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* test_start-only *

LOGs for ID: 2605311040242157925

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2605311040242157925.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2605311040242157925.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2605311040242157925.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    142
            First residue number     =     11
            Last  residue number     =    152
            Number of atoms found    =   1117
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    33.851690 +/-     7.648984 From:    15.174000 To:    49.525000
 =    12.562173 +/-     8.953065 From:    -5.846000 To:    34.334000
 =    10.202533 +/-    11.846904 From:   -13.130000 To:    35.161000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   6.7289 % Filled.
 Pdbmat>       377915  non-zero elements.
 Pdbmat>        41252 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     73.86 +/-     19.60
         Maximum number =    122
         Minimum number =     18

 Pdbmat> Matrix trace   =  825040.    
 Pdbmat> Larger element =  470.062    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
142 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2605311040242157925.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          1
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2605311040242157925.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2605311040242157925.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1117 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     1 residue(s) per block.
 Blocpdb>   142 residues.
 Blocpdb>     9 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>     4 atoms in block      2
 Block first atom:     10
 Blocpdb>     8 atoms in block      3
 Block first atom:     14
 Blocpdb>    11 atoms in block      4
 Block first atom:     22
 Blocpdb>     8 atoms in block      5
 Block first atom:     33
 Blocpdb>     9 atoms in block      6
 Block first atom:     41
 Blocpdb>     8 atoms in block      7
 Block first atom:     50
 Blocpdb>    12 atoms in block      8
 Block first atom:     58
 Blocpdb>     9 atoms in block      9
 Block first atom:     70
 Blocpdb>     8 atoms in block     10
 Block first atom:     79
 Blocpdb>     7 atoms in block     11
 Block first atom:     87
 Blocpdb>     9 atoms in block     12
 Block first atom:     94
 Blocpdb>     4 atoms in block     13
 Block first atom:    103
 Blocpdb>    12 atoms in block     14
 Block first atom:    107
 Blocpdb>    12 atoms in block     15
 Block first atom:    119
 Blocpdb>     7 atoms in block     16
 Block first atom:    131
 Blocpdb>     8 atoms in block     17
 Block first atom:    138
 Blocpdb>     4 atoms in block     18
 Block first atom:    146
 Blocpdb>     8 atoms in block     19
 Block first atom:    150
 Blocpdb>     4 atoms in block     20
 Block first atom:    158
 Blocpdb>    10 atoms in block     21
 Block first atom:    162
 Blocpdb>     8 atoms in block     22
 Block first atom:    172
 Blocpdb>     8 atoms in block     23
 Block first atom:    180
 Blocpdb>     7 atoms in block     24
 Block first atom:    188
 Blocpdb>     9 atoms in block     25
 Block first atom:    195
 Blocpdb>     6 atoms in block     26
 Block first atom:    204
 Blocpdb>     7 atoms in block     27
 Block first atom:    210
 Blocpdb>     6 atoms in block     28
 Block first atom:    217
 Blocpdb>     8 atoms in block     29
 Block first atom:    223
 Blocpdb>     8 atoms in block     30
 Block first atom:    231
 Blocpdb>     5 atoms in block     31
 Block first atom:    239
 Blocpdb>     5 atoms in block     32
 Block first atom:    244
 Blocpdb>     9 atoms in block     33
 Block first atom:    249
 Blocpdb>     6 atoms in block     34
 Block first atom:    258
 Blocpdb>     9 atoms in block     35
 Block first atom:    264
 Blocpdb>     8 atoms in block     36
 Block first atom:    273
 Blocpdb>     8 atoms in block     37
 Block first atom:    281
 Blocpdb>     9 atoms in block     38
 Block first atom:    289
 Blocpdb>     5 atoms in block     39
 Block first atom:    298
 Blocpdb>     8 atoms in block     40
 Block first atom:    303
 Blocpdb>     4 atoms in block     41
 Block first atom:    311
 Blocpdb>    11 atoms in block     42
 Block first atom:    315
 Blocpdb>     8 atoms in block     43
 Block first atom:    326
 Blocpdb>     6 atoms in block     44
 Block first atom:    334
 Blocpdb>     8 atoms in block     45
 Block first atom:    340
 Blocpdb>     4 atoms in block     46
 Block first atom:    348
 Blocpdb>     7 atoms in block     47
 Block first atom:    352
 Blocpdb>     8 atoms in block     48
 Block first atom:    359
 Blocpdb>     7 atoms in block     49
 Block first atom:    367
 Blocpdb>     9 atoms in block     50
 Block first atom:    374
 Blocpdb>     8 atoms in block     51
 Block first atom:    383
 Blocpdb>     9 atoms in block     52
 Block first atom:    391
 Blocpdb>     5 atoms in block     53
 Block first atom:    400
 Blocpdb>     9 atoms in block     54
 Block first atom:    405
 Blocpdb>     9 atoms in block     55
 Block first atom:    414
 Blocpdb>     8 atoms in block     56
 Block first atom:    423
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:    431
 Blocpdb>     8 atoms in block     58
 Block first atom:    442
 Blocpdb>     9 atoms in block     59
 Block first atom:    450
 Blocpdb>     8 atoms in block     60
 Block first atom:    459
 Blocpdb>     7 atoms in block     61
 Block first atom:    467
 Blocpdb>     8 atoms in block     62
 Block first atom:    474
 Blocpdb>     5 atoms in block     63
 Block first atom:    482
 Blocpdb>     5 atoms in block     64
 Block first atom:    487
 Blocpdb>     7 atoms in block     65
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    11 atoms in block     66
 Block first atom:    499
 Blocpdb>     4 atoms in block     67
 Block first atom:    510
 Blocpdb>     8 atoms in block     68
 Block first atom:    514
 Blocpdb>     8 atoms in block     69
 Block first atom:    522
 Blocpdb>    11 atoms in block     70
 Block first atom:    530
 Blocpdb>     8 atoms in block     71
 Block first atom:    541
 Blocpdb>     5 atoms in block     72
 Block first atom:    549
 Blocpdb>     9 atoms in block     73
 Block first atom:    554
 Blocpdb>     8 atoms in block     74
 Block first atom:    563
 Blocpdb>     9 atoms in block     75
 Block first atom:    571
 Blocpdb>     7 atoms in block     76
 Block first atom:    580
 Blocpdb>     7 atoms in block     77
 Block first atom:    587
 Blocpdb>    12 atoms in block     78
 Block first atom:    594
 Blocpdb>     8 atoms in block     79
 Block first atom:    606
 Blocpdb>     6 atoms in block     80
 Block first atom:    614
 Blocpdb>     8 atoms in block     81
 Block first atom:    620
 Blocpdb>     8 atoms in block     82
 Block first atom:    628
 Blocpdb>     5 atoms in block     83
 Block first atom:    636
 Blocpdb>     7 atoms in block     84
 Block first atom:    641
 Blocpdb>    11 atoms in block     85
 Block first atom:    648
 Blocpdb>    11 atoms in block     86
 Block first atom:    659
 Blocpdb>     6 atoms in block     87
 Block first atom:    670
 Blocpdb>     5 atoms in block     88
 Block first atom:    676
 Blocpdb>     8 atoms in block     89
 Block first atom:    681
 Blocpdb>     8 atoms in block     90
 Block first atom:    689
 Blocpdb>     8 atoms in block     91
 Block first atom:    697
 Blocpdb>     8 atoms in block     92
 Block first atom:    705
 Blocpdb>     7 atoms in block     93
 Block first atom:    713
 Blocpdb>    11 atoms in block     94
 Block first atom:    720
 Blocpdb>     9 atoms in block     95
 Block first atom:    731
 Blocpdb>     8 atoms in block     96
 Block first atom:    740
 Blocpdb>     4 atoms in block     97
 Block first atom:    748
 Blocpdb>     9 atoms in block     98
 Block first atom:    752
 Blocpdb>     7 atoms in block     99
 Block first atom:    761
 Blocpdb>     4 atoms in block    100
 Block first atom:    768
 Blocpdb>     7 atoms in block    101
 Block first atom:    772
 Blocpdb>     5 atoms in block    102
 Block first atom:    779
 Blocpdb>     4 atoms in block    103
 Block first atom:    784
 Blocpdb>    11 atoms in block    104
 Block first atom:    788
 Blocpdb>     7 atoms in block    105
 Block first atom:    799
 Blocpdb>     8 atoms in block    106
 Block first atom:    806
 Blocpdb>     6 atoms in block    107
 Block first atom:    814
 Blocpdb>     8 atoms in block    108
 Block first atom:    820
 Blocpdb>    11 atoms in block    109
 Block first atom:    828
 Blocpdb>     8 atoms in block    110
 Block first atom:    839
 Blocpdb>     8 atoms in block    111
 Block first atom:    847
 Blocpdb>     9 atoms in block    112
 Block first atom:    855
 Blocpdb>     9 atoms in block    113
 Block first atom:    864
 Blocpdb>     9 atoms in block    114
 Block first atom:    873
 Blocpdb>    11 atoms in block    115
 Block first atom:    882
 Blocpdb>    14 atoms in block    116
 Block first atom:    893
 Blocpdb>     8 atoms in block    117
 Block first atom:    907
 Blocpdb>     9 atoms in block    118
 Block first atom:    915
 Blocpdb>     5 atoms in block    119
 Block first atom:    924
 Blocpdb>     5 atoms in block    120
 Block first atom:    929
 Blocpdb>     7 atoms in block    121
 Block first atom:    934
 Blocpdb>     8 atoms in block    122
 Block first atom:    941
 Blocpdb>     8 atoms in block    123
 Block first atom:    949
 Blocpdb>     5 atoms in block    124
 Block first atom:    957
 Blocpdb>     9 atoms in block    125
 Block first atom:    962
 Blocpdb>     6 atoms in block    126
 Block first atom:    971
 Blocpdb>    11 atoms in block    127
 Block first atom:    977
 Blocpdb>    14 atoms in block    128
 Block first atom:    988
 Blocpdb>    12 atoms in block    129
 Block first atom:   1002
 Blocpdb>     8 atoms in block    130
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>     9 atoms in block    131
 Block first atom:   1022
 Blocpdb>     7 atoms in block    132
 Block first atom:   1031
 Blocpdb>     7 atoms in block    133
 Block first atom:   1038
 Blocpdb>     8 atoms in block    134
 Block first atom:   1045
 Blocpdb>    11 atoms in block    135
 Block first atom:   1053
 Blocpdb>     5 atoms in block    136
 Block first atom:   1064
 Blocpdb>     9 atoms in block    137
 Block first atom:   1069
 Blocpdb>    11 atoms in block    138
 Block first atom:   1078
 Blocpdb>     7 atoms in block    139
 Block first atom:   1089
 Blocpdb>     8 atoms in block    140
 Block first atom:   1096
 Blocpdb>     7 atoms in block    141
 Block first atom:   1104
 Blocpdb>     7 atoms in block    142
 Block first atom:   1110

 Blocpdb>   142 blocks.

 Blocpdb> At most,     14 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     4 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       378057 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       3351

 Prepmat> Matrix trace    =     825040.0000
 Prepmat> Last element read:    3351   3351       233.5102
 Prepmat>        10154 lines saved.
 Prepmat>         8519 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1117
 RTB> Total mass =        1117.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1117
 RTB> Number of blocks =   142
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  189743.7893
 RTB>     56694 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      852
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    56694
 Diagstd> Projected matrix trace =  189743.7893

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    852 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 189743.7893
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.7043947      1.4736357      3.4036604      4.4508255
      5.6416803      9.1657467     10.3448679     14.1257579     14.3270154
     15.3402749     18.4856671     20.3242902     20.4317458     21.8805414
     22.4817834     24.2643600     25.3853728     26.1812216     27.3152434
     28.2939271     29.4812259     30.3841904     31.6331460     34.7468919
     35.0995220     36.0076893     36.5854493     36.7091844     37.7007855
     38.5393404     39.6068099     40.1383094     41.4718220     42.7775674
     43.1858189     44.9823855     46.4490534     47.6582016     47.9680094
     48.4910908     49.6894826     50.4021561     51.7760855     52.4260517
     52.9193407     53.5570338     54.8108699     55.8507859     56.5321947
     57.1406598     57.9010012     58.8062144     59.2038132     59.5175793
     60.7871976     61.4437937     61.7207823     62.3427842     63.8758099
     64.5125050     65.6095077     66.7223034     67.2216675     67.9497290
     69.1426191     69.7323589     70.3415715     71.3581848     72.3931036
     72.6579403     73.3927335     74.5284523     75.1906063     75.9012470
     76.5879087     76.7789246     77.9875532     78.2535499     78.8242815
     79.3598496     80.6128489     81.2116195     81.8042640     82.4310232
     83.5573131     83.9546371     84.3658808     85.7799622     86.3632006
     87.1637615     87.5046147     87.8774477     88.3393506     88.8728311
     89.3369077     90.1206018     90.3739958     91.8107381     92.7057383
     93.5711790

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034325      0.0034330      0.0034337      0.0034337      0.0034338
      0.0034341     91.1388042    131.8227442    200.3403318    229.0949744
    257.9286102    328.7601765    349.2671614    408.1324811    411.0296426
    425.3161285    466.8881425    489.5566724    490.8491221    507.9539156
    514.8854985    534.9087480    547.1256212    555.6358176    567.5417532
    577.6195653    589.6143562    598.5757453    610.7542157    640.1080104
    643.3478907    651.6177507    656.8247010    657.9344819    666.7614460
    674.1358435    683.4082424    687.9784240    699.3133807    710.2370480
    713.6181048    728.3104170    740.0885994    749.6595971    752.0922762
    756.1818636    765.4688422    770.9386831    781.3756741    786.2648410
    789.9552553    794.7005954    803.9492376    811.5399888    816.4755861
    820.8577551    826.3010732    832.7351401    835.5455297    837.7567004
    846.6449873    851.2052460    853.1217047    857.4096700    867.8876135
    872.2023110    879.5867325    887.0146560    890.3277726    895.1362497
    902.9593379    906.8019780    910.7544742    917.3122165    923.9402314
    925.6287203    930.2974103    937.4677394    941.6230340    946.0622984
    950.3320709    951.5164319    958.9764184    960.6104447    964.1071211
    967.3768683    974.9838347    978.5980947    982.1622799    985.9176140
    992.6302671    994.9874994    997.4214481   1005.7457487   1009.1591093
   1013.8256204   1015.8059651   1017.9676993   1020.6395222   1023.7166997
   1026.3860439   1030.8781199   1032.3263730   1040.4998445   1045.5591058
   1050.4281001

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1117
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    142

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9917E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9941E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7044    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.474    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.404    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.451    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.642    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.166    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.57    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    852 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99997 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003
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 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997
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 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
 1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002
 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
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 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    20106 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99997 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003
 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 0.99996
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997
 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
 1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002
 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2605311040242157925.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2605311040242157925.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2605311040242157925.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2605311040242157925.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    142
            First residue number     =     11
            Last  residue number     =    152
            Number of atoms found    =   1117
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9917E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9941E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9985E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9987E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7044    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.474    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.404    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.451    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.642    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.166    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.57    

 Bfactors>  106 vectors,   3351 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.704400
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.411 for    142 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.058 +/-   0.03
 Bfactors> =     16.605 +/-   7.30
 Bfactors> Shiftng-fct=     16.547
 Bfactors> Scaling-fct=    242.063

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2605311040242157925.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2605311040242157925.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4324E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4328E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   91.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   131.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   200.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   229.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   257.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   328.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   349.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   408.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   835.5    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   846.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   851.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   853.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   872.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   887.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   890.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   895.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   902.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   906.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   910.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   917.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   923.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   925.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1021.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1024.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1026.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1031.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1032.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1040.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1046.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1050.    

 Chkmod>  106 vectors,   3351 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1117 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    53 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7564
      0.0034      0.6875
      0.0034      0.7577
      0.0034      0.8067
      0.0034      0.9315
      0.0034      0.8296
     91.1352      0.7676
    131.8334      0.7171
    200.3417      0.6908
    229.0896      0.6799
    257.9248      0.7870
    328.7506      0.7539
    349.1700      0.5368
    408.1762      0.4571
    411.0548      0.4435
    425.2941      0.4749
    466.9228      0.4876
    489.4840      0.3889
    490.8071      0.5296
    507.9258      0.4312
    514.8430      0.4566
    534.8377      0.5737
    547.1520      0.5052
    555.5990      0.4386
    567.5668      0.5541
    577.5547      0.5906
    589.5768      0.2914
    598.5088      0.4358
    610.6976      0.5256
    640.1092      0.4880
    643.3247      0.4583
    651.6107      0.5628
    656.8374      0.2161
    657.9135      0.3213
    666.7259      0.5321
    674.1127      0.5750
    683.4064      0.2279
    687.9634      0.3896
    699.2680      0.3430
    710.2268      0.3629
    713.6220      0.4063
    728.2598      0.3619
    740.0644      0.3275
    749.6416      0.3684
    752.0756      0.2232
    756.1409      0.3693
    765.4400      0.2973
    770.8891      0.4216
    781.3717      0.4033
    786.2607      0.3031
    789.9263      0.3125
    794.6885      0.3617
    803.9083      0.2997
    811.4994      0.4044
    816.4247      0.3322
    820.8178      0.2653
    826.2585      0.3774
    832.7262      0.3658
    835.4828      0.3495
    837.7378      0.3379
    846.6282      0.3511
    851.1424      0.4051
    853.0797      0.4250
    857.3537      0.3971
    867.8788      0.3780
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    886.9613      0.3310
    890.2785      0.4628
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    906.7477      0.3841
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    917.2845      0.4167
    923.8808      0.1933
    925.6021      0.4420
    930.2402      0.3222
    937.4372      0.2483
    941.5788      0.2944
    946.0139      0.3881
    950.3042      0.3771
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    958.9503      0.3390
    960.5474      0.2465
    964.0396      0.2587
    967.3363      0.3048
    974.9248      0.2851
    978.5463      0.3961
    982.0945      0.3663
    985.8692      0.4288
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   1040.4510      0.3467
   1045.5383      0.3766
   1050.3764      0.2570
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311040242157925 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605311040242157925.eigenfacs
2605311040242157925.atom
making animated gifs
11 models are in 2605311040242157925.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2605311040242157925.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2605311040242157925.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311040242157925.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311040242157925.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311040242157925.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311040242157925.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311040242157925 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311040242157925.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311040242157925.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2605311040242157925.10.pdb
2605311040242157925.11.pdb
2605311040242157925.7.pdb
2605311040242157925.8.pdb
2605311040242157925.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m7.758s
user	0m7.714s
sys	0m0.041s
rm: cannot remove '2605311040242157925.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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