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***  LRRK2_7LI4_G2019S  ***

CA distance fluctuations for 2605161002373039660

---  normal mode 8  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
LYS 1003 0.03 GLY 558 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.03 ILE 559 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 GLN 560 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 LYS 561 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 CYS 562 -0.09 SER 1743
LYS 2379 0.03 GLY 563 -0.09 SER 1743
LYS 2379 0.03 LEU 564 -0.09 SER 1743
LYS 2379 0.03 LYS 565 -0.09 LYS 1620
LYS 2379 0.03 VAL 566 -0.09 LYS 1620
THR 2380 0.03 ILE 567 -0.10 LYS 1620
THR 2380 0.03 SER 568 -0.09 LYS 1620
THR 2380 0.04 SER 569 -0.09 LYS 1620
THR 2380 0.03 ILE 570 -0.10 LYS 1620
THR 2380 0.03 VAL 571 -0.10 LYS 1620
THR 2380 0.04 HIS 572 -0.10 LYS 1620
THR 2380 0.04 PHE 573 -0.10 LYS 1620
THR 2380 0.03 PRO 574 -0.11 LYS 1620
THR 2380 0.03 ASP 575 -0.11 LYS 1620
THR 2380 0.03 ALA 576 -0.11 LYS 1620
THR 2380 0.03 LEU 577 -0.12 LYS 1620
THR 2380 0.02 GLY 584 -0.12 SER 1743
THR 2380 0.03 ALA 585 -0.11 SER 1743
THR 2380 0.03 MET 586 -0.11 SER 1743
THR 2380 0.02 ASP 587 -0.12 SER 1743
THR 2380 0.02 SER 588 -0.11 SER 1743
THR 2380 0.03 VAL 589 -0.10 SER 1743
THR 2380 0.03 LEU 590 -0.11 SER 1743
LYS 2379 0.02 HIS 591 -0.11 SER 1743
LYS 2379 0.03 THR 592 -0.10 SER 1743
CYS 1005 0.03 LEU 593 -0.10 SER 1743
CYS 1005 0.03 GLN 594 -0.10 SER 1743
CYS 1005 0.03 MET 595 -0.10 SER 1743
CYS 1005 0.03 TYR 596 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 PRO 597 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.04 ASP 598 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 ASP 599 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 GLN 600 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 GLU 601 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 ILE 602 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.03 GLN 603 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.03 CYS 604 -0.08 SER 1743
LYS 2379 0.03 LEU 605 -0.08 SER 1743
LYS 2379 0.03 GLY 606 -0.09 SER 1743
THR 2380 0.03 LEU 607 -0.09 SER 1743
THR 2380 0.03 SER 608 -0.09 SER 1743
THR 2380 0.03 LEU 609 -0.10 SER 1743
THR 2380 0.03 ILE 610 -0.10 SER 1743
THR 2380 0.03 GLY 611 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.03 TYR 612 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 GLY 624 -0.13 SER 1743
THR 2380 0.02 HIS 625 -0.12 SER 1743
THR 2380 0.02 LEU 626 -0.12 SER 1743
THR 2380 0.02 LEU 627 -0.11 SER 1743
THR 2380 0.02 ALA 628 -0.11 SER 1743
THR 2380 0.02 LYS 629 -0.10 SER 1743
THR 2380 0.03 ILE 630 -0.10 SER 1743
THR 2380 0.03 LEU 631 -0.09 SER 1743
THR 2380 0.03 VAL 632 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 SER 633 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 SER 634 -0.09 SER 1743
CYS 1005 0.03 LEU 635 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 TYR 636 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 ARG 637 -0.08 SER 1743
CYS 1005 0.04 PHE 638 -0.07 SER 1743
CYS 1005 0.04 LYS 639 -0.07 SER 1743
CYS 1005 0.05 ASP 640 -0.06 SER 1743
CYS 1005 0.04 VAL 641 -0.07 SER 1743
ARG 830 0.04 ALA 642 -0.07 SER 1743
LYS 2379 0.04 GLU 643 -0.07 SER 1743
LYS 2379 0.04 ILE 644 -0.08 SER 1743
LYS 2379 0.04 GLN 645 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.04 THR 646 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.04 LYS 647 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.03 GLY 648 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.04 PHE 649 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.04 GLN 650 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.03 THR 651 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.03 ILE 652 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.03 LEU 653 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.03 ALA 654 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.03 ILE 655 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.03 LEU 656 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.02 LYS 657 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.02 LEU 658 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.02 SER 659 -0.12 LEU 1727
THR 2380 0.02 ALA 660 -0.12 LEU 1727
THR 2380 0.02 SER 661 -0.13 LEU 1727
THR 2380 0.02 PHE 662 -0.12 LEU 1727
THR 2380 0.02 SER 663 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.02 LYS 664 -0.12 LEU 1727
THR 2380 0.02 LEU 665 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.02 LEU 666 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 VAL 667 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 HIS 668 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.02 HIS 669 -0.10 SER 1743
CYS 1005 0.02 SER 670 -0.09 SER 1743
THR 2380 0.02 PHE 671 -0.09 LEU 1727
CYS 1005 0.02 ASP 672 -0.08 LEU 1727
CYS 1005 0.03 LEU 673 -0.07 LEU 1727
CYS 1005 0.03 VAL 674 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.03 ILE 675 -0.08 LEU 1727
CYS 1005 0.03 PHE 676 -0.07 LEU 1727
CYS 1005 0.04 HIS 677 -0.06 LEU 1727
CYS 1005 0.04 GLN 678 -0.07 LEU 1727
LYS 2379 0.04 MET 679 -0.06 LEU 1727
CYS 1005 0.04 SER 680 -0.06 LEU 1727
CYS 1005 0.05 SER 681 -0.06 LEU 1727
ARG 830 0.06 ASN 682 -0.05 LEU 1727
ARG 830 0.06 ILE 683 -0.06 LEU 1727
ARG 830 0.07 MET 684 -0.05 LEU 1727
ARG 830 0.08 GLU 685 -0.05 LEU 1727
ARG 830 0.06 GLN 686 -0.05 LEU 1727
LYS 2379 0.07 LYS 687 -0.05 LEU 1727
THR 2380 0.06 ASP 688 -0.06 LEU 1727
THR 2380 0.07 GLN 689 -0.06 LEU 1727
THR 2380 0.06 GLN 690 -0.06 LEU 1727
THR 2380 0.05 PHE 691 -0.07 LEU 1727
THR 2380 0.05 LEU 692 -0.07 LEU 1727
THR 2380 0.05 ASN 693 -0.07 LEU 1727
THR 2380 0.04 LEU 694 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.04 CYS 695 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.04 CYS 696 -0.07 LEU 1727
THR 2380 0.03 LYS 697 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.03 CYS 698 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.03 PHE 699 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.03 ALA 700 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.02 LYS 701 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 VAL 702 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 ALA 703 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.02 MET 704 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 ASP 705 -0.11 LEU 1727
THR 2380 0.01 ASP 706 -0.11 ALA 1726
THR 2380 0.01 TYR 707 -0.11 ALA 1726
THR 2380 0.02 LEU 708 -0.10 LEU 1727
THR 2380 0.02 LYS 709 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.01 ASN 710 -0.09 ALA 1726
THR 2380 0.02 VAL 711 -0.09 LEU 1727
THR 2380 0.02 MET 712 -0.08 LEU 1727
THR 2380 0.02 LEU 713 -0.07 LEU 1727
THR 2380 0.02 GLU 714 -0.07 LEU 1727
CYS 1005 0.02 ARG 715 -0.07 LEU 1727
CYS 1005 0.02 ALA 716 -0.07 LEU 1727
CYS 1005 0.02 CYS 717 -0.06 LEU 1727
CYS 1005 0.02 ASP 718 -0.06 LEU 1727
CYS 1005 0.03 GLN 719 -0.06 LEU 1727
SER 754 0.03 ASN 720 -0.05 LEU 1727
CYS 1005 0.03 ASN 721 -0.05 LEU 1727
CYS 1005 0.03 SER 722 -0.05 LEU 1727
CYS 1005 0.03 ILE 723 -0.05 LEU 1727
CYS 1005 0.03 MET 724 -0.06 LEU 1727
CYS 1005 0.02 VAL 725 -0.06 LEU 1727
SER 2440 0.02 GLU 726 -0.05 LEU 1727
CYS 2384 0.02 CYS 727 -0.06 LEU 1727
CYS 2384 0.02 LEU 728 -0.07 LEU 1727
THR 2441 0.02 LEU 729 -0.06 ALA 1726
THR 2441 0.02 LEU 730 -0.06 ALA 1726
CYS 2384 0.02 LEU 731 -0.07 ALA 1726
CYS 2384 0.01 GLY 732 -0.07 ALA 1726
CYS 2384 0.01 ALA 733 -0.08 ALA 1726
THR 2441 0.02 ASP 734 -0.07 GLU 2516
THR 2441 0.02 ALA 735 -0.06 ALA 1726
THR 2441 0.02 ASN 736 -0.07 LYS 2520
THR 2441 0.01 GLN 737 -0.09 LYS 2520
THR 2441 0.01 ALA 738 -0.08 LEU 1720
THR 2441 0.01 LYS 739 -0.08 GLU 2527
THR 2441 0.01 GLU 740 -0.08 ASN 1867
LYS 2509 0.01 GLY 741 -0.08 ASN 1867
ASN 2422 0.01 SER 742 -0.07 ASN 1867
THR 2441 0.01 SER 743 -0.06 LEU 1720
THR 2441 0.02 LEU 744 -0.06 LEU 1720
ASN 2422 0.02 ILE 745 -0.05 LEU 1720
ASN 2422 0.01 CYS 746 -0.05 LEU 1720
THR 2361 0.01 GLN 747 -0.05 LEU 1720
THR 2361 0.02 VAL 748 -0.05 LEU 1727
THR 2310 0.02 CYS 749 -0.04 LEU 1727
THR 2310 0.01 GLU 750 -0.04 LEU 1720
ASP 718 0.02 LYS 751 -0.04 LEU 1727
CYS 1005 0.02 GLU 752 -0.04 LEU 1727
ASN 720 0.03 SER 753 -0.04 LEU 1727
ASN 720 0.03 SER 754 -0.04 LEU 1727
CYS 1005 0.03 PRO 755 -0.04 LEU 1727
CYS 1005 0.03 LYS 756 -0.04 LEU 1727
CYS 1005 0.02 LEU 757 -0.04 LEU 1727
ASN 2422 0.02 VAL 758 -0.04 ALA 1726
ASN 2422 0.03 GLU 759 -0.04 ALA 1726
SER 2440 0.02 LEU 760 -0.04 ALA 1726
THR 2441 0.02 LEU 761 -0.05 ALA 1726
ASN 2422 0.02 LEU 762 -0.04 ALA 1726
THR 2423 0.03 ASN 763 -0.04 ALA 1726
THR 2441 0.02 SER 764 -0.05 ALA 1726
THR 2441 0.02 GLY 765 -0.05 ALA 1726
THR 2423 0.02 SER 766 -0.05 ALA 1726
LYS 2509 0.02 ARG 767 -0.05 LEU 1720
LYS 2509 0.02 GLU 768 -0.04 LEU 1720
LYS 2509 0.02 GLN 769 -0.04 LEU 1720
ASN 2422 0.01 ASP 770 -0.05 LEU 1720
ASN 2422 0.02 VAL 771 -0.04 LEU 1720
ASN 2422 0.02 ARG 772 -0.04 GLU 1901
ASN 2422 0.01 LYS 773 -0.05 GLU 1901
ASN 2422 0.02 ALA 774 -0.04 LEU 1720
THR 2310 0.02 LEU 775 -0.03 LEU 1720
THR 2310 0.02 THR 776 -0.04 GLY 1900
THR 2310 0.02 ILE 777 -0.03 GLY 1900
THR 2310 0.02 SER 778 -0.03 LEU 1720
THR 2310 0.02 ILE 779 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.02 GLY 780 -0.02 LEU 1720
ASP 640 0.02 LYS 781 -0.03 ALA 1726
ASP 640 0.03 GLY 782 -0.02 ALA 1726
ASP 640 0.03 ASP 783 -0.03 ALA 1726
SER 816 0.03 SER 784 -0.03 ALA 1726
ASP 640 0.03 GLN 785 -0.03 ALA 1726
ASP 640 0.02 ILE 786 -0.03 ALA 1726
ASP 640 0.02 ILE 787 -0.03 ALA 1726
ASN 682 0.03 SER 788 -0.03 ALA 1726
ASN 682 0.02 LEU 789 -0.03 ALA 1726
ASN 2422 0.02 LEU 790 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.02 LEU 791 -0.03 ALA 1726
ASN 2422 0.02 ARG 792 -0.03 ALA 1726
ASN 2422 0.02 ARG 793 -0.03 ALA 1726
ASN 2422 0.02 LEU 794 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.02 ALA 795 -0.03 ALA 1726
ASN 2308 0.03 LEU 796 -0.03 ALA 1726
LYS 2421 0.03 ASP 797 -0.02 ALA 1726
LYS 2421 0.04 VAL 798 -0.02 ALA 1726
LYS 2421 0.04 ALA 799 -0.02 ALA 1726
LYS 2467 0.04 ASN 800 -0.02 ALA 1726
SER 2309 0.04 ASN 801 -0.02 ALA 1726
SER 2309 0.03 SER 802 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.03 ILE 803 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.02 CYS 804 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.02 LEU 805 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.02 GLY 806 -0.02 TYR 707
THR 2310 0.02 GLY 807 -0.03 TYR 707
THR 2310 0.02 PHE 808 -0.03 ARG 772
THR 2310 0.02 CYS 809 -0.02 GLU 740
THR 2310 0.02 ILE 810 -0.02 THR 776
THR 2310 0.02 GLY 811 -0.02 THR 776
THR 2310 0.02 LYS 812 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.03 VAL 813 -0.02 ALA 1726
ASP 640 0.03 GLU 814 -0.02 ALA 1726
ASN 682 0.03 PRO 815 -0.02 ALA 1726
ASN 682 0.04 SER 816 -0.02 ALA 1726
ASN 682 0.03 TRP 817 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.03 LEU 818 -0.02 ALA 1726
ASN 682 0.04 GLY 819 -0.02 ALA 1726
ASN 682 0.04 PRO 820 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.04 LEU 821 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.04 PHE 822 -0.02 ALA 1726
THR 2310 0.05 PRO 823 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.06 ASP 824 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.07 LYS 825 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.07 THR 826 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.07 SER 827 -0.03 ALA 1726
THR 2310 0.09 ASN 828 -0.04 ALA 1726
THR 2310 0.08 LEU 829 -0.04 ALA 1726
GLU 685 0.08 ARG 830 -0.04 ALA 1726
LEU 829 0.07 LYS 831 -0.04 LEU 1727
MET 684 0.05 GLN 832 -0.04 LEU 1727
THR 2361 0.04 THR 833 -0.05 LEU 1727
THR 2361 0.05 ASN 834 -0.05 LEU 1727
THR 2361 0.04 ILE 835 -0.05 LEU 1727
THR 2361 0.03 ALA 836 -0.05 LEU 1727
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ARG 2163 0.04 ILE 1177 -0.02 SER 661
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ARG 2163 0.05 ARG 1199 -0.02 SER 661
ARG 2163 0.04 SER 1200 -0.03 SER 661
ARG 2163 0.04 LEU 1201 -0.03 SER 661
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LYS 2211 0.03 MET 1203 -0.03 GLY 624
LYS 2211 0.03 SER 1204 -0.03 GLY 624
GLU 2210 0.03 SER 1205 -0.03 GLY 624
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ARG 2163 0.04 LEU 1222 -0.03 SER 661
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CYS 1685 0.01 GLU 1686 -0.10 GLY 624
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ARG 2163 0.01 MET 1702 -0.08 LEU 577
ARG 2163 0.01 GLY 1703 -0.08 LEU 577
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SER 1913 0.01 ASN 1730 -0.12 GLY 624
SER 1913 0.01 ARG 1731 -0.12 GLY 624
SER 1913 0.01 MET 1732 -0.11 GLY 624
SER 1913 0.01 TYR 1733 -0.10 GLY 624
LYS 1910 0.01 TRP 1734 -0.10 LEU 577
LYS 1910 0.01 ARG 1735 -0.10 LEU 577
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SER 1913 0.01 ILE 1738 -0.10 GLY 624
SER 1913 0.01 TYR 1739 -0.11 GLY 624
SER 1913 0.01 LEU 1740 -0.11 GLY 624
SER 1913 0.01 ASN 1741 -0.12 GLY 624
ARG 1915 0.01 TRP 1742 -0.13 GLY 624
ARG 1915 0.01 SER 1743 -0.13 GLY 624
SER 1913 0.01 PRO 1744 -0.13 GLY 624
ARG 2026 0.01 GLU 1745 -0.12 GLY 624
ARG 1915 0.01 ALA 1746 -0.12 GLY 624
SER 1913 0.01 TYR 1747 -0.11 GLY 624
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ARG 2026 0.01 CYS 1770 -0.11 GLY 624
CYS 2025 0.01 ARG 1771 -0.10 GLY 624
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ARG 1915 0.01 ILE 1775 -0.10 GLY 624
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