*** HYDROLASE 28-NOV-12 4I5I ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605171950363324789.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605171950363324789.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605171950363324789.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 544
First residue number = 241
Last residue number = 512
Number of atoms found = 4238
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 26.605076 +/- 16.526832 From: -9.191000 To: 62.412000
= -15.428569 +/- 18.070491 From: -54.973000 To: 24.157000
= 22.618669 +/- 9.984446 From: -3.260000 To: 47.526000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.8787 % Filled.
Pdbmat> 1518539 non-zero elements.
Pdbmat> 165929 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.31 +/- 21.98
Maximum number = 123
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 3.318580E+06
Pdbmat> Larger element = 480.289
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
544 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605171950363324789.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605171950363324789.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605171950363324789.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4238 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 544 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 22 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 46
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 66
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 88
Blocpdb> 23 atoms in block 6
Block first atom: 109
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 132
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 151
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 167
Blocpdb> 18 atoms in block 10
Block first atom: 186
Blocpdb> 26 atoms in block 11
Block first atom: 204
Blocpdb> 28 atoms in block 12
Block first atom: 230
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 258
Blocpdb> 28 atoms in block 14
Block first atom: 278
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 306
Blocpdb> 26 atoms in block 16
Block first atom: 326
Blocpdb> 23 atoms in block 17
Block first atom: 352
Blocpdb> 24 atoms in block 18
Block first atom: 375
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 399
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 423
Blocpdb> 34 atoms in block 21
Block first atom: 445
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 479
Blocpdb> 29 atoms in block 23
Block first atom: 499
Blocpdb> 31 atoms in block 24
Block first atom: 528
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 559
Blocpdb> 27 atoms in block 26
Block first atom: 582
Blocpdb> 24 atoms in block 27
Block first atom: 609
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 633
Blocpdb> 24 atoms in block 29
Block first atom: 655
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 679
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 707
Blocpdb> 26 atoms in block 32
Block first atom: 726
Blocpdb> 21 atoms in block 33
Block first atom: 752
Blocpdb> 27 atoms in block 34
Block first atom: 773
Blocpdb> 28 atoms in block 35
Block first atom: 800
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 828
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 852
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 876
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 897
Blocpdb> 27 atoms in block 40
Block first atom: 918
Blocpdb> 25 atoms in block 41
Block first atom: 945
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 970
Blocpdb> 17 atoms in block 43
Block first atom: 991
Blocpdb> 20 atoms in block 44
Block first atom: 1008
Blocpdb> 23 atoms in block 45
Block first atom: 1028
Blocpdb> 28 atoms in block 46
Block first atom: 1051
Blocpdb> 23 atoms in block 47
Block first atom: 1079
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1102
Blocpdb> 20 atoms in block 49
Block first atom: 1125
Blocpdb> 28 atoms in block 50
Block first atom: 1145
Blocpdb> 21 atoms in block 51
Block first atom: 1173
Blocpdb> 24 atoms in block 52
Block first atom: 1194
Blocpdb> 24 atoms in block 53
Block first atom: 1218
Blocpdb> 15 atoms in block 54
Block first atom: 1242
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 1257
Blocpdb> 25 atoms in block 56
Block first atom: 1277
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 1302
Blocpdb> 29 atoms in block 58
Block first atom: 1326
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 1355
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1376
Blocpdb> 30 atoms in block 61
Block first atom: 1396
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1426
Blocpdb> 29 atoms in block 63
Block first atom: 1450
Blocpdb> 26 atoms in block 64
Block first atom: 1479
Blocpdb> 23 atoms in block 65
Block first atom: 1505
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1528
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1551
Blocpdb> 23 atoms in block 68
Block first atom: 1569
Blocpdb> 25 atoms in block 69
Block first atom: 1592
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1617
Blocpdb> 21 atoms in block 71
Block first atom: 1637
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1658
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1679
Blocpdb> 24 atoms in block 74
Block first atom: 1705
Blocpdb> 24 atoms in block 75
Block first atom: 1729
Blocpdb> 27 atoms in block 76
Block first atom: 1753
Blocpdb> 25 atoms in block 77
Block first atom: 1780
Blocpdb> 29 atoms in block 78
Block first atom: 1805
Blocpdb> 24 atoms in block 79
Block first atom: 1834
Blocpdb> 20 atoms in block 80
Block first atom: 1858
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 1878
Blocpdb> 23 atoms in block 82
Block first atom: 1900
Blocpdb> 25 atoms in block 83
Block first atom: 1923
Blocpdb> 27 atoms in block 84
Block first atom: 1948
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1975
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 1991
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 2017
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 2040
Blocpdb> 24 atoms in block 89
Block first atom: 2061
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 2085
Blocpdb> 12 atoms in block 91
Block first atom: 2108
Blocpdb> 23 atoms in block 92
Block first atom: 2120
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2143
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 2165
Blocpdb> 22 atoms in block 95
Block first atom: 2185
Blocpdb> 21 atoms in block 96
Block first atom: 2207
Blocpdb> 23 atoms in block 97
Block first atom: 2228
Blocpdb> 19 atoms in block 98
Block first atom: 2251
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 2270
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 2286
Blocpdb> 18 atoms in block 101
Block first atom: 2305
Blocpdb> 26 atoms in block 102
Block first atom: 2323
Blocpdb> 28 atoms in block 103
Block first atom: 2349
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 2377
Blocpdb> 28 atoms in block 105
Block first atom: 2397
Blocpdb> 20 atoms in block 106
Block first atom: 2425
Blocpdb> 26 atoms in block 107
Block first atom: 2445
Blocpdb> 23 atoms in block 108
Block first atom: 2471
Blocpdb> 24 atoms in block 109
Block first atom: 2494
Blocpdb> 24 atoms in block 110
Block first atom: 2518
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2542
Blocpdb> 34 atoms in block 112
Block first atom: 2564
Blocpdb> 24 atoms in block 113
Block first atom: 2598
Blocpdb> 29 atoms in block 114
Block first atom: 2622
Blocpdb> 31 atoms in block 115
Block first atom: 2651
Blocpdb> 23 atoms in block 116
Block first atom: 2682
Blocpdb> 27 atoms in block 117
Block first atom: 2705
Blocpdb> 24 atoms in block 118
Block first atom: 2732
Blocpdb> 22 atoms in block 119
Block first atom: 2756
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2778
Blocpdb> 28 atoms in block 121
Block first atom: 2802
Blocpdb> 19 atoms in block 122
Block first atom: 2830
Blocpdb> 26 atoms in block 123
Block first atom: 2849
Blocpdb> 21 atoms in block 124
Block first atom: 2875
Blocpdb> 27 atoms in block 125
Block first atom: 2896
Blocpdb> 28 atoms in block 126
Block first atom: 2923
Blocpdb> 24 atoms in block 127
Block first atom: 2951
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 2975
Blocpdb> 21 atoms in block 129
Block first atom: 2999
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 3020
Blocpdb> 27 atoms in block 131
Block first atom: 3041
Blocpdb> 25 atoms in block 132
Block first atom: 3068
Blocpdb> 21 atoms in block 133
Block first atom: 3093
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 3114
Blocpdb> 20 atoms in block 135
Block first atom: 3131
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 3151
Blocpdb> 28 atoms in block 137
Block first atom: 3174
Blocpdb> 23 atoms in block 138
Block first atom: 3202
Blocpdb> 23 atoms in block 139
Block first atom: 3225
Blocpdb> 20 atoms in block 140
Block first atom: 3248
Blocpdb> 28 atoms in block 141
Block first atom: 3268
Blocpdb> 21 atoms in block 142
Block first atom: 3296
Blocpdb> 24 atoms in block 143
Block first atom: 3317
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 3341
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 3365
Blocpdb> 20 atoms in block 146
Block first atom: 3383
Blocpdb> 25 atoms in block 147
Block first atom: 3403
Blocpdb> 24 atoms in block 148
Block first atom: 3428
Blocpdb> 29 atoms in block 149
Block first atom: 3452
Blocpdb> 21 atoms in block 150
Block first atom: 3481
Blocpdb> 20 atoms in block 151
Block first atom: 3502
Blocpdb> 30 atoms in block 152
Block first atom: 3522
Blocpdb> 24 atoms in block 153
Block first atom: 3552
Blocpdb> 22 atoms in block 154
Block first atom: 3576
Blocpdb> 26 atoms in block 155
Block first atom: 3598
Blocpdb> 23 atoms in block 156
Block first atom: 3624
Blocpdb> 23 atoms in block 157
Block first atom: 3647
Blocpdb> 18 atoms in block 158
Block first atom: 3670
Blocpdb> 23 atoms in block 159
Block first atom: 3688
Blocpdb> 25 atoms in block 160
Block first atom: 3711
Blocpdb> 20 atoms in block 161
Block first atom: 3736
Blocpdb> 21 atoms in block 162
Block first atom: 3756
Blocpdb> 21 atoms in block 163
Block first atom: 3777
Blocpdb> 26 atoms in block 164
Block first atom: 3798
Blocpdb> 24 atoms in block 165
Block first atom: 3824
Blocpdb> 24 atoms in block 166
Block first atom: 3848
Blocpdb> 27 atoms in block 167
Block first atom: 3872
Blocpdb> 25 atoms in block 168
Block first atom: 3899
Blocpdb> 29 atoms in block 169
Block first atom: 3924
Blocpdb> 24 atoms in block 170
Block first atom: 3953
Blocpdb> 20 atoms in block 171
Block first atom: 3977
Blocpdb> 22 atoms in block 172
Block first atom: 3997
Blocpdb> 23 atoms in block 173
Block first atom: 4019
Blocpdb> 25 atoms in block 174
Block first atom: 4042
Blocpdb> 27 atoms in block 175
Block first atom: 4067
Blocpdb> 16 atoms in block 176
Block first atom: 4094
Blocpdb> 26 atoms in block 177
Block first atom: 4110
Blocpdb> 23 atoms in block 178
Block first atom: 4136
Blocpdb> 21 atoms in block 179
Block first atom: 4159
Blocpdb> 24 atoms in block 180
Block first atom: 4180
Blocpdb> 23 atoms in block 181
Block first atom: 4204
Blocpdb> 12 atoms in block 182
Block first atom: 4226
Blocpdb> 182 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1518721 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12714
Prepmat> Matrix trace = 3318580.0000
Prepmat> Last element read: 12714 12714 21.0456
Prepmat> 16654 lines saved.
Prepmat> 14885 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4238
RTB> Total mass = 4238.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4238
RTB> Number of blocks = 182
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 220805.9708
RTB> 60918 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1092
Diagstd> Nb of non-zero elements: 60918
Diagstd> Projected matrix trace = 220805.9708
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1092 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 220805.9708
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3660610 0.7707556 1.1362669 1.3866812
1.7603923 2.6125487 2.9114939 3.4899335 4.0800822
4.1984452 4.4238231 4.6071177 5.8210096 6.2066376
6.5719693 6.8682807 8.3024794 8.4245217 8.6162929
8.9762654 10.0948435 10.4972618 10.8626309 11.5898156
12.7755697 13.1967659 13.7104039 13.9423311 14.9466116
15.1408241 15.8100219 17.0505451 17.1351463 17.2816707
17.9954607 18.2957712 18.5305681 18.9009759 19.3349341
19.7671923 19.8663280 20.3033720 20.7613455 21.1168053
21.5478940 21.9451928 22.2593794 22.6632072 23.0726753
23.4222654 23.6234643 23.7530947 24.9272171 25.1105407
25.6348508 25.6712562 26.1655521 26.5700087 27.0444413
28.0696037 28.4600937 28.8725557 29.3224673 29.7013845
30.2221634 30.3715439 30.9181609 31.6427099 31.7428291
32.1192118 33.3999847 33.9769211 34.3533847 34.9023463
35.1864511 35.3262022 35.9386928 36.3350915 36.6911838
36.9858153 37.3520018 37.7622060 37.9925754 38.7062153
39.0736253 39.1800340 40.0047012 40.3000364 40.7944559
41.1763097 41.6636623 42.4164655 42.6993664 42.8844714
43.2575493 43.4190960 43.7112169 43.9564891 44.0801755
44.4446665
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034327 0.0034328 0.0034332 0.0034334
0.0034340 65.7010062 95.3352772 115.7538548 127.8743960
144.0787746 175.5203493 185.2905303 202.8634735 219.3460091
222.5048722 228.3989783 233.0826437 261.9958658 270.5350090
278.3832136 284.5897792 312.8954047 315.1867174 318.7539005
325.3442407 345.0206396 351.8303456 357.9009011 369.6864591
388.1373330 394.4836758 402.0873445 405.4739677 419.8234134
422.5421491 431.7790002 448.3987712 449.5098249 451.4276369
460.6560343 464.4838744 467.4548248 472.1036897 477.4925814
482.8005696 484.0097170 489.3046762 494.7924095 499.0101596
504.0779438 508.7037988 512.3323813 516.9588381 521.6080167
525.5447832 527.7971894 529.2433137 542.1658747 544.1558620
549.8075218 550.1977887 555.4695183 559.7461674 564.7214545
575.3252318 579.3132252 583.4960152 588.0246545 591.8118094
596.9776263 598.4511629 603.8125104 610.8465351 611.8121476
615.4286640 627.5790165 632.9760689 636.4730900 641.5383045
644.1440704 645.4219858 650.9931498 654.5734850 657.7731507
660.4088414 663.6700532 667.3043544 669.3367136 675.5937671
678.7926550 679.7162995 686.8324343 689.3630466 693.5788685
696.8174070 700.9289559 707.2330025 709.5875638 711.1239591
714.2105083 715.5428864 717.9459151 719.9573654 720.9695745
723.9442220
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4238
Rtb_to_modes> Number of blocs = 182
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.81
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.57
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.90
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.44
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1092 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003
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1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99996 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
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1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000
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0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 76284 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998
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0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
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1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99996 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00002 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002
1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00000
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0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605171950363324789.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605171950363324789.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605171950363324789.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605171950363324789.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 544
First residue number = 241
Last residue number = 512
Number of atoms found = 4238
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3661
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7708
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.136
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.387
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.760
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.613
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.911
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.976
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.44
Bfactors> 106 vectors, 12714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.366100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.097 for 544 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.043 +/- 0.08
Bfactors> = 0.033 +/- 0.04
Bfactors> Shiftng-fct= -0.009
Bfactors> Scaling-fct= 0.489
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605171950363324789.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605171950363324789.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.9
Chkmod> 106 vectors, 12714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9168
0.0034 0.8454
0.0034 0.9913
0.0034 0.7776
0.0034 0.8824
0.0034 0.7916
65.7017 0.6943
95.3339 0.4881
115.7353 0.0358
127.8836 0.3961
144.0565 0.0383
175.5280 0.2691
185.2669 0.5736
202.8567 0.1266
219.3344 0.3483
222.4835 0.7153
228.3937 0.0840
233.0697 0.4876
261.9844 0.4326
270.5313 0.4015
278.3719 0.2780
284.5717 0.3138
312.8729 0.1901
315.1821 0.2185
318.7348 0.1294
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getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605171950363324789 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605171950363324789.7.pdb, 1 models will be skipped
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making animated gif 300x300
2605171950363324789.7.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m19.406s
user 0m19.292s
sys 0m0.096s
rm: cannot remove '2605171950363324789.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
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