*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605280951211694340.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605280951211694340.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605280951211694340.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1570
First residue number = 1
Last residue number = 785
Number of atoms found = 12390
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.381826 +/- 22.418100 From: -55.109000 To: 55.471000
= -0.205818 +/- 22.121745 From: -50.023000 To: 52.901000
= 0.427334 +/- 21.629315 From: -53.476000 To: 59.189000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.6603 % Filled.
Pdbmat> 4561333 non-zero elements.
Pdbmat> 498622 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.49 +/- 21.20
Maximum number = 130
Minimum number = 7
Pdbmat> Matrix trace = 9.972440E+06
Pdbmat> Larger element = 492.487
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1570 non-zero elements, NRBL set to 8
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605280951211694340.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 8
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605280951211694340.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605280951211694340.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 12390 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 8 residue(s) per block.
Blocpdb> 1570 residues.
Blocpdb> 77 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 55 atoms in block 2
Block first atom: 78
Blocpdb> 53 atoms in block 3
Block first atom: 133
Blocpdb> 72 atoms in block 4
Block first atom: 186
Blocpdb> 65 atoms in block 5
Block first atom: 258
Blocpdb> 59 atoms in block 6
Block first atom: 323
Blocpdb> 55 atoms in block 7
Block first atom: 382
Blocpdb> 55 atoms in block 8
Block first atom: 437
Blocpdb> 72 atoms in block 9
Block first atom: 492
Blocpdb> 60 atoms in block 10
Block first atom: 564
Blocpdb> 61 atoms in block 11
Block first atom: 624
Blocpdb> 62 atoms in block 12
Block first atom: 685
Blocpdb> 69 atoms in block 13
Block first atom: 747
Blocpdb> 69 atoms in block 14
Block first atom: 816
Blocpdb> 68 atoms in block 15
Block first atom: 885
Blocpdb> 64 atoms in block 16
Block first atom: 953
Blocpdb> 63 atoms in block 17
Block first atom: 1017
Blocpdb> 63 atoms in block 18
Block first atom: 1080
Blocpdb> 71 atoms in block 19
Block first atom: 1143
Blocpdb> 61 atoms in block 20
Block first atom: 1214
Blocpdb> 60 atoms in block 21
Block first atom: 1275
Blocpdb> 59 atoms in block 22
Block first atom: 1335
Blocpdb> 55 atoms in block 23
Block first atom: 1394
Blocpdb> 75 atoms in block 24
Block first atom: 1449
Blocpdb> 65 atoms in block 25
Block first atom: 1524
Blocpdb> 66 atoms in block 26
Block first atom: 1589
Blocpdb> 58 atoms in block 27
Block first atom: 1655
Blocpdb> 58 atoms in block 28
Block first atom: 1713
Blocpdb> 62 atoms in block 29
Block first atom: 1771
Blocpdb> 62 atoms in block 30
Block first atom: 1833
Blocpdb> 61 atoms in block 31
Block first atom: 1895
Blocpdb> 58 atoms in block 32
Block first atom: 1956
Blocpdb> 70 atoms in block 33
Block first atom: 2014
Blocpdb> 66 atoms in block 34
Block first atom: 2084
Blocpdb> 63 atoms in block 35
Block first atom: 2150
Blocpdb> 73 atoms in block 36
Block first atom: 2213
Blocpdb> 70 atoms in block 37
Block first atom: 2286
Blocpdb> 65 atoms in block 38
Block first atom: 2356
Blocpdb> 53 atoms in block 39
Block first atom: 2421
Blocpdb> 55 atoms in block 40
Block first atom: 2474
Blocpdb> 58 atoms in block 41
Block first atom: 2529
Blocpdb> 59 atoms in block 42
Block first atom: 2587
Blocpdb> 64 atoms in block 43
Block first atom: 2646
Blocpdb> 63 atoms in block 44
Block first atom: 2710
Blocpdb> 64 atoms in block 45
Block first atom: 2773
Blocpdb> 73 atoms in block 46
Block first atom: 2837
Blocpdb> 60 atoms in block 47
Block first atom: 2910
Blocpdb> 63 atoms in block 48
Block first atom: 2970
Blocpdb> 61 atoms in block 49
Block first atom: 3033
Blocpdb> 62 atoms in block 50
Block first atom: 3094
Blocpdb> 68 atoms in block 51
Block first atom: 3156
Blocpdb> 66 atoms in block 52
Block first atom: 3224
Blocpdb> 61 atoms in block 53
Block first atom: 3290
Blocpdb> 54 atoms in block 54
Block first atom: 3351
Blocpdb> 61 atoms in block 55
Block first atom: 3405
Blocpdb> 61 atoms in block 56
Block first atom: 3466
Blocpdb> 59 atoms in block 57
Block first atom: 3527
Blocpdb> 57 atoms in block 58
Block first atom: 3586
Blocpdb> 61 atoms in block 59
Block first atom: 3643
Blocpdb> 61 atoms in block 60
Block first atom: 3704
Blocpdb> 59 atoms in block 61
Block first atom: 3765
Blocpdb> 66 atoms in block 62
Block first atom: 3824
Blocpdb> 69 atoms in block 63
Block first atom: 3890
Blocpdb> 72 atoms in block 64
Block first atom: 3959
Blocpdb> 61 atoms in block 65
Block first atom: 4031
Blocpdb> 76 atoms in block 66
Block first atom: 4092
Blocpdb> 58 atoms in block 67
Block first atom: 4168
Blocpdb> 66 atoms in block 68
Block first atom: 4226
Blocpdb> 53 atoms in block 69
Block first atom: 4292
Blocpdb> 48 atoms in block 70
Block first atom: 4345
Blocpdb> 69 atoms in block 71
Block first atom: 4393
Blocpdb> 62 atoms in block 72
Block first atom: 4462
Blocpdb> 56 atoms in block 73
Block first atom: 4524
Blocpdb> 64 atoms in block 74
Block first atom: 4580
Blocpdb> 66 atoms in block 75
Block first atom: 4644
Blocpdb> 65 atoms in block 76
Block first atom: 4710
Blocpdb> 69 atoms in block 77
Block first atom: 4775
Blocpdb> 64 atoms in block 78
Block first atom: 4844
Blocpdb> 60 atoms in block 79
Block first atom: 4908
Blocpdb> 71 atoms in block 80
Block first atom: 4968
Blocpdb> 71 atoms in block 81
Block first atom: 5039
Blocpdb> 55 atoms in block 82
Block first atom: 5110
Blocpdb> 60 atoms in block 83
Block first atom: 5165
Blocpdb> 62 atoms in block 84
Block first atom: 5225
Blocpdb> 67 atoms in block 85
Block first atom: 5287
Blocpdb> 61 atoms in block 86
Block first atom: 5354
Blocpdb> 62 atoms in block 87
Block first atom: 5415
Blocpdb> 66 atoms in block 88
Block first atom: 5477
Blocpdb> 63 atoms in block 89
Block first atom: 5543
Blocpdb> 65 atoms in block 90
Block first atom: 5606
Blocpdb> 65 atoms in block 91
Block first atom: 5671
Blocpdb> 59 atoms in block 92
Block first atom: 5736
Blocpdb> 68 atoms in block 93
Block first atom: 5795
Blocpdb> 76 atoms in block 94
Block first atom: 5863
Blocpdb> 71 atoms in block 95
Block first atom: 5939
Blocpdb> 62 atoms in block 96
Block first atom: 6010
Blocpdb> 54 atoms in block 97
Block first atom: 6072
Blocpdb> 57 atoms in block 98
Block first atom: 6126
Blocpdb> 13 atoms in block 99
Block first atom: 6183
Blocpdb> 77 atoms in block 100
Block first atom: 6196
Blocpdb> 55 atoms in block 101
Block first atom: 6273
Blocpdb> 53 atoms in block 102
Block first atom: 6328
Blocpdb> 72 atoms in block 103
Block first atom: 6381
Blocpdb> 65 atoms in block 104
Block first atom: 6453
Blocpdb> 59 atoms in block 105
Block first atom: 6518
Blocpdb> 55 atoms in block 106
Block first atom: 6577
Blocpdb> 55 atoms in block 107
Block first atom: 6632
Blocpdb> 72 atoms in block 108
Block first atom: 6687
Blocpdb> 60 atoms in block 109
Block first atom: 6759
Blocpdb> 61 atoms in block 110
Block first atom: 6819
Blocpdb> 62 atoms in block 111
Block first atom: 6880
Blocpdb> 69 atoms in block 112
Block first atom: 6942
Blocpdb> 69 atoms in block 113
Block first atom: 7011
Blocpdb> 68 atoms in block 114
Block first atom: 7080
Blocpdb> 64 atoms in block 115
Block first atom: 7148
Blocpdb> 63 atoms in block 116
Block first atom: 7212
Blocpdb> 63 atoms in block 117
Block first atom: 7275
Blocpdb> 71 atoms in block 118
Block first atom: 7338
Blocpdb> 61 atoms in block 119
Block first atom: 7409
Blocpdb> 60 atoms in block 120
Block first atom: 7470
Blocpdb> 59 atoms in block 121
Block first atom: 7530
Blocpdb> 55 atoms in block 122
Block first atom: 7589
Blocpdb> 75 atoms in block 123
Block first atom: 7644
Blocpdb> 65 atoms in block 124
Block first atom: 7719
Blocpdb> 66 atoms in block 125
Block first atom: 7784
Blocpdb> 58 atoms in block 126
Block first atom: 7850
Blocpdb> 58 atoms in block 127
Block first atom: 7908
Blocpdb> 62 atoms in block 128
Block first atom: 7966
Blocpdb> 62 atoms in block 129
Block first atom: 8028
Blocpdb> 61 atoms in block 130
Block first atom: 8090
Blocpdb> 58 atoms in block 131
Block first atom: 8151
Blocpdb> 70 atoms in block 132
Block first atom: 8209
Blocpdb> 66 atoms in block 133
Block first atom: 8279
Blocpdb> 63 atoms in block 134
Block first atom: 8345
Blocpdb> 73 atoms in block 135
Block first atom: 8408
Blocpdb> 70 atoms in block 136
Block first atom: 8481
Blocpdb> 65 atoms in block 137
Block first atom: 8551
Blocpdb> 53 atoms in block 138
Block first atom: 8616
Blocpdb> 55 atoms in block 139
Block first atom: 8669
Blocpdb> 58 atoms in block 140
Block first atom: 8724
Blocpdb> 59 atoms in block 141
Block first atom: 8782
Blocpdb> 64 atoms in block 142
Block first atom: 8841
Blocpdb> 63 atoms in block 143
Block first atom: 8905
Blocpdb> 64 atoms in block 144
Block first atom: 8968
Blocpdb> 73 atoms in block 145
Block first atom: 9032
Blocpdb> 60 atoms in block 146
Block first atom: 9105
Blocpdb> 63 atoms in block 147
Block first atom: 9165
Blocpdb> 61 atoms in block 148
Block first atom: 9228
Blocpdb> 62 atoms in block 149
Block first atom: 9289
Blocpdb> 68 atoms in block 150
Block first atom: 9351
Blocpdb> 66 atoms in block 151
Block first atom: 9419
Blocpdb> 61 atoms in block 152
Block first atom: 9485
Blocpdb> 54 atoms in block 153
Block first atom: 9546
Blocpdb> 61 atoms in block 154
Block first atom: 9600
Blocpdb> 61 atoms in block 155
Block first atom: 9661
Blocpdb> 59 atoms in block 156
Block first atom: 9722
Blocpdb> 57 atoms in block 157
Block first atom: 9781
Blocpdb> 61 atoms in block 158
Block first atom: 9838
Blocpdb> 61 atoms in block 159
Block first atom: 9899
Blocpdb> 59 atoms in block 160
Block first atom: 9960
Blocpdb> 66 atoms in block 161
Block first atom: 10019
Blocpdb> 69 atoms in block 162
Block first atom: 10085
Blocpdb> 72 atoms in block 163
Block first atom: 10154
Blocpdb> 61 atoms in block 164
Block first atom: 10226
Blocpdb> 76 atoms in block 165
Block first atom: 10287
Blocpdb> 58 atoms in block 166
Block first atom: 10363
Blocpdb> 66 atoms in block 167
Block first atom: 10421
Blocpdb> 53 atoms in block 168
Block first atom: 10487
Blocpdb> 48 atoms in block 169
Block first atom: 10540
Blocpdb> 69 atoms in block 170
Block first atom: 10588
Blocpdb> 62 atoms in block 171
Block first atom: 10657
Blocpdb> 56 atoms in block 172
Block first atom: 10719
Blocpdb> 64 atoms in block 173
Block first atom: 10775
Blocpdb> 66 atoms in block 174
Block first atom: 10839
Blocpdb> 65 atoms in block 175
Block first atom: 10905
Blocpdb> 69 atoms in block 176
Block first atom: 10970
Blocpdb> 64 atoms in block 177
Block first atom: 11039
Blocpdb> 60 atoms in block 178
Block first atom: 11103
Blocpdb> 71 atoms in block 179
Block first atom: 11163
Blocpdb> 71 atoms in block 180
Block first atom: 11234
Blocpdb> 55 atoms in block 181
Block first atom: 11305
Blocpdb> 60 atoms in block 182
Block first atom: 11360
Blocpdb> 62 atoms in block 183
Block first atom: 11420
Blocpdb> 67 atoms in block 184
Block first atom: 11482
Blocpdb> 61 atoms in block 185
Block first atom: 11549
Blocpdb> 62 atoms in block 186
Block first atom: 11610
Blocpdb> 66 atoms in block 187
Block first atom: 11672
Blocpdb> 63 atoms in block 188
Block first atom: 11738
Blocpdb> 65 atoms in block 189
Block first atom: 11801
Blocpdb> 65 atoms in block 190
Block first atom: 11866
Blocpdb> 59 atoms in block 191
Block first atom: 11931
Blocpdb> 68 atoms in block 192
Block first atom: 11990
Blocpdb> 76 atoms in block 193
Block first atom: 12058
Blocpdb> 71 atoms in block 194
Block first atom: 12134
Blocpdb> 62 atoms in block 195
Block first atom: 12205
Blocpdb> 54 atoms in block 196
Block first atom: 12267
Blocpdb> 57 atoms in block 197
Block first atom: 12321
Blocpdb> 13 atoms in block 198
Block first atom: 12377
Blocpdb> 198 blocks.
Blocpdb> At most, 77 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4561531 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 37170
Prepmat> Matrix trace = 9972440.0000
Prepmat> Last element read: 37170 37170 255.8918
Prepmat> 19702 lines saved.
Prepmat> 18198 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12390
RTB> Total mass = 12390.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 12390
RTB> Number of blocks = 198
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 188777.5370
RTB> 51138 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1188
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51138
Diagstd> Projected matrix trace = 188777.5370
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1188 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 188777.5370
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2339617 0.2627095 0.6163422 0.6926389
0.8171721 0.9881810 1.0869454 1.1198508 1.2216222
1.2429079 1.3835261 1.4688949 1.5958825 2.5086509
2.5846272 2.9048031 3.0017416 3.0671356 3.2091304
3.3338117 3.4577387 3.6640512 4.0938522 4.2225355
4.3961770 4.5883792 4.6924017 4.7321657 5.0428636
5.4913665 5.8822460 6.0359016 6.5526844 6.6680643
7.0123026 7.1215333 7.2180619 7.3468066 7.5260245
7.8745723 8.4391824 8.6897370 8.8833973 9.1084995
9.4144312 9.9331155 10.0781157 10.3162824 10.5321159
11.1202560 11.3506911 11.6439950 11.7432765 11.9063920
12.2761734 12.3262850 12.9222630 13.3201353 13.4128023
13.7018522 13.9331615 14.1425251 14.4368884 14.5186045
14.6191635 15.1597788 15.4813690 15.8055907 15.9774486
16.2208083 16.5231803 17.1598404 17.4501542 17.5791781
17.6807873 17.8029781 18.3203480 18.6964326 18.7649641
19.0853307 19.2368889 19.7602011 19.8366605 19.9914087
20.0313043 20.3904626 20.9001217 21.3351444 21.5647867
21.7715457 22.0503619 22.6998945 23.1438771 23.6815867
24.2993721 24.3329317 25.0198205 25.2361673 25.3272428
26.3571494
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034335 0.0034338 0.0034339 0.0034339
0.0034350 52.5251949 55.6587161 85.2523230 90.3750864
98.1639516 107.9477356 113.2137440 114.9146414 120.0227948
121.0639285 127.7288381 131.6105322 137.1815606 171.9948298
174.5798992 185.0775029 188.1403430 190.1786538 194.5310630
198.2740217 201.9255911 207.8624538 219.7158355 223.1423159
227.6841854 232.6081514 235.2300888 236.2246706 243.8562492
254.4693580 263.3703451 266.7880391 277.9744677 280.4110790
287.5580993 289.7890930 291.7464511 294.3368145 297.9052079
304.7254794 315.4608487 320.1095246 323.6568659 327.7318870
333.1902790 342.2457177 344.7346598 348.7842715 352.4139534
362.1201346 365.8528413 370.5495467 372.1259215 374.7014456
380.4755800 381.2513436 390.3593344 396.3232934 397.6994978
401.9619263 405.3406093 408.3746354 412.6027131 413.7687794
415.1992327 422.8065561 427.2676008 431.7184868 434.0592294
437.3524126 441.4099320 449.8336117 453.6228422 455.2967634
456.6106960 458.1857832 464.7957412 469.5422255 470.4019894
474.4004858 476.2803884 482.7151840 483.6481836 485.5310178
486.0152479 490.3529809 496.4433385 501.5833056 504.2754945
506.6871756 509.9212853 517.3770972 522.4122327 528.4460781
535.2945301 535.6640477 543.1720012 545.5153544 546.4988306
557.4995225
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12390
Rtb_to_modes> Number of blocs = 198
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2340
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2627
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6163
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6926
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8172
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9882
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.087
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.120
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.222
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.243
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.384
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.469
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.596
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.509
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.585
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.905
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.002
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.209
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.334
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.458
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.664
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.094
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.223
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.396
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.588
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.692
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.732
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.043
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.882
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.036
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.553
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.668
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.012
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.122
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.218
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.347
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.875
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.439
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.414
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.36
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003
1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
1.00002 0.99997 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 223020 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003
1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
1.00002 0.99997 1.00002 0.99998 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605280951211694340.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605280951211694340.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605280951211694340.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605280951211694340.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1570
First residue number = 1
Last residue number = 785
Number of atoms found = 12390
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2340
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2627
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6926
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9882
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.087
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.120
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.222
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.469
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.509
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.585
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.905
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.002
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.209
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.334
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.458
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.664
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.094
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.223
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.396
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.588
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.732
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.043
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.882
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.036
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.553
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.668
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.122
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.218
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.347
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.875
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.439
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.414
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.36
Bfactors> 106 vectors, 37170 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.234000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.589 for 1570 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.036 +/- 0.12
Bfactors> = 80.199 +/- 12.98
Bfactors> Shiftng-fct= 80.163
Bfactors> Scaling-fct= 107.142
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605280951211694340.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605280951211694340.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 278.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.5
Chkmod> 106 vectors, 37170 coordinates in file.
Chkmod> That is: 12390 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7708
0.0034 0.9753
0.0034 0.8138
0.0034 0.7152
0.0034 0.7680
0.0034 0.8668
52.5272 0.0133
55.6553 0.0137
85.2457 0.4735
90.3687 0.4101
98.1614 0.2168
107.9441 0.0119
113.2117 0.2668
114.9174 0.0236
120.0362 0.0938
121.0632 0.1115
127.7452 0.1461
131.6096 0.4357
137.1807 0.5945
171.9994 0.4681
174.5850 0.3411
185.0758 0.5836
188.1404 0.5172
190.1663 0.7842
194.5188 0.0747
198.2711 0.0527
201.9246 0.4283
207.8521 0.6351
219.7104 0.5899
223.1450 0.3445
227.6698 0.7387
232.5886 0.0898
235.2099 0.0937
236.2104 0.4092
243.8491 0.5457
254.4499 0.5294
263.3535 0.7401
266.7788 0.5168
277.9692 0.1709
280.3977 0.4701
287.5396 0.3736
289.7861 0.2510
291.7327 0.5651
294.3281 0.5812
297.8919 0.2145
304.7207 0.4738
315.4439 0.1468
320.1006 0.1982
323.6357 0.4454
327.7088 0.4869
333.1683 0.2086
342.2290 0.5064
344.7521 0.2078
348.8321 0.5469
352.3634 0.6369
362.1004 0.5685
365.8260 0.5633
370.4701 0.3784
372.0580 0.4401
374.7421 0.5716
380.5185 0.3357
381.2924 0.2891
390.3084 0.2777
396.3043 0.2229
397.6409 0.5249
401.9175 0.4828
405.2772 0.5611
408.3206 0.3388
412.6295 0.0675
413.7709 0.5401
415.1933 0.4922
422.7915 0.5781
427.2304 0.4764
431.7602 0.5139
434.0753 0.3198
437.3227 0.5040
441.3485 0.4602
449.8164 0.2345
453.6014 0.4679
455.2879 0.5813
456.5809 0.5396
458.1278 0.4557
464.7714 0.4698
469.5669 0.5188
470.3196 0.5211
474.4381 0.5660
476.2985 0.5608
482.6920 0.5206
483.6681 0.2938
485.4931 0.2934
485.9786 0.1672
490.3264 0.4625
496.4206 0.5553
501.6188 0.5044
504.1979 0.4565
506.6474 0.5788
509.8952 0.5511
517.3561 0.5970
522.3460 0.5261
528.4057 0.4180
535.2785 0.5518
535.6088 0.5799
543.1506 0.3719
545.5334 0.5616
546.5051 0.5204
557.5057 0.5774
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605280951211694340 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
making animated gifs
11 models are in 2605280951211694340.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605280951211694340 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
making animated gifs
11 models are in 2605280951211694340.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605280951211694340 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
making animated gifs
11 models are in 2605280951211694340.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605280951211694340 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
making animated gifs
11 models are in 2605280951211694340.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605280951211694340 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605280951211694340.eigenfacs
2605280951211694340.atom
making animated gifs
11 models are in 2605280951211694340.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605280951211694340.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605280951211694340.10.pdb
2605280951211694340.11.pdb
2605280951211694340.7.pdb
2605280951211694340.8.pdb
2605280951211694340.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m28.135s
user 1m27.646s
sys 0m0.426s
rm: cannot remove '2605280951211694340.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
