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***  Shlomo2  ***

LOGs for ID: 260611120353707780

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260611120353707780.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260611120353707780.atom to be opened. Openam> File opened: 260611120353707780.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1980 First residue number = 0 Last residue number = 494 Number of atoms found = 16028 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 150.891014 +/- 12.948011 From: 110.850000 To: 187.413000 = 147.666596 +/- 20.882115 From: 98.624000 To: 199.232000 = 202.468248 +/- 47.952183 From: 99.455000 To: 304.011000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.6324 % Filled. Pdbmat> 6270178 non-zero elements. Pdbmat> 686120 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.62 +/- 25.45 Maximum number = 220 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 1.372240E+07 Pdbmat> Larger element = 822.128 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1980 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260611120353707780.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260611120353707780.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260611120353707780.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 16028 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1980 residues. Blocpdb> 70 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 85 atoms in block 2 Block first atom: 71 Blocpdb> 95 atoms in block 3 Block first atom: 156 Blocpdb> 85 atoms in block 4 Block first atom: 251 Blocpdb> 73 atoms in block 5 Block first atom: 336 Blocpdb> 74 atoms in block 6 Block first atom: 409 Blocpdb> 81 atoms in block 7 Block first atom: 483 Blocpdb> 73 atoms in block 8 Block first atom: 564 Blocpdb> 76 atoms in block 9 Block first atom: 637 Blocpdb> 85 atoms in block 10 Block first atom: 713 Blocpdb> 87 atoms in block 11 Block first atom: 798 Blocpdb> 78 atoms in block 12 Block first atom: 885 Blocpdb> 80 atoms in block 13 Block first atom: 963 Blocpdb> 77 atoms in block 14 Block first atom: 1043 Blocpdb> 74 atoms in block 15 Block first atom: 1120 Blocpdb> 84 atoms in block 16 Block first atom: 1194 Blocpdb> 81 atoms in block 17 Block first atom: 1278 Blocpdb> 64 atoms in block 18 Block first atom: 1359 Blocpdb> 79 atoms in block 19 Block first atom: 1423 Blocpdb> 79 atoms in block 20 Block first atom: 1502 Blocpdb> 92 atoms in block 21 Block first atom: 1581 Blocpdb> 87 atoms in block 22 Block first atom: 1673 Blocpdb> 87 atoms in block 23 Block first atom: 1760 Blocpdb> 79 atoms in block 24 Block first atom: 1847 Blocpdb> 78 atoms in block 25 Block first atom: 1926 Blocpdb> 94 atoms in block 26 Block first atom: 2004 Blocpdb> 85 atoms in block 27 Block first atom: 2098 Blocpdb> 70 atoms in block 28 Block first atom: 2183 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 2253 Blocpdb> 82 atoms in block 30 Block first atom: 2330 Blocpdb> 88 atoms in block 31 Block first atom: 2412 Blocpdb> 86 atoms in block 32 Block first atom: 2500 Blocpdb> 84 atoms in block 33 Block first atom: 2586 Blocpdb> 91 atoms in block 34 Block first atom: 2670 Blocpdb> 71 atoms in block 35 Block first atom: 2761 Blocpdb> 74 atoms in block 36 Block first atom: 2832 Blocpdb> 75 atoms in block 37 Block first atom: 2906 Blocpdb> 80 atoms in block 38 Block first atom: 2981 Blocpdb> 90 atoms in block 39 Block first atom: 3061 Blocpdb> 88 atoms in block 40 Block first atom: 3151 Blocpdb> 76 atoms in block 41 Block first atom: 3239 Blocpdb> 83 atoms in block 42 Block first atom: 3315 Blocpdb> 86 atoms in block 43 Block first atom: 3398 Blocpdb> 83 atoms in block 44 Block first atom: 3484 Blocpdb> 74 atoms in block 45 Block first atom: 3567 Blocpdb> 75 atoms in block 46 Block first atom: 3641 Blocpdb> 88 atoms in block 47 Block first atom: 3716 Blocpdb> 84 atoms in block 48 Block first atom: 3804 Blocpdb> 76 atoms in block 49 Block first atom: 3888 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 3964 Blocpdb> 70 atoms in block 51 Block first atom: 4008 Blocpdb> 85 atoms in block 52 Block first atom: 4078 Blocpdb> 95 atoms in block 53 Block first atom: 4163 Blocpdb> 85 atoms in block 54 Block first atom: 4258 Blocpdb> 73 atoms in block 55 Block first atom: 4343 Blocpdb> 74 atoms in block 56 Block first atom: 4416 Blocpdb> 81 atoms in block 57 Block first atom: 4490 Blocpdb> 73 atoms in block 58 Block first atom: 4571 Blocpdb> 76 atoms in block 59 Block first atom: 4644 Blocpdb> 85 atoms in block 60 Block first atom: 4720 Blocpdb> 87 atoms in block 61 Block first atom: 4805 Blocpdb> 78 atoms in block 62 Block first atom: 4892 Blocpdb> 80 atoms in block 63 Block first atom: 4970 Blocpdb> 77 atoms in block 64 Block first atom: 5050 Blocpdb> 74 atoms in block 65 Block first atom: 5127 Blocpdb> 84 atoms in block 66 Block first atom: 5201 Blocpdb> 81 atoms in block 67 Block first atom: 5285 Blocpdb> 64 atoms in block 68 Block first atom: 5366 Blocpdb> 79 atoms in block 69 Block first atom: 5430 Blocpdb> 79 atoms in block 70 Block first atom: 5509 Blocpdb> 92 atoms in block 71 Block first atom: 5588 Blocpdb> 87 atoms in block 72 Block first atom: 5680 Blocpdb> 87 atoms in block 73 Block first atom: 5767 Blocpdb> 79 atoms in block 74 Block first atom: 5854 Blocpdb> 78 atoms in block 75 Block first atom: 5933 Blocpdb> 94 atoms in block 76 Block first atom: 6011 Blocpdb> 85 atoms in block 77 Block first atom: 6105 Blocpdb> 70 atoms in block 78 Block first atom: 6190 Blocpdb> 77 atoms in block 79 Block first atom: 6260 Blocpdb> 82 atoms in block 80 Block first atom: 6337 Blocpdb> 88 atoms in block 81 Block first atom: 6419 Blocpdb> 86 atoms in block 82 Block first atom: 6507 Blocpdb> 84 atoms in block 83 Block first atom: 6593 Blocpdb> 91 atoms in block 84 Block first atom: 6677 Blocpdb> 71 atoms in block 85 Block first atom: 6768 Blocpdb> 74 atoms in block 86 Block first atom: 6839 Blocpdb> 75 atoms in block 87 Block first atom: 6913 Blocpdb> 80 atoms in block 88 Block first atom: 6988 Blocpdb> 90 atoms in block 89 Block first atom: 7068 Blocpdb> 88 atoms in block 90 Block first atom: 7158 Blocpdb> 76 atoms in block 91 Block first atom: 7246 Blocpdb> 83 atoms in block 92 Block first atom: 7322 Blocpdb> 86 atoms in block 93 Block first atom: 7405 Blocpdb> 83 atoms in block 94 Block first atom: 7491 Blocpdb> 74 atoms in block 95 Block first atom: 7574 Blocpdb> 75 atoms in block 96 Block first atom: 7648 Blocpdb> 88 atoms in block 97 Block first atom: 7723 Blocpdb> 84 atoms in block 98 Block first atom: 7811 Blocpdb> 76 atoms in block 99 Block first atom: 7895 Blocpdb> 44 atoms in block 100 Block first atom: 7971 Blocpdb> 70 atoms in block 101 Block first atom: 8015 Blocpdb> 85 atoms in block 102 Block first atom: 8085 Blocpdb> 95 atoms in block 103 Block first atom: 8170 Blocpdb> 85 atoms in block 104 Block first atom: 8265 Blocpdb> 73 atoms in block 105 Block first atom: 8350 Blocpdb> 74 atoms in block 106 Block first atom: 8423 Blocpdb> 81 atoms in block 107 Block first atom: 8497 Blocpdb> 73 atoms in block 108 Block first atom: 8578 Blocpdb> 76 atoms in block 109 Block first atom: 8651 Blocpdb> 85 atoms in block 110 Block first atom: 8727 Blocpdb> 87 atoms in block 111 Block first atom: 8812 Blocpdb> 78 atoms in block 112 Block first atom: 8899 Blocpdb> 80 atoms in block 113 Block first atom: 8977 Blocpdb> 77 atoms in block 114 Block first atom: 9057 Blocpdb> 74 atoms in block 115 Block first atom: 9134 Blocpdb> 84 atoms in block 116 Block first atom: 9208 Blocpdb> 81 atoms in block 117 Block first atom: 9292 Blocpdb> 64 atoms in block 118 Block first atom: 9373 Blocpdb> 79 atoms in block 119 Block first atom: 9437 Blocpdb> 79 atoms in block 120 Block first atom: 9516 Blocpdb> 92 atoms in block 121 Block first atom: 9595 Blocpdb> 87 atoms in block 122 Block first atom: 9687 Blocpdb> 87 atoms in block 123 Block first atom: 9774 Blocpdb> 79 atoms in block 124 Block first atom: 9861 Blocpdb> 78 atoms in block 125 Block first atom: 9940 Blocpdb> 94 atoms in block 126 Block first atom: 10018 Blocpdb> 85 atoms in block 127 Block first atom: 10112 Blocpdb> 70 atoms in block 128 Block first atom: 10197 Blocpdb> 77 atoms in block 129 Block first atom: 10267 Blocpdb> 82 atoms in block 130 Block first atom: 10344 Blocpdb> 88 atoms in block 131 Block first atom: 10426 Blocpdb> 86 atoms in block 132 Block first atom: 10514 Blocpdb> 84 atoms in block 133 Block first atom: 10600 Blocpdb> 91 atoms in block 134 Block first atom: 10684 Blocpdb> 71 atoms in block 135 Block first atom: 10775 Blocpdb> 74 atoms in block 136 Block first atom: 10846 Blocpdb> 75 atoms in block 137 Block first atom: 10920 Blocpdb> 80 atoms in block 138 Block first atom: 10995 Blocpdb> 90 atoms in block 139 Block first atom: 11075 Blocpdb> 88 atoms in block 140 Block first atom: 11165 Blocpdb> 76 atoms in block 141 Block first atom: 11253 Blocpdb> 83 atoms in block 142 Block first atom: 11329 Blocpdb> 86 atoms in block 143 Block first atom: 11412 Blocpdb> 83 atoms in block 144 Block first atom: 11498 Blocpdb> 74 atoms in block 145 Block first atom: 11581 Blocpdb> 75 atoms in block 146 Block first atom: 11655 Blocpdb> 88 atoms in block 147 Block first atom: 11730 Blocpdb> 84 atoms in block 148 Block first atom: 11818 Blocpdb> 76 atoms in block 149 Block first atom: 11902 Blocpdb> 44 atoms in block 150 Block first atom: 11978 Blocpdb> 70 atoms in block 151 Block first atom: 12022 Blocpdb> 85 atoms in block 152 Block first atom: 12092 Blocpdb> 95 atoms in block 153 Block first atom: 12177 Blocpdb> 85 atoms in block 154 Block first atom: 12272 Blocpdb> 73 atoms in block 155 Block first atom: 12357 Blocpdb> 74 atoms in block 156 Block first atom: 12430 Blocpdb> 81 atoms in block 157 Block first atom: 12504 Blocpdb> 73 atoms in block 158 Block first atom: 12585 Blocpdb> 76 atoms in block 159 Block first atom: 12658 Blocpdb> 85 atoms in block 160 Block first atom: 12734 Blocpdb> 87 atoms in block 161 Block first atom: 12819 Blocpdb> 78 atoms in block 162 Block first atom: 12906 Blocpdb> 80 atoms in block 163 Block first atom: 12984 Blocpdb> 77 atoms in block 164 Block first atom: 13064 Blocpdb> 74 atoms in block 165 Block first atom: 13141 Blocpdb> 84 atoms in block 166 Block first atom: 13215 Blocpdb> 81 atoms in block 167 Block first atom: 13299 Blocpdb> 64 atoms in block 168 Block first atom: 13380 Blocpdb> 79 atoms in block 169 Block first atom: 13444 Blocpdb> 79 atoms in block 170 Block first atom: 13523 Blocpdb> 92 atoms in block 171 Block first atom: 13602 Blocpdb> 87 atoms in block 172 Block first atom: 13694 Blocpdb> 87 atoms in block 173 Block first atom: 13781 Blocpdb> 79 atoms in block 174 Block first atom: 13868 Blocpdb> 78 atoms in block 175 Block first atom: 13947 Blocpdb> 94 atoms in block 176 Block first atom: 14025 Blocpdb> 85 atoms in block 177 Block first atom: 14119 Blocpdb> 70 atoms in block 178 Block first atom: 14204 Blocpdb> 77 atoms in block 179 Block first atom: 14274 Blocpdb> 82 atoms in block 180 Block first atom: 14351 Blocpdb> 88 atoms in block 181 Block first atom: 14433 Blocpdb> 86 atoms in block 182 Block first atom: 14521 Blocpdb> 84 atoms in block 183 Block first atom: 14607 Blocpdb> 91 atoms in block 184 Block first atom: 14691 Blocpdb> 71 atoms in block 185 Block first atom: 14782 Blocpdb> 74 atoms in block 186 Block first atom: 14853 Blocpdb> 75 atoms in block 187 Block first atom: 14927 Blocpdb> 80 atoms in block 188 Block first atom: 15002 Blocpdb> 90 atoms in block 189 Block first atom: 15082 Blocpdb> 88 atoms in block 190 Block first atom: 15172 Blocpdb> 76 atoms in block 191 Block first atom: 15260 Blocpdb> 83 atoms in block 192 Block first atom: 15336 Blocpdb> 86 atoms in block 193 Block first atom: 15419 Blocpdb> 83 atoms in block 194 Block first atom: 15505 Blocpdb> 74 atoms in block 195 Block first atom: 15588 Blocpdb> 75 atoms in block 196 Block first atom: 15662 Blocpdb> 88 atoms in block 197 Block first atom: 15737 Blocpdb> 84 atoms in block 198 Block first atom: 15825 Blocpdb> 76 atoms in block 199 Block first atom: 15909 Blocpdb> 44 atoms in block 200 Block first atom: 15984 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 95 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 44 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6270378 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 48084 Prepmat> Matrix trace = 13722400.0000 Prepmat> Last element read: 48084 48084 180.1680 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18443 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 16028 RTB> Total mass = 16028.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 16028 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 208317.3492 RTB> 56652 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56652 Diagstd> Projected matrix trace = 208317.3492 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 208317.3492 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0773262 0.1035798 0.1491704 0.3145672 0.4727269 1.0497029 1.2420978 1.4353945 1.6354778 1.7883887 2.0483160 2.3240613 2.5771031 2.7445824 2.9041562 3.1645669 3.5460113 3.9524871 4.0638337 4.5923641 4.6962840 4.9916419 5.2878743 5.4030787 6.2896035 6.4435307 6.8262355 6.9951863 7.1717368 7.4539037 7.7467854 7.9973145 8.3004407 8.4723864 8.7073720 9.1341485 10.1583394 10.9052879 11.2982721 11.6690368 12.1749079 12.5000963 12.7430049 13.4091376 13.8929737 14.3269502 14.3717952 14.5465782 15.8886902 16.1603834 16.3515656 17.2139897 17.3766538 17.5562245 18.1094004 18.2237574 18.4995522 18.7274340 18.7991436 19.0551919 19.3672250 19.4682651 19.9640933 20.1153155 20.3390412 20.4967053 20.9357575 21.1828878 21.6261255 22.2012114 22.6917908 23.0298940 23.1012750 23.5210348 23.6995717 24.2130095 24.4388015 24.6779604 25.1089423 25.2735367 25.8887710 26.4943000 26.6251208 27.1156633 27.4591474 27.6573451 28.1222010 28.3240474 29.3744373 29.5617587 29.6853778 29.8471706 30.3500968 30.9857625 31.1118918 31.6593393 31.7864855 32.4197469 32.5651535 32.9192238 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034323 0.0034329 0.0034335 0.0034342 0.0034350 30.1966369 34.9488420 41.9407844 60.9048622 74.6621389 111.2572899 121.0244654 130.1010872 138.8729339 145.2199340 155.4152939 165.5461447 174.3256045 179.9009336 185.0568915 193.1756675 204.4868266 215.8889993 218.9088130 232.7091387 235.3273786 242.6146327 249.7099469 252.4154460 272.3371666 275.6495147 283.7173619 287.2069354 290.8087379 296.4743790 302.2428549 307.0911970 312.8569846 316.0808295 320.4341765 328.1930001 346.1040166 358.6029419 365.0070859 370.9477879 378.9030680 383.9299211 387.6423389 397.6451627 404.7556195 411.0287075 411.6714883 414.1672006 432.8519000 436.5370512 439.1116412 450.5427952 452.6664997 454.9994201 462.1120740 463.5688474 467.0634563 469.9313488 470.8302015 474.0257602 477.8911409 479.1361140 485.1991998 487.0333538 489.7342957 491.6287909 496.8663889 499.7903466 504.9921645 511.6625330 517.2847388 521.1242099 521.9311959 526.6517023 528.6467045 534.3424368 536.8280897 539.4484026 544.1385428 545.9191013 552.5238094 558.9481270 560.3263855 565.4645676 569.0347703 571.0846997 575.8640066 577.9269361 588.5455197 590.4191213 591.6523182 593.2624548 598.2398249 604.4722579 605.7012786 611.0070257 612.2327207 618.3012017 619.6862293 623.0459448 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 16028 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9891E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7326E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3146 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.242 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.635 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.324 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.904 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.165 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.064 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.592 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.696 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.290 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.444 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.826 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.172 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.454 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.300 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.472 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.92 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 288504 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260611120353707780.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260611120353707780.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260611120353707780.atom Openam> file on opening on unit 11: 260611120353707780.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1980 First residue number = 0 Last residue number = 494 Number of atoms found = 16028 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9891E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7326E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3146 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.242 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.635 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.324 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.904 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.165 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.064 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.592 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.290 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.444 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.826 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.172 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.454 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.300 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.472 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.92 Bfactors> 106 vectors, 48084 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.077326 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.049 for 1980 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.045 +/- 0.03 Bfactors> = 95.722 +/- 12.87 Bfactors> Shiftng-fct= 95.677 Bfactors> Scaling-fct= 436.904 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260611120353707780.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260611120353707780.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 16028 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260611120353707780.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260611120353707780.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260611120353707780 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260611120353707780 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260611120353707780.eigenfacs 260611120353707780.atom 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