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***  CELL ADHESION/IMMUNE SYSTEM 21-SEP-11 3VI3  ***

LOGs for ID: 260522123717486593

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260522123717486593.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260522123717486593.atom to be opened. Openam> File opened: 260522123717486593.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2923 First residue number = 1 Last residue number = 218 Number of atoms found = 22435 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.914649 +/- 30.666965 From: -81.258000 To: 54.285000 = -24.316360 +/- 29.981727 From: -90.577000 To: 57.637000 = -26.792525 +/- 37.432741 From: -112.495000 To: 58.066000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 7.2684 % Filled. Pdbmat> 8542681 non-zero elements. Pdbmat> 934384 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.30 +/- 23.56 Maximum number = 137 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.868768E+07 Pdbmat> Larger element = 520.898 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 2923 non-zero elements, NRBL set to 15 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260522123717486593.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 15 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260522123717486593.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260522123717486593.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 22435 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 15 residue(s) per block. Blocpdb> 2923 residues. Blocpdb> 105 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 121 atoms in block 2 Block first atom: 106 Blocpdb> 98 atoms in block 3 Block first atom: 227 Blocpdb> 111 atoms in block 4 Block first atom: 325 Blocpdb> 109 atoms in block 5 Block first atom: 436 Blocpdb> 106 atoms in block 6 Block first atom: 545 Blocpdb> 124 atoms in block 7 Block first atom: 651 Blocpdb> 107 atoms in block 8 Block first atom: 775 Blocpdb> 119 atoms in block 9 Block first atom: 882 Blocpdb> 127 atoms in block 10 Block first atom: 1001 Blocpdb> 116 atoms in block 11 Block first atom: 1128 Blocpdb> 110 atoms in block 12 Block first atom: 1244 Blocpdb> 111 atoms in block 13 Block first atom: 1354 Blocpdb> 130 atoms in block 14 Block first atom: 1465 Blocpdb> 114 atoms in block 15 Block first atom: 1595 Blocpdb> 119 atoms in block 16 Block first atom: 1709 Blocpdb> 104 atoms in block 17 Block first atom: 1828 Blocpdb> 115 atoms in block 18 Block first atom: 1932 Blocpdb> 126 atoms in block 19 Block first atom: 2047 Blocpdb> 100 atoms in block 20 Block first atom: 2173 Blocpdb> 112 atoms in block 21 Block first atom: 2273 Blocpdb> 127 atoms in block 22 Block first atom: 2385 Blocpdb> 105 atoms in block 23 Block first atom: 2512 Blocpdb> 112 atoms in block 24 Block first atom: 2617 Blocpdb> 112 atoms in block 25 Block first atom: 2729 Blocpdb> 104 atoms in block 26 Block first atom: 2841 Blocpdb> 103 atoms in block 27 Block first atom: 2945 Blocpdb> 118 atoms in block 28 Block first atom: 3048 Blocpdb> 109 atoms in block 29 Block first atom: 3166 Blocpdb> 113 atoms in block 30 Block first atom: 3275 Blocpdb> 108 atoms in block 31 Block first atom: 3388 Blocpdb> 110 atoms in block 32 Block first atom: 3496 Blocpdb> 110 atoms in block 33 Block first atom: 3606 Blocpdb> 121 atoms in block 34 Block first atom: 3716 Blocpdb> 118 atoms in block 35 Block first atom: 3837 Blocpdb> 113 atoms in block 36 Block first atom: 3955 Blocpdb> 131 atoms in block 37 Block first atom: 4068 Blocpdb> 124 atoms in block 38 Block first atom: 4199 Blocpdb> 110 atoms in block 39 Block first atom: 4323 Blocpdb> 127 atoms in block 40 Block first atom: 4433 Blocpdb> 8 atoms in block 41 Block first atom: 4560 Blocpdb> 109 atoms in block 42 Block first atom: 4568 Blocpdb> 61 atoms in block 43 Block first atom: 4677 Blocpdb> 114 atoms in block 44 Block first atom: 4738 Blocpdb> 120 atoms in block 45 Block first atom: 4852 Blocpdb> 116 atoms in block 46 Block first atom: 4972 Blocpdb> 127 atoms in block 47 Block first atom: 5088 Blocpdb> 127 atoms in block 48 Block first atom: 5215 Blocpdb> 127 atoms in block 49 Block first atom: 5342 Blocpdb> 117 atoms in block 50 Block first atom: 5469 Blocpdb> 130 atoms in block 51 Block first atom: 5586 Blocpdb> 116 atoms in block 52 Block first atom: 5716 Blocpdb> 114 atoms in block 53 Block first atom: 5832 Blocpdb> 117 atoms in block 54 Block first atom: 5946 Blocpdb> 119 atoms in block 55 Block first atom: 6063 Blocpdb> 107 atoms in block 56 Block first atom: 6182 Blocpdb> 113 atoms in block 57 Block first atom: 6289 Blocpdb> 113 atoms in block 58 Block first atom: 6402 Blocpdb> 104 atoms in block 59 Block first atom: 6515 Blocpdb> 135 atoms in block 60 Block first atom: 6619 Blocpdb> 118 atoms in block 61 Block first atom: 6754 Blocpdb> 127 atoms in block 62 Block first atom: 6872 Blocpdb> 105 atoms in block 63 Block first atom: 6999 Blocpdb> 115 atoms in block 64 Block first atom: 7104 Blocpdb> 109 atoms in block 65 Block first atom: 7219 Blocpdb> 113 atoms in block 66 Block first atom: 7328 Blocpdb> 106 atoms in block 67 Block first atom: 7441 Blocpdb> 119 atoms in block 68 Block first atom: 7547 Blocpdb> 122 atoms in block 69 Block first atom: 7666 Blocpdb> 107 atoms in block 70 Block first atom: 7788 Blocpdb> 105 atoms in block 71 Block first atom: 7895 Blocpdb> 121 atoms in block 72 Block first atom: 8000 Blocpdb> 98 atoms in block 73 Block first atom: 8121 Blocpdb> 111 atoms in block 74 Block first atom: 8219 Blocpdb> 109 atoms in block 75 Block first atom: 8330 Blocpdb> 106 atoms in block 76 Block first atom: 8439 Blocpdb> 124 atoms in block 77 Block first atom: 8545 Blocpdb> 107 atoms in block 78 Block first atom: 8669 Blocpdb> 119 atoms in block 79 Block first atom: 8776 Blocpdb> 127 atoms in block 80 Block first atom: 8895 Blocpdb> 116 atoms in block 81 Block first atom: 9022 Blocpdb> 110 atoms in block 82 Block first atom: 9138 Blocpdb> 111 atoms in block 83 Block first atom: 9248 Blocpdb> 130 atoms in block 84 Block first atom: 9359 Blocpdb> 114 atoms in block 85 Block first atom: 9489 Blocpdb> 119 atoms in block 86 Block first atom: 9603 Blocpdb> 104 atoms in block 87 Block first atom: 9722 Blocpdb> 115 atoms in block 88 Block first atom: 9826 Blocpdb> 126 atoms in block 89 Block first atom: 9941 Blocpdb> 100 atoms in block 90 Block first atom: 10067 Blocpdb> 112 atoms in block 91 Block first atom: 10167 Blocpdb> 127 atoms in block 92 Block first atom: 10279 Blocpdb> 105 atoms in block 93 Block first atom: 10406 Blocpdb> 112 atoms in block 94 Block first atom: 10511 Blocpdb> 112 atoms in block 95 Block first atom: 10623 Blocpdb> 104 atoms in block 96 Block first atom: 10735 Blocpdb> 103 atoms in block 97 Block first atom: 10839 Blocpdb> 118 atoms in block 98 Block first atom: 10942 Blocpdb> 109 atoms in block 99 Block first atom: 11060 Blocpdb> 113 atoms in block 100 Block first atom: 11169 Blocpdb> 108 atoms in block 101 Block first atom: 11282 Blocpdb> 110 atoms in block 102 Block first atom: 11390 Blocpdb> 110 atoms in block 103 Block first atom: 11500 Blocpdb> 121 atoms in block 104 Block first atom: 11610 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 11731 Blocpdb> 117 atoms in block 106 Block first atom: 11749 Blocpdb> 121 atoms in block 107 Block first atom: 11866 Blocpdb> 56 atoms in block 108 Block first atom: 11987 Blocpdb> 117 atoms in block 109 Block first atom: 12043 Blocpdb> 117 atoms in block 110 Block first atom: 12160 Blocpdb> 88 atoms in block 111 Block first atom: 12277 Blocpdb> 108 atoms in block 112 Block first atom: 12365 Blocpdb> 102 atoms in block 113 Block first atom: 12473 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12575 Blocpdb> 120 atoms in block 115 Block first atom: 12689 Blocpdb> 116 atoms in block 116 Block first atom: 12809 Blocpdb> 127 atoms in block 117 Block first atom: 12925 Blocpdb> 127 atoms in block 118 Block first atom: 13052 Blocpdb> 127 atoms in block 119 Block first atom: 13179 Blocpdb> 117 atoms in block 120 Block first atom: 13306 Blocpdb> 130 atoms in block 121 Block first atom: 13423 Blocpdb> 116 atoms in block 122 Block first atom: 13553 Blocpdb> 114 atoms in block 123 Block first atom: 13669 Blocpdb> 117 atoms in block 124 Block first atom: 13783 Blocpdb> 119 atoms in block 125 Block first atom: 13900 Blocpdb> 107 atoms in block 126 Block first atom: 14019 Blocpdb> 113 atoms in block 127 Block first atom: 14126 Blocpdb> 113 atoms in block 128 Block first atom: 14239 Blocpdb> 104 atoms in block 129 Block first atom: 14352 Blocpdb> 135 atoms in block 130 Block first atom: 14456 Blocpdb> 118 atoms in block 131 Block first atom: 14591 Blocpdb> 127 atoms in block 132 Block first atom: 14709 Blocpdb> 105 atoms in block 133 Block first atom: 14836 Blocpdb> 115 atoms in block 134 Block first atom: 14941 Blocpdb> 109 atoms in block 135 Block first atom: 15056 Blocpdb> 113 atoms in block 136 Block first atom: 15165 Blocpdb> 106 atoms in block 137 Block first atom: 15278 Blocpdb> 119 atoms in block 138 Block first atom: 15384 Blocpdb> 122 atoms in block 139 Block first atom: 15503 Blocpdb> 107 atoms in block 140 Block first atom: 15625 Blocpdb> 108 atoms in block 141 Block first atom: 15732 Blocpdb> 108 atoms in block 142 Block first atom: 15840 Blocpdb> 135 atoms in block 143 Block first atom: 15948 Blocpdb> 118 atoms in block 144 Block first atom: 16083 Blocpdb> 96 atoms in block 145 Block first atom: 16201 Blocpdb> 115 atoms in block 146 Block first atom: 16297 Blocpdb> 130 atoms in block 147 Block first atom: 16412 Blocpdb> 109 atoms in block 148 Block first atom: 16542 Blocpdb> 103 atoms in block 149 Block first atom: 16651 Blocpdb> 124 atoms in block 150 Block first atom: 16754 Blocpdb> 121 atoms in block 151 Block first atom: 16878 Blocpdb> 122 atoms in block 152 Block first atom: 16999 Blocpdb> 125 atoms in block 153 Block first atom: 17121 Blocpdb> 112 atoms in block 154 Block first atom: 17246 Blocpdb> 75 atoms in block 155 Block first atom: 17358 Blocpdb> 112 atoms in block 156 Block first atom: 17433 Blocpdb> 109 atoms in block 157 Block first atom: 17545 Blocpdb> 132 atoms in block 158 Block first atom: 17654 Blocpdb> 123 atoms in block 159 Block first atom: 17786 Blocpdb> 117 atoms in block 160 Block first atom: 17909 Blocpdb> 113 atoms in block 161 Block first atom: 18026 Blocpdb> 116 atoms in block 162 Block first atom: 18139 Blocpdb> 111 atoms in block 163 Block first atom: 18255 Blocpdb> 100 atoms in block 164 Block first atom: 18366 Blocpdb> 110 atoms in block 165 Block first atom: 18466 Blocpdb> 114 atoms in block 166 Block first atom: 18576 Blocpdb> 115 atoms in block 167 Block first atom: 18690 Blocpdb> 107 atoms in block 168 Block first atom: 18805 Blocpdb> 106 atoms in block 169 Block first atom: 18912 Blocpdb> 66 atoms in block 170 Block first atom: 19018 Blocpdb> 108 atoms in block 171 Block first atom: 19084 Blocpdb> 108 atoms in block 172 Block first atom: 19192 Blocpdb> 135 atoms in block 173 Block first atom: 19300 Blocpdb> 118 atoms in block 174 Block first atom: 19435 Blocpdb> 96 atoms in block 175 Block first atom: 19553 Blocpdb> 115 atoms in block 176 Block first atom: 19649 Blocpdb> 130 atoms in block 177 Block first atom: 19764 Blocpdb> 109 atoms in block 178 Block first atom: 19894 Blocpdb> 103 atoms in block 179 Block first atom: 20003 Blocpdb> 124 atoms in block 180 Block first atom: 20106 Blocpdb> 121 atoms in block 181 Block first atom: 20230 Blocpdb> 122 atoms in block 182 Block first atom: 20351 Blocpdb> 125 atoms in block 183 Block first atom: 20473 Blocpdb> 112 atoms in block 184 Block first atom: 20598 Blocpdb> 75 atoms in block 185 Block first atom: 20710 Blocpdb> 112 atoms in block 186 Block first atom: 20785 Blocpdb> 109 atoms in block 187 Block first atom: 20897 Blocpdb> 132 atoms in block 188 Block first atom: 21006 Blocpdb> 123 atoms in block 189 Block first atom: 21138 Blocpdb> 117 atoms in block 190 Block first atom: 21261 Blocpdb> 113 atoms in block 191 Block first atom: 21378 Blocpdb> 116 atoms in block 192 Block first atom: 21491 Blocpdb> 111 atoms in block 193 Block first atom: 21607 Blocpdb> 100 atoms in block 194 Block first atom: 21718 Blocpdb> 110 atoms in block 195 Block first atom: 21818 Blocpdb> 114 atoms in block 196 Block first atom: 21928 Blocpdb> 115 atoms in block 197 Block first atom: 22042 Blocpdb> 107 atoms in block 198 Block first atom: 22157 Blocpdb> 106 atoms in block 199 Block first atom: 22264 Blocpdb> 66 atoms in block 200 Block first atom: 22369 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 135 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 8542881 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 67305 Prepmat> Matrix trace = 18687680.0001 Prepmat> Last element read: 67305 67305 52.6474 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18530 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 22435 RTB> Total mass = 22435.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 22435 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 192994.5512 RTB> 53520 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53520 Diagstd> Projected matrix trace = 192994.5512 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 192994.5512 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0069509 0.0149616 0.0263427 0.0663612 0.1080658 0.1550385 0.1755008 0.2077780 0.3490711 0.3935036 0.4416021 0.4862033 0.6587656 0.7628912 0.8480287 0.9051850 1.0041898 1.0870244 1.1887787 1.2860459 1.3210150 1.5370075 1.8346215 1.8938640 2.2009534 2.3895572 2.9112320 2.9788865 3.2979147 3.4456744 3.7259450 3.7666647 4.2947282 4.4260247 4.5581121 4.7713438 4.9941171 5.0446677 5.3793034 5.4886707 5.8843963 6.1814748 7.0244871 7.1172034 7.5828279 7.7017362 8.1698493 8.6325460 8.8998470 9.3456108 9.5317859 9.5727597 9.9251513 10.3404929 10.3548477 10.8746819 11.2477115 11.4248429 11.5097679 11.6691567 11.9804376 12.6810939 13.1194861 13.6175886 13.9616886 14.0392537 14.5146426 14.6499623 14.7819339 14.8490794 15.1745689 15.6721297 15.7678141 16.3432003 16.5220333 16.6920299 16.8713377 16.9678683 17.1394738 17.5195183 17.9812040 18.6106393 18.7639503 18.8479150 19.1914839 19.6236471 19.7273635 20.2790817 20.5771320 20.6567358 21.0626274 21.2432112 21.5824493 22.0189396 22.3075977 22.5825353 23.1033627 23.2001021 23.4005806 23.8473632 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034325 0.0034326 0.0034334 0.0034336 0.0034341 9.0534908 13.2826434 17.6248515 27.9738673 35.6976356 42.7577716 45.4919727 49.4988499 64.1582096 68.1192175 72.1623757 75.7188893 88.1375010 94.8476540 100.0001264 103.3151353 108.8186120 113.2178575 118.3983872 123.1469106 124.8099333 134.6273422 147.0850452 149.4409679 161.1019171 167.8626193 185.2821942 187.4227285 197.2036679 201.5730193 209.6107248 210.7529990 225.0417621 228.4558054 231.8396877 237.2005205 242.6747778 243.8998655 251.8594798 254.4068898 263.4184782 269.9860532 287.8078209 289.7009839 299.0273279 301.3627711 310.3861278 319.0543954 323.9563897 331.9702199 335.2605242 335.9803357 342.1084877 349.1932988 349.4355926 358.0993729 364.1894527 367.0459184 368.4075854 370.9496935 375.8647707 386.6995256 393.3269383 400.7240292 405.7553497 406.8808890 413.7123197 415.6363605 417.5042576 418.4514188 423.0127533 429.8919270 431.2022572 438.9993043 441.3946107 443.6595729 446.0361309 447.3103241 449.5665834 454.5235196 460.4735245 468.4636810 470.3892817 471.4405527 475.7179720 481.0443774 482.3139281 489.0118947 492.5923945 493.5442858 498.3696114 500.5014774 504.4819644 509.5578309 512.8869896 516.0379360 521.9547791 523.0464132 525.3014468 530.2924734 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 22435 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9869E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9509E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4962E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6343E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6361E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1550 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1755 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4862 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9052 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.004 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.321 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.537 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.835 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.979 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.726 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.994 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.024 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.633 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.900 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.573 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.925 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.85 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99996 1.00005 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 403830 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99996 1.00005 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260522123717486593.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260522123717486593.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260522123717486593.atom Openam> file on opening on unit 11: 260522123717486593.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 2923 First residue number = 1 Last residue number = 218 Number of atoms found = 22435 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9869E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9918E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9509E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4962E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6343E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6361E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1755 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4862 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9052 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.004 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.321 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.537 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.835 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.979 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.298 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.726 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.994 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.024 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.633 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.900 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.573 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.925 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.85 Bfactors> 106 vectors, 67305 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.006951 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.414 for 2923 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.220 +/- 0.19 Bfactors> = 70.617 +/- 25.28 Bfactors> Shiftng-fct= 70.397 Bfactors> Scaling-fct= 133.871 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260522123717486593.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260522123717486593.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 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vecteur en lecture: 429.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.3 Chkmod> 106 vectors, 67305 coordinates in file. Chkmod> That is: 22435 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9278 0.0034 0.7337 0.0034 0.9886 0.0034 0.8887 0.0034 0.6840 0.0034 0.9490 9.0531 0.6296 13.2822 0.5974 17.6242 0.4664 27.9726 0.6137 35.7017 0.3934 42.7506 0.2039 45.4899 0.2490 49.4993 0.7139 64.1581 0.5344 68.1160 0.3160 72.1591 0.4867 75.7154 0.4975 88.1360 0.6304 94.8441 0.3915 99.9941 0.4699 103.3116 0.4663 108.8037 0.5196 113.2117 0.3545 118.4043 0.1658 123.1394 0.2541 124.8039 0.4859 134.6212 0.3503 147.0939 0.1707 149.4399 0.4579 161.0967 0.4446 167.8710 0.3837 185.2669 0.5354 187.4183 0.7421 197.1978 0.2945 201.5739 0.3733 209.6033 0.4682 210.7533 0.4521 225.0392 0.3427 228.4454 0.4779 231.8269 0.2682 237.1818 0.4353 242.6615 0.4277 243.8974 0.4543 251.8416 0.5395 254.4036 0.5346 263.3983 0.4980 269.9641 0.4224 287.7855 0.5281 289.6844 0.5298 299.0179 0.4499 301.3550 0.4569 310.3757 0.2720 319.0491 0.1733 323.9453 0.0788 331.9629 0.0623 335.2499 0.0631 335.9701 0.2908 342.0912 0.2822 349.1700 0.2469 349.3388 0.2880 358.0069 0.3510 364.2109 0.3324 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260522123717486593.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260522123717486593.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260522123717486593 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260522123717486593 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260522123717486593 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260522123717486593.eigenfacs 260522123717486593.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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