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***  LRRK2_7LI4_G2019S  ***

LOGs for ID: 2605161002373039660

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605161002373039660.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605161002373039660.atom to be opened. Openam> File opened: 2605161002373039660.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1795 First residue number = 558 Last residue number = 2527 Number of atoms found = 14112 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 174.474280 +/- 20.806091 From: 128.501000 To: 235.962000 = 221.157324 +/- 20.817454 From: 170.335000 To: 275.584000 = 198.401945 +/- 32.657494 From: 122.728000 To: 257.408000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.5710 % Filled. Pdbmat> 5116998 non-zero elements. Pdbmat> 559224 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.26 +/- 21.17 Maximum number = 126 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 1.118448E+07 Pdbmat> Larger element = 480.769 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1795 non-zero elements, NRBL set to 9 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605161002373039660.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 9 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605161002373039660.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605161002373039660.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 14112 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 9 residue(s) per block. Blocpdb> 1795 residues. Blocpdb> 64 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 68 atoms in block 2 Block first atom: 65 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 133 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 146 Blocpdb> 65 atoms in block 5 Block first atom: 206 Blocpdb> 61 atoms in block 6 Block first atom: 271 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 332 Blocpdb> 63 atoms in block 8 Block first atom: 348 Blocpdb> 75 atoms in block 9 Block first atom: 411 Blocpdb> 67 atoms in block 10 Block first atom: 486 Blocpdb> 67 atoms in block 11 Block first atom: 553 Blocpdb> 70 atoms in block 12 Block first atom: 620 Blocpdb> 79 atoms in block 13 Block first atom: 690 Blocpdb> 71 atoms in block 14 Block first atom: 769 Blocpdb> 76 atoms in block 15 Block first atom: 840 Blocpdb> 62 atoms in block 16 Block first atom: 916 Blocpdb> 70 atoms in block 17 Block first atom: 978 Blocpdb> 66 atoms in block 18 Block first atom: 1048 Blocpdb> 70 atoms in block 19 Block first atom: 1114 Blocpdb> 58 atoms in block 20 Block first atom: 1184 Blocpdb> 60 atoms in block 21 Block first atom: 1242 Blocpdb> 70 atoms in block 22 Block first atom: 1302 Blocpdb> 68 atoms in block 23 Block first atom: 1372 Blocpdb> 73 atoms in block 24 Block first atom: 1440 Blocpdb> 62 atoms in block 25 Block first atom: 1513 Blocpdb> 76 atoms in block 26 Block first atom: 1575 Blocpdb> 60 atoms in block 27 Block first atom: 1651 Blocpdb> 60 atoms in block 28 Block first atom: 1711 Blocpdb> 70 atoms in block 29 Block first atom: 1771 Blocpdb> 75 atoms in block 30 Block first atom: 1841 Blocpdb> 67 atoms in block 31 Block first atom: 1916 Blocpdb> 79 atoms in block 32 Block first atom: 1983 Blocpdb> 45 atoms in block 33 Block first atom: 2062 Blocpdb> 77 atoms in block 34 Block first atom: 2107 Blocpdb> 71 atoms in block 35 Block first atom: 2184 Blocpdb> 63 atoms in block 36 Block first atom: 2255 Blocpdb> 78 atoms in block 37 Block first atom: 2318 Blocpdb> 70 atoms in block 38 Block first atom: 2396 Blocpdb> 74 atoms in block 39 Block first atom: 2466 Blocpdb> 74 atoms in block 40 Block first atom: 2540 Blocpdb> 71 atoms in block 41 Block first atom: 2614 Blocpdb> 70 atoms in block 42 Block first atom: 2685 Blocpdb> 72 atoms in block 43 Block first atom: 2755 Blocpdb> 61 atoms in block 44 Block first atom: 2827 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 2888 Blocpdb> 76 atoms in block 46 Block first atom: 2961 Blocpdb> 68 atoms in block 47 Block first atom: 3037 Blocpdb> 77 atoms in block 48 Block first atom: 3105 Blocpdb> 59 atoms in block 49 Block first atom: 3182 Blocpdb> 77 atoms in block 50 Block first atom: 3241 Blocpdb> 71 atoms in block 51 Block first atom: 3318 Blocpdb> 66 atoms in block 52 Block first atom: 3389 Blocpdb> 66 atoms in block 53 Block first atom: 3455 Blocpdb> 71 atoms in block 54 Block first atom: 3521 Blocpdb> 70 atoms in block 55 Block first atom: 3592 Blocpdb> 72 atoms in block 56 Block first atom: 3662 Blocpdb> 68 atoms in block 57 Block first atom: 3734 Blocpdb> 71 atoms in block 58 Block first atom: 3802 Blocpdb> 71 atoms in block 59 Block first atom: 3873 Blocpdb> 79 atoms in block 60 Block first atom: 3944 Blocpdb> 77 atoms in block 61 Block first atom: 4023 Blocpdb> 63 atoms in block 62 Block first atom: 4100 Blocpdb> 84 atoms in block 63 Block first atom: 4163 Blocpdb> 77 atoms in block 64 Block first atom: 4247 Blocpdb> 66 atoms in block 65 Block first atom: 4324 Blocpdb> 70 atoms in block 66 Block first atom: 4390 Blocpdb> 76 atoms in block 67 Block first atom: 4460 Blocpdb> 75 atoms in block 68 Block first atom: 4536 Blocpdb> 74 atoms in block 69 Block first atom: 4611 Blocpdb> 72 atoms in block 70 Block first atom: 4685 Blocpdb> 77 atoms in block 71 Block first atom: 4757 Blocpdb> 74 atoms in block 72 Block first atom: 4834 Blocpdb> 79 atoms in block 73 Block first atom: 4908 Blocpdb> 56 atoms in block 74 Block first atom: 4987 Blocpdb> 75 atoms in block 75 Block first atom: 5043 Blocpdb> 63 atoms in block 76 Block first atom: 5118 Blocpdb> 72 atoms in block 77 Block first atom: 5181 Blocpdb> 80 atoms in block 78 Block first atom: 5253 Blocpdb> 76 atoms in block 79 Block first atom: 5333 Blocpdb> 74 atoms in block 80 Block first atom: 5409 Blocpdb> 80 atoms in block 81 Block first atom: 5483 Blocpdb> 73 atoms in block 82 Block first atom: 5563 Blocpdb> 62 atoms in block 83 Block first atom: 5636 Blocpdb> 82 atoms in block 84 Block first atom: 5698 Blocpdb> 61 atoms in block 85 Block first atom: 5780 Blocpdb> 65 atoms in block 86 Block first atom: 5841 Blocpdb> 52 atoms in block 87 Block first atom: 5906 Blocpdb> 68 atoms in block 88 Block first atom: 5958 Blocpdb> 80 atoms in block 89 Block first atom: 6026 Blocpdb> 62 atoms in block 90 Block first atom: 6106 Blocpdb> 77 atoms in block 91 Block first atom: 6168 Blocpdb> 75 atoms in block 92 Block first atom: 6245 Blocpdb> 66 atoms in block 93 Block first atom: 6320 Blocpdb> 76 atoms in block 94 Block first atom: 6386 Blocpdb> 73 atoms in block 95 Block first atom: 6462 Blocpdb> 74 atoms in block 96 Block first atom: 6535 Blocpdb> 77 atoms in block 97 Block first atom: 6609 Blocpdb> 70 atoms in block 98 Block first atom: 6686 Blocpdb> 74 atoms in block 99 Block first atom: 6756 Blocpdb> 72 atoms in block 100 Block first atom: 6830 Blocpdb> 68 atoms in block 101 Block first atom: 6902 Blocpdb> 77 atoms in block 102 Block first atom: 6970 Blocpdb> 68 atoms in block 103 Block first atom: 7047 Blocpdb> 65 atoms in block 104 Block first atom: 7115 Blocpdb> 49 atoms in block 105 Block first atom: 7180 Blocpdb> 83 atoms in block 106 Block first atom: 7229 Blocpdb> 72 atoms in block 107 Block first atom: 7312 Blocpdb> 66 atoms in block 108 Block first atom: 7384 Blocpdb> 73 atoms in block 109 Block first atom: 7450 Blocpdb> 71 atoms in block 110 Block first atom: 7523 Blocpdb> 78 atoms in block 111 Block first atom: 7594 Blocpdb> 85 atoms in block 112 Block first atom: 7672 Blocpdb> 66 atoms in block 113 Block first atom: 7757 Blocpdb> 84 atoms in block 114 Block first atom: 7823 Blocpdb> 80 atoms in block 115 Block first atom: 7907 Blocpdb> 64 atoms in block 116 Block first atom: 7987 Blocpdb> 69 atoms in block 117 Block first atom: 8051 Blocpdb> 69 atoms in block 118 Block first atom: 8120 Blocpdb> 67 atoms in block 119 Block first atom: 8189 Blocpdb> 70 atoms in block 120 Block first atom: 8256 Blocpdb> 79 atoms in block 121 Block first atom: 8326 Blocpdb> 63 atoms in block 122 Block first atom: 8405 Blocpdb> 79 atoms in block 123 Block first atom: 8468 Blocpdb> 57 atoms in block 124 Block first atom: 8547 Blocpdb> 74 atoms in block 125 Block first atom: 8604 Blocpdb> 66 atoms in block 126 Block first atom: 8678 Blocpdb> 72 atoms in block 127 Block first atom: 8744 Blocpdb> 67 atoms in block 128 Block first atom: 8816 Blocpdb> 71 atoms in block 129 Block first atom: 8883 Blocpdb> 78 atoms in block 130 Block first atom: 8954 Blocpdb> 69 atoms in block 131 Block first atom: 9032 Blocpdb> 66 atoms in block 132 Block first atom: 9101 Blocpdb> 67 atoms in block 133 Block first atom: 9167 Blocpdb> 76 atoms in block 134 Block first atom: 9234 Blocpdb> 78 atoms in block 135 Block first atom: 9310 Blocpdb> 73 atoms in block 136 Block first atom: 9388 Blocpdb> 63 atoms in block 137 Block first atom: 9461 Blocpdb> 71 atoms in block 138 Block first atom: 9524 Blocpdb> 68 atoms in block 139 Block first atom: 9595 Blocpdb> 72 atoms in block 140 Block first atom: 9663 Blocpdb> 76 atoms in block 141 Block first atom: 9735 Blocpdb> 73 atoms in block 142 Block first atom: 9811 Blocpdb> 74 atoms in block 143 Block first atom: 9884 Blocpdb> 75 atoms in block 144 Block first atom: 9958 Blocpdb> 66 atoms in block 145 Block first atom: 10033 Blocpdb> 70 atoms in block 146 Block first atom: 10099 Blocpdb> 43 atoms in block 147 Block first atom: 10169 Blocpdb> 62 atoms in block 148 Block first atom: 10212 Blocpdb> 63 atoms in block 149 Block first atom: 10274 Blocpdb> 78 atoms in block 150 Block first atom: 10337 Blocpdb> 73 atoms in block 151 Block first atom: 10415 Blocpdb> 65 atoms in block 152 Block first atom: 10488 Blocpdb> 75 atoms in block 153 Block first atom: 10553 Blocpdb> 71 atoms in block 154 Block first atom: 10628 Blocpdb> 67 atoms in block 155 Block first atom: 10699 Blocpdb> 77 atoms in block 156 Block first atom: 10766 Blocpdb> 74 atoms in block 157 Block first atom: 10843 Blocpdb> 72 atoms in block 158 Block first atom: 10917 Blocpdb> 67 atoms in block 159 Block first atom: 10989 Blocpdb> 74 atoms in block 160 Block first atom: 11056 Blocpdb> 69 atoms in block 161 Block first atom: 11130 Blocpdb> 70 atoms in block 162 Block first atom: 11199 Blocpdb> 67 atoms in block 163 Block first atom: 11269 Blocpdb> 73 atoms in block 164 Block first atom: 11336 Blocpdb> 70 atoms in block 165 Block first atom: 11409 Blocpdb> 68 atoms in block 166 Block first atom: 11479 Blocpdb> 69 atoms in block 167 Block first atom: 11547 Blocpdb> 70 atoms in block 168 Block first atom: 11616 Blocpdb> 65 atoms in block 169 Block first atom: 11686 Blocpdb> 74 atoms in block 170 Block first atom: 11751 Blocpdb> 69 atoms in block 171 Block first atom: 11825 Blocpdb> 72 atoms in block 172 Block first atom: 11894 Blocpdb> 77 atoms in block 173 Block first atom: 11966 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 12043 Blocpdb> 76 atoms in block 175 Block first atom: 12100 Blocpdb> 63 atoms in block 176 Block first atom: 12176 Blocpdb> 63 atoms in block 177 Block first atom: 12239 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 12302 Blocpdb> 72 atoms in block 179 Block first atom: 12366 Blocpdb> 68 atoms in block 180 Block first atom: 12438 Blocpdb> 76 atoms in block 181 Block first atom: 12506 Blocpdb> 74 atoms in block 182 Block first atom: 12582 Blocpdb> 69 atoms in block 183 Block first atom: 12656 Blocpdb> 64 atoms in block 184 Block first atom: 12725 Blocpdb> 71 atoms in block 185 Block first atom: 12789 Blocpdb> 79 atoms in block 186 Block first atom: 12860 Blocpdb> 64 atoms in block 187 Block first atom: 12939 Blocpdb> 79 atoms in block 188 Block first atom: 13003 Blocpdb> 77 atoms in block 189 Block first atom: 13082 Blocpdb> 70 atoms in block 190 Block first atom: 13159 Blocpdb> 74 atoms in block 191 Block first atom: 13229 Blocpdb> 57 atoms in block 192 Block first atom: 13303 Blocpdb> 75 atoms in block 193 Block first atom: 13360 Blocpdb> 79 atoms in block 194 Block first atom: 13435 Blocpdb> 68 atoms in block 195 Block first atom: 13514 Blocpdb> 66 atoms in block 196 Block first atom: 13582 Blocpdb> 74 atoms in block 197 Block first atom: 13648 Blocpdb> 73 atoms in block 198 Block first atom: 13722 Blocpdb> 73 atoms in block 199 Block first atom: 13795 Blocpdb> 74 atoms in block 200 Block first atom: 13868 Blocpdb> 81 atoms in block 201 Block first atom: 13942 Blocpdb> 74 atoms in block 202 Block first atom: 14023 Blocpdb> 16 atoms in block 203 Block first atom: 14096 Blocpdb> 203 blocks. Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5117201 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 42336 Prepmat> Matrix trace = 11184480.0000 Prepmat> Last element read: 42336 42336 130.4897 Prepmat> 20707 lines saved. Prepmat> 19204 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14112 RTB> Total mass = 14112.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 14112 RTB> Number of blocks = 203 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 188675.7529 RTB> 51027 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1218 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51027 Diagstd> Projected matrix trace = 188675.7529 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1218 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 188675.7529 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1057739 0.1495821 0.2535843 0.2794461 0.3683974 0.5182423 0.7754668 0.8195717 1.1904384 1.3747568 1.5911719 1.7415389 1.8039627 2.1079875 2.3229618 2.4640670 2.7363737 2.9684494 3.0553936 3.2445381 3.4848881 3.7060932 3.9138251 4.0963728 4.2329518 4.5719683 4.7907410 4.9225773 5.2147353 5.3960235 5.5346279 5.6044624 5.8405784 6.2619071 6.3219765 6.4929106 6.7413741 6.8878568 7.1761584 7.3305025 7.7078418 7.9704220 8.0540861 8.1298666 8.4377301 8.6917962 8.8968137 9.1510834 9.4030343 9.6055041 9.7414406 9.9798312 10.5985852 11.0967288 11.3143341 11.3398451 11.5823230 11.7667982 11.9305235 12.2021088 12.3801896 12.6366085 12.7685473 13.0427710 13.2717905 13.9301044 14.1635077 14.1950291 14.7032207 14.9143552 15.5004777 15.6921975 15.9240024 16.4042577 16.7024425 16.7983988 16.8826943 17.1410552 17.2623089 17.5994045 17.7953393 18.0332311 18.4346691 18.5638903 18.6906112 18.9669698 19.3631031 19.5396977 19.8512110 20.2063464 20.2947677 20.5222767 20.7361112 20.8687866 21.3395989 21.7528431 22.0563208 22.3654000 22.6445684 22.7479284 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034332 0.0034334 0.0034340 0.0034343 0.0034353 35.3170652 41.9986336 54.6835200 57.4042863 65.9103405 78.1738908 95.6262001 98.3079755 118.4810109 127.3233967 136.9789487 143.3051728 145.8508824 157.6628206 165.5069813 170.4596285 179.6317032 187.0941054 189.8142711 195.6012915 202.7167802 209.0515783 214.8305250 219.7834661 223.4173732 232.1918036 237.6821827 240.9303739 247.9770071 252.2505944 255.4697560 257.0764291 262.4358792 271.7368825 273.0371362 276.7037154 281.9483084 284.9950617 290.8983710 294.0100350 301.4822011 306.5744355 308.1792636 309.6256925 315.4337036 320.1474510 323.9011790 328.4970984 332.9885421 336.5544684 338.9275507 343.0495692 353.5242653 361.7368619 365.2664467 365.6780069 369.5669412 372.4984190 375.0809702 379.3261004 382.0840671 386.0206568 388.0306448 392.1752789 395.6034213 405.2961388 408.6774653 409.1319770 416.3911774 419.3701558 427.5312080 430.1670712 433.3326345 439.8185792 443.7979305 445.0709244 446.1862259 449.5873225 451.1746838 455.5586175 458.0874740 461.1392139 466.2436747 467.8749321 469.4691211 472.9271610 477.8402827 480.0143280 483.8255322 488.1341338 489.2009852 491.9353700 494.4916213 496.0710453 501.6356654 506.4694960 509.9901814 513.5510425 516.7462152 517.9242032 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14112 Rtb_to_modes> Number of blocs = 203 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1496 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.323 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.968 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.485 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.706 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.233 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.572 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.791 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.841 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.322 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.888 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.331 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.054 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.692 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.897 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.151 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.980 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 254016 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605161002373039660.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605161002373039660.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605161002373039660.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605161002373039660.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1795 First residue number = 558 Last residue number = 2527 Number of atoms found = 14112 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1496 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.323 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.968 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.485 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.706 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.233 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.791 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.841 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.322 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.888 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.331 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.054 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.692 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.897 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.151 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.980 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75 Bfactors> 106 vectors, 42336 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.105800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.555 for 1795 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.049 +/- 0.06 Bfactors> = 46.411 +/- 23.93 Bfactors> Shiftng-fct= 46.362 Bfactors> Scaling-fct= 417.529 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605161002373039660.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605161002373039660.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 14112 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7131 0.0034 0.7146 0.0034 0.7965 0.0034 0.8603 0.0034 0.9019 0.0034 0.8336 35.3199 0.5307 41.9993 0.4012 54.6829 0.5023 57.3971 0.3565 65.9077 0.4360 78.1673 0.6725 95.6241 0.2545 98.3055 0.6459 118.4541 0.5960 127.3292 0.6319 136.9657 0.2847 143.3180 0.5381 145.8461 0.6743 157.6565 0.6640 165.5012 0.4476 170.4500 0.6453 179.6117 0.3669 187.0719 0.5148 189.7939 0.4889 195.6068 0.2573 202.7113 0.5344 209.0400 0.0843 214.8261 0.3586 219.7640 0.3318 223.4091 0.3694 232.1826 0.0974 237.6784 0.1995 240.9304 0.4982 247.9727 0.2790 252.2392 0.3484 255.4674 0.2891 257.0548 0.3192 262.4341 0.3534 271.7272 0.2265 273.0259 0.0625 276.6937 0.3075 281.9284 0.2050 284.9858 0.4316 290.8827 0.3845 294.0074 0.2493 301.4724 0.3079 306.5532 0.3376 308.1644 0.3808 309.6149 0.4317 315.4252 0.4831 320.1375 0.3928 323.8907 0.3119 328.4815 0.3282 332.9736 0.3784 336.5487 0.4417 338.9053 0.3674 343.0377 0.3684 353.5327 0.3558 361.7746 0.5145 365.1808 0.3779 365.6648 0.3355 369.5140 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605161002373039660.eigenfacs 2605161002373039660.atom making animated gifs 11 models are in 2605161002373039660.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605161002373039660.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605161002373039660.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making 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