Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
Some cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* HYDROLASE 21-FEB-23 8CMV *

LOGs for ID: 2606131810021463505

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2606131810021463505.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2606131810021463505.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2606131810021463505.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    258
            First residue number     =     36
            Last  residue number     =    293
            Number of atoms found    =   4004
            Mean number per residue  =     15.5

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   -28.926652 +/-     9.825552 From:   -52.817000 To:    -8.143000
 =    26.788064 +/-    10.939874 From:     1.749000 To:    48.191000
 =     1.594483 +/-     7.840112 From:   -17.104000 To:    20.407000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.4688 % Filled.
 Pdbmat>      3224256  non-zero elements.
 Pdbmat>       355638 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=    177.64 +/-     54.15
         Maximum number =    278
         Minimum number =     34

 Pdbmat> Matrix trace   = 7.112760E+06
 Pdbmat> Larger element =  1035.02    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
258 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2606131810021463505.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2606131810021463505.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2606131810021463505.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4004 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   258 residues.
 Blocpdb>    26 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    35 atoms in block      2
 Block first atom:     27
 Blocpdb>    48 atoms in block      3
 Block first atom:     62
 Blocpdb>    21 atoms in block      4
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    28 atoms in block      5
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    38 atoms in block      6
 Block first atom:    159
 Blocpdb>    30 atoms in block      7
 Block first atom:    197
 Blocpdb>    33 atoms in block      8
 Block first atom:    227
 Blocpdb>    22 atoms in block      9
 Block first atom:    260
 Blocpdb>    21 atoms in block     10
 Block first atom:    282
 Blocpdb>    42 atoms in block     11
 Block first atom:    303
 Blocpdb>    26 atoms in block     12
 Block first atom:    345
 Blocpdb>    35 atoms in block     13
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    30 atoms in block     14
 Block first atom:    406
 Blocpdb>    35 atoms in block     15
 Block first atom:    436
 Blocpdb>    30 atoms in block     16
 Block first atom:    471
 Blocpdb>    27 atoms in block     17
 Block first atom:    501
 Blocpdb>    27 atoms in block     18
 Block first atom:    528
 Blocpdb>    14 atoms in block     19
 Block first atom:    555
 Blocpdb>    23 atoms in block     20
 Block first atom:    569
 Blocpdb>    40 atoms in block     21
 Block first atom:    592
 Blocpdb>    35 atoms in block     22
 Block first atom:    632
 Blocpdb>    21 atoms in block     23
 Block first atom:    667
 Blocpdb>    25 atoms in block     24
 Block first atom:    688
 Blocpdb>    33 atoms in block     25
 Block first atom:    713
 Blocpdb>    27 atoms in block     26
 Block first atom:    746
 Blocpdb>    26 atoms in block     27
 Block first atom:    773
 Blocpdb>    40 atoms in block     28
 Block first atom:    799
 Blocpdb>    25 atoms in block     29
 Block first atom:    839
 Blocpdb>    28 atoms in block     30
 Block first atom:    864
 Blocpdb>    24 atoms in block     31
 Block first atom:    892
 Blocpdb>    22 atoms in block     32
 Block first atom:    916
 Blocpdb>    22 atoms in block     33
 Block first atom:    938
 Blocpdb>    29 atoms in block     34
 Block first atom:    960
 Blocpdb>    43 atoms in block     35
 Block first atom:    989
 Blocpdb>    31 atoms in block     36
 Block first atom:   1032
 Blocpdb>    43 atoms in block     37
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    21 atoms in block     38
 Block first atom:   1106
 Blocpdb>    25 atoms in block     39
 Block first atom:   1127
 Blocpdb>    36 atoms in block     40
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    35 atoms in block     41
 Block first atom:   1188
 Blocpdb>    35 atoms in block     42
 Block first atom:   1223
 Blocpdb>    28 atoms in block     43
 Block first atom:   1258
 Blocpdb>    25 atoms in block     44
 Block first atom:   1286
 Blocpdb>    44 atoms in block     45
 Block first atom:   1311
 Blocpdb>    19 atoms in block     46
 Block first atom:   1355
 Blocpdb>    26 atoms in block     47
 Block first atom:   1374
 Blocpdb>    35 atoms in block     48
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    28 atoms in block     49
 Block first atom:   1435
 Blocpdb>    36 atoms in block     50
 Block first atom:   1463
 Blocpdb>    28 atoms in block     51
 Block first atom:   1499
 Blocpdb>    29 atoms in block     52
 Block first atom:   1527
 Blocpdb>    45 atoms in block     53
 Block first atom:   1556
 Blocpdb>    58 atoms in block     54
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    38 atoms in block     55
 Block first atom:   1659
 Blocpdb>    25 atoms in block     56
 Block first atom:   1697
 Blocpdb>    28 atoms in block     57
 Block first atom:   1722
 Blocpdb>    40 atoms in block     58
 Block first atom:   1750
 Blocpdb>    34 atoms in block     59
 Block first atom:   1790
 Blocpdb>    31 atoms in block     60
 Block first atom:   1824
 Blocpdb>    24 atoms in block     61
 Block first atom:   1855
 Blocpdb>    43 atoms in block     62
 Block first atom:   1879
 Blocpdb>    26 atoms in block     63
 Block first atom:   1922
 Blocpdb>    17 atoms in block     64
 Block first atom:   1948
 Blocpdb>    29 atoms in block     65
 Block first atom:   1965
 Blocpdb>    24 atoms in block     66
 Block first atom:   1994
 Blocpdb>    14 atoms in block     67
 Block first atom:   2018
 Blocpdb>    21 atoms in block     68
 Block first atom:   2032
 Blocpdb>    43 atoms in block     69
 Block first atom:   2053
 Blocpdb>    29 atoms in block     70
 Block first atom:   2096
 Blocpdb>    32 atoms in block     71
 Block first atom:   2125
 Blocpdb>    28 atoms in block     72
 Block first atom:   2157
 Blocpdb>    30 atoms in block     73
 Block first atom:   2185
 Blocpdb>    32 atoms in block     74
 Block first atom:   2215
 Blocpdb>    26 atoms in block     75
 Block first atom:   2247
 Blocpdb>    33 atoms in block     76
 Block first atom:   2273
 Blocpdb>    28 atoms in block     77
 Block first atom:   2306
 Blocpdb>    42 atoms in block     78
 Block first atom:   2334
 Blocpdb>    26 atoms in block     79
 Block first atom:   2376
 Blocpdb>    36 atoms in block     80
 Block first atom:   2402
 Blocpdb>    34 atoms in block     81
 Block first atom:   2438
 Blocpdb>    25 atoms in block     82
 Block first atom:   2472
 Blocpdb>    30 atoms in block     83
 Block first atom:   2497
 Blocpdb>    35 atoms in block     84
 Block first atom:   2527
 Blocpdb>    35 atoms in block     85
 Block first atom:   2562
 Blocpdb>    17 atoms in block     86
 Block first atom:   2597
 Blocpdb>    39 atoms in block     87
 Block first atom:   2614
 Blocpdb>    26 atoms in block     88
 Block first atom:   2653
 Blocpdb>    26 atoms in block     89
 Block first atom:   2679
 Blocpdb>    30 atoms in block     90
 Block first atom:   2705
 Blocpdb>    35 atoms in block     91
 Block first atom:   2735
 Blocpdb>    28 atoms in block     92
 Block first atom:   2770
 Blocpdb>    33 atoms in block     93
 Block first atom:   2798
 Blocpdb>    41 atoms in block     94
 Block first atom:   2831
 Blocpdb>    31 atoms in block     95
 Block first atom:   2872
 Blocpdb>    33 atoms in block     96
 Block first atom:   2903
 Blocpdb>    32 atoms in block     97
 Block first atom:   2936
 Blocpdb>    28 atoms in block     98
 Block first atom:   2968
 Blocpdb>    38 atoms in block     99
 Block first atom:   2996
 Blocpdb>    37 atoms in block    100
 Block first atom:   3034
 Blocpdb>    34 atoms in block    101
 Block first atom:   3071
 Blocpdb>    35 atoms in block    102
 Block first atom:   3105
 Blocpdb>    21 atoms in block    103
 Block first atom:   3140
 Blocpdb>    37 atoms in block    104
 Block first atom:   3161
 Blocpdb>    24 atoms in block    105
 Block first atom:   3198
 Blocpdb>    25 atoms in block    106
 Block first atom:   3222
 Blocpdb>    28 atoms in block    107
 Block first atom:   3247
 Blocpdb>    20 atoms in block    108
 Block first atom:   3275
 Blocpdb>    30 atoms in block    109
 Block first atom:   3295
 Blocpdb>    37 atoms in block    110
 Block first atom:   3325
 Blocpdb>    33 atoms in block    111
 Block first atom:   3362
 Blocpdb>    35 atoms in block    112
 Block first atom:   3395
 Blocpdb>    39 atoms in block    113
 Block first atom:   3430
 Blocpdb>    43 atoms in block    114
 Block first atom:   3469
 Blocpdb>    28 atoms in block    115
 Block first atom:   3512
 Blocpdb>    26 atoms in block    116
 Block first atom:   3540
 Blocpdb>    38 atoms in block    117
 Block first atom:   3566
 Blocpdb>    45 atoms in block    118
 Block first atom:   3604
 Blocpdb>    37 atoms in block    119
 Block first atom:   3649
 Blocpdb>    30 atoms in block    120
 Block first atom:   3686
 Blocpdb>    28 atoms in block    121
 Block first atom:   3716
 Blocpdb>    34 atoms in block    122
 Block first atom:   3744
 Blocpdb>    24 atoms in block    123
 Block first atom:   3778
 Blocpdb>    30 atoms in block    124
 Block first atom:   3802
 Blocpdb>    32 atoms in block    125
 Block first atom:   3832
 Blocpdb>    38 atoms in block    126
 Block first atom:   3864
 Blocpdb>    28 atoms in block    127
 Block first atom:   3902
 Blocpdb>    42 atoms in block    128
 Block first atom:   3930
 Blocpdb>    33 atoms in block    129
 Block first atom:   3971

 Blocpdb>   129 blocks.

 Blocpdb> At most,     58 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,    14 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      3224385 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      12012

 Prepmat> Matrix trace    =    7112760.0000
 Prepmat> Last element read:   12012  12012       340.4524
 Prepmat>         8386 lines saved.
 Prepmat>         6589 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4004
 RTB> Total mass =        4004.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4004
 RTB> Number of blocks =   129
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  395303.1012
 RTB>     62721 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      774
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    62721
 Diagstd> Projected matrix trace =  395303.1012

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    774 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 395303.1012
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000     17.7295061     18.9601999     25.6857040     30.2337097
     30.7337669     37.8403812     37.9417023     39.6756731     41.7962335
     42.6311347     48.3004945     49.3161501     53.5754314     54.6797908
     57.3976343     59.7769094     62.5293389     63.7923614     67.1490608
     68.2520868     69.4612589     71.6918220     73.3499270     77.9345079
     78.7169231     83.7674386     84.9886298     87.0020290     89.7467093
     93.4271295     97.6147202     98.3259613    100.6156829    101.1763666
    103.5589667    105.3546505    107.4959579    109.1634190    111.3398183
    112.9520982    115.0620203    116.5305261    119.8966053    121.5535709
    122.3346179    124.2831721    126.2431018    128.1136780    131.1693970
    131.9472504    134.2328891    137.7373161    138.1413462    140.7502847
    142.5668297    143.7656932    144.1000999    146.2557804    149.5969297
    151.4635119    152.8880872    154.1643451    155.7567965    158.5285430
    160.5567537    161.1335000    162.8280094    164.0451507    165.2933393
    167.3404098    169.0201200    169.8824250    171.1265080    173.8835444
    176.0499375    177.5741960    178.9865540    180.6480632    183.3541426
    183.6679781    185.8571981    186.4787324    188.5358546    191.4554662
    192.0336950    193.1239956    195.2221610    196.7519267    197.8929241
    198.5155234    202.4392032    205.2602263    206.4587315    207.5795023
    209.1870638    210.9793492    212.8917117    214.4414915    216.9157523
    217.2427506

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034317      0.0034345      0.0034348      0.0034350      0.0034354
      0.0034370    457.2393508    472.8427518    550.3525931    597.0916524
    602.0092673    667.9947229    668.8884341    684.0020948    702.0432270
    709.0203928    754.6942985    762.5878176    794.8370793    802.9873478
    822.7014766    839.5798540    858.6915690    867.3205163    889.8468175
    897.1255953    905.0375641    919.4541750    930.0260715    958.6502260
    963.4503418    993.8775901   1001.0959262   1012.8846062   1028.7374426
   1049.6192403   1072.8844162   1076.7859515   1089.2513824   1092.2821081
   1105.0683347   1114.6079483   1125.8780370   1134.5766594   1145.8309120
   1154.0973176   1164.8265955   1172.2362138   1189.0461846   1197.2342740
   1201.0745516   1210.6021611   1220.1103427   1229.1164470   1243.6882787
   1247.3704531   1258.1277719   1274.4449723   1276.3127926   1288.3086454
   1296.5955489   1302.0357584   1303.5491813   1313.2632767   1328.1790338
   1336.4394639   1342.7096305   1348.3022255   1355.2480263   1367.2534071
   1375.9719147   1378.4410582   1385.6700720   1390.8393799   1396.1206699
   1404.7391758   1411.7717365   1415.3684356   1420.5414955   1431.9390156
   1440.8315772   1447.0555685   1452.7988376   1459.5263336   1470.4174351
   1471.6753066   1480.4201005   1482.8934076   1491.0501721   1502.5508047
   1504.8180763   1509.0839473   1517.2594051   1523.1924460   1527.6026853
   1530.0038258   1545.0501831   1555.7782009   1560.3136492   1564.5430347
   1570.5895096   1577.3034545   1584.4358384   1590.1924600   1599.3400984
   1600.5451391

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4004
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    129

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9866E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0018E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   93.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   97.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   98.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   100.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   101.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   103.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   105.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   107.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   109.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   111.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   113.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   115.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   116.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   119.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   121.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   122.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   124.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   126.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   128.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   131.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   131.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   134.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   137.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   138.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   140.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   142.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   143.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   144.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   146.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   149.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   151.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   152.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   154.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   155.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   158.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   160.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   161.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   162.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   164.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   165.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   167.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   169.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   169.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   171.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   173.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   176.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   177.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   179.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   180.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   183.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   183.7    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   185.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   186.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   188.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   191.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   192.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   193.1    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   195.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   196.8    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   197.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   198.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   202.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   205.3    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   206.5    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   207.6    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   209.2    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   211.0    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   212.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   214.4    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   216.9    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   217.2    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    774 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99997 0.99999 1.00004 1.00003
 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99998 1.00006 1.00001 1.00003
 0.99997 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99997 1.00000 0.99996 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00004 0.99996
 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00002 0.99998 1.00003 1.00001
 0.99998 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003
 1.00002 0.99997 1.00001 1.00003 1.00001
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    72072 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99997 0.99999 1.00004 1.00003
 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99998 1.00006 1.00001 1.00003
 0.99997 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999
 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999 1.00002
 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00000 0.99997 1.00000 0.99996 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 1.00000 0.99999 1.00004 0.99996
 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003
 0.99999 1.00002 0.99998 1.00003 1.00001
 0.99998 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 0.99998
 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003
 1.00002 0.99997 1.00001 1.00003 1.00001
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2606131810021463505.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2606131810021463505.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2606131810021463505.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2606131810021463505.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    258
            First residue number     =     36
            Last  residue number     =    293
            Number of atoms found    =   4004
            Mean number per residue  =     15.5

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9866E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0005E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0008E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0018E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   93.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   97.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   98.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   100.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   101.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   103.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   105.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   107.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   109.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   111.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   113.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   115.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   116.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   119.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   121.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   122.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   124.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   126.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   128.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   131.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   134.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   137.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   138.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   140.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   142.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   143.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   144.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   146.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   149.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   151.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   152.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   154.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   155.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   158.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   160.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   161.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   162.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   164.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   165.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   167.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   169.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   169.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   171.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   173.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   176.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   177.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   179.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   180.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   183.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   183.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   185.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   186.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   188.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   191.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   192.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   193.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   195.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   196.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   197.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   198.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   202.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   205.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   206.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   207.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   209.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   211.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   212.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   214.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   216.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   217.2    

 Bfactors>  106 vectors,  12012 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :    17.730000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.780 for    268 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.004 +/-   0.00
 Bfactors> =     12.747 +/-   4.70
 Bfactors> Shiftng-fct=     12.744
 Bfactors> Scaling-fct=   1115.819

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2606131810021463505.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2606131810021463505.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4315E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4347E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4352E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4369E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   457.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   472.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   550.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   597.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   601.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   684.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   702.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   709.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   794.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   803.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   822.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   858.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   889.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   897.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   905.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   919.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   930.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   958.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   963.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   993.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1001.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1013.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1029.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1050.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1073.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1077.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1089.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1092.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1105.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1115.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1126.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1135.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1146.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1154.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1165.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1172.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1189.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1197.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1201.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1211.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1220.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1229.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1244.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1247.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1258.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1274.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1276.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1288.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1297.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1302.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1303.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1313.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1328.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1337.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1343.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1348.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1355.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1367.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1376.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1378.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1385.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1391.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1396.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1405.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1412.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1415.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1420.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1432.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1441.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1447.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1453.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1459.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1471.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1472.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1481.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1483.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1491.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1503.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1505.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1509.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1517.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1523.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1528.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1530.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1545.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1556.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1560.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1565.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1571.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1577.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1584.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1590.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1599.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1600.    

 Chkmod>  106 vectors,  12012 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4004 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    23 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8031
      0.0034      0.9708
      0.0034      0.7366
      0.0034      0.9802
      0.0034      0.7514
      0.0034      0.7942
    457.2261      0.4554
    472.8200      0.5647
    550.3750      0.0672
    597.0294      0.2613
    601.9465      0.2290
    667.9627      0.1835
    668.8447      0.3277
    684.0100      0.3393
    702.0447      0.3669
    708.9805      0.4408
    754.6580      0.5516
    762.5848      0.4098
    794.8368      0.5249
    802.9544      0.4407
    822.6831      0.4233
    839.5655      0.3613
    858.6592      0.2345
    867.2672      0.4253
    889.8148      0.4011
    897.0734      0.3486
    904.9905      0.3358
    919.4030      0.7396
    929.9866      0.5233
    958.5813      0.4029
    963.4278      0.3622
    993.8501      0.3120
   1001.0610      0.2927
   1012.8293      0.4736
   1028.7121      0.3571
   1049.5903      0.5470
   1072.8124      0.3795
   1076.7618      0.3372
   1089.1197      0.3652
   1092.3628      0.4807
   1105.2398      0.3958
   1114.8000      0.4471
   1125.8509      0.4285
   1134.7180      0.4314
   1145.5768      0.2763
   1154.2925      0.3008
   1164.9688      0.2883
   1172.0324      0.5777
   1189.0120      0.5682
   1197.4115      0.3948
   1200.8530      0.5000
   1210.6321      0.4049
   1219.8497      0.2505
   1228.9981      0.3826
   1243.7800      0.2908
   1247.0936      0.3503
   1257.9196      0.4634
   1274.2176      0.4638
   1276.0670      0.4988
   1288.4808      0.5098
   1296.6907      0.3021
   1302.1352      0.3269
   1303.4928      0.3653
   1313.4054      0.4569
   1328.1356      0.4151
   1336.5431      0.3985
   1342.7043      0.5044
   1348.4002      0.3384
   1355.3778      0.3642
   1367.0716      0.5181
   1376.0981      0.3406
   1378.2386      0.4210
   1385.4914      0.4049
   1390.5883      0.3957
   1396.0889      0.4255
   1404.5093      0.4049
   1411.6271      0.1453
   1415.3809      0.5170
   1420.3705      0.5375
   1431.9453      0.3293
   1440.5654      0.4459
   1447.0986      0.4581
   1452.7910      0.3546
   1459.2695      0.3776
   1470.5382      0.4586
   1471.7404      0.3979
   1480.5270      0.4530
   1482.9143      0.4201
   1490.8444      0.4251
   1502.6610      0.4176
   1504.6215      0.4778
   1508.9254      0.3373
   1517.1082      0.3407
   1523.3131      0.4567
   1527.5644      0.3618
   1529.8783      0.4804
   1544.8343      0.4895
   1555.8621      0.4573
   1560.4026      0.4370
   1564.5531      0.3499
   1570.5706      0.4509
   1577.3129      0.4201
   1584.3987      0.4631
   1589.9704      0.4469
   1599.2134      0.4068
   1600.3189      0.4854
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2606131810021463505 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
making animated gifs
11 models are in 2606131810021463505.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2606131810021463505 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
making animated gifs
11 models are in 2606131810021463505.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2606131810021463505 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
making animated gifs
11 models are in 2606131810021463505.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2606131810021463505 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
making animated gifs
11 models are in 2606131810021463505.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2606131810021463505 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2606131810021463505.eigenfacs
2606131810021463505.atom
making animated gifs
11 models are in 2606131810021463505.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2606131810021463505.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2606131810021463505.10.pdb
2606131810021463505.11.pdb
2606131810021463505.7.pdb
2606131810021463505.8.pdb
2606131810021463505.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m13.131s
user	0m12.856s
sys	0m0.260s
rm: cannot remove '2606131810021463505.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been relocated. **Some cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** HYDROLASE 21-FEB-23 8CMV ***

LOGs for ID: 2606131810021463505

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
Some cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* HYDROLASE 21-FEB-23 8CMV *
