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***  xill  ***

LOGs for ID: 2606032143472659296

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606032143472659296.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606032143472659296.atom to be opened. Openam> File opened: 2606032143472659296.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 349 First residue number = 234 Last residue number = 582 Number of atoms found = 2798 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 25.987397 +/- 10.702050 From: -5.159000 To: 48.066000 = 5.460359 +/- 10.350113 From: -17.476000 To: 29.913000 = 45.605119 +/- 12.648444 From: 11.691000 To: 75.216000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.1005 % Filled. Pdbmat> 1092439 non-zero elements. Pdbmat> 119539 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.45 +/- 23.79 Maximum number = 134 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 2.390780E+06 Pdbmat> Larger element = 509.646 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 349 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606032143472659296.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606032143472659296.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606032143472659296.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2798 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 349 residues. Blocpdb> 14 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 15 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 29 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 42 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 57 Blocpdb> 12 atoms in block 6 Block first atom: 76 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 88 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 100 Blocpdb> 9 atoms in block 9 Block first atom: 114 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 123 Blocpdb> 12 atoms in block 11 Block first atom: 138 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 150 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 163 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 179 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 197 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 214 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 230 Blocpdb> 18 atoms in block 18 Block first atom: 246 Blocpdb> 21 atoms in block 19 Block first atom: 264 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 285 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 302 Blocpdb> 14 atoms in block 22 Block first atom: 316 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 330 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 346 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 363 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 377 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 397 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 413 Blocpdb> 13 atoms in block 29 Block first atom: 429 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 442 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 464 Blocpdb> 14 atoms in block 32 Block first atom: 484 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 498 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 515 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 530 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 550 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 564 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 580 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 594 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 608 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 622 Blocpdb> 18 atoms in block 42 Block first atom: 639 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 657 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 681 Blocpdb> 13 atoms in block 45 Block first atom: 696 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 709 Blocpdb> 17 atoms in block 47 Block first atom: 730 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 747 Blocpdb> 13 atoms in block 49 Block first atom: 764 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 777 Blocpdb> 10 atoms in block 51 Block first atom: 794 Blocpdb> 22 atoms in block 52 Block first atom: 804 Blocpdb> 15 atoms in block 53 Block first atom: 826 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 841 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 858 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 876 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 891 Blocpdb> 12 atoms in block 58 Block first atom: 907 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 919 Blocpdb> 18 atoms in block 60 Block first atom: 940 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 958 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 971 Blocpdb> 15 atoms in block 63 Block first atom: 987 Blocpdb> 14 atoms in block 64 Block first atom: 1002 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1016 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 1036 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1051 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1066 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1080 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1099 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1116 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1129 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1152 Blocpdb> 16 atoms in block 74 Block first atom: 1165 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1181 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1196 Blocpdb> 13 atoms in block 77 Block first atom: 1210 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1223 Blocpdb> 21 atoms in block 79 Block first atom: 1238 Blocpdb> 20 atoms in block 80 Block first atom: 1259 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1279 Blocpdb> 9 atoms in block 82 Block first atom: 1295 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 1304 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1324 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1339 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 1352 Blocpdb> 10 atoms in block 87 Block first atom: 1373 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1383 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1399 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1412 Blocpdb> 13 atoms in block 91 Block first atom: 1427 Blocpdb> 20 atoms in block 92 Block first atom: 1440 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1460 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1480 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1500 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 1516 Blocpdb> 13 atoms in block 97 Block first atom: 1538 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 1551 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1568 Blocpdb> 12 atoms in block 100 Block first atom: 1584 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1596 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1609 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1624 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 1640 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1661 Blocpdb> 11 atoms in block 106 Block first atom: 1677 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1688 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1703 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1715 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 1727 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1747 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 1763 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 1777 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1793 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1806 Blocpdb> 13 atoms in block 116 Block first atom: 1822 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1835 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1852 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 1867 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 1884 Blocpdb> 15 atoms in block 121 Block first atom: 1900 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1915 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1934 Blocpdb> 17 atoms in block 124 Block first atom: 1950 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1967 Blocpdb> 15 atoms in block 126 Block first atom: 1983 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1998 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 2015 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 2030 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 2049 Blocpdb> 13 atoms in block 131 Block first atom: 2065 Blocpdb> 12 atoms in block 132 Block first atom: 2078 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 2090 Blocpdb> 19 atoms in block 134 Block first atom: 2105 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2124 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2139 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2154 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 2170 Blocpdb> 18 atoms in block 139 Block first atom: 2187 Blocpdb> 21 atoms in block 140 Block first atom: 2205 Blocpdb> 24 atoms in block 141 Block first atom: 2226 Blocpdb> 16 atoms in block 142 Block first atom: 2250 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2266 Blocpdb> 19 atoms in block 144 Block first atom: 2282 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 2301 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2318 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2332 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 2348 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2365 Blocpdb> 12 atoms in block 150 Block first atom: 2380 Blocpdb> 15 atoms in block 151 Block first atom: 2392 Blocpdb> 18 atoms in block 152 Block first atom: 2407 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2425 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2440 Blocpdb> 14 atoms in block 155 Block first atom: 2457 Blocpdb> 22 atoms in block 156 Block first atom: 2471 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2493 Blocpdb> 21 atoms in block 158 Block first atom: 2510 Blocpdb> 16 atoms in block 159 Block first atom: 2531 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2547 Blocpdb> 23 atoms in block 161 Block first atom: 2563 Blocpdb> 15 atoms in block 162 Block first atom: 2586 Blocpdb> 19 atoms in block 163 Block first atom: 2601 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 2620 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2639 Blocpdb> 12 atoms in block 166 Block first atom: 2658 Blocpdb> 16 atoms in block 167 Block first atom: 2670 Blocpdb> 13 atoms in block 168 Block first atom: 2686 Blocpdb> 13 atoms in block 169 Block first atom: 2699 Blocpdb> 16 atoms in block 170 Block first atom: 2712 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2728 Blocpdb> 17 atoms in block 172 Block first atom: 2741 Blocpdb> 17 atoms in block 173 Block first atom: 2758 Blocpdb> 17 atoms in block 174 Block first atom: 2775 Blocpdb> 7 atoms in block 175 Block first atom: 2791 Blocpdb> 175 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1092614 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8394 Prepmat> Matrix trace = 2390780.0000 Prepmat> Last element read: 8394 8394 172.5217 Prepmat> 15401 lines saved. Prepmat> 13420 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2798 RTB> Total mass = 2798.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2798 RTB> Number of blocks = 175 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 253146.0148 RTB> 68655 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1050 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68655 Diagstd> Projected matrix trace = 253146.0148 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1050 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 253146.0148 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.5236982 3.6955662 5.4597945 6.7014358 7.7915032 8.2908078 9.2342706 9.7392218 10.2677217 11.1894057 11.6768643 12.4187026 12.9001253 13.3217329 13.8469129 15.6623972 15.9016240 15.9855786 16.7927754 17.2042364 17.8099220 18.4608930 18.8463932 19.6965009 21.0587185 22.2773375 22.5976903 23.6077517 23.7371800 23.9237655 25.3907106 26.1302932 27.2810716 27.6265051 27.9929411 28.8511936 29.6822147 29.8923286 30.8221709 31.8093106 32.2991064 32.5559562 33.6392209 33.7349597 34.5700302 35.5504180 36.4284453 36.5222397 37.7725698 38.1750268 39.3041060 39.6583624 40.1064880 40.7827727 41.2096324 41.8251471 42.4990740 42.9150148 45.0008019 45.2775065 45.5878727 46.1001895 46.8920813 47.0485319 48.2638708 48.6409340 49.3906310 50.0327178 50.6466039 52.2152746 52.8710199 53.5793214 54.1069066 54.3476370 55.0430113 55.4256041 55.7079685 56.3807596 56.8735857 57.4227302 57.8734084 58.5748302 59.1038818 59.7625456 60.4684914 60.9942598 61.8199133 62.4718165 63.0228057 63.2325525 63.7123070 64.6875662 65.0126788 65.8620173 66.4217010 66.8967229 67.2120943 67.5368179 68.2150981 69.0138440 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034333 0.0034333 0.0034341 0.0034345 0.0034352 172.5098881 208.7544654 253.7367817 281.1118872 303.1139387 312.6753934 329.9868081 338.8889499 347.9624057 363.2442851 371.0721806 382.6779098 390.0248191 396.3470608 404.0840979 429.7584223 433.0280416 434.1696483 444.9964227 450.4151410 458.2751298 466.5751804 471.4215207 481.9365012 498.3233646 512.5390067 516.2110618 527.6216341 529.0659864 531.1412716 547.1831406 555.0951361 567.1866410 570.7662097 574.5390411 583.2801177 591.6207954 593.7110805 602.8744690 612.4524958 617.1497163 619.5987145 629.8226060 630.7182214 638.4768566 647.4669968 655.4138262 656.2570494 667.3959191 670.9419641 680.7916829 683.8528622 687.7056577 693.4795439 697.0993067 702.2860124 707.9213561 711.3771539 728.4594922 730.6956654 733.1957579 737.3040770 743.6096803 744.8491357 754.4081214 757.3493085 763.1634585 768.1080696 772.8059284 784.6826744 789.5945176 794.8659344 798.7697928 800.5447488 805.6499283 808.4450346 810.5017203 815.3812895 818.9371738 822.8813114 826.1041627 831.0952484 834.8400644 839.4789765 844.4225980 848.0857437 853.8065382 858.2965112 862.0732060 863.5065517 866.7761357 873.3849140 875.5769315 881.2777281 885.0142776 888.1732766 890.2643738 892.4123616 896.8824670 902.1180844 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2798 Rtb_to_modes> Number of blocs = 175 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.701 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.792 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.739 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.01 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1050 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50364 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606032143472659296.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606032143472659296.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606032143472659296.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606032143472659296.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 349 First residue number = 234 Last residue number = 582 Number of atoms found = 2798 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.701 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.792 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.739 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.01 Bfactors> 106 vectors, 8394 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.524000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.060 for 349 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.021 +/- 0.03 Bfactors> = 55.361 +/- 31.42 Bfactors> Shiftng-fct= 55.341 Bfactors> Scaling-fct= 1230.254 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606032143472659296.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606032143472659296.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.3 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vecteur en lecture: 794.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 2798 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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DQ=-80 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom making animated gifs 11 models are in 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2606032143472659296 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom making animated gifs 11 models are in 2606032143472659296.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606032143472659296.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606032143472659296.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2606032143472659296 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606032143472659296.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2606032143472659296 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606032143472659296.eigenfacs 2606032143472659296.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606032143472659296.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606032143472659296.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2606032143472659296.10.pdb 2606032143472659296.11.pdb 2606032143472659296.7.pdb 2606032143472659296.8.pdb 2606032143472659296.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m15.568s user 0m15.468s sys 0m0.096s rm: cannot remove '2606032143472659296.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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