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***  WT cc2d1a  ***

LOGs for ID: 2606051608322953402

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2606051608322953402.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2606051608322953402.atom to be opened. Openam> File opened: 2606051608322953402.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 951 First residue number = 1 Last residue number = 951 Number of atoms found = 7317 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -5.751958 +/- 27.146664 From: -72.370000 To: 61.681000 = 8.266338 +/- 23.480712 From: -54.932000 To: 69.061000 = -2.169993 +/- 24.259319 From: -64.447000 To: 62.441000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.8429 % Filled. Pdbmat> 2030822 non-zero elements. Pdbmat> 220810 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 60.36 +/- 26.51 Maximum number = 127 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 4.416200E+06 Pdbmat> Larger element = 492.991 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 951 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2606051608322953402.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2606051608322953402.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2606051608322953402.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7317 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 951 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 29 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 77 Blocpdb> 35 atoms in block 4 Block first atom: 108 Blocpdb> 35 atoms in block 5 Block first atom: 143 Blocpdb> 37 atoms in block 6 Block first atom: 178 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 215 Blocpdb> 34 atoms in block 8 Block first atom: 250 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 284 Blocpdb> 38 atoms in block 10 Block first atom: 327 Blocpdb> 32 atoms in block 11 Block first atom: 365 Blocpdb> 36 atoms in block 12 Block first atom: 397 Blocpdb> 39 atoms in block 13 Block first atom: 433 Blocpdb> 34 atoms in block 14 Block first atom: 472 Blocpdb> 40 atoms in block 15 Block first atom: 506 Blocpdb> 33 atoms in block 16 Block first atom: 546 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 579 Blocpdb> 44 atoms in block 18 Block first atom: 621 Blocpdb> 36 atoms in block 19 Block first atom: 665 Blocpdb> 38 atoms in block 20 Block first atom: 701 Blocpdb> 37 atoms in block 21 Block first atom: 739 Blocpdb> 41 atoms in block 22 Block first atom: 776 Blocpdb> 39 atoms in block 23 Block first atom: 817 Blocpdb> 36 atoms in block 24 Block first atom: 856 Blocpdb> 33 atoms in block 25 Block first atom: 892 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 925 Blocpdb> 33 atoms in block 27 Block first atom: 966 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 999 Blocpdb> 42 atoms in block 29 Block first atom: 1038 Blocpdb> 41 atoms in block 30 Block first atom: 1080 Blocpdb> 39 atoms in block 31 Block first atom: 1121 Blocpdb> 32 atoms in block 32 Block first atom: 1160 Blocpdb> 44 atoms in block 33 Block first atom: 1192 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1236 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1279 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1320 Blocpdb> 37 atoms in block 37 Block first atom: 1355 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1392 Blocpdb> 36 atoms in block 39 Block first atom: 1430 Blocpdb> 30 atoms in block 40 Block first atom: 1466 Blocpdb> 32 atoms in block 41 Block first atom: 1496 Blocpdb> 37 atoms in block 42 Block first atom: 1528 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1565 Blocpdb> 37 atoms in block 44 Block first atom: 1600 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1637 Blocpdb> 35 atoms in block 46 Block first atom: 1676 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1711 Blocpdb> 31 atoms in block 48 Block first atom: 1741 Blocpdb> 33 atoms in block 49 Block first atom: 1772 Blocpdb> 35 atoms in block 50 Block first atom: 1805 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1840 Blocpdb> 37 atoms in block 52 Block first atom: 1870 Blocpdb> 46 atoms in block 53 Block first atom: 1907 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 1953 Blocpdb> 37 atoms in block 55 Block first atom: 1995 Blocpdb> 37 atoms in block 56 Block first atom: 2032 Blocpdb> 33 atoms in block 57 Block first atom: 2069 Blocpdb> 44 atoms in block 58 Block first atom: 2102 Blocpdb> 39 atoms in block 59 Block first atom: 2146 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 2185 Blocpdb> 37 atoms in block 61 Block first atom: 2222 Blocpdb> 35 atoms in block 62 Block first atom: 2259 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 2294 Blocpdb> 39 atoms in block 64 Block first atom: 2330 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 2369 Blocpdb> 36 atoms in block 66 Block first atom: 2404 Blocpdb> 31 atoms in block 67 Block first atom: 2440 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2471 Blocpdb> 35 atoms in block 69 Block first atom: 2507 Blocpdb> 43 atoms in block 70 Block first atom: 2542 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 2585 Blocpdb> 49 atoms in block 72 Block first atom: 2627 Blocpdb> 31 atoms in block 73 Block first atom: 2676 Blocpdb> 33 atoms in block 74 Block first atom: 2707 Blocpdb> 42 atoms in block 75 Block first atom: 2740 Blocpdb> 49 atoms in block 76 Block first atom: 2782 Blocpdb> 45 atoms in block 77 Block first atom: 2831 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 2876 Blocpdb> 33 atoms in block 79 Block first atom: 2917 Blocpdb> 38 atoms in block 80 Block first atom: 2950 Blocpdb> 36 atoms in block 81 Block first atom: 2988 Blocpdb> 36 atoms in block 82 Block first atom: 3024 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 3060 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 3096 Blocpdb> 39 atoms in block 85 Block first atom: 3133 Blocpdb> 35 atoms in block 86 Block first atom: 3172 Blocpdb> 37 atoms in block 87 Block first atom: 3207 Blocpdb> 39 atoms in block 88 Block first atom: 3244 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 3283 Blocpdb> 40 atoms in block 90 Block first atom: 3320 Blocpdb> 41 atoms in block 91 Block first atom: 3360 Blocpdb> 33 atoms in block 92 Block first atom: 3401 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 3434 Blocpdb> 38 atoms in block 94 Block first atom: 3469 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 3507 Blocpdb> 33 atoms in block 96 Block first atom: 3539 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 3572 Blocpdb> 36 atoms in block 98 Block first atom: 3605 Blocpdb> 40 atoms in block 99 Block first atom: 3641 Blocpdb> 43 atoms in block 100 Block first atom: 3681 Blocpdb> 43 atoms in block 101 Block first atom: 3724 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 3767 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 3805 Blocpdb> 33 atoms in block 104 Block first atom: 3845 Blocpdb> 46 atoms in block 105 Block first atom: 3878 Blocpdb> 35 atoms in block 106 Block first atom: 3924 Blocpdb> 41 atoms in block 107 Block first atom: 3959 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 4000 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4034 Blocpdb> 37 atoms in block 110 Block first atom: 4072 Blocpdb> 36 atoms in block 111 Block first atom: 4109 Blocpdb> 40 atoms in block 112 Block first atom: 4145 Blocpdb> 38 atoms in block 113 Block first atom: 4185 Blocpdb> 34 atoms in block 114 Block first atom: 4223 Blocpdb> 41 atoms in block 115 Block first atom: 4257 Blocpdb> 40 atoms in block 116 Block first atom: 4298 Blocpdb> 45 atoms in block 117 Block first atom: 4338 Blocpdb> 42 atoms in block 118 Block first atom: 4383 Blocpdb> 40 atoms in block 119 Block first atom: 4425 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 4465 Blocpdb> 36 atoms in block 121 Block first atom: 4509 Blocpdb> 43 atoms in block 122 Block first atom: 4545 Blocpdb> 39 atoms in block 123 Block first atom: 4588 Blocpdb> 40 atoms in block 124 Block first atom: 4627 Blocpdb> 42 atoms in block 125 Block first atom: 4667 Blocpdb> 38 atoms in block 126 Block first atom: 4709 Blocpdb> 36 atoms in block 127 Block first atom: 4747 Blocpdb> 45 atoms in block 128 Block first atom: 4783 Blocpdb> 42 atoms in block 129 Block first atom: 4828 Blocpdb> 43 atoms in block 130 Block first atom: 4870 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 4913 Blocpdb> 43 atoms in block 132 Block first atom: 4949 Blocpdb> 36 atoms in block 133 Block first atom: 4992 Blocpdb> 37 atoms in block 134 Block first atom: 5028 Blocpdb> 32 atoms in block 135 Block first atom: 5065 Blocpdb> 35 atoms in block 136 Block first atom: 5097 Blocpdb> 48 atoms in block 137 Block first atom: 5132 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 5180 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 5225 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 5264 Blocpdb> 39 atoms in block 141 Block first atom: 5303 Blocpdb> 41 atoms in block 142 Block first atom: 5342 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 5383 Blocpdb> 41 atoms in block 144 Block first atom: 5430 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 5471 Blocpdb> 44 atoms in block 146 Block first atom: 5513 Blocpdb> 37 atoms in block 147 Block first atom: 5557 Blocpdb> 44 atoms in block 148 Block first atom: 5594 Blocpdb> 36 atoms in block 149 Block first atom: 5638 Blocpdb> 42 atoms in block 150 Block first atom: 5674 Blocpdb> 33 atoms in block 151 Block first atom: 5716 Blocpdb> 38 atoms in block 152 Block first atom: 5749 Blocpdb> 36 atoms in block 153 Block first atom: 5787 Blocpdb> 44 atoms in block 154 Block first atom: 5823 Blocpdb> 40 atoms in block 155 Block first atom: 5867 Blocpdb> 40 atoms in block 156 Block first atom: 5907 Blocpdb> 36 atoms in block 157 Block first atom: 5947 Blocpdb> 41 atoms in block 158 Block first atom: 5983 Blocpdb> 42 atoms in block 159 Block first atom: 6024 Blocpdb> 40 atoms in block 160 Block first atom: 6066 Blocpdb> 41 atoms in block 161 Block first atom: 6106 Blocpdb> 45 atoms in block 162 Block first atom: 6147 Blocpdb> 31 atoms in block 163 Block first atom: 6192 Blocpdb> 37 atoms in block 164 Block first atom: 6223 Blocpdb> 29 atoms in block 165 Block first atom: 6260 Blocpdb> 35 atoms in block 166 Block first atom: 6289 Blocpdb> 35 atoms in block 167 Block first atom: 6324 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 6359 Blocpdb> 37 atoms in block 169 Block first atom: 6397 Blocpdb> 37 atoms in block 170 Block first atom: 6434 Blocpdb> 41 atoms in block 171 Block first atom: 6471 Blocpdb> 48 atoms in block 172 Block first atom: 6512 Blocpdb> 38 atoms in block 173 Block first atom: 6560 Blocpdb> 47 atoms in block 174 Block first atom: 6598 Blocpdb> 37 atoms in block 175 Block first atom: 6645 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 6682 Blocpdb> 42 atoms in block 177 Block first atom: 6724 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 6766 Blocpdb> 42 atoms in block 179 Block first atom: 6815 Blocpdb> 28 atoms in block 180 Block first atom: 6857 Blocpdb> 51 atoms in block 181 Block first atom: 6885 Blocpdb> 36 atoms in block 182 Block first atom: 6936 Blocpdb> 48 atoms in block 183 Block first atom: 6972 Blocpdb> 38 atoms in block 184 Block first atom: 7020 Blocpdb> 42 atoms in block 185 Block first atom: 7058 Blocpdb> 37 atoms in block 186 Block first atom: 7100 Blocpdb> 33 atoms in block 187 Block first atom: 7137 Blocpdb> 50 atoms in block 188 Block first atom: 7170 Blocpdb> 39 atoms in block 189 Block first atom: 7220 Blocpdb> 47 atoms in block 190 Block first atom: 7259 Blocpdb> 12 atoms in block 191 Block first atom: 7305 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2031013 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 21951 Prepmat> Matrix trace = 4416200.0000 Prepmat> Last element read: 21951 21951 61.7455 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 17349 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7317 RTB> Total mass = 7317.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7317 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 130667.9224 RTB> 32667 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 32667 Diagstd> Projected matrix trace = 130667.9224 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 130667.9224 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000363 0.0000564 0.0000907 0.0001201 0.0001617 0.0002215 0.0002353 0.0004167 0.0004947 0.0008143 0.0008252 0.0010497 0.0011047 0.0013558 0.0019554 0.0025061 0.0030490 0.0036383 0.0038610 0.0044495 0.0047379 0.0059673 0.0063962 0.0068995 0.0069843 0.0093321 0.0098119 0.0107387 0.0117841 0.0133909 0.0140529 0.0146566 0.0173351 0.0214604 0.0236865 0.0244479 0.0267970 0.0281672 0.0284483 0.0289976 0.0369704 0.0397048 0.0413124 0.0448360 0.0466763 0.0484109 0.0525450 0.0653849 0.0708467 0.0717258 0.0784926 0.0893745 0.0904354 0.0953996 0.1015248 0.1028088 0.1080190 0.1148939 0.1156644 0.1281367 0.1365491 0.1393539 0.1423829 0.1538111 0.1548592 0.1632063 0.1750817 0.2085865 0.2367432 0.2383953 0.2621668 0.2682200 0.2735418 0.3036042 0.3140107 0.3655052 0.3695744 0.3984710 0.4116239 0.4208713 0.4354133 0.4433920 0.4838408 0.4901220 0.5386371 0.5448755 0.5517057 0.5581201 0.5839078 0.5908605 0.6250834 0.6377454 0.6766052 0.7151575 0.7446020 0.7884435 0.8498164 0.8581366 0.8681171 0.9012789 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034336 0.0034339 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.6541362 0.8156661 1.0344483 1.1902138 1.3807835 1.6160445 1.6658800 2.2168097 2.4153377 3.0988285 3.1193622 3.5183328 3.6092455 3.9985065 4.8019346 5.4361968 5.9962151 6.5500880 6.7475308 7.2435154 7.4745923 8.3885076 8.6847435 9.0199584 9.0752091 10.4902345 10.7565009 11.2530779 11.7881081 12.5660771 12.8729773 13.1465711 14.2974563 15.9079318 16.7126805 16.9791483 17.7761773 18.2249985 18.3157070 18.4916845 20.8796142 21.6379732 22.0716976 22.9936994 23.4608378 23.8927958 24.8920781 27.7673195 28.9038149 29.0825735 30.4235290 32.4640063 32.6561175 33.5404162 34.6004171 34.8185352 35.6899011 36.8081253 36.9313424 38.8715631 40.1272761 40.5373023 40.9754942 42.5881868 42.7330423 43.8696010 45.4376229 49.5950519 52.8364995 53.0205367 55.6011969 56.2394206 56.7946156 59.8341584 60.8509719 65.6511116 66.0155444 68.5478176 69.6699620 70.4482070 71.6549392 72.3084722 75.5346998 76.0234182 79.6972623 80.1574521 80.6582891 81.1258230 82.9788511 83.4714108 85.8547365 86.7199359 89.3229282 91.8324430 93.7038380 96.4229857 100.1054760 100.5943264 101.1776160 103.0919828 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7317 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6287E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6420E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0746E-05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2013E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6168E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2147E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3534E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1674E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9473E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.1434E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2517E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0497E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1047E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3558E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9554E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5061E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0490E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6383E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8610E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4495E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7379E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9673E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3962E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8995E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9843E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3321E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8119E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0739E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1784E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3391E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4053E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4657E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7335E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1460E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3687E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4448E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6797E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8167E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8448E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8998E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6970E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.9705E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1312E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4836E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6676E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8411E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2545E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5385E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0847E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1726E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8493E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9375E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.0435E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5400E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1028 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1080 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1157 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1424 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1549 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2086 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2367 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2622 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3140 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4116 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5386 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5449 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5839 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6377 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8681 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9013 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00006 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99999 1.00005 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00006 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 131706 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00004 1.00002 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00003 1.00002 1.00003 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00006 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99999 1.00005 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00003 1.00006 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606051608322953402.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606051608322953402.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2606051608322953402.atom Openam> file on opening on unit 11: 2606051608322953402.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 951 First residue number = 1 Last residue number = 951 Number of atoms found = 7317 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6287E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6420E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0746E-05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2013E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6168E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2147E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3534E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1674E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9473E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.1434E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2517E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0497E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1047E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3558E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9554E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5061E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0490E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6383E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8610E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4495E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7379E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9673E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3962E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8995E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9843E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8119E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0739E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1784E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3391E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4053E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4657E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7335E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1460E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3687E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4448E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6797E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8167E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8448E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8998E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6970E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.9705E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1312E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4836E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6676E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8411E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2545E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5385E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0847E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.1726E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8493E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9375E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.0435E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5400E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1028 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1080 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1157 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1424 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1549 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1751 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2086 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2367 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2622 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3140 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4116 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5386 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5449 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5839 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6377 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9013 Bfactors> 106 vectors, 21951 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000036 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.325 for 951 C-alpha atoms. Bfactors> = 201.353 +/- 488.76 Bfactors> = 73.327 +/- 23.27 Bfactors> Shiftng-fct= -128.026 Bfactors> Scaling-fct= 0.048 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2606051608322953402.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2606051608322953402.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.6541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 0.8156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.034 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.190 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.381 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.616 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.119 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.474 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.020 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.075 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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vecteur en lecture: 56.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 7317 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 86 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 95 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 100 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051608322953402.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051608322953402.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2606051608322953402 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606051608322953402.eigenfacs 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making animated gifs 11 models are in 2606051608322953402.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051608322953402.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051608322953402.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2606051608322953402 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2606051608322953402.eigenfacs 2606051608322953402.atom making animated gifs 11 models are in 2606051608322953402.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051608322953402.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2606051608322953402.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted 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