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LOGs for ID: 2605250255541103988

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2605250255541103988.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2605250255541103988.atom to be opened. Openam> File opened: 2605250255541103988.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 587 First residue number = 1 Last residue number = 84 Number of atoms found = 4526 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.107971 +/- 13.291273 From: -30.280000 To: 35.424000 = 0.006290 +/- 13.588929 From: -43.470000 To: 38.277000 = -0.409951 +/- 18.088749 From: -48.114000 To: 41.907000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.7213 % Filled. Pdbmat> 1586787 non-zero elements. Pdbmat> 173319 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.59 +/- 22.10 Maximum number = 127 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 3.466380E+06 Pdbmat> Larger element = 498.689 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 587 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2605250255541103988.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2605250255541103988.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2605250255541103988.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4526 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 587 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 17 atoms in block 3 Block first atom: 44 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 61 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 84 Blocpdb> 22 atoms in block 6 Block first atom: 120 Blocpdb> 21 atoms in block 7 Block first atom: 142 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 163 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 186 Blocpdb> 23 atoms in block 10 Block first atom: 217 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 240 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 263 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 281 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 302 Blocpdb> 24 atoms in block 15 Block first atom: 325 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 349 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 371 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 387 Blocpdb> 27 atoms in block 19 Block first atom: 406 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 433 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 457 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 470 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 493 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 516 Blocpdb> 23 atoms in block 25 Block first atom: 540 Blocpdb> 27 atoms in block 26 Block first atom: 563 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 590 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 609 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 632 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 657 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 675 Blocpdb> 25 atoms in block 32 Block first atom: 697 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 722 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 750 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 771 Blocpdb> 25 atoms in block 36 Block first atom: 794 Blocpdb> 25 atoms in block 37 Block first atom: 819 Blocpdb> 30 atoms in block 38 Block first atom: 844 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 874 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 895 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 917 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 939 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 958 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 982 Blocpdb> 27 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 23 atoms in block 46 Block first atom: 1030 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 1053 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1075 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 1098 Blocpdb> 30 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 18 atoms in block 51 Block first atom: 1147 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1165 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1185 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 1206 Blocpdb> 27 atoms in block 55 Block first atom: 1225 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1252 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1278 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 1306 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 1328 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1344 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1364 Blocpdb> 26 atoms in block 62 Block first atom: 1386 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1412 Blocpdb> 23 atoms in block 64 Block first atom: 1432 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1455 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1474 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 1494 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1520 Blocpdb> 21 atoms in block 69 Block first atom: 1541 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1562 Blocpdb> 22 atoms in block 71 Block first atom: 1579 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1601 Blocpdb> 21 atoms in block 73 Block first atom: 1623 Blocpdb> 27 atoms in block 74 Block first atom: 1644 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 1671 Blocpdb> 24 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 31 atoms in block 77 Block first atom: 1722 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 1753 Blocpdb> 27 atoms in block 79 Block first atom: 1782 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 1809 Blocpdb> 28 atoms in block 81 Block first atom: 1836 Blocpdb> 27 atoms in block 82 Block first atom: 1864 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1891 Blocpdb> 31 atoms in block 84 Block first atom: 1910 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1941 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 1961 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 1987 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 2011 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 2034 Blocpdb> 22 atoms in block 90 Block first atom: 2050 Blocpdb> 24 atoms in block 91 Block first atom: 2072 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 93 Block first atom: 2117 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2139 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2159 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2185 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2212 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2231 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2258 Blocpdb> 31 atoms in block 100 Block first atom: 2281 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 2312 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 2333 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 2353 Blocpdb> 27 atoms in block 104 Block first atom: 2378 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2405 Blocpdb> 30 atoms in block 106 Block first atom: 2426 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 2456 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2485 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2510 Blocpdb> 24 atoms in block 110 Block first atom: 2536 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 2560 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2582 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 2607 Blocpdb> 19 atoms in block 114 Block first atom: 2633 Blocpdb> 18 atoms in block 115 Block first atom: 2652 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2670 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 2697 Blocpdb> 25 atoms in block 118 Block first atom: 2715 Blocpdb> 31 atoms in block 119 Block first atom: 2740 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 2771 Blocpdb> 23 atoms in block 121 Block first atom: 2795 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2818 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 2840 Blocpdb> 26 atoms in block 124 Block first atom: 2857 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 2883 Blocpdb> 21 atoms in block 126 Block first atom: 2903 Blocpdb> 24 atoms in block 127 Block first atom: 2924 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 2948 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 2981 Blocpdb> 24 atoms in block 130 Block first atom: 2999 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 3023 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3039 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 3063 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3087 Blocpdb> 24 atoms in block 135 Block first atom: 3109 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3133 Blocpdb> 25 atoms in block 137 Block first atom: 3157 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3182 Blocpdb> 22 atoms in block 139 Block first atom: 3205 Blocpdb> 29 atoms in block 140 Block first atom: 3227 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3256 Blocpdb> 24 atoms in block 142 Block first atom: 3277 Blocpdb> 31 atoms in block 143 Block first atom: 3301 Blocpdb> 25 atoms in block 144 Block first atom: 3332 Blocpdb> 10 atoms in block 145 Block first atom: 3357 Blocpdb> 27 atoms in block 146 Block first atom: 3367 Blocpdb> 21 atoms in block 147 Block first atom: 3394 Blocpdb> 21 atoms in block 148 Block first atom: 3415 Blocpdb> 27 atoms in block 149 Block first atom: 3436 Blocpdb> 22 atoms in block 150 Block first atom: 3463 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3485 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3510 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3532 Blocpdb> 25 atoms in block 154 Block first atom: 3554 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 3579 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 3608 Blocpdb> 27 atoms in block 157 Block first atom: 3628 Blocpdb> 23 atoms in block 158 Block first atom: 3655 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3678 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3700 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3720 Blocpdb> 23 atoms in block 162 Block first atom: 3742 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 3765 Blocpdb> 26 atoms in block 164 Block first atom: 3791 Blocpdb> 26 atoms in block 165 Block first atom: 3817 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3843 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3865 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3884 Blocpdb> 6 atoms in block 169 Block first atom: 3908 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 3914 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 3939 Blocpdb> 27 atoms in block 172 Block first atom: 3958 Blocpdb> 20 atoms in block 173 Block first atom: 3985 Blocpdb> 21 atoms in block 174 Block first atom: 4005 Blocpdb> 24 atoms in block 175 Block first atom: 4026 Blocpdb> 27 atoms in block 176 Block first atom: 4050 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4077 Blocpdb> 23 atoms in block 178 Block first atom: 4100 Blocpdb> 22 atoms in block 179 Block first atom: 4123 Blocpdb> 23 atoms in block 180 Block first atom: 4145 Blocpdb> 19 atoms in block 181 Block first atom: 4168 Blocpdb> 19 atoms in block 182 Block first atom: 4187 Blocpdb> 20 atoms in block 183 Block first atom: 4206 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4226 Blocpdb> 18 atoms in block 185 Block first atom: 4248 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4266 Blocpdb> 18 atoms in block 187 Block first atom: 4290 Blocpdb> 23 atoms in block 188 Block first atom: 4308 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4331 Blocpdb> 20 atoms in block 190 Block first atom: 4353 Blocpdb> 19 atoms in block 191 Block first atom: 4373 Blocpdb> 21 atoms in block 192 Block first atom: 4392 Blocpdb> 23 atoms in block 193 Block first atom: 4413 Blocpdb> 23 atoms in block 194 Block first atom: 4436 Blocpdb> 19 atoms in block 195 Block first atom: 4459 Blocpdb> 20 atoms in block 196 Block first atom: 4478 Blocpdb> 29 atoms in block 197 Block first atom: 4497 Blocpdb> 197 blocks. Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1586984 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13578 Prepmat> Matrix trace = 3466380.0000 Prepmat> Last element read: 13578 13578 279.8470 Prepmat> 19504 lines saved. Prepmat> 17631 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4526 RTB> Total mass = 4526.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4526 RTB> Number of blocks = 197 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 232738.9970 RTB> 64437 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1182 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64437 Diagstd> Projected matrix trace = 232738.9970 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1182 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 232738.9970 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1867440 0.3102049 0.4578152 0.4739553 0.6451002 0.8594280 1.0801402 1.5905843 1.6746578 2.2380397 2.3880861 2.4609694 2.5458424 2.7118551 2.8003912 2.8603928 3.2666007 3.4025375 4.0271724 4.2707947 4.9717113 5.3001294 5.4447141 5.7268279 6.0689237 6.2514818 6.6757011 6.9175466 7.3722843 7.6308788 7.7066970 8.5165172 8.9307439 9.1699608 9.5009222 10.0772052 10.1626417 10.4276904 11.4345817 11.6662299 11.9248887 12.3608761 12.5296168 12.6202521 13.1124820 13.5218470 13.8211262 14.0375208 14.3777922 14.6444545 14.7259441 15.3141017 15.7016677 15.9302167 16.2345051 16.7214304 17.1933481 17.9286088 18.3314382 18.3776982 18.7211055 19.0411391 19.5314294 20.2490883 20.6385210 20.9205001 20.9707706 21.1333508 21.9919282 22.2028604 22.7163832 23.4786390 23.6163770 24.0282019 24.2967868 24.9265859 24.9791062 25.4763758 25.6682501 26.0475899 26.3589766 26.5440893 26.8770630 27.1579076 27.3170376 27.5897849 28.2537880 28.6001329 28.8775348 29.5028061 29.7171304 30.2296562 30.6271462 31.0665539 31.3797312 31.7283381 31.9318083 32.2730124 32.6324672 33.2933170 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034327 0.0034328 0.0034334 0.0034342 0.0034344 46.9265542 60.4810940 73.4751296 74.7590821 87.2185481 100.6699890 112.8587765 136.9536559 140.5265289 162.4535395 167.8109390 170.3524504 173.2650778 178.8251186 181.7207955 183.6572674 196.2652019 200.3072835 217.9191476 224.4138351 242.1297938 249.9991416 253.3861188 259.8677253 267.5168369 271.5105852 280.5716095 285.6086313 294.8467317 299.9732713 301.4598109 316.9029581 324.5182299 328.8357458 334.7173015 344.7190873 346.1773001 350.6625157 367.2023233 370.9031702 374.9923836 381.7859189 384.3830031 385.7707506 393.2219320 399.3128528 403.7076668 406.8557771 411.7573698 415.5582223 416.7128130 424.9531409 430.2968539 433.4171798 437.5370230 444.0501219 450.2725881 459.7995855 464.9364019 465.5226734 469.8519418 473.8509360 479.9127571 488.6501280 493.3266377 496.6853051 497.2816976 499.2056145 509.2451893 511.6815347 517.5649686 526.1768537 527.7180111 532.2993266 535.2660539 542.1590105 542.7298737 548.1054281 550.1655741 554.2159919 557.5188463 559.4730810 562.9712089 565.9048725 567.5603926 570.3867617 577.2097010 580.7367448 583.5463243 589.8301148 591.9686600 597.0516244 600.9641229 605.2597869 608.3029045 611.6724818 613.6306401 616.9003728 620.3263588 626.5760827 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4526 Rtb_to_modes> Number of blocs = 197 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3102 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4578 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8594 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.080 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.675 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.461 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.712 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.860 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.300 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.445 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.931 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.501 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99995 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81468 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99995 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605250255541103988.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605250255541103988.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2605250255541103988.atom Openam> file on opening on unit 11: 2605250255541103988.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 587 First residue number = 1 Last residue number = 84 Number of atoms found = 4526 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3102 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4578 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8594 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.080 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.675 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.461 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.860 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.300 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.445 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.931 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.501 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29 Bfactors> 106 vectors, 13578 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.186700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.300 for 587 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.080 +/- 0.22 Bfactors> = 79.969 +/- 12.25 Bfactors> Shiftng-fct= 79.889 Bfactors> Scaling-fct= 55.560 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2605250255541103988.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2605250255541103988.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8 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vecteur en lecture: 526.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5 Chkmod> 106 vectors, 13578 coordinates in file. Chkmod> That is: 4526 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 91 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7456 0.0034 0.7175 0.0034 0.6604 0.0034 0.9303 0.0034 0.7824 0.0034 0.9552 46.9190 0.0597 60.4780 0.0794 73.4708 0.0655 74.7594 0.1606 87.2148 0.0285 100.6640 0.1274 112.8466 0.0381 136.9657 0.2574 140.5349 0.3375 162.4451 0.2465 167.8007 0.1621 170.3462 0.3062 173.2630 0.1902 178.8222 0.0801 181.7003 0.1858 183.6368 0.2379 196.2688 0.3003 200.3123 0.3445 217.9051 0.3457 224.4096 0.2711 242.1264 0.1844 249.9854 0.2954 253.3819 0.4152 259.8605 0.0726 267.5070 0.2272 271.4885 0.3726 280.5658 0.1008 285.6057 0.1692 294.8284 0.3423 299.9628 0.5319 301.4528 0.4490 316.8983 0.3171 324.5090 0.2092 328.8223 0.4240 334.7043 0.4547 344.7521 0.4518 346.1174 0.3145 350.6863 0.4758 367.1130 0.4289 370.9472 0.3313 374.8994 0.3304 381.7560 0.3110 384.3724 0.3987 385.7503 0.1468 393.1678 0.2401 399.2684 0.2940 403.6739 0.2630 406.8742 0.2578 411.7713 0.2885 415.4772 0.4557 416.7523 0.2263 424.8780 0.2365 430.2555 0.3073 433.3956 0.3118 437.4575 0.3490 444.0121 0.3965 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DQ=-80 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom making animated gifs 11 models are in 2605250255541103988.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605250255541103988.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605250255541103988.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom making animated gifs 11 models are in 2605250255541103988.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605250255541103988.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605250255541103988.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2605250255541103988.eigenfacs 2605250255541103988.atom making animated gifs 11 models are in 2605250255541103988.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605250255541103988.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2605250255541103988.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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