***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605250255541103988.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605250255541103988.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605250255541103988.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 587
First residue number = 1
Last residue number = 84
Number of atoms found = 4526
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.107971 +/- 13.291273 From: -30.280000 To: 35.424000
= 0.006290 +/- 13.588929 From: -43.470000 To: 38.277000
= -0.409951 +/- 18.088749 From: -48.114000 To: 41.907000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7213 % Filled.
Pdbmat> 1586787 non-zero elements.
Pdbmat> 173319 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 76.59 +/- 22.10
Maximum number = 127
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 3.466380E+06
Pdbmat> Larger element = 498.689
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
587 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605250255541103988.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605250255541103988.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605250255541103988.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4526 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 587 residues.
Blocpdb> 23 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 20 atoms in block 2
Block first atom: 24
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 44
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 61
Blocpdb> 36 atoms in block 5
Block first atom: 84
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 120
Blocpdb> 21 atoms in block 7
Block first atom: 142
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 163
Blocpdb> 31 atoms in block 9
Block first atom: 186
Blocpdb> 23 atoms in block 10
Block first atom: 217
Blocpdb> 23 atoms in block 11
Block first atom: 240
Blocpdb> 18 atoms in block 12
Block first atom: 263
Blocpdb> 21 atoms in block 13
Block first atom: 281
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 302
Blocpdb> 24 atoms in block 15
Block first atom: 325
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 349
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 371
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 387
Blocpdb> 27 atoms in block 19
Block first atom: 406
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 433
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 457
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 470
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 493
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 516
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 540
Blocpdb> 27 atoms in block 26
Block first atom: 563
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 590
Blocpdb> 23 atoms in block 28
Block first atom: 609
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 632
Blocpdb> 18 atoms in block 30
Block first atom: 657
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 675
Blocpdb> 25 atoms in block 32
Block first atom: 697
Blocpdb> 28 atoms in block 33
Block first atom: 722
Blocpdb> 21 atoms in block 34
Block first atom: 750
Blocpdb> 23 atoms in block 35
Block first atom: 771
Blocpdb> 25 atoms in block 36
Block first atom: 794
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 819
Blocpdb> 30 atoms in block 38
Block first atom: 844
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 874
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 895
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 917
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 939
Blocpdb> 24 atoms in block 43
Block first atom: 958
Blocpdb> 21 atoms in block 44
Block first atom: 982
Blocpdb> 27 atoms in block 45
Block first atom: 1003
Blocpdb> 23 atoms in block 46
Block first atom: 1030
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 1053
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1075
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 1098
Blocpdb> 30 atoms in block 50
Block first atom: 1117
Blocpdb> 18 atoms in block 51
Block first atom: 1147
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 1165
Blocpdb> 21 atoms in block 53
Block first atom: 1185
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 1206
Blocpdb> 27 atoms in block 55
Block first atom: 1225
Blocpdb> 26 atoms in block 56
Block first atom: 1252
Blocpdb> 28 atoms in block 57
Block first atom: 1278
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 1306
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 1328
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1344
Blocpdb> 22 atoms in block 61
Block first atom: 1364
Blocpdb> 26 atoms in block 62
Block first atom: 1386
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1412
Blocpdb> 23 atoms in block 64
Block first atom: 1432
Blocpdb> 19 atoms in block 65
Block first atom: 1455
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1474
Blocpdb> 26 atoms in block 67
Block first atom: 1494
Blocpdb> 21 atoms in block 68
Block first atom: 1520
Blocpdb> 21 atoms in block 69
Block first atom: 1541
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1562
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 1579
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1601
Blocpdb> 21 atoms in block 73
Block first atom: 1623
Blocpdb> 27 atoms in block 74
Block first atom: 1644
Blocpdb> 27 atoms in block 75
Block first atom: 1671
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 1698
Blocpdb> 31 atoms in block 77
Block first atom: 1722
Blocpdb> 29 atoms in block 78
Block first atom: 1753
Blocpdb> 27 atoms in block 79
Block first atom: 1782
Blocpdb> 27 atoms in block 80
Block first atom: 1809
Blocpdb> 28 atoms in block 81
Block first atom: 1836
Blocpdb> 27 atoms in block 82
Block first atom: 1864
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1891
Blocpdb> 31 atoms in block 84
Block first atom: 1910
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1941
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 1961
Blocpdb> 24 atoms in block 87
Block first atom: 1987
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 2011
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 2034
Blocpdb> 22 atoms in block 90
Block first atom: 2050
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 2072
Blocpdb> 21 atoms in block 92
Block first atom: 2096
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2117
Blocpdb> 20 atoms in block 94
Block first atom: 2139
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2159
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2185
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 2212
Blocpdb> 27 atoms in block 98
Block first atom: 2231
Blocpdb> 23 atoms in block 99
Block first atom: 2258
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 2281
Blocpdb> 21 atoms in block 101
Block first atom: 2312
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 2333
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2353
Blocpdb> 27 atoms in block 104
Block first atom: 2378
Blocpdb> 21 atoms in block 105
Block first atom: 2405
Blocpdb> 30 atoms in block 106
Block first atom: 2426
Blocpdb> 29 atoms in block 107
Block first atom: 2456
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2485
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2510
Blocpdb> 24 atoms in block 110
Block first atom: 2536
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2560
Blocpdb> 25 atoms in block 112
Block first atom: 2582
Blocpdb> 26 atoms in block 113
Block first atom: 2607
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 2633
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 2652
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 2670
Blocpdb> 18 atoms in block 117
Block first atom: 2697
Blocpdb> 25 atoms in block 118
Block first atom: 2715
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 2740
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2771
Blocpdb> 23 atoms in block 121
Block first atom: 2795
Blocpdb> 22 atoms in block 122
Block first atom: 2818
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 2840
Blocpdb> 26 atoms in block 124
Block first atom: 2857
Blocpdb> 20 atoms in block 125
Block first atom: 2883
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 2903
Blocpdb> 24 atoms in block 127
Block first atom: 2924
Blocpdb> 33 atoms in block 128
Block first atom: 2948
Blocpdb> 18 atoms in block 129
Block first atom: 2981
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 2999
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 3023
Blocpdb> 24 atoms in block 132
Block first atom: 3039
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3063
Blocpdb> 22 atoms in block 134
Block first atom: 3087
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3109
Blocpdb> 24 atoms in block 136
Block first atom: 3133
Blocpdb> 25 atoms in block 137
Block first atom: 3157
Blocpdb> 23 atoms in block 138
Block first atom: 3182
Blocpdb> 22 atoms in block 139
Block first atom: 3205
Blocpdb> 29 atoms in block 140
Block first atom: 3227
Blocpdb> 21 atoms in block 141
Block first atom: 3256
Blocpdb> 24 atoms in block 142
Block first atom: 3277
Blocpdb> 31 atoms in block 143
Block first atom: 3301
Blocpdb> 25 atoms in block 144
Block first atom: 3332
Blocpdb> 10 atoms in block 145
Block first atom: 3357
Blocpdb> 27 atoms in block 146
Block first atom: 3367
Blocpdb> 21 atoms in block 147
Block first atom: 3394
Blocpdb> 21 atoms in block 148
Block first atom: 3415
Blocpdb> 27 atoms in block 149
Block first atom: 3436
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 3463
Blocpdb> 25 atoms in block 151
Block first atom: 3485
Blocpdb> 22 atoms in block 152
Block first atom: 3510
Blocpdb> 22 atoms in block 153
Block first atom: 3532
Blocpdb> 25 atoms in block 154
Block first atom: 3554
Blocpdb> 29 atoms in block 155
Block first atom: 3579
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 3608
Blocpdb> 27 atoms in block 157
Block first atom: 3628
Blocpdb> 23 atoms in block 158
Block first atom: 3655
Blocpdb> 22 atoms in block 159
Block first atom: 3678
Blocpdb> 20 atoms in block 160
Block first atom: 3700
Blocpdb> 22 atoms in block 161
Block first atom: 3720
Blocpdb> 23 atoms in block 162
Block first atom: 3742
Blocpdb> 26 atoms in block 163
Block first atom: 3765
Blocpdb> 26 atoms in block 164
Block first atom: 3791
Blocpdb> 26 atoms in block 165
Block first atom: 3817
Blocpdb> 22 atoms in block 166
Block first atom: 3843
Blocpdb> 19 atoms in block 167
Block first atom: 3865
Blocpdb> 24 atoms in block 168
Block first atom: 3884
Blocpdb> 6 atoms in block 169
Block first atom: 3908
Blocpdb> 25 atoms in block 170
Block first atom: 3914
Blocpdb> 19 atoms in block 171
Block first atom: 3939
Blocpdb> 27 atoms in block 172
Block first atom: 3958
Blocpdb> 20 atoms in block 173
Block first atom: 3985
Blocpdb> 21 atoms in block 174
Block first atom: 4005
Blocpdb> 24 atoms in block 175
Block first atom: 4026
Blocpdb> 27 atoms in block 176
Block first atom: 4050
Blocpdb> 23 atoms in block 177
Block first atom: 4077
Blocpdb> 23 atoms in block 178
Block first atom: 4100
Blocpdb> 22 atoms in block 179
Block first atom: 4123
Blocpdb> 23 atoms in block 180
Block first atom: 4145
Blocpdb> 19 atoms in block 181
Block first atom: 4168
Blocpdb> 19 atoms in block 182
Block first atom: 4187
Blocpdb> 20 atoms in block 183
Block first atom: 4206
Blocpdb> 22 atoms in block 184
Block first atom: 4226
Blocpdb> 18 atoms in block 185
Block first atom: 4248
Blocpdb> 24 atoms in block 186
Block first atom: 4266
Blocpdb> 18 atoms in block 187
Block first atom: 4290
Blocpdb> 23 atoms in block 188
Block first atom: 4308
Blocpdb> 22 atoms in block 189
Block first atom: 4331
Blocpdb> 20 atoms in block 190
Block first atom: 4353
Blocpdb> 19 atoms in block 191
Block first atom: 4373
Blocpdb> 21 atoms in block 192
Block first atom: 4392
Blocpdb> 23 atoms in block 193
Block first atom: 4413
Blocpdb> 23 atoms in block 194
Block first atom: 4436
Blocpdb> 19 atoms in block 195
Block first atom: 4459
Blocpdb> 20 atoms in block 196
Block first atom: 4478
Blocpdb> 29 atoms in block 197
Block first atom: 4497
Blocpdb> 197 blocks.
Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1586984 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13578
Prepmat> Matrix trace = 3466380.0000
Prepmat> Last element read: 13578 13578 279.8470
Prepmat> 19504 lines saved.
Prepmat> 17631 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4526
RTB> Total mass = 4526.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4526
RTB> Number of blocks = 197
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 232738.9970
RTB> 64437 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1182
Diagstd> Nb of non-zero elements: 64437
Diagstd> Projected matrix trace = 232738.9970
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1182 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 232738.9970
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1867440 0.3102049 0.4578152 0.4739553
0.6451002 0.8594280 1.0801402 1.5905843 1.6746578
2.2380397 2.3880861 2.4609694 2.5458424 2.7118551
2.8003912 2.8603928 3.2666007 3.4025375 4.0271724
4.2707947 4.9717113 5.3001294 5.4447141 5.7268279
6.0689237 6.2514818 6.6757011 6.9175466 7.3722843
7.6308788 7.7066970 8.5165172 8.9307439 9.1699608
9.5009222 10.0772052 10.1626417 10.4276904 11.4345817
11.6662299 11.9248887 12.3608761 12.5296168 12.6202521
13.1124820 13.5218470 13.8211262 14.0375208 14.3777922
14.6444545 14.7259441 15.3141017 15.7016677 15.9302167
16.2345051 16.7214304 17.1933481 17.9286088 18.3314382
18.3776982 18.7211055 19.0411391 19.5314294 20.2490883
20.6385210 20.9205001 20.9707706 21.1333508 21.9919282
22.2028604 22.7163832 23.4786390 23.6163770 24.0282019
24.2967868 24.9265859 24.9791062 25.4763758 25.6682501
26.0475899 26.3589766 26.5440893 26.8770630 27.1579076
27.3170376 27.5897849 28.2537880 28.6001329 28.8775348
29.5028061 29.7171304 30.2296562 30.6271462 31.0665539
31.3797312 31.7283381 31.9318083 32.2730124 32.6324672
33.2933170
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034327 0.0034328 0.0034334 0.0034342
0.0034344 46.9265542 60.4810940 73.4751296 74.7590821
87.2185481 100.6699890 112.8587765 136.9536559 140.5265289
162.4535395 167.8109390 170.3524504 173.2650778 178.8251186
181.7207955 183.6572674 196.2652019 200.3072835 217.9191476
224.4138351 242.1297938 249.9991416 253.3861188 259.8677253
267.5168369 271.5105852 280.5716095 285.6086313 294.8467317
299.9732713 301.4598109 316.9029581 324.5182299 328.8357458
334.7173015 344.7190873 346.1773001 350.6625157 367.2023233
370.9031702 374.9923836 381.7859189 384.3830031 385.7707506
393.2219320 399.3128528 403.7076668 406.8557771 411.7573698
415.5582223 416.7128130 424.9531409 430.2968539 433.4171798
437.5370230 444.0501219 450.2725881 459.7995855 464.9364019
465.5226734 469.8519418 473.8509360 479.9127571 488.6501280
493.3266377 496.6853051 497.2816976 499.2056145 509.2451893
511.6815347 517.5649686 526.1768537 527.7180111 532.2993266
535.2660539 542.1590105 542.7298737 548.1054281 550.1655741
554.2159919 557.5188463 559.4730810 562.9712089 565.9048725
567.5603926 570.3867617 577.2097010 580.7367448 583.5463243
589.8301148 591.9686600 597.0516244 600.9641229 605.2597869
608.3029045 611.6724818 613.6306401 616.9003728 620.3263588
626.5760827
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4526
Rtb_to_modes> Number of blocs = 197
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1867
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4578
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4740
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6451
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8594
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.080
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.675
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.238
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.388
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.461
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.546
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.712
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.800
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.860
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.267
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.403
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.027
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.972
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.300
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.445
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.727
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.069
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.676
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.918
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.372
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.631
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.707
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.517
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.931
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.170
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.29
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003
0.99999 1.00000 0.99995 1.00002 0.99997
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000
1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002
0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999
1.00003 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
0.99998 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001
0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
0.99997 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999
1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 81468 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00003
0.99999 1.00000 0.99995 1.00002 0.99997
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001
0.99998 1.00004 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000
1.00003 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002
0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999
1.00003 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001
0.99998 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001
0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000
0.99997 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998
1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999
1.00003 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605250255541103988.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605250255541103988.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605250255541103988.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605250255541103988.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 587
First residue number = 1
Last residue number = 84
Number of atoms found = 4526
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1867
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6451
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8594
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.080
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.675
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.238
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.388
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.461
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.546
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.712
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.860
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.267
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.403
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.027
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.972
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.300
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.445
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.727
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.069
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.251
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.676
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.918
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.372
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.631
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.707
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.517
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.170
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.29
Bfactors> 106 vectors, 13578 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.186700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.300 for 587 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.080 +/- 0.22
Bfactors> = 79.969 +/- 12.25
Bfactors> Shiftng-fct= 79.889
Bfactors> Scaling-fct= 55.560
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605250255541103988.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605250255541103988.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.5
Chkmod> 106 vectors, 13578 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4526 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 91 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7456
0.0034 0.7175
0.0034 0.6604
0.0034 0.9303
0.0034 0.7824
0.0034 0.9552
46.9190 0.0597
60.4780 0.0794
73.4708 0.0655
74.7594 0.1606
87.2148 0.0285
100.6640 0.1274
112.8466 0.0381
136.9657 0.2574
140.5349 0.3375
162.4451 0.2465
167.8007 0.1621
170.3462 0.3062
173.2630 0.1902
178.8222 0.0801
181.7003 0.1858
183.6368 0.2379
196.2688 0.3003
200.3123 0.3445
217.9051 0.3457
224.4096 0.2711
242.1264 0.1844
249.9854 0.2954
253.3819 0.4152
259.8605 0.0726
267.5070 0.2272
271.4885 0.3726
280.5658 0.1008
285.6057 0.1692
294.8284 0.3423
299.9628 0.5319
301.4528 0.4490
316.8983 0.3171
324.5090 0.2092
328.8223 0.4240
334.7043 0.4547
344.7521 0.4518
346.1174 0.3145
350.6863 0.4758
367.1130 0.4289
370.9472 0.3313
374.8994 0.3304
381.7560 0.3110
384.3724 0.3987
385.7503 0.1468
393.1678 0.2401
399.2684 0.2940
403.6739 0.2630
406.8742 0.2578
411.7713 0.2885
415.4772 0.4557
416.7523 0.2263
424.8780 0.2365
430.2555 0.3073
433.3956 0.3118
437.4575 0.3490
444.0121 0.3965
450.2094 0.3697
459.7977 0.3532
464.8982 0.4122
465.5318 0.5467
469.8179 0.3475
473.8164 0.3396
479.8746 0.4001
488.6402 0.3714
493.3231 0.3345
496.6580 0.3752
497.2512 0.3236
499.1446 0.4141
509.2010 0.4026
511.6266 0.4874
517.5839 0.4461
526.1695 0.3436
527.7358 0.0232
532.2964 0.4386
535.2785 0.1492
542.1729 0.2975
542.7163 0.4122
548.1209 0.3876
550.1607 0.3030
554.2178 0.3367
557.5057 0.3061
559.4060 0.3672
562.9778 0.2471
565.9024 0.0266
567.5668 0.1789
570.3645 0.3232
577.1462 0.3179
580.7105 0.2707
583.5462 0.2657
589.7767 0.2426
591.9718 0.3986
597.0294 0.2567
600.9663 0.4751
605.2674 0.4021
608.2794 0.2863
611.6622 0.2910
613.5869 0.3116
616.8451 0.3344
620.2763 0.4178
626.5180 0.4558
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
making animated gifs
11 models are in 2605250255541103988.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
making animated gifs
11 models are in 2605250255541103988.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
making animated gifs
11 models are in 2605250255541103988.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
making animated gifs
11 models are in 2605250255541103988.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605250255541103988 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605250255541103988.eigenfacs
2605250255541103988.atom
making animated gifs
11 models are in 2605250255541103988.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605250255541103988.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605250255541103988.10.pdb
2605250255541103988.11.pdb
2605250255541103988.7.pdb
2605250255541103988.8.pdb
2605250255541103988.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m24.540s
user 0m24.398s
sys 0m0.132s
rm: cannot remove '2605250255541103988.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|