*** 1FC7C6F2933742E0 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605201334553922152.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605201334553922152.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605201334553922152.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 441
First residue number = 1
Last residue number = 115
Number of atoms found = 3289
Mean number per residue = 7.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.939894 +/- 13.262634 From: -33.038000 To: 27.649000
= 1.732355 +/- 19.462484 From: -40.478000 To: 43.193000
= 0.942270 +/- 9.404589 From: -20.349000 To: 28.362000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.5495 % Filled.
Pdbmat> 1241188 non-zero elements.
Pdbmat> 135741 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.54 +/- 23.22
Maximum number = 126
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 2.714820E+06
Pdbmat> Larger element = 498.389
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
441 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605201334553922152.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605201334553922152.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605201334553922152.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3289 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 441 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 23 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 47
Blocpdb> 15 atoms in block 4
Block first atom: 67
Blocpdb> 17 atoms in block 5
Block first atom: 82
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 99
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 115
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 133
Blocpdb> 24 atoms in block 9
Block first atom: 156
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 180
Blocpdb> 20 atoms in block 11
Block first atom: 200
Blocpdb> 23 atoms in block 12
Block first atom: 220
Blocpdb> 20 atoms in block 13
Block first atom: 243
Blocpdb> 24 atoms in block 14
Block first atom: 263
Blocpdb> 25 atoms in block 15
Block first atom: 287
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 312
Blocpdb> 22 atoms in block 17
Block first atom: 332
Blocpdb> 23 atoms in block 18
Block first atom: 354
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 377
Blocpdb> 23 atoms in block 20
Block first atom: 397
Blocpdb> 24 atoms in block 21
Block first atom: 420
Blocpdb> 29 atoms in block 22
Block first atom: 444
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 473
Blocpdb> 23 atoms in block 24
Block first atom: 496
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 519
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 542
Blocpdb> 24 atoms in block 27
Block first atom: 564
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 588
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 610
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 635
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 654
Blocpdb> 21 atoms in block 32
Block first atom: 678
Blocpdb> 31 atoms in block 33
Block first atom: 699
Blocpdb> 23 atoms in block 34
Block first atom: 730
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 753
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 775
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 799
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 821
Blocpdb> 26 atoms in block 39
Block first atom: 837
Blocpdb> 19 atoms in block 40
Block first atom: 863
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 882
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 901
Blocpdb> 27 atoms in block 43
Block first atom: 920
Blocpdb> 25 atoms in block 44
Block first atom: 947
Blocpdb> 21 atoms in block 45
Block first atom: 972
Blocpdb> 18 atoms in block 46
Block first atom: 993
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 1011
Blocpdb> 24 atoms in block 48
Block first atom: 1031
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 1055
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 1074
Blocpdb> 23 atoms in block 51
Block first atom: 1096
Blocpdb> 23 atoms in block 52
Block first atom: 1119
Blocpdb> 23 atoms in block 53
Block first atom: 1142
Blocpdb> 23 atoms in block 54
Block first atom: 1165
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1188
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 1210
Blocpdb> 23 atoms in block 57
Block first atom: 1232
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1255
Blocpdb> 24 atoms in block 59
Block first atom: 1277
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 1301
Blocpdb> 30 atoms in block 61
Block first atom: 1320
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 1350
Blocpdb> 28 atoms in block 63
Block first atom: 1371
Blocpdb> 27 atoms in block 64
Block first atom: 1399
Blocpdb> 23 atoms in block 65
Block first atom: 1426
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1449
Blocpdb> 21 atoms in block 67
Block first atom: 1475
Blocpdb> 26 atoms in block 68
Block first atom: 1496
Blocpdb> 22 atoms in block 69
Block first atom: 1522
Blocpdb> 25 atoms in block 70
Block first atom: 1544
Blocpdb> 24 atoms in block 71
Block first atom: 1569
Blocpdb> 19 atoms in block 72
Block first atom: 1593
Blocpdb> 27 atoms in block 73
Block first atom: 1612
Blocpdb> 25 atoms in block 74
Block first atom: 1639
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1664
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1683
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1703
Blocpdb> 20 atoms in block 78
Block first atom: 1725
Blocpdb> 24 atoms in block 79
Block first atom: 1745
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1769
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1788
Blocpdb> 19 atoms in block 82
Block first atom: 1803
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 1822
Blocpdb> 28 atoms in block 84
Block first atom: 1842
Blocpdb> 26 atoms in block 85
Block first atom: 1870
Blocpdb> 20 atoms in block 86
Block first atom: 1896
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1916
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 1933
Blocpdb> 19 atoms in block 89
Block first atom: 1954
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 1973
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 1997
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 2021
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 2039
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2058
Blocpdb> 24 atoms in block 95
Block first atom: 2080
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 2104
Blocpdb> 27 atoms in block 97
Block first atom: 2126
Blocpdb> 18 atoms in block 98
Block first atom: 2153
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 2171
Blocpdb> 24 atoms in block 100
Block first atom: 2190
Blocpdb> 25 atoms in block 101
Block first atom: 2214
Blocpdb> 23 atoms in block 102
Block first atom: 2239
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 2262
Blocpdb> 24 atoms in block 104
Block first atom: 2284
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 2308
Blocpdb> 25 atoms in block 106
Block first atom: 2332
Blocpdb> 26 atoms in block 107
Block first atom: 2357
Blocpdb> 27 atoms in block 108
Block first atom: 2383
Blocpdb> 22 atoms in block 109
Block first atom: 2410
Blocpdb> 25 atoms in block 110
Block first atom: 2432
Blocpdb> 24 atoms in block 111
Block first atom: 2457
Blocpdb> 14 atoms in block 112
Block first atom: 2481
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 2495
Blocpdb> 20 atoms in block 114
Block first atom: 2514
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 2534
Blocpdb> 25 atoms in block 116
Block first atom: 2552
Blocpdb> 16 atoms in block 117
Block first atom: 2577
Blocpdb> 14 atoms in block 118
Block first atom: 2593
Blocpdb> 30 atoms in block 119
Block first atom: 2607
Blocpdb> 25 atoms in block 120
Block first atom: 2637
Blocpdb> 26 atoms in block 121
Block first atom: 2662
Blocpdb> 31 atoms in block 122
Block first atom: 2688
Blocpdb> 16 atoms in block 123
Block first atom: 2719
Blocpdb> 21 atoms in block 124
Block first atom: 2735
Blocpdb> 21 atoms in block 125
Block first atom: 2756
Blocpdb> 18 atoms in block 126
Block first atom: 2777
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 2795
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 2815
Blocpdb> 31 atoms in block 129
Block first atom: 2833
Blocpdb> 19 atoms in block 130
Block first atom: 2864
Blocpdb> 20 atoms in block 131
Block first atom: 2883
Blocpdb> 29 atoms in block 132
Block first atom: 2903
Blocpdb> 25 atoms in block 133
Block first atom: 2932
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 2957
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 2979
Blocpdb> 28 atoms in block 136
Block first atom: 3003
Blocpdb> 25 atoms in block 137
Block first atom: 3031
Blocpdb> 25 atoms in block 138
Block first atom: 3056
Blocpdb> 22 atoms in block 139
Block first atom: 3081
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 3103
Blocpdb> 30 atoms in block 141
Block first atom: 3122
Blocpdb> 18 atoms in block 142
Block first atom: 3152
Blocpdb> 21 atoms in block 143
Block first atom: 3170
Blocpdb> 25 atoms in block 144
Block first atom: 3191
Blocpdb> 27 atoms in block 145
Block first atom: 3216
Blocpdb> 19 atoms in block 146
Block first atom: 3243
Blocpdb> 21 atoms in block 147
Block first atom: 3262
Blocpdb> 7 atoms in block 148
Block first atom: 3282
Blocpdb> 148 blocks.
Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1241336 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9867
Prepmat> Matrix trace = 2714820.0000
Prepmat> Last element read: 9867 9867 121.0453
Prepmat> 11027 lines saved.
Prepmat> 9494 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3289
RTB> Total mass = 3289.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3289
RTB> Number of blocks = 148
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 194663.6408
RTB> 52932 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 888
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52932
Diagstd> Projected matrix trace = 194663.6408
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 888 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 194663.6408
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.9589566 1.1606148 2.0317747 3.1722590
4.5526220 5.2442528 6.4069422 8.4142747 9.2885905
10.4944236 11.7631665 12.4253423 13.9169119 15.0890797
15.7135794 16.1091763 17.6184923 18.9088459 19.4988269
20.3673714 21.0523057 21.8337886 22.2008933 23.5858261
23.9015150 25.0737285 26.2782999 26.8755867 27.7559432
28.0115977 28.3805210 29.3583257 30.3732193 31.6628236
32.1788043 32.6334923 32.7210099 33.4261007 33.7375853
33.9754854 34.2600542 35.1460713 36.4501485 36.7448475
37.3026458 37.6391075 38.4803680 39.7187428 40.4467644
40.8790799 41.4503525 42.1432290 42.6268034 43.4590414
43.7989789 45.0373994 45.9069131 46.1562293 47.0557293
47.3893393 48.1036192 48.8148166 49.0236738 49.4303809
50.7713481 51.0434840 51.6464962 52.2491629 52.6691091
52.9354078 53.9525809 54.4209636 54.9734399 55.7913745
55.8805745 56.4069462 56.9223470 57.5518750 58.0829724
58.5960432 59.8511733 60.2490576 60.7703488 60.8614160
61.6705749 62.6176339 62.8896888 63.9042254 64.4290741
64.4700312 65.0502944 65.4375521 66.2123740 66.6075374
67.3619991 67.8419923 68.3279035 68.9628894 69.5918069
70.1414319
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034334 0.0034334 0.0034336 0.0034340
0.0034349 106.3395365 116.9874631 154.7864905 193.4103017
231.7000232 248.6778429 274.8657864 314.9949736 330.9559461
351.7827792 372.4409304 382.7801968 405.1041749 421.8195038
430.4600410 435.8448796 455.8055941 472.2019661 479.5120464
490.0752520 498.2474840 507.4109447 511.6588676 527.3765637
530.8942177 543.7568483 556.6649955 562.9557469 572.1017484
574.7304675 578.5027963 588.3840923 598.4676689 611.0406473
615.9993182 620.3361021 621.1673637 627.8243261 630.7427660
632.9626958 635.6079243 643.7743563 655.6090368 658.2539968
663.2314293 666.2158164 673.6198689 684.3732518 690.6168543
694.2978756 699.1323439 704.9514109 708.9843735 715.8719599
718.6662880 728.7556465 735.7568691 737.7520777 744.9061071
747.5420153 753.1546413 758.7017942 760.3231381 763.4704967
773.7570656 775.8279741 780.3972172 784.9372667 788.0853721
790.0751671 797.6298394 801.0846201 805.1406183 811.1082354
811.7563818 815.5706235 819.2881612 823.8061293 827.5985042
831.2457265 840.1012181 842.8890448 846.5276441 847.1616869
852.7746437 859.2976156 861.1622886 868.0806342 871.6381401
871.9151435 875.8301947 878.4333241 883.6186224 886.2514707
891.2566098 894.4263330 897.6237359 901.7849953 905.8876453
909.4578878
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3289
Rtb_to_modes> Number of blocs = 148
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.96
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.14
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 888 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999
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1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
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1.00000 0.99997 1.00001 0.99996 0.99999
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1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 59202 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00003 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998
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1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
1.00000 0.99997 1.00001 0.99996 0.99999
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
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0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
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1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605201334553922152.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605201334553922152.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605201334553922152.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605201334553922152.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 441
First residue number = 1
Last residue number = 115
Number of atoms found = 3289
Mean number per residue = 7.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.161
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.14
Bfactors> 106 vectors, 9867 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.959000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.186 for 441 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.027 +/- 0.02
Bfactors> = 93.314 +/- 9.22
Bfactors> Shiftng-fct= 93.287
Bfactors> Scaling-fct= 420.755
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605201334553922152.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605201334553922152.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.4
Chkmod> 106 vectors, 9867 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3289 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8441
0.0034 0.9652
0.0034 0.7251
0.0034 0.8175
0.0034 0.7401
0.0034 0.7934
106.3374 0.6068
117.0019 0.6070
154.7884 0.6061
193.3941 0.5815
231.6997 0.6319
248.6612 0.7072
274.8552 0.6868
314.9763 0.5345
330.9490 0.4463
351.6935 0.4592
372.3748 0.0997
382.8355 0.2476
405.1317 0.4019
421.8143 0.5107
430.3925 0.5571
435.8373 0.3895
455.8055 0.2117
472.1961 0.4049
479.5059 0.2890
490.0858 0.2931
498.1988 0.4275
507.3451 0.3778
511.6266 0.2888
527.4006 0.2870
530.8546 0.3282
543.6931 0.3705
556.6591 0.5033
562.9778 0.4684
572.1190 0.2723
574.6894 0.3758
578.4727 0.3912
588.3756 0.3446
598.4103 0.4785
610.9872 0.3207
615.9843 0.4517
620.2763 0.3717
621.1311 0.2824
627.8340 0.4143
630.7383 0.3840
632.9776 0.5572
635.5801 0.2417
643.7827 0.3970
655.5796 0.2896
658.1823 0.3558
663.1794 0.3050
666.1951 0.4187
673.5877 0.4689
684.3547 0.4794
690.6148 0.4125
694.2759 0.4916
699.0994 0.5512
704.8941 0.3743
708.9805 0.0917
715.8491 0.4860
718.6438 0.3605
728.7454 0.3824
735.7500 0.4908
737.7505 0.4824
744.9079 0.5217
747.5151 0.3751
753.0940 0.3342
758.6318 0.4220
760.2620 0.3217
763.4348 0.5629
773.7136 0.4505
775.7682 0.4134
780.3902 0.4974
784.9099 0.3620
788.0582 0.3308
790.0755 0.3008
797.5765 0.4060
801.0431 0.5066
805.0809 0.4933
811.0634 0.4577
811.7174 0.4862
815.5577 0.4559
819.2361 0.3733
823.7573 0.4870
827.5418 0.3681
831.2381 0.3729
840.0569 0.5284
842.8595 0.4266
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847.1155 0.3657
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.559s
user 0m11.457s
sys 0m0.097s
rm: cannot remove '2605201334553922152.sdijf': No such file or directory
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