CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  fg  ***

LOGs for ID: 2606040549382699479

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606040549382699479.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606040549382699479.atom to be opened. Openam> File opened: 2606040549382699479.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 319 First residue number = 5 Last residue number = 323 Number of atoms found = 2360 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = -52.316164 +/- 8.493428 From: -71.733000 To: -33.160000 = 6.900293 +/- 18.110400 From: -27.372000 To: 40.477000 = 18.867766 +/- 9.047561 From: -3.516000 To: 39.528000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3779 % Filled. Pdbmat> 846721 non-zero elements. Pdbmat> 92524 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.41 +/- 22.66 Maximum number = 125 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 1.850480E+06 Pdbmat> Larger element = 479.379 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 319 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606040549382699479.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606040549382699479.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606040549382699479.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2360 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 319 residues. Blocpdb> 10 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 12 atoms in block 2 Block first atom: 11 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 23 Blocpdb> 18 atoms in block 4 Block first atom: 42 Blocpdb> 13 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 73 Blocpdb> 10 atoms in block 7 Block first atom: 89 Blocpdb> 11 atoms in block 8 Block first atom: 99 Blocpdb> 10 atoms in block 9 Block first atom: 110 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 120 Blocpdb> 10 atoms in block 11 Block first atom: 137 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 147 Blocpdb> 10 atoms in block 13 Block first atom: 167 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 177 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 193 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 210 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 226 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 241 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 261 Blocpdb> 13 atoms in block 20 Block first atom: 279 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 292 Blocpdb> 13 atoms in block 22 Block first atom: 308 Blocpdb> 9 atoms in block 23 Block first atom: 321 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 330 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 343 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 358 Blocpdb> 15 atoms in block 27 Block first atom: 372 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 387 Blocpdb> 19 atoms in block 29 Block first atom: 403 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 422 Blocpdb> 18 atoms in block 31 Block first atom: 433 Blocpdb> 11 atoms in block 32 Block first atom: 451 Blocpdb> 16 atoms in block 33 Block first atom: 462 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 478 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 490 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 506 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 522 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 536 Blocpdb> 15 atoms in block 39 Block first atom: 552 Blocpdb> 18 atoms in block 40 Block first atom: 567 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 585 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 600 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 615 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 631 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 646 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 660 Blocpdb> 15 atoms in block 47 Block first atom: 676 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 691 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 708 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 724 Blocpdb> 18 atoms in block 51 Block first atom: 742 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 760 Blocpdb> 14 atoms in block 53 Block first atom: 773 Blocpdb> 14 atoms in block 54 Block first atom: 787 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 801 Blocpdb> 13 atoms in block 56 Block first atom: 816 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 829 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 843 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 857 Blocpdb> 9 atoms in block 60 Block first atom: 869 Blocpdb> 12 atoms in block 61 Block first atom: 878 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 890 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 912 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 932 Blocpdb> 10 atoms in block 65 Block first atom: 949 Blocpdb> 15 atoms in block 66 Block first atom: 959 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 974 Blocpdb> 19 atoms in block 68 Block first atom: 1000 Blocpdb> 12 atoms in block 69 Block first atom: 1019 Blocpdb> 11 atoms in block 70 Block first atom: 1031 Blocpdb> 11 atoms in block 71 Block first atom: 1042 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1053 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1066 Blocpdb> 10 atoms in block 74 Block first atom: 1078 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1088 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1103 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1125 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1142 Blocpdb> 12 atoms in block 79 Block first atom: 1157 Blocpdb> 12 atoms in block 80 Block first atom: 1169 Blocpdb> 8 atoms in block 81 Block first atom: 1181 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1189 Blocpdb> 13 atoms in block 83 Block first atom: 1203 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1216 Blocpdb> 12 atoms in block 85 Block first atom: 1234 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1246 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1265 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1281 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1297 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1312 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1331 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 1347 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1368 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 1387 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1405 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1421 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1436 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1452 Blocpdb> 10 atoms in block 99 Block first atom: 1466 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1476 Blocpdb> 15 atoms in block 101 Block first atom: 1490 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1505 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 1522 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 1538 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 1559 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1573 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 1589 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1605 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 1622 Blocpdb> 9 atoms in block 110 Block first atom: 1630 Blocpdb> 8 atoms in block 111 Block first atom: 1639 Blocpdb> 15 atoms in block 112 Block first atom: 1647 Blocpdb> 9 atoms in block 113 Block first atom: 1662 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1671 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1687 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1703 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 1719 Blocpdb> 13 atoms in block 118 Block first atom: 1733 Blocpdb> 13 atoms in block 119 Block first atom: 1746 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 1759 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1775 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1791 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 1801 Blocpdb> 16 atoms in block 124 Block first atom: 1820 Blocpdb> 12 atoms in block 125 Block first atom: 1836 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1848 Blocpdb> 12 atoms in block 127 Block first atom: 1867 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 1879 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 1895 Blocpdb> 12 atoms in block 130 Block first atom: 1914 Blocpdb> 17 atoms in block 131 Block first atom: 1926 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 1943 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 1960 Blocpdb> 12 atoms in block 134 Block first atom: 1975 Blocpdb> 19 atoms in block 135 Block first atom: 1987 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2006 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2018 Blocpdb> 10 atoms in block 138 Block first atom: 2034 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2044 Blocpdb> 13 atoms in block 140 Block first atom: 2061 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2074 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 2090 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2101 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 2117 Blocpdb> 15 atoms in block 145 Block first atom: 2126 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2141 Blocpdb> 18 atoms in block 147 Block first atom: 2158 Blocpdb> 23 atoms in block 148 Block first atom: 2176 Blocpdb> 14 atoms in block 149 Block first atom: 2199 Blocpdb> 15 atoms in block 150 Block first atom: 2213 Blocpdb> 10 atoms in block 151 Block first atom: 2228 Blocpdb> 10 atoms in block 152 Block first atom: 2238 Blocpdb> 10 atoms in block 153 Block first atom: 2248 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2258 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2271 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2284 Blocpdb> 19 atoms in block 157 Block first atom: 2297 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 2316 Blocpdb> 18 atoms in block 159 Block first atom: 2336 Blocpdb> 7 atoms in block 160 Block first atom: 2353 Blocpdb> 160 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 846881 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7080 Prepmat> Matrix trace = 1850480.0000 Prepmat> Last element read: 7080 7080 148.4573 Prepmat> 12881 lines saved. Prepmat> 11160 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2360 RTB> Total mass = 2360.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2360 RTB> Number of blocks = 160 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 213771.4604 RTB> 59520 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 960 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59520 Diagstd> Projected matrix trace = 213771.4604 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 960 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 213771.4604 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2355174 0.4194920 0.6275807 2.0736878 2.5379459 3.0697461 4.8168403 6.4295120 6.4594304 7.9496596 10.0784038 10.3669750 11.8829695 12.1773631 13.2631964 14.1108875 14.6561845 15.4332363 16.0875184 16.5470777 17.3768266 17.6409780 18.2403516 18.7790019 20.1116640 20.4937099 20.8861300 21.3919216 22.7219968 23.1574943 23.4459958 24.0929656 24.9630522 25.2912220 25.7895597 27.0502805 27.7427438 27.9874402 28.2890951 28.5499255 30.1787922 30.5131169 30.9783674 31.2722925 32.0140015 33.0652464 33.6187954 33.8542557 34.4612897 35.1897756 35.3871826 35.5317687 36.4752897 37.3024608 37.9169912 38.8125634 39.4617958 39.8941066 40.5610570 41.2246461 42.4201709 42.6996777 43.3655165 44.6647171 44.8784022 45.3723445 45.8292913 46.5751829 47.0668509 48.1798061 49.1087868 49.5293541 49.8950480 49.9854877 51.2866828 51.5353096 52.2195281 53.0840782 53.8204230 55.3118271 56.2032526 56.7622673 57.2378715 57.7920710 58.1233886 58.5222605 59.0151555 60.5105697 61.1241024 61.5347920 61.7317809 62.2769574 62.7724554 63.6456420 63.8792911 65.0481305 65.4718440 65.7696396 66.8081603 67.3953499 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034329 0.0034330 0.0034331 0.0034338 0.0034348 52.6995297 70.3326766 86.0260703 156.3748710 172.9961589 190.2595681 238.3287333 275.3494961 275.9893930 306.1748742 344.7395876 349.6401573 374.3327047 378.9412717 395.4753147 407.9176006 415.7246173 426.6028794 435.5517955 441.7290219 452.6687497 456.0963629 463.7798580 470.5779062 486.9891465 491.5928664 496.2771380 502.2502708 517.6289137 522.5658963 525.8109450 533.0162023 542.5554406 546.1100733 551.4640985 564.7824161 571.9657006 574.4825872 577.5702407 580.2267809 596.5491178 599.8443416 604.4001220 607.2606497 614.4198823 624.4262642 629.6313652 631.8324335 637.4718970 644.1745002 645.9788123 647.2971475 655.8350985 663.2297848 668.6705780 676.5212521 682.1559992 685.8823896 691.5919225 697.2262798 707.2638931 709.5901505 715.1012582 725.7341739 727.4681328 731.4605202 735.1345781 741.0927500 744.9941310 753.7508318 760.9828738 764.2344526 767.0505799 767.7454430 777.6740103 779.5567294 784.7146338 791.1838623 796.6523353 807.6148254 814.0967206 818.1353300 821.5557087 825.5234400 827.8863899 830.7222198 834.2132010 844.7163517 848.9879526 851.8353301 853.1977145 856.9568872 860.3592624 866.3225438 867.9112632 875.8156269 878.6634608 880.6594733 887.5851683 891.4772125 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2360 Rtb_to_modes> Number of blocs = 160 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.817 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.40 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 960 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00004 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 0.99996 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 42480 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00004 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 0.99996 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606040549382699479.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606040549382699479.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606040549382699479.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606040549382699479.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 319 First residue number = 5 Last residue number = 323 Number of atoms found = 2360 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.817 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.40 Bfactors> 106 vectors, 7080 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.235500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.613 for 319 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.081 +/- 0.07 Bfactors> = 55.447 +/- 19.40 Bfactors> Shiftng-fct= 55.366 Bfactors> Scaling-fct= 268.975 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606040549382699479.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606040549382699479.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 891.5 Chkmod> 106 vectors, 7080 coordinates in file. Chkmod> That is: 2360 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 83 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7706 0.0034 0.8591 0.0034 0.9796 0.0034 0.6587 0.0034 0.8140 0.0034 0.8325 52.6953 0.7050 70.3303 0.7560 86.0237 0.6964 156.3799 0.6218 172.9906 0.8764 190.2593 0.6975 238.3225 0.2826 275.3481 0.2403 275.9684 0.0331 306.1683 0.1210 344.7521 0.3775 349.6762 0.3409 374.2699 0.1881 378.9660 0.0548 395.4107 0.4606 407.8873 0.3084 415.7609 0.3917 426.5398 0.3935 435.5667 0.1987 441.7491 0.1073 452.6906 0.2320 456.0641 0.3157 463.7555 0.0970 470.5702 0.1995 486.9481 0.3182 491.5273 0.2255 496.3018 0.3338 502.2062 0.1475 517.5839 0.2962 522.5717 0.3907 525.8333 0.2382 532.9605 0.3419 542.4990 0.3735 546.0734 0.3718 551.4451 0.3987 564.7552 0.2514 571.9129 0.3130 574.4842 0.3875 577.5547 0.4050 580.2026 0.4697 596.5354 0.3686 599.7880 0.3261 604.3901 0.2332 607.2123 0.3802 614.3551 0.4656 624.4443 0.4126 629.6156 0.3457 631.7656 0.1951 637.4326 0.3949 644.1489 0.2327 645.9768 0.3858 647.2533 0.0908 655.8493 0.3319 663.1794 0.2452 668.6684 0.1372 676.4699 0.3491 682.1112 0.3618 685.8176 0.3820 691.5532 0.2466 697.1571 0.3153 707.2321 0.4367 709.5624 0.4093 715.1075 0.4456 725.6647 0.3413 727.4499 0.4459 731.4102 0.3086 735.1087 0.4379 741.0993 0.3718 744.9871 0.4127 753.7200 0.3280 760.9596 0.3188 764.2066 0.3356 767.0557 0.1816 767.7471 0.3920 777.6658 0.4119 779.5587 0.3139 784.6845 0.3451 791.1195 0.3803 796.6150 0.3258 807.5668 0.4028 814.0382 0.3102 818.0839 0.2689 821.5357 0.4427 825.4732 0.3710 827.8267 0.3875 830.6705 0.4119 834.2116 0.4230 844.6761 0.4512 848.9230 0.4449 851.7656 0.4223 853.1488 0.2881 856.9410 0.3765 860.3055 0.4457 866.3150 0.4298 867.8788 0.2627 875.7906 0.3746 878.6134 0.4377 880.6241 0.3072 887.5593 0.4261 891.4697 0.4910 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2606040549382699479 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom making animated gifs 11 models are in 2606040549382699479.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2606040549382699479 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom making animated gifs 11 models are in 2606040549382699479.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2606040549382699479 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom making animated gifs 11 models are in 2606040549382699479.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2606040549382699479 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom making animated gifs 11 models are in 2606040549382699479.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2606040549382699479 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606040549382699479.eigenfacs 2606040549382699479.atom making animated gifs 11 models are in 2606040549382699479.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606040549382699479.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2606040549382699479.10.pdb 2606040549382699479.11.pdb 2606040549382699479.7.pdb 2606040549382699479.8.pdb 2606040549382699479.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m13.284s user 0m13.216s sys 0m0.059s rm: cannot remove '2606040549382699479.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.