***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606032003402649896.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606032003402649896.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606032003402649896.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 159
First residue number = 233
Last residue number = 311
Number of atoms found = 2488
Mean number per residue = 15.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -15.029275 +/- 17.340657 From: -53.830000 To: 21.525000
= -5.606685 +/- 7.702581 From: -24.019000 To: 13.276000
= -9.397746 +/- 7.133532 From: -24.481000 To: 7.595000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.8268 % Filled.
Pdbmat> 1623304 non-zero elements.
Pdbmat> 178739 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 143.68 +/- 48.64
Maximum number = 249
Minimum number = 24
Pdbmat> Matrix trace = 3.574780E+06
Pdbmat> Larger element = 880.893
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
159 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606032003402649896.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606032003402649896.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606032003402649896.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2488 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 159 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 28
Blocpdb> 24 atoms in block 4
Block first atom: 43
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 67
Blocpdb> 14 atoms in block 6
Block first atom: 81
Blocpdb> 21 atoms in block 7
Block first atom: 95
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 116
Blocpdb> 21 atoms in block 9
Block first atom: 127
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 148
Blocpdb> 10 atoms in block 11
Block first atom: 165
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 175
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 192
Blocpdb> 17 atoms in block 14
Block first atom: 211
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 228
Blocpdb> 10 atoms in block 16
Block first atom: 248
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 258
Blocpdb> 14 atoms in block 18
Block first atom: 277
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 291
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 302
Blocpdb> 7 atoms in block 21
Block first atom: 316
Blocpdb> 7 atoms in block 22
Block first atom: 323
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 330
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 352
Blocpdb> 17 atoms in block 25
Block first atom: 376
Blocpdb> 14 atoms in block 26
Block first atom: 393
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 407
Blocpdb> 22 atoms in block 28
Block first atom: 426
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 448
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 460
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 479
Blocpdb> 14 atoms in block 32
Block first atom: 500
Blocpdb> 24 atoms in block 33
Block first atom: 514
Blocpdb> 19 atoms in block 34
Block first atom: 538
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 557
Blocpdb> 12 atoms in block 36
Block first atom: 572
Blocpdb> 17 atoms in block 37
Block first atom: 584
Blocpdb> 20 atoms in block 38
Block first atom: 601
Blocpdb> 14 atoms in block 39
Block first atom: 621
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 635
Blocpdb> 20 atoms in block 41
Block first atom: 656
Blocpdb> 10 atoms in block 42
Block first atom: 676
Blocpdb> 17 atoms in block 43
Block first atom: 686
Blocpdb> 7 atoms in block 44
Block first atom: 703
Blocpdb> 10 atoms in block 45
Block first atom: 710
Blocpdb> 7 atoms in block 46
Block first atom: 720
Blocpdb> 14 atoms in block 47
Block first atom: 727
Blocpdb> 7 atoms in block 48
Block first atom: 741
Blocpdb> 24 atoms in block 49
Block first atom: 748
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 772
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 794
Blocpdb> 11 atoms in block 52
Block first atom: 808
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 819
Blocpdb> 24 atoms in block 54
Block first atom: 838
Blocpdb> 17 atoms in block 55
Block first atom: 862
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 879
Blocpdb> 19 atoms in block 57
Block first atom: 893
Blocpdb> 11 atoms in block 58
Block first atom: 912
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 923
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 942
Blocpdb> 12 atoms in block 61
Block first atom: 959
Blocpdb> 17 atoms in block 62
Block first atom: 971
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 988
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 1008
Blocpdb> 24 atoms in block 65
Block first atom: 1024
Blocpdb> 15 atoms in block 66
Block first atom: 1048
Blocpdb> 14 atoms in block 67
Block first atom: 1063
Blocpdb> 11 atoms in block 68
Block first atom: 1077
Blocpdb> 10 atoms in block 69
Block first atom: 1088
Blocpdb> 7 atoms in block 70
Block first atom: 1098
Blocpdb> 7 atoms in block 71
Block first atom: 1105
Blocpdb> 7 atoms in block 72
Block first atom: 1112
Blocpdb> 16 atoms in block 73
Block first atom: 1119
Blocpdb> 11 atoms in block 74
Block first atom: 1135
Blocpdb> 20 atoms in block 75
Block first atom: 1146
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 1166
Blocpdb> 14 atoms in block 77
Block first atom: 1190
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1204
Blocpdb> 7 atoms in block 79
Block first atom: 1223
Blocpdb> 11 atoms in block 80
Block first atom: 1230
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1241
Blocpdb> 11 atoms in block 82
Block first atom: 1257
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1268
Blocpdb> 24 atoms in block 84
Block first atom: 1283
Blocpdb> 14 atoms in block 85
Block first atom: 1307
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1321
Blocpdb> 21 atoms in block 87
Block first atom: 1335
Blocpdb> 11 atoms in block 88
Block first atom: 1356
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 1367
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1388
Blocpdb> 10 atoms in block 91
Block first atom: 1405
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 1415
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 1432
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1451
Blocpdb> 20 atoms in block 95
Block first atom: 1468
Blocpdb> 10 atoms in block 96
Block first atom: 1488
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 1498
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1517
Blocpdb> 11 atoms in block 99
Block first atom: 1531
Blocpdb> 14 atoms in block 100
Block first atom: 1542
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1556
Blocpdb> 24 atoms in block 102
Block first atom: 1571
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 1595
Blocpdb> 24 atoms in block 104
Block first atom: 1617
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1641
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1658
Blocpdb> 19 atoms in block 107
Block first atom: 1672
Blocpdb> 22 atoms in block 108
Block first atom: 1691
Blocpdb> 12 atoms in block 109
Block first atom: 1713
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 1725
Blocpdb> 21 atoms in block 111
Block first atom: 1744
Blocpdb> 14 atoms in block 112
Block first atom: 1765
Blocpdb> 24 atoms in block 113
Block first atom: 1779
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1803
Blocpdb> 15 atoms in block 115
Block first atom: 1822
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1837
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 1849
Blocpdb> 20 atoms in block 118
Block first atom: 1866
Blocpdb> 14 atoms in block 119
Block first atom: 1886
Blocpdb> 21 atoms in block 120
Block first atom: 1900
Blocpdb> 20 atoms in block 121
Block first atom: 1921
Blocpdb> 7 atoms in block 122
Block first atom: 1941
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1948
Blocpdb> 19 atoms in block 124
Block first atom: 1965
Blocpdb> 10 atoms in block 125
Block first atom: 1984
Blocpdb> 7 atoms in block 126
Block first atom: 1994
Blocpdb> 14 atoms in block 127
Block first atom: 2001
Blocpdb> 7 atoms in block 128
Block first atom: 2015
Blocpdb> 24 atoms in block 129
Block first atom: 2022
Blocpdb> 7 atoms in block 130
Block first atom: 2046
Blocpdb> 14 atoms in block 131
Block first atom: 2053
Blocpdb> 11 atoms in block 132
Block first atom: 2067
Blocpdb> 19 atoms in block 133
Block first atom: 2078
Blocpdb> 24 atoms in block 134
Block first atom: 2097
Blocpdb> 17 atoms in block 135
Block first atom: 2121
Blocpdb> 14 atoms in block 136
Block first atom: 2138
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 2152
Blocpdb> 11 atoms in block 138
Block first atom: 2171
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 2182
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2201
Blocpdb> 12 atoms in block 141
Block first atom: 2218
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2230
Blocpdb> 20 atoms in block 143
Block first atom: 2247
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2267
Blocpdb> 24 atoms in block 145
Block first atom: 2283
Blocpdb> 15 atoms in block 146
Block first atom: 2307
Blocpdb> 14 atoms in block 147
Block first atom: 2322
Blocpdb> 11 atoms in block 148
Block first atom: 2336
Blocpdb> 10 atoms in block 149
Block first atom: 2347
Blocpdb> 7 atoms in block 150
Block first atom: 2357
Blocpdb> 7 atoms in block 151
Block first atom: 2364
Blocpdb> 7 atoms in block 152
Block first atom: 2371
Blocpdb> 16 atoms in block 153
Block first atom: 2378
Blocpdb> 11 atoms in block 154
Block first atom: 2394
Blocpdb> 20 atoms in block 155
Block first atom: 2405
Blocpdb> 24 atoms in block 156
Block first atom: 2425
Blocpdb> 14 atoms in block 157
Block first atom: 2449
Blocpdb> 19 atoms in block 158
Block first atom: 2463
Blocpdb> 7 atoms in block 159
Block first atom: 2481
Blocpdb> 159 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1623463 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7464
Prepmat> Matrix trace = 3574780.0000
Prepmat> Last element read: 7464 7464 414.7270
Prepmat> 12721 lines saved.
Prepmat> 10713 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2488
RTB> Total mass = 2488.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2488
RTB> Number of blocks = 159
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 396987.2725
RTB> 69867 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 954
Diagstd> Nb of non-zero elements: 69867
Diagstd> Projected matrix trace = 396987.2725
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 954 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 396987.2725
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.3586661 0.8748846 1.8641420 2.5693043
4.9376781 5.0787928 8.0052658 11.2633676 14.8328542
17.4437890 18.8019785 20.4944308 20.7765292 22.9344862
24.4086032 28.2732452 28.7138143 31.3784917 32.2043068
33.4610259 34.7818422 38.2956676 40.7939916 41.9005610
45.6384591 47.0375612 48.9338627 51.2909131 54.6285238
55.0085415 56.1048022 57.2205200 58.1422073 58.7191601
62.4050541 62.9715311 64.1672387 65.0316423 68.0646532
68.7776181 70.5508644 73.3069610 73.8999274 75.0138077
76.1639373 77.7534271 78.5521575 78.8776026 80.8284851
83.3523591 84.9237975 85.6348899 88.2384337 90.1660400
90.4283093 91.6359427 92.3203256 94.3774009 94.9831743
97.7944878 99.7296334 101.3024324 101.6191382 102.7300666
104.5530211 106.5277710 107.5002092 108.2352404 110.2371792
110.6268783 111.5866098 113.0666650 115.9240021 116.6758898
117.5390572 118.2595921 119.9916474 120.7309333 121.8577182
122.6625315 124.0954461 124.4279338 125.5042214 127.3060068
127.6191132 128.7388246 129.4604082 130.9421442 132.1615129
132.5856735 134.8706770 135.7885283 135.8545360 138.3111049
138.7137513 140.0184517 142.6672012 143.3637458 145.4400214
146.0589996
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034304 0.0034324 0.0034326 0.0034334 0.0034353
0.0034358 65.0339981 101.5712220 148.2636813 174.0616326
241.2996365 244.7234179 307.2438217 364.4428292 418.2227405
453.5401017 470.8657005 491.6015127 494.9733075 520.0436381
536.4963161 577.4084168 581.8897727 608.2908900 616.2433673
628.1522306 640.4298565 672.0012841 693.5749214 702.9188647
733.6024390 744.7622897 759.6263652 777.7060821 802.6108246
805.3976264 813.3833873 821.4311733 828.0204020 832.1185385
857.8377668 861.7224485 869.8651980 875.7046203 895.8929071
900.5728418 912.1083885 929.7536422 933.5063708 940.5153452
947.6980208 957.5358664 962.4414953 964.4331536 976.2869857
991.4121299 1000.7140175 1004.8949234 1020.0563775 1031.1379678
1032.6365333 1039.5088861 1043.3834509 1054.9437094 1058.3239393
1073.8718755 1084.4446524 1092.9623882 1094.6695408 1100.6368904
1110.3594001 1120.7963301 1125.9003004 1129.7429067 1140.1430024
1142.1564824 1147.1001110 1154.6824671 1169.1815763 1172.9671275
1177.2979334 1180.9009409 1189.5173698 1193.1761375 1198.7311779
1202.6831932 1209.6875267 1211.3069944 1216.5345487 1225.2359420
1226.7417373 1232.1116105 1235.5597903 1242.6104579 1248.3828134
1250.3844953 1261.1131347 1265.3970595 1265.7045811 1277.0967673
1278.9543362 1284.9549917 1297.0518906 1300.2143357 1309.5957144
1312.3795097
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2488
Rtb_to_modes> Number of blocs = 159
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9791E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3587
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8749
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.864
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.569
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.938
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.079
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.005
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.1
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 954 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00003
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
1.00005 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 0.99997
1.00002 0.99999 0.99998 1.00005 1.00002
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
0.99998 0.99998 1.00000 1.00006 1.00002
0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002
1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 44784 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001
1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00003
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
1.00005 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 0.99997
1.00002 0.99999 0.99998 1.00005 1.00002
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
0.99998 0.99998 1.00000 1.00006 1.00002
0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997
1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002
1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606032003402649896.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606032003402649896.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606032003402649896.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606032003402649896.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 159
First residue number = 233
Last residue number = 311
Number of atoms found = 2488
Mean number per residue = 15.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9791E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9919E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3587
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.864
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.569
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.938
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.079
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.005
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.1
Bfactors> 106 vectors, 7464 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.358700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.320 for 159 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.042 +/- 0.06
Bfactors> = 64.377 +/- 9.05
Bfactors> Shiftng-fct= 64.335
Bfactors> Scaling-fct= 156.697
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606032003402649896.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606032003402649896.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1093.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1199.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1210.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1211.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1225.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1249.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1265.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1266.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1300.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1309.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1313.
Chkmod> 106 vectors, 7464 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2488 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 59 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7199
0.0034 0.7944
0.0034 0.9332
0.0034 0.8752
0.0034 0.8596
0.0034 0.8327
65.0343 0.6332
101.5678 0.7086
148.2517 0.6372
174.0439 0.0311
241.2971 0.7050
244.7179 0.0918
307.2255 0.3151
364.3727 0.7856
418.1645 0.1994
453.4714 0.1065
470.8207 0.0796
491.5273 0.2243
494.9934 0.3595
519.9705 0.1498
536.4886 0.2967
577.3505 0.1533
581.8261 0.2982
608.2794 0.1148
616.1757 0.2469
628.1156 0.2237
640.3854 0.1950
672.0104 0.1758
693.5112 0.2294
702.8840 0.3593
733.5833 0.2677
744.7496 0.1998
759.5638 0.1871
777.6658 0.2824
802.5872 0.2588
805.3737 0.2343
813.3137 0.2570
821.3922 0.2258
827.9691 0.1264
832.0888 0.1700
857.8349 0.1835
861.6750 0.1961
869.8466 0.1267
875.6560 0.1517
895.8238 0.3173
900.5498 0.4130
912.0636 0.2507
929.7330 0.1889
933.4668 0.3986
940.4511 0.2508
947.6328 0.1598
957.4737 0.3440
962.3870 0.1600
964.4064 0.2708
976.2542 0.3553
991.3555 0.3870
1000.6487 0.3481
1004.8231 0.3000
1020.0216 0.1002
1031.1163 0.1802
1032.6019 0.1948
1039.4873 0.2682
1043.3368 0.2056
1054.9129 0.3832
1058.2608 0.2270
1073.8011 0.3706
1084.4001 0.0349
1092.9023 0.1986
1094.5195 0.3231
1100.4286 0.4554
1110.5612 0.3887
1120.6021 0.1335
1125.8509 0.2712
1129.5105 0.1631
1139.9018 0.2079
1141.9687 0.3454
1147.1197 0.4286
1154.8031 0.3627
1169.0103 0.2654
1173.0380 0.0337
1177.0518 0.2902
1181.0520 0.3384
1189.5077 0.3358
1192.9721 0.2496
1198.8877 0.3446
1202.8152 0.5094
1209.6578 0.0850
1211.1190 0.4842
1216.4619 0.3740
1225.1544 0.3187
1226.5972 0.2887
1231.8729 0.2702
1235.6957 0.3098
1242.3571 0.2273
1248.5110 0.3664
1250.3984 0.2678
1261.1961 0.3416
1265.3962 0.1637
1265.8620 0.0975
1276.9907 0.3699
1278.8360 0.3111
1284.8152 0.3218
1297.1453 0.2490
1300.3229 0.1757
1309.3593 0.3629
1312.5074 0.2694
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606032003402649896 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
making animated gifs
11 models are in 2606032003402649896.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606032003402649896 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
making animated gifs
11 models are in 2606032003402649896.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606032003402649896 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
making animated gifs
11 models are in 2606032003402649896.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606032003402649896 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
making animated gifs
11 models are in 2606032003402649896.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606032003402649896 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606032003402649896.eigenfacs
2606032003402649896.atom
making animated gifs
11 models are in 2606032003402649896.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606032003402649896.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2606032003402649896.10.pdb
2606032003402649896.11.pdb
2606032003402649896.7.pdb
2606032003402649896.8.pdb
2606032003402649896.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m11.892s
user 0m11.805s
sys 0m0.083s
rm: cannot remove '2606032003402649896.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|