***  LRRK2_7LI4_G2019S  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605161002373039660.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605161002373039660.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605161002373039660.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1795
First residue number = 558
Last residue number = 2527
Number of atoms found = 14112
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 174.474280 +/- 20.806091 From: 128.501000 To: 235.962000
= 221.157324 +/- 20.817454 From: 170.335000 To: 275.584000
= 198.401945 +/- 32.657494 From: 122.728000 To: 257.408000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.5710 % Filled.
Pdbmat> 5116998 non-zero elements.
Pdbmat> 559224 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.26 +/- 21.17
Maximum number = 126
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.118448E+07
Pdbmat> Larger element = 480.769
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1795 non-zero elements, NRBL set to 9
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605161002373039660.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 9
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605161002373039660.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605161002373039660.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 14112 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 9 residue(s) per block.
Blocpdb> 1795 residues.
Blocpdb> 64 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 68 atoms in block 2
Block first atom: 65
Blocpdb> 13 atoms in block 3
Block first atom: 133
Blocpdb> 60 atoms in block 4
Block first atom: 146
Blocpdb> 65 atoms in block 5
Block first atom: 206
Blocpdb> 61 atoms in block 6
Block first atom: 271
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 332
Blocpdb> 63 atoms in block 8
Block first atom: 348
Blocpdb> 75 atoms in block 9
Block first atom: 411
Blocpdb> 67 atoms in block 10
Block first atom: 486
Blocpdb> 67 atoms in block 11
Block first atom: 553
Blocpdb> 70 atoms in block 12
Block first atom: 620
Blocpdb> 79 atoms in block 13
Block first atom: 690
Blocpdb> 71 atoms in block 14
Block first atom: 769
Blocpdb> 76 atoms in block 15
Block first atom: 840
Blocpdb> 62 atoms in block 16
Block first atom: 916
Blocpdb> 70 atoms in block 17
Block first atom: 978
Blocpdb> 66 atoms in block 18
Block first atom: 1048
Blocpdb> 70 atoms in block 19
Block first atom: 1114
Blocpdb> 58 atoms in block 20
Block first atom: 1184
Blocpdb> 60 atoms in block 21
Block first atom: 1242
Blocpdb> 70 atoms in block 22
Block first atom: 1302
Blocpdb> 68 atoms in block 23
Block first atom: 1372
Blocpdb> 73 atoms in block 24
Block first atom: 1440
Blocpdb> 62 atoms in block 25
Block first atom: 1513
Blocpdb> 76 atoms in block 26
Block first atom: 1575
Blocpdb> 60 atoms in block 27
Block first atom: 1651
Blocpdb> 60 atoms in block 28
Block first atom: 1711
Blocpdb> 70 atoms in block 29
Block first atom: 1771
Blocpdb> 75 atoms in block 30
Block first atom: 1841
Blocpdb> 67 atoms in block 31
Block first atom: 1916
Blocpdb> 79 atoms in block 32
Block first atom: 1983
Blocpdb> 45 atoms in block 33
Block first atom: 2062
Blocpdb> 77 atoms in block 34
Block first atom: 2107
Blocpdb> 71 atoms in block 35
Block first atom: 2184
Blocpdb> 63 atoms in block 36
Block first atom: 2255
Blocpdb> 78 atoms in block 37
Block first atom: 2318
Blocpdb> 70 atoms in block 38
Block first atom: 2396
Blocpdb> 74 atoms in block 39
Block first atom: 2466
Blocpdb> 74 atoms in block 40
Block first atom: 2540
Blocpdb> 71 atoms in block 41
Block first atom: 2614
Blocpdb> 70 atoms in block 42
Block first atom: 2685
Blocpdb> 72 atoms in block 43
Block first atom: 2755
Blocpdb> 61 atoms in block 44
Block first atom: 2827
Blocpdb> 73 atoms in block 45
Block first atom: 2888
Blocpdb> 76 atoms in block 46
Block first atom: 2961
Blocpdb> 68 atoms in block 47
Block first atom: 3037
Blocpdb> 77 atoms in block 48
Block first atom: 3105
Blocpdb> 59 atoms in block 49
Block first atom: 3182
Blocpdb> 77 atoms in block 50
Block first atom: 3241
Blocpdb> 71 atoms in block 51
Block first atom: 3318
Blocpdb> 66 atoms in block 52
Block first atom: 3389
Blocpdb> 66 atoms in block 53
Block first atom: 3455
Blocpdb> 71 atoms in block 54
Block first atom: 3521
Blocpdb> 70 atoms in block 55
Block first atom: 3592
Blocpdb> 72 atoms in block 56
Block first atom: 3662
Blocpdb> 68 atoms in block 57
Block first atom: 3734
Blocpdb> 71 atoms in block 58
Block first atom: 3802
Blocpdb> 71 atoms in block 59
Block first atom: 3873
Blocpdb> 79 atoms in block 60
Block first atom: 3944
Blocpdb> 77 atoms in block 61
Block first atom: 4023
Blocpdb> 63 atoms in block 62
Block first atom: 4100
Blocpdb> 84 atoms in block 63
Block first atom: 4163
Blocpdb> 77 atoms in block 64
Block first atom: 4247
Blocpdb> 66 atoms in block 65
Block first atom: 4324
Blocpdb> 70 atoms in block 66
Block first atom: 4390
Blocpdb> 76 atoms in block 67
Block first atom: 4460
Blocpdb> 75 atoms in block 68
Block first atom: 4536
Blocpdb> 74 atoms in block 69
Block first atom: 4611
Blocpdb> 72 atoms in block 70
Block first atom: 4685
Blocpdb> 77 atoms in block 71
Block first atom: 4757
Blocpdb> 74 atoms in block 72
Block first atom: 4834
Blocpdb> 79 atoms in block 73
Block first atom: 4908
Blocpdb> 56 atoms in block 74
Block first atom: 4987
Blocpdb> 75 atoms in block 75
Block first atom: 5043
Blocpdb> 63 atoms in block 76
Block first atom: 5118
Blocpdb> 72 atoms in block 77
Block first atom: 5181
Blocpdb> 80 atoms in block 78
Block first atom: 5253
Blocpdb> 76 atoms in block 79
Block first atom: 5333
Blocpdb> 74 atoms in block 80
Block first atom: 5409
Blocpdb> 80 atoms in block 81
Block first atom: 5483
Blocpdb> 73 atoms in block 82
Block first atom: 5563
Blocpdb> 62 atoms in block 83
Block first atom: 5636
Blocpdb> 82 atoms in block 84
Block first atom: 5698
Blocpdb> 61 atoms in block 85
Block first atom: 5780
Blocpdb> 65 atoms in block 86
Block first atom: 5841
Blocpdb> 52 atoms in block 87
Block first atom: 5906
Blocpdb> 68 atoms in block 88
Block first atom: 5958
Blocpdb> 80 atoms in block 89
Block first atom: 6026
Blocpdb> 62 atoms in block 90
Block first atom: 6106
Blocpdb> 77 atoms in block 91
Block first atom: 6168
Blocpdb> 75 atoms in block 92
Block first atom: 6245
Blocpdb> 66 atoms in block 93
Block first atom: 6320
Blocpdb> 76 atoms in block 94
Block first atom: 6386
Blocpdb> 73 atoms in block 95
Block first atom: 6462
Blocpdb> 74 atoms in block 96
Block first atom: 6535
Blocpdb> 77 atoms in block 97
Block first atom: 6609
Blocpdb> 70 atoms in block 98
Block first atom: 6686
Blocpdb> 74 atoms in block 99
Block first atom: 6756
Blocpdb> 72 atoms in block 100
Block first atom: 6830
Blocpdb> 68 atoms in block 101
Block first atom: 6902
Blocpdb> 77 atoms in block 102
Block first atom: 6970
Blocpdb> 68 atoms in block 103
Block first atom: 7047
Blocpdb> 65 atoms in block 104
Block first atom: 7115
Blocpdb> 49 atoms in block 105
Block first atom: 7180
Blocpdb> 83 atoms in block 106
Block first atom: 7229
Blocpdb> 72 atoms in block 107
Block first atom: 7312
Blocpdb> 66 atoms in block 108
Block first atom: 7384
Blocpdb> 73 atoms in block 109
Block first atom: 7450
Blocpdb> 71 atoms in block 110
Block first atom: 7523
Blocpdb> 78 atoms in block 111
Block first atom: 7594
Blocpdb> 85 atoms in block 112
Block first atom: 7672
Blocpdb> 66 atoms in block 113
Block first atom: 7757
Blocpdb> 84 atoms in block 114
Block first atom: 7823
Blocpdb> 80 atoms in block 115
Block first atom: 7907
Blocpdb> 64 atoms in block 116
Block first atom: 7987
Blocpdb> 69 atoms in block 117
Block first atom: 8051
Blocpdb> 69 atoms in block 118
Block first atom: 8120
Blocpdb> 67 atoms in block 119
Block first atom: 8189
Blocpdb> 70 atoms in block 120
Block first atom: 8256
Blocpdb> 79 atoms in block 121
Block first atom: 8326
Blocpdb> 63 atoms in block 122
Block first atom: 8405
Blocpdb> 79 atoms in block 123
Block first atom: 8468
Blocpdb> 57 atoms in block 124
Block first atom: 8547
Blocpdb> 74 atoms in block 125
Block first atom: 8604
Blocpdb> 66 atoms in block 126
Block first atom: 8678
Blocpdb> 72 atoms in block 127
Block first atom: 8744
Blocpdb> 67 atoms in block 128
Block first atom: 8816
Blocpdb> 71 atoms in block 129
Block first atom: 8883
Blocpdb> 78 atoms in block 130
Block first atom: 8954
Blocpdb> 69 atoms in block 131
Block first atom: 9032
Blocpdb> 66 atoms in block 132
Block first atom: 9101
Blocpdb> 67 atoms in block 133
Block first atom: 9167
Blocpdb> 76 atoms in block 134
Block first atom: 9234
Blocpdb> 78 atoms in block 135
Block first atom: 9310
Blocpdb> 73 atoms in block 136
Block first atom: 9388
Blocpdb> 63 atoms in block 137
Block first atom: 9461
Blocpdb> 71 atoms in block 138
Block first atom: 9524
Blocpdb> 68 atoms in block 139
Block first atom: 9595
Blocpdb> 72 atoms in block 140
Block first atom: 9663
Blocpdb> 76 atoms in block 141
Block first atom: 9735
Blocpdb> 73 atoms in block 142
Block first atom: 9811
Blocpdb> 74 atoms in block 143
Block first atom: 9884
Blocpdb> 75 atoms in block 144
Block first atom: 9958
Blocpdb> 66 atoms in block 145
Block first atom: 10033
Blocpdb> 70 atoms in block 146
Block first atom: 10099
Blocpdb> 43 atoms in block 147
Block first atom: 10169
Blocpdb> 62 atoms in block 148
Block first atom: 10212
Blocpdb> 63 atoms in block 149
Block first atom: 10274
Blocpdb> 78 atoms in block 150
Block first atom: 10337
Blocpdb> 73 atoms in block 151
Block first atom: 10415
Blocpdb> 65 atoms in block 152
Block first atom: 10488
Blocpdb> 75 atoms in block 153
Block first atom: 10553
Blocpdb> 71 atoms in block 154
Block first atom: 10628
Blocpdb> 67 atoms in block 155
Block first atom: 10699
Blocpdb> 77 atoms in block 156
Block first atom: 10766
Blocpdb> 74 atoms in block 157
Block first atom: 10843
Blocpdb> 72 atoms in block 158
Block first atom: 10917
Blocpdb> 67 atoms in block 159
Block first atom: 10989
Blocpdb> 74 atoms in block 160
Block first atom: 11056
Blocpdb> 69 atoms in block 161
Block first atom: 11130
Blocpdb> 70 atoms in block 162
Block first atom: 11199
Blocpdb> 67 atoms in block 163
Block first atom: 11269
Blocpdb> 73 atoms in block 164
Block first atom: 11336
Blocpdb> 70 atoms in block 165
Block first atom: 11409
Blocpdb> 68 atoms in block 166
Block first atom: 11479
Blocpdb> 69 atoms in block 167
Block first atom: 11547
Blocpdb> 70 atoms in block 168
Block first atom: 11616
Blocpdb> 65 atoms in block 169
Block first atom: 11686
Blocpdb> 74 atoms in block 170
Block first atom: 11751
Blocpdb> 69 atoms in block 171
Block first atom: 11825
Blocpdb> 72 atoms in block 172
Block first atom: 11894
Blocpdb> 77 atoms in block 173
Block first atom: 11966
Blocpdb> 57 atoms in block 174
Block first atom: 12043
Blocpdb> 76 atoms in block 175
Block first atom: 12100
Blocpdb> 63 atoms in block 176
Block first atom: 12176
Blocpdb> 63 atoms in block 177
Block first atom: 12239
Blocpdb> 64 atoms in block 178
Block first atom: 12302
Blocpdb> 72 atoms in block 179
Block first atom: 12366
Blocpdb> 68 atoms in block 180
Block first atom: 12438
Blocpdb> 76 atoms in block 181
Block first atom: 12506
Blocpdb> 74 atoms in block 182
Block first atom: 12582
Blocpdb> 69 atoms in block 183
Block first atom: 12656
Blocpdb> 64 atoms in block 184
Block first atom: 12725
Blocpdb> 71 atoms in block 185
Block first atom: 12789
Blocpdb> 79 atoms in block 186
Block first atom: 12860
Blocpdb> 64 atoms in block 187
Block first atom: 12939
Blocpdb> 79 atoms in block 188
Block first atom: 13003
Blocpdb> 77 atoms in block 189
Block first atom: 13082
Blocpdb> 70 atoms in block 190
Block first atom: 13159
Blocpdb> 74 atoms in block 191
Block first atom: 13229
Blocpdb> 57 atoms in block 192
Block first atom: 13303
Blocpdb> 75 atoms in block 193
Block first atom: 13360
Blocpdb> 79 atoms in block 194
Block first atom: 13435
Blocpdb> 68 atoms in block 195
Block first atom: 13514
Blocpdb> 66 atoms in block 196
Block first atom: 13582
Blocpdb> 74 atoms in block 197
Block first atom: 13648
Blocpdb> 73 atoms in block 198
Block first atom: 13722
Blocpdb> 73 atoms in block 199
Block first atom: 13795
Blocpdb> 74 atoms in block 200
Block first atom: 13868
Blocpdb> 81 atoms in block 201
Block first atom: 13942
Blocpdb> 74 atoms in block 202
Block first atom: 14023
Blocpdb> 16 atoms in block 203
Block first atom: 14096
Blocpdb> 203 blocks.
Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5117201 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 42336
Prepmat> Matrix trace = 11184480.0000
Prepmat> Last element read: 42336 42336 130.4897
Prepmat> 20707 lines saved.
Prepmat> 19204 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14112
RTB> Total mass = 14112.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 14112
RTB> Number of blocks = 203
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 188675.7529
RTB> 51027 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1218
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51027
Diagstd> Projected matrix trace = 188675.7529
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1218 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 188675.7529
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1057739 0.1495821 0.2535843 0.2794461
0.3683974 0.5182423 0.7754668 0.8195717 1.1904384
1.3747568 1.5911719 1.7415389 1.8039627 2.1079875
2.3229618 2.4640670 2.7363737 2.9684494 3.0553936
3.2445381 3.4848881 3.7060932 3.9138251 4.0963728
4.2329518 4.5719683 4.7907410 4.9225773 5.2147353
5.3960235 5.5346279 5.6044624 5.8405784 6.2619071
6.3219765 6.4929106 6.7413741 6.8878568 7.1761584
7.3305025 7.7078418 7.9704220 8.0540861 8.1298666
8.4377301 8.6917962 8.8968137 9.1510834 9.4030343
9.6055041 9.7414406 9.9798312 10.5985852 11.0967288
11.3143341 11.3398451 11.5823230 11.7667982 11.9305235
12.2021088 12.3801896 12.6366085 12.7685473 13.0427710
13.2717905 13.9301044 14.1635077 14.1950291 14.7032207
14.9143552 15.5004777 15.6921975 15.9240024 16.4042577
16.7024425 16.7983988 16.8826943 17.1410552 17.2623089
17.5994045 17.7953393 18.0332311 18.4346691 18.5638903
18.6906112 18.9669698 19.3631031 19.5396977 19.8512110
20.2063464 20.2947677 20.5222767 20.7361112 20.8687866
21.3395989 21.7528431 22.0563208 22.3654000 22.6445684
22.7479284
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034332 0.0034334 0.0034340 0.0034343
0.0034353 35.3170652 41.9986336 54.6835200 57.4042863
65.9103405 78.1738908 95.6262001 98.3079755 118.4810109
127.3233967 136.9789487 143.3051728 145.8508824 157.6628206
165.5069813 170.4596285 179.6317032 187.0941054 189.8142711
195.6012915 202.7167802 209.0515783 214.8305250 219.7834661
223.4173732 232.1918036 237.6821827 240.9303739 247.9770071
252.2505944 255.4697560 257.0764291 262.4358792 271.7368825
273.0371362 276.7037154 281.9483084 284.9950617 290.8983710
294.0100350 301.4822011 306.5744355 308.1792636 309.6256925
315.4337036 320.1474510 323.9011790 328.4970984 332.9885421
336.5544684 338.9275507 343.0495692 353.5242653 361.7368619
365.2664467 365.6780069 369.5669412 372.4984190 375.0809702
379.3261004 382.0840671 386.0206568 388.0306448 392.1752789
395.6034213 405.2961388 408.6774653 409.1319770 416.3911774
419.3701558 427.5312080 430.1670712 433.3326345 439.8185792
443.7979305 445.0709244 446.1862259 449.5873225 451.1746838
455.5586175 458.0874740 461.1392139 466.2436747 467.8749321
469.4691211 472.9271610 477.8402827 480.0143280 483.8255322
488.1341338 489.2009852 491.9353700 494.4916213 496.0710453
501.6356654 506.4694960 509.9901814 513.5510425 516.7462152
517.9242032
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14112
Rtb_to_modes> Number of blocs = 203
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1058
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1496
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2536
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2794
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3684
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5182
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7755
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8196
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.190
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.375
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.742
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.804
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.323
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.736
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.968
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.055
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.245
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.485
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.706
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.914
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.096
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.233
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.572
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.791
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.923
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.215
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.396
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.535
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.604
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.841
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.262
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.322
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.493
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.741
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.888
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.176
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.331
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.708
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.970
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.054
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.130
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.438
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.692
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.897
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.151
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.403
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.606
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.741
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.980
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.75
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1218 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
1.00004 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001
1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997
1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 254016 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
1.00004 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001
1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004
1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997
1.00001 0.99997 0.99997 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605161002373039660.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605161002373039660.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605161002373039660.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605161002373039660.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1795
First residue number = 558
Last residue number = 2527
Number of atoms found = 14112
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1058
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1496
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2794
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3684
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5182
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7755
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8196
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.190
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.375
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.742
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.804
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.323
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.736
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.968
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.055
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.245
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.485
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.706
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.914
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.096
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.233
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.572
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.791
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.396
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.535
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.604
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.841
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.262
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.493
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.741
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.888
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.176
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.331
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.708
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.970
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.054
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.130
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.438
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.897
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.151
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.403
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.741
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.980
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.75
Bfactors> 106 vectors, 42336 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.105800
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.555 for 1795 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.049 +/- 0.06
Bfactors> = 46.411 +/- 23.93
Bfactors> Shiftng-fct= 46.362
Bfactors> Scaling-fct= 417.529
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605161002373039660.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605161002373039660.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.9
Chkmod> 106 vectors, 42336 coordinates in file.
Chkmod> That is: 14112 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7131
0.0034 0.7146
0.0034 0.7965
0.0034 0.8603
0.0034 0.9019
0.0034 0.8336
35.3199 0.5307
41.9993 0.4012
54.6829 0.5023
57.3971 0.3565
65.9077 0.4360
78.1673 0.6725
95.6241 0.2545
98.3055 0.6459
118.4541 0.5960
127.3292 0.6319
136.9657 0.2847
143.3180 0.5381
145.8461 0.6743
157.6565 0.6640
165.5012 0.4476
170.4500 0.6453
179.6117 0.3669
187.0719 0.5148
189.7939 0.4889
195.6068 0.2573
202.7113 0.5344
209.0400 0.0843
214.8261 0.3586
219.7640 0.3318
223.4091 0.3694
232.1826 0.0974
237.6784 0.1995
240.9304 0.4982
247.9727 0.2790
252.2392 0.3484
255.4674 0.2891
257.0548 0.3192
262.4341 0.3534
271.7272 0.2265
273.0259 0.0625
276.6937 0.3075
281.9284 0.2050
284.9858 0.4316
290.8827 0.3845
294.0074 0.2493
301.4724 0.3079
306.5532 0.3376
308.1644 0.3808
309.6149 0.4317
315.4252 0.4831
320.1375 0.3928
323.8907 0.3119
328.4815 0.3282
332.9736 0.3784
336.5487 0.4417
338.9053 0.3674
343.0377 0.3684
353.5327 0.3558
361.7746 0.5145
365.1808 0.3779
365.6648 0.3355
369.5140 0.0862
372.5331 0.4412
375.0566 0.1086
379.2770 0.3584
382.0647 0.3397
386.0559 0.1561
388.0361 0.3332
392.1168 0.3621
395.5598 0.4233
405.2772 0.2658
408.6093 0.5077
409.1860 0.4170
416.3277 0.4502
419.2909 0.4239
427.5063 0.4231
430.1185 0.3937
433.2596 0.4801
439.7426 0.3803
443.7464 0.3834
445.0730 0.2950
446.1315 0.0437
449.5542 0.2302
451.1251 0.0969
455.5468 0.3689
458.1278 0.4028
461.0781 0.3483
466.1646 0.2990
467.8058 0.1289
469.4413 0.2120
472.9446 0.2780
477.7815 0.3221
479.9974 0.2572
483.7900 0.2928
488.1573 0.1408
489.1225 0.4246
491.8870 0.4099
494.5168 0.3596
496.0642 0.3576
501.6188 0.4088
506.4147 0.5009
510.0108 0.2597
513.5818 0.4139
516.6719 0.5282
517.9256 0.3215
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605161002373039660 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
making animated gifs
11 models are in 2605161002373039660.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605161002373039660 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
making animated gifs
11 models are in 2605161002373039660.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605161002373039660 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
making animated gifs
11 models are in 2605161002373039660.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605161002373039660 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
making animated gifs
11 models are in 2605161002373039660.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605161002373039660 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605161002373039660.eigenfacs
2605161002373039660.atom
making animated gifs
11 models are in 2605161002373039660.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605161002373039660.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605161002373039660.10.pdb
2605161002373039660.11.pdb
2605161002373039660.7.pdb
2605161002373039660.8.pdb
2605161002373039660.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m50.604s
user 1m50.066s
sys 0m0.472s
rm: cannot remove '2605161002373039660.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|