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***  AF2MV3_model4  ***

LOGs for ID: 2607021444072006537

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2607021444072006537.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2607021444072006537.atom to be opened. Openam> File opened: 2607021444072006537.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18879 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 99.142959 +/- 24.937251 From: 30.600000 To: 178.210000 = 116.674200 +/- 35.167561 From: 26.880000 To: 181.930000 = 100.283468 +/- 26.582311 From: 21.140000 To: 187.680000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HSP ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HSD ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 34 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -1.9515 % Filled. Pdbmat> 10607783 non-zero elements. Pdbmat> 1168030 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 123.74 +/- 58.82 Maximum number = 257 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 2.336060E+07 Pdbmat> Larger element = 901.216 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1216 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2607021444072006537.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2607021444072006537.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2607021444072006537.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 18879 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1216 residues. Blocpdb> 106 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 109 atoms in block 2 Block first atom: 107 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 216 Blocpdb> 109 atoms in block 4 Block first atom: 299 Blocpdb> 118 atoms in block 5 Block first atom: 408 Blocpdb> 82 atoms in block 6 Block first atom: 526 Blocpdb> 116 atoms in block 7 Block first atom: 608 Blocpdb> 90 atoms in block 8 Block first atom: 724 Blocpdb> 127 atoms in block 9 Block first atom: 814 Blocpdb> 141 atoms in block 10 Block first atom: 941 Blocpdb> 137 atoms in block 11 Block first atom: 1082 Blocpdb> 114 atoms in block 12 Block first atom: 1219 Blocpdb> 136 atoms in block 13 Block first atom: 1333 Blocpdb> 104 atoms in block 14 Block first atom: 1469 Blocpdb> 124 atoms in block 15 Block first atom: 1573 Blocpdb> 108 atoms in block 16 Block first atom: 1697 Blocpdb> 133 atoms in block 17 Block first atom: 1805 Blocpdb> 117 atoms in block 18 Block first atom: 1938 Blocpdb> 127 atoms in block 19 Block first atom: 2055 Blocpdb> 139 atoms in block 20 Block first atom: 2182 Blocpdb> 108 atoms in block 21 Block first atom: 2321 Blocpdb> 110 atoms in block 22 Block first atom: 2429 Blocpdb> 124 atoms in block 23 Block first atom: 2539 Blocpdb> 97 atoms in block 24 Block first atom: 2663 Blocpdb> 110 atoms in block 25 Block first atom: 2760 Blocpdb> 119 atoms in block 26 Block first atom: 2870 Blocpdb> 98 atoms in block 27 Block first atom: 2989 Blocpdb> 131 atoms in block 28 Block first atom: 3087 Blocpdb> 104 atoms in block 29 Block first atom: 3218 Blocpdb> 93 atoms in block 30 Block first atom: 3322 Blocpdb> 99 atoms in block 31 Block first atom: 3415 Blocpdb> 109 atoms in block 32 Block first atom: 3514 Blocpdb> 110 atoms in block 33 Block first atom: 3623 Blocpdb> 82 atoms in block 34 Block first atom: 3733 Blocpdb> 126 atoms in block 35 Block first atom: 3815 Blocpdb> 107 atoms in block 36 Block first atom: 3941 Blocpdb> 120 atoms in block 37 Block first atom: 4048 Blocpdb> 126 atoms in block 38 Block first atom: 4168 Blocpdb> 113 atoms in block 39 Block first atom: 4294 Blocpdb> 134 atoms in block 40 Block first atom: 4407 Blocpdb> 110 atoms in block 41 Block first atom: 4541 Blocpdb> 113 atoms in block 42 Block first atom: 4651 Blocpdb> 112 atoms in block 43 Block first atom: 4764 Blocpdb> 102 atoms in block 44 Block first atom: 4876 Blocpdb> 105 atoms in block 45 Block first atom: 4978 Blocpdb> 121 atoms in block 46 Block first atom: 5083 Blocpdb> 104 atoms in block 47 Block first atom: 5204 Blocpdb> 111 atoms in block 48 Block first atom: 5308 Blocpdb> 101 atoms in block 49 Block first atom: 5419 Blocpdb> 109 atoms in block 50 Block first atom: 5520 Blocpdb> 113 atoms in block 51 Block first atom: 5629 Blocpdb> 92 atoms in block 52 Block first atom: 5742 Blocpdb> 85 atoms in block 53 Block first atom: 5834 Blocpdb> 68 atoms in block 54 Block first atom: 5919 Blocpdb> 89 atoms in block 55 Block first atom: 5987 Blocpdb> 94 atoms in block 56 Block first atom: 6076 Blocpdb> 103 atoms in block 57 Block first atom: 6170 Blocpdb> 149 atoms in block 58 Block first atom: 6273 Blocpdb> 105 atoms in block 59 Block first atom: 6422 Blocpdb> 88 atoms in block 60 Block first atom: 6527 Blocpdb> 91 atoms in block 61 Block first atom: 6615 Blocpdb> 111 atoms in block 62 Block first atom: 6706 Blocpdb> 92 atoms in block 63 Block first atom: 6817 Blocpdb> 112 atoms in block 64 Block first atom: 6909 Blocpdb> 101 atoms in block 65 Block first atom: 7021 Blocpdb> 110 atoms in block 66 Block first atom: 7122 Blocpdb> 90 atoms in block 67 Block first atom: 7232 Blocpdb> 109 atoms in block 68 Block first atom: 7322 Blocpdb> 86 atoms in block 69 Block first atom: 7431 Blocpdb> 107 atoms in block 70 Block first atom: 7517 Blocpdb> 123 atoms in block 71 Block first atom: 7624 Blocpdb> 88 atoms in block 72 Block first atom: 7747 Blocpdb> 110 atoms in block 73 Block first atom: 7835 Blocpdb> 86 atoms in block 74 Block first atom: 7945 Blocpdb> 105 atoms in block 75 Block first atom: 8031 Blocpdb> 71 atoms in block 76 Block first atom: 8136 Blocpdb> 115 atoms in block 77 Block first atom: 8207 Blocpdb> 99 atoms in block 78 Block first atom: 8322 Blocpdb> 83 atoms in block 79 Block first atom: 8421 Blocpdb> 84 atoms in block 80 Block first atom: 8504 Blocpdb> 91 atoms in block 81 Block first atom: 8588 Blocpdb> 97 atoms in block 82 Block first atom: 8679 Blocpdb> 123 atoms in block 83 Block first atom: 8776 Blocpdb> 81 atoms in block 84 Block first atom: 8899 Blocpdb> 86 atoms in block 85 Block first atom: 8980 Blocpdb> 103 atoms in block 86 Block first atom: 9066 Blocpdb> 102 atoms in block 87 Block first atom: 9169 Blocpdb> 89 atoms in block 88 Block first atom: 9271 Blocpdb> 91 atoms in block 89 Block first atom: 9360 Blocpdb> 123 atoms in block 90 Block first atom: 9451 Blocpdb> 113 atoms in block 91 Block first atom: 9574 Blocpdb> 89 atoms in block 92 Block first atom: 9687 Blocpdb> 108 atoms in block 93 Block first atom: 9776 Blocpdb> 115 atoms in block 94 Block first atom: 9884 Blocpdb> 87 atoms in block 95 Block first atom: 9999 Blocpdb> 89 atoms in block 96 Block first atom: 10086 Blocpdb> 73 atoms in block 97 Block first atom: 10175 Blocpdb> 66 atoms in block 98 Block first atom: 10248 Blocpdb> 107 atoms in block 99 Block first atom: 10314 Blocpdb> 134 atoms in block 100 Block first atom: 10421 Blocpdb> 128 atoms in block 101 Block first atom: 10555 Blocpdb> 127 atoms in block 102 Block first atom: 10683 Blocpdb> 133 atoms in block 103 Block first atom: 10810 Blocpdb> 112 atoms in block 104 Block first atom: 10943 Blocpdb> 102 atoms in block 105 Block first atom: 11055 Blocpdb> 114 atoms in block 106 Block first atom: 11157 Blocpdb> 121 atoms in block 107 Block first atom: 11271 Blocpdb> 123 atoms in block 108 Block first atom: 11392 Blocpdb> 116 atoms in block 109 Block first atom: 11515 Blocpdb> 97 atoms in block 110 Block first atom: 11631 Blocpdb> 106 atoms in block 111 Block first atom: 11728 Blocpdb> 104 atoms in block 112 Block first atom: 11834 Blocpdb> 88 atoms in block 113 Block first atom: 11938 Blocpdb> 114 atoms in block 114 Block first atom: 12026 Blocpdb> 123 atoms in block 115 Block first atom: 12140 Blocpdb> 97 atoms in block 116 Block first atom: 12263 Blocpdb> 125 atoms in block 117 Block first atom: 12360 Blocpdb> 128 atoms in block 118 Block first atom: 12485 Blocpdb> 126 atoms in block 119 Block first atom: 12613 Blocpdb> 112 atoms in block 120 Block first atom: 12739 Blocpdb> 114 atoms in block 121 Block first atom: 12851 Blocpdb> 135 atoms in block 122 Block first atom: 12965 Blocpdb> 115 atoms in block 123 Block first atom: 13100 Blocpdb> 107 atoms in block 124 Block first atom: 13215 Blocpdb> 106 atoms in block 125 Block first atom: 13322 Blocpdb> 105 atoms in block 126 Block first atom: 13428 Blocpdb> 107 atoms in block 127 Block first atom: 13533 Blocpdb> 88 atoms in block 128 Block first atom: 13640 Blocpdb> 109 atoms in block 129 Block first atom: 13728 Blocpdb> 116 atoms in block 130 Block first atom: 13837 Blocpdb> 127 atoms in block 131 Block first atom: 13953 Blocpdb> 119 atoms in block 132 Block first atom: 14080 Blocpdb> 104 atoms in block 133 Block first atom: 14199 Blocpdb> 112 atoms in block 134 Block first atom: 14303 Blocpdb> 128 atoms in block 135 Block first atom: 14415 Blocpdb> 108 atoms in block 136 Block first atom: 14543 Blocpdb> 110 atoms in block 137 Block first atom: 14651 Blocpdb> 112 atoms in block 138 Block first atom: 14761 Blocpdb> 106 atoms in block 139 Block first atom: 14873 Blocpdb> 113 atoms in block 140 Block first atom: 14979 Blocpdb> 103 atoms in block 141 Block first atom: 15092 Blocpdb> 125 atoms in block 142 Block first atom: 15195 Blocpdb> 117 atoms in block 143 Block first atom: 15320 Blocpdb> 112 atoms in block 144 Block first atom: 15437 Blocpdb> 138 atoms in block 145 Block first atom: 15549 Blocpdb> 109 atoms in block 146 Block first atom: 15687 Blocpdb> 109 atoms in block 147 Block first atom: 15796 Blocpdb> 120 atoms in block 148 Block first atom: 15905 Blocpdb> 125 atoms in block 149 Block first atom: 16025 Blocpdb> 99 atoms in block 150 Block first atom: 16150 Blocpdb> 113 atoms in block 151 Block first atom: 16249 Blocpdb> 110 atoms in block 152 Block first atom: 16362 Blocpdb> 121 atoms in block 153 Block first atom: 16472 Blocpdb> 103 atoms in block 154 Block first atom: 16593 Blocpdb> 110 atoms in block 155 Block first atom: 16696 Blocpdb> 92 atoms in block 156 Block first atom: 16806 Blocpdb> 109 atoms in block 157 Block first atom: 16898 Blocpdb> 120 atoms in block 158 Block first atom: 17007 Blocpdb> 126 atoms in block 159 Block first atom: 17127 Blocpdb> 126 atoms in block 160 Block first atom: 17253 Blocpdb> 101 atoms in block 161 Block first atom: 17379 Blocpdb> 98 atoms in block 162 Block first atom: 17480 Blocpdb> 106 atoms in block 163 Block first atom: 17578 Blocpdb> 101 atoms in block 164 Block first atom: 17684 Blocpdb> 129 atoms in block 165 Block first atom: 17785 Blocpdb> 113 atoms in block 166 Block first atom: 17914 Blocpdb> 101 atoms in block 167 Block first atom: 18027 Blocpdb> 121 atoms in block 168 Block first atom: 18128 Blocpdb> 130 atoms in block 169 Block first atom: 18249 Blocpdb> 111 atoms in block 170 Block first atom: 18379 Blocpdb> 118 atoms in block 171 Block first atom: 18490 Blocpdb> 96 atoms in block 172 Block first atom: 18608 Blocpdb> 83 atoms in block 173 Block first atom: 18704 Blocpdb> 93 atoms in block 174 Block first atom: 18786 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 149 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 66 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10607957 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 56637 Prepmat> Matrix trace = 23360600.0001 Prepmat> Last element read: 56637 56637 156.4522 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 14198 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 18879 RTB> Total mass = 18879.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 18879 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 223131.6397 RTB> 34362 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 34362 Diagstd> Projected matrix trace = 223131.6397 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 223131.6397 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0002074 0.0002682 0.0005443 0.0012005 0.0017246 0.0021983 0.0023434 0.0026516 0.0040880 0.0048617 0.0055842 0.0068815 0.0099595 0.0105515 0.0122218 0.0150319 0.0156289 0.0183901 0.0195882 0.0267317 0.0308855 0.0389298 0.0450624 0.0571979 0.0587151 0.0635135 0.0672098 0.0696612 0.0758006 0.0820956 0.0891839 0.1026795 0.1109566 0.1130405 0.1197919 0.1349494 0.1373606 0.1426159 0.1585342 0.1856807 0.1907991 0.2076792 0.2205794 0.2302851 0.2447195 0.2654018 0.2706358 0.3030358 0.3120109 0.3341774 0.3409738 0.3694986 0.3820928 0.4160571 0.4352562 0.4435848 0.4753677 0.4953144 0.5229378 0.5409890 0.5550568 0.5942322 0.6064930 0.6380244 0.6524349 0.6883297 0.7062798 0.7674765 0.7844688 0.7935504 0.8400642 0.8794427 0.9480580 0.9661624 1.0007886 1.0266373 1.0985651 1.1191719 1.1688876 1.1880764 1.2021767 1.2860662 1.3172181 1.3335644 1.3461678 1.3876401 1.4724162 1.5257699 1.6528811 1.6932829 1.7365934 1.8232751 1.8495713 1.9206748 1.9605924 2.0237195 2.0336122 2.0677438 2.1573480 2.2993118 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034338 0.0034338 0.0034339 0.0034340 0.0034340 0.0034374 1.5639761 1.7784863 2.5333509 3.7624449 4.5096110 5.0914444 5.2567540 5.5917734 6.9430645 7.5716120 8.1147504 9.0081791 10.8371427 11.1545577 12.0050398 13.3138238 13.5755997 14.7261008 15.1982011 17.7545153 19.0841471 21.4257551 23.0516782 25.9707936 26.3129957 27.3670654 28.1521541 28.6609705 29.8972768 31.1139561 32.4293697 34.7966211 36.1719412 36.5100346 37.5845183 39.8915312 40.2463444 41.0090128 43.2371184 46.7927604 47.4333129 49.4870734 51.0008883 52.1108586 53.7192033 55.9431911 56.4921241 59.7781167 60.6568904 62.7745816 63.4097162 66.0087783 67.1242860 70.0441322 71.6420126 72.3241913 74.8703897 76.4250522 78.5272331 79.8710709 80.9028826 83.7092357 84.5684148 86.7389035 87.7129810 90.0935133 91.2606763 95.1322642 96.1796326 96.7347528 99.5294307 101.8354658 105.7335280 106.7383167 108.6341712 110.0281493 113.8172728 114.8798027 117.4036631 118.3634107 119.0637146 123.1478812 124.6304381 125.4013704 125.9925550 127.9186006 131.7681902 134.1342868 139.6098589 141.3058169 143.1015568 146.6295107 147.6831063 150.4950425 152.0508784 154.4793526 154.8564680 156.1505947 159.4980530 164.6623147 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 18879 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0020E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0743E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6823E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4425E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2005E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7246E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1983E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3434E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6516E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0880E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8617E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5842E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.8815E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9595E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0551E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2222E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5032E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5629E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8390E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.9588E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.6732E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0886E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8930E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.5062E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.7198E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8715E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3513E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.7210E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.9661E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.5801E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2096E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9184E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1110 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1198 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1585 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1908 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2706 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3030 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3695 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3821 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4436 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4953 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5551 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6065 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7063 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7675 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9481 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.119 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.202 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.346 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.388 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.472 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.526 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.693 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.823 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.921 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.961 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.024 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.034 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.157 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.299 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00005 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99995 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 0.99998 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00003 0.99997 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00004 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 339822 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00005 1.00002 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99995 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00004 0.99998 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00003 1.00003 0.99997 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00004 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021444072006537.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021444072006537.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2607021444072006537.atom Openam> file on opening on unit 11: 2607021444072006537.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1216 First residue number = 1 Last residue number = 854 Number of atoms found = 18879 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0020E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0743E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6823E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4425E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2005E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.7246E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1983E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3434E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6516E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.0880E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8617E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5842E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.8815E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9595E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0551E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2222E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5032E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5629E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8390E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.9588E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.6732E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0886E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8930E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.5062E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.7198E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8715E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3513E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.7210E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.9661E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.5801E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2096E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9184E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1110 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1198 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1585 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2706 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3030 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3695 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3821 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4436 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4953 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5551 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6065 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6380 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7675 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9481 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.119 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.202 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.346 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.388 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.472 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.526 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.693 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.823 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.921 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.961 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.024 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.034 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.157 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.299 Bfactors> 106 vectors, 56637 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000207 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 14.335 +/- 66.17 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -14.335 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2607021444072006537.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2607021444072006537.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4372E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.564 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.592 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.943 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.571 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.70 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vecteur en lecture: 101.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.6 Chkmod> 106 vectors, 56637 coordinates in file. Chkmod> That is: 18879 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 33 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7677 0.0034 0.6239 0.0034 0.6701 0.0034 0.9752 0.0034 0.9896 0.0034 0.6847 1.5639 0.0456 1.7784 0.0370 2.5332 0.0872 3.7623 0.0685 4.5094 0.1515 5.0912 0.1416 5.2565 0.1559 5.5915 0.0909 6.9428 0.1166 7.5713 0.1619 8.1144 0.2181 9.0078 0.2292 10.8367 0.1619 11.1538 0.1026 12.0046 0.1426 13.3133 0.1060 13.5751 0.1606 14.7254 0.2400 15.1975 0.2280 17.7538 0.1382 19.0835 0.1950 21.4249 0.0555 23.0506 0.1801 25.9697 0.1812 26.3118 0.1486 27.3658 0.2436 28.1510 0.1130 28.6597 0.1362 29.8961 0.1534 31.1127 0.2516 32.4280 0.2156 34.7986 0.5291 36.1775 0.2075 36.5019 0.0069 37.5842 0.1521 39.8825 0.3214 40.2504 0.2911 41.0050 0.2515 43.2306 0.2117 46.7932 0.2545 47.4314 0.2376 49.4874 0.2129 51.0011 0.4603 52.1103 0.1707 53.7148 0.1105 55.9406 0.1041 56.4860 0.0793 59.7720 0.1553 60.6532 0.2633 62.7740 0.1774 63.4094 0.1713 66.0061 0.2009 67.1220 0.1766 70.0447 0.0698 71.6425 0.1713 72.3223 0.1448 74.8697 0.1287 76.4207 0.1359 78.5210 0.2013 79.8685 0.1062 80.9026 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structure for DQ=-60 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom making animated gifs 11 models are in 2607021444072006537.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021444072006537.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2607021444072006537.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2607021444072006537 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 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running: ../../bin/get_modes.sh 2607021444072006537 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2607021444072006537.eigenfacs 2607021444072006537.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2607021444072006537.eigenfacs 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