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LOGs for ID: 2605191927023748813

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605191927023748813.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605191927023748813.atom to be opened. Openam> File opened: 2605191927023748813.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 612 First residue number = 1 Last residue number = 109 Number of atoms found = 9627 Mean number per residue = 15.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 9.851610 +/- 12.844397 From: -27.578000 To: 40.000000 = 0.431241 +/- 13.488707 From: -42.653000 To: 30.198000 = -6.418760 +/- 19.253101 From: -53.711000 To: 44.276000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6557 % Filled. Pdbmat> 6905387 non-zero elements. Pdbmat> 760955 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 158.09 +/- 52.71 Maximum number = 297 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 1.521910E+07 Pdbmat> Larger element = 1118.13 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 612 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605191927023748813.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605191927023748813.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605191927023748813.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9627 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 612 residues. Blocpdb> 68 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 54 atoms in block 2 Block first atom: 69 Blocpdb> 74 atoms in block 3 Block first atom: 123 Blocpdb> 58 atoms in block 4 Block first atom: 197 Blocpdb> 64 atoms in block 5 Block first atom: 255 Blocpdb> 63 atoms in block 6 Block first atom: 319 Blocpdb> 69 atoms in block 7 Block first atom: 382 Blocpdb> 64 atoms in block 8 Block first atom: 451 Blocpdb> 74 atoms in block 9 Block first atom: 515 Blocpdb> 73 atoms in block 10 Block first atom: 589 Blocpdb> 62 atoms in block 11 Block first atom: 662 Blocpdb> 60 atoms in block 12 Block first atom: 724 Blocpdb> 58 atoms in block 13 Block first atom: 784 Blocpdb> 68 atoms in block 14 Block first atom: 842 Blocpdb> 78 atoms in block 15 Block first atom: 910 Blocpdb> 70 atoms in block 16 Block first atom: 988 Blocpdb> 60 atoms in block 17 Block first atom: 1058 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 1118 Blocpdb> 56 atoms in block 19 Block first atom: 1139 Blocpdb> 55 atoms in block 20 Block first atom: 1195 Blocpdb> 56 atoms in block 21 Block first atom: 1250 Blocpdb> 75 atoms in block 22 Block first atom: 1306 Blocpdb> 72 atoms in block 23 Block first atom: 1381 Blocpdb> 64 atoms in block 24 Block first atom: 1453 Blocpdb> 71 atoms in block 25 Block first atom: 1517 Blocpdb> 68 atoms in block 26 Block first atom: 1588 Blocpdb> 56 atoms in block 27 Block first atom: 1656 Blocpdb> 55 atoms in block 28 Block first atom: 1712 Blocpdb> 62 atoms in block 29 Block first atom: 1767 Blocpdb> 58 atoms in block 30 Block first atom: 1829 Blocpdb> 47 atoms in block 31 Block first atom: 1887 Blocpdb> 65 atoms in block 32 Block first atom: 1934 Blocpdb> 61 atoms in block 33 Block first atom: 1999 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 2060 Blocpdb> 62 atoms in block 35 Block first atom: 2103 Blocpdb> 68 atoms in block 36 Block first atom: 2165 Blocpdb> 61 atoms in block 37 Block first atom: 2233 Blocpdb> 67 atoms in block 38 Block first atom: 2294 Blocpdb> 65 atoms in block 39 Block first atom: 2361 Blocpdb> 66 atoms in block 40 Block first atom: 2426 Blocpdb> 59 atoms in block 41 Block first atom: 2492 Blocpdb> 62 atoms in block 42 Block first atom: 2551 Blocpdb> 70 atoms in block 43 Block first atom: 2613 Blocpdb> 48 atoms in block 44 Block first atom: 2683 Blocpdb> 80 atoms in block 45 Block first atom: 2731 Blocpdb> 56 atoms in block 46 Block first atom: 2811 Blocpdb> 75 atoms in block 47 Block first atom: 2867 Blocpdb> 57 atoms in block 48 Block first atom: 2942 Blocpdb> 53 atoms in block 49 Block first atom: 2999 Blocpdb> 73 atoms in block 50 Block first atom: 3052 Blocpdb> 60 atoms in block 51 Block first atom: 3125 Blocpdb> 66 atoms in block 52 Block first atom: 3185 Blocpdb> 60 atoms in block 53 Block first atom: 3251 Blocpdb> 65 atoms in block 54 Block first atom: 3311 Blocpdb> 57 atoms in block 55 Block first atom: 3376 Blocpdb> 76 atoms in block 56 Block first atom: 3433 Blocpdb> 48 atoms in block 57 Block first atom: 3509 Blocpdb> 55 atoms in block 58 Block first atom: 3557 Blocpdb> 70 atoms in block 59 Block first atom: 3612 Blocpdb> 69 atoms in block 60 Block first atom: 3682 Blocpdb> 72 atoms in block 61 Block first atom: 3751 Blocpdb> 58 atoms in block 62 Block first atom: 3823 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 3881 Blocpdb> 68 atoms in block 64 Block first atom: 3928 Blocpdb> 62 atoms in block 65 Block first atom: 3996 Blocpdb> 64 atoms in block 66 Block first atom: 4058 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 4122 Blocpdb> 58 atoms in block 68 Block first atom: 4177 Blocpdb> 67 atoms in block 69 Block first atom: 4235 Blocpdb> 52 atoms in block 70 Block first atom: 4302 Blocpdb> 53 atoms in block 71 Block first atom: 4354 Blocpdb> 63 atoms in block 72 Block first atom: 4407 Blocpdb> 68 atoms in block 73 Block first atom: 4470 Blocpdb> 69 atoms in block 74 Block first atom: 4538 Blocpdb> 76 atoms in block 75 Block first atom: 4607 Blocpdb> 79 atoms in block 76 Block first atom: 4683 Blocpdb> 78 atoms in block 77 Block first atom: 4762 Blocpdb> 69 atoms in block 78 Block first atom: 4840 Blocpdb> 81 atoms in block 79 Block first atom: 4909 Blocpdb> 45 atoms in block 80 Block first atom: 4990 Blocpdb> 79 atoms in block 81 Block first atom: 5035 Blocpdb> 45 atoms in block 82 Block first atom: 5114 Blocpdb> 73 atoms in block 83 Block first atom: 5159 Blocpdb> 69 atoms in block 84 Block first atom: 5232 Blocpdb> 52 atoms in block 85 Block first atom: 5301 Blocpdb> 67 atoms in block 86 Block first atom: 5353 Blocpdb> 53 atoms in block 87 Block first atom: 5420 Blocpdb> 60 atoms in block 88 Block first atom: 5473 Blocpdb> 65 atoms in block 89 Block first atom: 5533 Blocpdb> 72 atoms in block 90 Block first atom: 5598 Blocpdb> 57 atoms in block 91 Block first atom: 5670 Blocpdb> 57 atoms in block 92 Block first atom: 5727 Blocpdb> 83 atoms in block 93 Block first atom: 5784 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 5867 Blocpdb> 72 atoms in block 95 Block first atom: 5911 Blocpdb> 67 atoms in block 96 Block first atom: 5983 Blocpdb> 65 atoms in block 97 Block first atom: 6050 Blocpdb> 74 atoms in block 98 Block first atom: 6115 Blocpdb> 66 atoms in block 99 Block first atom: 6189 Blocpdb> 67 atoms in block 100 Block first atom: 6255 Blocpdb> 65 atoms in block 101 Block first atom: 6322 Blocpdb> 62 atoms in block 102 Block first atom: 6387 Blocpdb> 65 atoms in block 103 Block first atom: 6449 Blocpdb> 57 atoms in block 104 Block first atom: 6514 Blocpdb> 67 atoms in block 105 Block first atom: 6571 Blocpdb> 53 atoms in block 106 Block first atom: 6638 Blocpdb> 78 atoms in block 107 Block first atom: 6691 Blocpdb> 64 atoms in block 108 Block first atom: 6769 Blocpdb> 64 atoms in block 109 Block first atom: 6833 Blocpdb> 52 atoms in block 110 Block first atom: 6897 Blocpdb> 70 atoms in block 111 Block first atom: 6949 Blocpdb> 59 atoms in block 112 Block first atom: 7019 Blocpdb> 64 atoms in block 113 Block first atom: 7078 Blocpdb> 78 atoms in block 114 Block first atom: 7142 Blocpdb> 48 atoms in block 115 Block first atom: 7220 Blocpdb> 60 atoms in block 116 Block first atom: 7268 Blocpdb> 52 atoms in block 117 Block first atom: 7328 Blocpdb> 73 atoms in block 118 Block first atom: 7380 Blocpdb> 63 atoms in block 119 Block first atom: 7453 Blocpdb> 57 atoms in block 120 Block first atom: 7516 Blocpdb> 64 atoms in block 121 Block first atom: 7573 Blocpdb> 65 atoms in block 122 Block first atom: 7637 Blocpdb> 63 atoms in block 123 Block first atom: 7702 Blocpdb> 68 atoms in block 124 Block first atom: 7765 Blocpdb> 67 atoms in block 125 Block first atom: 7833 Blocpdb> 84 atoms in block 126 Block first atom: 7900 Blocpdb> 23 atoms in block 127 Block first atom: 7984 Blocpdb> 66 atoms in block 128 Block first atom: 8007 Blocpdb> 58 atoms in block 129 Block first atom: 8073 Blocpdb> 63 atoms in block 130 Block first atom: 8131 Blocpdb> 63 atoms in block 131 Block first atom: 8194 Blocpdb> 68 atoms in block 132 Block first atom: 8257 Blocpdb> 73 atoms in block 133 Block first atom: 8325 Blocpdb> 71 atoms in block 134 Block first atom: 8398 Blocpdb> 51 atoms in block 135 Block first atom: 8469 Blocpdb> 52 atoms in block 136 Block first atom: 8520 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 8572 Blocpdb> 56 atoms in block 138 Block first atom: 8613 Blocpdb> 54 atoms in block 139 Block first atom: 8669 Blocpdb> 60 atoms in block 140 Block first atom: 8723 Blocpdb> 44 atoms in block 141 Block first atom: 8783 Blocpdb> 71 atoms in block 142 Block first atom: 8827 Blocpdb> 59 atoms in block 143 Block first atom: 8898 Blocpdb> 46 atoms in block 144 Block first atom: 8957 Blocpdb> 69 atoms in block 145 Block first atom: 9003 Blocpdb> 71 atoms in block 146 Block first atom: 9072 Blocpdb> 51 atoms in block 147 Block first atom: 9143 Blocpdb> 74 atoms in block 148 Block first atom: 9194 Blocpdb> 66 atoms in block 149 Block first atom: 9268 Blocpdb> 65 atoms in block 150 Block first atom: 9334 Blocpdb> 55 atoms in block 151 Block first atom: 9399 Blocpdb> 50 atoms in block 152 Block first atom: 9454 Blocpdb> 43 atoms in block 153 Block first atom: 9504 Blocpdb> 65 atoms in block 154 Block first atom: 9547 Blocpdb> 16 atoms in block 155 Block first atom: 9611 Blocpdb> 155 blocks. Blocpdb> At most, 84 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6905542 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 28881 Prepmat> Matrix trace = 15219100.0000 Prepmat> Last element read: 28881 28881 248.7315 Prepmat> 12091 lines saved. Prepmat> 10535 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9627 RTB> Total mass = 9627.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9627 RTB> Number of blocks = 155 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 355246.2336 RTB> 53655 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 930 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53655 Diagstd> Projected matrix trace = 355246.2336 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 930 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 355246.2336 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3724007 0.4675508 0.9916432 1.0490798 1.3498748 1.7680581 3.4497376 3.5814546 4.3963016 5.2617050 5.6649535 6.1039909 6.5771438 7.1895623 7.8027950 8.2193583 9.0298907 9.7475095 10.0890465 11.6853496 12.5503482 13.6015020 13.7555371 15.1231999 15.2763531 15.9694298 17.1031059 17.7280516 18.2658176 19.5219659 20.0467692 21.7386902 22.8321436 23.1039615 24.0578467 25.6374478 25.9608347 26.4359118 27.0021458 27.3316540 28.5617433 29.7247383 30.5662091 31.3303399 32.2609045 32.7798762 33.4699989 33.8771835 34.8650706 36.0193437 36.6188049 38.5775655 39.3472963 41.4064163 41.7084022 42.6365880 43.4069554 44.4742226 45.4829011 45.8268945 46.4953426 48.2151834 48.6489231 50.7880621 51.5239954 52.6985097 53.4355526 55.3178142 56.3184883 56.8514657 57.9956975 58.8974578 61.1915084 61.8454020 62.9755100 63.6297401 65.2506929 66.0152157 66.3767898 67.2349250 68.6797287 69.7024459 71.8305162 72.7397885 73.2077761 74.0318603 75.2089826 76.3037984 77.1357112 77.8348727 78.6052125 79.4629331 79.9562321 80.3789915 81.9308023 82.4467301 82.9659687 83.8274119 85.8366503 86.2243757 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034327 0.0034328 0.0034330 0.0034351 0.0034360 66.2674907 74.2522600 108.1366723 111.2242639 126.1659119 144.3921395 201.6918324 205.5062356 227.6874108 249.0912824 258.4600688 268.2886003 278.4927859 291.1699197 303.3335012 311.3251717 326.3146165 339.0331095 344.9215601 371.2069809 384.7008696 400.4872694 402.7486154 422.2961548 424.4290726 433.9502926 449.0893671 457.2205949 464.1034949 479.7964775 486.2028216 506.3047096 518.8820227 521.9615435 532.6275875 549.8353711 553.2922740 558.3318813 564.2796897 567.7122136 580.3468558 592.0444304 600.3659734 607.8239846 616.7846405 621.7258644 628.2364481 632.0463516 641.1956313 651.7231950 657.1240516 674.4700805 681.1656325 698.7617158 701.3051957 709.0657398 715.4428423 724.1848968 732.3511357 735.1153548 740.4572785 754.0275112 757.4115018 773.8844160 779.4711516 788.3053009 793.7987905 807.6585330 814.9308797 818.7779022 826.9764997 833.3809240 849.4559442 853.9825346 861.7496721 866.2143117 877.1782289 882.3020810 884.7150243 890.4155644 899.9317328 906.6074618 920.3431283 926.1499282 929.1244471 934.3392894 941.7380916 948.5677585 953.7246869 958.0372379 962.7664624 968.0049452 971.0049417 973.5685963 982.9216119 986.0115411 989.1115531 994.2333100 1006.0780199 1008.3476943 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9627 Rtb_to_modes> Number of blocs = 155 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3724 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.350 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.219 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.030 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.748 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.22 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 930 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99995 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 173286 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997 1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 0.99995 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605191927023748813.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605191927023748813.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605191927023748813.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605191927023748813.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 612 First residue number = 1 Last residue number = 109 Number of atoms found = 9627 Mean number per residue = 15.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9904E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3724 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.350 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.219 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.030 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.748 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.32 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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vecteur en lecture: 518.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0 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