*** open_10 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260611224133873640.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 10.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260611224133873640.atom to be opened.
Openam> File opened: 260611224133873640.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 22.016933 +/- 7.673025 From: 5.783000 To: 44.264000
= 59.291193 +/- 13.799616 From: 33.552000 To: 87.836000
= 45.190895 +/- 7.996367 From: 26.771000 To: 62.409000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijf
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.0465 % Filled.
Pdbmat> 20539 non-zero elements.
Pdbmat> 2124 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 17.85 +/- 5.25
Maximum number = 31
Minimum number = 5
Pdbmat> Matrix trace = 42480.0
Pdbmat> Larger element = 120.078
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
using diagstd (there are 238 atoms in your structure)
Diagstd> Version 1.05, August 2004.
Diagstd> Matrix to be read from file: pdbmat.sdijf
Diagstd> Lecture de la matrice -Format CERFACS-
Diagstd> Matrix dimension (Nord) = 714
Diagstd> Number of non-zero elements 20539
Diagstd> Nb of elements found twice: 0
Diagstd> Nb of elements > 1E+10 : 0
Diagstd> Matrix trace: 42480.0000007
%Diagstd-Wn: Nb on non-zero elements there: 714
Openam> file on opening on unit 11:
pdbmat.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 714 eigenvectors are about to be computed.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 42480.0000007
Diagstd> Eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4422765 0.7545103 0.8277255 1.0420977
1.0891225 1.3698187 2.0282526 2.0876888 2.1668763
2.5925046 2.6923433 3.0594742 3.3075668 3.3758931
3.4819954 3.8649361 4.0030275 4.2849507 4.4759889
4.5894298 4.9549377 4.9893850 5.2495031 5.5940475
5.7033163 5.8833310 6.0619568 6.1114910 6.3819342
6.5177036 6.7055111 7.1223339 7.2346742 7.3930099
7.8253598 7.9201514 8.1448227 8.2607084 8.3559540
8.6630977 8.9006296 9.0521944 9.2439547 9.2600343
9.5783277 9.8434293 10.0769214 10.2425035 10.4898912
10.5602899 10.8138942 11.1535405 11.2700742 11.2979625
12.0880785 12.2148905 12.4489503 12.5531079 12.6145316
12.9374901 13.0153717 13.1268968 13.2359833 13.3671686
13.6178271 13.8551039 14.0277901 14.2656251 14.4579991
14.7739468 14.9561451 15.0520096 15.1639116 15.2214015
15.3380025 15.4438261 15.6183969 15.7793951 15.9155136
16.1223940 16.4655271 16.5203762 16.5653727 16.8554022
16.8990737 17.1427376 17.4502703 17.4618039 17.5650392
17.8487953 18.1002833 18.2836614 18.4089309 18.5621976
18.6613875 19.1061215 19.2709139 19.5347396 19.7161707
20.0282572 20.1093856 20.3829632 20.4976022 20.7152882
20.8182653 21.0108635 21.2028364 21.4475453 21.5337038
21.7000155 21.9158006 22.0644747 22.1670680 22.2996902
22.3975884 22.7898015 22.9338821 23.1001720 23.2491233
23.3811754 23.4723797 23.7541961 23.7922742 23.9180090
24.1497077 24.3088048 24.4718577 24.4986072 24.7399875
24.7678950 25.0705053 25.1906268 25.6570303 25.7917409
25.8797254 25.9820482 26.2807171 26.3758555 26.5718463
26.7678493 26.9314467 27.0068943 27.2183090 27.3187751
27.5985556 27.6818411 27.9458117 28.0913706 28.2631029
28.4369624 28.5109965 28.6982214 28.8190735 28.9395843
29.0402036 29.2278100 29.3256573 29.3585864 29.5446666
29.5714311 29.7695534 30.0366254 30.1105009 30.1773471
30.3254122 30.5098081 30.6374336 30.7661186 31.0312656
31.0516208 31.1203203 31.2645539 31.4045337 31.6342981
31.7127216 31.7499741 31.8993735 32.0569248 32.2931989
32.4034867 32.4918373 32.6983389 32.7319156 32.9829373
33.2856764 33.3400035 33.5622644 33.5741346 33.7612576
33.9109576 34.0501386 34.1857516 34.2550159 34.3629233
34.5117230 34.6371429 34.7532952 34.8429890 34.9396771
35.0718806 35.3159965 35.3951175 35.5615286 35.6507041
35.7590316 35.7682201 35.9260401 36.0938014 36.1458394
36.3154164 36.3412908 36.4823433 36.6866006 36.8221832
37.0002503 37.2504105 37.2862336 37.3861075 37.6695254
37.7727814 37.8016444 37.9329602 38.0897172 38.1366311
38.3164357 38.4055561 38.6332724 38.7501096 39.0951760
39.1916107 39.4270220 39.5134350 39.5754134 39.6497191
39.8157667 40.0827811 40.1234233 40.1767749 40.3497521
40.5956502 40.6714587 40.9198947 41.1704819 41.2012853
41.2740570 41.4599983 41.6695798 41.8166932 41.9209217
42.1117776 42.1844193 42.2998350 42.3742954 42.4972870
42.5289796 42.7185748 42.8209371 42.9080050 42.9499948
43.1477969 43.2815097 43.5177237 43.6386600 43.6948227
43.7402928 43.9210440 43.9988195 44.0157803 44.1546461
44.2605697 44.3714664 44.5248244 44.7118214 44.8295055
44.9519106 45.0919768 45.1851260 45.2836855 45.3332811
45.3724557 45.6557218 45.6733850 45.8149712 45.9009010
46.1224780 46.2417383 46.3976892 46.4193898 46.5887039
46.6738909 46.8447905 46.9252489 47.0837729 47.2307560
47.3878792 47.6385930 47.8503618 47.8963482 48.0395737
48.0812918 48.2331425 48.2714823 48.4988724 48.5523410
48.6642796 48.9419267 48.9528397 49.0549468 49.1959208
49.4017482 49.5659939 49.6486350 49.7512638 49.7759118
49.9603761 50.0791997 50.2376410 50.4284886 50.5684253
50.7959510 50.9118040 51.0147368 51.1399748 51.4040258
51.5909812 51.7372446 51.8542031 51.8950233 52.1043398
52.2721188 52.2891365 52.4290127 52.5042442 52.6415629
52.8944786 52.9843924 53.0717668 53.1940410 53.3900579
53.5051580 53.5571652 53.6415253 53.8231549 53.9392759
53.9729318 54.1072708 54.4158613 54.5161153 54.6334630
54.7763166 54.8759118 54.9785318 55.1092493 55.2307175
55.3218709 55.4918512 55.5659964 55.7318107 55.8885950
56.0444800 56.1659579 56.3257323 56.3725727 56.5791206
56.6056050 56.7976193 56.9806236 57.1477794 57.2543661
57.4359983 57.6305876 57.6482616 57.8175895 57.8500137
58.1884086 58.2250950 58.4409597 58.6392522 58.6447672
58.8827327 58.9522080 59.0589006 59.2352538 59.4606134
59.4901616 59.8068965 59.8621320 60.0342441 60.0889958
60.1828776 60.3772875 60.6935480 60.7563505 60.8478081
61.0161021 61.1569146 61.2450140 61.4700538 61.6267345
61.6673784 61.7672117 62.0126121 62.2581686 62.3017023
62.4586531 62.5403676 62.8152733 62.9446609 63.0910266
63.2093859 63.4928198 63.6132643 63.7614591 63.8584497
64.1280270 64.3410420 64.4565054 64.4752098 64.8435508
65.0521680 65.2280617 65.3016641 65.4293196 65.5166219
65.6755091 65.7458696 65.9162325 66.2008007 66.3618816
66.5528233 66.7163521 67.0046569 67.0971159 67.1228222
67.1602078 67.3737113 67.5653926 67.7797848 67.7882144
67.9973240 68.2895664 68.3345746 68.4926802 68.6384726
68.8374214 68.9414602 69.0753061 69.3274538 69.4447418
69.5534347 69.6638402 69.9199424 69.9959386 70.2425935
70.6116701 70.8116418 70.8889831 71.0672846 71.1128781
71.3963929 71.4954822 71.7041919 71.8250738 71.9446607
72.1731860 72.3381929 72.5770369 72.8126106 72.8895515
73.2178537 73.2631589 73.5544123 73.7455872 73.8516698
74.0278722 74.2806416 74.3518963 74.5199649 74.6219273
74.8020512 75.0279352 75.3111445 75.4511004 75.8189755
75.9590832 76.0484117 76.2994098 76.3330553 76.5919449
76.7161353 77.0100200 77.0809782 77.1013468 77.2326933
77.4171538 77.7367865 77.7776909 78.0447171 78.0865039
78.3088655 78.5392626 78.7634305 78.9545644 79.0316339
79.3529344 79.4624756 79.6565700 80.0807075 80.2593799
80.3438171 80.4560292 80.6611927 80.7933007 81.1592261
81.2264561 81.6045645 81.8842506 82.0134171 82.1896505
82.3624154 82.5111080 82.7437996 82.9226058 83.0982563
83.5019708 83.6064363 83.9395568 84.2866860 84.3821927
84.4823512 84.7032568 84.8598609 85.0668530 85.1943900
85.5536302 85.6453888 85.9672174 86.0112841 86.2565616
86.7044581 86.8690371 87.2962987 87.4217649 87.7070991
87.7342408 88.1246694 88.2057127 88.4349268 88.7308268
89.0144415 89.1552651 89.4862108 89.6556961 90.0005098
90.3305263 90.4872437 90.5794695 90.8330744 91.0510248
91.2775142 91.5565924 91.6887660 91.9199326 92.0375768
92.3902952 92.5060369 92.6754676 92.7251160 92.9070248
93.0518582 93.3872416 93.5965506 93.9517107 94.0368561
94.1985847 94.3998944 94.8006488 94.8855908 95.3769330
95.4501385 95.5594301 95.7995546 95.9975757 96.3077813
96.6339067 96.7273903 96.9019594 97.0468423 97.2364870
97.3783704 97.9825226 98.2169072 98.3687921 98.5054538
98.8412209 99.3542056 99.5035834 99.5599155 99.6964612
99.9363977 100.3151132 100.3963559 100.5071376 100.5968196
101.1131686 101.3591373 101.7576979 101.8650133 102.0954016
102.1719431 102.4711877 102.9247320 103.0875820 103.3079625
103.6602257 104.0414072 104.0907567 104.4120575 104.6073191
105.1492656 105.5435700 105.7297919 105.9580367 106.4391678
106.8173541 107.0830096 107.3657863 107.4083775 107.8903339
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1032.0780711 1032.9729765 1033.4992521 1034.9450394 1036.1859501
1037.4739059 1039.0587176 1039.8084543 1041.1184164 1041.7844439
1043.7787662 1044.4323573 1045.3883915 1045.6683737 1046.6935708
1047.5091018 1049.3951536 1050.5705009 1052.5618535 1053.0386968
1053.9438384 1055.0694173 1057.3065802 1057.7801508 1060.5153444
1060.9222597 1061.5294707 1062.8623549 1063.9602752 1065.6779238
1067.4807423 1067.9969576 1068.9602591 1069.7590884 1070.8038160
1071.5847673 1074.9037756 1076.1886496 1077.0204498 1077.7683313
1079.6036171 1082.4015558 1083.2149390 1083.5215162 1084.2642831
1085.5682322 1087.6232027 1088.0635330 1088.6636757 1089.1492719
1091.9409176 1093.2682431 1095.4155885 1095.9930580 1097.2317628
1097.6429860 1099.2492178 1101.6792073 1102.5504144 1103.7283005
1105.6084656 1107.6393831 1107.9020426 1109.6106265 1110.6476863
1113.5209751 1115.6068452 1116.5906042 1117.7951773 1120.3301287
1122.3186723 1123.7134126 1125.1961432 1125.4192991 1127.9414300
1128.3632443 1129.1669209 1131.7396722 1132.8671454 1134.9349982
1138.4520233 1140.5025733 1141.7774751 1143.1619151 1144.8926800
1146.3462796 1147.4118848 1150.7087863 1152.4791230 1155.1642920
1158.5721769 1159.0217678 1161.3954201 1163.4822871 1164.6938273
1168.6558979 1170.2505184 1172.1680137 1174.5014274 1174.5556728
1177.5283017 1180.8347943 1181.6083935 1183.9947737 1187.0983137
1190.4228081 1192.4935007 1194.1830212 1195.7162148 1196.8797875
1198.9047077 1201.7202230 1202.2476177 1206.1903351 1208.5866688
1212.2404690 1213.6075350 1214.8852672 1218.7709016 1219.7782736
1222.5552525 1224.1394685 1226.4205945 1234.8416677 1237.2359558
1240.7513324 1242.2933069 1246.0504227 1253.1693365 1256.3716325
1257.7904880 1261.0011650 1262.0582212 1268.2791288 1272.5954070
1275.7985976 1276.4196826 1279.2536941 1287.3348137 1291.4513788
1298.7211694 1302.6697827 1305.9801292 1314.7006971 1318.5549944
1326.3953413 1327.9610133 1339.1492415 1343.9145585 1349.6384683
1356.1131784 1362.0365662 1374.2765756 1396.8746778
Diagstd> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260611224133873640.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260611224133873640.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260611224133873640.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260611224133873640.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 238
First residue number = 1
Last residue number = 238
Number of atoms found = 238
Mean number per residue = 1.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9130E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9559E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9685E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0023E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0039E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0071E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8277
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.042
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.089
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.028
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.088
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.692
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.308
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.376
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.482
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.865
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.003
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.285
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.476
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.589
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.955
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.989
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.250
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.594
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.111
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.518
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.706
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.122
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.235
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.920
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.145
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.663
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.901
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.052
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.244
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.843
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
%Rdmodfacs-Wn> More than 106 vectors in file.
Bfactors> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.442300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.533 for 238 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.266 +/- 2.77
Bfactors> = 20.283 +/- 8.39
Bfactors> Shiftng-fct= 19.017
Bfactors> Scaling-fct= 3.026
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260611224133873640.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260611224133873640.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4188E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4262E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4284E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4378E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4405E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4460E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 229.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
%Rdmodfacs-Err> More than 106 vectors in file.
Chkmod> 106 vectors, 714 coordinates in file.
Chkmod> That is: 238 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7120
0.0034 0.8768
0.0034 0.9719
0.0034 0.6676
0.0034 0.9162
0.0034 0.6868
72.2163 0.0059
94.3205 0.0705
98.7900 0.5881
110.8436 0.4907
113.3158 0.5838
127.0975 0.0971
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159.8476 0.0631
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178.1616 0.5615
189.9181 0.3976
197.4965 0.1025
199.5161 0.6125
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213.4771 0.3276
217.2548 0.5310
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248.8034 0.0939
256.8253 0.2994
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getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260611224133873640 7 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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MODEL 2 will be plotted
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MODEL 4 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260611224133873640 8 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260611224133873640 9 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260611224133873640 10 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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5 models are in 260611224133873640.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
5 models are in 260611224133873640.10.pdb, 0 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 2 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260611224133873640 11 -20 20 10 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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getting mode 16
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