*** fg ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606040605132702897.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606040605132702897.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606040605132702897.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 637
First residue number = 6
Last residue number = 323
Number of atoms found = 4721
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -39.066825 +/- 16.847958 From: -71.693000 To: 2.786000
= 9.642600 +/- 14.842710 From: -27.367000 To: 40.488000
= 22.897831 +/- 13.338284 From: -9.072000 To: 57.939000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7277 % Filled.
Pdbmat> 1732903 non-zero elements.
Pdbmat> 189428 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.25 +/- 22.17
Maximum number = 125
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 3.788560E+06
Pdbmat> Larger element = 477.901
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
637 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606040605132702897.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606040605132702897.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606040605132702897.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4721 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 637 residues.
Blocpdb> 25 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 36 atoms in block 2
Block first atom: 26
Blocpdb> 26 atoms in block 3
Block first atom: 62
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 88
Blocpdb> 27 atoms in block 5
Block first atom: 110
Blocpdb> 30 atoms in block 6
Block first atom: 137
Blocpdb> 30 atoms in block 7
Block first atom: 167
Blocpdb> 31 atoms in block 8
Block first atom: 197
Blocpdb> 32 atoms in block 9
Block first atom: 228
Blocpdb> 35 atoms in block 10
Block first atom: 260
Blocpdb> 26 atoms in block 11
Block first atom: 295
Blocpdb> 25 atoms in block 12
Block first atom: 321
Blocpdb> 28 atoms in block 13
Block first atom: 346
Blocpdb> 32 atoms in block 14
Block first atom: 374
Blocpdb> 33 atoms in block 15
Block first atom: 406
Blocpdb> 26 atoms in block 16
Block first atom: 439
Blocpdb> 28 atoms in block 17
Block first atom: 465
Blocpdb> 32 atoms in block 18
Block first atom: 493
Blocpdb> 31 atoms in block 19
Block first atom: 525
Blocpdb> 35 atoms in block 20
Block first atom: 556
Blocpdb> 27 atoms in block 21
Block first atom: 591
Blocpdb> 30 atoms in block 22
Block first atom: 618
Blocpdb> 30 atoms in block 23
Block first atom: 648
Blocpdb> 30 atoms in block 24
Block first atom: 678
Blocpdb> 40 atoms in block 25
Block first atom: 708
Blocpdb> 28 atoms in block 26
Block first atom: 748
Blocpdb> 27 atoms in block 27
Block first atom: 776
Blocpdb> 28 atoms in block 28
Block first atom: 803
Blocpdb> 26 atoms in block 29
Block first atom: 831
Blocpdb> 23 atoms in block 30
Block first atom: 857
Blocpdb> 35 atoms in block 31
Block first atom: 880
Blocpdb> 33 atoms in block 32
Block first atom: 915
Blocpdb> 33 atoms in block 33
Block first atom: 948
Blocpdb> 37 atoms in block 34
Block first atom: 981
Blocpdb> 25 atoms in block 35
Block first atom: 1018
Blocpdb> 26 atoms in block 36
Block first atom: 1043
Blocpdb> 21 atoms in block 37
Block first atom: 1069
Blocpdb> 38 atoms in block 38
Block first atom: 1090
Blocpdb> 29 atoms in block 39
Block first atom: 1128
Blocpdb> 23 atoms in block 40
Block first atom: 1157
Blocpdb> 23 atoms in block 41
Block first atom: 1180
Blocpdb> 30 atoms in block 42
Block first atom: 1203
Blocpdb> 34 atoms in block 43
Block first atom: 1233
Blocpdb> 31 atoms in block 44
Block first atom: 1267
Blocpdb> 36 atoms in block 45
Block first atom: 1298
Blocpdb> 40 atoms in block 46
Block first atom: 1334
Blocpdb> 37 atoms in block 47
Block first atom: 1374
Blocpdb> 28 atoms in block 48
Block first atom: 1411
Blocpdb> 33 atoms in block 49
Block first atom: 1439
Blocpdb> 27 atoms in block 50
Block first atom: 1472
Blocpdb> 33 atoms in block 51
Block first atom: 1499
Blocpdb> 36 atoms in block 52
Block first atom: 1532
Blocpdb> 29 atoms in block 53
Block first atom: 1568
Blocpdb> 30 atoms in block 54
Block first atom: 1597
Blocpdb> 17 atoms in block 55
Block first atom: 1627
Blocpdb> 24 atoms in block 56
Block first atom: 1644
Blocpdb> 27 atoms in block 57
Block first atom: 1668
Blocpdb> 32 atoms in block 58
Block first atom: 1695
Blocpdb> 27 atoms in block 59
Block first atom: 1727
Blocpdb> 31 atoms in block 60
Block first atom: 1754
Blocpdb> 25 atoms in block 61
Block first atom: 1785
Blocpdb> 35 atoms in block 62
Block first atom: 1810
Blocpdb> 30 atoms in block 63
Block first atom: 1845
Blocpdb> 32 atoms in block 64
Block first atom: 1875
Blocpdb> 29 atoms in block 65
Block first atom: 1907
Blocpdb> 35 atoms in block 66
Block first atom: 1936
Blocpdb> 29 atoms in block 67
Block first atom: 1971
Blocpdb> 28 atoms in block 68
Block first atom: 2000
Blocpdb> 24 atoms in block 69
Block first atom: 2028
Blocpdb> 30 atoms in block 70
Block first atom: 2052
Blocpdb> 31 atoms in block 71
Block first atom: 2082
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 2113
Blocpdb> 33 atoms in block 73
Block first atom: 2135
Blocpdb> 41 atoms in block 74
Block first atom: 2168
Blocpdb> 25 atoms in block 75
Block first atom: 2209
Blocpdb> 19 atoms in block 76
Block first atom: 2234
Blocpdb> 24 atoms in block 77
Block first atom: 2253
Blocpdb> 30 atoms in block 78
Block first atom: 2277
Blocpdb> 39 atoms in block 79
Block first atom: 2307
Blocpdb> 16 atoms in block 80
Block first atom: 2346
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 2362
Blocpdb> 37 atoms in block 82
Block first atom: 2384
Blocpdb> 29 atoms in block 83
Block first atom: 2421
Blocpdb> 21 atoms in block 84
Block first atom: 2450
Blocpdb> 27 atoms in block 85
Block first atom: 2471
Blocpdb> 30 atoms in block 86
Block first atom: 2498
Blocpdb> 26 atoms in block 87
Block first atom: 2528
Blocpdb> 33 atoms in block 88
Block first atom: 2554
Blocpdb> 35 atoms in block 89
Block first atom: 2587
Blocpdb> 31 atoms in block 90
Block first atom: 2622
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 2653
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 2682
Blocpdb> 29 atoms in block 93
Block first atom: 2704
Blocpdb> 31 atoms in block 94
Block first atom: 2733
Blocpdb> 30 atoms in block 95
Block first atom: 2764
Blocpdb> 29 atoms in block 96
Block first atom: 2794
Blocpdb> 28 atoms in block 97
Block first atom: 2823
Blocpdb> 32 atoms in block 98
Block first atom: 2851
Blocpdb> 30 atoms in block 99
Block first atom: 2883
Blocpdb> 33 atoms in block 100
Block first atom: 2913
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 2946
Blocpdb> 31 atoms in block 102
Block first atom: 2976
Blocpdb> 30 atoms in block 103
Block first atom: 3007
Blocpdb> 32 atoms in block 104
Block first atom: 3037
Blocpdb> 34 atoms in block 105
Block first atom: 3069
Blocpdb> 31 atoms in block 106
Block first atom: 3103
Blocpdb> 28 atoms in block 107
Block first atom: 3134
Blocpdb> 28 atoms in block 108
Block first atom: 3162
Blocpdb> 28 atoms in block 109
Block first atom: 3190
Blocpdb> 21 atoms in block 110
Block first atom: 3218
Blocpdb> 34 atoms in block 111
Block first atom: 3239
Blocpdb> 37 atoms in block 112
Block first atom: 3273
Blocpdb> 25 atoms in block 113
Block first atom: 3310
Blocpdb> 45 atoms in block 114
Block first atom: 3335
Blocpdb> 23 atoms in block 115
Block first atom: 3380
Blocpdb> 24 atoms in block 116
Block first atom: 3403
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 3427
Blocpdb> 37 atoms in block 118
Block first atom: 3449
Blocpdb> 32 atoms in block 119
Block first atom: 3486
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 3518
Blocpdb> 22 atoms in block 121
Block first atom: 3542
Blocpdb> 31 atoms in block 122
Block first atom: 3564
Blocpdb> 31 atoms in block 123
Block first atom: 3595
Blocpdb> 32 atoms in block 124
Block first atom: 3626
Blocpdb> 34 atoms in block 125
Block first atom: 3658
Blocpdb> 37 atoms in block 126
Block first atom: 3692
Blocpdb> 37 atoms in block 127
Block first atom: 3729
Blocpdb> 31 atoms in block 128
Block first atom: 3766
Blocpdb> 30 atoms in block 129
Block first atom: 3797
Blocpdb> 24 atoms in block 130
Block first atom: 3827
Blocpdb> 32 atoms in block 131
Block first atom: 3851
Blocpdb> 37 atoms in block 132
Block first atom: 3883
Blocpdb> 30 atoms in block 133
Block first atom: 3920
Blocpdb> 33 atoms in block 134
Block first atom: 3950
Blocpdb> 17 atoms in block 135
Block first atom: 3983
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 4000
Blocpdb> 25 atoms in block 137
Block first atom: 4023
Blocpdb> 32 atoms in block 138
Block first atom: 4048
Blocpdb> 27 atoms in block 139
Block first atom: 4080
Blocpdb> 29 atoms in block 140
Block first atom: 4107
Blocpdb> 26 atoms in block 141
Block first atom: 4136
Blocpdb> 35 atoms in block 142
Block first atom: 4162
Blocpdb> 31 atoms in block 143
Block first atom: 4197
Blocpdb> 28 atoms in block 144
Block first atom: 4228
Blocpdb> 31 atoms in block 145
Block first atom: 4256
Blocpdb> 34 atoms in block 146
Block first atom: 4287
Blocpdb> 27 atoms in block 147
Block first atom: 4321
Blocpdb> 31 atoms in block 148
Block first atom: 4348
Blocpdb> 26 atoms in block 149
Block first atom: 4379
Blocpdb> 30 atoms in block 150
Block first atom: 4405
Blocpdb> 27 atoms in block 151
Block first atom: 4435
Blocpdb> 25 atoms in block 152
Block first atom: 4462
Blocpdb> 32 atoms in block 153
Block first atom: 4487
Blocpdb> 41 atoms in block 154
Block first atom: 4519
Blocpdb> 29 atoms in block 155
Block first atom: 4560
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 4589
Blocpdb> 23 atoms in block 157
Block first atom: 4609
Blocpdb> 26 atoms in block 158
Block first atom: 4632
Blocpdb> 39 atoms in block 159
Block first atom: 4658
Blocpdb> 25 atoms in block 160
Block first atom: 4696
Blocpdb> 160 blocks.
Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1733063 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 14163
Prepmat> Matrix trace = 3788560.0000
Prepmat> Last element read: 14163 14163 139.7921
Prepmat> 12881 lines saved.
Prepmat> 11432 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4721
RTB> Total mass = 4721.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4721
RTB> Number of blocks = 160
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 190010.7039
RTB> 49728 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 960
Diagstd> Nb of non-zero elements: 49728
Diagstd> Projected matrix trace = 190010.7039
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 960 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 190010.7039
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2417074 0.7565289 1.1078367 1.4298639
1.4882848 2.0136903 2.0154737 2.6396683 2.7613189
3.3693118 3.8198264 4.6530172 5.7548153 5.9230609
7.2320810 7.3629800 7.7648544 8.2648102 9.1174317
9.3160541 11.7012233 11.9699246 12.4997911 13.0207592
14.3211929 14.9780760 15.1921937 16.1037656 16.3264265
17.2752472 17.5342859 17.6514230 18.5142978 19.1474636
19.6034862 20.2320161 20.5598067 20.9647049 21.2194907
21.4983216 21.8093301 22.3046141 22.9369490 23.0282118
23.2387031 23.8289279 24.2701061 24.8059243 25.9634627
26.1761584 26.7839915 27.1350186 27.6868379 28.0668175
28.4799798 29.1341764 29.6924536 30.0300317 30.3333725
30.9709672 31.3286812 32.0513894 32.3810217 32.7574911
33.0717705 33.1201255 33.6300197 34.1515418 34.5942340
35.2733059 35.3963250 36.7409868 36.9600576 37.5431478
37.8954540 38.2521569 38.7729981 39.8223017 40.2036062
40.6996512 41.3549733 41.5353434 42.0604068 43.0709725
43.4192533 43.7242891 43.7493555 44.1249944 44.8068199
45.3112998 45.6119693 45.8309600 46.6084419 46.8154945
47.2466861 47.5680225 47.9462189 48.6689139 48.7764390
49.1929223
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034328 0.0034332 0.0034342 0.0034345
0.0034345 53.3875791 94.4513204 114.2965567 129.8502032
132.4763330 154.0960895 154.1643108 176.4289932 180.4486202
199.3268865 212.2350433 234.2408355 260.5019480 264.2824835
292.0296318 294.6606153 302.5951339 312.1847767 327.8925429
331.4448543 371.4590247 375.6998204 383.9252337 391.8442105
410.9461135 420.2650694 423.2583398 435.7716777 438.7739641
451.3437315 454.7150432 456.2313679 467.2495616 475.1720706
480.7972070 488.4440919 492.3849776 497.2097744 500.2219650
503.4977777 507.1266610 512.8526887 520.0715600 521.1051775
523.4813620 530.0874615 534.9720810 540.8452093 553.3202780
555.5820874 561.9956187 565.6663470 571.3891107 575.2966768
579.5155833 586.1336468 591.7228276 595.0770150 598.0749734
604.3279271 607.8078950 614.7785563 617.9318122 621.5135421
624.4878644 624.9442361 629.7364639 634.6005405 638.7003282
644.9385886 646.0622522 658.2194154 660.1788391 665.3660260
668.4806456 671.6194184 676.1763425 685.2648557 688.5377970
692.7724743 698.3275127 699.8487363 704.2583662 712.6685919
715.5441830 718.0532609 718.2590556 721.3360079 726.8877356
730.9682952 733.3895071 735.1479614 741.3573075 743.0021800
746.4160278 748.9500068 751.9214294 757.5671030 758.4034952
761.6344705
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4721
Rtb_to_modes> Number of blocs = 160
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2417
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7565
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.108
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.430
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.488
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.014
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.015
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.369
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.820
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.755
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.923
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.232
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.363
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.765
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.265
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.117
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.316
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 960 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003
1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 0.99998
1.00000 1.00003 0.99996 0.99999 1.00002
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99997
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001
1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 84978 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003
1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 0.99998
1.00000 1.00003 0.99996 0.99999 1.00002
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99997
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001
1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606040605132702897.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606040605132702897.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606040605132702897.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606040605132702897.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 637
First residue number = 6
Last residue number = 323
Number of atoms found = 4721
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2417
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7565
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.430
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.488
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.014
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.015
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.369
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.820
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.653
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.755
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.232
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.363
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.765
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.265
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.117
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.316
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19
Bfactors> 106 vectors, 14163 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.241700
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.389 for 637 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.045 +/- 0.03
Bfactors> = 54.679 +/- 19.52
Bfactors> Shiftng-fct= 54.634
Bfactors> Scaling-fct= 590.241
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606040605132702897.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606040605132702897.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.6
Chkmod> 106 vectors, 14163 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4721 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 33 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9898
0.0034 0.7663
0.0034 0.8865
0.0034 0.8866
0.0034 0.8418
0.0034 0.7000
53.3845 0.6229
94.4455 0.5615
114.3001 0.6421
129.8508 0.6547
132.4580 0.6329
154.1013 0.6057
154.1396 0.6203
176.4325 0.5544
180.4305 0.4422
199.3091 0.6496
212.2308 0.7452
234.2303 0.7997
260.4949 0.7510
264.2698 0.7230
292.0155 0.5479
294.6484 0.5335
302.5850 0.6340
312.1750 0.3151
327.8707 0.4144
331.4297 0.3873
371.4237 0.1910
375.6849 0.1650
383.9120 0.1570
391.8160 0.1854
410.9114 0.0499
420.2740 0.0942
423.2096 0.0455
435.7020 0.1738
438.8031 0.2075
451.3864 0.1977
454.6399 0.0958
456.1934 0.3236
467.1753 0.2212
475.1831 0.1805
480.7338 0.3593
488.3988 0.4555
492.3662 0.2581
497.1326 0.2608
500.2065 0.3010
503.4958 0.2773
507.1127 0.3101
512.7776 0.2937
520.0838 0.2848
521.1030 0.2396
523.4735 0.2802
530.0766 0.1810
534.9479 0.1581
540.8664 0.3406
553.2596 0.3387
555.5990 0.2473
561.9296 0.4176
565.6940 0.3801
571.3972 0.3487
575.3046 0.3228
579.4909 0.3327
586.0665 0.2761
591.6730 0.4243
595.0512 0.5187
598.0161 0.4347
604.2925 0.3655
607.7946 0.2565
614.7388 0.3554
617.8955 0.3443
621.5107 0.4023
624.4443 0.4235
624.9162 0.5337
629.7092 0.4708
634.5590 0.5865
638.6338 0.5983
644.8807 0.4404
646.0681 0.5253
658.1823 0.3182
660.1500 0.2177
665.3096 0.5720
668.4920 0.2144
671.5717 0.4951
676.1212 0.3600
685.2156 0.4242
688.4774 0.2502
692.7457 0.2557
698.2555 0.1928
699.8579 0.2861
704.2247 0.2738
712.6300 0.3312
715.5196 0.4229
717.9872 0.5408
718.2335 0.2326
721.2642 0.3525
726.8823 0.5463
730.9264 0.4921
733.3422 0.1546
735.1087 0.5921
741.3379 0.4023
743.0060 0.4874
746.4102 0.2017
748.9334 0.4228
751.9188 0.4087
757.5430 0.4590
758.3986 0.1928
761.5792 0.3609
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606040605132702897 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
making animated gifs
11 models are in 2606040605132702897.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606040605132702897 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
making animated gifs
11 models are in 2606040605132702897.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606040605132702897 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
making animated gifs
11 models are in 2606040605132702897.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606040605132702897 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
making animated gifs
11 models are in 2606040605132702897.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606040605132702897 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606040605132702897.eigenfacs
2606040605132702897.atom
making animated gifs
11 models are in 2606040605132702897.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606040605132702897.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2606040605132702897.10.pdb
2606040605132702897.11.pdb
2606040605132702897.7.pdb
2606040605132702897.8.pdb
2606040605132702897.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m17.994s
user 0m17.865s
sys 0m0.121s
rm: cannot remove '2606040605132702897.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
