*** TRANSCRIPTION 19-MAY-05 1ZR9 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2606121922511161981.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2606121922511161981.atom to be opened.
Openam> File opened: 2606121922511161981.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 67
First residue number = 28
Last residue number = 94
Number of atoms found = 1038
Mean number per residue = 15.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 4.514855 +/- 11.479437 From: -14.593000 To: 36.218000
= -2.514738 +/- 8.373469 From: -31.966000 To: 13.867000
= -1.543940 +/- 6.939514 From: -21.999000 To: 12.118000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 11.1241 % Filled.
Pdbmat> 539526 non-zero elements.
Pdbmat> 59267 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 114.19 +/- 42.59
Maximum number = 205
Minimum number = 30
Pdbmat> Matrix trace = 1.185340E+06
Pdbmat> Larger element = 780.955
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
67 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2606121922511161981.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2606121922511161981.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2606121922511161981.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1038 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 67 residues.
Blocpdb> 12 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 13
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 27
Blocpdb> 10 atoms in block 4
Block first atom: 41
Blocpdb> 15 atoms in block 5
Block first atom: 51
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 66
Blocpdb> 12 atoms in block 7
Block first atom: 86
Blocpdb> 14 atoms in block 8
Block first atom: 98
Blocpdb> 12 atoms in block 9
Block first atom: 112
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 14 atoms in block 11
Block first atom: 143
Blocpdb> 7 atoms in block 12
Block first atom: 157
Blocpdb> 7 atoms in block 13
Block first atom: 164
Blocpdb> 7 atoms in block 14
Block first atom: 171
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 178
Blocpdb> 18 atoms in block 16
Block first atom: 197
Blocpdb> 24 atoms in block 17
Block first atom: 215
Blocpdb> 10 atoms in block 18
Block first atom: 239
Blocpdb> 19 atoms in block 19
Block first atom: 249
Blocpdb> 10 atoms in block 20
Block first atom: 268
Blocpdb> 10 atoms in block 21
Block first atom: 278
Blocpdb> 10 atoms in block 22
Block first atom: 288
Blocpdb> 24 atoms in block 23
Block first atom: 298
Blocpdb> 21 atoms in block 24
Block first atom: 322
Blocpdb> 20 atoms in block 25
Block first atom: 343
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 363
Blocpdb> 12 atoms in block 27
Block first atom: 382
Blocpdb> 11 atoms in block 28
Block first atom: 394
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 405
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 419
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 433
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 452
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 474
Blocpdb> 17 atoms in block 34
Block first atom: 488
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 505
Blocpdb> 24 atoms in block 36
Block first atom: 525
Blocpdb> 11 atoms in block 37
Block first atom: 549
Blocpdb> 22 atoms in block 38
Block first atom: 560
Blocpdb> 12 atoms in block 39
Block first atom: 582
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 594
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 611
Blocpdb> 22 atoms in block 42
Block first atom: 633
Blocpdb> 24 atoms in block 43
Block first atom: 655
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 679
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 698
Blocpdb> 17 atoms in block 46
Block first atom: 720
Blocpdb> 19 atoms in block 47
Block first atom: 737
Blocpdb> 11 atoms in block 48
Block first atom: 756
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 767
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 783
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 798
Blocpdb> 21 atoms in block 52
Block first atom: 812
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 833
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 844
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 861
Blocpdb> 15 atoms in block 56
Block first atom: 876
Blocpdb> 10 atoms in block 57
Block first atom: 891
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 901
Blocpdb> 24 atoms in block 59
Block first atom: 916
Blocpdb> 10 atoms in block 60
Block first atom: 940
Blocpdb> 10 atoms in block 61
Block first atom: 950
Blocpdb> 7 atoms in block 62
Block first atom: 960
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 967
Blocpdb> 7 atoms in block 64
Block first atom: 984
Blocpdb> 11 atoms in block 65
Block first atom: 991
Blocpdb> 21 atoms in block 66
Block first atom: 1002
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1022
Blocpdb> 67 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 539593 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3114
Prepmat> Matrix trace = 1185340.0000
Prepmat> Last element read: 3114 3114 22.2651
Prepmat> 2279 lines saved.
Prepmat> 1667 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1038
RTB> Total mass = 1038.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1038
RTB> Number of blocks = 67
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 133217.3008
RTB> 20991 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 402
Diagstd> Nb of non-zero elements: 20991
Diagstd> Projected matrix trace = 133217.3008
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 402 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 133217.3008
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1324549 0.2970417 0.8437440 1.6971452
1.9712268 3.2607802 3.4896513 5.6581265 7.8473388
8.7527715 10.7277577 11.9196975 14.1589632 15.8564590
18.4540217 19.3758488 22.9892934 24.9704528 28.0120801
28.7779373 30.6489105 36.1732363 38.5020500 41.2943547
43.2136974 44.9918944 48.9663014 50.4292062 53.2887556
53.8702327 58.8860445 59.4877105 62.2717226 64.4693049
65.7999840 66.7730559 69.8164356 71.0222215 72.4768808
74.4780889 76.6688355 81.1679515 82.3834790 84.8048663
88.0395388 89.2418578 94.7301532 95.0331075 97.3294955
98.6134155 99.6803714 101.6205641 105.3492544 107.5950211
109.9500852 111.9213502 114.6064184 115.6134262 118.6783840
120.9879174 122.5478325 122.9494798 127.4105211 128.3672794
128.9870826 133.0628558 135.6980388 136.2204933 138.3667737
139.8261023 141.7105848 143.0731761 144.1450334 146.4068213
148.6444071 150.8781540 152.8214910 153.7214328 156.1069901
156.9695557 159.3674649 162.6199862 165.0342178 167.0965742
168.3122169 170.6318134 171.8665311 173.1090889 173.8498890
175.4339591 176.8205747 179.3169872 180.9407014 181.2128558
182.2637663 184.3508994 186.8145904 188.6170717 189.1432834
191.7115907
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034318 0.0034321 0.0034336 0.0034337 0.0034339
0.0034346 39.5211176 59.1839571 99.7471833 141.4668808
152.4626889 196.0902680 202.8552703 258.3042835 304.1980900
321.2684480 355.6720658 374.9107531 408.6118967 432.4126449
466.4883407 477.9975259 520.6646487 542.6358581 574.7354163
582.5391411 601.1776145 653.1139548 673.8096203 697.8155164
713.8484048 728.3873922 759.8781052 771.1455312 792.7076870
797.0208928 833.3001722 837.5464605 856.9208703 871.9102319
880.8626066 887.3519467 907.3484813 915.1502580 924.4746936
937.1509339 950.8340237 978.3349600 985.6332462 1000.0130491
1018.9060937 1025.8398876 1056.9133904 1058.6020864 1071.3158156
1078.3587851 1084.1767857 1094.6772206 1114.5794037 1126.3966959
1138.6573802 1148.8193730 1162.5181723 1167.6143292 1182.9900512
1194.4453413 1202.1207603 1204.0891084 1225.7387791 1230.3323650
1233.2990313 1252.6325715 1264.9753589 1267.4081768 1277.3537506
1284.0720889 1292.6960608 1298.8960300 1303.7524029 1313.9412164
1323.9438506 1333.8545088 1342.4171646 1346.3640047 1356.7706972
1360.5139360 1370.8663382 1384.7846481 1395.0259289 1403.7153638
1408.8121887 1418.4867500 1423.6096919 1428.7466185 1431.8004322
1438.3087169 1443.9816661 1454.1392500 1460.7080240 1461.8061431
1466.0387527 1474.4087877 1484.2281914 1491.3712933 1493.4501891
1503.5555068
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1038
Rtb_to_modes> Number of blocs = 67
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9876E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1325
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2970
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8437
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.697
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.971
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.261
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.490
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.658
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.847
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.753
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.0
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 189.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 191.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 402 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00003 0.99998 1.00004 1.00001
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1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
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1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
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1.00003 0.99999 1.00004 0.99997 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001
1.00005 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000
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1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999
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1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 18684 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00003 0.99998 1.00004 1.00001
0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998
0.99999 0.99996 1.00003 0.99999 1.00000
1.00004 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00002 0.99997 0.99996 1.00000
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001
1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000
1.00003 0.99999 1.00004 0.99997 1.00001
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0.99999 0.99996 1.00001 0.99998 1.00001
1.00005 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000
0.99997 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000
1.00001 0.99999 0.99994 0.99996 1.00000
1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999
1.00006 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997
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1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00002
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606121922511161981.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606121922511161981.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2606121922511161981.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2606121922511161981.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 67
First residue number = 28
Last residue number = 94
Number of atoms found = 1038
Mean number per residue = 15.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9876E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9892E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1325
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2970
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.697
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.971
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.261
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.490
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.658
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.847
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.753
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 191.7
Bfactors> 106 vectors, 3114 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.132500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.171 +/- 0.41
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.171
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2606121922511161981.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2606121922511161981.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1149.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1167.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1233.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1265.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1284.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1293.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1299.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1314.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1324.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1342.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1346.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1357.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1371.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1385.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1395.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1404.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1409.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1418.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1424.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1429.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1432.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1444.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1454.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1460.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1462.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1466.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1484.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1491.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1493.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1503.
Chkmod> 106 vectors, 3114 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1038 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 53 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 62 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 79 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 86 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 92 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9771
0.0034 0.9600
0.0034 0.7276
0.0034 0.6600
0.0034 0.7873
0.0034 0.6388
39.5262 0.1710
59.1773 0.2004
99.7403 0.0657
141.4548 0.2922
152.4474 0.3993
196.0885 0.4569
202.8567 0.1313
258.2903 0.3114
304.1785 0.2583
321.2589 0.3324
355.6940 0.3923
374.8994 0.4312
408.6093 0.3533
432.4424 0.5970
466.4175 0.3873
478.0282 0.4033
520.6503 0.3188
542.6076 0.2281
574.6894 0.2752
582.5350 0.4460
601.1625 0.4181
653.0567 0.4464
673.7628 0.1075
697.7488 0.5246
713.7872 0.4041
728.3408 0.4148
759.8742 0.3161
771.1185 0.2821
792.6829 0.5245
796.9850 0.5158
833.2924 0.4733
837.5266 0.5310
856.8722 0.0609
871.8775 0.4626
880.8249 0.1840
887.2936 0.3576
907.3327 0.3198
915.0967 0.2870
924.4549 0.5284
937.1227 0.1059
950.8004 0.4114
978.3053 0.1234
985.5701 0.2553
999.9414 0.4525
1018.8650 0.0929
1025.7852 0.0455
1056.8672 0.0598
1058.5393 0.3543
1071.2726 0.5089
1078.2938 0.5619
1084.1282 0.0956
1094.5195 0.3117
1114.2710 0.3838
1126.3744 0.4427
1138.8669 0.4125
1148.6605 0.1389
1162.4357 0.2515
1167.4964 0.3323
1183.0470 0.4934
1194.4537 0.2588
1201.8345 0.2665
1203.7951 0.0708
1225.6356 0.1005
1230.4363 0.5031
1233.3078 0.5405
1252.7536 0.2899
1264.9302 0.1862
1267.2584 0.1796
1277.4523 0.2970
1283.8971 0.3437
1292.5923 0.4263
1298.9620 0.4600
1303.4928 0.3130
1313.8542 0.4327
1323.6892 0.3445
1333.8938 0.1336
1342.2651 0.1093
1346.2124 0.1649
1356.6821 0.4591
1360.5875 0.0365
1370.9474 0.4719
1384.6401 0.5330
1394.8214 0.4616
1403.6695 0.1870
1408.7006 0.0701
1418.2936 0.1302
1423.6872 0.2706
1428.6478 0.0438
1431.5335 0.4988
1438.1078 0.2331
1443.8357 0.4550
1454.0080 0.0164
1460.4810 0.1434
1461.6915 0.4665
1466.1215 0.4379
1474.5418 0.4146
1484.1065 0.4820
1491.2398 0.4417
1493.2152 0.4721
1503.4455 0.0595
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606121922511161981 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
making animated gifs
11 models are in 2606121922511161981.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606121922511161981.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606121922511161981.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606121922511161981 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606121922511161981.eigenfacs
2606121922511161981.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606121922511161981.eigenfacs
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
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getting mode 11
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m1.637s
user 0m1.606s
sys 0m0.030s
rm: cannot remove '2606121922511161981.sdijf': No such file or directory
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