*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605260534121309443.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605260534121309443.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605260534121309443.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 109
First residue number = 1
Last residue number = 109
Number of atoms found = 799
Mean number per residue = 7.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.457676 +/- 12.499350 From: -27.551000 To: 29.088000
= 0.167905 +/- 11.662037 From: -21.548000 To: 27.540000
= 0.107191 +/- 7.164420 From: -18.266000 To: 15.425000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 7.3489 % Filled.
Pdbmat> 211207 non-zero elements.
Pdbmat> 22937 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 57.41 +/- 20.58
Maximum number = 104
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 458740.
Pdbmat> Larger element = 449.445
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
109 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605260534121309443.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605260534121309443.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605260534121309443.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 799 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 109 residues.
Blocpdb> 8 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 6 atoms in block 2
Block first atom: 9
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 15
Blocpdb> 7 atoms in block 4
Block first atom: 26
Blocpdb> 6 atoms in block 5
Block first atom: 33
Blocpdb> 6 atoms in block 6
Block first atom: 39
Blocpdb> 8 atoms in block 7
Block first atom: 45
Blocpdb> 8 atoms in block 8
Block first atom: 53
Blocpdb> 11 atoms in block 9
Block first atom: 61
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 72
Blocpdb> 7 atoms in block 11
Block first atom: 80
Blocpdb> 5 atoms in block 12
Block first atom: 87
Blocpdb> 5 atoms in block 13
Block first atom: 92
Blocpdb> 9 atoms in block 14
Block first atom: 97
Blocpdb> 7 atoms in block 15
Block first atom: 106
Blocpdb> 11 atoms in block 16
Block first atom: 113
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 124
Blocpdb> 5 atoms in block 18
Block first atom: 132
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 137
Blocpdb> 8 atoms in block 20
Block first atom: 148
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 156
Blocpdb> 7 atoms in block 22
Block first atom: 164
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 171
Blocpdb> 8 atoms in block 24
Block first atom: 179
Blocpdb> 7 atoms in block 25
Block first atom: 187
Blocpdb> 8 atoms in block 26
Block first atom: 194
Blocpdb> 8 atoms in block 27
Block first atom: 202
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 210
Blocpdb> 6 atoms in block 29
Block first atom: 219
Blocpdb> 7 atoms in block 30
Block first atom: 225
Blocpdb> 9 atoms in block 31
Block first atom: 232
Blocpdb> 6 atoms in block 32
Block first atom: 241
Blocpdb> 8 atoms in block 33
Block first atom: 247
Blocpdb> 7 atoms in block 34
Block first atom: 255
Blocpdb> 8 atoms in block 35
Block first atom: 262
Blocpdb> 4 atoms in block 36
Block first atom: 270
Blocpdb> 4 atoms in block 37
Block first atom: 274
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 278
Blocpdb> 4 atoms in block 39
Block first atom: 289
Blocpdb> 4 atoms in block 40
Block first atom: 293
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 297
Blocpdb> 9 atoms in block 42
Block first atom: 304
Blocpdb> 6 atoms in block 43
Block first atom: 313
Blocpdb> 8 atoms in block 44
Block first atom: 319
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 327
Blocpdb> 4 atoms in block 46
Block first atom: 335
Blocpdb> 6 atoms in block 47
Block first atom: 339
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 345
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 353
Blocpdb> 4 atoms in block 50
Block first atom: 364
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 368
Blocpdb> 6 atoms in block 52
Block first atom: 377
Blocpdb> 6 atoms in block 53
Block first atom: 383
Blocpdb> 6 atoms in block 54
Block first atom: 389
Blocpdb> 6 atoms in block 55
Block first atom: 395
Blocpdb> 6 atoms in block 56
Block first atom: 401
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 407
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 418
Blocpdb> 5 atoms in block 59
Block first atom: 426
Blocpdb> 9 atoms in block 60
Block first atom: 431
Blocpdb> 8 atoms in block 61
Block first atom: 440
Blocpdb> 7 atoms in block 62
Block first atom: 448
Blocpdb> 5 atoms in block 63
Block first atom: 455
Blocpdb> 7 atoms in block 64
Block first atom: 460
Blocpdb> 7 atoms in block 65
Block first atom: 467
Blocpdb> 5 atoms in block 66
Block first atom: 474
Blocpdb> 5 atoms in block 67
Block first atom: 479
Blocpdb> 5 atoms in block 68
Block first atom: 484
Blocpdb> 11 atoms in block 69
Block first atom: 489
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 500
Blocpdb> 7 atoms in block 71
Block first atom: 508
Blocpdb> 8 atoms in block 72
Block first atom: 515
Blocpdb> 7 atoms in block 73
Block first atom: 523
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 530
Blocpdb> 8 atoms in block 75
Block first atom: 538
Blocpdb> 8 atoms in block 76
Block first atom: 546
Blocpdb> 7 atoms in block 77
Block first atom: 554
Blocpdb> 4 atoms in block 78
Block first atom: 561
Blocpdb> 7 atoms in block 79
Block first atom: 565
Blocpdb> 8 atoms in block 80
Block first atom: 572
Blocpdb> 5 atoms in block 81
Block first atom: 580
Blocpdb> 11 atoms in block 82
Block first atom: 585
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 596
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 607
Blocpdb> 11 atoms in block 85
Block first atom: 614
Blocpdb> 9 atoms in block 86
Block first atom: 625
Blocpdb> 7 atoms in block 87
Block first atom: 634
Blocpdb> 6 atoms in block 88
Block first atom: 641
Blocpdb> 7 atoms in block 89
Block first atom: 647
Blocpdb> 7 atoms in block 90
Block first atom: 654
Blocpdb> 6 atoms in block 91
Block first atom: 661
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 667
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 676
Blocpdb> 9 atoms in block 94
Block first atom: 683
Blocpdb> 5 atoms in block 95
Block first atom: 692
Blocpdb> 7 atoms in block 96
Block first atom: 697
Blocpdb> 6 atoms in block 97
Block first atom: 704
Blocpdb> 4 atoms in block 98
Block first atom: 710
Blocpdb> 9 atoms in block 99
Block first atom: 714
Blocpdb> 9 atoms in block 100
Block first atom: 723
Blocpdb> 6 atoms in block 101
Block first atom: 732
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 738
Blocpdb> 4 atoms in block 103
Block first atom: 746
Blocpdb> 6 atoms in block 104
Block first atom: 750
Blocpdb> 9 atoms in block 105
Block first atom: 756
Blocpdb> 7 atoms in block 106
Block first atom: 765
Blocpdb> 7 atoms in block 107
Block first atom: 772
Blocpdb> 11 atoms in block 108
Block first atom: 779
Blocpdb> 10 atoms in block 109
Block first atom: 789
Blocpdb> 109 blocks.
Blocpdb> At most, 11 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 211316 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2397
Prepmat> Matrix trace = 458740.0000
Prepmat> Last element read: 2397 2397 82.9763
Prepmat> 5996 lines saved.
Prepmat> 5064 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 799
RTB> Total mass = 799.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 799
RTB> Number of blocks = 109
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 107865.9280
RTB> 31881 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 654
Diagstd> Nb of non-zero elements: 31881
Diagstd> Projected matrix trace = 107865.9280
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 654 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 107865.9280
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0412010 0.1188760 0.2309446 0.4951952
0.6154768 0.8359382 1.1477436 1.3922149 1.6089504
1.9299331 2.0599142 2.4411557 2.8862715 3.2301678
3.4809869 3.8506726 4.1260902 4.1758850 4.5629592
5.0915347 5.8566333 6.3486792 6.9517328 7.1745365
7.6985074 8.7400324 9.1534947 9.5649129 9.9169968
10.8660786 11.1322594 11.8336545 11.9047804 12.5512723
13.2283323 13.8025370 14.3625869 15.1506035 15.3679633
15.3931066 16.8598213 16.9328017 17.2454659 17.8693075
19.0161311 19.1190052 19.6057792 20.2653966 20.2819371
21.7977706 22.1018197 22.6819728 22.8305058 23.4046255
24.5488650 24.5982747 25.2916662 25.5674077 25.8567503
26.8643681 27.6505783 27.8278287 27.9928880 28.3598091
28.9921542 29.2957356 29.6435982 29.9745023 30.7689324
30.9946193 31.0564655 33.3016157 33.4356971 34.5255614
35.6617831 36.9593193 37.9203675 38.7451605 40.0430447
40.4282502 41.3324461 41.9399514 42.9540562 43.4884944
43.9594351 44.0973489 45.0003884 45.3804472 45.7120871
46.2139091 46.5307192 48.3867321 48.6430112 49.2531177
51.6690190 52.2337664 52.3850992 53.5970045 53.9106654
53.9929380
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034332 0.0034332 0.0034338 0.0034338 0.0034340
0.0034340 22.0419008 37.4405592 52.1854238 76.4158566
85.1924499 99.2847088 116.3369646 128.1292910 137.7420702
150.8573273 155.8546788 169.6652969 184.4861931 195.1676448
202.6032813 213.0902490 220.5792403 221.9062550 231.9629219
245.0302120 262.7963306 273.6131541 286.3134940 290.8654944
301.2995932 321.0345711 328.5403738 335.8426053 341.9679195
357.9576938 362.3155215 373.5551461 374.6760859 384.7150316
394.9551931 403.4360845 411.5395847 422.6785866 425.6997912
426.0478902 445.8838725 446.8478696 450.9545224 459.0385308
473.5396640 474.8188220 480.8253256 488.8468641 489.0463203
506.9922486 510.5159274 517.1728200 518.8634112 525.3468453
538.0355710 538.5767534 546.1148686 549.0837979 552.1820075
562.8382384 571.0148326 572.8421169 574.5384970 578.2916635
584.7032704 587.7565590 591.2358218 594.5265728 602.3535778
604.5586415 605.1615044 626.6541682 627.9144413 638.0660760
648.4803304 660.1722461 668.7003475 675.9335645 687.1615115
690.4587735 698.1372871 703.2491918 711.7006636 716.1144981
719.9814911 721.1100043 728.4561454 731.5258305 734.1939570
738.2129054 740.7389178 755.3677278 757.3654796 762.1003191
780.5673621 784.8216080 785.9576865 794.9970905 797.3199421
797.9281017
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 799
Rtb_to_modes> Number of blocs = 109
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1201E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1189
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2309
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4952
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6155
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8359
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.148
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.392
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.609
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.930
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.060
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.441
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.886
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.230
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.481
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.851
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.126
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.176
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.563
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.092
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.857
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.349
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.952
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.175
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.699
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.740
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.153
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.917
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.99
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 654 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00003
1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002
1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
1.00004 1.00001 1.00001 0.99996 0.99997
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 0.99998
1.00002 0.99998 1.00000 1.00004 1.00002
1.00001 0.99994 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
1.00001 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001
0.99998 1.00005 0.99998 0.99997 1.00000
0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003
1.00003 0.99998 1.00004 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 14382 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00003
1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002
1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998
1.00004 1.00001 1.00001 0.99996 0.99997
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997
1.00000 1.00002 1.00004 1.00001 0.99998
1.00002 0.99998 1.00000 1.00004 1.00002
1.00001 0.99994 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002
1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998
1.00001 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001
0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001
0.99998 1.00005 0.99998 0.99997 1.00000
0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003
1.00003 0.99998 1.00004 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605260534121309443.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605260534121309443.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605260534121309443.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605260534121309443.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 109
First residue number = 1
Last residue number = 109
Number of atoms found = 799
Mean number per residue = 7.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1201E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1189
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2309
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4952
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6155
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.148
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.392
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.609
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.930
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.060
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.441
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.886
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.230
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.481
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.126
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.176
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.563
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.092
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.857
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.952
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.699
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.153
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.917
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.99
Bfactors> 106 vectors, 2397 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.041201
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.281 for 109 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.913 +/- 1.30
Bfactors> = 6.073 +/- 2.57
Bfactors> Shiftng-fct= 5.160
Bfactors> Scaling-fct= 1.980
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605260534121309443.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605260534121309443.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9
Chkmod> 106 vectors, 2397 coordinates in file.
Chkmod> That is: 799 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 58 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9222
0.0034 0.6660
0.0034 0.8671
0.0034 0.8265
0.0034 0.7154
0.0034 0.9457
22.0410 0.3418
37.4427 0.3487
52.1781 0.5105
76.4129 0.6021
85.1904 0.3674
99.2782 0.4046
116.3450 0.5012
128.1139 0.1892
137.7383 0.3856
150.8535 0.3117
155.8512 0.5090
169.6526 0.3840
184.4696 0.4867
195.1542 0.1323
202.5950 0.1009
213.0902 0.2502
220.5674 0.3362
221.8998 0.2888
231.9540 0.2943
245.0309 0.3286
262.7933 0.3915
273.6083 0.3661
286.3067 0.3433
290.8624 0.0670
301.2963 0.2023
321.0202 0.3278
328.5174 0.2862
335.8297 0.1948
341.9533 0.2917
358.0069 0.5222
362.2632 0.1500
373.4814 0.4127
374.5848 0.3045
384.6790 0.3490
394.9631 0.2846
403.3817 0.4394
411.4849 0.2068
422.6520 0.3837
425.7097 0.4003
425.9866 0.0715
445.8671 0.3191
446.7917 0.2362
450.9944 0.4427
459.0277 0.1094
473.5675 0.3038
474.8108 0.2088
480.8564 0.3627
488.8814 0.3802
489.0020 0.3863
506.9964 0.0858
510.4730 0.2584
517.1281 0.3180
518.8354 0.1886
525.2724 0.3557
538.0249 0.2330
538.5725 0.3213
546.0734 0.3118
549.0881 0.3093
552.1930 0.4174
562.7683 0.2308
570.9843 0.1257
572.8399 0.1897
574.4842 0.3291
578.2688 0.1260
584.6564 0.2692
587.7741 0.4395
591.1746 0.5088
594.4564 0.3528
602.3382 0.1553
604.4876 0.4285
605.1700 0.2462
626.6121 0.4006
627.9279 0.4521
638.0797 0.1725
648.4363 0.2957
660.1500 0.2042
668.6684 0.4313
675.9468 0.3865
687.1059 0.0981
690.4441 0.3620
698.0867 0.2975
703.2194 0.4990
711.6365 0.3167
716.0962 0.2815
719.9552 0.3262
721.1007 0.3036
728.4217 0.4084
731.4908 0.4034
734.1457 0.2114
738.1500 0.2395
740.7014 0.2260
755.3608 0.2439
757.3095 0.4995
762.0435 0.3505
780.5413 0.3480
784.7596 0.3715
785.9607 0.3637
794.9852 0.2413
797.2808 0.1067
797.8721 0.2100
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260534121309443 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260534121309443.eigenfacs
2605260534121309443.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260534121309443.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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11 models are in 2605260534121309443.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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getting mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m3.374s
user 0m3.349s
sys 0m0.022s
rm: cannot remove '2605260534121309443.sdijf': No such file or directory
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