*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2605311400362176918.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2605311400362176918.atom to be opened.
Openam> File opened: 2605311400362176918.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 142
First residue number = 11
Last residue number = 152
Number of atoms found = 1117
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 33.851690 +/- 7.648984 From: 15.174000 To: 49.525000
= 12.562173 +/- 8.953065 From: -5.846000 To: 34.334000
= 10.202533 +/- 11.846904 From: -13.130000 To: 35.161000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 6.7289 % Filled.
Pdbmat> 377915 non-zero elements.
Pdbmat> 41252 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 73.86 +/- 19.60
Maximum number = 122
Minimum number = 18
Pdbmat> Matrix trace = 825040.
Pdbmat> Larger element = 470.062
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
142 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2605311400362176918.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2605311400362176918.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2605311400362176918.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1117 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 142 residues.
Blocpdb> 9 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 4 atoms in block 2
Block first atom: 10
Blocpdb> 8 atoms in block 3
Block first atom: 14
Blocpdb> 11 atoms in block 4
Block first atom: 22
Blocpdb> 8 atoms in block 5
Block first atom: 33
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 41
Blocpdb> 8 atoms in block 7
Block first atom: 50
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 58
Blocpdb> 9 atoms in block 9
Block first atom: 70
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 79
Blocpdb> 7 atoms in block 11
Block first atom: 87
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 94
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 103
Blocpdb> 12 atoms in block 14
Block first atom: 107
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 119
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 131
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 138
Blocpdb> 4 atoms in block 18
Block first atom: 146
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 150
Blocpdb> 4 atoms in block 20
Block first atom: 158
Blocpdb> 10 atoms in block 21
Block first atom: 162
Blocpdb> 8 atoms in block 22
Block first atom: 172
Blocpdb> 8 atoms in block 23
Block first atom: 180
Blocpdb> 7 atoms in block 24
Block first atom: 188
Blocpdb> 9 atoms in block 25
Block first atom: 195
Blocpdb> 6 atoms in block 26
Block first atom: 204
Blocpdb> 7 atoms in block 27
Block first atom: 210
Blocpdb> 6 atoms in block 28
Block first atom: 217
Blocpdb> 8 atoms in block 29
Block first atom: 223
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 231
Blocpdb> 5 atoms in block 31
Block first atom: 239
Blocpdb> 5 atoms in block 32
Block first atom: 244
Blocpdb> 9 atoms in block 33
Block first atom: 249
Blocpdb> 6 atoms in block 34
Block first atom: 258
Blocpdb> 9 atoms in block 35
Block first atom: 264
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 273
Blocpdb> 8 atoms in block 37
Block first atom: 281
Blocpdb> 9 atoms in block 38
Block first atom: 289
Blocpdb> 5 atoms in block 39
Block first atom: 298
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 303
Blocpdb> 4 atoms in block 41
Block first atom: 311
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 315
Blocpdb> 8 atoms in block 43
Block first atom: 326
Blocpdb> 6 atoms in block 44
Block first atom: 334
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 340
Blocpdb> 4 atoms in block 46
Block first atom: 348
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 352
Blocpdb> 8 atoms in block 48
Block first atom: 359
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 367
Blocpdb> 9 atoms in block 50
Block first atom: 374
Blocpdb> 8 atoms in block 51
Block first atom: 383
Blocpdb> 9 atoms in block 52
Block first atom: 391
Blocpdb> 5 atoms in block 53
Block first atom: 400
Blocpdb> 9 atoms in block 54
Block first atom: 405
Blocpdb> 9 atoms in block 55
Block first atom: 414
Blocpdb> 8 atoms in block 56
Block first atom: 423
Blocpdb> 11 atoms in block 57
Block first atom: 431
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 442
Blocpdb> 9 atoms in block 59
Block first atom: 450
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 459
Blocpdb> 7 atoms in block 61
Block first atom: 467
Blocpdb> 8 atoms in block 62
Block first atom: 474
Blocpdb> 5 atoms in block 63
Block first atom: 482
Blocpdb> 5 atoms in block 64
Block first atom: 487
Blocpdb> 7 atoms in block 65
Block first atom: 492
Blocpdb> 11 atoms in block 66
Block first atom: 499
Blocpdb> 4 atoms in block 67
Block first atom: 510
Blocpdb> 8 atoms in block 68
Block first atom: 514
Blocpdb> 8 atoms in block 69
Block first atom: 522
Blocpdb> 11 atoms in block 70
Block first atom: 530
Blocpdb> 8 atoms in block 71
Block first atom: 541
Blocpdb> 5 atoms in block 72
Block first atom: 549
Blocpdb> 9 atoms in block 73
Block first atom: 554
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 563
Blocpdb> 9 atoms in block 75
Block first atom: 571
Blocpdb> 7 atoms in block 76
Block first atom: 580
Blocpdb> 7 atoms in block 77
Block first atom: 587
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 594
Blocpdb> 8 atoms in block 79
Block first atom: 606
Blocpdb> 6 atoms in block 80
Block first atom: 614
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 620
Blocpdb> 8 atoms in block 82
Block first atom: 628
Blocpdb> 5 atoms in block 83
Block first atom: 636
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 641
Blocpdb> 11 atoms in block 85
Block first atom: 648
Blocpdb> 11 atoms in block 86
Block first atom: 659
Blocpdb> 6 atoms in block 87
Block first atom: 670
Blocpdb> 5 atoms in block 88
Block first atom: 676
Blocpdb> 8 atoms in block 89
Block first atom: 681
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 689
Blocpdb> 8 atoms in block 91
Block first atom: 697
Blocpdb> 8 atoms in block 92
Block first atom: 705
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 713
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 720
Blocpdb> 9 atoms in block 95
Block first atom: 731
Blocpdb> 8 atoms in block 96
Block first atom: 740
Blocpdb> 4 atoms in block 97
Block first atom: 748
Blocpdb> 9 atoms in block 98
Block first atom: 752
Blocpdb> 7 atoms in block 99
Block first atom: 761
Blocpdb> 4 atoms in block 100
Block first atom: 768
Blocpdb> 7 atoms in block 101
Block first atom: 772
Blocpdb> 5 atoms in block 102
Block first atom: 779
Blocpdb> 4 atoms in block 103
Block first atom: 784
Blocpdb> 11 atoms in block 104
Block first atom: 788
Blocpdb> 7 atoms in block 105
Block first atom: 799
Blocpdb> 8 atoms in block 106
Block first atom: 806
Blocpdb> 6 atoms in block 107
Block first atom: 814
Blocpdb> 8 atoms in block 108
Block first atom: 820
Blocpdb> 11 atoms in block 109
Block first atom: 828
Blocpdb> 8 atoms in block 110
Block first atom: 839
Blocpdb> 8 atoms in block 111
Block first atom: 847
Blocpdb> 9 atoms in block 112
Block first atom: 855
Blocpdb> 9 atoms in block 113
Block first atom: 864
Blocpdb> 9 atoms in block 114
Block first atom: 873
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 882
Blocpdb> 14 atoms in block 116
Block first atom: 893
Blocpdb> 8 atoms in block 117
Block first atom: 907
Blocpdb> 9 atoms in block 118
Block first atom: 915
Blocpdb> 5 atoms in block 119
Block first atom: 924
Blocpdb> 5 atoms in block 120
Block first atom: 929
Blocpdb> 7 atoms in block 121
Block first atom: 934
Blocpdb> 8 atoms in block 122
Block first atom: 941
Blocpdb> 8 atoms in block 123
Block first atom: 949
Blocpdb> 5 atoms in block 124
Block first atom: 957
Blocpdb> 9 atoms in block 125
Block first atom: 962
Blocpdb> 6 atoms in block 126
Block first atom: 971
Blocpdb> 11 atoms in block 127
Block first atom: 977
Blocpdb> 14 atoms in block 128
Block first atom: 988
Blocpdb> 12 atoms in block 129
Block first atom: 1002
Blocpdb> 8 atoms in block 130
Block first atom: 1014
Blocpdb> 9 atoms in block 131
Block first atom: 1022
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 1031
Blocpdb> 7 atoms in block 133
Block first atom: 1038
Blocpdb> 8 atoms in block 134
Block first atom: 1045
Blocpdb> 11 atoms in block 135
Block first atom: 1053
Blocpdb> 5 atoms in block 136
Block first atom: 1064
Blocpdb> 9 atoms in block 137
Block first atom: 1069
Blocpdb> 11 atoms in block 138
Block first atom: 1078
Blocpdb> 7 atoms in block 139
Block first atom: 1089
Blocpdb> 8 atoms in block 140
Block first atom: 1096
Blocpdb> 7 atoms in block 141
Block first atom: 1104
Blocpdb> 7 atoms in block 142
Block first atom: 1110
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 378057 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3351
Prepmat> Matrix trace = 825040.0000
Prepmat> Last element read: 3351 3351 233.5102
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8519 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1117
RTB> Total mass = 1117.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1117
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 189743.7893
RTB> 56694 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56694
Diagstd> Projected matrix trace = 189743.7893
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 189743.7893
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.7043947 1.4736357 3.4036604 4.4508255
5.6416803 9.1657467 10.3448679 14.1257579 14.3270154
15.3402749 18.4856671 20.3242902 20.4317458 21.8805414
22.4817834 24.2643600 25.3853728 26.1812216 27.3152434
28.2939271 29.4812259 30.3841904 31.6331460 34.7468919
35.0995220 36.0076893 36.5854493 36.7091844 37.7007855
38.5393404 39.6068099 40.1383094 41.4718220 42.7775674
43.1858189 44.9823855 46.4490534 47.6582016 47.9680094
48.4910908 49.6894826 50.4021561 51.7760855 52.4260517
52.9193407 53.5570338 54.8108699 55.8507859 56.5321947
57.1406598 57.9010012 58.8062144 59.2038132 59.5175793
60.7871976 61.4437937 61.7207823 62.3427842 63.8758099
64.5125050 65.6095077 66.7223034 67.2216675 67.9497290
69.1426191 69.7323589 70.3415715 71.3581848 72.3931036
72.6579403 73.3927335 74.5284523 75.1906063 75.9012470
76.5879087 76.7789246 77.9875532 78.2535499 78.8242815
79.3598496 80.6128489 81.2116195 81.8042640 82.4310232
83.5573131 83.9546371 84.3658808 85.7799622 86.3632006
87.1637615 87.5046147 87.8774477 88.3393506 88.8728311
89.3369077 90.1206018 90.3739958 91.8107381 92.7057383
93.5711790
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034330 0.0034337 0.0034337 0.0034338
0.0034341 91.1388042 131.8227442 200.3403318 229.0949744
257.9286102 328.7601765 349.2671614 408.1324811 411.0296426
425.3161285 466.8881425 489.5566724 490.8491221 507.9539156
514.8854985 534.9087480 547.1256212 555.6358176 567.5417532
577.6195653 589.6143562 598.5757453 610.7542157 640.1080104
643.3478907 651.6177507 656.8247010 657.9344819 666.7614460
674.1358435 683.4082424 687.9784240 699.3133807 710.2370480
713.6181048 728.3104170 740.0885994 749.6595971 752.0922762
756.1818636 765.4688422 770.9386831 781.3756741 786.2648410
789.9552553 794.7005954 803.9492376 811.5399888 816.4755861
820.8577551 826.3010732 832.7351401 835.5455297 837.7567004
846.6449873 851.2052460 853.1217047 857.4096700 867.8876135
872.2023110 879.5867325 887.0146560 890.3277726 895.1362497
902.9593379 906.8019780 910.7544742 917.3122165 923.9402314
925.6287203 930.2974103 937.4677394 941.6230340 946.0622984
950.3320709 951.5164319 958.9764184 960.6104447 964.1071211
967.3768683 974.9838347 978.5980947 982.1622799 985.9176140
992.6302671 994.9874994 997.4214481 1005.7457487 1009.1591093
1013.8256204 1015.8059651 1017.9676993 1020.6395222 1023.7166997
1026.3860439 1030.8781199 1032.3263730 1040.4998445 1045.5591058
1050.4281001
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1117
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7044
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.474
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.404
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.451
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.642
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.166
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.57
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003
0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 0.99996
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997
1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002
1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 20106 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
0.99997 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 1.00003 1.00000 0.99998
1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003
0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 0.99996
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997
1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 0.99998 1.00003 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999
1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998
1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002
1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605311400362176918.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605311400362176918.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2605311400362176918.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605311400362176918.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 142
First residue number = 11
Last residue number = 152
Number of atoms found = 1117
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7044
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.474
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.451
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.642
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.166
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.57
Bfactors> 106 vectors, 3351 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.704400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.411 for 142 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.058 +/- 0.03
Bfactors> = 16.605 +/- 7.30
Bfactors> Shiftng-fct= 16.547
Bfactors> Scaling-fct= 242.063
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2605311400362176918.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605311400362176918.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Chkmod> 106 vectors, 3351 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1117 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 53 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7564
0.0034 0.6875
0.0034 0.7577
0.0034 0.8067
0.0034 0.9315
0.0034 0.8296
91.1352 0.7676
131.8334 0.7171
200.3417 0.6908
229.0896 0.6799
257.9248 0.7870
328.7506 0.7539
349.1700 0.5368
408.1762 0.4571
411.0548 0.4435
425.2941 0.4749
466.9228 0.4876
489.4840 0.3889
490.8071 0.5296
507.9258 0.4312
514.8430 0.4566
534.8377 0.5737
547.1520 0.5052
555.5990 0.4386
567.5668 0.5541
577.5547 0.5906
589.5768 0.2914
598.5088 0.4358
610.6976 0.5256
640.1092 0.4880
643.3247 0.4583
651.6107 0.5628
656.8374 0.2161
657.9135 0.3213
666.7259 0.5321
674.1127 0.5750
683.4064 0.2279
687.9634 0.3896
699.2680 0.3430
710.2268 0.3629
713.6220 0.4063
728.2598 0.3619
740.0644 0.3275
749.6416 0.3684
752.0756 0.2232
756.1409 0.3693
765.4400 0.2973
770.8891 0.4216
781.3717 0.4033
786.2607 0.3031
789.9263 0.3125
794.6885 0.3617
803.9083 0.2997
811.4994 0.4044
816.4247 0.3322
820.8178 0.2653
826.2585 0.3774
832.7262 0.3658
835.4828 0.3495
837.7378 0.3379
846.6282 0.3511
851.1424 0.4051
853.0797 0.4250
857.3537 0.3971
867.8788 0.3780
872.1479 0.3774
879.5523 0.3654
886.9613 0.3310
890.2785 0.4628
895.0996 0.2988
902.9035 0.4024
906.7477 0.3841
910.7052 0.2463
917.2845 0.4167
923.8808 0.1933
925.6021 0.4420
930.2402 0.3222
937.4372 0.2483
941.5788 0.2944
946.0139 0.3881
950.3042 0.3771
951.4822 0.3613
958.9503 0.3390
960.5474 0.2465
964.0396 0.2587
967.3363 0.3048
974.9248 0.2851
978.5463 0.3961
982.0945 0.3663
985.8692 0.4288
992.6036 0.2892
994.9173 0.3750
997.4030 0.3786
1005.7028 0.2800
1009.0971 0.3384
1013.7602 0.1507
1015.7356 0.4328
1017.9388 0.2448
1020.5995 0.3387
1023.6564 0.1671
1026.3597 0.4569
1030.8304 0.3323
1032.2592 0.4225
1040.4510 0.3467
1045.5383 0.3766
1050.3764 0.2570
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2605311400362176918.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2605311400362176918.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2605311400362176918.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2605311400362176918.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2605311400362176918.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2605311400362176918.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 997.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Projmod> 106 vectors, 3351 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 142
First residue number = 11
Last residue number = 152
Number of atoms found = 1117
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 142
First residue number = 11
Last residue number = 152
Number of atoms found = 1117
Mean number per residue = 7.9
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 1117 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 4.75
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.033 Sum= 0.001 q= 5.1744
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.210 Sum= 0.045 q= 33.3882
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.658 Sum= 0.478 q= -104.4336
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.144 Sum= 0.499 q= 22.9094
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.351 Sum= 0.622 q= -55.7415
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.106 Sum= 0.634 q= 16.8139
Vector: 7 F= 91.14 Cos= 0.142 Sum= 0.654 q= 22.6018
Vector: 8 F= 131.83 Cos= 0.437 Sum= 0.845 q= 69.3704
Vector: 9 F= 200.34 Cos= -0.100 Sum= 0.855 q= -15.8735
Vector: 10 F= 229.09 Cos= -0.126 Sum= 0.871 q= -19.9227
Vector: 11 F= 257.92 Cos= -0.122 Sum= 0.886 q= -19.4414
Vector: 12 F= 328.75 Cos= 0.095 Sum= 0.895 q= 15.1256
Vector: 13 F= 349.17 Cos= -0.000 Sum= 0.895 q= -0.0584
Vector: 14 F= 408.18 Cos= -0.038 Sum= 0.896 q= -5.9949
Vector: 15 F= 411.05 Cos= 0.032 Sum= 0.897 q= 5.0381
Vector: 16 F= 425.29 Cos= -0.084 Sum= 0.904 q= -13.3690
Vector: 17 F= 466.92 Cos= 0.022 Sum= 0.905 q= 3.4390
Vector: 18 F= 489.48 Cos= 0.012 Sum= 0.905 q= 1.8608
Vector: 19 F= 490.81 Cos= 0.033 Sum= 0.906 q= 5.2351
Vector: 20 F= 507.93 Cos= -0.021 Sum= 0.906 q= -3.3679
Vector: 21 F= 514.84 Cos= 0.068 Sum= 0.911 q= 10.8083
Vector: 22 F= 534.84 Cos= 0.008 Sum= 0.911 q= 1.2454
Vector: 23 F= 547.15 Cos= -0.035 Sum= 0.912 q= -5.5398
Vector: 24 F= 555.60 Cos= -0.010 Sum= 0.912 q= -1.6000
Vector: 25 F= 567.57 Cos= 0.006 Sum= 0.912 q= 0.9047
Vector: 26 F= 577.55 Cos= -0.007 Sum= 0.912 q= -1.0403
Vector: 27 F= 589.58 Cos= 0.018 Sum= 0.913 q= 2.8052
Vector: 28 F= 598.51 Cos= 0.023 Sum= 0.913 q= 3.6108
Vector: 29 F= 610.70 Cos= 0.029 Sum= 0.914 q= 4.6203
Vector: 30 F= 640.11 Cos= 0.028 Sum= 0.915 q= 4.4141
Vector: 31 F= 643.32 Cos= 0.018 Sum= 0.915 q= 2.9092
Vector: 32 F= 651.61 Cos= 0.006 Sum= 0.915 q= 1.0178
Vector: 33 F= 656.84 Cos= 0.021 Sum= 0.916 q= 3.3524
Vector: 34 F= 657.91 Cos= 0.021 Sum= 0.916 q= 3.2872
Vector: 35 F= 666.73 Cos= 0.046 Sum= 0.918 q= 7.2905
Vector: 36 F= 674.11 Cos= 0.004 Sum= 0.918 q= 0.6814
Vector: 37 F= 683.41 Cos= 0.005 Sum= 0.918 q= 0.7250
Vector: 38 F= 687.96 Cos= -0.001 Sum= 0.918 q= -0.0951
Vector: 39 F= 699.27 Cos= 0.003 Sum= 0.918 q= 0.5180
Vector: 40 F= 710.23 Cos= 0.006 Sum= 0.918 q= 0.9449
Vector: 41 F= 713.62 Cos= 0.047 Sum= 0.921 q= 7.4873
Vector: 42 F= 728.26 Cos= 0.017 Sum= 0.921 q= 2.6334
Vector: 43 F= 740.06 Cos= 0.021 Sum= 0.921 q= 3.3686
Vector: 44 F= 749.64 Cos= -0.016 Sum= 0.922 q= -2.4894
Vector: 45 F= 752.08 Cos= -0.001 Sum= 0.922 q= -0.0956
Vector: 46 F= 756.14 Cos= -0.019 Sum= 0.922 q= -2.9905
Vector: 47 F= 765.44 Cos= -0.007 Sum= 0.922 q= -1.1516
Vector: 48 F= 770.89 Cos= 0.019 Sum= 0.922 q= 2.9374
Vector: 49 F= 781.37 Cos= -0.019 Sum= 0.923 q= -3.0088
Vector: 50 F= 786.26 Cos= -0.001 Sum= 0.923 q= -0.2006
Vector: 51 F= 789.93 Cos= -0.011 Sum= 0.923 q= -1.8114
Vector: 52 F= 794.69 Cos= -0.010 Sum= 0.923 q= -1.5082
%Projmod-Wn> Eigenvector 53 Norm= 1.0001
Vector: 53 F= 803.91 Cos= -0.010 Sum= 0.923 q= -1.6393
Vector: 54 F= 811.50 Cos= -0.004 Sum= 0.923 q= -0.6273
Vector: 55 F= 816.42 Cos= -0.024 Sum= 0.924 q= -3.7703
Vector: 56 F= 820.82 Cos= -0.053 Sum= 0.926 q= -8.4473
Vector: 57 F= 826.26 Cos= 0.047 Sum= 0.929 q= 7.4839
Vector: 58 F= 832.73 Cos= 0.016 Sum= 0.929 q= 2.5316
Vector: 59 F= 835.48 Cos= 0.003 Sum= 0.929 q= 0.4339
Vector: 60 F= 837.74 Cos= -0.001 Sum= 0.929 q= -0.1369
Vector: 61 F= 846.63 Cos= -0.048 Sum= 0.931 q= -7.6856
Vector: 62 F= 851.14 Cos= 0.039 Sum= 0.933 q= 6.1809
Vector: 63 F= 853.08 Cos= 0.039 Sum= 0.934 q= 6.1920
Vector: 64 F= 857.35 Cos= -0.003 Sum= 0.934 q= -0.5069
Vector: 65 F= 867.88 Cos= 0.015 Sum= 0.935 q= 2.3892
Vector: 66 F= 872.15 Cos= 0.001 Sum= 0.935 q= 0.2178
Vector: 67 F= 879.55 Cos= 0.030 Sum= 0.935 q= 4.6900
Vector: 68 F= 886.96 Cos= -0.003 Sum= 0.935 q= -0.4425
Vector: 69 F= 890.28 Cos= 0.000 Sum= 0.935 q= 0.0645
Vector: 70 F= 895.10 Cos= -0.005 Sum= 0.935 q= -0.7585
Vector: 71 F= 902.90 Cos= -0.007 Sum= 0.935 q= -1.0746
Vector: 72 F= 906.75 Cos= 0.004 Sum= 0.935 q= 0.5653
Vector: 73 F= 910.71 Cos= -0.023 Sum= 0.936 q= -3.6577
Vector: 74 F= 917.28 Cos= 0.024 Sum= 0.937 q= 3.7896
Vector: 75 F= 923.88 Cos= 0.003 Sum= 0.937 q= 0.4584
Vector: 76 F= 925.60 Cos= -0.025 Sum= 0.937 q= -3.9070
Vector: 77 F= 930.24 Cos= 0.012 Sum= 0.937 q= 1.9237
Vector: 78 F= 937.44 Cos= 0.023 Sum= 0.938 q= 3.6298
Vector: 79 F= 941.58 Cos= 0.005 Sum= 0.938 q= 0.8059
Vector: 80 F= 946.01 Cos= -0.012 Sum= 0.938 q= -1.9460
Vector: 81 F= 950.30 Cos= -0.005 Sum= 0.938 q= -0.8395
Vector: 82 F= 951.48 Cos= 0.027 Sum= 0.939 q= 4.2244
Vector: 83 F= 958.95 Cos= -0.002 Sum= 0.939 q= -0.3358
Vector: 84 F= 960.55 Cos= -0.012 Sum= 0.939 q= -1.8891
Vector: 85 F= 964.04 Cos= -0.008 Sum= 0.939 q= -1.3392
Vector: 86 F= 967.34 Cos= -0.004 Sum= 0.939 q= -0.7112
Vector: 87 F= 974.92 Cos= 0.014 Sum= 0.939 q= 2.1459
Vector: 88 F= 978.55 Cos= 0.031 Sum= 0.940 q= 4.8717
Vector: 89 F= 982.09 Cos= -0.012 Sum= 0.940 q= -1.8370
Vector: 90 F= 985.87 Cos= 0.004 Sum= 0.940 q= 0.5641
Vector: 91 F= 992.60 Cos= 0.026 Sum= 0.941 q= 4.1270
Vector: 92 F= 994.92 Cos= 0.009 Sum= 0.941 q= 1.5027
Vector: 93 F= 997.40 Cos= -0.032 Sum= 0.942 q= -5.1021
Vector: 94 F= 1005.70 Cos= -0.018 Sum= 0.942 q= -2.9276
Vector: 95 F= 1009.10 Cos= -0.016 Sum= 0.943 q= -2.5647
Vector: 96 F= 1013.76 Cos= -0.027 Sum= 0.943 q= -4.3463
Vector: 97 F= 1015.74 Cos= 0.001 Sum= 0.943 q= 0.1746
Vector: 98 F= 1017.94 Cos= 0.013 Sum= 0.944 q= 2.0797
Vector: 99 F= 1020.60 Cos= -0.003 Sum= 0.944 q= -0.5032
Vector: 100 F= 1023.66 Cos= 0.005 Sum= 0.944 q= 0.8459
Vector: 101 F= 1026.36 Cos= -0.001 Sum= 0.944 q= -0.2096
Vector: 102 F= 1030.83 Cos= -0.002 Sum= 0.944 q= -0.3375
Vector: 103 F= 1032.26 Cos= -0.011 Sum= 0.944 q= -1.7914
Vector: 104 F= 1040.45 Cos= -0.012 Sum= 0.944 q= -1.9372
Vector: 105 F= 1045.54 Cos= 0.000 Sum= 0.944 q= 0.0625
Vector: 106 F= 1050.38 Cos= -0.018 Sum= 0.944 q= -2.8065
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 91.135233
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.66 for mode 3 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.433 0.747 0.833 0.875 0.901 0.944
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311400362176918 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
making animated gifs
11 models are in 2605311400362176918.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 142 4.352 85 1.138
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 142 3.909 87 1.126
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 142 3.503 94 1.544
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 142 3.148 100 1.707
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 142 2.863 103 1.502
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 142 2.670 108 1.536
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 142 2.591 109 1.605
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 142 2.635 105 1.801
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 142 2.796 103 1.783
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 142 3.057 95 1.336
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 142 3.394 67 2.228
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311400362176918 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
making animated gifs
11 models are in 2605311400362176918.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 142 5.254 84 1.252
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 142 4.707 87 1.346
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 142 4.169 88 1.281
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 142 3.645 94 1.608
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 142 3.142 101 1.601
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 142 2.670 108 1.536
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 142 2.250 119 1.660
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 142 1.918 127 1.516
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 142 1.722 131 1.434
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 142 1.712 134 1.494
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 142 1.891 132 1.621
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311400362176918 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
making animated gifs
11 models are in 2605311400362176918.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 142 3.582 94 1.364
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 142 3.226 98 1.234
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 142 2.936 104 1.254
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 142 2.735 109 1.649
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 142 2.643 106 1.672
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 142 2.670 108 1.536
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 142 2.814 96 1.893
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 142 3.058 82 2.054
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 142 3.380 67 2.114
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 142 3.761 61 2.012
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 142 4.184 54 1.984
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311400362176918 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
making animated gifs
11 models are in 2605311400362176918.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 142 3.162 77 2.278
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 142 2.839 96 2.189
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 142 2.607 106 2.047
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 142 2.495 108 1.961
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 142 2.517 107 1.907
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 142 2.670 108 1.536
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 142 2.934 103 1.316
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 142 3.281 100 1.252
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 142 3.690 96 1.082
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 142 4.140 95 1.055
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 142 4.621 94 1.033
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2605311400362176918 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2605311400362176918.eigenfacs
2605311400362176918.atom
making animated gifs
11 models are in 2605311400362176918.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2605311400362176918.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 142 3.433 90 1.701
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 142 3.085 96 1.581
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 142 2.814 104 1.685
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 142 2.643 107 1.626
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 142 2.593 109 1.652
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 142 2.670 108 1.536
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 142 2.864 107 1.629
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 142 3.154 81 1.868
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 142 3.515 72 1.758
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 142 3.929 66 1.745
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 142 4.380 57 1.894
2605311400362176918.10.pdb
2605311400362176918.11.pdb
2605311400362176918.7.pdb
2605311400362176918.8.pdb
2605311400362176918.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.082s
user 0m7.997s
sys 0m0.082s
rm: cannot remove '2605311400362176918.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
