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***  GT2  ***

LOGs for ID: 2605200926183861763

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605200926183861763.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605200926183861763.atom to be opened. Openam> File opened: 2605200926183861763.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 395 First residue number = 1 Last residue number = 395 Number of atoms found = 3134 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.112020 +/- 13.578535 From: -30.101000 To: 32.026000 = 0.180951 +/- 10.799780 From: -23.952000 To: 26.454000 = -1.570708 +/- 12.525098 From: -33.405000 To: 26.010000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.6448 % Filled. Pdbmat> 1169099 non-zero elements. Pdbmat> 127835 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.58 +/- 22.57 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.556700E+06 Pdbmat> Larger element = 500.641 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 395 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605200926183861763.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605200926183861763.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605200926183861763.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3134 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 395 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 48 Blocpdb> 18 atoms in block 5 Block first atom: 64 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 82 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 96 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 110 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 125 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 139 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 151 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 166 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 180 Blocpdb> 17 atoms in block 14 Block first atom: 197 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 214 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 230 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 245 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 267 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 281 Blocpdb> 21 atoms in block 20 Block first atom: 297 Blocpdb> 18 atoms in block 21 Block first atom: 318 Blocpdb> 19 atoms in block 22 Block first atom: 336 Blocpdb> 14 atoms in block 23 Block first atom: 355 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 369 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 378 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 390 Blocpdb> 18 atoms in block 27 Block first atom: 407 Blocpdb> 19 atoms in block 28 Block first atom: 425 Blocpdb> 16 atoms in block 29 Block first atom: 444 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 460 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 478 Blocpdb> 18 atoms in block 32 Block first atom: 492 Blocpdb> 11 atoms in block 33 Block first atom: 510 Blocpdb> 13 atoms in block 34 Block first atom: 521 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 534 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 546 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 562 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 581 Blocpdb> 18 atoms in block 39 Block first atom: 597 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 615 Blocpdb> 13 atoms in block 41 Block first atom: 632 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 645 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 661 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 677 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 694 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 710 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 726 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 741 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 755 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 775 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 794 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 813 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 833 Blocpdb> 9 atoms in block 54 Block first atom: 853 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 862 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 875 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 890 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 909 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 929 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 945 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 956 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 969 Blocpdb> 11 atoms in block 63 Block first atom: 981 Blocpdb> 19 atoms in block 64 Block first atom: 992 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1011 Blocpdb> 18 atoms in block 66 Block first atom: 1026 Blocpdb> 18 atoms in block 67 Block first atom: 1044 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1062 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1079 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1094 Blocpdb> 16 atoms in block 71 Block first atom: 1112 Blocpdb> 10 atoms in block 72 Block first atom: 1128 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1138 Blocpdb> 17 atoms in block 74 Block first atom: 1150 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1167 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1183 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1201 Blocpdb> 16 atoms in block 78 Block first atom: 1216 Blocpdb> 13 atoms in block 79 Block first atom: 1232 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1245 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1262 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1280 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1299 Blocpdb> 12 atoms in block 84 Block first atom: 1310 Blocpdb> 17 atoms in block 85 Block first atom: 1322 Blocpdb> 15 atoms in block 86 Block first atom: 1339 Blocpdb> 20 atoms in block 87 Block first atom: 1354 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1374 Blocpdb> 17 atoms in block 89 Block first atom: 1390 Blocpdb> 13 atoms in block 90 Block first atom: 1407 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1420 Blocpdb> 14 atoms in block 92 Block first atom: 1436 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1450 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1469 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 1486 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1509 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1525 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1540 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1559 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1574 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1591 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1605 Blocpdb> 11 atoms in block 103 Block first atom: 1624 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 1635 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1652 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1668 Blocpdb> 18 atoms in block 107 Block first atom: 1684 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1702 Blocpdb> 18 atoms in block 109 Block first atom: 1717 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 1735 Blocpdb> 17 atoms in block 111 Block first atom: 1752 Blocpdb> 17 atoms in block 112 Block first atom: 1769 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1786 Blocpdb> 15 atoms in block 114 Block first atom: 1801 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 1816 Blocpdb> 14 atoms in block 116 Block first atom: 1836 Blocpdb> 11 atoms in block 117 Block first atom: 1850 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1861 Blocpdb> 18 atoms in block 119 Block first atom: 1876 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 1894 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 1910 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1929 Blocpdb> 14 atoms in block 123 Block first atom: 1948 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1962 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1978 Blocpdb> 10 atoms in block 126 Block first atom: 1994 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 2004 Blocpdb> 13 atoms in block 128 Block first atom: 2023 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 2036 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 2050 Blocpdb> 9 atoms in block 131 Block first atom: 2063 Blocpdb> 18 atoms in block 132 Block first atom: 2072 Blocpdb> 13 atoms in block 133 Block first atom: 2090 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2103 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2118 Blocpdb> 18 atoms in block 136 Block first atom: 2135 Blocpdb> 12 atoms in block 137 Block first atom: 2153 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 2165 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 2182 Blocpdb> 13 atoms in block 140 Block first atom: 2201 Blocpdb> 19 atoms in block 141 Block first atom: 2214 Blocpdb> 14 atoms in block 142 Block first atom: 2233 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2247 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2264 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 2280 Blocpdb> 15 atoms in block 146 Block first atom: 2297 Blocpdb> 15 atoms in block 147 Block first atom: 2312 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 2327 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2346 Blocpdb> 8 atoms in block 150 Block first atom: 2363 Blocpdb> 16 atoms in block 151 Block first atom: 2371 Blocpdb> 13 atoms in block 152 Block first atom: 2387 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2400 Blocpdb> 12 atoms in block 154 Block first atom: 2417 Blocpdb> 21 atoms in block 155 Block first atom: 2429 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2450 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2463 Blocpdb> 14 atoms in block 158 Block first atom: 2478 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2492 Blocpdb> 18 atoms in block 160 Block first atom: 2507 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 2525 Blocpdb> 16 atoms in block 162 Block first atom: 2542 Blocpdb> 15 atoms in block 163 Block first atom: 2558 Blocpdb> 14 atoms in block 164 Block first atom: 2573 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2587 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2606 Blocpdb> 18 atoms in block 167 Block first atom: 2621 Blocpdb> 9 atoms in block 168 Block first atom: 2639 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2648 Blocpdb> 14 atoms in block 170 Block first atom: 2667 Blocpdb> 17 atoms in block 171 Block first atom: 2681 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2698 Blocpdb> 13 atoms in block 173 Block first atom: 2714 Blocpdb> 17 atoms in block 174 Block first atom: 2727 Blocpdb> 17 atoms in block 175 Block first atom: 2744 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 2761 Blocpdb> 15 atoms in block 177 Block first atom: 2775 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 2790 Blocpdb> 19 atoms in block 179 Block first atom: 2806 Blocpdb> 16 atoms in block 180 Block first atom: 2825 Blocpdb> 21 atoms in block 181 Block first atom: 2841 Blocpdb> 13 atoms in block 182 Block first atom: 2862 Blocpdb> 12 atoms in block 183 Block first atom: 2875 Blocpdb> 18 atoms in block 184 Block first atom: 2887 Blocpdb> 16 atoms in block 185 Block first atom: 2905 Blocpdb> 15 atoms in block 186 Block first atom: 2921 Blocpdb> 20 atoms in block 187 Block first atom: 2936 Blocpdb> 15 atoms in block 188 Block first atom: 2956 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 2971 Blocpdb> 17 atoms in block 190 Block first atom: 2987 Blocpdb> 16 atoms in block 191 Block first atom: 3004 Blocpdb> 17 atoms in block 192 Block first atom: 3020 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 3037 Blocpdb> 17 atoms in block 194 Block first atom: 3056 Blocpdb> 16 atoms in block 195 Block first atom: 3073 Blocpdb> 20 atoms in block 196 Block first atom: 3089 Blocpdb> 17 atoms in block 197 Block first atom: 3109 Blocpdb> 9 atoms in block 198 Block first atom: 3125 Blocpdb> 198 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1169297 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9402 Prepmat> Matrix trace = 2556700.0000 Prepmat> Last element read: 9402 9402 111.9539 Prepmat> 19702 lines saved. Prepmat> 17488 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3134 RTB> Total mass = 3134.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3134 RTB> Number of blocks = 198 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 273910.3143 RTB> 76698 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1188 Diagstd> Nb of non-zero elements: 76698 Diagstd> Projected matrix trace = 273910.3143 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1188 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 273910.3143 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.1614686 2.3283781 3.5217241 5.2415365 6.3489758 7.4064393 8.3903117 8.6066481 9.2533755 10.2661176 10.5674860 10.8728604 12.0583548 12.5836320 12.9976904 13.5722355 14.7835524 15.1116351 15.5940839 15.9181207 16.8718110 17.5119547 18.0084284 18.6286257 18.7494177 19.5052463 20.3591358 20.4568395 21.9144364 22.5124029 22.6566920 23.0758573 23.8601319 24.4219438 24.9492817 25.5765803 26.3601279 26.7632251 27.1140165 28.7230493 29.1328219 30.0050160 30.3507931 30.4122094 30.8909560 31.6040778 32.4610676 33.0243400 33.5351208 33.8918303 34.8164529 35.3271794 35.5677023 36.1497872 36.6942706 36.8515981 37.9388849 38.5507702 38.8571138 39.4856018 40.2696167 40.7681666 41.2714856 41.8925146 42.1609158 42.6154788 42.9685671 43.4139120 44.4632769 44.7745331 44.9437099 45.4857292 46.2065354 46.6578229 47.0608285 47.6135594 47.7081285 48.1568739 48.8226894 49.6131688 50.4302677 50.5582832 51.0814706 51.6004265 51.9235673 52.4348295 53.1888256 53.8387857 54.2985751 54.8031240 55.0706911 55.4648557 55.9392606 56.4823824 56.8145186 57.4988673 57.6485772 58.6372518 58.9005039 59.8411364 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034333 0.0034333 0.0034343 0.0034345 0.0034349 159.6503035 165.6998185 203.7853419 248.6134308 273.6195456 295.5289396 314.5461165 318.5754483 330.3279887 347.9352244 353.0052143 358.0693811 377.0850451 385.2106493 391.4969422 400.0561703 417.5271126 422.1346571 428.8201788 433.2526000 446.0423864 454.4253949 460.8219816 468.6900010 470.2070888 479.5909721 489.9761607 491.1504533 508.3471972 515.2360079 516.8845261 521.6439836 530.4344229 536.6429075 542.4057739 549.1822837 557.5310211 561.7777103 565.4473954 581.9833396 586.1200221 594.8291062 598.2466872 598.8516717 603.5468043 610.4735352 618.6951052 624.0398928 628.8473252 632.1829696 640.7484172 645.4309129 647.6243743 652.9022312 657.8008194 659.2094784 668.8635984 674.2358020 676.9094077 682.3617291 689.1028213 693.3553496 697.6222622 702.8513692 705.0993237 708.8901899 711.8208685 715.5001699 724.0957752 726.6257987 727.9972514 732.3739040 738.1540101 741.7499323 744.9464667 749.3084058 750.0521676 753.5714284 758.7629733 764.8808068 771.1536470 772.1318001 776.1166068 780.0490746 782.4877390 786.3306615 791.9640735 796.7882269 800.1833250 803.8924281 805.8524740 808.7312480 812.1825251 816.1157961 818.5118017 823.4266619 824.4979436 831.5379681 833.4024743 840.0307740 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3134 Rtb_to_modes> Number of blocs = 198 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.242 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.607 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.253 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.84 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00003 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 56412 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00003 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605200926183861763.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605200926183861763.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605200926183861763.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605200926183861763.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 395 First residue number = 1 Last residue number = 395 Number of atoms found = 3134 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.242 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.607 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.253 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.84 Bfactors> 106 vectors, 9402 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.161000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.712 for 395 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.023 +/- 0.02 Bfactors> = 95.506 +/- 5.11 Bfactors> Shiftng-fct= 95.483 Bfactors> Scaling-fct= 226.821 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605200926183861763.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605200926183861763.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.0 Chkmod> 106 vectors, 9402 coordinates in file. Chkmod> That is: 3134 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7050 0.0034 0.9832 0.0034 0.7242 0.0034 0.8523 0.0034 0.7745 0.0034 0.7832 159.6261 0.5803 165.6793 0.5771 203.7846 0.5775 248.6138 0.4786 273.6083 0.4748 295.5075 0.4433 314.5268 0.3945 318.5683 0.6812 330.3071 0.1878 347.9861 0.2715 353.0320 0.2553 358.0069 0.5098 377.0946 0.3948 385.1385 0.4002 391.5149 0.2702 400.0061 0.2302 417.4590 0.3176 422.0937 0.4584 428.7456 0.2690 433.2596 0.2270 445.9993 0.4542 454.3805 0.2934 460.8223 0.3387 468.6872 0.3465 470.1942 0.3776 479.6288 0.4858 489.9655 0.2114 491.1673 0.1355 508.2739 0.3073 515.1864 0.2658 516.9001 0.2189 521.6684 0.4721 530.4102 0.4216 536.5985 0.3574 542.3903 0.5319 549.1954 0.2766 557.5057 0.4375 561.7197 0.3792 565.3812 0.4465 581.9275 0.3164 586.0665 0.4707 594.8530 0.5079 598.2132 0.3878 598.8042 0.5454 603.5116 0.3953 610.4079 0.4604 618.6584 0.4852 623.9721 0.4469 628.8661 0.3605 632.1388 0.4733 640.7535 0.4859 645.4290 0.4657 647.6175 0.4371 652.8761 0.3441 657.7343 0.3577 659.1669 0.3562 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DQ=-80 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom making animated gifs 11 models are in 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generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605200926183861763.eigenfacs 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605200926183861763 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom making animated gifs 11 models are in 2605200926183861763.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605200926183861763.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605200926183861763.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2605200926183861763 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605200926183861763.eigenfacs 2605200926183861763.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605200926183861763.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2605200926183861763.10.pdb 2605200926183861763.11.pdb 2605200926183861763.7.pdb 2605200926183861763.8.pdb 2605200926183861763.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m21.103s user 0m21.002s sys 0m0.094s rm: cannot remove '2605200926183861763.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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