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LOGs for ID: 260610034121387737

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260610034121387737.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260610034121387737.atom to be opened. Openam> File opened: 260610034121387737.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9048 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.092399 +/- 17.897488 From: -46.406000 To: 40.595000 = 0.035376 +/- 17.505410 From: -47.431000 To: 40.502000 = 0.379210 +/- 21.070220 From: -43.306000 To: 46.322000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9678 % Filled. Pdbmat> 3565431 non-zero elements. Pdbmat> 390197 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.25 +/- 22.73 Maximum number = 134 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 7.803940E+06 Pdbmat> Larger element = 495.491 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1192 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260610034121387737.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260610034121387737.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260610034121387737.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9048 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1192 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 52 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 147 Blocpdb> 52 atoms in block 5 Block first atom: 197 Blocpdb> 47 atoms in block 6 Block first atom: 249 Blocpdb> 42 atoms in block 7 Block first atom: 296 Blocpdb> 50 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 388 Blocpdb> 48 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 42 atoms in block 11 Block first atom: 474 Blocpdb> 43 atoms in block 12 Block first atom: 516 Blocpdb> 42 atoms in block 13 Block first atom: 559 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 601 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 646 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 693 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 740 Blocpdb> 50 atoms in block 18 Block first atom: 795 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 845 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 884 Blocpdb> 42 atoms in block 21 Block first atom: 929 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 971 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 1009 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1050 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 1096 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 1130 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1172 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1212 Blocpdb> 44 atoms in block 29 Block first atom: 1261 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1305 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1347 Blocpdb> 52 atoms in block 32 Block first atom: 1401 Blocpdb> 50 atoms in block 33 Block first atom: 1453 Blocpdb> 43 atoms in block 34 Block first atom: 1503 Blocpdb> 50 atoms in block 35 Block first atom: 1546 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1596 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1636 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1685 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 1727 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1775 Blocpdb> 43 atoms in block 41 Block first atom: 1819 Blocpdb> 44 atoms in block 42 Block first atom: 1862 Blocpdb> 46 atoms in block 43 Block first atom: 1906 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1952 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1996 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2042 Blocpdb> 41 atoms in block 47 Block first atom: 2090 Blocpdb> 51 atoms in block 48 Block first atom: 2131 Blocpdb> 58 atoms in block 49 Block first atom: 2182 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 2240 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2263 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 2310 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 2357 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2409 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 2459 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2511 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2558 Blocpdb> 50 atoms in block 58 Block first atom: 2600 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2650 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2688 Blocpdb> 42 atoms in block 61 Block first atom: 2736 Blocpdb> 43 atoms in block 62 Block first atom: 2778 Blocpdb> 42 atoms in block 63 Block first atom: 2821 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2863 Blocpdb> 47 atoms in block 65 Block first atom: 2908 Blocpdb> 47 atoms in block 66 Block first atom: 2955 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 3002 Blocpdb> 50 atoms in block 68 Block first atom: 3057 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 3107 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 3146 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 3191 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 3233 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 3271 Blocpdb> 46 atoms in block 74 Block first atom: 3312 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 3358 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3392 Blocpdb> 40 atoms in block 77 Block first atom: 3434 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3474 Blocpdb> 44 atoms in block 79 Block first atom: 3523 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3567 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3609 Blocpdb> 52 atoms in block 82 Block first atom: 3663 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3715 Blocpdb> 43 atoms in block 84 Block first atom: 3765 Blocpdb> 50 atoms in block 85 Block first atom: 3808 Blocpdb> 40 atoms in block 86 Block first atom: 3858 Blocpdb> 49 atoms in block 87 Block first atom: 3898 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 3947 Blocpdb> 48 atoms in block 89 Block first atom: 3989 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4037 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 4081 Blocpdb> 44 atoms in block 92 Block first atom: 4124 Blocpdb> 46 atoms in block 93 Block first atom: 4168 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4214 Blocpdb> 46 atoms in block 95 Block first atom: 4258 Blocpdb> 48 atoms in block 96 Block first atom: 4304 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 4352 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 4393 Blocpdb> 58 atoms in block 99 Block first atom: 4444 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 4502 Blocpdb> 47 atoms in block 101 Block first atom: 4525 Blocpdb> 47 atoms in block 102 Block first atom: 4572 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 4619 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4671 Blocpdb> 52 atoms in block 105 Block first atom: 4721 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 4773 Blocpdb> 42 atoms in block 107 Block first atom: 4820 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 4862 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4912 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 4950 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 4998 Blocpdb> 43 atoms in block 112 Block first atom: 5040 Blocpdb> 42 atoms in block 113 Block first atom: 5083 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 5125 Blocpdb> 47 atoms in block 115 Block first atom: 5170 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 5217 Blocpdb> 55 atoms in block 117 Block first atom: 5264 Blocpdb> 50 atoms in block 118 Block first atom: 5319 Blocpdb> 39 atoms in block 119 Block first atom: 5369 Blocpdb> 45 atoms in block 120 Block first atom: 5408 Blocpdb> 42 atoms in block 121 Block first atom: 5453 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 5495 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 5533 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 5574 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 5620 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 5654 Blocpdb> 40 atoms in block 127 Block first atom: 5696 Blocpdb> 49 atoms in block 128 Block first atom: 5736 Blocpdb> 44 atoms in block 129 Block first atom: 5785 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5829 Blocpdb> 54 atoms in block 131 Block first atom: 5871 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 5925 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 5977 Blocpdb> 43 atoms in block 134 Block first atom: 6027 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 6070 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 6120 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6160 Blocpdb> 42 atoms in block 138 Block first atom: 6209 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6251 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 6299 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6343 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6386 Blocpdb> 46 atoms in block 143 Block first atom: 6430 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6476 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 6520 Blocpdb> 48 atoms in block 146 Block first atom: 6566 Blocpdb> 41 atoms in block 147 Block first atom: 6614 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 6655 Blocpdb> 58 atoms in block 149 Block first atom: 6706 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 6764 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 6787 Blocpdb> 47 atoms in block 152 Block first atom: 6834 Blocpdb> 52 atoms in block 153 Block first atom: 6881 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 6933 Blocpdb> 52 atoms in block 155 Block first atom: 6983 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7035 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 7082 Blocpdb> 50 atoms in block 158 Block first atom: 7124 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 7174 Blocpdb> 48 atoms in block 160 Block first atom: 7212 Blocpdb> 42 atoms in block 161 Block first atom: 7260 Blocpdb> 43 atoms in block 162 Block first atom: 7302 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 7345 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7387 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7432 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 7479 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 7526 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7581 Blocpdb> 39 atoms in block 169 Block first atom: 7631 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 7670 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7715 Blocpdb> 38 atoms in block 172 Block first atom: 7757 Blocpdb> 41 atoms in block 173 Block first atom: 7795 Blocpdb> 46 atoms in block 174 Block first atom: 7836 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 7882 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 7916 Blocpdb> 40 atoms in block 177 Block first atom: 7958 Blocpdb> 49 atoms in block 178 Block first atom: 7998 Blocpdb> 44 atoms in block 179 Block first atom: 8047 Blocpdb> 42 atoms in block 180 Block first atom: 8091 Blocpdb> 54 atoms in block 181 Block first atom: 8133 Blocpdb> 52 atoms in block 182 Block first atom: 8187 Blocpdb> 50 atoms in block 183 Block first atom: 8239 Blocpdb> 43 atoms in block 184 Block first atom: 8289 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 8332 Blocpdb> 40 atoms in block 186 Block first atom: 8382 Blocpdb> 49 atoms in block 187 Block first atom: 8422 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 8471 Blocpdb> 48 atoms in block 189 Block first atom: 8513 Blocpdb> 44 atoms in block 190 Block first atom: 8561 Blocpdb> 43 atoms in block 191 Block first atom: 8605 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 8648 Blocpdb> 46 atoms in block 193 Block first atom: 8692 Blocpdb> 44 atoms in block 194 Block first atom: 8738 Blocpdb> 46 atoms in block 195 Block first atom: 8782 Blocpdb> 48 atoms in block 196 Block first atom: 8828 Blocpdb> 41 atoms in block 197 Block first atom: 8876 Blocpdb> 51 atoms in block 198 Block first atom: 8917 Blocpdb> 58 atoms in block 199 Block first atom: 8968 Blocpdb> 23 atoms in block 200 Block first atom: 9025 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 58 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 23 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3565631 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 27144 Prepmat> Matrix trace = 7803940.0000 Prepmat> Last element read: 27144 27144 131.4631 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18325 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9048 RTB> Total mass = 9048.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9048 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 236991.8189 RTB> 60900 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60900 Diagstd> Projected matrix trace = 236991.8189 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 236991.8189 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7552937 0.8623639 0.9718066 1.3722244 1.4441990 1.6838793 1.9923902 2.8202904 3.2052457 3.5135030 3.9423937 4.1111385 4.3805695 5.5352712 5.9565601 7.7449979 7.9059556 8.0394703 11.3795128 11.7333992 12.1730193 12.7093302 13.0135617 14.3201911 14.4082543 14.4764864 15.7527882 16.2287829 16.4479572 16.8793944 17.1485753 18.2092363 18.7372651 19.3646382 20.0558671 20.4231599 20.4595380 20.6055879 20.8387095 21.0075520 21.5961499 22.2020007 22.2464318 22.4292950 22.6498258 23.6562239 24.0021891 24.7978152 24.8954893 25.4012211 25.5689791 25.7017722 26.4932692 27.1896541 27.5412584 27.9080418 27.9530320 28.1376224 28.5864159 28.6493846 28.8891292 29.1112173 30.1199788 30.1586827 30.5341200 31.0793362 31.5992653 31.7389859 31.9770533 32.8923664 32.9239291 33.0377472 33.4495446 33.9651693 34.5550107 34.9995737 35.2030543 35.3658491 35.5606338 35.6112304 36.1472034 36.9573255 37.1971768 37.3612429 37.9200073 38.1265046 38.2516785 38.4764493 38.9794784 39.4420898 40.0021118 40.4565428 40.6553949 40.9619486 41.1355834 41.5197418 41.7475207 42.2479879 42.6965706 43.1914111 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034330 0.0034333 0.0034335 0.0034338 0.0034349 94.3741832 100.8417959 107.0496366 127.2060729 130.4994871 140.9129031 153.2789384 182.3652963 194.4132858 203.5473451 215.6131658 220.1792237 227.2796589 255.4846040 265.0287833 302.2079828 305.3321002 307.8995109 366.3170344 371.9693917 378.8736798 387.1298078 391.7358951 410.9317401 412.1933324 413.1681764 430.9967525 437.4599064 440.4040097 446.1426167 449.6859337 463.3841197 470.0546804 477.8592243 486.3131369 490.7459782 491.1828468 492.9328769 495.7134360 497.7176059 504.6420633 511.6716278 512.1833561 514.2840936 516.8061981 528.1630212 532.0111160 540.7568003 541.8207258 547.2963822 549.1006713 550.5247077 558.9372530 566.2355363 569.8849265 573.6671247 574.1293397 576.0218784 580.5974633 581.2365676 583.6634610 585.9026510 595.9675468 596.3503301 600.0507515 605.3842916 610.4270540 611.7751094 614.0652209 622.7917343 623.0904704 624.1665535 628.0444543 632.8665941 638.3381436 642.4312486 644.2960261 645.7840657 647.5600188 648.0205370 652.8788977 660.1544391 662.2931601 663.7521454 668.6971718 670.5154297 671.6152186 673.5855688 677.9743946 681.9856539 686.8102057 690.7003312 692.3957158 695.0012479 696.4727205 699.7172846 701.6339977 705.8270452 709.5643329 713.6643070 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9048 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9854E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8624 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9718 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.444 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.514 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.381 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.957 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.906 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.039 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 162864 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00004 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260610034121387737.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260610034121387737.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260610034121387737.atom Openam> file on opening on unit 11: 260610034121387737.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1192 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 9048 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9854E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7553 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8624 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9718 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.444 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.514 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.111 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.381 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.957 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.906 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.039 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19 Bfactors> 106 vectors, 27144 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.755300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.020 +/- 0.01 Bfactors> = 20.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= 19.980 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260610034121387737.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260610034121387737.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6 Chkmod> 106 vectors, 27144 coordinates in file. Chkmod> That is: 9048 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8686 0.0034 0.8981 0.0034 0.8322 0.0034 0.7560 0.0034 0.9870 0.0034 0.9142 94.3705 0.7418 100.8396 0.6645 107.0447 0.7160 127.1902 0.6867 130.4849 0.7317 140.9119 0.7076 153.2573 0.6561 182.3481 0.6883 194.3975 0.7109 203.5530 0.8659 215.5931 0.7172 220.1661 0.6851 227.2811 0.8202 255.4674 0.7407 265.0272 0.7370 302.1951 0.5738 305.3199 0.6927 307.8773 0.6027 366.3092 0.4555 371.8995 0.3180 378.8104 0.2759 387.1234 0.3235 391.6655 0.5398 410.9114 0.3891 412.2006 0.3882 413.2006 0.3605 430.9401 0.4616 437.4575 0.4621 440.4125 0.5299 446.1315 0.5066 449.6853 0.4909 463.3739 0.5280 470.0688 0.3404 477.7815 0.3570 486.3424 0.1929 490.6869 0.2749 491.1673 0.1796 492.9645 0.1601 495.7075 0.0691 497.7252 0.0721 504.6654 0.1190 511.6266 0.2780 512.2024 0.2764 514.2701 0.3742 516.7860 0.2000 528.1825 0.3699 531.9640 0.4537 540.7574 0.4915 541.8465 0.5568 547.2597 0.6067 549.0881 0.2975 550.4821 0.6735 558.8788 0.5917 566.2148 0.4533 569.8474 0.6499 573.6626 0.2817 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260610034121387737.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260610034121387737.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260610034121387737 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260610034121387737 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260610034121387737.eigenfacs 260610034121387737.atom 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