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***  AF2MV3_model2  ***

LOGs for ID: 2607021438021983782

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021438021983782.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021438021983782.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021438021983782.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18878 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 187.744880 +/- 29.061959 From: 76.220000 To: 271.840000 = 104.205530 +/- 28.037879 From: 43.960000 To: 172.510000 = 106.451592 +/- 27.951889 From: 20.830000 To: 195.630000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSP ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'LSN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 36 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.9925 % Filled. Pdbmat> 10834427 non-zero elements. Pdbmat> 1193260 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 126.42 +/- 59.23 Maximum number = 258 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.386520E+07 Pdbmat> Larger element = 952.338 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1216 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021438021983782.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021438021983782.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021438021983782.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18878 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1216 residues. Blocpdb> 106 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 109 atoms in block 2 Block first atom: 107 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 216 Blocpdb> 109 atoms in block 4 Block first atom: 299 Blocpdb> 118 atoms in block 5 Block first atom: 408 Blocpdb> 82 atoms in block 6 Block first atom: 526 Blocpdb> 116 atoms in block 7 Block first atom: 608 Blocpdb> 90 atoms in block 8 Block first atom: 724 Blocpdb> 127 atoms in block 9 Block first atom: 814 Blocpdb> 141 atoms in block 10 Block first atom: 941 Blocpdb> 137 atoms in block 11 Block first atom: 1082 Blocpdb> 114 atoms in block 12 Block first atom: 1219 Blocpdb> 136 atoms in block 13 Block first atom: 1333 Blocpdb> 104 atoms in block 14 Block first atom: 1469 Blocpdb> 124 atoms in block 15 Block first atom: 1573 Blocpdb> 108 atoms in block 16 Block first atom: 1697 Blocpdb> 133 atoms in block 17 Block first atom: 1805 Blocpdb> 117 atoms in block 18 Block first atom: 1938 Blocpdb> 127 atoms in block 19 Block first atom: 2055 Blocpdb> 139 atoms in block 20 Block first atom: 2182 Blocpdb> 108 atoms in block 21 Block first atom: 2321 Blocpdb> 110 atoms in block 22 Block first atom: 2429 Blocpdb> 124 atoms in block 23 Block first atom: 2539 Blocpdb> 97 atoms in block 24 Block first atom: 2663 Blocpdb> 110 atoms in block 25 Block first atom: 2760 Blocpdb> 119 atoms in block 26 Block first atom: 2870 Blocpdb> 98 atoms in block 27 Block first atom: 2989 Blocpdb> 131 atoms in block 28 Block first atom: 3087 Blocpdb> 104 atoms in block 29 Block first atom: 3218 Blocpdb> 93 atoms in block 30 Block first atom: 3322 Blocpdb> 99 atoms in block 31 Block first atom: 3415 Blocpdb> 109 atoms in block 32 Block first atom: 3514 Blocpdb> 110 atoms in block 33 Block first atom: 3623 Blocpdb> 82 atoms in block 34 Block first atom: 3733 Blocpdb> 125 atoms in block 35 Block first atom: 3815 Blocpdb> 107 atoms in block 36 Block first atom: 3940 Blocpdb> 120 atoms in block 37 Block first atom: 4047 Blocpdb> 126 atoms in block 38 Block first atom: 4167 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 4293 Blocpdb> 134 atoms in block 40 Block first atom: 4406 Blocpdb> 110 atoms in block 41 Block first atom: 4540 Blocpdb> 113 atoms in block 42 Block first atom: 4650 Blocpdb> 112 atoms in block 43 Block first atom: 4763 Blocpdb> 102 atoms in block 44 Block first atom: 4875 Blocpdb> 105 atoms in block 45 Block first atom: 4977 Blocpdb> 121 atoms in block 46 Block first atom: 5082 Blocpdb> 104 atoms in block 47 Block first atom: 5203 Blocpdb> 111 atoms in block 48 Block first atom: 5307 Blocpdb> 101 atoms in block 49 Block first atom: 5418 Blocpdb> 109 atoms in block 50 Block first atom: 5519 Blocpdb> 113 atoms in block 51 Block first atom: 5628 Blocpdb> 92 atoms in block 52 Block first atom: 5741 Blocpdb> 85 atoms in block 53 Block first atom: 5833 Blocpdb> 68 atoms in block 54 Block first atom: 5918 Blocpdb> 89 atoms in block 55 Block first atom: 5986 Blocpdb> 94 atoms in block 56 Block first atom: 6075 Blocpdb> 103 atoms in block 57 Block first atom: 6169 Blocpdb> 149 atoms in block 58 Block first atom: 6272 Blocpdb> 105 atoms in block 59 Block first atom: 6421 Blocpdb> 88 atoms in block 60 Block first atom: 6526 Blocpdb> 91 atoms in block 61 Block first atom: 6614 Blocpdb> 111 atoms in block 62 Block first atom: 6705 Blocpdb> 92 atoms in block 63 Block first atom: 6816 Blocpdb> 112 atoms in block 64 Block first atom: 6908 Blocpdb> 101 atoms in block 65 Block first atom: 7020 Blocpdb> 110 atoms in block 66 Block first atom: 7121 Blocpdb> 90 atoms in block 67 Block first atom: 7231 Blocpdb> 109 atoms in block 68 Block first atom: 7321 Blocpdb> 86 atoms in block 69 Block first atom: 7430 Blocpdb> 107 atoms in block 70 Block first atom: 7516 Blocpdb> 123 atoms in block 71 Block first atom: 7623 Blocpdb> 88 atoms in block 72 Block first atom: 7746 Blocpdb> 110 atoms in block 73 Block first atom: 7834 Blocpdb> 86 atoms in block 74 Block first atom: 7944 Blocpdb> 105 atoms in block 75 Block first atom: 8030 Blocpdb> 71 atoms in block 76 Block first atom: 8135 Blocpdb> 115 atoms in block 77 Block first atom: 8206 Blocpdb> 99 atoms in block 78 Block first atom: 8321 Blocpdb> 83 atoms in block 79 Block first atom: 8420 Blocpdb> 84 atoms in block 80 Block first atom: 8503 Blocpdb> 91 atoms in block 81 Block first atom: 8587 Blocpdb> 97 atoms in block 82 Block first atom: 8678 Blocpdb> 123 atoms in block 83 Block first atom: 8775 Blocpdb> 81 atoms in block 84 Block first atom: 8898 Blocpdb> 86 atoms in block 85 Block first atom: 8979 Blocpdb> 103 atoms in block 86 Block first atom: 9065 Blocpdb> 102 atoms in block 87 Block first atom: 9168 Blocpdb> 89 atoms in block 88 Block first atom: 9270 Blocpdb> 91 atoms in block 89 Block first atom: 9359 Blocpdb> 123 atoms in block 90 Block first atom: 9450 Blocpdb> 113 atoms in block 91 Block first atom: 9573 Blocpdb> 89 atoms in block 92 Block first atom: 9686 Blocpdb> 108 atoms in block 93 Block first atom: 9775 Blocpdb> 115 atoms in block 94 Block first atom: 9883 Blocpdb> 87 atoms in block 95 Block first atom: 9998 Blocpdb> 89 atoms in block 96 Block first atom: 10085 Blocpdb> 73 atoms in block 97 Block first atom: 10174 Blocpdb> 66 atoms in block 98 Block first atom: 10247 Blocpdb> 107 atoms in block 99 Block first atom: 10313 Blocpdb> 134 atoms in block 100 Block first atom: 10420 Blocpdb> 128 atoms in block 101 Block first atom: 10554 Blocpdb> 127 atoms in block 102 Block first atom: 10682 Blocpdb> 133 atoms in block 103 Block first atom: 10809 Blocpdb> 112 atoms in block 104 Block first atom: 10942 Blocpdb> 102 atoms in block 105 Block first atom: 11054 Blocpdb> 114 atoms in block 106 Block first atom: 11156 Blocpdb> 122 atoms in block 107 Block first atom: 11270 Blocpdb> 123 atoms in block 108 Block first atom: 11392 Blocpdb> 116 atoms in block 109 Block first atom: 11515 Blocpdb> 97 atoms in block 110 Block first atom: 11631 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11728 Blocpdb> 104 atoms in block 112 Block first atom: 11834 Blocpdb> 88 atoms in block 113 Block first atom: 11938 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12026 Blocpdb> 123 atoms in block 115 Block first atom: 12140 Blocpdb> 97 atoms in block 116 Block first atom: 12263 Blocpdb> 125 atoms in block 117 Block first atom: 12360 Blocpdb> 128 atoms in block 118 Block first atom: 12485 Blocpdb> 126 atoms in block 119 Block first atom: 12613 Blocpdb> 112 atoms in block 120 Block first atom: 12739 Blocpdb> 114 atoms in block 121 Block first atom: 12851 Blocpdb> 135 atoms in block 122 Block first atom: 12965 Blocpdb> 115 atoms in block 123 Block first atom: 13100 Blocpdb> 107 atoms in block 124 Block first atom: 13215 Blocpdb> 106 atoms in block 125 Block first atom: 13322 Blocpdb> 105 atoms in block 126 Block first atom: 13428 Blocpdb> 107 atoms in block 127 Block first atom: 13533 Blocpdb> 88 atoms in block 128 Block first atom: 13640 Blocpdb> 109 atoms in block 129 Block first atom: 13728 Blocpdb> 116 atoms in block 130 Block first atom: 13837 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13953 Blocpdb> 119 atoms in block 132 Block first atom: 14080 Blocpdb> 105 atoms in block 133 Block first atom: 14199 Blocpdb> 112 atoms in block 134 Block first atom: 14304 Blocpdb> 129 atoms in block 135 Block first atom: 14416 Blocpdb> 108 atoms in block 136 Block first atom: 14545 Blocpdb> 110 atoms in block 137 Block first atom: 14653 Blocpdb> 112 atoms in block 138 Block first atom: 14763 Blocpdb> 106 atoms in block 139 Block first atom: 14875 Blocpdb> 113 atoms in block 140 Block first atom: 14981 Blocpdb> 102 atoms in block 141 Block first atom: 15094 Blocpdb> 125 atoms in block 142 Block first atom: 15196 Blocpdb> 117 atoms in block 143 Block first atom: 15321 Blocpdb> 111 atoms in block 144 Block first atom: 15438 Blocpdb> 138 atoms in block 145 Block first atom: 15549 Blocpdb> 109 atoms in block 146 Block first atom: 15687 Blocpdb> 109 atoms in block 147 Block first atom: 15796 Blocpdb> 120 atoms in block 148 Block first atom: 15905 Blocpdb> 125 atoms in block 149 Block first atom: 16025 Blocpdb> 99 atoms in block 150 Block first atom: 16150 Blocpdb> 113 atoms in block 151 Block first atom: 16249 Blocpdb> 110 atoms in block 152 Block first atom: 16362 Blocpdb> 121 atoms in block 153 Block first atom: 16472 Blocpdb> 103 atoms in block 154 Block first atom: 16593 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16696 Blocpdb> 92 atoms in block 156 Block first atom: 16806 Blocpdb> 109 atoms in block 157 Block first atom: 16898 Blocpdb> 120 atoms in block 158 Block first atom: 17007 Blocpdb> 126 atoms in block 159 Block first atom: 17127 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17253 Blocpdb> 101 atoms in block 161 Block first atom: 17379 Blocpdb> 98 atoms in block 162 Block first atom: 17480 Blocpdb> 106 atoms in block 163 Block first atom: 17578 Blocpdb> 101 atoms in block 164 Block first atom: 17684 Blocpdb> 128 atoms in block 165 Block first atom: 17785 Blocpdb> 113 atoms in block 166 Block first atom: 17913 Blocpdb> 102 atoms in block 167 Block first atom: 18026 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18128 Blocpdb> 130 atoms in block 169 Block first atom: 18249 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18379 Blocpdb> 117 atoms in block 171 Block first atom: 18490 Blocpdb> 96 atoms in block 172 Block first atom: 18607 Blocpdb> 83 atoms in block 173 Block first atom: 18703 Blocpdb> 93 atoms in block 174 Block first atom: 18785 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 66 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10834601 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56634 Prepmat> Matrix trace = 23865200.0001 Prepmat> Last element read: 56634 56634 178.6709 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 14124 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18878 RTB> Total mass = 18878.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18878 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 232777.5097 RTB> 37026 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 37026 Diagstd> Projected matrix trace = 232777.5097 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 232777.5097 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0005848 0.0006198 0.0007938 0.0008994 0.0013036 0.0015431 0.0023539 0.0030934 0.0032159 0.0044254 0.0060122 0.0074946 0.0089503 0.0107212 0.0135291 0.0164610 0.0182479 0.0194015 0.0201514 0.0219026 0.0300617 0.0348536 0.0403345 0.0425990 0.0465816 0.0499690 0.0626747 0.0667128 0.0687880 0.0740935 0.0912206 0.0985752 0.1046827 0.1069642 0.1193772 0.1335553 0.1511218 0.1600607 0.1782983 0.1875474 0.1918580 0.2054628 0.2202858 0.2371090 0.2583215 0.3029865 0.3251663 0.3294029 0.3421996 0.3491535 0.3720145 0.3979247 0.4033081 0.4125614 0.4433784 0.4676406 0.4973109 0.5226405 0.5803538 0.5887511 0.6393558 0.6462200 0.6580264 0.7029000 0.7259676 0.7640595 0.8086565 0.8125300 0.8583653 0.8843980 0.9515653 0.9609017 1.0011785 1.0246265 1.0817707 1.1223952 1.1394759 1.1540792 1.1798493 1.2189605 1.2800090 1.3193922 1.3537154 1.4324591 1.4468969 1.4922048 1.5248919 1.5603052 1.6245148 1.7595671 1.8365559 1.8528329 1.8989797 1.9955491 2.0164627 2.0849393 2.1405543 2.2611069 2.3893789 2.4790335 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034349 2.6260785 2.7034657 3.0594363 3.2566293 3.9207193 4.2657203 5.2684890 6.0396883 6.1581075 7.2239029 8.4199863 9.4009007 10.2733902 11.2439253 12.6307671 13.9323214 14.6690396 15.1256186 15.4151551 16.0709946 18.8278957 20.2730577 21.8088857 22.4127397 23.4370204 24.2742319 27.1857603 28.0478709 28.4807532 29.5587098 32.7975835 34.0940962 35.1344077 35.5152184 37.5194068 39.6849576 42.2142295 43.4447819 45.8531184 47.0273807 47.5647563 49.2222988 50.9669377 52.8772981 55.1919297 59.7732600 61.9224340 62.3245253 63.5235868 64.1657821 66.2331231 68.5008126 68.9626225 69.7492542 72.3073636 74.2593930 76.5789283 78.5049073 82.7259390 83.3222830 86.8293570 87.2942171 88.0880374 91.0420556 92.5238918 94.9202470 97.6511384 97.8847395 100.6077294 102.1219644 105.9289288 106.4473288 108.6553281 109.9203409 112.9439299 115.0451128 115.9171944 116.6576133 117.9528780 119.8919706 122.8575340 124.7332481 126.3452630 129.9679858 130.6213227 132.6506854 134.0956874 135.6438338 138.4066991 144.0450045 147.1625692 147.8132626 149.6426669 153.4003984 154.2021317 156.7985301 158.8760404 163.2885850 167.8563565 170.9765222 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18878 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8482E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1980E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9377E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9939E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3036E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5431E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3539E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0934E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2159E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.4254E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0122E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4946E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9503E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0721E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.3529E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6461E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8248E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9402E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0151E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1903E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0062E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.4854E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0334E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.2599E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6582E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9969E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2675E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.6713E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8788E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.4094E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1221E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8575E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1047 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1336 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1511 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1601 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1783 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1919 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2203 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2371 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3030 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3252 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3294 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3979 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4033 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5226 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5804 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5888 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8125 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8584 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8844 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9516 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.154 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.180 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.219 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.354 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.525 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.560 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.853 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.899 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.085 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.141 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.389 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.479 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00004 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99994 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00004 0.99998 1.00006 1.00005 1.00000 1.00005 1.00003 1.00003 1.00001 0.99994 0.99995 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00004 1.00001 1.00006 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99997 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 1.00006 1.00004 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99996 0.99999 1.00006 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 339804 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00004 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99994 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00004 0.99998 1.00006 1.00005 1.00000 1.00005 1.00003 1.00003 1.00001 0.99994 0.99995 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00004 1.00001 1.00006 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99997 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00004 1.00006 1.00004 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99996 0.99999 1.00006 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021438021983782.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021438021983782.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021438021983782.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021438021983782.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18878 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8482E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1980E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9377E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9939E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3036E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5431E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3539E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0934E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2159E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.4254E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0122E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4946E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9503E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0721E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.3529E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6461E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8248E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9402E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0151E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1903E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0062E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.4854E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0334E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.2599E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6582E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9969E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2675E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.6713E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8788E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.4094E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1221E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8575E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1047 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1336 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1511 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1601 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1783 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2203 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2371 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3030 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3252 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3294 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3979 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4033 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5804 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5888 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8125 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8584 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8844 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9516 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.154 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.180 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.219 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.354 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.525 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.560 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.853 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.899 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.085 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.141 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.389 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.479 Bfactors> 106 vectors, 56634 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000585 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 8.847 +/- 33.05 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -8.847 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021438021983782.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021438021983782.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.703 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.059 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.256 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.268 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.039 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.158 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.420 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.400 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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vecteur en lecture: 106.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 18878 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 40 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 84 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9201 0.0034 0.9889 0.0034 0.7714 0.0034 0.5866 0.0034 0.6691 0.0034 0.6139 2.6260 0.0703 2.7034 0.0869 3.0593 0.1480 3.2565 0.0159 3.9206 0.1669 4.2655 0.1492 5.2683 0.1441 6.0394 0.1096 6.1578 0.1039 7.2236 0.0496 8.4196 0.2293 9.4005 0.1923 10.2730 0.0285 11.2433 0.1293 12.6302 0.1271 13.9317 0.1449 14.6685 0.1346 15.1252 0.1356 15.4143 0.1699 16.0705 0.2076 18.8272 0.0261 20.2723 0.1092 21.8078 0.1898 22.4118 0.1588 23.4361 0.1412 24.2732 0.1877 27.1847 0.1637 28.0467 0.1090 28.4795 0.1641 29.5575 0.0568 32.7962 0.1329 34.0926 0.1394 35.1358 0.1007 35.5196 0.0273 37.5214 0.1364 39.6899 0.1478 42.2094 0.1655 43.4483 0.0945 45.8514 0.1621 47.0194 0.1510 47.5679 0.1421 49.2246 0.0246 50.9664 0.1126 52.8740 0.1110 55.1873 0.0928 59.7720 0.1760 61.9230 0.0686 62.3216 0.1452 63.5209 0.1065 64.1673 0.2084 66.2290 0.3260 68.4957 0.2564 68.9590 0.1229 69.7495 0.1747 72.3060 0.1054 74.2530 0.1177 76.5748 0.0929 78.4985 0.1623 82.7257 0.1817 83.3222 0.1706 86.8286 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021438021983782.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021438021983782.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021438021983782 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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running: ../../bin/get_modes.sh 2607021438021983782 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021438021983782.eigenfacs 2607021438021983782.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021438021983782.eigenfacs 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