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***  AF2MV3_model3  ***

LOGs for ID: 2607021439531994767

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021439531994767.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021439531994767.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021439531994767.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18882 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 99.174537 +/- 22.174209 From: 38.300000 To: 176.060000 = 103.570585 +/- 36.466180 From: 19.300000 To: 195.060000 = 108.103146 +/- 25.853485 From: 26.620000 To: 187.750000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSP ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'ASH ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 35 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.9814 % Filled. Pdbmat> 10760640 non-zero elements. Pdbmat> 1185006 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 125.52 +/- 58.16 Maximum number = 252 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.370012E+07 Pdbmat> Larger element = 890.819 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1216 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021439531994767.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021439531994767.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021439531994767.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18882 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1216 residues. Blocpdb> 106 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 109 atoms in block 2 Block first atom: 107 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 216 Blocpdb> 109 atoms in block 4 Block first atom: 299 Blocpdb> 118 atoms in block 5 Block first atom: 408 Blocpdb> 82 atoms in block 6 Block first atom: 526 Blocpdb> 116 atoms in block 7 Block first atom: 608 Blocpdb> 90 atoms in block 8 Block first atom: 724 Blocpdb> 127 atoms in block 9 Block first atom: 814 Blocpdb> 141 atoms in block 10 Block first atom: 941 Blocpdb> 137 atoms in block 11 Block first atom: 1082 Blocpdb> 114 atoms in block 12 Block first atom: 1219 Blocpdb> 136 atoms in block 13 Block first atom: 1333 Blocpdb> 104 atoms in block 14 Block first atom: 1469 Blocpdb> 124 atoms in block 15 Block first atom: 1573 Blocpdb> 108 atoms in block 16 Block first atom: 1697 Blocpdb> 133 atoms in block 17 Block first atom: 1805 Blocpdb> 117 atoms in block 18 Block first atom: 1938 Blocpdb> 127 atoms in block 19 Block first atom: 2055 Blocpdb> 139 atoms in block 20 Block first atom: 2182 Blocpdb> 108 atoms in block 21 Block first atom: 2321 Blocpdb> 111 atoms in block 22 Block first atom: 2429 Blocpdb> 124 atoms in block 23 Block first atom: 2540 Blocpdb> 97 atoms in block 24 Block first atom: 2664 Blocpdb> 110 atoms in block 25 Block first atom: 2761 Blocpdb> 119 atoms in block 26 Block first atom: 2871 Blocpdb> 98 atoms in block 27 Block first atom: 2990 Blocpdb> 131 atoms in block 28 Block first atom: 3088 Blocpdb> 104 atoms in block 29 Block first atom: 3219 Blocpdb> 93 atoms in block 30 Block first atom: 3323 Blocpdb> 99 atoms in block 31 Block first atom: 3416 Blocpdb> 109 atoms in block 32 Block first atom: 3515 Blocpdb> 110 atoms in block 33 Block first atom: 3624 Blocpdb> 82 atoms in block 34 Block first atom: 3734 Blocpdb> 126 atoms in block 35 Block first atom: 3816 Blocpdb> 107 atoms in block 36 Block first atom: 3942 Blocpdb> 120 atoms in block 37 Block first atom: 4049 Blocpdb> 126 atoms in block 38 Block first atom: 4169 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 4295 Blocpdb> 134 atoms in block 40 Block first atom: 4408 Blocpdb> 110 atoms in block 41 Block first atom: 4542 Blocpdb> 113 atoms in block 42 Block first atom: 4652 Blocpdb> 112 atoms in block 43 Block first atom: 4765 Blocpdb> 102 atoms in block 44 Block first atom: 4877 Blocpdb> 105 atoms in block 45 Block first atom: 4979 Blocpdb> 121 atoms in block 46 Block first atom: 5084 Blocpdb> 104 atoms in block 47 Block first atom: 5205 Blocpdb> 111 atoms in block 48 Block first atom: 5309 Blocpdb> 101 atoms in block 49 Block first atom: 5420 Blocpdb> 109 atoms in block 50 Block first atom: 5521 Blocpdb> 113 atoms in block 51 Block first atom: 5630 Blocpdb> 92 atoms in block 52 Block first atom: 5743 Blocpdb> 85 atoms in block 53 Block first atom: 5835 Blocpdb> 68 atoms in block 54 Block first atom: 5920 Blocpdb> 89 atoms in block 55 Block first atom: 5988 Blocpdb> 94 atoms in block 56 Block first atom: 6077 Blocpdb> 103 atoms in block 57 Block first atom: 6171 Blocpdb> 149 atoms in block 58 Block first atom: 6274 Blocpdb> 105 atoms in block 59 Block first atom: 6423 Blocpdb> 88 atoms in block 60 Block first atom: 6528 Blocpdb> 91 atoms in block 61 Block first atom: 6616 Blocpdb> 111 atoms in block 62 Block first atom: 6707 Blocpdb> 92 atoms in block 63 Block first atom: 6818 Blocpdb> 112 atoms in block 64 Block first atom: 6910 Blocpdb> 101 atoms in block 65 Block first atom: 7022 Blocpdb> 110 atoms in block 66 Block first atom: 7123 Blocpdb> 90 atoms in block 67 Block first atom: 7233 Blocpdb> 109 atoms in block 68 Block first atom: 7323 Blocpdb> 86 atoms in block 69 Block first atom: 7432 Blocpdb> 107 atoms in block 70 Block first atom: 7518 Blocpdb> 123 atoms in block 71 Block first atom: 7625 Blocpdb> 88 atoms in block 72 Block first atom: 7748 Blocpdb> 110 atoms in block 73 Block first atom: 7836 Blocpdb> 86 atoms in block 74 Block first atom: 7946 Blocpdb> 105 atoms in block 75 Block first atom: 8032 Blocpdb> 71 atoms in block 76 Block first atom: 8137 Blocpdb> 115 atoms in block 77 Block first atom: 8208 Blocpdb> 99 atoms in block 78 Block first atom: 8323 Blocpdb> 83 atoms in block 79 Block first atom: 8422 Blocpdb> 84 atoms in block 80 Block first atom: 8505 Blocpdb> 91 atoms in block 81 Block first atom: 8589 Blocpdb> 97 atoms in block 82 Block first atom: 8680 Blocpdb> 123 atoms in block 83 Block first atom: 8777 Blocpdb> 81 atoms in block 84 Block first atom: 8900 Blocpdb> 86 atoms in block 85 Block first atom: 8981 Blocpdb> 103 atoms in block 86 Block first atom: 9067 Blocpdb> 102 atoms in block 87 Block first atom: 9170 Blocpdb> 89 atoms in block 88 Block first atom: 9272 Blocpdb> 91 atoms in block 89 Block first atom: 9361 Blocpdb> 123 atoms in block 90 Block first atom: 9452 Blocpdb> 113 atoms in block 91 Block first atom: 9575 Blocpdb> 89 atoms in block 92 Block first atom: 9688 Blocpdb> 108 atoms in block 93 Block first atom: 9777 Blocpdb> 115 atoms in block 94 Block first atom: 9885 Blocpdb> 87 atoms in block 95 Block first atom: 10000 Blocpdb> 89 atoms in block 96 Block first atom: 10087 Blocpdb> 73 atoms in block 97 Block first atom: 10176 Blocpdb> 66 atoms in block 98 Block first atom: 10249 Blocpdb> 107 atoms in block 99 Block first atom: 10315 Blocpdb> 134 atoms in block 100 Block first atom: 10422 Blocpdb> 128 atoms in block 101 Block first atom: 10556 Blocpdb> 127 atoms in block 102 Block first atom: 10684 Blocpdb> 133 atoms in block 103 Block first atom: 10811 Blocpdb> 112 atoms in block 104 Block first atom: 10944 Blocpdb> 102 atoms in block 105 Block first atom: 11056 Blocpdb> 115 atoms in block 106 Block first atom: 11158 Blocpdb> 121 atoms in block 107 Block first atom: 11273 Blocpdb> 123 atoms in block 108 Block first atom: 11394 Blocpdb> 116 atoms in block 109 Block first atom: 11517 Blocpdb> 97 atoms in block 110 Block first atom: 11633 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11730 Blocpdb> 104 atoms in block 112 Block first atom: 11836 Blocpdb> 88 atoms in block 113 Block first atom: 11940 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12028 Blocpdb> 123 atoms in block 115 Block first atom: 12142 Blocpdb> 97 atoms in block 116 Block first atom: 12265 Blocpdb> 125 atoms in block 117 Block first atom: 12362 Blocpdb> 128 atoms in block 118 Block first atom: 12487 Blocpdb> 126 atoms in block 119 Block first atom: 12615 Blocpdb> 112 atoms in block 120 Block first atom: 12741 Blocpdb> 114 atoms in block 121 Block first atom: 12853 Blocpdb> 135 atoms in block 122 Block first atom: 12967 Blocpdb> 115 atoms in block 123 Block first atom: 13102 Blocpdb> 107 atoms in block 124 Block first atom: 13217 Blocpdb> 106 atoms in block 125 Block first atom: 13324 Blocpdb> 105 atoms in block 126 Block first atom: 13430 Blocpdb> 107 atoms in block 127 Block first atom: 13535 Blocpdb> 88 atoms in block 128 Block first atom: 13642 Blocpdb> 109 atoms in block 129 Block first atom: 13730 Blocpdb> 116 atoms in block 130 Block first atom: 13839 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13955 Blocpdb> 119 atoms in block 132 Block first atom: 14082 Blocpdb> 105 atoms in block 133 Block first atom: 14201 Blocpdb> 112 atoms in block 134 Block first atom: 14306 Blocpdb> 129 atoms in block 135 Block first atom: 14418 Blocpdb> 108 atoms in block 136 Block first atom: 14547 Blocpdb> 110 atoms in block 137 Block first atom: 14655 Blocpdb> 112 atoms in block 138 Block first atom: 14765 Blocpdb> 106 atoms in block 139 Block first atom: 14877 Blocpdb> 113 atoms in block 140 Block first atom: 14983 Blocpdb> 102 atoms in block 141 Block first atom: 15096 Blocpdb> 125 atoms in block 142 Block first atom: 15198 Blocpdb> 117 atoms in block 143 Block first atom: 15323 Blocpdb> 112 atoms in block 144 Block first atom: 15440 Blocpdb> 138 atoms in block 145 Block first atom: 15552 Blocpdb> 109 atoms in block 146 Block first atom: 15690 Blocpdb> 109 atoms in block 147 Block first atom: 15799 Blocpdb> 120 atoms in block 148 Block first atom: 15908 Blocpdb> 125 atoms in block 149 Block first atom: 16028 Blocpdb> 99 atoms in block 150 Block first atom: 16153 Blocpdb> 113 atoms in block 151 Block first atom: 16252 Blocpdb> 110 atoms in block 152 Block first atom: 16365 Blocpdb> 121 atoms in block 153 Block first atom: 16475 Blocpdb> 103 atoms in block 154 Block first atom: 16596 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16699 Blocpdb> 92 atoms in block 156 Block first atom: 16809 Blocpdb> 109 atoms in block 157 Block first atom: 16901 Blocpdb> 120 atoms in block 158 Block first atom: 17010 Blocpdb> 126 atoms in block 159 Block first atom: 17130 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17256 Blocpdb> 101 atoms in block 161 Block first atom: 17382 Blocpdb> 98 atoms in block 162 Block first atom: 17483 Blocpdb> 106 atoms in block 163 Block first atom: 17581 Blocpdb> 102 atoms in block 164 Block first atom: 17687 Blocpdb> 128 atoms in block 165 Block first atom: 17789 Blocpdb> 113 atoms in block 166 Block first atom: 17917 Blocpdb> 101 atoms in block 167 Block first atom: 18030 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18131 Blocpdb> 130 atoms in block 169 Block first atom: 18252 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18382 Blocpdb> 118 atoms in block 171 Block first atom: 18493 Blocpdb> 96 atoms in block 172 Block first atom: 18611 Blocpdb> 83 atoms in block 173 Block first atom: 18707 Blocpdb> 93 atoms in block 174 Block first atom: 18789 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 66 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10760814 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56646 Prepmat> Matrix trace = 23700120.0001 Prepmat> Last element read: 56646 56646 26.3014 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 14172 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18882 RTB> Total mass = 18882.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18882 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 228185.9991 RTB> 35298 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 35298 Diagstd> Projected matrix trace = 228185.9991 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 228185.9991 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0002277 0.0003123 0.0004997 0.0008542 0.0010873 0.0017185 0.0018829 0.0032730 0.0043016 0.0052870 0.0067273 0.0078940 0.0087698 0.0104433 0.0113080 0.0146401 0.0206063 0.0225912 0.0313051 0.0404486 0.0459439 0.0461981 0.0513499 0.0542516 0.0588585 0.0658076 0.0796050 0.0870281 0.0983958 0.1069288 0.1093193 0.1233545 0.1275792 0.1360539 0.1482546 0.1556503 0.1576629 0.1661325 0.1910044 0.2026787 0.2201018 0.2474781 0.2598336 0.2693844 0.3011740 0.3158610 0.3295327 0.3363014 0.3551465 0.3890034 0.4066535 0.4210471 0.4659699 0.4996812 0.5117127 0.5142579 0.5524452 0.5768617 0.6044704 0.6572313 0.6786948 0.6874193 0.7222369 0.7441932 0.8035562 0.8393993 0.8516035 0.9053019 0.9282038 0.9844743 1.0152460 1.0497005 1.0911142 1.1107542 1.1386973 1.2136035 1.2434227 1.3024215 1.3879092 1.4646609 1.5150804 1.5696798 1.5914049 1.6249815 1.6656752 1.7269613 1.7574735 1.8082822 1.8403242 1.8732351 1.8780022 1.9400645 1.9752938 2.0149787 2.0468126 2.0551507 2.1271655 2.2144178 2.2418260 2.3531086 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034341 0.0034342 0.0034346 1.6386598 1.9189673 2.4274386 3.1737070 3.5806949 4.5016588 4.7119949 6.2125109 7.1221719 7.8958447 8.9066715 9.6481268 10.1692719 11.0972407 11.5475107 13.1391562 15.5881780 16.3216907 19.2133464 21.8397238 23.2760417 23.3403363 24.6073693 25.2930603 26.3451071 27.8569402 30.6383522 32.0350203 34.0630457 35.5093435 35.9040764 38.1393098 38.7869084 40.0544456 41.8118478 42.8420582 43.1181372 44.2611419 47.4588232 48.8876693 50.9456493 54.0211300 55.3532240 56.3613659 59.5942067 61.0299900 62.3368079 62.9737610 64.7141243 67.7285804 69.2480462 70.4629198 74.1266200 76.7612071 77.6798504 77.8727926 80.7123324 82.4766739 84.4272774 88.0348043 89.4607534 90.0339155 92.2858528 93.6781118 97.3427054 99.4900367 100.2106763 103.3218054 104.6205371 107.7450844 109.4160248 111.2571639 113.4306392 114.4469606 115.8775827 119.6282345 121.0889971 123.9284631 127.9310059 131.4207126 133.6635893 136.0507112 136.9889793 138.4265811 140.1491404 142.7041430 143.9592803 146.0253914 147.3134675 148.6248495 148.8138432 151.2527809 152.6198869 154.1453782 155.3582519 155.6743700 158.3783886 161.5939384 162.5908970 166.5774727 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18882 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2771E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1228E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9970E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.5417E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0873E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7185E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8829E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2730E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.3016E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2870E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7273E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.8940E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7698E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0443E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1308E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4640E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0606E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2591E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.1305E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0449E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5944E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6198E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1350E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4252E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8859E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.5808E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.9605E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7028E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.8396E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1276 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1483 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1577 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2598 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3363 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3551 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3890 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4210 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4660 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5143 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6572 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6787 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7442 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8516 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.111 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.465 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.515 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.625 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.757 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.808 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.878 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.015 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.047 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.242 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.353 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99996 0.99997 1.00001 1.00003 1.00003 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00004 1.00002 1.00000 1.00005 0.99995 1.00006 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99996 1.00003 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 339876 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99996 0.99997 1.00001 1.00003 1.00003 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00004 1.00002 1.00000 1.00005 0.99995 1.00006 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 0.99997 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99996 1.00003 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021439531994767.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021439531994767.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021439531994767.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021439531994767.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18882 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2771E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1228E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9970E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.5417E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0873E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7185E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8829E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2730E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.3016E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2870E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7273E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.8940E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7698E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0443E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.1308E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4640E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0606E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2591E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.1305E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0449E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5944E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6198E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1350E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4252E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8859E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.5808E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.9605E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7028E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.8396E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1276 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1483 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2598 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3363 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3551 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3890 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4210 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4660 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6572 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6787 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7442 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8516 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.111 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.465 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.515 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.625 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.757 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.808 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.878 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.975 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.047 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.242 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.353 Bfactors> 106 vectors, 56646 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000228 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 14.123 +/- 67.17 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -14.123 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021439531994767.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021439531994767.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.427 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.501 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.906 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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vecteur en lecture: 111.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 18882 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 24 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9661 0.0034 0.7426 0.0034 0.6244 0.0034 0.7833 0.0034 0.9219 0.0034 0.6130 1.6386 0.0339 1.9189 0.0371 2.4273 0.0549 3.1736 0.0355 3.5806 0.0360 4.5014 0.0341 4.7118 0.0806 6.2123 0.0687 7.1218 0.1534 7.8955 0.1392 8.9063 0.2489 9.6477 0.0933 10.1688 0.1004 11.0966 0.0937 11.5470 0.0467 13.1385 0.0939 15.5874 0.1094 16.3209 0.2439 19.2125 0.0857 21.8389 0.0589 23.2751 0.1195 23.3393 0.1201 24.6063 0.1301 25.2921 0.1368 26.3441 0.0896 27.8558 0.0831 30.6370 0.2222 32.0336 0.1288 34.0616 0.1345 35.5030 0.0948 35.8994 0.1284 38.1447 0.2315 38.7884 0.1816 40.0595 0.1131 41.8165 0.1109 42.8471 0.0842 43.1214 0.0938 44.2549 0.1849 47.4562 0.1220 48.8881 0.2074 50.9433 0.3553 54.0212 0.1130 55.3473 0.1154 56.3606 0.1663 59.5942 0.2188 61.0311 0.0927 62.3310 0.0614 62.9709 0.1444 64.7071 0.2685 67.7254 0.2117 69.2490 0.2127 70.4560 0.1174 74.1258 0.0918 76.7594 0.1839 77.6756 0.0800 77.8726 0.1721 80.7056 0.2211 82.4759 0.1776 84.4257 0.1868 88.0289 0.1930 89.4573 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structure for DQ=-60 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom making animated gifs 11 models are in 2607021439531994767.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021439531994767.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021439531994767.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021439531994767 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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running: ../../bin/get_modes.sh 2607021439531994767 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021439531994767.eigenfacs 2607021439531994767.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021439531994767.eigenfacs 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