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***  LRRK2_7LI4_G2019S  ***

CA distance fluctuations for 2605161002373039660

---  normal mode 10  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
ARG 1847 0.08 GLY 558 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.08 ILE 559 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.08 GLN 560 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.07 LYS 561 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.07 CYS 562 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.07 GLY 563 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.07 LEU 564 -0.13 THR 2380
ARG 1847 0.06 LYS 565 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.07 VAL 566 -0.13 THR 2380
ARG 1847 0.07 ILE 567 -0.14 GLN 2342
ARG 1847 0.06 SER 568 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.06 SER 569 -0.15 GLN 2342
ARG 1847 0.06 ILE 570 -0.16 GLN 2342
ARG 1847 0.06 VAL 571 -0.16 GLN 2342
ARG 1847 0.06 HIS 572 -0.18 GLN 2342
ARG 1847 0.05 PHE 573 -0.18 GLN 2342
GLY 1819 0.06 PRO 574 -0.17 GLN 2342
GLY 1819 0.06 ASP 575 -0.18 GLN 2342
ASP 1818 0.06 ALA 576 -0.16 GLN 2342
ASP 1818 0.07 LEU 577 -0.15 GLN 2342
ARG 1847 0.08 GLY 584 -0.12 GLN 2342
ARG 1847 0.07 ALA 585 -0.12 GLN 2342
ARG 1847 0.07 MET 586 -0.12 GLN 2342
ARG 1847 0.08 ASP 587 -0.11 GLN 2342
ARG 1847 0.08 SER 588 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.07 VAL 589 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.08 LEU 590 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.08 HIS 591 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.08 THR 592 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.08 LEU 593 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.08 GLN 594 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.09 MET 595 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.08 TYR 596 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.08 PRO 597 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 ASP 598 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 ASP 599 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 GLN 600 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.06 GLU 601 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.06 ILE 602 -0.13 THR 2380
ARG 1847 0.07 GLN 603 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.07 CYS 604 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.06 LEU 605 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.06 GLY 606 -0.13 THR 2380
ARG 1847 0.06 LEU 607 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.06 SER 608 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.06 LEU 609 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.06 ILE 610 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.05 GLY 611 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.06 TYR 612 -0.16 GLN 2342
LEU 1848 0.08 GLY 624 -0.09 THR 2380
LEU 1848 0.08 HIS 625 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.08 LEU 626 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 LEU 627 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.07 ALA 628 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.07 LYS 629 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 ILE 630 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.06 LEU 631 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.06 VAL 632 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.07 SER 633 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 SER 634 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.06 LEU 635 -0.12 THR 2380
LYS 751 0.06 TYR 636 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.07 ARG 637 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.06 PHE 638 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.05 LYS 639 -0.11 LYS 2379
ARG 1847 0.05 ASP 640 -0.12 LYS 2379
ARG 1847 0.05 VAL 641 -0.12 LYS 2379
ARG 1847 0.05 ALA 642 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.05 GLU 643 -0.16 THR 2380
ARG 1847 0.05 ILE 644 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.05 GLN 645 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.05 THR 646 -0.18 THR 2380
ARG 1847 0.05 LYS 647 -0.16 THR 2380
ARG 1847 0.05 GLY 648 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.05 PHE 649 -0.16 THR 2380
ARG 1847 0.05 GLN 650 -0.17 THR 2380
ARG 1847 0.05 THR 651 -0.15 THR 2380
ARG 1847 0.05 ILE 652 -0.14 THR 2380
ARG 1847 0.05 LEU 653 -0.16 THR 2380
ASP 1818 0.05 ALA 654 -0.15 THR 2380
ASP 1818 0.05 ILE 655 -0.13 THR 2380
ASP 1818 0.05 LEU 656 -0.14 CYS 2384
ASP 1818 0.05 LYS 657 -0.15 CYS 2384
ASP 1818 0.05 LEU 658 -0.14 LEU 2343
ASP 1818 0.05 SER 659 -0.12 LEU 2343
ASP 1818 0.05 ALA 660 -0.12 CYS 2384
ASP 1818 0.06 SER 661 -0.11 CYS 2384
ASP 1818 0.06 PHE 662 -0.11 CYS 2384
ASP 1818 0.05 SER 663 -0.11 CYS 2384
LEU 1848 0.06 LYS 664 -0.09 CYS 2384
LEU 1848 0.06 LEU 665 -0.09 THR 2380
LEU 1848 0.06 LEU 666 -0.10 THR 2380
LEU 1848 0.06 VAL 667 -0.09 THR 2380
LEU 1848 0.07 HIS 668 -0.08 THR 2380
ARG 1847 0.07 HIS 669 -0.09 THR 2380
ARG 1847 0.06 SER 670 -0.09 THR 2380
ARG 1847 0.06 PHE 671 -0.10 THR 2380
ARG 1847 0.05 ASP 672 -0.09 THR 2380
GLN 719 0.06 LEU 673 -0.09 THR 2380
ARG 1847 0.05 VAL 674 -0.11 THR 2380
ARG 1847 0.05 ILE 675 -0.12 THR 2380
ARG 1847 0.04 PHE 676 -0.10 LYS 2379
ARG 1847 0.04 HIS 677 -0.10 LYS 2379
ARG 1847 0.04 GLN 678 -0.13 LYS 2379
ARG 1847 0.04 MET 679 -0.13 LYS 2379
ARG 1847 0.04 SER 680 -0.11 THR 2310
ARG 1847 0.04 SER 681 -0.11 GLU 2311
ARG 1847 0.03 ASN 682 -0.13 GLU 2311
ARG 1847 0.03 ILE 683 -0.16 LYS 2379
ARG 1847 0.03 MET 684 -0.17 GLU 2311
ARG 1847 0.03 GLU 685 -0.19 GLU 2311
ARG 1847 0.03 GLN 686 -0.19 LYS 2379
ARG 1847 0.03 LYS 687 -0.24 LYS 2379
ARG 1847 0.03 ASP 688 -0.22 THR 2380
ARG 1847 0.03 GLN 689 -0.27 THR 2380
ARG 1847 0.03 GLN 690 -0.26 THR 2380
ARG 1847 0.04 PHE 691 -0.21 THR 2380
ARG 1847 0.03 LEU 692 -0.21 THR 2380
ASP 1818 0.03 ASN 693 -0.24 THR 2380
ARG 1847 0.04 LEU 694 -0.20 THR 2380
ARG 1847 0.04 CYS 695 -0.17 THR 2380
LEU 1848 0.04 CYS 696 -0.17 THR 2380
ASP 1818 0.04 LYS 697 -0.19 CYS 2384
LEU 1848 0.04 CYS 698 -0.15 CYS 2384
LEU 1848 0.04 PHE 699 -0.14 CYS 2384
ASP 1818 0.04 ALA 700 -0.16 CYS 2384
ASP 1818 0.04 LYS 701 -0.14 CYS 2384
LEU 1848 0.04 VAL 702 -0.12 CYS 2384
ASP 1818 0.04 ALA 703 -0.11 CYS 2384
ASP 1818 0.04 MET 704 -0.12 CYS 2384
CYS 1770 0.04 ASP 705 -0.09 CYS 2384
CYS 1770 0.04 ASP 706 -0.08 CYS 2384
CYS 1770 0.05 TYR 707 -0.07 CYS 2384
CYS 1770 0.05 LEU 708 -0.08 CYS 2384
CYS 1770 0.04 LYS 709 -0.08 THR 2361
GLU 1899 0.04 ASN 710 -0.06 THR 2361
GLU 1899 0.05 VAL 711 -0.07 THR 2380
LEU 1848 0.04 MET 712 -0.08 THR 2361
GLU 1899 0.04 LEU 713 -0.07 THR 2361
LEU 744 0.06 GLU 714 -0.06 THR 2361
GLY 1900 0.05 ARG 715 -0.06 LYS 2379
GLY 1900 0.05 ALA 716 -0.07 THR 2310
VAL 748 0.05 CYS 717 -0.06 THR 2310
LYS 751 0.06 ASP 718 -0.05 THR 2310
LEU 673 0.06 GLN 719 -0.06 THR 2310
SER 753 0.05 ASN 720 -0.07 THR 2310
GLY 1900 0.04 ASN 721 -0.08 THR 2310
GLY 1900 0.03 SER 722 -0.08 THR 2310
GLY 1900 0.03 ILE 723 -0.10 THR 2310
GLY 1900 0.03 MET 724 -0.09 THR 2361
GLY 1900 0.03 VAL 725 -0.07 THR 2310
GLY 1900 0.03 GLU 726 -0.08 THR 2361
LEU 1848 0.03 CYS 727 -0.11 THR 2361
LEU 1848 0.03 LEU 728 -0.09 THR 2361
LYS 2399 0.03 LEU 729 -0.08 THR 2361
LYS 2399 0.03 LEU 730 -0.13 THR 2441
LYS 2399 0.03 LEU 731 -0.12 THR 2441
LYS 2399 0.03 GLY 732 -0.09 THR 2441
CYS 1770 0.03 ALA 733 -0.07 THR 2441
GLU 1899 0.03 ASP 734 -0.06 THR 2441
GLU 1899 0.04 ALA 735 -0.05 THR 2361
GLU 1899 0.04 ASN 736 -0.04 THR 2361
GLU 1899 0.04 GLN 737 -0.04 THR 2361
GLU 1899 0.05 ALA 738 -0.04 THR 2361
GLU 1899 0.06 LYS 739 -0.03 THR 2380
GLU 1899 0.06 GLU 740 -0.03 THR 2361
GLU 1899 0.07 GLY 741 -0.03 THR 2361
GLU 1899 0.07 SER 742 -0.03 THR 2361
GLU 1899 0.06 SER 743 -0.03 THR 2310
GLU 714 0.06 LEU 744 -0.04 THR 2310
GLY 1900 0.05 ILE 745 -0.04 THR 2310
GLY 1900 0.06 CYS 746 -0.03 THR 2310
GLY 1900 0.06 GLN 747 -0.04 THR 2310
ASP 718 0.06 VAL 748 -0.04 THR 2310
GLY 1900 0.05 CYS 749 -0.03 THR 2310
ASP 598 0.06 GLU 750 -0.03 THR 2310
ARG 637 0.06 LYS 751 -0.04 THR 2310
ARG 637 0.06 GLU 752 -0.04 THR 2310
ARG 637 0.05 SER 753 -0.05 THR 2310
ARG 637 0.04 SER 754 -0.05 THR 2310
ASP 598 0.04 PRO 755 -0.05 THR 2310
GLY 1900 0.03 LYS 756 -0.06 THR 2310
GLY 1900 0.03 LEU 757 -0.06 THR 2310
GLY 1900 0.03 VAL 758 -0.04 THR 2310
GLY 1900 0.03 GLU 759 -0.04 THR 2310
GLY 1900 0.03 LEU 760 -0.05 THR 2310
GLY 1900 0.03 LEU 761 -0.04 THR 2310
GLY 1900 0.03 LEU 762 -0.03 THR 2310
GLY 1900 0.02 ASN 763 -0.04 ASN 2308
GLY 1900 0.02 SER 764 -0.04 ASN 2308
GLU 1899 0.03 GLY 765 -0.04 THR 2441
GLY 1900 0.03 SER 766 -0.03 THR 2361
GLU 1901 0.03 ARG 767 -0.02 THR 2441
GLU 1901 0.04 GLU 768 -0.02 THR 2441
GLU 1901 0.05 GLN 769 -0.02 THR 2441
GLU 1901 0.05 ASP 770 -0.02 THR 2310
GLU 1901 0.04 VAL 771 -0.02 THR 2310
GLU 1901 0.05 ARG 772 -0.01 PRO 2208
GLY 1900 0.07 LYS 773 -0.02 THR 2310
GLY 1900 0.05 ALA 774 -0.02 THR 2310
GLY 1900 0.05 LEU 775 -0.02 PRO 2208
GLY 1900 0.06 THR 776 -0.01 PRO 2208
GLY 1900 0.06 ILE 777 -0.02 THR 2310
ASP 598 0.05 SER 778 -0.02 PRO 2208
GLY 811 0.05 ILE 779 -0.02 PRO 2208
ASP 598 0.06 GLY 780 -0.02 PRO 2208
ASP 598 0.06 LYS 781 -0.02 PRO 2208
ASP 598 0.06 GLY 782 -0.02 PRO 2208
ASP 598 0.05 ASP 783 -0.03 PRO 2208
ASP 598 0.05 SER 784 -0.03 PRO 2208
ASP 598 0.04 GLN 785 -0.04 PRO 2208
ASP 598 0.04 ILE 786 -0.03 PRO 2208
ASP 598 0.04 ILE 787 -0.02 PRO 2208
ASP 598 0.04 SER 788 -0.03 PRO 2208
ASP 598 0.03 LEU 789 -0.03 PRO 2208
ASP 598 0.03 LEU 790 -0.02 PRO 2208
ASP 598 0.03 LEU 791 -0.02 LYS 2211
ASP 598 0.03 ARG 792 -0.02 SER 2465
ASP 598 0.02 ARG 793 -0.02 SER 2465
ASP 598 0.03 LEU 794 -0.02 VAL 852
ASP 598 0.03 ALA 795 -0.02 VAL 852
ASP 598 0.02 LEU 796 -0.02 VAL 852
LYS 2421 0.02 ASP 797 -0.03 VAL 852
LYS 2421 0.03 VAL 798 -0.03 LEU 2466
LYS 2421 0.03 ALA 799 -0.03 VAL 852
SER 2309 0.03 ASN 800 -0.03 VAL 852
THR 2310 0.04 ASN 801 -0.03 ASN 2185
THR 2310 0.03 SER 802 -0.02 VAL 852
ASP 598 0.03 ILE 803 -0.02 VAL 852
ASP 598 0.03 CYS 804 -0.02 VAL 852
ASP 598 0.03 LEU 805 -0.01 VAL 852
ASP 598 0.03 GLY 806 -0.01 THR 2524
ASP 598 0.04 GLY 807 -0.02 THR 2524
ASP 598 0.04 PHE 808 -0.02 THR 2524
THR 776 0.05 CYS 809 -0.02 THR 2524
ILE 779 0.05 ILE 810 -0.02 THR 2524
GLY 780 0.05 GLY 811 -0.02 GLU 2527
ASP 598 0.05 LYS 812 -0.01 GLU 2527
ASP 598 0.04 VAL 813 -0.01 ASN 2185
ASP 598 0.05 GLU 814 -0.02 ARG 2163
ASP 598 0.04 PRO 815 -0.02 ARG 2163
ASP 598 0.04 SER 816 -0.02 LYS 2211
ASP 598 0.04 TRP 817 -0.02 LYS 2211
ASP 598 0.03 LEU 818 -0.02 ARG 2163
ASP 598 0.03 GLY 819 -0.03 ARG 2163
THR 2361 0.03 PRO 820 -0.03 ARG 2163
THR 2361 0.03 LEU 821 -0.03 SER 2465
THR 2310 0.04 PHE 822 -0.03 ARG 2163
THR 2310 0.05 PRO 823 -0.05 SER 2465
THR 2310 0.06 ASP 824 -0.05 ARG 2163
THR 2310 0.10 LYS 825 -0.07 ARG 2163
THR 2310 0.09 THR 826 -0.07 PRO 2208
THR 2361 0.07 SER 827 -0.06 PRO 2208
THR 2361 0.09 ASN 828 -0.08 PRO 2208
THR 2361 0.08 LEU 829 -0.08 LYS 2258
CYS 2384 0.08 ARG 830 -0.15 THR 2310
SER 2440 0.08 LYS 831 -0.17 THR 2310
THR 2441 0.06 GLN 832 -0.15 THR 2310
THR 2441 0.06 THR 833 -0.13 THR 2310
THR 2441 0.06 ASN 834 -0.17 THR 2361
GLU 2395 0.03 ILE 835 -0.16 THR 2361
GLU 2395 0.03 ALA 836 -0.14 THR 2361
GLU 2395 0.04 SER 837 -0.18 THR 2361
GLU 2395 0.03 THR 838 -0.22 THR 2361
LEU 1848 0.03 LEU 839 -0.17 THR 2361
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ASP 2094 0.05 GLY 2188 -0.05 PHE 573
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ARG 981 0.04 SER 2252 -0.12 LYS 687
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ARG 981 0.05 LYS 2255 -0.13 LYS 687
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ARG 981 0.01 ALA 2268 -0.11 PHE 573
ARG 981 0.02 ASP 2269 -0.11 PHE 573
ARG 981 0.02 GLY 2270 -0.12 PHE 573
GLY 2100 0.02 LYS 2271 -0.11 PHE 573
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GLY 2100 0.02 ILE 2290 -0.11 PHE 573
ARG 981 0.02 LEU 2291 -0.12 PHE 573
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ARG 981 0.03 ILE 2293 -0.13 PHE 573
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ARG 981 0.02 VAL 2296 -0.12 PHE 573
LYS 825 0.02 SER 2297 -0.12 PHE 573
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ARG 981 0.02 LEU 2300 -0.11 PHE 573
ARG 981 0.02 MET 2301 -0.11 PHE 573
ARG 981 0.02 CYS 2302 -0.10 PHE 573
ARG 981 0.03 LEU 2303 -0.11 GLN 689
ARG 981 0.04 SER 2304 -0.12 GLN 689
ARG 981 0.05 GLU 2305 -0.13 GLN 689
LYS 825 0.06 SER 2306 -0.14 GLN 689
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ARG 981 0.09 SER 2309 -0.16 LYS 831
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ARG 981 0.07 ARG 2312 -0.16 GLU 685
ARG 981 0.06 ASN 2313 -0.15 LYS 687
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ARG 830 0.05 SER 2345 -0.21 GLU 853
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THR 826 0.03 ASP 2351 -0.14 PHE 573
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ASN 828 0.05 TYR 2364 -0.15 ARG 845
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ARG 830 0.05 GLU 2374 -0.17 LYS 849
ARG 830 0.06 VAL 2375 -0.20 ARG 845
ASN 828 0.06 TRP 2376 -0.19 ARG 845
ASN 828 0.07 ASP 2377 -0.21 GLN 689
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ARG 830 0.07 THR 2380 -0.27 GLN 689
THR 826 0.06 GLU 2381 -0.22 GLN 690
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ARG 830 0.07 LEU 2383 -0.21 LYS 849
ARG 830 0.08 CYS 2384 -0.27 ARG 845
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ARG 830 0.06 LEU 2386 -0.22 LYS 849
ARG 830 0.06 ILE 2387 -0.19 VAL 852
ARG 830 0.05 ASP 2388 -0.18 VAL 852
ARG 830 0.04 CYS 2389 -0.14 VAL 852
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LYS 825 0.04 GLN 2420 -0.09 ARG 841
LYS 825 0.06 LYS 2421 -0.09 ARG 841
LYS 825 0.07 ASN 2422 -0.11 SER 837
ASN 828 0.05 THR 2423 -0.10 ARG 841
ASN 828 0.04 ALA 2424 -0.10 ARG 841
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SER 1743 0.02 GLY 2431 -0.07 GLU 853
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ARG 830 0.04 LEU 2437 -0.10 MET 848
ARG 830 0.05 ASP 2438 -0.09 ILE 844
ARG 830 0.06 LEU 2439 -0.14 ARG 841
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ARG 830 0.05 ARG 2443 -0.12 MET 848
ARG 830 0.04 LEU 2444 -0.09 VAL 852
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GLY 2100 0.08 GLY 2464 -0.06 ARG 981
GLY 2100 0.07 SER 2465 -0.07 ARG 981
ALA 2102 0.07 LEU 2466 -0.05 ARG 841
ALA 2102 0.05 LYS 2467 -0.06 ASN 834
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LEU 1727 0.03 TYR 2475 -0.06 PHE 573
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CYS 2139 0.02 ASP 2497 -0.06 VAL 852
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GLN 2420 0.02 ASN 2499 -0.05 VAL 852
GLU 1745 0.01 LEU 2500 -0.06 VAL 852
LYS 825 0.02 PRO 2501 -0.06 MET 848
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GLU 1745 0.02 GLU 2503 -0.05 VAL 852
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ASN 828 0.02 GLN 2505 -0.05 VAL 852
ARG 1771 0.02 ASN 2506 -0.04 VAL 852
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ARG 1771 0.02 LYS 2509 -0.03 VAL 852
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HIS 668 0.03 LEU 2517 -0.02 ARG 2442
ARG 1771 0.03 ALA 2518 -0.02 ARG 2442
ARG 1771 0.03 GLU 2519 -0.02 CYS 2384
HIS 668 0.04 LYS 2520 -0.02 CYS 2384
HIS 668 0.03 MET 2521 -0.02 GLY 807
ARG 1771 0.03 ARG 2522 -0.02 GLN 1591
HIS 668 0.04 ARG 2523 -0.02 ASN 1644
PRO 1865 0.05 THR 2524 -0.02 CYS 809
ARG 1771 0.04 SER 2525 -0.02 ALA 991
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GLY 624 0.05 GLU 2527 -0.02 ALA 1726

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