*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605260847501347416.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605260847501347416.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605260847501347416.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 625
First residue number = 1
Last residue number = 155
Number of atoms found = 10402
Mean number per residue = 16.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 269.406068 +/- 17.208425 From: 233.457000 To: 313.433000
= 243.149289 +/- 15.745548 From: 210.260000 To: 277.959000
= 260.977505 +/- 13.114474 From: 231.346000 To: 299.350000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.6206 % Filled.
Pdbmat> 7891097 non-zero elements.
Pdbmat> 870010 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 167.28 +/- 48.72
Maximum number = 255
Minimum number = 27
Pdbmat> Matrix trace = 1.740020E+07
Pdbmat> Larger element = 938.629
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
625 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605260847501347416.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605260847501347416.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605260847501347416.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 10402 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 625 residues.
Blocpdb> 75 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 76 atoms in block 2
Block first atom: 76
Blocpdb> 68 atoms in block 3
Block first atom: 152
Blocpdb> 75 atoms in block 4
Block first atom: 220
Blocpdb> 62 atoms in block 5
Block first atom: 295
Blocpdb> 64 atoms in block 6
Block first atom: 357
Blocpdb> 68 atoms in block 7
Block first atom: 421
Blocpdb> 44 atoms in block 8
Block first atom: 489
Blocpdb> 69 atoms in block 9
Block first atom: 533
Blocpdb> 71 atoms in block 10
Block first atom: 602
Blocpdb> 55 atoms in block 11
Block first atom: 673
Blocpdb> 63 atoms in block 12
Block first atom: 728
Blocpdb> 69 atoms in block 13
Block first atom: 791
Blocpdb> 78 atoms in block 14
Block first atom: 860
Blocpdb> 68 atoms in block 15
Block first atom: 938
Blocpdb> 74 atoms in block 16
Block first atom: 1006
Blocpdb> 68 atoms in block 17
Block first atom: 1080
Blocpdb> 77 atoms in block 18
Block first atom: 1148
Blocpdb> 65 atoms in block 19
Block first atom: 1225
Blocpdb> 73 atoms in block 20
Block first atom: 1290
Blocpdb> 73 atoms in block 21
Block first atom: 1363
Blocpdb> 64 atoms in block 22
Block first atom: 1436
Blocpdb> 62 atoms in block 23
Block first atom: 1500
Blocpdb> 73 atoms in block 24
Block first atom: 1562
Blocpdb> 77 atoms in block 25
Block first atom: 1635
Blocpdb> 64 atoms in block 26
Block first atom: 1712
Blocpdb> 64 atoms in block 27
Block first atom: 1776
Blocpdb> 56 atoms in block 28
Block first atom: 1840
Blocpdb> 74 atoms in block 29
Block first atom: 1896
Blocpdb> 76 atoms in block 30
Block first atom: 1970
Blocpdb> 51 atoms in block 31
Block first atom: 2046
Blocpdb> 85 atoms in block 32
Block first atom: 2097
Blocpdb> 67 atoms in block 33
Block first atom: 2182
Blocpdb> 67 atoms in block 34
Block first atom: 2249
Blocpdb> 43 atoms in block 35
Block first atom: 2316
Blocpdb> 59 atoms in block 36
Block first atom: 2359
Blocpdb> 66 atoms in block 37
Block first atom: 2418
Blocpdb> 76 atoms in block 38
Block first atom: 2484
Blocpdb> 79 atoms in block 39
Block first atom: 2560
Blocpdb> 57 atoms in block 40
Block first atom: 2639
Blocpdb> 65 atoms in block 41
Block first atom: 2696
Blocpdb> 81 atoms in block 42
Block first atom: 2761
Blocpdb> 68 atoms in block 43
Block first atom: 2842
Blocpdb> 58 atoms in block 44
Block first atom: 2910
Blocpdb> 65 atoms in block 45
Block first atom: 2968
Blocpdb> 65 atoms in block 46
Block first atom: 3033
Blocpdb> 58 atoms in block 47
Block first atom: 3098
Blocpdb> 70 atoms in block 48
Block first atom: 3156
Blocpdb> 70 atoms in block 49
Block first atom: 3226
Blocpdb> 60 atoms in block 50
Block first atom: 3296
Blocpdb> 65 atoms in block 51
Block first atom: 3356
Blocpdb> 64 atoms in block 52
Block first atom: 3421
Blocpdb> 49 atoms in block 53
Block first atom: 3485
Blocpdb> 70 atoms in block 54
Block first atom: 3534
Blocpdb> 66 atoms in block 55
Block first atom: 3604
Blocpdb> 63 atoms in block 56
Block first atom: 3670
Blocpdb> 59 atoms in block 57
Block first atom: 3733
Blocpdb> 55 atoms in block 58
Block first atom: 3792
Blocpdb> 73 atoms in block 59
Block first atom: 3847
Blocpdb> 64 atoms in block 60
Block first atom: 3920
Blocpdb> 78 atoms in block 61
Block first atom: 3984
Blocpdb> 64 atoms in block 62
Block first atom: 4062
Blocpdb> 75 atoms in block 63
Block first atom: 4126
Blocpdb> 76 atoms in block 64
Block first atom: 4201
Blocpdb> 59 atoms in block 65
Block first atom: 4277
Blocpdb> 59 atoms in block 66
Block first atom: 4336
Blocpdb> 64 atoms in block 67
Block first atom: 4395
Blocpdb> 85 atoms in block 68
Block first atom: 4459
Blocpdb> 60 atoms in block 69
Block first atom: 4544
Blocpdb> 72 atoms in block 70
Block first atom: 4604
Blocpdb> 59 atoms in block 71
Block first atom: 4676
Blocpdb> 63 atoms in block 72
Block first atom: 4735
Blocpdb> 80 atoms in block 73
Block first atom: 4798
Blocpdb> 63 atoms in block 74
Block first atom: 4878
Blocpdb> 64 atoms in block 75
Block first atom: 4941
Blocpdb> 64 atoms in block 76
Block first atom: 5005
Blocpdb> 64 atoms in block 77
Block first atom: 5069
Blocpdb> 61 atoms in block 78
Block first atom: 5133
Blocpdb> 77 atoms in block 79
Block first atom: 5194
Blocpdb> 60 atoms in block 80
Block first atom: 5271
Blocpdb> 72 atoms in block 81
Block first atom: 5331
Blocpdb> 64 atoms in block 82
Block first atom: 5403
Blocpdb> 69 atoms in block 83
Block first atom: 5467
Blocpdb> 62 atoms in block 84
Block first atom: 5536
Blocpdb> 71 atoms in block 85
Block first atom: 5598
Blocpdb> 56 atoms in block 86
Block first atom: 5669
Blocpdb> 70 atoms in block 87
Block first atom: 5725
Blocpdb> 76 atoms in block 88
Block first atom: 5795
Blocpdb> 74 atoms in block 89
Block first atom: 5871
Blocpdb> 65 atoms in block 90
Block first atom: 5945
Blocpdb> 66 atoms in block 91
Block first atom: 6010
Blocpdb> 76 atoms in block 92
Block first atom: 6076
Blocpdb> 61 atoms in block 93
Block first atom: 6152
Blocpdb> 61 atoms in block 94
Block first atom: 6213
Blocpdb> 49 atoms in block 95
Block first atom: 6274
Blocpdb> 67 atoms in block 96
Block first atom: 6323
Blocpdb> 60 atoms in block 97
Block first atom: 6390
Blocpdb> 80 atoms in block 98
Block first atom: 6450
Blocpdb> 68 atoms in block 99
Block first atom: 6530
Blocpdb> 58 atoms in block 100
Block first atom: 6598
Blocpdb> 59 atoms in block 101
Block first atom: 6656
Blocpdb> 66 atoms in block 102
Block first atom: 6715
Blocpdb> 70 atoms in block 103
Block first atom: 6781
Blocpdb> 74 atoms in block 104
Block first atom: 6851
Blocpdb> 70 atoms in block 105
Block first atom: 6925
Blocpdb> 70 atoms in block 106
Block first atom: 6995
Blocpdb> 52 atoms in block 107
Block first atom: 7065
Blocpdb> 65 atoms in block 108
Block first atom: 7117
Blocpdb> 59 atoms in block 109
Block first atom: 7182
Blocpdb> 68 atoms in block 110
Block first atom: 7241
Blocpdb> 84 atoms in block 111
Block first atom: 7309
Blocpdb> 65 atoms in block 112
Block first atom: 7393
Blocpdb> 57 atoms in block 113
Block first atom: 7458
Blocpdb> 60 atoms in block 114
Block first atom: 7515
Blocpdb> 72 atoms in block 115
Block first atom: 7575
Blocpdb> 69 atoms in block 116
Block first atom: 7647
Blocpdb> 73 atoms in block 117
Block first atom: 7716
Blocpdb> 56 atoms in block 118
Block first atom: 7789
Blocpdb> 64 atoms in block 119
Block first atom: 7845
Blocpdb> 61 atoms in block 120
Block first atom: 7909
Blocpdb> 64 atoms in block 121
Block first atom: 7970
Blocpdb> 73 atoms in block 122
Block first atom: 8034
Blocpdb> 53 atoms in block 123
Block first atom: 8107
Blocpdb> 74 atoms in block 124
Block first atom: 8160
Blocpdb> 69 atoms in block 125
Block first atom: 8234
Blocpdb> 62 atoms in block 126
Block first atom: 8303
Blocpdb> 62 atoms in block 127
Block first atom: 8365
Blocpdb> 60 atoms in block 128
Block first atom: 8427
Blocpdb> 67 atoms in block 129
Block first atom: 8487
Blocpdb> 62 atoms in block 130
Block first atom: 8554
Blocpdb> 69 atoms in block 131
Block first atom: 8616
Blocpdb> 81 atoms in block 132
Block first atom: 8685
Blocpdb> 64 atoms in block 133
Block first atom: 8766
Blocpdb> 66 atoms in block 134
Block first atom: 8830
Blocpdb> 61 atoms in block 135
Block first atom: 8896
Blocpdb> 69 atoms in block 136
Block first atom: 8957
Blocpdb> 48 atoms in block 137
Block first atom: 9026
Blocpdb> 71 atoms in block 138
Block first atom: 9074
Blocpdb> 58 atoms in block 139
Block first atom: 9145
Blocpdb> 75 atoms in block 140
Block first atom: 9203
Blocpdb> 56 atoms in block 141
Block first atom: 9278
Blocpdb> 65 atoms in block 142
Block first atom: 9334
Blocpdb> 77 atoms in block 143
Block first atom: 9399
Blocpdb> 87 atoms in block 144
Block first atom: 9476
Blocpdb> 71 atoms in block 145
Block first atom: 9563
Blocpdb> 75 atoms in block 146
Block first atom: 9634
Blocpdb> 56 atoms in block 147
Block first atom: 9709
Blocpdb> 56 atoms in block 148
Block first atom: 9765
Blocpdb> 57 atoms in block 149
Block first atom: 9821
Blocpdb> 71 atoms in block 150
Block first atom: 9878
Blocpdb> 51 atoms in block 151
Block first atom: 9949
Blocpdb> 74 atoms in block 152
Block first atom: 10000
Blocpdb> 61 atoms in block 153
Block first atom: 10074
Blocpdb> 66 atoms in block 154
Block first atom: 10135
Blocpdb> 68 atoms in block 155
Block first atom: 10201
Blocpdb> 80 atoms in block 156
Block first atom: 10269
Blocpdb> 54 atoms in block 157
Block first atom: 10348
Blocpdb> 157 blocks.
Blocpdb> At most, 87 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 43 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 7891254 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 31206
Prepmat> Matrix trace = 17400200.0000
Prepmat> Last element read: 31206 31206 598.3768
Prepmat> 12404 lines saved.
Prepmat> 10715 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10402
RTB> Total mass = 10402.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 10402
RTB> Number of blocks = 157
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 390686.8645
RTB> 58413 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 942
Diagstd> Nb of non-zero elements: 58413
Diagstd> Projected matrix trace = 390686.8645
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 942 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 390686.8645
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.1648810 3.9327679 5.9566260 6.3919184
8.9329594 10.2921651 12.4303451 13.3013939 13.7388944
15.4905951 16.5131119 18.2909319 19.1357019 19.9136008
21.3673236 23.6493645 25.0011571 26.8138451 28.1933495
29.2092946 30.5539220 33.0017273 34.4043472 36.4793020
38.4626707 39.6962826 41.4417754 43.2909858 44.5042840
44.7561272 47.3642861 49.3097721 49.8249617 51.2416632
52.4536975 53.7045606 54.2987908 56.5780557 57.7382183
59.3600956 60.3744275 61.1525211 61.4085582 62.7713622
63.6460925 64.7849693 67.0285425 67.3709487 69.6287451
72.0427973 72.1245988 73.6155298 75.2846675 76.2106080
77.1188830 77.2928988 79.2980070 79.7251302 79.9567888
82.7983785 83.4745479 85.2308106 86.1640780 86.7073886
87.6766351 88.3648424 89.7977794 91.6735893 92.4260484
93.9315762 94.6296753 95.0800104 95.5276009 96.4176941
98.5487928 99.0702685 99.6760348 101.0948565 101.9077312
102.9242130 104.0320404 105.5613491 106.1565789 107.7216438
109.4565847 109.8770109 110.8471927 111.5105986 112.3645497
112.9798259 114.0733799 115.0535782 115.9006449 118.3717591
118.6794356 119.7673190 120.8263655 122.4060543 122.9236164
123.6276462
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034312 0.0034312 0.0034326 0.0034335 0.0034349
0.0034352 193.1852536 215.3497841 265.0302496 274.5433272
324.5584804 348.3763405 382.8572473 396.0443827 402.5049013
427.3948956 441.2754254 464.4224412 475.0261065 484.5852368
501.9614255 528.0864425 542.9693754 562.3087330 576.5920072
586.8887910 600.2452928 623.8262078 636.9450121 655.8711686
673.4649510 684.1797239 699.0600062 714.4864850 724.4296036
726.4764329 747.3443888 762.5385036 766.5116625 777.3326133
786.4721240 795.7943732 800.1849140 816.8066965 825.1387243
836.6476127 843.7655569 849.1852920 850.9611448 860.3517706
866.3256098 874.0422149 889.0479160 891.3158139 906.1280282
921.7020725 922.2252005 931.7083789 942.2118210 947.9883352
953.6206470 954.6959453 966.9998718 969.6006523 971.0083226
988.1120517 992.1385346 1002.5212562 1007.9950581 1011.1680380
1016.8039324 1020.7867730 1029.0301012 1039.7223941 1043.9807073
1052.4490617 1056.3527207 1058.8632867 1061.3526673 1066.2858617
1078.0053958 1080.8537914 1084.1532019 1091.8420354 1096.2228406
1101.6764294 1107.5895217 1115.7008045 1118.8419390 1127.0592984
1136.0991288 1138.2789339 1143.2932241 1146.7093505 1151.0917417
1154.2389642 1159.8115649 1164.7838631 1169.0637829 1181.4608395
1182.9952922 1188.4049285 1193.6476192 1201.4251795 1203.9624572
1207.4053074
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10402
Rtb_to_modes> Number of blocs = 157
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9839E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9839E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.165
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.957
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.392
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.21
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.6
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 942 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99998
0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997
1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99999 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999
0.99999 1.00004 0.99999 1.00000 1.00004
0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 0.99997
1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 187236 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 0.99998
0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 0.99997
1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998
1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001
0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998
1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998
0.99999 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999
0.99999 1.00004 0.99999 1.00000 1.00004
0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 0.99997
1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998
0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605260847501347416.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605260847501347416.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605260847501347416.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605260847501347416.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 625
First residue number = 1
Last residue number = 155
Number of atoms found = 10402
Mean number per residue = 16.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9839E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9839E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.957
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.392
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.6
Bfactors> 106 vectors, 31206 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.165000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.004 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.004
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605260847501347416.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605260847501347416.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1143.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1189.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207.
Chkmod> 106 vectors, 31206 coordinates in file.
Chkmod> That is: 10402 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7336
0.0034 0.7447
0.0034 0.9347
0.0034 0.7643
0.0034 0.8280
0.0034 0.8888
193.1806 0.6020
215.3469 0.5454
265.0272 0.6225
274.5333 0.5863
324.5453 0.7346
348.3247 0.5922
382.8355 0.6289
396.0066 0.6602
402.5038 0.5790
427.3683 0.3529
441.2149 0.3343
464.3907 0.4428
475.0591 0.4690
484.5206 0.3350
501.9713 0.3711
528.0709 0.4588
542.9335 0.4733
562.2443 0.2511
576.5330 0.3331
586.8707 0.3686
600.1810 0.4457
623.7831 0.4908
636.8774 0.3561
655.8493 0.4260
673.4127 0.4383
684.1824 0.4179
699.0150 0.3552
714.4477 0.4348
724.3636 0.4056
726.4767 0.5167
747.2785 0.4079
762.5075 0.4451
766.4406 0.3662
777.2866 0.3494
786.4106 0.4208
795.7264 0.4861
800.1595 0.4099
816.7857 0.5292
825.1160 0.4070
836.6110 0.3813
843.6984 0.2898
849.1313 0.3602
850.9346 0.3735
860.3055 0.4304
866.3150 0.4916
873.9712 0.3664
889.0194 0.3962
891.2713 0.4747
906.0973 0.3641
921.6446 0.4114
922.1562 0.3158
931.6967 0.3339
942.1422 0.3360
947.9439 0.2403
953.5866 0.3112
954.6371 0.4225
966.9705 0.4832
969.5886 0.4405
970.9861 0.4315
988.0793 0.3433
992.0689 0.4262
1002.4735 0.3529
1007.9279 0.4752
1011.1399 0.4609
1016.7798 0.4091
1020.7150 0.4030
1028.9987 0.4776
1039.6574 0.3715
1043.9582 0.4795
1052.3951 0.4645
1056.3092 0.3755
1058.8178 0.4868
1061.3204 0.2930
1066.2528 0.4405
1077.9657 0.4314
1080.8059 0.4644
1084.1282 0.3071
1091.8229 0.4577
1096.1342 0.5206
1101.4995 0.4283
1107.3714 0.4547
1115.8571 0.3551
1119.0227 0.5045
1126.8977 0.3294
1136.2756 0.4773
1138.3491 0.4258
1143.0008 0.4182
1146.6056 0.5137
1151.2239 0.3824
1154.2925 0.4515
1159.8971 0.4386
1164.9688 0.2859
1169.0103 0.2943
1181.5510 0.4654
1183.0470 0.4452
1188.5160 0.4338
1193.4661 0.4771
1201.3439 0.4647
1203.7951 0.5536
1207.2185 0.4697
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2605260847501347416.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605260847501347416.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2605260847501347416.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605260847501347416.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2605260847501347416.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2605260847501347416.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1107.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1143.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1189.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207.
Projmod> 106 vectors, 31206 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 625
First residue number = 1
Last residue number = 155
Number of atoms found = 10402
Mean number per residue = 16.6
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 625
First residue number = 1
Last residue number = 155
Number of atoms found = 10402
Mean number per residue = 16.6
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 10402 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 0.00
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 2 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 3 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 4 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 5 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 6 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 7 F= 193.18 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 8 F= 215.35 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 9 F= 265.03 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 10 F= 274.53 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 11 F= 324.55 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 12 F= 348.32 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 13 F= 382.84 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 14 F= 396.01 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 15 F= 402.50 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 16 F= 427.37 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 17 F= 441.21 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 18 F= 464.39 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 19 F= 475.06 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 20 F= 484.52 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 21 F= 501.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 22 F= 528.07 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 23 F= 542.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 24 F= 562.24 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 25 F= 576.53 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 26 F= 586.87 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 27 F= 600.18 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 28 F= 623.78 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 29 F= 636.88 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 30 F= 655.85 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 31 F= 673.41 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 32 F= 684.18 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 33 F= 699.02 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 34 F= 714.45 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 35 F= 724.36 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 36 F= 726.48 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 39 F= 766.44 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 40 F= 777.29 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 41 F= 786.41 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 42 F= 795.73 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 43 F= 800.16 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 44 F= 816.79 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 45 F= 825.12 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 46 F= 836.61 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 47 F= 843.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 48 F= 849.13 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 49 F= 850.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 50 F= 860.31 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 51 F= 866.32 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 52 F= 873.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 53 F= 889.02 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 54 F= 891.27 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 55 F= 906.10 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 56 F= 921.64 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 57 F= 922.16 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 58 F= 931.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 59 F= 942.14 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 60 F= 947.94 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 61 F= 953.59 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 62 F= 954.64 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 63 F= 966.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 64 F= 969.59 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 65 F= 970.99 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 66 F= 988.08 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 67 F= 992.07 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 68 F= 1002.47 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 69 F= 1007.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 70 F= 1011.14 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 71 F= 1016.78 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 72 F= 1020.71 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 73 F= 1029.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 74 F= 1039.66 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 75 F= 1043.96 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 76 F= 1052.40 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 77 F= 1056.31 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 78 F= 1058.82 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 79 F= 1061.32 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 80 F= 1066.25 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 81 F= 1077.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 82 F= 1080.81 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
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Vector: 105 F= 1203.80 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Vector: 106 F= 1207.22 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003431
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 193.180593
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.00 for mode -1 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = NaN NaN NaN NaN NaN NaN
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 138 0.469 138 0.469
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 138 0.375 138 0.375
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 138 0.281 138 0.281
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 138 0.187 138 0.187
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 138 0.094 138 0.094
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 138 0.094 138 0.094
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 138 0.187 138 0.187
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 138 0.281 138 0.281
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 138 0.375 138 0.375
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 138 0.468 138 0.468
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 138 0.507 138 0.507
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 138 0.405 138 0.405
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 138 0.304 138 0.304
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 138 0.203 138 0.203
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 138 0.101 138 0.101
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 138 0.101 138 0.101
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 138 0.203 138 0.203
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 138 0.304 138 0.304
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 138 0.405 138 0.405
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 138 0.507 138 0.507
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 138 0.462 138 0.462
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 138 0.369 138 0.369
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 138 0.277 138 0.277
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 138 0.185 138 0.185
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 138 0.092 138 0.092
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 138 0.092 138 0.092
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 138 0.185 138 0.185
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 138 0.278 138 0.278
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 138 0.370 138 0.370
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 138 0.463 138 0.463
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 138 0.652 138 0.652
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 138 0.522 138 0.522
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 138 0.392 138 0.392
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 138 0.261 138 0.261
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 138 0.131 138 0.131
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 138 0.131 138 0.131
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 138 0.262 138 0.262
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 138 0.393 138 0.393
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 138 0.525 138 0.525
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 138 0.656 138 0.656
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
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2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 138 0.462 138 0.462
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 138 0.369 138 0.369
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 138 0.277 138 0.277
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 138 0.185 138 0.185
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 138 0.092 138 0.092
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 138 0.092 138 0.092
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 138 0.185 138 0.185
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 138 0.277 138 0.277
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 138 0.370 138 0.370
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 138 0.462 138 0.462
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 12 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
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2605260847501347416.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-100 138 0.630 138 0.630
MODEL 2 MODE=12 DQ=-80 138 0.504 138 0.504
MODEL 3 MODE=12 DQ=-60 138 0.378 138 0.378
MODEL 4 MODE=12 DQ=-40 138 0.252 138 0.252
MODEL 5 MODE=12 DQ=-20 138 0.126 138 0.126
MODEL 6 MODE=12 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=12 DQ=20 138 0.126 138 0.126
MODEL 8 MODE=12 DQ=40 138 0.252 138 0.252
MODEL 9 MODE=12 DQ=60 138 0.379 138 0.379
MODEL 10 MODE=12 DQ=80 138 0.505 138 0.505
MODEL 11 MODE=12 DQ=100 138 0.632 138 0.632
getting mode 13
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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11 models are in 2605260847501347416.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-100 138 0.603 138 0.603
MODEL 2 MODE=13 DQ=-80 138 0.483 138 0.483
MODEL 3 MODE=13 DQ=-60 138 0.362 138 0.362
MODEL 4 MODE=13 DQ=-40 138 0.241 138 0.241
MODEL 5 MODE=13 DQ=-20 138 0.121 138 0.121
MODEL 6 MODE=13 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=13 DQ=20 138 0.121 138 0.121
MODEL 8 MODE=13 DQ=40 138 0.241 138 0.241
MODEL 9 MODE=13 DQ=60 138 0.362 138 0.362
MODEL 10 MODE=13 DQ=80 138 0.482 138 0.482
MODEL 11 MODE=13 DQ=100 138 0.603 138 0.603
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 14 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
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11 models are in 2605260847501347416.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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11 models are in 2605260847501347416.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-100 138 0.607 138 0.607
MODEL 2 MODE=14 DQ=-80 138 0.485 138 0.485
MODEL 3 MODE=14 DQ=-60 138 0.364 138 0.364
MODEL 4 MODE=14 DQ=-40 138 0.243 138 0.243
MODEL 5 MODE=14 DQ=-20 138 0.121 138 0.121
MODEL 6 MODE=14 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=14 DQ=20 138 0.121 138 0.121
MODEL 8 MODE=14 DQ=40 138 0.242 138 0.242
MODEL 9 MODE=14 DQ=60 138 0.364 138 0.364
MODEL 10 MODE=14 DQ=80 138 0.485 138 0.485
MODEL 11 MODE=14 DQ=100 138 0.606 138 0.606
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 15 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-100 138 0.808 138 0.808
MODEL 2 MODE=15 DQ=-80 138 0.646 138 0.646
MODEL 3 MODE=15 DQ=-60 138 0.485 138 0.485
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MODEL 5 MODE=15 DQ=-20 138 0.162 138 0.162
MODEL 6 MODE=15 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=15 DQ=20 138 0.162 138 0.162
MODEL 8 MODE=15 DQ=40 138 0.323 138 0.323
MODEL 9 MODE=15 DQ=60 138 0.485 138 0.485
MODEL 10 MODE=15 DQ=80 138 0.646 138 0.646
MODEL 11 MODE=15 DQ=100 138 0.808 138 0.808
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 2605260847501347416 16 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605260847501347416.eigenfacs
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2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
2605260847501347416.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605260847501347416.eigenfacs
2605260847501347416.atom
making animated gifs
11 models are in 2605260847501347416.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605260847501347416.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-100 138 0.781 137 0.739
MODEL 2 MODE=16 DQ=-80 138 0.625 138 0.625
MODEL 3 MODE=16 DQ=-60 138 0.468 138 0.468
MODEL 4 MODE=16 DQ=-40 138 0.312 138 0.312
MODEL 5 MODE=16 DQ=-20 138 0.156 138 0.156
MODEL 6 MODE=16 DQ=0 138 0.000 138 0.000
MODEL 7 MODE=16 DQ=20 138 0.156 138 0.156
MODEL 8 MODE=16 DQ=40 138 0.312 138 0.312
MODEL 9 MODE=16 DQ=60 138 0.467 138 0.467
MODEL 10 MODE=16 DQ=80 138 0.622 138 0.622
MODEL 11 MODE=16 DQ=100 138 0.778 137 0.736
2605260847501347416.10.pdb
2605260847501347416.11.pdb
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2605260847501347416.13.pdb
2605260847501347416.14.pdb
2605260847501347416.15.pdb
2605260847501347416.16.pdb
2605260847501347416.7.pdb
2605260847501347416.8.pdb
2605260847501347416.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
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