6400294 444.8566495 446.1275433 448.8718652 451.0726545 455.5196867 457.9822145 460.9320309 466.0371073 467.8532503 469.4500963 472.8596459 477.1129072 479.9083923 483.6805846 487.9016175 489.0158436 491.8262765 494.3317402 495.6273962 501.5170749 506.2111506 509.9328632 513.4298976 516.5926239 517.6195026 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14105 Rtb_to_modes> Number of blocs = 203 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1495 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2534 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7752 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.962 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.230 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.705 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.902 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.231 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.790 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.597 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.839 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.256 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.878 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.947 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99995 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 253890 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00003 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99995 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605160929253032129.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605160929253032129.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605160929253032129.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605160929253032129.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1795 First residue number = 558 Last residue number = 2527 Number of atoms found = 14105 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9815E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1495 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2534 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7752 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.962 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.230 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.705 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.902 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.231 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.790 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.597 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.839 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.878 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.947 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Bfactors> 106 vectors, 42315 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.105800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.555 for 1795 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.049 +/- 0.06 Bfactors> = 46.424 +/- 23.92 Bfactors> Shiftng-fct= 46.374 Bfactors> Scaling-fct= 417.398 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605160929253032129.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605160929253032129.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.9 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vecteur en lecture: 429.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.6 Chkmod> 106 vectors, 42315 coordinates in file. Chkmod> That is: 14105 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 65 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7127 0.0034 0.9298 0.0034 0.7698 0.0034 0.9396 0.0034 0.7232 0.0034 0.9673 35.3199 0.5308 41.9853 0.4018 54.6613 0.5040 57.3971 0.3573 65.8899 0.4354 78.1673 0.6727 95.6056 0.2572 98.2275 0.6450 118.4043 0.5972 127.2829 0.6321 136.9657 0.2855 143.2357 0.5427 145.7653 0.6696 157.4694 0.6670 165.3587 0.4597 169.9998 0.6369 179.5461 0.3699 186.8827 0.5173 189.4830 0.5042 195.1542 0.2684 202.5659 0.5258 209.0118 0.0863 214.4965 0.3675 219.2806 0.3335 223.3563 0.3668 232.1319 0.0973 237.6536 0.2020 240.8080 0.4956 247.9251 0.2792 252.2158 0.3489 255.2134 0.2957 256.8942 0.3167 262.3892 0.3550 271.5970 0.2365 272.9827 0.0578 276.6085 0.3040 281.7401 0.2222 284.7788 0.4186 290.7408 0.3946 293.8871 0.2431 301.1006 0.3296 306.5339 0.3349 307.9730 0.3812 309.1195 0.4328 315.3130 0.4765 320.0638 0.3893 323.5082 0.3457 327.5109 0.2984 332.5662 0.4015 336.2683 0.4376 338.8357 0.3722 342.4701 0.3714 353.0320 0.3704 361.1222 0.5064 365.1808 0.3931 365.5035 0.3346 369.1948 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models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605160929253032129.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605160929253032129.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605160929253032129 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605160929253032129.eigenfacs 2605160929253032129.atom making animated gifs 11 models are in 2605160929253032129.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605160929253032129.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605160929253032129.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making 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