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LOGs for ID: 260612085305979267

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 260612085305979267.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 260612085305979267.atom to be opened.

 Openam> File opened: 260612085305979267.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    307
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    307
            Number of atoms found    =   2799
            Mean number per residue  =      9.1

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    50.925440 +/-    14.877404 From:    21.392000 To:    84.811000
 =    42.117065 +/-     9.939465 From:    17.540000 To:    65.554000
 =    37.825836 +/-     9.692732 From:    15.129000 To:    63.444000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.4099 % Filled.
 Pdbmat>      1202301  non-zero elements.
 Pdbmat>       131743 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     94.14 +/-     26.95
         Maximum number =    153
         Minimum number =     13

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.634860E+06
 Pdbmat> Larger element =  576.440    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
307 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 260612085305979267.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 260612085305979267.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 260612085305979267.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2799 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   307 residues.
 Blocpdb>    21 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    24 atoms in block      2
 Block first atom:     22
 Blocpdb>    21 atoms in block      3
 Block first atom:     46
 Blocpdb>    17 atoms in block      4
 Block first atom:     67
 Blocpdb>    17 atoms in block      5
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:    101
 Blocpdb>    10 atoms in block      7
 Block first atom:    114
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    124
 Blocpdb>    12 atoms in block      9
 Block first atom:    137
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    149
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    165
 Blocpdb>    23 atoms in block     12
 Block first atom:    180
 Blocpdb>    23 atoms in block     13
 Block first atom:    203
 Blocpdb>    18 atoms in block     14
 Block first atom:    226
 Blocpdb>    22 atoms in block     15
 Block first atom:    244
 Blocpdb>    17 atoms in block     16
 Block first atom:    266
 Blocpdb>    18 atoms in block     17
 Block first atom:    283
 Blocpdb>    22 atoms in block     18
 Block first atom:    301
 Blocpdb>    18 atoms in block     19
 Block first atom:    323
 Blocpdb>    12 atoms in block     20
 Block first atom:    341
 Blocpdb>    11 atoms in block     21
 Block first atom:    353
 Blocpdb>    15 atoms in block     22
 Block first atom:    364
 Blocpdb>    18 atoms in block     23
 Block first atom:    379
 Blocpdb>    25 atoms in block     24
 Block first atom:    397
 Blocpdb>    15 atoms in block     25
 Block first atom:    422
 Blocpdb>    25 atoms in block     26
 Block first atom:    437
 Blocpdb>    12 atoms in block     27
 Block first atom:    462
 Blocpdb>    15 atoms in block     28
 Block first atom:    474
 Blocpdb>    15 atoms in block     29
 Block first atom:    489
 Blocpdb>    17 atoms in block     30
 Block first atom:    504
 Blocpdb>    14 atoms in block     31
 Block first atom:    521
 Blocpdb>    21 atoms in block     32
 Block first atom:    535
 Blocpdb>    19 atoms in block     33
 Block first atom:    556
 Blocpdb>    17 atoms in block     34
 Block first atom:    575
 Blocpdb>    26 atoms in block     35
 Block first atom:    592
 Blocpdb>    18 atoms in block     36
 Block first atom:    618
 Blocpdb>    18 atoms in block     37
 Block first atom:    636
 Blocpdb>    17 atoms in block     38
 Block first atom:    654
 Blocpdb>    17 atoms in block     39
 Block first atom:    671
 Blocpdb>    31 atoms in block     40
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    23 atoms in block     41
 Block first atom:    719
 Blocpdb>    20 atoms in block     42
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    19 atoms in block     43
 Block first atom:    762
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    781
 Blocpdb>    17 atoms in block     45
 Block first atom:    799
 Blocpdb>    17 atoms in block     46
 Block first atom:    816
 Blocpdb>    21 atoms in block     47
 Block first atom:    833
 Blocpdb>    21 atoms in block     48
 Block first atom:    854
 Blocpdb>    23 atoms in block     49
 Block first atom:    875
 Blocpdb>    17 atoms in block     50
 Block first atom:    898
 Blocpdb>    14 atoms in block     51
 Block first atom:    915
 Blocpdb>    21 atoms in block     52
 Block first atom:    929
 Blocpdb>    22 atoms in block     53
 Block first atom:    950
 Blocpdb>    15 atoms in block     54
 Block first atom:    972
 Blocpdb>    17 atoms in block     55
 Block first atom:    987
 Blocpdb>    15 atoms in block     56
 Block first atom:   1004
 Blocpdb>    11 atoms in block     57
 Block first atom:   1019
 Blocpdb>    14 atoms in block     58
 Block first atom:   1030
 Blocpdb>    26 atoms in block     59
 Block first atom:   1044
 Blocpdb>    14 atoms in block     60
 Block first atom:   1070
 Blocpdb>    16 atoms in block     61
 Block first atom:   1084
 Blocpdb>    15 atoms in block     62
 Block first atom:   1100
 Blocpdb>    16 atoms in block     63
 Block first atom:   1115
 Blocpdb>    23 atoms in block     64
 Block first atom:   1131
 Blocpdb>    22 atoms in block     65
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    13 atoms in block     66
 Block first atom:   1176
 Blocpdb>    22 atoms in block     67
 Block first atom:   1189
 Blocpdb>    13 atoms in block     68
 Block first atom:   1211
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1224
 Blocpdb>    14 atoms in block     70
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    18 atoms in block     71
 Block first atom:   1254
 Blocpdb>    31 atoms in block     72
 Block first atom:   1272
 Blocpdb>    28 atoms in block     73
 Block first atom:   1303
 Blocpdb>    18 atoms in block     74
 Block first atom:   1331
 Blocpdb>    16 atoms in block     75
 Block first atom:   1349
 Blocpdb>    13 atoms in block     76
 Block first atom:   1365
 Blocpdb>    20 atoms in block     77
 Block first atom:   1378
 Blocpdb>    17 atoms in block     78
 Block first atom:   1398
 Blocpdb>    14 atoms in block     79
 Block first atom:   1415
 Blocpdb>    20 atoms in block     80
 Block first atom:   1429
 Blocpdb>    18 atoms in block     81
 Block first atom:   1449
 Blocpdb>    17 atoms in block     82
 Block first atom:   1467
 Blocpdb>    22 atoms in block     83
 Block first atom:   1484
 Blocpdb>    18 atoms in block     84
 Block first atom:   1506
 Blocpdb>    17 atoms in block     85
 Block first atom:   1524
 Blocpdb>    20 atoms in block     86
 Block first atom:   1541
 Blocpdb>    25 atoms in block     87
 Block first atom:   1561
 Blocpdb>    16 atoms in block     88
 Block first atom:   1586
 Blocpdb>    22 atoms in block     89
 Block first atom:   1602
 Blocpdb>    19 atoms in block     90
 Block first atom:   1624
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1643
 Blocpdb>    14 atoms in block     92
 Block first atom:   1661
 Blocpdb>    18 atoms in block     93
 Block first atom:   1675
 Blocpdb>    19 atoms in block     94
 Block first atom:   1693
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1712
 Blocpdb>    18 atoms in block     96
 Block first atom:   1730
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    21 atoms in block     98
 Block first atom:   1763
 Blocpdb>    25 atoms in block     99
 Block first atom:   1784
 Blocpdb>    23 atoms in block    100
 Block first atom:   1809
 Blocpdb>    26 atoms in block    101
 Block first atom:   1832
 Blocpdb>    18 atoms in block    102
 Block first atom:   1858
 Blocpdb>    26 atoms in block    103
 Block first atom:   1876
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1902
 Blocpdb>    20 atoms in block    105
 Block first atom:   1920
 Blocpdb>    11 atoms in block    106
 Block first atom:   1940
 Blocpdb>    17 atoms in block    107
 Block first atom:   1951
 Blocpdb>    14 atoms in block    108
 Block first atom:   1968
 Blocpdb>    18 atoms in block    109
 Block first atom:   1982
 Blocpdb>    29 atoms in block    110
 Block first atom:   2000
 Blocpdb>    12 atoms in block    111
 Block first atom:   2029
 Blocpdb>    18 atoms in block    112
 Block first atom:   2041
 Blocpdb>    17 atoms in block    113
 Block first atom:   2059
 Blocpdb>    22 atoms in block    114
 Block first atom:   2076
 Blocpdb>    18 atoms in block    115
 Block first atom:   2098
 Blocpdb>    16 atoms in block    116
 Block first atom:   2116
 Blocpdb>    13 atoms in block    117
 Block first atom:   2132
 Blocpdb>    20 atoms in block    118
 Block first atom:   2145
 Blocpdb>    23 atoms in block    119
 Block first atom:   2165
 Blocpdb>    17 atoms in block    120
 Block first atom:   2188
 Blocpdb>    21 atoms in block    121
 Block first atom:   2205
 Blocpdb>    16 atoms in block    122
 Block first atom:   2226
 Blocpdb>    18 atoms in block    123
 Block first atom:   2242
 Blocpdb>    20 atoms in block    124
 Block first atom:   2260
 Blocpdb>    11 atoms in block    125
 Block first atom:   2280
 Blocpdb>    20 atoms in block    126
 Block first atom:   2291
 Blocpdb>    19 atoms in block    127
 Block first atom:   2311
 Blocpdb>    20 atoms in block    128
 Block first atom:   2330
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   2350
 Blocpdb>    13 atoms in block    130
 Block first atom:   2364
 Blocpdb>    24 atoms in block    131
 Block first atom:   2377
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   2401
 Blocpdb>    18 atoms in block    133
 Block first atom:   2420
 Blocpdb>    21 atoms in block    134
 Block first atom:   2438
 Blocpdb>    16 atoms in block    135
 Block first atom:   2459
 Blocpdb>    12 atoms in block    136
 Block first atom:   2475
 Blocpdb>    24 atoms in block    137
 Block first atom:   2487
 Blocpdb>    14 atoms in block    138
 Block first atom:   2511
 Blocpdb>    14 atoms in block    139
 Block first atom:   2525
 Blocpdb>    26 atoms in block    140
 Block first atom:   2539
 Blocpdb>    20 atoms in block    141
 Block first atom:   2565
 Blocpdb>    19 atoms in block    142
 Block first atom:   2585
 Blocpdb>    25 atoms in block    143
 Block first atom:   2604
 Blocpdb>    14 atoms in block    144
 Block first atom:   2629
 Blocpdb>    14 atoms in block    145
 Block first atom:   2643
 Blocpdb>    11 atoms in block    146
 Block first atom:   2657
 Blocpdb>    14 atoms in block    147
 Block first atom:   2668
 Blocpdb>    16 atoms in block    148
 Block first atom:   2682
 Blocpdb>    12 atoms in block    149
 Block first atom:   2698
 Blocpdb>    15 atoms in block    150
 Block first atom:   2710
 Blocpdb>    18 atoms in block    151
 Block first atom:   2725
 Blocpdb>    29 atoms in block    152
 Block first atom:   2743
 Blocpdb>    20 atoms in block    153
 Block first atom:   2772
 Blocpdb>     8 atoms in block    154
 Block first atom:   2791

 Blocpdb>   154 blocks.

 Blocpdb> At most,     31 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1202455 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       8397

 Prepmat> Matrix trace    =    2634860.0000
 Prepmat> Last element read:    8397   8397       134.1406
 Prepmat>        11936 lines saved.
 Prepmat>        10199 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2799
 RTB> Total mass =        2799.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2799
 RTB> Number of blocks =   154
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  247547.9248
 RTB>     60186 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      924
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    60186
 Diagstd> Projected matrix trace =  247547.9248

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    924 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 247547.9248
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.1737236      1.8980951      2.2833641      5.4281261
      5.9998710      7.0876913      8.2180943      9.5188924     10.5533013
     11.5591343     14.2512000     14.8911221     17.5698565     18.1813228
     19.5579906     20.7336653     21.3526407     22.0293224     23.1036381
     23.4740504     24.0937091     24.8237330     25.3301197     26.1761058
     26.9579948     28.3425333     29.1711210     30.0315167     30.5679381
     31.7838939     32.4126697     33.1919593     34.5435217     35.4243453
     36.4110937     36.8543664     37.1308082     37.5292534     37.9255280
     38.8333933     39.5338413     40.4225863     41.3924781     41.6035977
     42.0287472     42.5592381     44.4218083     45.3495178     45.8423203
     47.0876540     47.9628820     48.0720835     48.9674842     49.7348264
     50.5200019     50.7465760     52.1505403     52.5581444     52.9587299
     54.6561465     55.0150576     56.4805476     57.2805669     58.4298960
     58.7717759     59.3945338     59.8417807     60.5529394     61.7844679
     62.6202936     63.8058606     64.0721451     65.5777947     66.4299698
     66.6209403     67.6393971     68.8523033     69.6718379     69.9750485
     70.8201529     72.0157069     72.9246626     73.7360270     74.2944163
     75.2496385     75.6028158     75.8215830     76.5625069     77.1148397
     78.3803701     78.9119433     79.0819315     79.8022143     80.6968645
     81.3529245     82.7305378     83.1808921     83.5058833     84.2646739
     85.4085079

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034330      0.0034331      0.0034336      0.0034337      0.0034337
      0.0034342    117.6462816    149.6078079    164.0902836    252.9998381
    265.9905687    289.0997235    311.3012324    335.0336961    352.7682163
    369.1968052    409.9406610    419.0433887    455.1760340    463.0288153
    480.2389672    494.4624570    501.7889303    509.6779554    521.9578904
    526.1254333    533.0244263    541.0393169    546.5298679    555.5815291
    563.8181769    578.1154989    586.5051630    595.0917280    600.3829532
    612.2077618    618.2337106    625.6215861    638.2320155    646.3179190
    655.2577138    659.2342378    661.7020523    665.2428914    668.7458469
    676.7027646    682.7784216    690.4104067    698.6440975    700.4235250
    703.9932618    708.4222657    723.7580330    731.2764992    735.2390684
    745.1587529    752.0520786    752.9077244    759.8872822    765.8180240
    771.8394268    773.5682790    784.1961152    787.2547547    790.2491927
    802.8137175    805.4453271    816.1025403    821.8620629    830.0664047
    832.4912685    836.8902708    840.0352961    845.0120365    853.5617312
    859.3158652    867.4122790    869.2204041    879.3741279    885.0693632
    886.3406329    893.0898308    901.0616721    906.4083838    908.3785793
    913.8474625    921.5287615    927.3261240    932.4705985    935.9946532
    941.9925962    944.2005860    945.5656869    950.1744605    953.5956480
    961.3885274    964.6430720    965.6815061    970.0692794    975.4917719
    979.4490858    987.7071646    990.3918712    992.3247361    996.8230054
   1003.5657883

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2799
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    154

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9946E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9983E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.174    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.898    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.283    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.428    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.000    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.088    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.218    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.519    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.41    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    924 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997
 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99996 0.99998
 1.00003 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99998
 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00005 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997
 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    50382 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997
 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99997
 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001
 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99996 0.99998
 1.00003 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003
 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998
 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99998
 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00005 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997
 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260612085305979267.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260612085305979267.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 260612085305979267.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 260612085305979267.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    307
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    307
            Number of atoms found    =   2799
            Mean number per residue  =      9.1

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9946E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9951E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9979E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9983E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.174    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.898    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.283    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.428    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.000    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.088    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.218    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.519    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.41    

 Bfactors>  106 vectors,   8397 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.174000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.540 for    307 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.023 +/-   0.02
 Bfactors> =     95.781 +/-   4.27
 Bfactors> Shiftng-fct=     95.757
 Bfactors> Scaling-fct=    199.423

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260612085305979267.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260612085305979267.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   752.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   752.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   773.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   879.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   885.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   901.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   908.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   921.5    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   975.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   979.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   987.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   990.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   992.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   996.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1004.    

 Chkmod>  106 vectors,   8397 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2799 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7158
      0.0034      0.9457
      0.0034      0.7611
      0.0034      0.9823
      0.0034      0.7571
      0.0034      0.7191
    117.6551      0.6589
    149.5976      0.7104
    164.0702      0.5986
    252.9860      0.6111
    265.9820      0.2914
    289.0936      0.6948
    311.2861      0.6029
    335.0212      0.3577
    352.6979      0.1672
    369.1948      0.3787
    409.9058      0.0670
    419.0096      0.2175
    455.1584      0.3838
    462.9921      0.3212
    480.2430      0.3102
    494.3975      0.4022
    501.7364      0.4156
    509.6639      0.3474
    521.8944      0.3773
    526.0575      0.4222
    532.9605      0.4562
    540.9754      0.2421
    546.5051      0.2205
    555.5990      0.3748
    563.8149      0.2722
    578.0648      0.4596
    586.4687      0.1690
    595.0512      0.4474
    600.3774      0.1508
    612.1440      0.3493
    618.1817      0.3967
    625.5763      0.3686
    638.1721      0.3599
    646.2505      0.3577
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    821.8227      0.3165
    830.0315      0.4762
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    836.8224      0.3611
    839.9867      0.3067
    844.9553      0.1610
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    859.2770      0.4247
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    893.0555      0.4122
    901.0079      0.4697
    906.3575      0.4063
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    913.8072      0.3433
    921.5167      0.4764
    927.2567      0.3258
    932.4557      0.3687
    935.9267      0.4493
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   1003.5315      0.4805
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260612085305979267 7 -500 500 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-500
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=-480
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=-460
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=-440
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=-420
260612085305979267.eigenfacs
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260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=400
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=420
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=440
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=460
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=480
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
calculating perturbed structure for DQ=500
260612085305979267.eigenfacs
260612085305979267.atom
WARNING: max number of models (51) reached
         no more models will be calculated for this mode
making animated gifs
51 models are in 260612085305979267.11.pdb, 9 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
MODEL 31 will be plotted
MODEL 41 will be plotted
MODEL 51 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
51 models are in 260612085305979267.11.pdb, 9 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
MODEL 21 will be plotted
MODEL 31 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
51 models are in 260612085305979267.11.pdb, 9 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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MODEL 21 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260612085305979267.10.pdb
260612085305979267.11.pdb
260612085305979267.7.pdb
260612085305979267.8.pdb
260612085305979267.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m11.804s
user	0m11.734s
sys	0m0.067s
rm: cannot remove '260612085305979267.sdijf': No such file or directory
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