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***  Mutant cc2d1a  ***

LOGs for ID: 2606051253112923739

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606051253112923739.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606051253112923739.atom to be opened. Openam> File opened: 2606051253112923739.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 956 First residue number = 1 Last residue number = 5 Number of atoms found = 14780 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = -5.659684 +/- 27.164451 From: -73.358000 To: 62.591000 = 8.224545 +/- 23.537794 From: -55.501000 To: 69.943000 = -2.251769 +/- 24.120934 From: -65.083000 To: 62.441000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8208 % Filled. Pdbmat> 8068924 non-zero elements. Pdbmat> 886973 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 120.02 +/- 55.62 Maximum number = 253 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.773946E+07 Pdbmat> Larger element = 883.993 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 956 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606051253112923739.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606051253112923739.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606051253112923739.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 14780 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 956 residues. Blocpdb> 104 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 56 atoms in block 2 Block first atom: 105 Blocpdb> 62 atoms in block 3 Block first atom: 161 Blocpdb> 71 atoms in block 4 Block first atom: 223 Blocpdb> 80 atoms in block 5 Block first atom: 294 Blocpdb> 68 atoms in block 6 Block first atom: 374 Blocpdb> 76 atoms in block 7 Block first atom: 442 Blocpdb> 58 atoms in block 8 Block first atom: 518 Blocpdb> 76 atoms in block 9 Block first atom: 576 Blocpdb> 74 atoms in block 10 Block first atom: 652 Blocpdb> 66 atoms in block 11 Block first atom: 726 Blocpdb> 72 atoms in block 12 Block first atom: 792 Blocpdb> 92 atoms in block 13 Block first atom: 864 Blocpdb> 71 atoms in block 14 Block first atom: 956 Blocpdb> 81 atoms in block 15 Block first atom: 1027 Blocpdb> 68 atoms in block 16 Block first atom: 1108 Blocpdb> 79 atoms in block 17 Block first atom: 1176 Blocpdb> 72 atoms in block 18 Block first atom: 1255 Blocpdb> 60 atoms in block 19 Block first atom: 1327 Blocpdb> 68 atoms in block 20 Block first atom: 1387 Blocpdb> 78 atoms in block 21 Block first atom: 1455 Blocpdb> 79 atoms in block 22 Block first atom: 1533 Blocpdb> 73 atoms in block 23 Block first atom: 1612 Blocpdb> 72 atoms in block 24 Block first atom: 1685 Blocpdb> 68 atoms in block 25 Block first atom: 1757 Blocpdb> 82 atoms in block 26 Block first atom: 1825 Blocpdb> 62 atoms in block 27 Block first atom: 1907 Blocpdb> 81 atoms in block 28 Block first atom: 1969 Blocpdb> 85 atoms in block 29 Block first atom: 2050 Blocpdb> 81 atoms in block 30 Block first atom: 2135 Blocpdb> 79 atoms in block 31 Block first atom: 2216 Blocpdb> 57 atoms in block 32 Block first atom: 2295 Blocpdb> 97 atoms in block 33 Block first atom: 2352 Blocpdb> 83 atoms in block 34 Block first atom: 2449 Blocpdb> 84 atoms in block 35 Block first atom: 2532 Blocpdb> 78 atoms in block 36 Block first atom: 2616 Blocpdb> 77 atoms in block 37 Block first atom: 2694 Blocpdb> 68 atoms in block 38 Block first atom: 2771 Blocpdb> 77 atoms in block 39 Block first atom: 2839 Blocpdb> 65 atoms in block 40 Block first atom: 2916 Blocpdb> 63 atoms in block 41 Block first atom: 2981 Blocpdb> 70 atoms in block 42 Block first atom: 3044 Blocpdb> 69 atoms in block 43 Block first atom: 3114 Blocpdb> 78 atoms in block 44 Block first atom: 3183 Blocpdb> 77 atoms in block 45 Block first atom: 3261 Blocpdb> 71 atoms in block 46 Block first atom: 3338 Blocpdb> 59 atoms in block 47 Block first atom: 3409 Blocpdb> 60 atoms in block 48 Block first atom: 3468 Blocpdb> 72 atoms in block 49 Block first atom: 3528 Blocpdb> 69 atoms in block 50 Block first atom: 3600 Blocpdb> 57 atoms in block 51 Block first atom: 3669 Blocpdb> 79 atoms in block 52 Block first atom: 3726 Blocpdb> 93 atoms in block 53 Block first atom: 3805 Blocpdb> 84 atoms in block 54 Block first atom: 3898 Blocpdb> 78 atoms in block 55 Block first atom: 3982 Blocpdb> 67 atoms in block 56 Block first atom: 4060 Blocpdb> 68 atoms in block 57 Block first atom: 4127 Blocpdb> 87 atoms in block 58 Block first atom: 4195 Blocpdb> 75 atoms in block 59 Block first atom: 4282 Blocpdb> 79 atoms in block 60 Block first atom: 4357 Blocpdb> 71 atoms in block 61 Block first atom: 4436 Blocpdb> 69 atoms in block 62 Block first atom: 4507 Blocpdb> 75 atoms in block 63 Block first atom: 4576 Blocpdb> 76 atoms in block 64 Block first atom: 4651 Blocpdb> 65 atoms in block 65 Block first atom: 4727 Blocpdb> 70 atoms in block 66 Block first atom: 4792 Blocpdb> 62 atoms in block 67 Block first atom: 4862 Blocpdb> 68 atoms in block 68 Block first atom: 4924 Blocpdb> 72 atoms in block 69 Block first atom: 4992 Blocpdb> 91 atoms in block 70 Block first atom: 5064 Blocpdb> 85 atoms in block 71 Block first atom: 5155 Blocpdb> 94 atoms in block 72 Block first atom: 5240 Blocpdb> 63 atoms in block 73 Block first atom: 5334 Blocpdb> 72 atoms in block 74 Block first atom: 5397 Blocpdb> 85 atoms in block 75 Block first atom: 5469 Blocpdb> 97 atoms in block 76 Block first atom: 5554 Blocpdb> 95 atoms in block 77 Block first atom: 5651 Blocpdb> 82 atoms in block 78 Block first atom: 5746 Blocpdb> 66 atoms in block 79 Block first atom: 5828 Blocpdb> 78 atoms in block 80 Block first atom: 5894 Blocpdb> 74 atoms in block 81 Block first atom: 5972 Blocpdb> 69 atoms in block 82 Block first atom: 6046 Blocpdb> 76 atoms in block 83 Block first atom: 6115 Blocpdb> 75 atoms in block 84 Block first atom: 6191 Blocpdb> 78 atoms in block 85 Block first atom: 6266 Blocpdb> 73 atoms in block 86 Block first atom: 6344 Blocpdb> 82 atoms in block 87 Block first atom: 6417 Blocpdb> 68 atoms in block 88 Block first atom: 6499 Blocpdb> 63 atoms in block 89 Block first atom: 6567 Blocpdb> 72 atoms in block 90 Block first atom: 6630 Blocpdb> 86 atoms in block 91 Block first atom: 6702 Blocpdb> 68 atoms in block 92 Block first atom: 6788 Blocpdb> 73 atoms in block 93 Block first atom: 6856 Blocpdb> 77 atoms in block 94 Block first atom: 6929 Blocpdb> 60 atoms in block 95 Block first atom: 7006 Blocpdb> 70 atoms in block 96 Block first atom: 7066 Blocpdb> 70 atoms in block 97 Block first atom: 7136 Blocpdb> 73 atoms in block 98 Block first atom: 7206 Blocpdb> 80 atoms in block 99 Block first atom: 7279 Blocpdb> 85 atoms in block 100 Block first atom: 7359 Blocpdb> 99 atoms in block 101 Block first atom: 7444 Blocpdb> 80 atoms in block 102 Block first atom: 7543 Blocpdb> 85 atoms in block 103 Block first atom: 7623 Blocpdb> 60 atoms in block 104 Block first atom: 7708 Blocpdb> 99 atoms in block 105 Block first atom: 7768 Blocpdb> 75 atoms in block 106 Block first atom: 7867 Blocpdb> 80 atoms in block 107 Block first atom: 7942 Blocpdb> 66 atoms in block 108 Block first atom: 8022 Blocpdb> 80 atoms in block 109 Block first atom: 8088 Blocpdb> 80 atoms in block 110 Block first atom: 8168 Blocpdb> 76 atoms in block 111 Block first atom: 8248 Blocpdb> 73 atoms in block 112 Block first atom: 8324 Blocpdb> 78 atoms in block 113 Block first atom: 8397 Blocpdb> 68 atoms in block 114 Block first atom: 8475 Blocpdb> 83 atoms in block 115 Block first atom: 8543 Blocpdb> 76 atoms in block 116 Block first atom: 8626 Blocpdb> 101 atoms in block 117 Block first atom: 8702 Blocpdb> 77 atoms in block 118 Block first atom: 8803 Blocpdb> 76 atoms in block 119 Block first atom: 8880 Blocpdb> 87 atoms in block 120 Block first atom: 8956 Blocpdb> 69 atoms in block 121 Block first atom: 9043 Blocpdb> 85 atoms in block 122 Block first atom: 9112 Blocpdb> 78 atoms in block 123 Block first atom: 9197 Blocpdb> 85 atoms in block 124 Block first atom: 9275 Blocpdb> 89 atoms in block 125 Block first atom: 9360 Blocpdb> 77 atoms in block 126 Block first atom: 9449 Blocpdb> 75 atoms in block 127 Block first atom: 9526 Blocpdb> 86 atoms in block 128 Block first atom: 9601 Blocpdb> 85 atoms in block 129 Block first atom: 9687 Blocpdb> 94 atoms in block 130 Block first atom: 9772 Blocpdb> 67 atoms in block 131 Block first atom: 9866 Blocpdb> 87 atoms in block 132 Block first atom: 9933 Blocpdb> 83 atoms in block 133 Block first atom: 10020 Blocpdb> 75 atoms in block 134 Block first atom: 10103 Blocpdb> 65 atoms in block 135 Block first atom: 10178 Blocpdb> 66 atoms in block 136 Block first atom: 10243 Blocpdb> 92 atoms in block 137 Block first atom: 10309 Blocpdb> 83 atoms in block 138 Block first atom: 10401 Blocpdb> 73 atoms in block 139 Block first atom: 10484 Blocpdb> 81 atoms in block 140 Block first atom: 10557 Blocpdb> 85 atoms in block 141 Block first atom: 10638 Blocpdb> 72 atoms in block 142 Block first atom: 10723 Blocpdb> 96 atoms in block 143 Block first atom: 10795 Blocpdb> 87 atoms in block 144 Block first atom: 10891 Blocpdb> 79 atoms in block 145 Block first atom: 10978 Blocpdb> 94 atoms in block 146 Block first atom: 11057 Blocpdb> 84 atoms in block 147 Block first atom: 11151 Blocpdb> 84 atoms in block 148 Block first atom: 11235 Blocpdb> 75 atoms in block 149 Block first atom: 11319 Blocpdb> 88 atoms in block 150 Block first atom: 11394 Blocpdb> 67 atoms in block 151 Block first atom: 11482 Blocpdb> 82 atoms in block 152 Block first atom: 11549 Blocpdb> 74 atoms in block 153 Block first atom: 11631 Blocpdb> 89 atoms in block 154 Block first atom: 11705 Blocpdb> 81 atoms in block 155 Block first atom: 11794 Blocpdb> 83 atoms in block 156 Block first atom: 11875 Blocpdb> 72 atoms in block 157 Block first atom: 11958 Blocpdb> 92 atoms in block 158 Block first atom: 12030 Blocpdb> 86 atoms in block 159 Block first atom: 12122 Blocpdb> 78 atoms in block 160 Block first atom: 12208 Blocpdb> 81 atoms in block 161 Block first atom: 12286 Blocpdb> 90 atoms in block 162 Block first atom: 12367 Blocpdb> 64 atoms in block 163 Block first atom: 12457 Blocpdb> 77 atoms in block 164 Block first atom: 12521 Blocpdb> 60 atoms in block 165 Block first atom: 12598 Blocpdb> 76 atoms in block 166 Block first atom: 12658 Blocpdb> 72 atoms in block 167 Block first atom: 12734 Blocpdb> 71 atoms in block 168 Block first atom: 12806 Blocpdb> 78 atoms in block 169 Block first atom: 12877 Blocpdb> 74 atoms in block 170 Block first atom: 12955 Blocpdb> 78 atoms in block 171 Block first atom: 13029 Blocpdb> 97 atoms in block 172 Block first atom: 13107 Blocpdb> 89 atoms in block 173 Block first atom: 13204 Blocpdb> 99 atoms in block 174 Block first atom: 13293 Blocpdb> 73 atoms in block 175 Block first atom: 13392 Blocpdb> 81 atoms in block 176 Block first atom: 13465 Blocpdb> 82 atoms in block 177 Block first atom: 13546 Blocpdb> 93 atoms in block 178 Block first atom: 13628 Blocpdb> 85 atoms in block 179 Block first atom: 13721 Blocpdb> 54 atoms in block 180 Block first atom: 13806 Blocpdb> 103 atoms in block 181 Block first atom: 13860 Blocpdb> 71 atoms in block 182 Block first atom: 13963 Blocpdb> 97 atoms in block 183 Block first atom: 14034 Blocpdb> 70 atoms in block 184 Block first atom: 14131 Blocpdb> 88 atoms in block 185 Block first atom: 14201 Blocpdb> 66 atoms in block 186 Block first atom: 14289 Blocpdb> 67 atoms in block 187 Block first atom: 14355 Blocpdb> 102 atoms in block 188 Block first atom: 14422 Blocpdb> 76 atoms in block 189 Block first atom: 14524 Blocpdb> 103 atoms in block 190 Block first atom: 14600 Blocpdb> 25 atoms in block 191 Block first atom: 14703 Blocpdb> 53 atoms in block 192 Block first atom: 14727 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 104 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 25 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 8069116 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 44340 Prepmat> Matrix trace = 17739460.0000 Prepmat> Last element read: 44340 44340 41.1071 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 17454 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14780 RTB> Total mass = 14780.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 14780 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 268556.4497 RTB> 35784 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 35784 Diagstd> Projected matrix trace = 268556.4497 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 268556.4497 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0002128 0.0003350 0.0004292 0.0007580 0.0008731 0.0009940 0.0015084 0.0020372 0.0022823 0.0033614 0.0040597 0.0048134 0.0066944 0.0074817 0.0106603 0.0129670 0.0150337 0.0173990 0.0182210 0.0206168 0.0222329 0.0249708 0.0260124 0.0292296 0.0334073 0.0365334 0.0378991 0.0429211 0.0459887 0.0507548 0.0538903 0.0725402 0.0741024 0.0764164 0.0817546 0.0835301 0.0863057 0.0908727 0.0980910 0.1054011 0.1189481 0.1268622 0.1414646 0.1518815 0.1585240 0.1664142 0.1898080 0.1963347 0.2211742 0.2369439 0.2588236 0.2680706 0.2949624 0.3020153 0.3109633 0.3287454 0.3345431 0.3464222 0.3743195 0.3871959 0.4078658 0.4182983 0.4590855 0.5116919 0.5277248 0.5487489 0.5745964 0.6259853 0.6336787 0.6770931 0.7349464 0.7785035 0.8152483 0.8799873 0.9369448 0.9445363 1.0444614 1.1005321 1.1499652 1.2230775 1.2822630 1.3613079 1.3955577 1.4084639 1.4412096 1.5531194 1.5950725 1.6285601 1.6983444 1.7933862 1.9233994 1.9771005 2.1014822 2.1900331 2.2702993 2.3395842 2.3573963 2.3788795 2.5689014 2.6345935 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034337 0.0034338 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034341 1.5839103 1.9876434 2.2498185 2.9896875 3.2086769 3.4236732 4.2174261 4.9013100 5.1877248 6.2958562 6.9189469 7.5339380 8.8849002 9.3928371 11.2119459 12.3656063 13.3146158 14.3237594 14.6582156 15.5921557 16.1917345 17.1597850 17.5140071 18.5655064 19.8479674 20.7558547 21.1402385 22.4973032 23.2873906 24.4643594 25.2086969 29.2472170 29.5604767 30.0184626 31.0492598 31.3846064 31.9017799 32.7349721 34.0102443 35.2547654 37.4519136 38.6777713 40.8431488 42.3202000 43.2357238 44.2986536 47.3099550 48.1164794 51.0696056 52.8588882 55.2455430 56.2237592 58.9764524 59.6773781 60.5549751 62.2622988 62.8089213 63.9143158 66.4379904 67.5710512 69.3511935 70.2325330 73.5769999 77.6782740 78.8858368 80.4418591 82.3145703 85.9166554 86.4430032 89.3551256 93.0943040 95.8132494 98.0483379 101.8669920 105.1119942 105.5369646 110.9791739 113.9191220 116.4494992 120.0942630 122.9656566 126.6990790 128.2830231 128.8748382 130.3643546 135.3311291 137.1467435 138.5789227 141.5168520 145.4226951 150.6017495 152.6896688 157.4193599 160.7017561 163.6201698 166.0980842 166.7291676 167.4871537 174.0479827 176.2593183 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14780 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1275E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3503E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2924E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.5799E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7309E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9402E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5084E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0372E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2823E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3614E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0597E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8134E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6944E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4817E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0660E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2967E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5034E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7399E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8221E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0617E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2233E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4971E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6012E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.9230E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3407E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6533E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7899E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2921E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5989E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.0755E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3890E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.2540E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4102E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6416E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.1755E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.3530E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6306E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0873E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8091E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1054 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1269 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1519 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1585 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1664 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1898 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2681 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2950 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3020 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3743 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4183 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6337 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9445 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.223 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.408 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.441 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.923 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.977 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.190 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.340 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.569 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.635 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99995 1.00002 0.99998 1.00003 0.99997 1.00003 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 0.99996 0.99996 1.00000 0.99996 0.99997 1.00002 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 266040 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99995 1.00002 0.99998 1.00003 0.99997 1.00003 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 1.00004 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99996 1.00004 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 0.99997 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 0.99996 0.99996 1.00000 0.99996 0.99997 1.00002 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606051253112923739.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606051253112923739.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606051253112923739.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606051253112923739.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 956 First residue number = 1 Last residue number = 5 Number of atoms found = 14780 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1275E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3503E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2924E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5799E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7309E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9402E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5084E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0372E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2823E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3614E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0597E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8134E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6944E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4817E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0660E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2967E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5034E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7399E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8221E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0617E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2233E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4971E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6012E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.9230E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3407E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6533E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7899E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2921E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5989E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.0755E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3890E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.2540E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4102E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6416E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1755E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.3530E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.6306E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0873E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8091E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1054 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1269 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1519 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1585 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1664 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1898 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2950 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3020 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3743 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4183 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6337 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9445 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.223 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.408 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.441 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.553 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.923 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.977 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.340 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.569 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.635 Bfactors> 106 vectors, 44340 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000213 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.342 for 956 C-alpha atoms. Bfactors> = 17.872 +/- 34.78 Bfactors> = 72.944 +/- 23.81 Bfactors> Shiftng-fct= 55.072 Bfactors> Scaling-fct= 0.685 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606051253112923739.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606051253112923739.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.990 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.424 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.296 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.534 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.3 Chkmod> 106 vectors, 44340 coordinates in file. Chkmod> That is: 14780 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6913 0.0034 0.8088 0.0034 0.7062 0.0034 0.8785 0.0034 0.8220 0.0034 0.7660 1.5838 0.3901 1.9876 0.1530 2.2497 0.3661 2.9896 0.3707 3.2085 0.4605 3.4235 0.0449 4.2173 0.3751 4.9011 0.3261 5.1876 0.4859 6.2956 0.3381 6.9187 0.4798 7.5336 0.0617 8.8845 0.4213 9.3924 0.1204 11.2113 0.3353 12.3651 0.2628 13.3142 0.3140 14.3232 0.3374 14.6576 0.1895 15.5916 0.3842 16.1911 0.2826 17.1591 0.2888 17.5131 0.3913 18.5648 0.5244 19.8470 0.3342 20.7548 0.2123 21.1393 0.2604 22.4963 0.3412 23.2865 0.0953 24.4634 0.2409 25.2076 0.2345 29.2459 0.2452 29.5591 0.2921 30.0171 0.2098 31.0480 0.0986 31.3832 0.1076 31.9005 0.2804 32.7336 0.2231 34.0088 0.2011 35.2531 0.2404 37.4427 0.3863 38.6819 0.2129 40.8465 0.1473 42.3210 0.1578 43.2306 0.1880 44.2949 0.2778 47.3069 0.2196 48.1102 0.1171 51.0704 0.4793 52.8517 0.3394 55.2406 0.2830 56.2244 0.0517 58.9777 0.1751 59.6733 0.1937 60.5560 0.2246 62.2553 0.1549 62.8022 0.2836 63.9095 0.0985 66.4334 0.3182 67.5685 0.2373 69.3511 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structure for DQ=-60 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom making animated gifs 11 models are in 2606051253112923739.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051253112923739.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051253112923739.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2606051253112923739 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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running: ../../bin/get_modes.sh 2606051253112923739 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606051253112923739.eigenfacs 2606051253112923739.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606051253112923739.eigenfacs 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