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* 01-AUG-25 *

LOGs for ID: 2605181658433537902

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2605181658433537902.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2605181658433537902.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2605181658433537902.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    260
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    260
            Number of atoms found    =   2084
            Mean number per residue  =      8.0

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     3.192295 +/-    16.966934 From:   -33.069000 To:    32.859000
 =     2.341172 +/-    10.688122 From:   -27.605000 To:    27.090000
 =     0.114316 +/-    18.772906 From:   -42.351000 To:    39.713000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.6432 % Filled.
 Pdbmat>       712138  non-zero elements.
 Pdbmat>        77751 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     74.62 +/-     22.41
         Maximum number =    127
         Minimum number =      9

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.555020E+06
 Pdbmat> Larger element =  477.032    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
260 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2605181658433537902.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2605181658433537902.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2605181658433537902.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2084 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   260 residues.
 Blocpdb>    14 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     15
 Blocpdb>    15 atoms in block      3
 Block first atom:     30
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     45
 Blocpdb>    11 atoms in block      5
 Block first atom:     61
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     72
 Blocpdb>    20 atoms in block      7
 Block first atom:     85
 Blocpdb>    14 atoms in block      8
 Block first atom:    105
 Blocpdb>    14 atoms in block      9
 Block first atom:    119
 Blocpdb>    12 atoms in block     10
 Block first atom:    133
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    145
 Blocpdb>    17 atoms in block     12
 Block first atom:    160
 Blocpdb>    15 atoms in block     13
 Block first atom:    177
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    192
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    206
 Blocpdb>    13 atoms in block     16
 Block first atom:    218
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    231
 Blocpdb>    13 atoms in block     18
 Block first atom:    248
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    261
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    276
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    292
 Blocpdb>    15 atoms in block     22
 Block first atom:    311
 Blocpdb>    12 atoms in block     23
 Block first atom:    326
 Blocpdb>    17 atoms in block     24
 Block first atom:    338
 Blocpdb>    16 atoms in block     25
 Block first atom:    355
 Blocpdb>    19 atoms in block     26
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    13 atoms in block     27
 Block first atom:    390
 Blocpdb>    18 atoms in block     28
 Block first atom:    403
 Blocpdb>    23 atoms in block     29
 Block first atom:    421
 Blocpdb>    16 atoms in block     30
 Block first atom:    444
 Blocpdb>    19 atoms in block     31
 Block first atom:    460
 Blocpdb>    19 atoms in block     32
 Block first atom:    479
 Blocpdb>    13 atoms in block     33
 Block first atom:    498
 Blocpdb>    18 atoms in block     34
 Block first atom:    511
 Blocpdb>    16 atoms in block     35
 Block first atom:    529
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    19 atoms in block     37
 Block first atom:    561
 Blocpdb>    18 atoms in block     38
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    12 atoms in block     39
 Block first atom:    598
 Blocpdb>    16 atoms in block     40
 Block first atom:    610
 Blocpdb>    22 atoms in block     41
 Block first atom:    626
 Blocpdb>    14 atoms in block     42
 Block first atom:    648
 Blocpdb>    19 atoms in block     43
 Block first atom:    662
 Blocpdb>    21 atoms in block     44
 Block first atom:    681
 Blocpdb>    16 atoms in block     45
 Block first atom:    702
 Blocpdb>    15 atoms in block     46
 Block first atom:    718
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    733
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    750
 Blocpdb>    18 atoms in block     49
 Block first atom:    763
 Blocpdb>    18 atoms in block     50
 Block first atom:    781
 Blocpdb>    16 atoms in block     51
 Block first atom:    799
 Blocpdb>    14 atoms in block     52
 Block first atom:    815
 Blocpdb>    14 atoms in block     53
 Block first atom:    829
 Blocpdb>    18 atoms in block     54
 Block first atom:    843
 Blocpdb>    13 atoms in block     55
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    16 atoms in block     56
 Block first atom:    874
 Blocpdb>    16 atoms in block     57
 Block first atom:    890
 Blocpdb>    15 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    17 atoms in block     59
 Block first atom:    921
 Blocpdb>    18 atoms in block     60
 Block first atom:    938
 Blocpdb>    16 atoms in block     61
 Block first atom:    956
 Blocpdb>    17 atoms in block     62
 Block first atom:    972
 Blocpdb>    18 atoms in block     63
 Block first atom:    989
 Blocpdb>    18 atoms in block     64
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    14 atoms in block     65
 Block first atom:   1025
 Blocpdb>    16 atoms in block     66
 Block first atom:   1039
 Blocpdb>    20 atoms in block     67
 Block first atom:   1055
 Blocpdb>    14 atoms in block     68
 Block first atom:   1075
 Blocpdb>    12 atoms in block     69
 Block first atom:   1089
 Blocpdb>    12 atoms in block     70
 Block first atom:   1101
 Blocpdb>    17 atoms in block     71
 Block first atom:   1113
 Blocpdb>    18 atoms in block     72
 Block first atom:   1130
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1148
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1161
 Blocpdb>    17 atoms in block     75
 Block first atom:   1177
 Blocpdb>    13 atoms in block     76
 Block first atom:   1194
 Blocpdb>    14 atoms in block     77
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>    19 atoms in block     78
 Block first atom:   1221
 Blocpdb>    17 atoms in block     79
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    12 atoms in block     80
 Block first atom:   1257
 Blocpdb>    15 atoms in block     81
 Block first atom:   1269
 Blocpdb>    19 atoms in block     82
 Block first atom:   1284
 Blocpdb>    18 atoms in block     83
 Block first atom:   1303
 Blocpdb>    14 atoms in block     84
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    12 atoms in block     85
 Block first atom:   1335
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1347
 Blocpdb>    14 atoms in block     87
 Block first atom:   1361
 Blocpdb>    13 atoms in block     88
 Block first atom:   1375
 Blocpdb>    18 atoms in block     89
 Block first atom:   1388
 Blocpdb>    17 atoms in block     90
 Block first atom:   1406
 Blocpdb>    15 atoms in block     91
 Block first atom:   1423
 Blocpdb>    18 atoms in block     92
 Block first atom:   1438
 Blocpdb>    15 atoms in block     93
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    22 atoms in block     94
 Block first atom:   1471
 Blocpdb>    12 atoms in block     95
 Block first atom:   1493
 Blocpdb>    15 atoms in block     96
 Block first atom:   1505
 Blocpdb>    13 atoms in block     97
 Block first atom:   1520
 Blocpdb>    15 atoms in block     98
 Block first atom:   1533
 Blocpdb>    18 atoms in block     99
 Block first atom:   1548
 Blocpdb>    21 atoms in block    100
 Block first atom:   1566
 Blocpdb>    16 atoms in block    101
 Block first atom:   1587
 Blocpdb>    17 atoms in block    102
 Block first atom:   1603
 Blocpdb>    17 atoms in block    103
 Block first atom:   1620
 Blocpdb>    19 atoms in block    104
 Block first atom:   1637
 Blocpdb>    21 atoms in block    105
 Block first atom:   1656
 Blocpdb>    14 atoms in block    106
 Block first atom:   1677
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1691
 Blocpdb>    18 atoms in block    108
 Block first atom:   1704
 Blocpdb>    16 atoms in block    109
 Block first atom:   1722
 Blocpdb>    17 atoms in block    110
 Block first atom:   1738
 Blocpdb>    16 atoms in block    111
 Block first atom:   1755
 Blocpdb>    18 atoms in block    112
 Block first atom:   1771
 Blocpdb>    18 atoms in block    113
 Block first atom:   1789
 Blocpdb>    15 atoms in block    114
 Block first atom:   1807
 Blocpdb>    17 atoms in block    115
 Block first atom:   1822
 Blocpdb>    13 atoms in block    116
 Block first atom:   1839
 Blocpdb>    14 atoms in block    117
 Block first atom:   1852
 Blocpdb>    15 atoms in block    118
 Block first atom:   1866
 Blocpdb>    14 atoms in block    119
 Block first atom:   1881
 Blocpdb>    14 atoms in block    120
 Block first atom:   1895
 Blocpdb>    16 atoms in block    121
 Block first atom:   1909
 Blocpdb>    17 atoms in block    122
 Block first atom:   1925
 Blocpdb>    13 atoms in block    123
 Block first atom:   1942
 Blocpdb>    19 atoms in block    124
 Block first atom:   1955
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1974
 Blocpdb>    17 atoms in block    126
 Block first atom:   1990
 Blocpdb>    16 atoms in block    127
 Block first atom:   2007
 Blocpdb>    19 atoms in block    128
 Block first atom:   2023
 Blocpdb>    19 atoms in block    129
 Block first atom:   2042
 Blocpdb>    24 atoms in block    130
 Block first atom:   2060

 Blocpdb>   130 blocks.

 Blocpdb> At most,     24 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    11 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       712268 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6252

 Prepmat> Matrix trace    =    1555020.0000
 Prepmat> Last element read:    6252   6252        65.5686
 Prepmat>         8516 lines saved.
 Prepmat>         7288 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2084
 RTB> Total mass =        2084.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2084
 RTB> Number of blocks =   130
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  159574.1749
 RTB>     42222 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      780
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    42222
 Diagstd> Projected matrix trace =  159574.1749

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    780 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 159574.1749
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.1226993      0.1783277      0.2436361      0.8267830
      1.1074635      1.4632638      1.6689143      2.4899487      2.9587941
      3.5128487      4.3703840      4.9439032      5.1164975      5.4386694
      7.7924323      7.9287707      8.7475249      9.2239848      9.9864669
     10.7870392     11.2503666     11.7295232     12.6970407     13.3293859
     14.1125147     15.1822902     15.2623386     16.3075044     16.6091112
     17.3458563     18.0602018     19.0470075     20.2084036     20.8724416
     21.3924598     22.2870256     22.5103324     24.2163197     24.6692592
     25.2521214     26.5675617     26.9443500     27.8241009     28.0432350
     29.1590677     29.3238512     30.3480561     31.3000031     31.6873273
     32.0903297     32.4915259     33.0316080     33.9194046     34.2758781
     34.8706876     35.5285169     35.8497195     36.8737095     37.2991788
     38.2482131     39.0215979     39.3428009     40.6286014     41.0018866
     41.5777021     42.6116108     43.0805190     43.1804092     43.4025047
     44.6215416     45.0922411     45.3585831     46.1208511     46.7073826
     47.4594148     48.1773291     48.7090052     49.7007149     50.2826148
     51.4921015     51.9725033     52.6094849     52.7881073     53.7180843
     54.3291051     55.1128829     55.6978589     56.2570802     56.6840471
     57.7963571     58.8386185     59.2890189     59.9055194     61.3737673
     61.8429231     62.2487076     63.3077435     63.9359286     64.4277929
     65.1397581

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034320      0.0034322      0.0034323      0.0034335      0.0034337
      0.0034342     38.0378811     45.8568968     53.6001570     98.7395309
    114.2773050    131.3580188    140.2853422    171.3525154    186.7895835
    203.5283935    227.0152741    241.4516945    245.6301435    253.2454253
    303.1320092    305.7723489    321.1721459    329.8029758    343.1635995
    356.6534337    364.2324351    371.9079478    386.9425917    396.4608900
    407.9411207    423.1203607    424.2343423    438.5196231    442.5562475
    452.2651799    461.4839272    473.9239496    488.1589814    496.1144858
    502.2565880    512.6504418    515.2123136    534.3789604    539.3532926
    545.6877625    559.7203913    563.6754708    572.8037469    575.0549360
    586.3839806    588.0385310    598.2197121    607.5296390    611.2770418
    615.1519004    618.9852979    624.1085583    632.4400880    635.7546936
    641.2472796    647.2675273    650.1868192    659.4072157    663.2006075
    671.5847956    678.3405898    681.1267199    692.1675207    695.3399795
    700.2055063    708.8580182    712.7475669    713.5734079    715.4061622
    725.3833211    729.1992120    731.3495863    737.4692847    742.1437696
    748.0945136    753.7314557    757.8790646    765.5553541    770.0239038
    779.2298641    782.8563851    787.6391686    788.9751519    795.8945637
    800.4082496    806.1611127    810.4281741    814.4864699    817.5714276
    825.5540517    832.9645405    836.1465690    840.4825461    850.7200555
    853.9654195    856.7625009    864.0198050    868.2959373    871.6294738
    876.4322520

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2084
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    130

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9886E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9897E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9901E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1227    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1783    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2436    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8268    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.107    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.463    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.669    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.490    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.959    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.513    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.370    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.944    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.116    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.439    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.792    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.929    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.748    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.224    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.986    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.14    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    780 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00004 1.00002 1.00002
 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998
 0.99999 1.00004 1.00000 0.99996 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99995 1.00000
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 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
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 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
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 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    37512 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999
 0.99998 0.99999 1.00004 1.00002 1.00002
 1.00001 1.00004 0.99999 0.99999 0.99998
 0.99999 1.00004 1.00000 0.99996 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99995 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
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 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001
 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99997 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2605181658433537902.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2605181658433537902.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2605181658433537902.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2605181658433537902.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    260
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    260
            Number of atoms found    =   2084
            Mean number per residue  =      8.0

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9886E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9897E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9901E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1227    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1783    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2436    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8268    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.107    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.463    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.669    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.490    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.959    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.513    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.370    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.944    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.116    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.439    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.792    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.929    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.748    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.224    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.986    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.14    

 Bfactors>  106 vectors,   6252 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.122700
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.288 for    260 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.183 +/-   0.16
 Bfactors> =     89.418 +/-   9.89
 Bfactors> Shiftng-fct=     89.235
 Bfactors> Scaling-fct=     62.995

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2605181658433537902.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2605181658433537902.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4319E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4320E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4321E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   38.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   45.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   53.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   98.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   114.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   131.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   140.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   171.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   186.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   203.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   227.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   241.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   245.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   253.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   303.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   305.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   321.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   713.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   770.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   850.7    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   856.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   864.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   871.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.4    

 Chkmod>  106 vectors,   6252 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2084 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    23 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    44 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8283
      0.0034      0.6711
      0.0034      0.9796
      0.0034      0.7778
      0.0034      0.9217
      0.0034      0.7766
     38.0364      0.7423
     45.8514      0.5643
     53.5939      0.5791
     98.7363      0.3264
    114.2485      0.2883
    131.3405      0.5822
    140.2829      0.6156
    171.3469      0.5949
    186.7881      0.0524
    203.5240      0.2963
    226.9956      0.3864
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    245.6077      0.0881
    253.2423      0.1834
    303.1106      0.2743
    305.7636      0.2485
    321.1671      0.1869
    329.7891      0.1364
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    364.2109      0.1896
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    871.6070      0.3673
    876.3963      0.3622
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605181658433537902 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
2605181658433537902.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2605181658433537902.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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2605181658433537902.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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getting mode 8
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2605181658433537902.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.079s
user	0m6.988s
sys	0m0.080s
rm: cannot remove '2605181658433537902.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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* 01-AUG-25 *
