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LOGs for ID: 260522105707376201

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260522105707376201.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260522105707376201.atom to be opened. Openam> File opened: 260522105707376201.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 294 First residue number = 1 Last residue number = 294 Number of atoms found = 2272 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.482820 +/- 11.325395 From: -28.046000 To: 27.998000 = 1.740679 +/- 8.954936 From: -18.294000 To: 26.053000 = 1.657807 +/- 11.944019 From: -26.313000 To: 27.450000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.6836 % Filled. Pdbmat> 855778 non-zero elements. Pdbmat> 93589 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.38 +/- 22.97 Maximum number = 127 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 1.871780E+06 Pdbmat> Larger element = 496.693 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 294 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260522105707376201.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260522105707376201.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260522105707376201.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2272 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 294 residues. Blocpdb> 15 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 16 Blocpdb> 16 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 48 Blocpdb> 11 atoms in block 5 Block first atom: 63 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 74 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 90 Blocpdb> 13 atoms in block 8 Block first atom: 102 Blocpdb> 17 atoms in block 9 Block first atom: 115 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 132 Blocpdb> 13 atoms in block 11 Block first atom: 150 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 163 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 179 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 192 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 208 Blocpdb> 11 atoms in block 16 Block first atom: 222 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 233 Blocpdb> 12 atoms in block 18 Block first atom: 248 Blocpdb> 14 atoms in block 19 Block first atom: 260 Blocpdb> 15 atoms in block 20 Block first atom: 274 Blocpdb> 22 atoms in block 21 Block first atom: 289 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 311 Blocpdb> 13 atoms in block 23 Block first atom: 328 Blocpdb> 11 atoms in block 24 Block first atom: 341 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 352 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 368 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 388 Blocpdb> 19 atoms in block 28 Block first atom: 404 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 423 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 437 Blocpdb> 13 atoms in block 31 Block first atom: 448 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 461 Blocpdb> 13 atoms in block 33 Block first atom: 478 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 491 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 505 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 521 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 536 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 551 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 566 Blocpdb> 20 atoms in block 40 Block first atom: 575 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 595 Blocpdb> 18 atoms in block 42 Block first atom: 610 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 628 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 651 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 664 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 679 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 694 Blocpdb> 13 atoms in block 48 Block first atom: 707 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 720 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 734 Blocpdb> 18 atoms in block 51 Block first atom: 747 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 765 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 778 Blocpdb> 15 atoms in block 54 Block first atom: 800 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 815 Blocpdb> 11 atoms in block 56 Block first atom: 834 Blocpdb> 19 atoms in block 57 Block first atom: 845 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 864 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 876 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 896 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 911 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 927 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 946 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 968 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 984 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 998 Blocpdb> 9 atoms in block 67 Block first atom: 1013 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1022 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1038 Blocpdb> 16 atoms in block 70 Block first atom: 1053 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1069 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1086 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1104 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1122 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1135 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1152 Blocpdb> 12 atoms in block 77 Block first atom: 1166 Blocpdb> 14 atoms in block 78 Block first atom: 1178 Blocpdb> 12 atoms in block 79 Block first atom: 1192 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1204 Blocpdb> 9 atoms in block 81 Block first atom: 1220 Blocpdb> 11 atoms in block 82 Block first atom: 1229 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1240 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1252 Blocpdb> 17 atoms in block 85 Block first atom: 1271 Blocpdb> 11 atoms in block 86 Block first atom: 1288 Blocpdb> 21 atoms in block 87 Block first atom: 1299 Blocpdb> 17 atoms in block 88 Block first atom: 1320 Blocpdb> 21 atoms in block 89 Block first atom: 1337 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1358 Blocpdb> 23 atoms in block 91 Block first atom: 1373 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 1396 Blocpdb> 12 atoms in block 93 Block first atom: 1415 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1427 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1439 Blocpdb> 13 atoms in block 96 Block first atom: 1454 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1467 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 1482 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1504 Blocpdb> 18 atoms in block 100 Block first atom: 1520 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1538 Blocpdb> 12 atoms in block 102 Block first atom: 1552 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1564 Blocpdb> 23 atoms in block 104 Block first atom: 1583 Blocpdb> 12 atoms in block 105 Block first atom: 1606 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1618 Blocpdb> 13 atoms in block 107 Block first atom: 1634 Blocpdb> 11 atoms in block 108 Block first atom: 1647 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1658 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1671 Blocpdb> 13 atoms in block 111 Block first atom: 1687 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 1700 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1718 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1733 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1749 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 1766 Blocpdb> 11 atoms in block 117 Block first atom: 1785 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1796 Blocpdb> 12 atoms in block 119 Block first atom: 1811 Blocpdb> 14 atoms in block 120 Block first atom: 1823 Blocpdb> 23 atoms in block 121 Block first atom: 1837 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1860 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1872 Blocpdb> 19 atoms in block 124 Block first atom: 1887 Blocpdb> 9 atoms in block 125 Block first atom: 1906 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 1915 Blocpdb> 22 atoms in block 127 Block first atom: 1933 Blocpdb> 25 atoms in block 128 Block first atom: 1955 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 1980 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 1995 Blocpdb> 13 atoms in block 131 Block first atom: 2009 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 2022 Blocpdb> 13 atoms in block 133 Block first atom: 2037 Blocpdb> 8 atoms in block 134 Block first atom: 2050 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2058 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2073 Blocpdb> 12 atoms in block 137 Block first atom: 2088 Blocpdb> 14 atoms in block 138 Block first atom: 2100 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2114 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 2127 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2144 Blocpdb> 13 atoms in block 142 Block first atom: 2160 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2173 Blocpdb> 20 atoms in block 144 Block first atom: 2193 Blocpdb> 20 atoms in block 145 Block first atom: 2213 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 2233 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 2252 Blocpdb> 147 blocks. Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 855925 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6816 Prepmat> Matrix trace = 1871780.0000 Prepmat> Last element read: 6816 6816 65.3660 Prepmat> 10879 lines saved. Prepmat> 9240 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2272 RTB> Total mass = 2272.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2272 RTB> Number of blocks = 147 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 208718.7140 RTB> 56763 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 882 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56763 Diagstd> Projected matrix trace = 208718.7140 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 882 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 208718.7140 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.0426558 4.4787585 4.9704526 5.4795572 6.2347855 7.3797012 8.1734967 8.6978464 9.6001717 10.0007156 10.3169587 11.5206375 12.3744947 12.6108101 13.4001943 15.2243056 15.5093383 16.0713651 16.3816700 17.1206509 17.6619887 18.2775091 20.0483443 20.8913559 21.2152695 21.3776505 22.2457463 23.2367375 24.5720221 24.8013273 25.2372917 25.9913499 26.7130494 27.2134977 27.6135832 28.9176687 29.2080152 30.3841173 31.1386294 31.8459023 33.2988891 33.5847996 34.0087812 36.6784233 37.1772488 38.6967904 39.4064385 40.3168812 40.9611895 42.5822698 42.8693219 44.4931806 44.8163567 46.2432840 46.4015823 47.2052438 47.6954883 48.6940044 49.6223381 49.6885945 50.4128089 51.0449001 52.3876296 52.6001588 53.4454224 53.7866919 54.5358561 55.6635134 56.7154577 57.1058252 58.0074381 58.5305233 60.1026642 60.3004430 60.5388258 61.8194235 62.3864365 63.0536436 63.7944667 64.4529092 65.1955069 65.6559514 67.0551471 67.3244735 67.4440356 67.7866369 68.5987083 69.4396589 70.1407603 71.4273767 71.7448225 72.5524704 73.1879027 74.0885246 74.3798505 75.9256598 76.0210675 76.9633400 77.8263743 78.3359970 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034332 0.0034333 0.0034339 0.0034343 0.0034347 189.4181961 229.8127423 242.0991416 254.1955915 271.1477701 294.9950091 310.4554061 320.2588546 336.4610383 343.4083252 348.7957027 368.5815028 381.9961770 385.6264132 397.5125357 423.7054272 427.6533863 435.3330749 439.5156727 449.3196539 456.3678912 464.2520017 486.2219229 496.3392203 500.1722088 502.0827112 512.1754650 523.4592231 538.2892774 540.7950924 545.5275071 553.6173573 561.2508529 566.4837577 570.6327103 583.9516898 586.8759374 598.5750251 605.9614921 612.8046600 626.6285137 629.3129385 633.2727704 657.6587603 662.1157279 675.5115090 681.6773642 689.5071033 694.9948079 708.6139273 710.9983410 724.3392291 726.9650871 738.4474827 739.7103159 746.0885979 749.9527982 757.7623544 764.9514847 765.4620012 771.0201502 775.8387360 785.9766687 787.5693533 793.8720965 796.4026518 801.9297916 810.1782643 817.7979185 820.6075079 827.0602015 830.7808627 841.8643946 843.2484112 844.9135537 853.8031560 857.7097960 862.2840923 867.3348278 871.7993536 876.8072123 879.8979985 889.2243366 891.0083275 891.7991517 894.0613569 899.4007584 904.8968359 909.4535336 917.7568406 919.7939805 924.9566576 928.9983256 934.6967949 936.5326677 946.2144319 946.8087485 952.6584712 957.9849347 961.1163559 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2272 Rtb_to_modes> Number of blocs = 147 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 0.99997 0.99996 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99996 0.99997 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00004 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260522105707376201.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260522105707376201.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260522105707376201.atom Openam> file on opening on unit 11: 260522105707376201.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 294 First residue number = 1 Last residue number = 294 Number of atoms found = 2272 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.970 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58 Rdmodfacs> Numero du 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Valeur propre du vecteur en lecture: 49.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.72 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.34 Bfactors> 106 vectors, 6816 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.043000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.393 for 294 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.023 +/- 0.03 Bfactors> = 88.085 +/- 12.55 Bfactors> Shiftng-fct= 88.062 Bfactors> Scaling-fct= 476.584 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260522105707376201.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260522105707376201.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 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vecteur en lecture: 561.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.8 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vecteur en lecture: 830.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.1 Chkmod> 106 vectors, 6816 coordinates in file. Chkmod> That is: 2272 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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