***  fg  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606050706392870977.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606050706392870977.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606050706392870977.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 612
First residue number = 2
Last residue number = 316
Number of atoms found = 5572
Mean number per residue = 9.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -18.381423 +/- 9.382129 From: -46.193000 To: 6.016000
= -15.088104 +/- 15.639314 From: -47.278000 To: 23.297000
= -19.895801 +/- 21.075553 From: -71.002000 To: 28.825000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.7354 % Filled.
Pdbmat> 2424706 non-zero elements.
Pdbmat> 265736 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 95.38 +/- 26.43
Maximum number = 159
Minimum number = 12
Pdbmat> Matrix trace = 5.314720E+06
Pdbmat> Larger element = 582.293
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
612 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606050706392870977.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606050706392870977.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606050706392870977.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5572 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 612 residues.
Blocpdb> 43 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 37 atoms in block 2
Block first atom: 44
Blocpdb> 27 atoms in block 3
Block first atom: 81
Blocpdb> 23 atoms in block 4
Block first atom: 108
Blocpdb> 29 atoms in block 5
Block first atom: 131
Blocpdb> 38 atoms in block 6
Block first atom: 160
Blocpdb> 44 atoms in block 7
Block first atom: 198
Blocpdb> 39 atoms in block 8
Block first atom: 242
Blocpdb> 42 atoms in block 9
Block first atom: 281
Blocpdb> 24 atoms in block 10
Block first atom: 323
Blocpdb> 30 atoms in block 11
Block first atom: 347
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 377
Blocpdb> 39 atoms in block 13
Block first atom: 386
Blocpdb> 34 atoms in block 14
Block first atom: 425
Blocpdb> 31 atoms in block 15
Block first atom: 459
Blocpdb> 22 atoms in block 16
Block first atom: 490
Blocpdb> 36 atoms in block 17
Block first atom: 512
Blocpdb> 47 atoms in block 18
Block first atom: 548
Blocpdb> 36 atoms in block 19
Block first atom: 595
Blocpdb> 36 atoms in block 20
Block first atom: 631
Blocpdb> 52 atoms in block 21
Block first atom: 667
Blocpdb> 36 atoms in block 22
Block first atom: 719
Blocpdb> 36 atoms in block 23
Block first atom: 755
Blocpdb> 41 atoms in block 24
Block first atom: 791
Blocpdb> 38 atoms in block 25
Block first atom: 832
Blocpdb> 36 atoms in block 26
Block first atom: 870
Blocpdb> 37 atoms in block 27
Block first atom: 906
Blocpdb> 32 atoms in block 28
Block first atom: 943
Blocpdb> 29 atoms in block 29
Block first atom: 975
Blocpdb> 37 atoms in block 30
Block first atom: 1004
Blocpdb> 29 atoms in block 31
Block first atom: 1041
Blocpdb> 40 atoms in block 32
Block first atom: 1070
Blocpdb> 36 atoms in block 33
Block first atom: 1110
Blocpdb> 30 atoms in block 34
Block first atom: 1146
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 1176
Blocpdb> 32 atoms in block 36
Block first atom: 1191
Blocpdb> 59 atoms in block 37
Block first atom: 1223
Blocpdb> 34 atoms in block 38
Block first atom: 1282
Blocpdb> 33 atoms in block 39
Block first atom: 1316
Blocpdb> 31 atoms in block 40
Block first atom: 1349
Blocpdb> 38 atoms in block 41
Block first atom: 1380
Blocpdb> 39 atoms in block 42
Block first atom: 1418
Blocpdb> 35 atoms in block 43
Block first atom: 1457
Blocpdb> 8 atoms in block 44
Block first atom: 1492
Blocpdb> 41 atoms in block 45
Block first atom: 1500
Blocpdb> 29 atoms in block 46
Block first atom: 1541
Blocpdb> 32 atoms in block 47
Block first atom: 1570
Blocpdb> 34 atoms in block 48
Block first atom: 1602
Blocpdb> 15 atoms in block 49
Block first atom: 1636
Blocpdb> 36 atoms in block 50
Block first atom: 1651
Blocpdb> 48 atoms in block 51
Block first atom: 1687
Blocpdb> 44 atoms in block 52
Block first atom: 1735
Blocpdb> 44 atoms in block 53
Block first atom: 1779
Blocpdb> 31 atoms in block 54
Block first atom: 1823
Blocpdb> 31 atoms in block 55
Block first atom: 1854
Blocpdb> 35 atoms in block 56
Block first atom: 1885
Blocpdb> 30 atoms in block 57
Block first atom: 1920
Blocpdb> 39 atoms in block 58
Block first atom: 1950
Blocpdb> 34 atoms in block 59
Block first atom: 1989
Blocpdb> 33 atoms in block 60
Block first atom: 2023
Blocpdb> 40 atoms in block 61
Block first atom: 2056
Blocpdb> 37 atoms in block 62
Block first atom: 2096
Blocpdb> 38 atoms in block 63
Block first atom: 2133
Blocpdb> 31 atoms in block 64
Block first atom: 2171
Blocpdb> 39 atoms in block 65
Block first atom: 2202
Blocpdb> 27 atoms in block 66
Block first atom: 2241
Blocpdb> 43 atoms in block 67
Block first atom: 2268
Blocpdb> 39 atoms in block 68
Block first atom: 2311
Blocpdb> 28 atoms in block 69
Block first atom: 2350
Blocpdb> 38 atoms in block 70
Block first atom: 2378
Blocpdb> 40 atoms in block 71
Block first atom: 2416
Blocpdb> 39 atoms in block 72
Block first atom: 2456
Blocpdb> 39 atoms in block 73
Block first atom: 2495
Blocpdb> 25 atoms in block 74
Block first atom: 2534
Blocpdb> 30 atoms in block 75
Block first atom: 2559
Blocpdb> 27 atoms in block 76
Block first atom: 2589
Blocpdb> 47 atoms in block 77
Block first atom: 2616
Blocpdb> 45 atoms in block 78
Block first atom: 2663
Blocpdb> 41 atoms in block 79
Block first atom: 2708
Blocpdb> 38 atoms in block 80
Block first atom: 2749
Blocpdb> 43 atoms in block 81
Block first atom: 2787
Blocpdb> 37 atoms in block 82
Block first atom: 2830
Blocpdb> 27 atoms in block 83
Block first atom: 2867
Blocpdb> 23 atoms in block 84
Block first atom: 2894
Blocpdb> 29 atoms in block 85
Block first atom: 2917
Blocpdb> 38 atoms in block 86
Block first atom: 2946
Blocpdb> 44 atoms in block 87
Block first atom: 2984
Blocpdb> 39 atoms in block 88
Block first atom: 3028
Blocpdb> 42 atoms in block 89
Block first atom: 3067
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 3109
Blocpdb> 30 atoms in block 91
Block first atom: 3133
Blocpdb> 9 atoms in block 92
Block first atom: 3163
Blocpdb> 39 atoms in block 93
Block first atom: 3172
Blocpdb> 34 atoms in block 94
Block first atom: 3211
Blocpdb> 31 atoms in block 95
Block first atom: 3245
Blocpdb> 22 atoms in block 96
Block first atom: 3276
Blocpdb> 36 atoms in block 97
Block first atom: 3298
Blocpdb> 47 atoms in block 98
Block first atom: 3334
Blocpdb> 36 atoms in block 99
Block first atom: 3381
Blocpdb> 36 atoms in block 100
Block first atom: 3417
Blocpdb> 52 atoms in block 101
Block first atom: 3453
Blocpdb> 36 atoms in block 102
Block first atom: 3505
Blocpdb> 36 atoms in block 103
Block first atom: 3541
Blocpdb> 41 atoms in block 104
Block first atom: 3577
Blocpdb> 38 atoms in block 105
Block first atom: 3618
Blocpdb> 36 atoms in block 106
Block first atom: 3656
Blocpdb> 37 atoms in block 107
Block first atom: 3692
Blocpdb> 32 atoms in block 108
Block first atom: 3729
Blocpdb> 29 atoms in block 109
Block first atom: 3761
Blocpdb> 37 atoms in block 110
Block first atom: 3790
Blocpdb> 29 atoms in block 111
Block first atom: 3827
Blocpdb> 40 atoms in block 112
Block first atom: 3856
Blocpdb> 36 atoms in block 113
Block first atom: 3896
Blocpdb> 30 atoms in block 114
Block first atom: 3932
Blocpdb> 15 atoms in block 115
Block first atom: 3962
Blocpdb> 32 atoms in block 116
Block first atom: 3977
Blocpdb> 59 atoms in block 117
Block first atom: 4009
Blocpdb> 34 atoms in block 118
Block first atom: 4068
Blocpdb> 33 atoms in block 119
Block first atom: 4102
Blocpdb> 31 atoms in block 120
Block first atom: 4135
Blocpdb> 38 atoms in block 121
Block first atom: 4166
Blocpdb> 39 atoms in block 122
Block first atom: 4204
Blocpdb> 35 atoms in block 123
Block first atom: 4243
Blocpdb> 8 atoms in block 124
Block first atom: 4278
Blocpdb> 41 atoms in block 125
Block first atom: 4286
Blocpdb> 29 atoms in block 126
Block first atom: 4327
Blocpdb> 32 atoms in block 127
Block first atom: 4356
Blocpdb> 34 atoms in block 128
Block first atom: 4388
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 4422
Blocpdb> 36 atoms in block 130
Block first atom: 4437
Blocpdb> 48 atoms in block 131
Block first atom: 4473
Blocpdb> 44 atoms in block 132
Block first atom: 4521
Blocpdb> 44 atoms in block 133
Block first atom: 4565
Blocpdb> 31 atoms in block 134
Block first atom: 4609
Blocpdb> 31 atoms in block 135
Block first atom: 4640
Blocpdb> 35 atoms in block 136
Block first atom: 4671
Blocpdb> 30 atoms in block 137
Block first atom: 4706
Blocpdb> 39 atoms in block 138
Block first atom: 4736
Blocpdb> 34 atoms in block 139
Block first atom: 4775
Blocpdb> 33 atoms in block 140
Block first atom: 4809
Blocpdb> 40 atoms in block 141
Block first atom: 4842
Blocpdb> 37 atoms in block 142
Block first atom: 4882
Blocpdb> 38 atoms in block 143
Block first atom: 4919
Blocpdb> 31 atoms in block 144
Block first atom: 4957
Blocpdb> 39 atoms in block 145
Block first atom: 4988
Blocpdb> 27 atoms in block 146
Block first atom: 5027
Blocpdb> 43 atoms in block 147
Block first atom: 5054
Blocpdb> 39 atoms in block 148
Block first atom: 5097
Blocpdb> 28 atoms in block 149
Block first atom: 5136
Blocpdb> 38 atoms in block 150
Block first atom: 5164
Blocpdb> 40 atoms in block 151
Block first atom: 5202
Blocpdb> 39 atoms in block 152
Block first atom: 5242
Blocpdb> 39 atoms in block 153
Block first atom: 5281
Blocpdb> 25 atoms in block 154
Block first atom: 5320
Blocpdb> 30 atoms in block 155
Block first atom: 5345
Blocpdb> 27 atoms in block 156
Block first atom: 5375
Blocpdb> 47 atoms in block 157
Block first atom: 5402
Blocpdb> 45 atoms in block 158
Block first atom: 5449
Blocpdb> 41 atoms in block 159
Block first atom: 5494
Blocpdb> 38 atoms in block 160
Block first atom: 5534
Blocpdb> 160 blocks.
Blocpdb> At most, 59 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2424866 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 16716
Prepmat> Matrix trace = 5314720.0000
Prepmat> Last element read: 16716 16716 219.9472
Prepmat> 12881 lines saved.
Prepmat> 11308 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5572
RTB> Total mass = 5572.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5572
RTB> Number of blocks = 160
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 228734.4311
RTB> 54192 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 960
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54192
Diagstd> Projected matrix trace = 228734.4311
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 960 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 228734.4311
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5951270 0.8003478 1.0276352 1.8280556
2.4505814 2.7233348 3.2241267 3.6784615 4.3205413
4.4259655 4.9207545 5.6019043 7.3634928 7.7662602
8.3266777 9.0401994 9.7520272 11.7915410 13.5827568
14.1108984 14.3483611 14.9976057 15.4751731 17.3919217
17.5992929 18.1208173 18.8930198 19.0649256 20.0012692
21.4778381 22.6335792 22.8699538 23.8582599 24.5676000
24.7375332 25.3648107 26.0762013 26.9424998 27.3890996
28.9059884 29.3184923 29.9958638 30.3928335 30.5250778
30.6477254 32.2695305 33.1084256 34.0618758 34.7383435
35.2357717 35.4987692 35.9002039 36.4732569 36.9947453
37.8798532 38.2013156 38.7403651 39.3453560 39.7348951
40.5142699 41.3178695 41.4712707 42.0640350 42.4248501
42.9788408 43.4735332 43.6723912 43.9708498 45.0264747
45.8640256 46.3665093 46.7862656 47.1080064 47.8924429
48.1369017 48.7076929 48.9842171 50.1288447 50.3212391
51.1192691 51.8029115 52.4362724 52.8074749 53.4587884
54.3165765 54.6158098 55.0953292 55.5773881 56.4909970
56.7966415 57.1121809 57.5781402 57.9032222 58.1363741
59.3330709 59.8310425 60.6295552 61.3017555 61.6600733
62.5198397
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034312 0.0034321 0.0034333 0.0034335 0.0034351
0.0034354 83.7722367 97.1481795 110.0816082 146.8216084
169.9925341 179.2032146 194.9850560 208.2707998 225.7170472
228.4542772 240.8857600 257.0177528 294.6708754 302.6225234
313.3510515 326.5008260 339.1116681 372.8898504 400.2112039
407.9177587 411.3357247 420.5389689 427.1820913 452.8653221
455.5571740 462.2577176 472.0043168 474.1468157 485.6507439
503.2578549 516.6208130 519.3114807 530.4136141 538.2408390
540.0991266 546.9039913 554.5202913 563.6561171 568.3085085
583.8337435 587.9847963 594.7383813 598.6608742 599.9618977
601.1659919 616.8670936 624.8338443 633.7669111 640.0292654
644.5953587 646.9964950 650.6444621 655.8168227 660.4885619
668.3430312 671.1729428 675.8917336 681.1488373 684.5123937
691.1929326 698.0141713 699.3087323 704.2887407 707.3028993
711.9059606 715.9913067 717.6269932 720.0749617 728.6672543
735.4131069 739.4307054 742.7701992 745.3197732 751.4996370
753.4151466 757.8688546 760.0171033 768.8455911 770.3195917
776.4037032 781.5780696 786.3414804 789.1198734 793.9713587
800.3159547 802.5174211 806.0327192 809.5512480 816.1780296
818.3830164 820.6531722 823.9940899 826.3169214 827.9788649
836.4571418 839.9599234 845.5464513 850.2208209 852.7020332
858.6263423
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5572
Rtb_to_modes> Number of blocs = 160
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9889E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5951
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8003
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.028
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.828
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.451
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.723
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.224
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.678
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.321
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.426
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.921
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.602
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.363
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.327
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.040
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.752
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.52
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 960 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999
0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001
0.99997 1.00000 0.99996 1.00000 0.99998
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00004 1.00004 1.00001 0.99997 1.00000
0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001
1.00000 0.99997 1.00004 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 100296 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999
0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001
0.99997 1.00000 0.99996 1.00000 0.99998
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00004 1.00004 1.00001 0.99997 1.00000
0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001
1.00000 0.99997 1.00004 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998
0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606050706392870977.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606050706392870977.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606050706392870977.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606050706392870977.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 612
First residue number = 2
Last residue number = 316
Number of atoms found = 5572
Mean number per residue = 9.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9889E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8003
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.451
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.723
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.224
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.678
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.321
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.426
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.921
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.363
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.040
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.752
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.52
Bfactors> 106 vectors, 16716 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.595100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.077 for 612 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.025 +/- 0.03
Bfactors> = 54.261 +/- 28.57
Bfactors> Shiftng-fct= 54.236
Bfactors> Scaling-fct= 1005.870
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606050706392870977.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606050706392870977.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.6
Chkmod> 106 vectors, 16716 coordinates in file.
Chkmod> That is: 5572 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6927
0.0034 0.9310
0.0034 0.8890
0.0034 0.8406
0.0034 0.7526
0.0034 0.7329
83.7667 0.5134
97.1411 0.5870
110.0964 0.3039
146.8131 0.5685
169.9998 0.3244
179.1845 0.3822
194.9729 0.1218
208.2488 0.2217
225.7193 0.5321
228.4454 0.4235
240.8814 0.2572
257.0089 0.6339
294.6484 0.6377
302.6045 0.3241
313.3437 0.5011
326.4832 0.6092
339.0966 0.3508
372.8495 0.2276
400.1534 0.4265
407.8873 0.2023
411.3416 0.0620
420.5545 0.2450
427.2304 0.3947
452.8209 0.3759
455.5468 0.2240
462.2275 0.2586
471.9463 0.0731
474.0652 0.1591
485.6145 0.3324
503.2616 0.1565
516.5578 0.1616
519.2897 0.1626
530.4102 0.2704
538.2440 0.4057
540.1029 0.3038
546.8287 0.4662
554.5369 0.2849
563.6058 0.4668
568.2935 0.1283
583.8492 0.4269
587.9747 0.1651
594.7539 0.4356
598.6073 0.3665
599.9845 0.4155
601.1625 0.3928
616.8451 0.3147
624.8219 0.3295
633.7223 0.2786
640.0171 0.4315
644.6064 0.3291
646.9799 0.3773
650.6147 0.3839
655.7594 0.4035
660.4178 0.2910
668.3156 0.3659
671.1326 0.3361
675.8595 0.3281
681.1598 0.2219
684.4408 0.4131
691.1268 0.3481
698.0022 0.2077
699.2680 0.4404
704.2247 0.4461
707.2321 0.4420
711.8850 0.2502
715.9315 0.2118
717.5765 0.4310
720.0371 0.3572
728.6645 0.3959
735.3493 0.5615
739.4268 0.5163
742.7680 0.4480
745.3035 0.4518
751.4482 0.5499
753.4070 0.4820
757.8543 0.2569
759.9518 0.4042
768.8214 0.4032
770.2770 0.4766
776.3759 0.4052
781.5226 0.3513
786.3357 0.3654
789.1049 0.5329
793.9463 0.5411
800.3068 0.4437
802.5138 0.5039
806.0323 0.4146
809.5355 0.4891
816.1358 0.4717
818.3721 0.3409
820.6023 0.3825
823.9720 0.3832
826.2585 0.3850
827.9691 0.3372
836.3996 0.5643
839.9165 0.4025
845.5133 0.4009
850.1721 0.4451
852.6649 0.3581
858.5906 0.4626
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606050706392870977 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
making animated gifs
11 models are in 2606050706392870977.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606050706392870977 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
making animated gifs
11 models are in 2606050706392870977.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606050706392870977 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
making animated gifs
11 models are in 2606050706392870977.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606050706392870977 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
making animated gifs
11 models are in 2606050706392870977.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606050706392870977 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606050706392870977.eigenfacs
2606050706392870977.atom
making animated gifs
11 models are in 2606050706392870977.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606050706392870977.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2606050706392870977.10.pdb
2606050706392870977.11.pdb
2606050706392870977.7.pdb
2606050706392870977.8.pdb
2606050706392870977.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m21.381s
user 0m21.219s
sys 0m0.154s
rm: cannot remove '2606050706392870977.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|