*** LAO_closed_cutoff10 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260611153325771059.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260611153325771059.atom to be opened.
Openam> File opened: 260611153325771059.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 31.502311 +/- 7.602442 From: 11.318000 To: 46.496000
= 58.933408 +/- 9.298722 From: 38.331000 To: 78.699000
= 27.498933 +/- 12.999350 From: 3.320000 To: 53.896000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.0484 % Filled.
Pdbmat> 20544 non-zero elements.
Pdbmat> 2124 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.85 +/- 5.25
Maximum number = 31
Minimum number = 5
Pdbmat> Matrix trace = 42480.0
Pdbmat> Larger element = 121.358
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 238 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 714
Diagstd> Number of non-zero elements 20544
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 42480.0000007
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 714
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 714 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 42480.0000007
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4423364 0.7545331 0.8277368 1.0420996
1.0891435 1.3698109 2.0282255 2.0877065 2.1671758
2.5924236 2.6923564 3.0594916 3.3078462 3.3759652
3.4819793 3.8650890 4.0030609 4.2850214 4.4760936
4.5896736 4.9550308 4.9894792 5.2495493 5.5941592
5.7036039 5.8833962 6.0620174 6.1119468 6.3821444
6.5179238 6.7057143 7.1225579 7.2344000 7.3931258
7.8254257 7.9201877 8.1447393 8.2607877 8.3558964
8.6629495 8.9008570 9.0521603 9.2441291 9.2603297
9.5784670 9.8438574 10.0771764 10.2428996 10.4902513
10.5603408 10.8140247 11.1536532 11.2703624 11.2982394
12.0882357 12.2152048 12.4489907 12.5530371 12.6146551
12.9375744 13.0148106 13.1266245 13.2358312 13.3672759
13.6178962 13.8549705 14.0274497 14.2656225 14.4579760
14.7739732 14.9563957 15.0520104 15.1637906 15.2213212
15.3380818 15.4437946 15.6179940 15.7793706 15.9156142
16.1226643 16.4654493 16.5200336 16.5656466 16.8551384
16.8986221 17.1428734 17.4498282 17.4612401 17.5653865
17.8490533 18.1004377 18.2834565 18.4093078 18.5619963
18.6611485 19.1059426 19.2708349 19.5345027 19.7164965
20.0279890 20.1091540 20.3828825 20.4977131 20.7155840
20.8183454 21.0113220 21.2025987 21.4473975 21.5334066
21.7000329 21.9157910 22.0645376 22.1675390 22.2995592
22.3979122 22.7897799 22.9342037 23.1000875 23.2494082
23.3816383 23.4722906 23.7540334 23.7925572 23.9177832
24.1497850 24.3092834 24.4722127 24.4986413 24.7401473
24.7678351 25.0706416 25.1908540 25.6569067 25.7916246
25.8795996 25.9819349 26.2812394 26.3766447 26.5721255
26.7687088 26.9313331 27.0074085 27.2179218 27.3187533
27.5986454 27.6816215 27.9464239 28.0913814 28.2625068
28.4369029 28.5109718 28.6990392 28.8193232 28.9400274
29.0406512 29.2287592 29.3260308 29.3586496 29.5446842
29.5720313 29.7700109 30.0364889 30.1110009 30.1778693
30.3255370 30.5101719 30.6375498 30.7658058 31.0314906
31.0521032 31.1205922 31.2650452 31.4049885 31.6335263
31.7126427 31.7502573 31.8996822 32.0569681 32.2932765
32.4035292 32.4917299 32.6979327 32.7314393 32.9829615
33.2856693 33.3402480 33.5622266 33.5740955 33.7614188
33.9112284 34.0504627 34.1857068 34.2548885 34.3633952
34.5119194 34.6369351 34.7532975 34.8428727 34.9397536
35.0724935 35.3167580 35.3961062 35.5616866 35.6509693
35.7591514 35.7680809 35.9261108 36.0944276 36.1455364
36.3156012 36.3419069 36.4825369 36.6866994 36.8226702
37.0011906 37.2511701 37.2863685 37.3858978 37.6697910
37.7742094 37.8021080 37.9330800 38.0899909 38.1364694
38.3168004 38.4065893 38.6344214 38.7501901 39.0948995
39.1920711 39.4269009 39.5141739 39.5756714 39.6501707
39.8157286 40.0820524 40.1230162 40.1772629 40.3499388
40.5954481 40.6711329 40.9192721 41.1704670 41.2016854
41.2745209 41.4600494 41.6697418 41.8169559 41.9216239
42.1116567 42.1845457 42.2998672 42.3741877 42.4975155
42.5289873 42.7182960 42.8211448 42.9078060 42.9500317
43.1472967 43.2818131 43.5178068 43.6388271 43.6949655
43.7404905 43.9215652 43.9990270 44.0159560 44.1540038
44.2608943 44.3715164 44.5250720 44.7120280 44.8298131
44.9522678 45.0926612 45.1854933 45.2837290 45.3331564
45.3726290 45.6560735 45.6734048 45.8153251 45.9007992
46.1226293 46.2415615 46.3979240 46.4195515 46.5883625
46.6736457 46.8442422 46.9253597 47.0841437 47.2311125
47.3881713 47.6394119 47.8504445 47.8956102 48.0390839
48.0814984 48.2330187 48.2720429 48.4989134 48.5518505
48.6640734 48.9418689 48.9533178 49.0557676 49.1961704
49.4017059 49.5662347 49.6491062 49.7511194 49.7765215
49.9602639 50.0794110 50.2375987 50.4283214 50.5686556
50.7960249 50.9118656 51.0149473 51.1403020 51.4043198
51.5914864 51.7373938 51.8543949 51.8957082 52.1042109
52.2728151 52.2895172 52.4289786 52.5050614 52.6423123
52.8953166 52.9846363 53.0720872 53.1940042 53.3908344
53.5054596 53.5574176 53.6424559 53.8228964 53.9393701
53.9725689 54.1076796 54.4162842 54.5160457 54.6334028
54.7763604 54.8755587 54.9789867 55.1093011 55.2305597
55.3216988 55.4913650 55.5664034 55.7320628 55.8885598
56.0441006 56.1660563 56.3256268 56.3727673 56.5795493
56.6053099 56.7977837 56.9809409 57.1484036 57.2544734
57.4364901 57.6307422 57.6485580 57.8177245 57.8499730
58.1877548 58.2252352 58.4413042 58.6394285 58.6452949
58.8833358 58.9523735 59.0589402 59.2352741 59.4606375
59.4897511 59.8071082 59.8621721 60.0345936 60.0886413
60.1831861 60.3775968 60.6940285 60.7566973 60.8478609
61.0162492 61.1570422 61.2451089 61.4703847 61.6267232
61.6677070 61.7668916 62.0131133 62.2584871 62.3020491
62.4591762 62.5404739 62.8156675 62.9443723 63.0910818
63.2095785 63.4929328 63.6131935 63.7616337 63.8592626
64.1283361 64.3412029 64.4567100 64.4757015 64.8437004
65.0527177 65.2280214 65.3019570 65.4294180 65.5171282
65.6751390 65.7458441 65.9162606 66.2009410 66.3619697
66.5528977 66.7163942 67.0044008 67.0972508 67.1230532
67.1606182 67.3736198 67.5652625 67.7802657 67.7879564
67.9967205 68.2891032 68.3342828 68.4923588 68.6383883
68.8372791 68.9411875 69.0751395 69.3274559 69.4451278
69.5536068 69.6638647 69.9193981 69.9954089 70.2426259
70.6114259 70.8121050 70.8885815 71.0669641 71.1127668
71.3966447 71.4952432 71.7041475 71.8249066 71.9448209
72.1731550 72.3378198 72.5771973 72.8124853 72.8893600
73.2179781 73.2631889 73.5546894 73.7457481 73.8515814
74.0279546 74.2812391 74.3518428 74.5202216 74.6208173
74.8022879 75.0283270 75.3113802 75.4509509 75.8190439
75.9589290 76.0479162 76.2997002 76.3328763 76.5922368
76.7157622 77.0102903 77.0809704 77.1015763 77.2326960
77.4169933 77.7363811 77.7776555 78.0448933 78.0861017
78.3088747 78.5388608 78.7627384 78.9548370 79.0318653
79.3529719 79.4622848 79.6562812 80.0808435 80.2591985
80.3438505 80.4560235 80.6612149 80.7936685 81.1593584
81.2262158 81.6047437 81.8836834 82.0135107 82.1896603
82.3621177 82.5106282 82.7436169 82.9219842 83.0986381
83.5015303 83.6060879 83.9397377 84.2860996 84.3819594
84.4824620 84.7032748 84.8598489 85.0664479 85.1942586
85.5534052 85.6454750 85.9669888 86.0111495 86.2563653
86.7047833 86.8689721 87.2964482 87.4210747 87.7068595
87.7342038 88.1248885 88.2055734 88.4346529 88.7305967
89.0140720 89.1547878 89.4859705 89.6555933 89.9998976
90.3305618 90.4869776 90.5794460 90.8330456 91.0506017
91.2773618 91.5569234 91.6879722 91.9198443 92.0376748
92.3902757 92.5057553 92.6755150 92.7245679 92.9064832
93.0511783 93.3871533 93.5968276 93.9515350 94.0363847
94.1977672 94.4002145 94.8002707 94.8854203 95.3771495
95.4496874 95.5593011 95.7993879 95.9978035 96.3075542
96.6330766 96.7272849 96.9018282 97.0467713 97.2361759
97.3777688 97.9819119 98.2166105 98.3681259 98.5048327
98.8407276 99.3544522 99.5031329 99.5595771 99.6966058
99.9366984 100.3145739 100.3957320 100.5069975 100.5974860
101.1124961 101.3585310 101.7567663 101.8644003 102.0951528
102.1717792 102.4705441 102.9241539 103.0866046 103.3078681
103.6595448 104.0415339 104.0904153 104.4110912 104.6066445
105.1484887 105.5434024 105.7293114 105.9575011 106.4390911
106.8165072 107.0836575 107.3654306 107.4074988 107.8898450
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1032.0782740 1032.9714577 1033.4991182 1034.9448751 1036.1835431
1037.4730400 1039.0605963 1039.8039529 1041.1179164 1041.7849983
1043.7786558 1044.4307673 1045.3886591 1045.6652829 1046.6905199
1047.5052753 1049.3946575 1050.5720555 1052.5608693 1053.0360573
1053.9392647 1055.0712061 1057.3044717 1057.7792006 1060.5165482
1060.9197532 1061.5287541 1062.8614303 1063.9615375 1065.6766675
1067.4761577 1067.9963760 1068.9595352 1069.7586970 1070.8021031
1071.5814576 1074.9004259 1076.1870242 1077.0168027 1077.7649336
1079.6009228 1082.4028992 1083.2124868 1083.5196748 1084.2650692
1085.5698653 1087.6202795 1088.0601522 1088.6629173 1089.1528798
1091.9372866 1093.2649733 1095.4105741 1095.9897606 1097.2304261
1097.6421062 1099.2457658 1101.6761129 1102.5451874 1103.7277961
1105.6048342 1107.6400573 1107.9002259 1109.6054921 1110.6441052
1113.5168613 1115.6059595 1116.5880668 1117.7923522 1120.3297251
1122.3142230 1123.7168118 1125.1942791 1125.4146957 1127.9388742
1128.3586007 1129.1685683 1131.7340884 1132.8658170 1134.9313520
1138.4485825 1140.5028466 1141.7743769 1143.1614130 1144.8920905
1146.3425317 1147.4079965 1150.7075613 1152.4794919 1155.1636414
1158.5699242 1159.0178298 1161.3924967 1163.4827536 1164.6959145
1168.6540665 1170.2477425 1172.1668904 1174.5039010 1174.5565866
1177.5305609 1180.8348075 1181.6071194 1183.9961853 1187.0989656
1190.4208674 1192.4950273 1194.1831510 1195.7172328 1196.8769073
1198.9075450 1201.7184369 1202.2462737 1206.1895928 1208.5864271
1212.2360619 1213.6061387 1214.8821605 1218.7704702 1219.7808296
1222.5541251 1224.1383823 1226.4174825 1234.8386568 1237.2318520
1240.7496463 1242.2920260 1246.0504142 1253.1656956 1256.3680526
1257.7894542 1261.0017241 1262.0550999 1268.2791959 1272.5905464
1275.7927008 1276.4185936 1279.2513242 1287.3324465 1291.4496800
1298.7204463 1302.6607089 1305.9750756 1314.6934886 1318.5511749
1326.3916313 1327.9612081 1339.1502757 1343.9108776 1349.6457301
1356.1152915 1362.0311730 1374.2798696 1396.8807794
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260611153325771059.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260611153325771059.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260611153325771059.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260611153325771059.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9466E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9859E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0021E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0042E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0068E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8277
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.042
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.089
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.592
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.308
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.482
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.865
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.003
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.476
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.590
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.989
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.250
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.594
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.112
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.706
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.123
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.234
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.145
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.901
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.052
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.244
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.844
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.442300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.533 for 238 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.266 +/- 2.77
Bfactors> = 20.283 +/- 8.39
Bfactors> Shiftng-fct= 19.017
Bfactors> Scaling-fct= 3.026
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260611153325771059.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260611153325771059.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4246E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4374E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4410E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4455E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7032
0.0034 0.7739
0.0034 0.9721
0.0034 0.8131
0.0034 0.8629
0.0034 0.9317
72.2163 0.0059
94.3205 0.0705
98.7900 0.5881
110.8436 0.4907
113.3158 0.5838
127.0975 0.0971
154.6360 0.3026
156.9068 0.3415
159.8476 0.0628
174.8212 0.1038
178.1616 0.5615
189.9181 0.3978
197.4965 0.1027
199.5161 0.6121
202.6241 0.6761
213.4771 0.3275
217.2548 0.5311
224.7771 0.2663
229.7321 0.4832
232.6392 0.3638
241.7121 0.5167
242.5400 0.5567
248.8034 0.0939
256.8253 0.2992
259.3381 0.1764
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267.3527 0.3698
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385.5975 0.5312
390.6104 0.3637
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393.4676 0.4288
395.1124 0.4609
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getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260611153325771059 8 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260611153325771059 9 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260611153325771059 10 -20 20 10 on 0
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generate a series of perturbations for mode 10
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making thumbnail 100x100
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getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260611153325771059 11 -20 20 10 on 0
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generate a series of perturbations for mode 11
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getting mode 15
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getting mode 16
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MODEL 2 will be plotted
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MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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rm: cannot remove '260611153325771059.sdijb': No such file or directory
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